KEGG   ORTHOLOGY: K19125
Entry
K19125                      KO                                     

Name
casD, cse5
Definition
CRISPR system Cascade subunit CasD
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19125  casD, cse5; CRISPR system Cascade subunit CasD
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-E factors
    K19125  casD, cse5; CRISPR system Cascade subunit CasD
Genes
ECO: b2757(casD)
ECJ: JW5844(ygcI)
ECD: ECDH10B_2925(ygcI)
EBW: BWG_2493(ygcI)
ECOK: ECMDS42_2262(ygcI)
ECE: Z4066
ECS: ECs3611
ECF: ECH74115_4010(cas5e)
ETW: ECSP_3705
ELX: CDCO157_3371
ESL: O3K_05745
ESO: O3O_19905
ESM: O3M_05790
EOK: G2583_3405(ygcI)
ELH: ETEC_2948
ECW: EcE24377A_3059(cas5e)
ECM: EcSMS35_2885(cas5e)
ECY: ECSE_3012
EKF: KO11_09190(cas5e)
EDJ: ECDH1ME8569_2667(ygcI)
ELW: ECW_m2964(cas5e)
ELL: WFL_14470(cas5e)
EFE: EFER_0306(ygcI)
ESZ: FEM44_03675(cas5e) FEM44_05330(cas5e)
STY: STY3067
STT: t2841
STM: STM2940
SENI: CY43_15340
SPT: SPA2796
SEK: SSPA2607
SEI: SPC_2984
SEC: SCH_2872(ygcI)
SHB: SU5_03421
SEE: SNSL254_A3150(cas5e)
SEW: SeSA_A3094(cas5)
SEA: SeAg_B3068(cas5)
SENS: Q786_14170
SED: SeD_A3251(cas5)
SEG: SG2843
SEL: SPUL_2939
SET: SEN2779
SENA: AU38_14115
SENO: AU37_14125
SENV: AU39_14125
SENQ: AU40_15890
SENL: IY59_14720
SEEP: I137_13995
SENB: BN855_29900(cas5)
SENE: IA1_14090
SBZ: A464_2962
SALZ: EOS98_04795(cas5e)
SSN: SSON_2906
SBO: SBO_2763
SBC: SbBS512_E3117(cas5e)
ESA: ESA_02834
CSK: ES15_2920(cas5)
CTU: CTU_10480
KPU: KP1_3166(cas5e)
KPP: A79E_2165
KPT: VK055_0384(cas5e)
KPR: KPR_4120
KPX: PMK1_04444(casD)
KPNK: BN49_1002
KVA: Kvar_0943
KOE: A225_4679
KQV: B8P98_12010(cas5e)
CRO: ROD_30491
CYO: CD187_05040(cas5e)
CFQ: C2U38_19995(cas5e)
LEH: C3F35_16495(cas5e)
LPV: HYN51_03145(cas5e)
IZH: FEM41_00190(cas5e)
SERA: Ser39006_005070(cas5e)
SERQ: CWC46_05070(cas5e)
PEC: W5S_0413
PPUJ: E2566_02100(cas5e)
DFN: CVE23_01940(cas5e)
DDQ: DDI_3192
DIC: Dpoa569_003595(cas5e)
EAM: EAMY_2816(ygcI)
EAY: EAM_0766
EPY: EpC_08110(cas5)
EPR: EPYR_00856(ygcI)
ERJ: EJP617_02860(cas5)
MINT: C7M51_00064(casD)
MTHI: C7M52_02650(casD)
PLU: plu0749
PAY: PAU_00710
PHAU: PH4a_00610(cas5e)
XBO: XBJ1_3753
XBV: XBW1_4260
XNE: XNC1_3721
XNM: XNC2_3576
XDO: XDD1_0594
XPO: XPG1_0517
ETE: ETEE_2631
PRAG: EKN56_10340(cas5e)
VCO: VC0395_A2675(cas5e)
VHR: AL538_00330(cas5e)
PPR: PBPRC0036
SCOT: HBA18_15020(cas5e)
PMY: Pmen_3757
PPSE: BN5_0771
PSEN: PNC201_20245(casD)
HMI: soil367_17140(cas5e)
PIN: Ping_1590
MII: BTJ40_18110(cas5e)
KIM: G3T16_03680(cas5e)
MCA: MCA0932
METL: U737_02365(cas5e)
MBUR: EQU24_20280(cas5e)
MMAI: sS8_4539
MMOB: F6R98_00795(cas5e)
NWA: Nwat_1400
NTT: TAO_1711
TTP: E6P07_10975(cas5e)
AEH: Mlg_0951
GHL: GM160_08040(cas5e)
CSA: Csal_0230
HAM: HALO4332
HBE: BEI_3527
HALK: CUU95_04735(cas5e)
NIK: F5I99_01700(cas5e)
SOK: D0B54_08905(cas5e)
SINI: GT972_11615(cas5e)
TBN: TBH_C1503
CHRI: DK842_14510(cas5e)
CHRB: DK843_20070(cas5e)
PSE: NH8B_0693
AMAH: DLM_2391
PIG: EGT29_03875(cas5e)
PACR: FXN63_18880(cas5e)
HPSE: HPF_16005
CBAA: SRAA_1197
CBAB: SMCB_1596
JAG: GJA_3177(cas5)
RGE: RGE_06850(cas5)
NLC: EBAPG3_008195(cas5e)
NIM: W01_09250(casD)
ACOM: CEW83_06425(cas5e)
AZD: CDA09_21045(cas5e)
TCL: Tchl_1800
ZPA: C3497_14085(cas5e)
HYO: NNO_1912
GSU: GSU1388(cas5e)
GSK: KN400_1354(cas5e)
GUR: Gura_0831
GLO: Glov_2476
PCA: Pcar_0960(cas5e)
PPD: Ppro_2339
DDE: Dde_0861
DDS: Ddes_0927
DEF: CNY67_05515(cas5e)
DCB: C3Y92_05840(cas5e)
DOL: Dole_2987
DAL: Dalk_4938
SFU: Sfum_2828
BSED: DN745_02410(cas5e)
BOS: BSY19_4792(cas5e)
MEE: DA075_08060(cas5e)
MTEA: DK419_15605(cas5e)
NOH: G5V57_09465(cas5e) G5V57_21910(cas5e)
PKD: F8A10_12745(cas5e)
DSH: Dshi_3218(cas5)
GEH: HYN69_12320(cas5e)
HML: HmaOT1_18370(cas5e)
MON: G8E03_16980(cas5e)
SECH: B18_17930
HGN: E6W36_14915(cas5e)
GOH: B932_0094
GTI: FXF46_10000(cas5e)
GDI: GDI2206
GDJ: Gdia_0424
GXY: GLX_07790
AOY: EOV40_007485(cas5e)
RMUC: FOB66_01595(cas5e)
NEH: E3E11_02170(cas5e)
SWF: E3E12_03295(cas5e)
BOB: GN304_00785(cas5e)
BOMB: GT348_01855(cas5e)
RCE: RC1_3336
AZZ: DEW08_03430(cas5e)
PSTG: E8M01_22905(cas5e)
STHE: T303_06230
SRAT: FY406_10310(cas5e)
LDB: Ldb0872
LBU: LBUL_0797
LCA: LSEI_0353
LHH: LBH_1243
LHD: HUO_04725
LFE: LAF_0695
LFF: LBFF_1326
LBN: LBUCD034_0105(casD)
TEY: GLW17_02290(cas5e)
TOO: C7K38_10755(cas5e)
OSI: DLJ48_08410(cas5e)
ABAE: CL176_04470(cas5e)
ESR: ES1_14560
FPA: FPR_15520
STH: STH668
SALQ: SYNTR_0950
HMO: HM1_0185(cas5)
ABUT: Ami103574_04830(cas5e)
FMA: FMG_P0058
LPIL: LIP_1463
CGT: cgR_6054
CDP: CD241_2097(cas4)
CDH: CDB402_0038(cas16)
CDT: CDHC01_2098(cas4)
CDR: CDHC03_0042(cas16)
CDA: CDHC04_0038(cas16)
CDD: CDCE8392_0036(cas16)
CDW: CDPW8_0034(cas16)
CJK: jk0645
CUR: cu1969(casD)
CUA: CU7111_1889(casD)
CAR: cauri_0902(casD)
CPL: Cp3995_0024(cas5)
CPG: CP316_00165(cas5e)
CPP: CpP54B96_0029(cas5)
CPZ: CpPAT10_0025(cas5)
COR: Cp267_0030(cas5)
COP: CP31_00160(cas5e)
COD: Cp106_0022(cas5)
COS: Cp4202_0024(cas5)
COI: CPCIP5297_00165(cas5e)
COE: CP258_00165(cas5e)
COU: CP162_00185(cas5e)
CPSE: CPTA_00548
CPSU: CPTB_00984
CPSF: CPTC_00646
CRD: CRES_2074(casC)
CUN: Cul210932_0042(cas8)
CUS: CulFRC11_0039(cas8)
CUQ: Cul210931_0040(cas8)
CUZ: Cul05146_0041(cas8)
CUJ: CUL131002_0040(cas8)
CTER: A606_11690
COA: DR71_1113(cas5e)
CSX: CSING_09700(casD)
CKU: UL82_04280(casD)
CUT: CUTER_08695(cas16)
CPHO: CPHO_10445
NFA: NFA_44240
NTP: CRH09_11710(cas5e)
NOZ: DMB37_15425(cas5e)
TOY: FO059_16115(cas5e)
SALB: XNR_0788
SMA: SAVERM_7539(cas5e)
SGR: SGR_3545
SFA: Sfla_6590
SALS: SLNWT_3607
STRP: F750_7155
SALU: DC74_7384
STRE: GZL_p00124
SLD: T261_7086
SRN: A4G23_04621(casD)
SLAU: SLA_7114
SRJ: SRO_1952
SKY: D0C37_15760(cas5e)
SDX: C4B68_00545(cas5e)
SGD: ELQ87_14435(cas5e) ELQ87_25770(cas5e)
SQZ: FQU76_09965(cas5) FQU76_31885(cas5e)
STRI: C7M71_014550(cas5e) C7M71_022825(cas5e)
MHOS: CXR34_16680(cas5e)
AUL: DCC27_009020(cas5e)
BRZ: CFK38_03545(cas5e)
LMOI: VV02_03395
XYL: ET495_13745(cas5e)
XYA: ET471_16265(cas5e)
CFI: Celf_0519
OEK: FFI11_005290(cas5e)
CACN: RN83_11110
NDA: Ndas_1284
NAL: B005_5407(cas5e)
NGV: CDO52_19450(cas5e)
STRR: EKD16_00070(casD)
FAL: FRAAL0456
NML: Namu_3051
NAK: EH165_04510(cas5)
AMD: AMED_5809
AMN: RAM_29775
AMM: AMES_5731
AMZ: B737_5731
SESP: BN6_19690
AHG: AHOG_15695(casD1) AHOG_20045(casD2) AHOG_20920(casD3) AHOG_21030(casD4) AHOG_23665(casD5)
ACTA: C1701_00585(cas5e) C1701_26245(cas5e)
ALO: CRK59254
MICH: FJK98_21615(cas5e)
PLK: CIK06_17150(cas5e)
CAI: Caci_3906
AHE: Arch_1756
MCU: HMPREF0573_10258(casD)
TPYO: X956_08735
ACTO: C3V41_12115(cas5e)
BADL: BADO_1328
BANL: BLAC_07140
BAST: BAST_1431
BCAT: BBCT_1282
BANG: BBAG_1187
BSCA: BBSC_1929
BGX: ESN35_01365(cas5e)
GVG: HMPREF0421_20674(cas5)
GVA: HMPREF0424_0763(casD)
TBI: Tbis_1532
AEY: CDG81_02005(cas5e) CDG81_13065(cas5e) CDG81_17995(cas5e)
EKE: EK0264_07835(cas5e)
AFO: Afer_0985
CYA: CYA_0731(cas5e)
DEH: cbdbB36
DMD: dcmb_1407
HAU: Haur_4343
STI: Sthe_3434
DGE: Dgeo_2633
DGO: DGo_PE0016(cse)
TRA: Trad_2307
TTJ: TTHB191
TSC: TSC_c12470(cas5e)
TBC: A0O31_02503(casD)
MRB: Mrub_3015
TTR: Tter_1899
PNL: PNK_1127(cas5)
VBL: L21SP4_02075(casD)
LBJ: LBJ_2452
LBL: LBL_0660
LST: LSS_15596
LMAY: DPV73_08640(cas5e)
LWL: FHG68_16870(cas5e)
RMR: Rmar_0484
CTE: CT1976
PAA: Paes_1414
NDE: NIDE1546(cas5e)
MARC: AR505_1093
MBAR: MSBR2_1625
MBU: Mbur_0597
MHU: Mhun_1377
MPL: Mpal_1604
RCI: RCIX1151
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Reference
  Authors
Perez-Rodriguez R, Haitjema C, Huang Q, Nam KH, Bernardis S, Ke A, DeLisa MP
  Title
Envelope stress is a trigger of CRISPR RNA-mediated DNA silencing in Escherichia coli.
  Journal
Mol Microbiol 79:584-99 (2011)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2010.07482.x
  Sequence
[eco:b2757]

DBGET integrated database retrieval system