KEGG   ORTHOLOGY: K17104
Entry
K17104                      KO                                     
Symbol
E2.5.1.41
Name
phosphoglycerol geranylgeranyltransferase [EC:2.5.1.41]
Pathway
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Reaction
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Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
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  09103 Lipid metabolism
   00564 Glycerophospholipid metabolism
    K17104  E2.5.1.41; phosphoglycerol geranylgeranyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.41  phosphoglycerol geranylgeranyltransferase
     K17104  E2.5.1.41; phosphoglycerol geranylgeranyltransferase
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MARH: Mia14_0378
 » show all
Reference
  Authors
Soderberg T, Chen A, Poulter CD
  Title
Geranylgeranylglyceryl phosphate synthase. Characterization of the recombinant enzyme from Methanobacterium thermoautotrophicum.
  Journal
Biochemistry 40:14847-54 (2001)
DOI:10.1021/bi0111799
  Sequence
[mth:MTH_552]

KEGG   ORTHOLOGY: K00787
Entry
K00787                      KO                                     
Symbol
FDPS
Name
farnesyl diphosphate synthase [EC:2.5.1.1 2.5.1.10]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
map05164  Influenza A
map05166  Human T-cell leukemia virus 1 infection
Module
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
M00367  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, non-plant eukaryotes
Reaction
R01658  dimethylallyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate dimethylallyltranstransferase
R02003  geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranyltrans-transferase
Disease
H01933  Porokeratosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05166 Human T-cell leukemia virus 1 infection
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
   05164 Influenza A
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K00787  FDPS; farnesyl diphosphate synthase
Other DBs
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Genes
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LOI: 92357855(LSCM4_01879)
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Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9
Reference
PMID:8631820
  Authors
Cunillera N, Arro M, Delourme D, Karst F, Boronat A, Ferrer A
  Title
Arabidopsis thaliana contains two differentially expressed farnesyl-diphosphate synthase genes.
  Journal
J Biol Chem 271:7774-80 (1996)
DOI:10.1074/jbc.271.13.7774
Reference
PMID:1968462
  Authors
Wilkin DJ, Kutsunai SY, Edwards PA
  Title
Isolation and sequence of the human farnesyl pyrophosphate synthetase cDNA. Coordinate regulation of the mRNAs for farnesyl pyrophosphate synthetase, 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase, and 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A synthase by phorbol ester.
  Journal
J Biol Chem 265:4607-14 (1990)
  Sequence
[hsa:2224]

KEGG   ORTHOLOGY: K14066
Entry
K14066                      KO                                     
Symbol
GPS
Name
geranyl diphosphate synthase [EC:2.5.1.1]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
Reaction
R01658  dimethylallyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate dimethylallyltranstransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K14066  GPS; geranyl diphosphate synthase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K14066  GPS; geranyl diphosphate synthase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K14066  GPS; geranyl diphosphate synthase
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K14066  GPS; geranyl diphosphate synthase
Other DBs
GO: 0004161
Genes
LSM: 121129646
DSV: 119434465
ATH: AT2G34630(GPS1)
ALY: 9315575
CRB: 17889095
CSAT: 104781856 104792216 109124523
EUS: EUTSA_v10016708mg
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 » show all
Reference
  Authors
van Schie CC, Ament K, Schmidt A, Lange T, Haring MA, Schuurink RC
  Title
Geranyl diphosphate synthase is required for biosynthesis of gibberellins.
  Journal
Plant J 52:752-62 (2007)
DOI:10.1111/j.1365-313X.2007.03273.x
  Sequence
[sly:778311] [ath:AT2G34630]

KEGG   ORTHOLOGY: K13787
Entry
K13787                      KO                                     
Symbol
idsA
Name
geranylgeranyl diphosphate synthase, type I [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00365  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, archaea
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Reaction
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R02003  geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranyltrans-transferase
R02061  trans,trans-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13787  idsA; geranylgeranyl diphosphate synthase, type I
Other DBs
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AG: BAA88983(fgs) BAI44337(cotB1)
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Reference
PMID:8182085
  Authors
Ohnuma S, Suzuki M, Nishino T
  Title
Archaebacterial ether-linked lipid biosynthetic gene. Expression cloning, sequencing, and characterization of geranylgeranyl-diphosphate synthase.
  Journal
J Biol Chem 269:14792-7 (1994)
  Sequence
[sai:Saci_0092]
Reference
  Authors
Vandermoten S, Haubruge E, Cusson M
  Title
New insights into short-chain prenyltransferases: structural features, evolutionary history and potential for selective inhibition.
  Journal
Cell Mol Life Sci 66:3685-95 (2009)
DOI:10.1007/s00018-009-0100-9

KEGG   ORTHOLOGY: K13789
Entry
K13789                      KO                                     
Symbol
GGPS
Name
geranylgeranyl diphosphate synthase, type II [EC:2.5.1.1 2.5.1.10 2.5.1.29]
Pathway
map00900  Terpenoid backbone biosynthesis
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
M00364  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, bacteria
M00366  C10-C20 isoprenoid biosynthesis, plants
Reaction
R01658  dimethylallyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate dimethylallyltranstransferase
R02003  geranyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate geranyltrans-transferase
R02061  trans,trans-farnesyl-diphosphate:isopentenyl-diphosphate farnesyltranstransferase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
   00900 Terpenoid backbone biosynthesis
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01006 Prenyltransferases
    K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups
   2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
    2.5.1.1  dimethylallyltranstransferase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.10  (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
    2.5.1.29  geranylgeranyl diphosphate synthase
     K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Prenyltransferases [BR:ko01006]
 Terpene biosynthesis
  Prenyl diphosphate synthase
   K13789  GGPS; geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
Other DBs
COG: COG0142
GO: 0004161 0004337 0004311
Genes
ATH: AT1G49530(GGPS6) AT2G18620 AT2G18640(GGPS4) AT2G23800(GGPS2) AT3G14510 AT3G14530 AT3G14550(GGPS3) AT3G20160 AT3G29430 AT3G32040 AT4G36810(GGPS1) AT4G38460(GGR)
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PLIS: NN484_13010(ispA)
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