KEGG   ORTHOLOGY: K17710
Entry
K17710                      KO                                     

Name
PTCD1
Definition
pentatricopeptide repeat domain-containing protein 1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis
    K17710  PTCD1; pentatricopeptide repeat domain-containing protein 1
   03029 Mitochondrial biogenesis
    K17710  PTCD1; pentatricopeptide repeat domain-containing protein 1
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic type
  3'processing and CCA adding factors
   3'processing factors
    K17710  PTCD1; pentatricopeptide repeat domain-containing protein 1
Mitochondrial biogenesis [BR:ko03029]
 Mitochondrial DNA transcription, translation, and replication factors
  Mitochondrial transcription and translation factors
   Other mitochondrial DNA transcription and translation factors
    K17710  PTCD1; pentatricopeptide repeat domain-containing protein 1
Genes
HSA: 100526740(ATP5MF-PTCD1) 26024(PTCD1)
PTR: 104001074
PPS: 100975093(PTCD1)
GGO: 101140034(PTCD1)
PON: 100174661(PTCD1)
NLE: 100584673(PTCD1)
MCC: 718712
MCF: 102130441(PTCD1)
CSAB: 103246783(PTCD1)
RRO: 104672080(PTCD1)
RBB: 108538142(PTCD1)
CJC: 100391167(PTCD1)
SBQ: 101041136(PTCD1)
MMU: 71799(Ptcd1)
MCAL: 110294245(Ptcd1)
MPAH: 110313219(Ptcd1)
RNO: 304278(Ptcd1)
CGE: 100752650(Ptcd1)
NGI: 103726470(Ptcd1)
HGL: 101696935(Ptcd1)
CCAN: 109685056
OCU: 100352550(PTCD1)
TUP: 102499737(PTCD1)
CFA: 479742(ATP5J2)
VVP: 112910021
AML: 100464352(PTCD1)
UMR: 103670104
UAH: 113267908(PTCD1)
ORO: 101386437
ELK: 111145870
FCA: 101095706(PTCD1)
PTG: 102962810(PTCD1)
PPAD: 109251232
AJU: 106981206(PTCD1)
BTA: 101910000(PTCD1)
BOM: 102265798(PTCD1)
BIU: 109578103
BBUB: 102396689(PTCD1)
CHX: 102170933(PTCD1)
OAS: 101109584(PTCD1)
SSC: 102160620(PTCD1)
CFR: 102516298(PTCD1)
CDK: 105099361
BACU: 102999017(PTCD1)
LVE: 103080353(PTCD1)
OOR: 101283073
DLE: 111181917(PTCD1)
PCAD: 102993864(PTCD1)
ECB: 100063716(PTCD1)
EAI: 106840491(PTCD1)
MYB: 102242474(PTCD1)
MYD: 102755603(PTCD1)
MNA: 107540905(PTCD1)
HAI: 109379052(PTCD1)
DRO: 112314843(PTCD1)
PALE: 102897834
RAY: 107517853(PTCD1)
MJV: 108403140(PTCD1)
LAV: 104846482(PTCD1)
MDO: 100016159(PTCD1)
SHR: 100925326(PTCD1)
PCW: 110223175(PTCD1)
OAA: 103165473(PTCD1)
MGP: 100541217(PTCD1)
CJO: 107320554
NMEL: 110405914(PTCD1)
APLA: 101802998(PTCD1)
ACYG: 106032089(PTCD1)
TGU: 105760893(PTCD1)
LSR: 110481189(PTCD1)
SCAN: 103817847(PTCD1)
GFR: 102040433(PTCD1)
FAB: 101810068(PTCD1)
PHI: 102108576(PTCD1)
PMAJ: 107211227(PTCD1)
CCAE: 111936122(PTCD1)
CCW: 104684793
ETL: 114060179(PTCD1)
FPG: 101919000(PTCD1)
FCH: 102051806(PTCD1)
CLV: 102097698(PTCD1)
EGZ: 104132634(PTCD1)
NNI: 104015230(PTCD1)
ACUN: 113485772(PTCD1)
PADL: 103918786(PTCD1)
AAM: 106500079(PTCD1)
ASN: 102371477(PTCD1)
AMJ: 102559960(ATP5J2)
PSS: 102453037(PTCD1)
CMY: 102939142(PTCD1)
CPIC: 101937904(PTCD1)
ACS: 100558181(ptcd1)
PVT: 110087191(PTCD1)
PBI: 103068000(PTCD1)
PMUR: 107298693(PTCD1)
TSR: 106550896
PMUA: 114584013(PTCD1)
GJA: 107116921(PTCD1)
XLA: 495833(ptcd1.L)
XTR: 100135205(ptcd1)
NPR: 108799912(PTCD1)
DRE: 570247(ptcd1)
SRX: 107722939 107725401
SANH: 107692668
SGH: 107565220 107575409 107590737
CCAR: 109073284
IPU: 108262201(ptcd1)
PHYP: 113535823
AMEX: 103041319
EEE: 113580935
TRU: 101070459
TNG: GSTEN00015747G001
LCO: 104921178
MZE: 101465823
ONL: 100697289
OLA: 101165376
XMA: 102221245
XCO: 114144901
PRET: 103462163
CVG: 107094089 107096504
NFU: 107389001
KMR: 108242809(ptcd1)
ALIM: 106519626
AOCE: 111576462 111583311
CSEM: 103383492
POV: 109642179
LCF: 108899385
SDU: 111216650
SLAL: 111672986
HCQ: 109511266
BPEC: 110167600
MALB: 109973321
SASA: 106589428
OTW: 112224309
SALP: 111967810
ELS: 105029640
SFM: 108926404
PKI: 111845533
LCM: 102359296(PTCD1)
CMK: 103186858(ptcd1)
RTP: 109910469(ptcd1)
BFO: 118429212
CIN: 100177037
SPU: 590051
APLC: 110985576
SKO: 100373791
DME: Dmel_CG4611(CG4611)
DER: 6544043
DSE: 6610854
DSI: Dsimw501_GD13877(Dsim_GD13877)
DYA: Dyak_GE21482
DSR: 110189049
DPO: Dpse_GA18300
DPE: 6599592
DMN: 108151061
DWI: 26530176 6643116
DGR: Dgri_GH16176
DMO: Dmoj_GI13329
DAZ: 108613229
DNV: 108651189
DHE: 111601652
DVI: 6624447
MDE: 101893354
LCQ: 111685353
AGA: AgaP_AGAP006051
AAG: 5567621
AALB: 109418128
CQU: CpipJ_CPIJ000308
AME: 102655127
BIM: 100747286
BTER: 100645602
CCAL: 108622907
OBB: 114879642
SOC: 105202270
MPHA: 105837010
AEC: 105149382
ACEP: 105621799
PBAR: 105425428
VEM: 105561429
HST: 105186107
DQU: 106740889
CFO: 105249718
LHU: 105670574
PGC: 109858201
OBO: 105279704
PCF: 106788098
NVI: 100123139
CSOL: 105363207
MDL: 103581006
TCA: 659708
DPA: 109538859
ATD: 109605224
NVL: 108560320
BMOR: 101741183
BMAN: 114247531
DPL: KGM_207297
PMAC: 106713801
PRAP: 111003106
HAW: 110370073
TNL: 113496834
PXY: 105397252
API: 100165858(Ptcd1)
DNX: 107162862
AGS: 114122659
RMD: 113548599
BTAB: 109037381
CLEC: 106665726
PHU: Phum_PHUM449140
ZNE: 110833232
FCD: 110855829
DPX: DAPPUDRAFT_304379
PVM: 113815956
ISC: IscW_ISCW023085
TUT: 107365817
CSCU: 111614846
PTEP: 107455927
TSP: Tsp_06780
HRO: HELRODRAFT_109396
LGI: LOTGIDRAFT_63492
PCAN: 112556355
CRG: 105329035
MYI: 110447460
OBI: 106884315
LAK: 106158916 106172327
SMM: Smp_175530 Smp_175540
SHX: MS3_05858
OVI: T265_04068
EGL: EGR_06440
NVE: 5520656
EPA: 110239674
ADF: 107345594
AMIL: 114958170
PDAM: 113666686
SPIS: 111324834
TAD: TRIADDRAFT_53824
AQU: 109585618
ATH: AT2G01740 AT2G02150(EMB2794) AT2G18940 AT5G25630
ALY: 110228245 9308042 9310342 9311156 9322320
CRB: 17884130 17885291 17886605 17893409
CSAT: 104700955 104706890 104710103 104710141 104747740 104767261 104772604 104779493 104779562 104789936 109124929 109132645
EUS: EUTSA_v10003688mg EUTSA_v10003915mg EUTSA_v10003932mg EUTSA_v10012659mg EUTSA_v10022551mg
BRP: 103827529 103837095 103839465 103845601 103874057
BNA: 106365894 106369354 106371684 106388870 106402727 106421297 106430978 106440370 106440843 106451699
BOE: 106301239 106313638 106314826 106318186 106331362 106335402
RSZ: 108805068 108810645 108816043 108824090 108827270 108833061 108849633
THJ: 104799204 104804489 104805941 104811116 104824130
CPAP: 110811096 110812427 110818611 110823904
CIT: 102607615 102614242 102615320 102619696
CIC: CICLE_v10004591mg CICLE_v10007460mg CICLE_v10007728mg CICLE_v10007776mg
TCC: 18587927 18588589 18589279 18609880 18609911
GRA: 105764382 105767366 105773598 105785624 105792995
GHI: 107901241 107903630 107907350 107907496 107918111 107921129 107946298
GAB: 108467845 108479994 108483952 108484319
DZI: 111299331 111303205 111303435 111303439 111318097 111318113
EGR: 104437422 104437755 104438268
GMX: 100779093 100786756 100796249 100803889 100806053 100809945 100820389
GSJ: 114367903 114384860 114384997 114388192 114391608 114413583 114421166 114421518
PVU: PHAVU_002G186700g PHAVU_004G150400g PHAVU_009G239200g PHAVU_010G165600g
VRA: 106765457 106771960 106774259 106779112
VAR: 108319118 108320661 108337606 108347608
VUN: 114164362 114165801 114175256
CCAJ: 109792274 109793996 109800781 109803410 109804784 109812997
MTR: MTR_1g008310 MTR_2g036560 MTR_8g103480
CAM: 101494520 101497208 101498302 101499995
LJA: Lj4g3v0166410.1(Lj4g3v0166410.1) Lj4g3v0166410.2(Lj4g3v0166410.2) Lj4g3v3071640.1(Lj4g3v3071640.1) Lj4g3v3071640.2(Lj4g3v3071640.2) Lj6g3v1368680.1(Lj6g3v1368680.1)
ADU: 107463387 107472270 107482070 107483811 107495205 110272484
AIP: 107605178 107612520 107631963 107632115 107639204
LANG: 109338715 109345050 109349798 109358221 109358604 109359699 109363093
FVE: 101297242 101307002 101308910 101312113
RCN: 112168971 112189322 112196245 112198210 112199916
PPER: 18769611 18783721 18788183 18788526 18788948
PMUM: 103320176 103320947 103321355 103322703 103327600 103340968
PAVI: 110744286 110744545 110754632 110761285 110762822 110768874 110771418
MDM: 103400496 103414669 103441183 103443433 103452217 103453837
PXB: 103934856 103941420 103957556 103962973
ZJU: 107403650 107413916 107420716 107429247 107431762 107434028
CSV: 101204641 101213196 101218169 116403373
CMO: 103492828 103493450 103501564 103503718 103503999
MCHA: 111011746 111014569 111015641 111015970 111020876
CMAX: 111468552 111471658 111489432 111490957 111492320
CMOS: 111436267 111441080 111443919 111444847 111447887 111460688
CPEP: 111785063 111792289 111796449 111798386 111799257 111806099 111808414
RCU: 8268358 8271213 8275339 8277351 8287865
JCU: 105636457 105637728 105638272 105645371
HBR: 110636172 110648410 110652859 110661570 110671660
MESC: 110603629 110608189 110611425 110617476 110623943
POP: 18100481 7458979 7459076 7476286
PEU: 105115503 105123683 105127131 105138936
JRE: 108979375 109005528 109006962 109006999 109009523
QSU: 111987073 111987770 111991537 112017809 112033953
VVI: 100241074 100247419 100253054 100267944
SLY: 101244724 101258289 101263225 101267036
SPEN: 107009179 107026033 107026118 107028521
SOT: 102578994 102582941 102591702
CANN: 107856054 107860483 107870233 107877866
NTA: 107768251 107771998 107774206 107786373 107793694 107811608 107815568 107816237
NSY: 104233944 104241432 104243854 104250063
NTO: 104099259 104102123 104112016 104121162
NAU: 109214992 109231762 109234056 109241061
INI: 109147982(PnC401) 109163124 109173115 109178690
SIND: 105155710 105169943 105171262 105173514 105180370
OEU: 111372770 111383543 111383547 111399112 111407894
HAN: 110865592 110868907 110907390
LSV: 111896746 111913999 111918540
CCAV: 112500762 112507406
DCR: 108192871 108197421 108204988 108215037
BVG: 104884865 104890701 104895272 104902216 104902218 104902392
SOE: 110775054 110785008 110792075 110798854
CQI: 110681876 110690849 110691019 110692265 110695046 110702161 110705622 110707780
NNU: 104592189 104602338 104603144 104610782
PSOM: 113279333 113290128 113298147 113302782 113348287 113349075
OSA: 4327187 4341324 9271043
DOSA: Os01t0228400-01(Os01g0228400) Os05t0275000-01(Os05g0275000) Os06t0565000-00(Os06g0565000)
OBR: 102700275 102716981 102719205
BDI: 100831795 100834484 100843166 100844961
ATS: 109738945(LOC109738945) 109742390(LOC109742390) 109773164(LOC109773164)
SBI: 8058454 8071459 8083251
ZMA: 100273524(si486067f01) 100302579(ppr10) 103642248
SITA: 101760003 101766618 101776888 101784461
PDA: 103701530 103710907 103712243 103716814 108510726
EGU: 105039276 105040817 105051859 105054980
MUS: 103972234 103975045 103980278 104000805
DCT: 110109368 110109997 110111233 110112262
PEQ: 110020109 110024743 110026242 110026333 110036149
AOF: 109823686 109833353 109841341 109851587
ATR: 18423812 18424586 18426580 18428797
SMO: SELMODRAFT_11024 SELMODRAFT_21211
PPP: 112293639
CRE: CHLREDRAFT_114572 CHLREDRAFT_169792(PPR4) CHLREDRAFT_58965(PPR3)
VCN: VOLCADRAFT_103021 VOLCADRAFT_116752 VOLCADRAFT_42994
MNG: MNEG_13204 MNEG_15081 MNEG_15334 MNEG_2776 MNEG_9642
CSL: COCSUDRAFT_17392 COCSUDRAFT_17988 COCSUDRAFT_46623 COCSUDRAFT_55901
CVR: CHLNCDRAFT_59068
APRO: F751_0570 F751_5530
OLU: OSTLU_29618
OTA: OT_ostta14g03080
BPG: Bathy04g01660 Bathy12g02620
MIS: MICPUN_71611
MPP: MICPUCDRAFT_32565 MICPUCDRAFT_5717
CME: CYME_CMN222C
ACAN: ACA1_309300
PTM: GSPATT00015707001
SMIN: v1.2.000202.t1(symbB.v1.2.000202.t1) v1.2.000999.t1(symbB.v1.2.000999.t1) v1.2.003422.t1(symbB.v1.2.003422.t1) v1.2.004219.t1(symbB.v1.2.004219.t1) v1.2.005880.t1(symbB.v1.2.005880.t1) v1.2.006294.t1(symbB.v1.2.006294.t1) v1.2.007235.t1(symbB.v1.2.007235.t1) v1.2.007332.t1(symbB.v1.2.007332.t1) v1.2.007810.t1(symbB.v1.2.007810.t1) v1.2.010726.t1(symbB.v1.2.010726.t1) v1.2.011522.t1(symbB.v1.2.011522.t1) v1.2.011648.t1(symbB.v1.2.011648.t1) v1.2.012311.t1(symbB.v1.2.012311.t1) v1.2.013570.t1(symbB.v1.2.013570.t1) v1.2.013695.t1(symbB.v1.2.013695.t1) v1.2.014686.t1(symbB.v1.2.014686.t1) v1.2.014687.t2(symbB.v1.2.014687.t2) v1.2.014894.t1(symbB.v1.2.014894.t1) v1.2.014978.t1(symbB.v1.2.014978.t1) v1.2.015857.t1(symbB.v1.2.015857.t1) v1.2.016601.t1(symbB.v1.2.016601.t1) v1.2.016601.t2(symbB.v1.2.016601.t2) v1.2.017675.t1(symbB.v1.2.017675.t1) v1.2.018621.t2(symbB.v1.2.018621.t2) v1.2.019683.t1(symbB.v1.2.019683.t1) v1.2.019729.t1(symbB.v1.2.019729.t1) v1.2.023928.t1(symbB.v1.2.023928.t1) v1.2.025258.t1(symbB.v1.2.025258.t1) v1.2.025259.t1(symbB.v1.2.025259.t1) v1.2.026433.t1(symbB.v1.2.026433.t1) v1.2.026813.t1(symbB.v1.2.026813.t1) v1.2.027806.t1(symbB.v1.2.027806.t1) v1.2.029442.t1(symbB.v1.2.029442.t1) v1.2.031311.t1(symbB.v1.2.031311.t1) v1.2.033095.t1(symbB.v1.2.033095.t1) v1.2.037863.t1(symbB.v1.2.037863.t1) v1.2.038431.t1(symbB.v1.2.038431.t1) v1.2.041449.t1(symbB.v1.2.041449.t1)
FCY: FRACYDRAFT_181047 FRACYDRAFT_185285
PIF: PITG_06853 PITG_14652
EHX: EMIHUDRAFT_197872 EMIHUDRAFT_450548 EMIHUDRAFT_459720 EMIHUDRAFT_51716 EMIHUDRAFT_51885 EMIHUDRAFT_52144 EMIHUDRAFT_52395 EMIHUDRAFT_52429 EMIHUDRAFT_53066 EMIHUDRAFT_53301
GTT: GUITHDRAFT_47604 GUITHDRAFT_53115 GUITHDRAFT_65976
TBR: Tb10.6k15.0120
TBG: TbgDal_X12410
TCR: 508307.50
LMA: LMJF_36_4810
LIF: LINJ_36_5040
LDO: LDBPK_365040
LMI: LMXM_36_4810
LBZ: LBRM_35_5060
LPAN: LPMP_354930
 » show all
Reference
  Authors
Sanchez MI, Mercer TR, Davies SM, Shearwood AM, Nygard KK, Richman TR, Mattick JS, Rackham O, Filipovska A
  Title
RNA processing in human mitochondria.
  Journal
Cell Cycle 10:2904-16 (2011)
DOI:10.4161/cc.10.17.17060
  Sequence
[hsa:26024]

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Gene (15219)   
   KEGG GENES (772)   
   KEGG MGENES (276)   
   RefGene (14099)   
   OC (72)   
Literature (1)   
   PubMed (1)   
All databases (15223)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system