KEGG   Lacinutrix venerupis: BWR22_12705
Entry
BWR22_12705       CDS       T04680                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K19721  collagen type V/XI/XXIV/XXVII, alpha
Organism
lvn  Lacinutrix venerupis
Pathway
lvn04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lvn00001]
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    BWR22_12705
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:lvn00536]
    BWR22_12705
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:lvn00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   BWR22_12705
SSDB
Motif
Pfam: Collagen DUF903 POLO_box Cadherin_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: APY01131
Position
2816969..2821180
AA seq 1403 aa
MKKILLLFTFLLVTNLFAQVKVGENPQSINPNSILELESTDKVLVVTRISTAQMNALNPL
NGAIIYNTDENCLFQYNNNTWSSLCVNVMDNETVTSLIDNNDGTISYTSEDGSTTTIIKS
NLIDNNDGTYTFNNGNGAPVTIDIPSLETLTSITLNPNNTTIDYIDEDGTLTQLNLSNIV
SNLETATTLVDNGDGTVTYTNENNVTTTVGIVGPQGEVGPQGPQGPAGLNGADGAQGPQG
EQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPAGTNGADGAQGPQGEQGPQGEQGIQGETGPQGPAG
INGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGEQGPAGTNGADGAQGPQGAQGIQGETGPQG
ETGPQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGEQGPAGINGADGAQGPQGEQG
IQGETGPQGPQGPQGEVGPQGEQGPAGANGTDGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGEVG
PQGPQGPAGTNGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGINGADGAQGPQGEQG
IQGETGPQGEVGPQGEQGPAGANGTDGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGTNG
ADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVG
PQGEQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGINGADGAQGPQGEQG
IQGETGPQGEVGPQGPQGPAGTNGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEQGPQGPQGPAGTNG
ADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVG
PQGEQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGPQGPQGEVGPQGEQGPAGTNGADGAQG
PQGEQGIQGETGPQGEQGPQGPQGPAGTNGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEQGPQGPQG
PAGTNGADGVQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGTNGADGAQGPQGEQGIQGETG
PQGEVGPQGEQGPAGINGADGSQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGPAGTNGADGAQG
PQGEQGIQGETGPQGEVGPQGEQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGPQGPQGEVG
PQGEQGPAGTNGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGPQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETG
PQGEVGPQGPQGPAGINGADGAQGPQGEQGIQGETGPQGEVGPQGPQGEQGIQGPVGPSN
AYVGQFIITATGNQTITGIPFEPSSITFVAHANVETLDIDADNGVGNNNTGIANSFGTMN
GFARNDSGTITQQVIYVGGSGNSINDISRFASSSRCIGLRYGNQNGDAVGRTLASLTSFN
ANGFTINVTNKSDNVVVIFTAYK
NT seq 4212 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaatcctactactattcacatttctattagtaactaatttatttgctcaagtt
aaggttggtgaaaaccctcaatccataaacccaaactctattcttgaattagaaagcaca
gataaagttttagttgtaacaagaatttctacagctcagatgaacgctctaaatccacta
aatggagctattatttacaatactgacgaaaattgcttattccaatataataacaataca
tggtcaagtttatgtgttaatgtaatggataatgaaactgttacttcattaatagataat
aatgatggaactattagttataccagcgaagatgggtctacaacaacaattattaagtct
aatcttatagataataatgatggaacttatacttttaacaatggtaatggcgctcctgtt
acaatagatataccttcactagaaactttaacatcaattactttaaacccaaacaatacc
actattgactatatagatgaagatggtacacttacacaattaaatctttcaaatattgtg
tctaacttagaaactgctacaactctagttgataatggagatggtacagttacttatacc
aatgaaaacaatgtaacaactactgttggaattgttggtcctcaaggtgaagttggtcct
caaggccctcaaggtcctgctggattaaatggtgcagatggtgctcagggtcctcaaggt
gaacaaggcccacaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggacctcaaggtgaagtt
ggtcctcaaggtcctgctggaacaaatggtgctgatggtgctcagggtcctcaaggtgaa
caaggcccacaaggtgaacaaggtattcaaggtgaaactggtcctcaaggtcctgctgga
ataaatggtgcggatggcgctcaaggcccacaaggtgaacaaggtattcaaggtgaaact
ggacctcaaggtgaagttggtcctcaaggagaacaaggtcctgctggaacaaatggtgca
gatggcgctcaaggcccacaaggtgcgcaaggtattcagggtgaaactggacctcaaggt
gaaactggaccacaaggtcctgctggaataaatggtgcagatggcgctcaaggcccacaa
ggtgaacaaggtattcaaggtgaaactggacctcaaggtgaagttggtcctcaaggagaa
caaggtcctgctggaataaatggtgcagatggtgctcagggtcctcaaggtgagcaaggt
attcaaggtgaaactgggcctcaaggtccacaaggtcctcaaggtgaagttggacctcaa
ggagaacaaggtcctgctggagcaaatggtactgacggtgctcagggtcctcaaggtgag
caaggtattcaaggtgaaactggtcctcaaggtgaagttggtcctcaaggtgaagttggt
cctcaaggtccacaaggtcctgctggaacaaatggtgcggatggcgctcaaggtccacaa
ggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggacctcaaggtgaagttggtcctcaaggccca
caaggtcctgctggaataaatggtgcagatggcgctcaaggcccacaaggtgaacaaggt
attcaaggtgaaactggacctcaaggtgaagttggtcctcaaggagaacaaggtcctgct
ggagcaaatggtactgacggtgctcagggtcctcaaggtgagcaaggtattcaaggtgaa
actggtcctcaaggtgaagttggtcctcaaggtccacaaggtcctgctggaacaaatggt
gcggatggcgctcaaggtccacaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggacctcaa
ggtgaagttggtcctcaaggcccacaaggtcctgctggaataaatggtgcagatggcgct
caaggcccacaaggtgaacaaggtattcaaggtgaaactggacctcaaggtgaagttggt
cctcaaggagaacaaggtcctgctggaataaatggtgcagatggtgctcagggtcctcaa
ggtgagcaaggtattcaaggtgaaactgggccacaaggtgaagttggtcctcaaggtcca
caaggtcctgctggaataaatggtgccgacggtgctcaaggtcctcaaggtgagcaaggt
attcaaggtgaaactggtcctcaaggtgaagttggtcctcaaggtccacaaggtcctgct
ggaacaaatggtgctgacggtgctcagggtcctcaaggtgaacaaggtattcaaggtgaa
actggacctcaaggtgaacaaggtcctcaaggtccacaaggtcctgctggaacaaatggt
gcggatggcgctcaaggtccacaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggacctcaa
ggtgaagttggtcctcaaggcccacaaggtcctgctggaataaatggtgcagatggcgct
caaggcccacaaggtgaacaaggtattcaaggtgaaactggacctcaaggtgaagttggt
cctcaaggagaacaaggtcctgctggaataaatggtgcagatggtgctcagggtcctcaa
ggtgagcaaggtattcaaggtgaaactgggcctcaaggtccacaaggtcctcaaggtgaa
gttggacctcaaggagaacaaggtcctgctggaacaaatggtgctgacggtgctcagggt
cctcaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggtcctcaaggtgaacaaggtcctcaa
ggtccacaaggtcctgctggaacaaatggtgctgacggtgctcagggtcctcaaggtgaa
caaggtattcaaggtgaaactggacctcaaggtgaacaaggtcctcaaggtccacaaggt
cctgctggaacaaatggtgcagatggcgttcaaggcccacaaggtgagcaaggtattcaa
ggtgaaactggacctcaaggtgaagttggtcctcaaggccctcaaggtcctgctggaaca
aatggcgcagatggtgctcaaggcccacaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactgga
cctcaaggtgaagttggtcctcaaggagaacaaggtcctgctggaataaatggtgctgac
ggttctcaaggcccacaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggaccacaaggtgaa
gttggtcctcaaggtccacaaggtcctgctggaacaaatggtgctgacggtgctcagggt
cctcaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggtcctcaaggtgaagttggtcctcaa
ggagagcaaggtcctgctggaataaatggtgcagatggtgctcagggtcctcaaggtgag
caaggtattcaaggtgaaactggtcctcaaggtcctcaaggtcctcaaggtgaagttgga
cctcaaggagaacaaggtcctgctggaacaaatggtgcagatggtgctcagggtcctcaa
ggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggtcctcaaggcccacaaggtcctgctggaata
aatggtgcagatggcgctcaaggcccacaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggg
ccacaaggtgaagttggtcctcaaggtccacaaggtcctgctggaataaatggtgccgac
ggtgctcaaggtcctcaaggtgagcaaggtattcaaggtgaaactggaccacaaggtgaa
gttggtcctcaaggcccacaaggtgagcaaggtattcaaggtccagtaggcccttctaat
gcttatgttggacaatttattattacagcaactgggaaccaaactataacaggaatacca
tttgaaccatcatcgataacatttgttgctcatgcgaatgtagaaacattagatatagac
gcagacaacggtgtaggcaataataacacaggcattgctaactcttttggaacaatgaat
ggctttgctagaaatgactctggaacgataacacaacaagtaatttatgtaggtggaagt
ggtaattctattaacgatatttcaagattcgcttcaagctctagatgtattggtttaaga
tatggtaatcaaaatggtgatgctgttggaagaacactagctagcttaacttcatttaac
gctaatggatttacaataaatgtaactaacaaatcagataatgttgttgtaatatttact
gcttataaataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (124)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (121)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (132)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system