KEGG   ORTHOLOGY: K18750
Entry
K18750                      KO                                     
Symbol
APOBEC3
Name
C->U-editing enzyme APOBEC3 [EC:3.5.4.-]
Pathway
map03250  Viral life cycle - HIV-1
map05170  Human immunodeficiency virus 1 infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09125 Information processing in viruses
   03250 Viral life cycle - HIV-1
    K18750  APOBEC3; C->U-editing enzyme APOBEC3
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05170 Human immunodeficiency virus 1 infection
    K18750  APOBEC3; C->U-editing enzyme APOBEC3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K18750  APOBEC3; C->U-editing enzyme APOBEC3
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.5  Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds
   3.5.4  In cyclic amidines
    3.5.4.-
     K18750  APOBEC3; C->U-editing enzyme APOBEC3
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     K18750  APOBEC3; C->U-editing enzyme APOBEC3
Genes
HSA: 100913187(APOBEC3A_B) 140564(APOBEC3D) 164668(APOBEC3H) 200315(APOBEC3A) 200316(APOBEC3F) 27350(APOBEC3C) 60489(APOBEC3G) 9582(APOBEC3B)
PTR: 100611714(APOBEC3C) 449577(APOBEC3G) 467121 470214(APOBEC3H) 470274(APOBEC3D) 470275 743891(APOBEC3B) 744498(APOBEC3A)
PPS: 100971498(APOBEC3B) 100982453(APOBEC3G) 100983444(APOBEC3C) 100983664(APOBEC3H) 100990514(APOBEC3F) 117977490(APOBEC3A) 117977491(APOBEC3D)
GGO: 101133558 101133902 101134601 101137376(APOBEC3G) 115930115 115931928(APOBEC3H) 115931934(APOBEC3A) 115931935 115931936 115932647
PON: 100455142(APOBEC3A) 100456583(APOBEC3F) 100458043(APOBEC3G) 100458762 103888537(APOBEC3C)
NLE: 100583627 100585149(APOBEC3A) 100585498(APOBEC3D) 100585723(APOBEC3C) 100585834(APOBEC3H) 100601000(APOBEC3G) 108684025(APOBEC3B) 115835901
MCC: 574398(APOBEC3G) 705870(APOBEC3C) 705996(APOBEC3D) 721030(APOBEC3A) 721047(APOBEC3B) 723811(APOBEC3H) 723812(APOBEC3F)
MCF: 101925624(APOBEC3C) 102126615(APOBEC3B) 102127357(APOBEC3D) 102128261(APOBEC3G) 102129411(APOBEC3H) 102131077(APOBEC3A) 107126386
CSAB: 103223331(APOBEC3D) 103223333(APOBEC3C) 103223334(APOBEC3G) 103223335(APOBEC3H) 103247808 108663998(APOBEC3B)
CATY: 105572988(APOBEC3G) 105573008 105573014(APOBEC3F) 105573020(APOBEC3C) 105573030(APOBEC3B) 105573037(APOBEC3A) 105573250(APOBEC3H)
PANU: 100303423(APOBEC3G) 101008781(APOBEC3A) 101009457(APOBEC3D) 101010266(APOBEC3H) 108663997(APOBEC3F) 108684027(APOBEC3C)
RRO: 104682550(APOBEC3H) 104682552(APOBEC3G) 104682553(APOBEC3F) 104682554(APOBEC3D) 104682555(APOBEC3B) 104682557(APOBEC3A) 108684023(APOBEC3C)
RBB: 108520475(APOBEC3G) 108520477(APOBEC3H) 108521436(APOBEC3A) 108521467 108521468 108521469 108526035
PTEH: 111530206(APOBEC3G) 111548998(APOBEC3H) 111548999 111549001 111549002
MMU: 80287(Apobec3)
MCAL: 110310320
MPAH: 110334948
RNO: 315137(Apobec3)
MCOC: 116076032
MUN: 110557822
CGE: 100772476(Apobec3b)
PLEU: 114694361
NGI: 103748572
CPOC: 101787475
CCAN: 109692930
DORD: 105992068
DSP: 122123553
OCU: 100340649 103348387(APOBEC3A)
TUP: 102468505 102476613 102477121 102486589(APOBEC3F) 102498341(APOBEC3H)
CFA: 481248(APOBEC3Z3) 610245(APOBEC3Z1)
VVP: 112934047
VLG: 121490498
UMR: 103659212(APOBEC3H) 103676525(APOBEC3F) 103681381
UAH: 113241577 113241590 113251074(APOBEC3H)
MPUF: 101680223
ORO: 101378154(APOBEC3B) 105757446(APOBEC3H)
ZCA: 113921548(APOBEC3B)
FCA: 100127022(APOBEC3Z3)
PTG: 102971284
AJU: 106981073
HHV: 120227638(APOBEC3A) 120234545
BTA: 108771180(APOBEC3Z3) 504505(APOBEC3Z2) 507162(APOBEC3Z1)
BIU: 109558629
BBUB: 102405577 112584444(APOBEC3A)
CHX: 102184324 106502146(APOBEC3A)
OAS: 100037691(APOBEC3F) 100301555(APOBEC3Z1)
ODA: 120857650(APOBEC3H) 120857653 120857654
CCAD: 122423755(APOBEC3B) 122423756(APOBEC3A)
SSC: 100037939(APOBEC3B)
CFR: 102512329
VPC: 102529953
BACU: 103013586(APOBEC3G) 103014141(APOBEC3B)
LVE: 103069082(APOBEC3G) 103086070(APOBEC3B)
ECB: 100070206 100070250(APOBEC3Z2A-Z2) 100070262(APOBEC3H) 100146802 100147481(A3F2) 100302571
HAI: 109392229 109392257(APOBEC3H) 109394478
MMF: 118623274 118623525 118624427(APOBEC3A)
RAY: 107502060(APOBEC3F) 107502068(APOBEC3H) 107502069 107507997 107519218(APOBEC3A)
MJV: 108386308(APOBEC3A)
SARA: 101546977
MDO: 103099360
SHR: 100914817
PCW: 110192697
ACS: 103278301
PVT: 110088515
SUND: 121924823
VKO: 123023204
PMUA: 114596543
ZVI: 118085315
GJA: 107115394
XLA: 108709754
XTR: 116408872
BBUF: 120995843
BGAR: 122932305
HCQ: 109515716
SFM: 108928992
PKI: 111859667
LOC: 107079409
PSPA: 121320895
MMER: 123560439
DGT: 114518497
 » show all
Reference
  Authors
Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC
  Title
Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business.
  Journal
Trends Genet 19:207-16 (2003)
DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
  Sequence
Reference
  Authors
Gallois-Montbrun S, Kramer B, Swanson CM, Byers H, Lynham S, Ward M, Malim MH
  Title
Antiviral protein APOBEC3G localizes to ribonucleoprotein complexes found in P bodies and stress granules.
  Journal
J Virol 81:2165-78 (2007)
DOI:10.1128/JVI.02287-06
  Sequence
[hsa:60489]
Reference
  Authors
Madsen P, Anant S, Rasmussen HH, Gromov P, Vorum H, Dumanski JP, Tommerup N, Collins JE, Wright CL, Dunham I, MacGinnitie AJ, Davidson NO, Celis JE
  Title
Psoriasis upregulated phorbolin-1 shares structural but not functional similarity to the mRNA-editing protein apobec-1.
  Journal
J Invest Dermatol 113:162-9 (1999)
DOI:10.1046/j.1523-1747.1999.00682.x
  Sequence
[hsa:200315]

DBGET integrated database retrieval system