KEGG   Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_69331
Entry
NAEGRDRAFT_69331  CDS       T01241                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14327  regulator of nonsense transcripts 2
Organism
ngr  Naegleria gruberi
Pathway
ngr03013  Nucleocytoplasmic transport
ngr03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ngr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    NAEGRDRAFT_69331
   03015 mRNA surveillance pathway
    NAEGRDRAFT_69331
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ngr03019]
    NAEGRDRAFT_69331
Messenger RNA biogenesis [BR:ngr03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Surveillance factors
    Surveillance complex
     NAEGRDRAFT_69331
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     NAEGRDRAFT_69331
SSDB
Motif
Pfam: MIF4G CNOT11 DUF5327
Other DBs
NCBI-GeneID: 8852207
NCBI-ProteinID: XP_002675400
JGI: Naegr1_69331
UniProt: D2VKB1
AA seq 973 aa
MNEEKKAELRAKNEQALKGKRPDASFFKSLDASIKKNSAFVKKIKSLHELTPDQKVSIVP
DIQKLNLRRFISEIVQGFLEMPLKLEDVDIIVEIASSLHQLYAEFSESFVTSLVKSCKDS
DKKEPNLPRLHVVLLIITKLFITRMHDNFTIVGTVLKGFITINKKTSQSSILMPFLTEFQ
HDFLIGKSYDATKCFITEPEHKLINEQFLSFFETLCERLRSKQKEINEDEQAATTNIDDG
NTENLDKEKKKLKQWKKQYDLAKEAADILQSKIPSDIEDALLKVEDLSAKKEQQDKKDIL
TDNIDKFVNERTRQFYEEIPDINTLINDKNELENIVSMEDLLDKLPKRPPIDKLATTLAI
KYLNQKGNRTKLVKKMFSVNRTSLELLPYYSRLIAILNPLFKDVGKSLVQSLEEEFNKLF
EEQDQIKIETKVKNIRFLGELILFKICPEETGIEFLKKCLSQFHHHNIDVACHFLEVCGR
YLYAQSTSHLLMVELISKMMRIKDIKVLDVKYNTMIDSAYYNTVVNVDQEVEKPRTVFGE
DDELTQYVLHLLLSELNKYNINTVLKQLRKLPYDDFDRIKNIIKSILSHIRECAFGTIHL
MASVLGGLSRYHEEIGVVIIDLLLEEIRYSLQQEYIDNIELGINQNAEYIPSRLRSEQKR
IIDIKFLGEFYNYQLLDINVIMDVLYTLILYPTPLLPHKQDTFRLRLVCTLLDTCGPYFE
TSADRKKLDRFLLYLQRYVLSKQYRLPVDMENMLADTLDTVRPKLKWPKNLKEVVDKIDY
IEQKKPIPLPGQSKSNDPLSLWPINDHEDELSATAAAEEEDVVQDETEDSQNNSKSSTHK
DDDGGELDKELMEMINQSINERKYLTNNNIVKMGTLISKPQEMMTQAITPKIIHHQQPAH
HHHHQQHIQHTQHAQHAQHDSTNTSSSSPPPPMAQKITILSKQGRTNKAQEVFVAANVTK
LLRKDSNNNNTTQ
NT seq 2922 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgaagaaaagaaggctgaactccgagcaaagaatgaacaggccttgaaaggaaaa
agacccgatgcttctttctttaaatcattggatgcttctattaagaagaatagtgctttt
gtaaagaaaattaaatcattacatgaattaactcctgatcaaaaagtatcaattgtacct
gatattcaaaaattaaatcttcgtagatttattagtgaaattgttcaaggctttttagaa
atgccattaaaattggaagatgtagatattattgtagaaattgcatcatcacttcatcaa
ttatatgctgaattttctgaaagttttgttacatcacttgtaaaatcatgtaaagattct
gacaagaaggaacctaacctacctagattacacgttgtattattaattattactaaatta
ttcataactaggatgcacgataattttacaattgtaggaactgttttaaagggatttatt
acaatcaataagaaaacttcacaatcatcaattttaatgccttttttaacagaattccaa
catgactttttaattggaaaatcctatgatgctactaaatgttttatcactgaaccagaa
cacaaacttattaatgaacaattcttgtcattctttgaaacactttgtgaacgtttaaga
tctaaacaaaaggaaattaatgaagatgaacaagcagctacaacaaatattgatgatgga
aatactgaaaatcttgataaggaaaagaaaaagttgaaacaatggaagaaacaatacgat
ttagcaaaagaagctgctgacattcttcaatccaagataccatcagatattgaagatgct
ttacttaaagttgaagatttatcagctaaaaaagaacaacaagataaaaaagatattctc
acagataatattgataaatttgtaaatgaaagaacaagacaattctatgaagaaatacct
gatattaatacattaattaatgataagaatgaattagaaaatatagtttctatggaagat
ttattagataaattacctaaaagaccacctattgataaattagcaacaacattggctata
aaatatcttaatcaaaaaggtaatagaactaaattagttaaaaagatgtttagtgttaat
agaacaagtttagaattattaccatattatagtagattaattgctatattgaatccactt
tttaaagatgttggtaaatcacttgttcaatcattagaagaagaatttaacaaattattt
gaagaacaagatcaaatcaaaattgaaaccaaagttaaaaatattagattcttgggtgaa
ttaattttatttaaaatatgtccagaagagactggtattgaatttttaaagaaatgtctt
tcacaatttcatcatcataatattgatgttgcatgtcattttcttgaagtttgtggaaga
tatttatatgcacaatctacatcacatttattaatggttgaattaatttctaaaatgatg
agaattaaagatattaaagtactagatgtaaaatataataccatgattgatagtgcctat
tataatacagttgtaaatgttgatcaagaagttgaaaaaccaagaacagtatttggtgaa
gatgatgaattaacacaatatgttttacatttacttttatcagaattgaacaagtataat
attaatactgttttaaaacaattgagaaaacttccatacgatgattttgatagaattaaa
aatattatcaagagtattctatcacatataagagaatgtgcatttggtactattcattta
atggcaagtgttttaggaggtttatcaagatatcatgaagaaattggtgttgttattatt
gatcttttattagaggaaattagatattcacttcaacaagaatatattgataatattgaa
ttgggtattaatcaaaatgctgaatatataccatctagattaagatctgaacaaaaaaga
attattgatatcaaattcttgggtgaattttataattatcaattattagatattaatgtc
attatggatgtattgtacacattaattttatatccaacaccactacttccacacaaacaa
gatacttttagattgagattagtttgtactcttctagatacatgtggtccttattttgaa
acatctgccgatagaaagaaattagatagatttttattatatttgcagagatatgtttta
agtaaacagtatcgtttaccagtcgatatggaaaatatgttagcagatactttggataca
gttagacctaaattgaaatggccaaagaatttgaaggaagttgttgataaaattgattat
attgaacaaaagaaaccaattccacttccaggtcaaagtaaatccaatgatccactttca
ctatggccaattaatgatcatgaggatgaactttctgcaactgctgctgctgaagaggaa
gatgttgttcaagatgaaactgaagattctcaaaacaactctaaatcatcaacacataaa
gatgatgatggaggtgaattggataaggaattaatggaaatgattaatcaaagtattaat
gagagaaaatacttgaccaataataatattgtcaagatgggtacattgatttcaaaacca
caagaaatgatgacacaagctattacacctaaaataattcatcatcaacaaccagcacat
catcatcatcaccaacaacacattcaacacactcaacatgctcaacatgctcaacatgat
agtacaaatacatcatcatcatcaccaccaccaccaatggctcaaaagattaccattctc
tctaaacaaggtagaactaataaggcacaagaagtttttgttgctgccaatgttacaaaa
ttattgagaaaagattcaaacaacaataacactactcaatag

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (2)   
   KEGG PATHWAY (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (40)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (35)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   JGI (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (51)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system