KEGG   Musca domestica (house fly): 101895032
Entry
101895032         CDS       T03448                                 
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(III) chain
  KO
K06237  collagen type IV alpha
Organism
mde  Musca domestica (house fly)
Pathway
mde04512  ECM-receptor interaction
mde04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mde00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    101895032
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    101895032
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome [BR:mde04147]
    101895032
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:mde00536]
    101895032
Exosome [BR:mde04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other cancer cells
   101895032
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:mde00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   101895032
SSDB
Motif
Pfam: Collagen C4
Other DBs
NCBI-GeneID: 101895032
NCBI-ProteinID: XP_005183728
UniProt: A0A1I8N2Z5
Position
Unknown
AA seq 1831 aa
MLPLPRGLLGLLGANATPKWHRQQQQQLTMKSVFLVLCLVLLSGQFADAKEQQQQPDRNC
GGLACDCKGLKGRPGDIGLPGFQGYEGPAGDMGPPGPPGRPGEWGDAGEYGEQGEKGHRG
DAGEPGLPGAPGVRGPPGEDGPHGPRGIDGCAGKPGKHGDNGAPGRHGPRGDVGKPGPPG
PQGDAGEGGINSKGTKGSRGDRGPDGYDGQTGFPGMKGYKGDIGFPGADGPKGEMGPKGF
KGEMAEDANIILQLQGEQGEKGEPGEAEEFPFEPNGNIPKGYAGDVGERGDQGRKGEQGE
KGDMGRDGFPGARGDSGEPGERGKPGKPGETGFPGAKGVKGAPGYNGRDGEDGLKGEMGD
DGYDGIPGVQGYAGPPGIYDPNLDESLPGPIGPQGDIGPPGDPGLPGIPGKQGRLGPRGN
TGPPGDPGLPGMPGRRGISIKGDEGDYGFMGPAGPMGNPGRPGPVGRPGARGADGRNVVG
PKGYAGQPGMPGLPGHRGDRGEIGFSGEKGLPGLGVNIVGPPGAHGPPGVRGPPGIDGQP
GYRGLTGDKGVRGDDCGICPAGPKGMRGIRGDDGFPGVHGVTGPHGLPGERGPKGQQGKP
GFMGFKGQPGPDGIPGESGRPGMPGPPGKVMRVGSLTKAEKGDMGDMGERGVQGLTGDRG
LNGAHGLHGQKGERGIRGDFGEPGRPGRDGAPGKPGKDGRPGRDANTPKLYLIGEKGYDG
RKGVAGEPGDMGPKGEKGQPHPGEIFDNRGEPGDVGEPGPRGPQGPKGERGTNGDNGERG
DIGLPGIVIQGPMGAKGYPGVTGEVGLHGAHGMEGLDGAPGIDGVAGVKGVRGDPGPYIL
PGEMGPDGPEGPKGMYGDMGFRGRPGVTGRPGVKGVRGEKGDIGPYGLQGLPGNKGVIGD
TLVGFQGAAGEPGINGRIAPHGRKGQKGETGVPGVQGVQGAKGDIGFPGRRGPHGDRGFQ
GIPGVIGMQGLVGIPGEQGERGELGEDGRHGDMGQRGSIGSMGPKGQMGDVGPYGRRGND
GIPGRKGVEGDRGYPGRVGAKGFASRSGIKGEYGEPGQRGPRGYDGMPGEKGVQGAPGDE
AYGQDGPMGRKGETGAPGVDGINGLDGLKGMRGDYGIMGLIGAIGDRGDKGQPGYPGRPG
LPGIDGAVGPMGEMGYQGQVGERGDEGYAGYVGQIGDRGDAGEPGAFGPKGEQGDEGFPG
RPGVLLAGYAQRGDKGQPGLRGQQGPMGETGMEGAPGYPGRKGERGDFGFAGAPGADGYP
GVDGERGDKGYPGPPGMTPDYAEPGDEGDVGYDGLPGRPGRVGPKGAPGDMGDYGFNGIK
GEMGMSIMGPKGMQGDIGYPGPPGHNGLHGMVGFKGERGDVGPQGMRGEPGYVIHGMRGD
RGDAGPPGARGPQGLKGEMGMHGRPGRTGPMGARGPRGPTGDAGFDGRNGLDGLPGPRGE
PGVTFPFHMARKGERGEPGIDGFKGEMGDVGAEGEVGFQGAYGLKGYQGERGLTGQMGLD
GPKGERGMQGPPGLAGFTGLAGAKGPEGDPAPPPPRPKSRGFIFARHSQSVLIPECPANT
NLMWVGYSLAGNIANSRAVAQDLGRSGSCLQRFSTMPYMTCDGSVCNYGQTNDDSMWLAT
DEPMNFAMVPIQANVIQKYISRCAVCETTTKVIALHSQSMSIPDCPNGWEEMWTGYSYFM
TTTDNTGGMGQNLVSPGSCLEEFRAQPIIECHGQGNCNLYNPVTSFWLAVIEEHEQWQMP
VQRTLKKDQTSKISRCSVCRRRNDSFVTRLERVDTSARELRRGYEQVVPAPQQHQPTYQR
RPNTNYHRRTGQNWPGRNYRSRYPRADTTAP
NT seq 5496 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctgccattgcccagaggcctattgggtctcttgggtgcaaatgccacccccaagtgg
catagacaacaacaacaacagctgacaatgaagtcagtgtttttggtattgtgcctcgtc
ttgctgagtggccaatttgcagatgcaaaggaacaacaacagcaacccgatagaaactgc
ggcggtttggcttgcgattgcaaaggtttgaagggacgtcccggtgatatcggtctgccc
ggtttccagggctatgaaggtccagccggtgatatgggtccacctggacctcccggtcgt
cccggtgaatggggtgatgctggcgagtacggtgaacaaggtgaaaagggtcatcgtggt
gatgctggtgaacctggtctacctggcgctcctggtgttcgtggtcctcccggcgaagat
ggtccacatggtccacgcggtattgatggctgtgccggcaaacccggtaaacatggtgac
aacggtgctcccggtagacacggtcctcgcggtgatgtcggcaaacccggccctccaggt
ccccaaggtgatgccggcgagggtggcatcaattcgaaaggtaccaagggtagccgcggt
gatcgtggccccgatggctatgacggccagactggtttccccggcatgaaaggttacaag
ggtgacattggtttccctggcgctgatggtcccaagggtgaaatgggtcccaagggtttc
aagggtgaaatggccgaagatgctaacatcattttgcagctgcaaggagaacaaggtgaa
aagggtgaaccgggtgaggccgaagaattcccattcgagccaaatggcaacattcccaaa
ggctatgccggtgatgtgggcgaacgcggtgaccaaggcagaaaaggtgaacagggtgaa
aagggtgacatgggtcgtgatggtttccccggcgctcgtggtgattccggcgaacccggt
gaacgtggtaaacctggtaagcccggtgagacgggtttccctggcgccaaaggtgtaaag
ggtgctcccggctacaatggcagagatggcgaagacggtcttaagggtgagatgggtgat
gatggctacgatggtattcccggtgttcagggttatgccggccctcctggtatttacgat
cccaatttggatgaatcgctgcccggtcccattggccctcagggtgatattggtcctccc
ggtgatccaggtctccccggtattcccggcaaacaaggtcgtctcggtccccgtggtaat
accggtccacccggtgatcccggtctacccggtatgcctggtcgtcgcggtatcagcatt
aagggtgatgaaggtgattacggatttatgggacctgctggtcccatgggtaaccccggt
cgtcctggtcccgttggccgtcccggtgcacgtggtgctgatggtcgcaatgtagttggt
cccaaaggttatgctggtcaaccgggtatgcctggtttgcctggacatcgtggtgatcgt
ggtgaaattggtttctccggtgaaaaaggtttgcccggtctgggtgttaacattgttggt
ccacctggcgcccacggtccccctggtgttcgtggtcctcctggtattgacggtcagcct
ggttatcgtggccttaccggtgacaagggtgttcgcggtgatgattgtggcatttgcccg
gccggacccaaaggcatgcgcggtattcgtggtgatgatggtttccctggtgtccatggc
gttactggtccccatggcttgcctggcgagcgtggacccaagggccaacaaggaaaacct
ggtttcatgggcttcaaaggtcaacccggtcccgatggtattcccggtgaaagtggcaga
cccggtatgcctggtcctccaggtaaagttatgagagttggctctttgacgaaggccgaa
aagggtgacatgggtgatatgggcgaacgtggagtacagggtctaactggtgatcgtggt
cttaacggtgctcacggtttacatggccagaaaggtgaaagaggcatacgcggtgatttc
ggtgagcccggcaggcctggacgagatggtgcccctggcaagccaggtaaagatggtcga
cctggtcgtgatgccaacactcccaagttgtatttgattggagaaaagggttacgatggt
cgcaagggtgtagccggtgagcctggtgatatgggtcccaagggtgaaaagggtcaaccc
catcccggtgaaatattcgacaacagaggcgaacctggtgatgttggtgagccaggtcca
cgtggtccccaaggtccaaaaggcgaacgcggtaccaatggcgataacggcgaacgcggt
gacattggtctgcctggtattgttattcaaggtcccatgggtgccaagggctatcctggc
gttaccggtgaagtgggtctccacggtgctcatggtatggagggtttggatggtgctcct
ggtatcgatggcgtggctggtgttaaaggtgttcgtggtgatcctggtccatacattcta
cctggcgagatgggtcctgacggtccagagggtcccaagggtatgtatggtgatatgggc
ttcagaggtaggcccggagtcactggcagacccggtgtgaagggtgtacgcggtgaaaag
ggcgacattggtccctatggtctacagggcttgcctggcaacaagggtgtcattggtgat
acattggtcggcttccaaggtgctgctggtgaaccaggtatcaatggccgtattgcccca
catggtcgcaagggtcaaaagggtgaaaccggtgttcccggtgtccagggtgtacaaggt
gccaagggtgatattggattccccggcagacgtggtcctcatggtgacagaggtttccag
ggcattcccggtgtcattggtatgcaaggtttggttggcattcctggtgagcaaggtgaa
cgcggtgagttgggagaagatggtcgtcacggagatatgggtcaaagaggttccattggc
tcgatgggtcccaaaggtcaaatgggtgatgttggtccctatggacgcagaggcaatgat
ggtatccccggccgcaagggtgtcgagggtgatcgcggttatcctggtcgtgttggtgct
aaaggttttgcctcgcgcagtggcatcaagggcgaatatggtgagccaggtcaacgtgga
cctcgtggttacgatggtatgcccggtgaaaagggtgttcaaggtgctcccggtgatgag
gcctatggccaagatggcccaatgggcagaaagggtgaaactggtgcacccggcgtggat
ggcatcaatggcttggatggtctcaagggtatgcgcggtgactatggtataatgggtctg
attggtgcaattggtgatcgcggcgacaagggccaacccggctatcctggaagacccggc
ctgccaggcattgatggagctgtgggtcccatgggtgaaatgggttatcaaggccaagtt
ggtgaacgcggtgacgaaggttatgctggctatgtgggacaaattggtgatcgcggtgat
gctggtgagccaggtgcctttggtcccaaaggtgaacagggtgatgaaggtttccctggt
cgtcccggtgttttgttggctggctatgcgcaaagaggtgacaagggtcaacctggtctc
agaggccaacagggtcccatgggtgagacgggtatggaaggtgccccaggttatcccggc
cgcaagggtgaacgtggcgactttggctttgctggagccccaggtgccgatggctatcca
ggtgtggatggtgaacgaggcgacaagggctatcccggtcctcctggtatgactcccgac
tatgctgagcccggtgatgaaggtgatgtgggttatgatggtttgcccggccgtcccgga
cgtgttggtcccaagggtgcccctggtgatatgggtgattatggcttcaatggcatcaag
ggtgaaatgggcatgagcatcatgggtcccaagggtatgcaaggtgatattggttatcct
ggcccacctggccacaatggtttgcacggcatggttggtttcaagggcgagcgtggtgat
gttggtccccagggcatgcgtggtgaacccggatatgttattcatggtatgcgcggtgat
cgtggtgatgctggtccgcccggtgctcgtggtccccaaggtttgaagggtgaaatgggt
atgcatggccgacctggtcgcaccggtcccatgggcgcacgtggtccccgcggtccaact
ggtgatgccggtttcgatggcagaaatggtttggatggcttgcccggtcctcgtggtgag
cccggtgtaacatttcccttccatatggcacgtaagggagaacgtggtgagcctggtatt
gatggcttcaagggtgaaatgggcgatgtgggcgcagaaggtgaagttggcttccaaggt
gcttatggcttgaagggttaccagggtgaacgtggtttgaccggtcaaatgggtttggat
ggtccaaagggtgaacgcggtatgcaaggtccaccaggtttggctggctttactggcttg
gccggtgccaagggtcccgagggtgatcccgccccaccaccaccacgtccaaagagtcgc
ggtttcattttcgcccgccattctcagtctgtgctgattcctgaatgtcccgccaacacc
aatctaatgtgggtgggttattcgctggccggtaatattgccaattcacgtgccgttgct
caagacttgggccgttccggttcgtgtttgcaacgtttcagcaccatgccgtatatgaca
tgtgacggcagtgtctgtaattatggccagaccaacgatgacagtatgtggctggccacg
gatgagccaatgaatttcgccatggttcccatccaggctaatgttattcagaaatacatt
tcacgttgtgctgtctgcgaaactaccaccaaggtaattgctttgcacagtcaaagcatg
agcattcccgactgtcccaatggctgggaggaaatgtggactggctacagttacttcatg
acaactaccgataacaccggcggtatgggtcaaaatcttgtctcacccggctcttgcttg
gaggaattccgtgcccaacccattattgagtgtcacggtcagggcaattgcaatttgtac
aatcctgtcacttcattctggttggccgtgatcgaagagcacgaacaatggcagatgcca
gtacaaagaacattgaagaaggatcagaccagtaagatcagcagatgttctgtgtgtcgt
cgtcgcaatgattcatttgtcacacgtctcgagcgagtcgatacctcggcccgtgaattg
agacgcggctatgagcaggtggtgccagctccacagcaacaccagcccacatatcaacgc
cggccaaataccaactatcacagacgaactggacaaaactggccaggccgcaactaccgt
agtcgttatcccagagccgataccacagctccttag

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (2)   
   KEGG PATHWAY (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (98)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (94)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (2)   
DNA sequence (6)   
   RefSeq(nuc) (2)   
   GenBank (2)   
   EMBL (2)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (115)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system