KEGG   ORTHOLOGY: K23778
Entry
K23778                      KO                                     

Name
rcdA
Definition
TetR/AcrR family transcriptional regulator, regulator of biofilm formation and stress response
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K23778  rcdA; TetR/AcrR family transcriptional regulator, regulator of biofilm formation and stress response
Transcription factors [BR:ko03000]
 Prokaryotic type
  Helix-turn-helix
   TetR/AcrR family
    K23778  rcdA; TetR/AcrR family transcriptional regulator, regulator of biofilm formation and stress response
Other DBs
COG: COG3226
Genes
ECO: b0846(rcdA)
ECJ: JW5114(ybjK)
ECD: ECDH10B_0915(ybjK)
EBW: BWG_0699(ybjK)
ECOK: ECMDS42_0697(ybjK)
ECE: Z1073
ECS: ECs0926
ECF: ECH74115_0999
ETW: ECSP_0946(ybjK)
ELX: CDCO157_0902
EOI: ECO111_0915(ybjK)
EOJ: ECO26_0973(ybjK)
EOH: ECO103_0890(ybjK)
ESL: O3K_17115
ESO: O3O_08175
ESM: O3M_17090
ECK: EC55989_0891(ybjK)
ECG: E2348C_0797(ybjK)
EOK: G2583_1076(ybjK)
ELH: ETEC_0913
ECP: ECP_0860
ENA: ECNA114_0788(ybjK)
ECOS: EC958_0958(ybjK)
ECV: APECO1_1247(ybjK)
ECY: ECSE_0904
ECR: ECIAI1_0885(ybjK)
ECQ: ECED1_0810(ybjK)
EUM: ECUMN_1036(ybjK)
ECT: ECIAI39_0825(ybjK)
EOC: CE10_0869(ybjK)
EBR: ECB_00813(ybjK)
EBL: ECD_00813(rcdA)
EBE: B21_00830(ybjK)
EBD: ECBD_2777
ECI: UTI89_C0849(ybjK)
ECZ: ECS88_0863(ybjK)
ECC: c0931(ybjK)
ESE: ECSF_0771
EKF: KO11_19540(ybjK)
EAB: ECABU_c08870(ybjK)
EDJ: ECDH1ME8569_0798(ybjK)
ELW: ECW_m0904(ybjK)
ELL: WFL_04400(ybjK)
ELC: i14_0895(ybjK)
ELD: i02_0895(ybjK)
ELF: LF82_2660(ybjK)
ECOJ: P423_04200
EFE: EFER_0987(ybjK)
STY: STY0902
STT: t2027
STM: STM0869
SENI: CY43_04655
SPT: SPA1893
SEK: SSPA1763
SEI: SPC_0868
SEC: SCH_0863(ybjK)
SHB: SU5_01538
SENS: Q786_04205
SED: SeD_A0973
SEG: SG0850
SEL: SPUL_2099
SET: SEN0815
SENA: AU38_04235
SENO: AU37_04220
SENV: AU39_04225
SENQ: AU40_04705
SENL: IY59_04295
SEEP: I137_09555
SENB: BN855_8500
SENE: IA1_04430
SBG: SBG_0747
SBZ: A464_829
SFL: SF0799
SFX: S0842
SFV: SFV_0831
SFE: SFxv_0868
SFN: SFy_1082
SFS: SFyv_1124
SSN: SSON_0831
SBO: SBO_0742
SDY: SDY_0750
ENC: ECL_02872
ECLX: LI66_07100
ECLY: LI62_07845
ECLZ: LI64_07405
ECLO: ENC_18660
EEC: EcWSU1_01401(ybjK)
ESA: ESA_02492
CSK: ES15_2588(ybjK)
CTU: CTU_14490(ybjK)
KPN: KPN_00877(ybjK)
KPU: KP1_1839(ybjK)
KPP: A79E_3362
KPR: KPR_3707
KPJ: N559_3452
KPNU: LI86_17675
KPNK: BN49_1930
KVA: Kvar_3500
KPE: KPK_3687
KOX: KOX_15610
KOE: A225_1972
EAE: EAE_14820
EAR: CCG31002
CRO: ROD_08521
CKO: CKO_02263
CAMA: F384_03930
AHN: NCTC12129_01785(ybjK)
EBF: D782_2966
PATR: EV46_10655
PATO: GZ59_23430
PCT: PC1_2089
PEC: W5S_2354
SOD: Sant_1019
PAEP: PA1S_14545
PAEM: U769_14145
PAEL: T223_15775
PAEG: AI22_19240
PSET: THL1_3495
SLO: Shew_2383
SWD: Swoo_2858
SWP: swp_1960
CPS: CPS_2264
SAGA: M5M_07495
ODI: ODI_R3926
DAL: Dalk_0729
DALK: DSCA_29200
MXA: MXAN_2234
SCL: sce1385
RBS: RHODOSMS8_03490(rcdA)
MOR: MOC_2169
HBA: Hbal_2286
STAX: MC45_17320
GXL: H845_783
PMW: B2K_08295
MTV: RVBD_3066
MRA: MRA_3099
MTUR: CFBS_3234
MTD: UDA_3066
MTUC: J113_21360
MTUE: J114_16400
MTUH: I917_21530
MTUL: TBHG_02996
MTUT: HKBT1_3221
MTUU: HKBT2_3226
MBB: BCG_3091
MBT: JTY_3086
MBX: BCGT_2916
MAF: MAF_30730
MMC: Mmcs_1824
MKM: Mkms_1871
MJL: Mjls_1805
MHAD: B586_16110
MMAG: MMAD_42160
CPRE: Csp1_01980(rcdA)
NFA: NFA_33250
RER: RER_37300
REY: O5Y_17195
RFA: A3L23_02177(rcdA_2)
RHS: A3Q41_01204(rcdA_1)
GOR: KTR9_4031
TPR: Tpau_0140
SALB: XNR_0895
SGR: SGR_3387
SGB: WQO_18810
SHY: SHJG_1782
SALU: DC74_2392
SALL: SAZ_13310
STRE: GZL_06616
SLD: T261_7697
STRM: M444_35535
SAMB: SAM23877_0452(ybjK) SAM23877_0690(ybjK)
SPRI: SPRI_0655
SLE: sle_62000(sle_62000)
STRD: NI25_35805
SALJ: SMD11_5118
SGE: DWG14_08101(rcdA_2)
CMI: CMM_2385
MTS: MTES_1161
MOO: BWL13_01880(rcdA_1)
MOY: CVS54_00577(rcdA_1)
ARM: ART_1018
ACH: Achl_3582
BCV: Bcav_2126
JDE: Jden_0532
IDO: I598_2318
CFI: Celf_0388
DCO: SAMEA4475696_2117(yvdT)
ACIJ: JS278_02886(rcdA)
KFL: Kfla_4836
NAL: B005_3707
AMD: AMED_6218
AMN: RAM_31900
AMM: AMES_6128
AMZ: B737_6128
AORI: SD37_11255
PDX: Psed_2171
PSEE: FRP1_13405
SESP: BN6_78490
ACTI: UA75_22570
ACAD: UA74_22095
AHG: AHOG_14825 AHOG_20245(kstR3)
ALO: CRK58047
ASE: ACPL_2966
AFS: AFR_01990
ACTS: ACWT_2580
TPYO: X956_02200
BBP: BBPR_0958
BBI: BBIF_0916
BBF: BBB_0897(ybjK)
BSCA: BBSC_0896
TBI: Tbis_1763
CWO: Cwoe_3555
 » show all
Reference
  Authors
Shimada T, Katayama Y, Kawakita S, Ogasawara H, Nakano M, Yamamoto K, Ishihama A
  Title
A novel regulator RcdA of the csgD gene encoding the master regulator of biofilm formation in Escherichia coli.
  Journal
Microbiologyopen 1:381-94 (2012)
DOI:10.1002/mbo3.42
  Sequence
[ecj:JW5114]

DBGET integrated database retrieval system