KEGG   Orientia tsutsugamushi Ikeda: OTT_0772
Entry
OTT_0772          CDS       T00705                                 
Symbol
virB6
Name
(GenBank) type IV secretion system protein VirB6
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
ott  Orientia tsutsugamushi Ikeda
Pathway
ott03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ott00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    OTT_0772 (virB6)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:ott02044]
    OTT_0772 (virB6)
Secretion system [BR:ott02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   OTT_0772 (virB6)
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAG40230
UniProt: B3CRT1
Position
804456..808343
AA seq 1295 aa
MIKHLLYNFRVVINNHSVLKALKEAICSVLLLVIVLPSIAYAGKDCCSKQKNKLRCCTYD
QQFCYPLVRSECIKKEELRYQNPDILQEKIQLLESSAKQAWNNAQNHQFSSNIEKLNAVT
NAGAKTREIISLSEQLKKALVNEGNARWAAFKIEKGKTNGGKLSKDKDFQQHKSLLNEQK
AALKLAQKFGNNASGQYKVIKASARDLVLVAGLDFWNALLLYKKIDDELDSKVRNGADKK
SILIAKKKVLYEIEKVLKAFVEGRDMYNKFVEWVIGYSDITEAKEKGAIEFLLQNLSYST
VMRSASFETTLKAVIEIYKNGDFINELKLQNESVKTDIAEIERSIQVAEDEMKRKQEEEE
AKKLLEFQNKVKKAKEEVDAAKDKFKEKQTQAQEAYDQANASGDLEDKIEALNKKKKEYE
AAKKYKEALDKAIDIGNNNPDLVRERDSLGNDIDNLSQSIDQMTDDVNRDKEIYKQQFEE
DKNSSVSANCDFSQYRSISPESSVFTLASFVYQNINFKCGNVCNTADKGFNLCLKVKKSD
LCRDCIPIYIGPQSEFKSIRKLFDTSGVKKGRRDPILVTENAVKNIGFKVEHTDKISCLK
IKTSYGDIPIVCKNISADIDLIPQARSNNRICSLSTTKSRVPFNFSGRAIGCLKEALDKM
FYADSITHDQVSSASILKPLSSFQRGMTLTVKAALMLYIIFFGIKMIFVKRFFSLERLVT
GVLQILIVMYFSVGLGPMTNKDGKISYNNGMQDHFLPFLSSVTSELAHMVFSSVGSDSAV
GGTKLCYFDPNKDYTPDARYYALWDAIDCRIGYYLGFRLLHNYTVDRSKPSLGGKLVGSS
IGTSANDDITKHLSNIKDGHALKKDDTFLVFPTLWGLLLSGEIIFFLVMLLFVIIFLTLF
WRFMAVFITSLVNLYVMCYISPIFIPMVLFEKTKSMFNNWLHLTLSFALQPAIVAAFIAL
FVTLMDSITYKTCQFARYDYQQGNKILSTFELRVPDRYIQDHGLFDDAYNSDAAKICRES
AGYRLVEYFNGKNWHQRIFLFFKAFVVYPEPDFLPTMIVVLLFCGIFYYFFQEAHRFAAV
ITSGITAVNMELPSLRIPSFRNKSTRTKGGKDDKEEEASDKFSSRGGIDKTATDKISSRS
NIESSAQDKISTGLKSNGISGVKHGLKKDHDAIRAAKKFDISNNDEVIGADKFSTSGNKQ
ADKLSSENIKPRDTSVVSAEDKFSTSFKLKDHKDIVQSEIDKKLESNVSDKSNSTSSNQT
IETRKSNIESDALSKKIDAKDLNEINKGSDDKKNI
NT seq 3888 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgataaagcatttactatataactttagggtagtaattaacaatcattctgttcttaaa
gctcttaaagaggcaatttgtagtgtattgttgctagttattgtactgccatccattgct
tacgctggaaaagattgctgtagtaagcagaagaataagcttagatgttgtacctatgat
caacaattttgttatccattagtaaggtccgaatgtatcaaaaaagaagaattacgttat
cagaatcctgatatattacaagaaaagatacagttacttgaatcttcagctaagcaagca
tggaataatgctcaaaatcatcaattttcatcgaatatagaaaaacttaatgctgtaact
aatgctggtgctaaaactagagagatcattagtttatctgaacaattgaaaaaagcttta
gtaaatgaaggtaatgctaggtgggctgcgtttaagatagaaaaaggtaaaactaatggt
ggtaaattaagtaaagataaagattttcagcaacacaaatcattactaaatgagcaaaaa
gctgcattaaaattagctcaaaaatttggtaacaatgcttcagggcaatataaggtaatt
aaagctagcgctagagatttagtattagttgctggattggacttttggaatgcgttgtta
ctatacaaaaaaattgatgatgagttagactcgaaagtgagaaatggtgctgataagaaa
agtatattaattgcaaaaaagaaagtgctttatgaaatagaaaaagttttgaaagctttt
gtagaaggaagagatatgtacaataaatttgtagaatgggttataggttattctgatata
acagaagcaaaagaaaaaggcgctattgagtttttattacaaaatctgagctatagtaca
gtaatgagatcagcctcatttgagaccactttgaaagcagtaatagagatatataaaaat
ggtgattttatcaatgaattaaaacttcaaaatgaaagtgtaaaaactgatattgctgaa
atagagcgtagcatacaagttgctgaagatgagatgaagagaaaacaggaagaggaagaa
gctaaaaaattattagagtttcaaaataaagttaaaaaagctaaagaagaagttgatgct
gctaaagataaatttaaagaaaaacagactcaagctcaggaagcttatgatcaagctaat
gctagtggagatttagaagataaaattgaagctctaaataaaaagaaaaaagagtatgaa
gctgctaaaaaatataaggaggctttggacaaagcaattgatattggtaacaacaatcct
gatttagttagagagcgtgatagtttaggaaatgatatagataatttatctcaaagtatt
gatcagatgacagatgatgttaatagagataaagagatatataagcaacaatttgaagaa
gataaaaattcatcagttagtgcaaactgtgattttagccagtatagaagcatctctcct
gaaagcagcgtttttactttagcttcttttgtatatcaaaatattaattttaagtgtgga
aatgtatgtaatactgcagataagggatttaatctttgtttaaaggttaaaaagtcagat
ctgtgtagagattgtattccaatatatattggtccgcaatctgaatttaagtctattagg
aagttatttgatactagtggagtaaagaaaggtagaagagatcctatactagtaactgaa
aatgcagtaaaaaatattggatttaaggttgaacatactgataaaatttcttgtttaaaa
atcaaaacatcttatggagatattcctatagtctgtaaaaatattagtgctgatattgat
ttaatacctcaagctaggagtaataatagaatttgtagtttaagtactacaaaaagtaga
gtgccttttaatttttctggtagagctataggttgtttaaaagaagcattggataagatg
ttttatgctgattcaattactcatgatcaggtatcttctgctagtatattgaagcctctt
tcaagctttcagcgtggtatgacattaactgttaaagctgctttaatgttatacataata
ttttttggcatcaaaatgatatttgttaagcgtttttttagcctagagagattagttact
ggagtattacagatactaattgtaatgtatttttctgttgggctaggtccaatgactaat
aaagatgggaaaataagttataataacggtatgcaagatcattttttgccatttttaagt
tcagttacctcagaattagctcatatggtattttcatctgttggtagtgattctgctgtt
ggcggtactaaattatgttattttgatcctaacaaagattatacacctgatgctcgttat
tatgcattatgggatgcaatagattgtagaataggatattacttaggttttagattatta
cataattatactgtagataggtcaaagccatcacttggtggtaagttagttggatcatct
attggaactagcgctaatgatgatattaccaagcatttgagtaatattaaggatggtcat
gcacttaagaaagatgatactttcttagtatttcctactttgtggggactgttattaagt
ggtgaaattatctttttcttggtaatgctactgtttgttataatctttttaacgttattt
tggaggtttatggctgtatttattactagtttagtaaatttatatgtcatgtgctatata
tctcctatttttattcctatggtattgtttgaaaagacaaaatcaatgtttaataattgg
ttacatttgacattatcttttgcattacagcctgcaattgttgcagcattcattgcgtta
tttgtgactttaatggattcaataacgtataaaacatgtcaatttgcaaggtatgattat
cagcaagggaataaaattttgagtacttttgagcttcgtgtacctgatcgttatattcaa
gaccatggcctctttgatgatgcgtataatagtgatgctgctaaaatatgtagagagagt
gctggatataggttagtagaatattttaatggaaaaaattggcatcaaagaatatttctt
ttctttaaagcatttgtagtatatcctgaaccagattttttacctactatgattgttgta
ttactattttgtggaattttttattacttctttcaggaagcacataggtttgcggcagtt
attactagtggtattactgctgtaaatatggagttaccaagcttaagaattcctagcttt
aggaataagagcactagaaccaaaggtggtaaagatgataaagaagaagaggcaagtgat
aagtttagctctagaggtggtatagataaaactgctacagataaaattagcagtcggtct
aacatcgaatcatcagctcaggataaaattagtactggattaaaaagtaatggtattagt
ggcgttaaacatggcttaaaaaaagatcatgatgctattagagctgctaagaagtttgac
attagtaataatgatgaagttattggtgctgataagtttagtactagtggaaataagcag
gctgataagttaagttctgaaaatattaagccaagagatactagtgtagtttctgcagaa
gataaatttagtacttcttttaaacttaaagatcataaagatattgttcaatctgagatt
gataagaaactagaatctaatgttagcgataagagtaatagtactagcagtaatcaaacc
atcgaaacaagaaagagtaatattgaatctgatgccttatcaaaaaagatcgatgctaag
gatttaaatgagattaataaaggtagtgatgataagaaaaacatctaa

DBGET integrated database retrieval system