KEGG   ORTHOLOGY: K23778Help
Entry
K23778                      KO                                     

Name
rcdA
Definition
TetR/AcrR family transcriptional regulator, regulator of biofilm formation and stress response
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K23778  rcdA; TetR/AcrR family transcriptional regulator, regulator of biofilm formation and stress response
Transcription factors [BR:ko03000]
 Prokaryotic type
  Helix-turn-helix
   TetR/AcrR family
    K23778  rcdA; TetR/AcrR family transcriptional regulator, regulator of biofilm formation and stress response
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG3226
Genes
ECO: b0846(rcdA)
ECJ: JW5114(ybjK)
ECD: ECDH10B_0915(ybjK)
EBW: BWG_0699(ybjK)
ECOK: ECMDS42_0697(ybjK)
ECE: Z1073
ECS: ECs0926
ECF: ECH74115_0999
ETW: ECSP_0946(ybjK)
ELX: CDCO157_0902
EOI: ECO111_0915(ybjK)
EOJ: ECO26_0973(ybjK)
EOH: ECO103_0890(ybjK)
ECOO: ECRM13514_0923
ECOH: ECRM13516_0878
ESL: O3K_17115
ESO: O3O_08175
ESM: O3M_17090
ECK: EC55989_0891(ybjK)
ECG: E2348C_0797(ybjK)
EOK: G2583_1076(ybjK)
ELR: ECO55CA74_05235
ELH: ETEC_0913
ECW: EcE24377A_0918
EUN: UMNK88_887
ECP: ECP_0860
ENA: ECNA114_0788(ybjK)
ECOS: EC958_0958(ybjK)
ECV: APECO1_1247(ybjK)
ECOA: APECO78_07900
ECX: EcHS_A0908
ECM: EcSMS35_0873
ECY: ECSE_0904
ECR: ECIAI1_0885(ybjK)
ECQ: ECED1_0810(ybjK)
EUM: ECUMN_1036(ybjK)
ECT: ECIAI39_0825(ybjK)
EOC: CE10_0869(ybjK)
EBR: ECB_00813(ybjK)
EBL: ECD_00813(rcdA)
EBE: B21_00830(ybjK)
EBD: ECBD_2777
ECI: UTI89_C0849(ybjK)
EIH: ECOK1_0848
ECZ: ECS88_0863(ybjK)
ECC: c0931(ybjK)
ELO: EC042_0937
ELN: NRG857_03810
ESE: ECSF_0771
ECL: EcolC_2796
EKO: EKO11_3039
EKF: KO11_19540(ybjK)
EAB: ECABU_c08870(ybjK)
EDH: EcDH1_2796
EDJ: ECDH1ME8569_0798(ybjK)
ELU: UM146_13420
ELW: ECW_m0904(ybjK)
ELL: WFL_04400(ybjK)
ELC: i14_0895(ybjK)
ELD: i02_0895(ybjK)
ELP: P12B_c0830
ELF: LF82_2660(ybjK)
ECOL: LY180_04455
ECOI: ECOPMV1_00848
ECOJ: P423_04200
EFE: EFER_0987(ybjK)
EAL: EAKF1_ch0627c
EMA: C1192_08065
ESZ: FEM44_18760
STY: STY0902
STT: t2027
SEX: STBHUCCB_21420
SENT: TY21A_10290
STM: STM0869
SEO: STM14_1020
SEV: STMMW_09201
SEY: SL1344_0845
SEM: STMDT12_C09250
SEJ: STMUK_0875
SEB: STM474_0895
SEF: UMN798_0945
SETU: STU288_10055
SETC: CFSAN001921_12660
SENR: STMDT2_08451
SEND: DT104_08841
SENI: CY43_04655
SEEN: SE451236_10380
SPT: SPA1893
SEK: SSPA1763
SPQ: SPAB_02621
SEI: SPC_0868
SEC: SCH_0863(ybjK)
SEH: SeHA_C1002
SHB: SU5_01538
SEEH: SEEH1578_13745
SEE: SNSL254_A0941
SENN: SN31241_19240
SEW: SeSA_A1021
SEA: SeAg_B0905
SENS: Q786_04205
SED: SeD_A0973
SEG: SG0850
SEL: SPUL_2099
SEGA: SPUCDC_2085
SET: SEN0815
SENA: AU38_04235
SENO: AU37_04220
SENV: AU39_04225
SENQ: AU40_04705
SENL: IY59_04295
SENJ: CFSAN001992_07090
SEEC: CFSAN002050_10895
SEEP: I137_09555
SENB: BN855_8500
SENE: IA1_04430
SENC: SEET0819_11280
SBG: SBG_0747
SBZ: A464_829
SALZ: EOS98_14840
SFL: SF0799
SFX: S0842
SFV: SFV_0831
SFE: SFxv_0868
SFN: SFy_1082
SFS: SFyv_1124
SSN: SSON_0831
SBO: SBO_0742
SBC: SbBS512_E2499
SDY: SDY_0750
SDZ: Asd1617_00938
SHQ: A0259_08185
ENC: ECL_02872
ENO: ECENHK_07240
ECLO: ENC_18660
ENL: A3UG_07135
ECLG: EC036_13850
ECLE: ECNIH2_07995
ECLN: ECNIH4_15400
ECLI: ECNIH5_07025
ECLX: LI66_07100
ECLY: LI62_07845
ECLZ: LI64_07405
EHM: AB284_17910
EXF: BFV63_07055
ECLA: ECNIH3_07045
ECLC: ECR091_07025
EAU: DI57_11660
EKB: BFV64_06955
EEC: EcWSU1_01401(ybjK)
ELG: BH714_03140
ECAN: CWI88_15125
ERN: BFV67_06700
ECLS: LI67_007955
ECHG: FY206_08325
ESH: C1N69_07065
ENT: Ent638_1337
EAS: Entas_1332 Entas_1984 Entas_4501
ENR: H650_23050
ENX: NI40_006675
ENF: AKI40_2323
EBG: FAI37_22420
END: A4308_11095
ESA: ESA_02492
CSK: ES15_2588(ybjK)
CSZ: CSSP291_11635
CSJ: CSK29544_03797
CCON: AFK62_06715
CDM: AFK67_06905
CSI: P262_03771
CMJ: AFK66_012970
CUI: AFK65_06665
CMW: AFK63_11935
CTU: CTU_14490(ybjK)
KPN: KPN_00877(ybjK)
KPU: KP1_1839(ybjK)
KPM: KPHS_17120
KPP: A79E_3362
KPH: KPNIH24_20210
KPZ: KPNIH27_08080
KPV: KPNIH29_08780
KPW: KPNIH30_08805
KPY: KPNIH31_08680
KPG: KPNIH32_08910
KPC: KPNIH10_08585
KPQ: KPR0928_08480
KPT: VK055_1649
KPE: KPK_3687
KPO: KPN2242_07210
KPR: KPR_3707
KPJ: N559_3452
KPI: D364_04605
KPA: KPNJ1_03697
KPS: KPNJ2_03685
KPX: PMK1_03213
KPB: FH42_25445
KPNE: KU54_017850
KPNU: LI86_17675
KPNK: BN49_1930
KVA: Kvar_3500
KPK: A593_18895
KVD: KR75_16350
KVQ: SP68_22945
KOX: KOX_15610
KOE: A225_1972
KOY: J415_21985
KOM: HR38_14145
KMI: VW41_06890
KOK: KONIH1_09690
KOC: AB185_26800
KQU: AVR78_13115
EAE: EAE_14820
EAR: CCG31002
KQV: B8P98_18885
KLL: BJF97_10005
KLW: DA718_18915
CRO: ROD_08521
CKO: CKO_02263
CFD: CFNIH1_14355
CBRA: A6J81_08740
CWE: CO701_14530
CYO: CD187_15720
CPOT: FOB25_03420
CFQ: C2U38_08400
CAMA: F384_03930
CAF: AL524_18370
CIF: AL515_08835
CFAR: CI104_08650
CIR: C2U53_18385
CIE: AN232_22085
CPAR: CUC49_04040
ROR: RORB6_10795
RON: TE10_10105
RAO: DSD31_17220
RTG: NCTC13098_05127
REE: electrica_03447
CNT: JT31_05485
CEM: LH23_12455
CEN: LH86_11855
CLAP: NCTC11466_03096
ESC: Entcl_2970
KLE: AO703_07455
KSA: C813_07400
KOR: AWR26_16785
KRD: A3780_07475
KGO: CEW81_16455
KIE: NCTC12125_02133
LAX: APT61_15410
LEI: C2U54_12095
LEH: C3F35_04390
LEE: DVA44_16470
LER: GNG29_07300
LEA: GNG26_06925
LAZ: A8A57_07185
LEF: LJPFL01_1404
LNI: CWR52_05180
LEW: DAI21_19500
BUF: D8682_07930
METY: MRY16398_38920
AHN: NCTC12129_01785(ybjK)
YRE: HEC60_01350
EBF: D782_2966
EBC: C2U52_27855
EBU: CUC76_06935
PATR: EV46_10655
PATO: GZ59_23430
PCT: PC1_2089
PCC: PCC21_021330
PCV: BCS7_10665
PWA: Pecwa_2375
PPAR: A8F97_06755
PEC: W5S_2354
PWS: A7983_19280
PPOA: BJK05_05405
PBRA: B5S52_11280
PPUJ: E2566_11000
SOD: Sant_1019
DDC: Dd586_4006
DSO: A4U42_19705
DFN: CVE23_11305
BNG: EH206_10400
PANP: PSNIH2_14175
PALH: B1H58_03230
PANS: FCN45_23085
PGZ: C2E15_04575
PCD: C2E16_04510
KIN: AB182_16870
PDZ: HHA33_19400
XSA: SB85_13760
XVE: BJD12_01725
PAG: PLES_30891
PNC: NCGM2_3218
PSG: G655_13970
PRP: M062_11595
PAEP: PA1S_14545
PAEM: U769_14145
PAEL: T223_15775
PAES: SCV20265_3138
PAEU: BN889_06532
PAEG: AI22_19240
PFO: Pfl01_2752
PLUL: FOB45_05745
PDR: H681_19785
PCP: JM49_15345
PSEC: CCOS191_2900
PSET: THL1_3495
PAGR: E2H98_08675
SLO: Shew_2383
SWD: Swoo_2858
SWP: swp_1960
SMAV: CFF01_07390
CPS: CPS_2264
COM: CMT41_09935
COZ: A3Q34_02420
COV: EKO29_12360
THT: E2K93_12810
THAP: FNC98_11100
SAGA: M5M_07495
OSG: BST96_03515
MTHD: A3224_03100
MAGA: Mag101_14115
MHYD: GTQ55_04530
ZPL: ZBT109_0117
ODI: ODI_R3926
KGY: EHF36_12165
SUTK: FG381_04570
DAL: Dalk_0729
DALK: DSCA_29200
ACP: A2cp1_3073
ANK: AnaeK_2968
MXA: MXAN_2234
MYM: A176_004823
CFUS: CYFUS_001360
SCL: sce1385
SCU: SCE1572_39815
RBS: RHODOSMS8_03490(rcdA)
BSYM: CIT39_03640
RPX: Rpdx1_2805
MRD: Mrad2831_1768
MOR: MOC_2169
MAQU: Maq22A_c19805
MPHY: MCBMB27_01396
MEE: DA075_27170
METX: A3862_22040
MMES: MMSR116_00490
MTEA: DK419_14035
PPRU: FDP22_00185
HBA: Hbal_2286
STAX: MC45_17320
SPLK: AV944_06345
GXL: H845_783
KEU: S101446_00124 S101446_03110
NAO: Y958_15005
PMW: B2K_08295
MTV: RVBD_3066
MRA: MRA_3099
MTF: TBFG_13083
MTB: TBMG_00901
MTK: TBSG_00907
MTZ: TBXG_000893
MTG: MRGA327_18855
MTI: MRGA423_19100
MTE: CCDC5079_2822
MTUR: CFBS_3234
MTL: CCDC5180_2787
MTO: MTCTRI2_3129
MTD: UDA_3066
MTN: ERDMAN_3356
MTJ: J112_16425
MTUB: MT7199_3100
MTUC: J113_21360
MTUE: J114_16400
MTX: M943_15825
MTUH: I917_21530
MTUL: TBHG_02996
MTUT: HKBT1_3221
MTUU: HKBT2_3226
MTQ: HKBS1_3232
MBO: BQ2027_MB3093
MBB: BCG_3091
MBT: JTY_3086
MBM: BCGMEX_3088
MBK: K60_031820
MBX: BCGT_2916
MAF: MAF_30730
MCE: MCAN_30911
MCQ: BN44_60579
MCV: BN43_60055
MCX: BN42_41080
MCZ: BN45_60054
MSA: Mycsm_02165
MUL: MUL_0675 MUL_3426
MMC: Mmcs_1824
MKM: Mkms_1871
MJL: Mjls_1805
MMI: MMAR_0923 MMAR_1611
MMAE: MMARE11_08740 MMARE11_15280
MLI: MULP_00953 MULP_01755
MKN: MKAN_22915
MYE: AB431_24460
MHAD: B586_16110
MYN: MyAD_06340
MDX: BTO20_33650
MGRO: FZ046_24405
MNE: D174_06470
MGO: AFA91_19730
MLL: B1R94_14325 B1R94_23800
MIZ: BAB75_18200
MSAO: MYCSP_15570
ASD: AS9A_1543 AS9A_2471
CCN: H924_05560
CFN: CFAL_02800
CGY: CGLY_14120
CKU: UL82_00555
CCJ: UL81_10750
CFK: CFRA_07040
CPEG: CPELA_09270
CXE: FOB82_01295
NFA: NFA_33250
NFR: ERS450000_00723
NCY: NOCYR_4133
NBR: O3I_008510 O3I_036715
NSR: NS506_03751
NTP: CRH09_18575 CRH09_26940
NOZ: DMB37_14755
NOD: FOH10_00080 FOH10_18200
RER: RER_37300
REY: O5Y_17195
REB: XU06_17405
REQ: REQ_03570 REQ_10380 REQ_29230
RPY: Y013_01390 Y013_06405
RHB: NY08_2222 NY08_4008
RAV: AAT18_16040
RFA: A3L23_02177(rcdA_2)
RHW: BFN03_02410
RHS: A3Q41_01204(rcdA_1)
RRZ: CS378_05650
RHQ: IM25_15450 IM25_20425
RHOD: AOT96_28775
RBY: CEJ39_12150 CEJ39_17320
GPO: GPOL_c18680 GPOL_c46090
GOR: KTR9_4031
GOQ: ACH46_00680
GTA: BCM27_21175
GOC: CXX93_02630
TPR: Tpau_0140
TSM: ASU32_01365 ASU32_03700
DIT: C3V38_15650
DIZ: CT688_09760
DPC: A6048_09970
DLU: A6035_09515
TOY: FO059_12665
SALB: XNR_0895
SGR: SGR_3387
SGB: WQO_18810
SSX: SACTE_0759 SACTE_1338
SVL: Strvi_7007
SFA: Sfla_2750 Sfla_4908
SBH: SBI_08056 SBI_09488
SHY: SHJG_1782
SHO: SHJGH_1547
SDV: BN159_0744
STRP: F750_1774 F750_4048
SFI: SFUL_1474 SFUL_3238
SCI: B446_03245
SRC: M271_36750
SALU: DC74_2392
SALL: SAZ_13310
SLV: SLIV_01720 SLIV_16120
STRE: GZL_06616
SCW: TU94_03470
SLD: T261_7697
SXI: SXIM_05350 SXIM_54360
STRM: M444_35535
SAMB: SAM23877_0452(ybjK) SAM23877_0690(ybjK)
SPRI: SPRI_0655
SCZ: ABE83_19840 ABE83_28485
SCX: AS200_42620
STRF: ASR50_13940
SLE: sle_62000(sle_62000)
SPAV: Spa2297_01165
STSI: A4E84_37275
SNR: SNOUR_30785
STRD: NI25_35805
SNW: BBN63_01045
SAUO: BV401_12785
SSIA: A7J05_34355
SVU: B1H20_06435 B1H20_15435
SPUN: BFF78_02865
SGV: B1H19_11530
SMAL: SMALA_1862 SMALA_7699
SALF: SMD44_01083 SMD44_04495
SALJ: SMD11_5118
SGE: DWG14_08101(rcdA_2)
SKY: D0C37_05930
KAB: B7C62_06300 B7C62_15260
LXL: KDY119_03585
CMI: CMM_2385
MTS: MTES_1161
MIO: AOA12_01745
MIP: AXH82_08875
MAUR: BOH66_07040
MFOL: DXT68_02265
MOO: BWL13_01880(rcdA_1)
RFS: C1I64_18780
AGY: ATC03_06960
LYD: D7I47_09270
LYK: FLP23_05770
PLAP: EAO79_17865
LEU: Leucomu_02290
LTR: EVS81_06360
LEB: G7066_04340
ARM: ART_1018
ARE: AL755_12715 AL755_13150
ARW: MB46_08825
ARQ: BWQ92_13170
ARI: UM93_10805
ACH: Achl_3582
GAR: AOZ07_11675
BCV: Bcav_2126
BFA: Bfae_22570
BRX: BH708_12540
BRV: CFK39_10550
BRZ: CFK38_00150
BRR: C1N80_03415
JDE: Jden_0532
IDO: I598_2318
CET: B8281_04565
CCEU: CBR64_06995
SKE: Sked_18410
SANW: G7063_07760
CFI: Celf_0388
CGA: Celgi_2991
CEZ: CBP52_12300
CEJ: GC089_08585
CELH: GXP71_18395
OEK: FFI11_007360 FFI11_008145
JLI: EXU32_16400
DCO: SAMEA4475696_2117(yvdT)
PPC: HMPREF9154_2134
ACIJ: JS278_02886(rcdA)
MPH: MLP_08440 MLP_08470 MLP_20720 MLP_26700
KFL: Kfla_4836
AER: AERYTH_03905 AERYTH_15995
MGG: MPLG2_3133
NDA: Ndas_4304 Ndas_4528
NAL: B005_3707
NGV: CDO52_11285
STRR: EKD16_09815 EKD16_22520
SRO: Sros_4477 Sros_7862 Sros_9052
NOA: BKM31_15700 BKM31_22600
NOW: GBF35_23660 GBF35_26270
BSD: BLASA_1041
SEN: SACE_1466 SACE_5370
SACE: GIY23_09030
SACG: FDZ84_22615
SVI: Svir_19020 Svir_31710
SACC: EYD13_00945
AMD: AMED_6218
AMN: RAM_31900
AMM: AMES_6128
AMZ: B737_6128
AJA: AJAP_15290
AMQ: AMETH_4496
AMYB: BKN51_02930 BKN51_16670
AAB: A4R43_10475 A4R43_21205
AMYY: YIM_08230 YIM_20630 YIM_26630
PDX: Psed_2171
PSEE: FRP1_13405
PSEQ: AD006_21085
PECQ: AD017_00665
PHH: AFB00_01790
PAUT: Pdca_04520 Pdca_06290
APRE: CNX65_14065 CNX65_19925
AMI: Amir_2779 Amir_3979
SESP: BN6_78490
SSYI: EKG83_29510
KPHY: AOZ06_05430 AOZ06_29525
AHM: TL08_05415 TL08_16500
ACTI: UA75_22570
ACAD: UA74_22095
AHG: AHOG_14825 AHOG_20245(kstR3)
ACTA: C1701_04405 C1701_08340
ALO: CRK58047
PMAD: BAY61_11895
ASE: ACPL_2966
AMS: AMIS_34600
AFS: AFR_01990
ACTS: ACWT_2580
SNA: Snas_0096 Snas_4038
TPY: CQ11_05495
TPYO: X956_02200
ANE: AN27039_2626
FLH: EJ997_00480 EJ997_10040
BBP: BBPR_0958
BBI: BBIF_0916
BBF: BBB_0897(ybjK)
BSCA: BBSC_0896
BGX: ESN35_02880
TBI: Tbis_1763
AEY: CDG81_03895 CDG81_08840
CWO: Cwoe_3555
LUO: HHL09_23195
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Shimada T, Katayama Y, Kawakita S, Ogasawara H, Nakano M, Yamamoto K, Ishihama A
  Title
A novel regulator RcdA of the csgD gene encoding the master regulator of biofilm formation in Escherichia coli.
  Journal
Microbiologyopen 1:381-94 (2012)
DOI:10.1002/mbo3.42
  Sequence
[ecj:JW5114]

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Gene (663)   
   KEGG GENES (663)   
Protein sequence (153)   
   UniProt (152)   
   SWISS-PROT (1)   
All databases (818)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system