KEGG T06755: LACOL

Paucilactobacillus oligofermentans: LACOL_1258

Entry

LACOL_1258        CDS       T06755

Symbol

mutS

Name

(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS

K03555

DNA mismatch repair protein MutS

Organism

lol Paucilactobacillus oligofermentans

Pathway

lol03430

Mismatch repair

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:lol00001]
09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    LACOL_1258 (mutS)
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:lol03400]
    LACOL_1258 (mutS)
DNA repair and recombination proteins [BR:lol03400]
Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     LACOL_1258 (mutS)

SSDB

Motif

Pfam:

MutS_V MutS_III MutS_I MutS_IV MutS_II nSTAND3 AAA_14 AAA_29 Rad17 AAA_23 DUF6738 AAA_22 Lumazine_bd_2 ATPase_2

Other DBs

NCBI-ProteinID:

CUS26566

UniProt:

A0A0R1RUG2

Position

I:complement(1279978..1282578)

AA seq 866 aa
MPQKTKETPMMQQYQAIKDQYQDAFLFYRLGDFYELFNEDAIKGAQILELTLTTRNKSAI
DPIPMCGVPHHAAENYIDILVDKGYKVAVCEQVEDPKEAKGMVKREVIRLVTPGTQMDIK
GDQTHDNNYLTAVLICNGEFGLAYTDLSTGELKTTILASADAVINEMINLRTKEVVIDDS
INDDLQRKFNQQSILISQQNEITDNSELSFLVQDLEQTTQEKVVSLLISYLITTQKRALD
HLQRAVSYETSYFLKMDHYSKYNLELTTNIRSGKKQGTLSWLLDETKTAMGSRLLKQWLD
RPLLDQSAIENRQDKVEELLNHYFERSNLQEELTKVYDLERLAGRVAYGSVNGRDLIQLL
TSLEQVPKISYVLESLNAPTFNALVKGMDPLADIAAMIKNSVAEEPPISITDGGVIKDGY
NDVLDQYRDAMKNGKQWIASLEAKERKETGISNLKIGFNRVFGYYIEVSKGNIGKLAEGR
YERKQTLTNAERFSTPELKEREALILEAQEKSTALEYELFAEIRNNVKLAIDRLQKLAKV
ISELDVIQSFAVVSETYHFVRPEFSDSHTLSIKDGRHPVVEKFMGHQAYVPNDVSMDSET
NILLITGPNMSGKSTYMRQLALTVVMAQMGCFVPAKEAKLPIFDQIFTRIGAADDLISGQ
STFMVEMQEANNALSHASSNSLILFDELGRGTATFDGMALAQSIIEYLHEKVHAKTLFST
HYHELTVLDKSLKNLKNVHVGAVEKDGELVFIHKVEDGPADQSYGIHVAKLAGMPTSLLS
RASVILSQLEDEKVELPDAVHDETQTTVVNSENKGKITDNQMELFQTVELDPKYEQVIDQ
IKKLNLMSMTPMDVMNMIYEWQNKIQ

NT seq 2601 nt +upstreamnt +downstreamnt
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tatcaagacgcgtttttattttaccgactcggtgatttttatgagttatttaatgaagat
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