KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_0913800
Entry
PBANKA_0913800    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, putative
  KO
K03002  DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:2.7.7.6]
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Pathway
pbe03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    PBANKA_0913800
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pbe03021]
    PBANKA_0913800
Enzymes [BR:pbe01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     PBANKA_0913800
Transcription machinery [BR:pbe03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Core subunits
     PBANKA_0913800
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_7
Other DBs
NCBI-GeneID: 55149592
NCBI-ProteinID: XP_034421489
Position
9:520115..524627
AA seq 1474 aa
MAVMTPNNHKTNEASEKEMDRYKMDSRKSLISKNRNNEDNNKKTRINLDITDEEIKLHVK
IIESLYPNIKLKIDKVINGTYNIFTKFLVQSHIDDFNSFINVYIKNMPETLPVIEYSPNL
NKYSCLNYERKPKERIKLYVSDIIIKSPIIKSDNGNTRPNYPYLCKLACSTYEGEVLMVI
NKQYKNEIVRTTVSTGFIPIMVLSDLCNLKNLNKKELVQKGEDESLLGGFFIISGHLKII
RYVICPKYNSILLNEENKVHINCLLSDNSVFINSLAYLKNYEYEFLSRFQGSFIHIPFNV
LILCLSPIKKKSYIYNKIKLGIKNENAIKYIENYINSIFLKNNINEKEIFEKYNLKYIGK
YANVSRTIFRYYEGNNHKKGKSVINYCVLPHLQTNSEKFETICLMFKQLVLSKFKLITTV
NKDSLEYHSVTTCSSLLSNILKERILSCFYRMQMLYSRSLHKFLEKKYEVFKLNVKQIYL
RYKEMILHELSEDHFNQILLNNNADKLENNEELTSENDHMNSKMDSTKNLRLMFMNEKEK
LFASADGYLREMFSDARVFIENSRTFGAASFSISYLFKTGNIASDYIHYQQKSGWVILAD
EINNLRLLTNFRSIHRGSFFQDVKVLSPRKLLGESWGFICPVHTPDGSPCGLLNHLSQYC
CIYNVASNESHKFNIKMYLKKIGININLDETSGIHTIYENQTIPIIVDSVPITYISETEF
KRTVYKLKYAKNHNLYNLKSHFEILAYLNEQSMMDSIIINTCTGRIIRPILNLKMKCIEF
ISPGYQPYVSIAVNYDDILKNNLARKILKKKENIVNLNMNNTKNTKKMTLKEQYHFYTNK
KHNIEKEAKNYNESEIVRKENKKASKSKNKVLNILENKKQYQFNEDEYISSSDYETSSES
DKYSDDNMSSTTYIDSDENLNIDIYEQIPQKFEYMELKQTSFLSFLASLTPFSDHNQSPR
NIYQCQMLKQTMGIQSLNMFYTFTNKIYRIITPQFPLVVTRDYEFYGVDNFPSGTNAVVA
ILAYTGYDMEDALIINKASSDRGMFRTHIYKTEVIDLYKKTNSPDFVLGNNIRYNANSLS
SKNNIREHKGKFLNKDGLPCINQKILENNPLYSYINKKNELTTYEIFKTHGDYYVDCVSN
SQNNQIAIIRLRTTRPPLVGDKFASRHGQKGVISRLFPHEDMPFSESGIVPDVIFNPHGI
PSRMTIGMLIESICGKAASIYGKRIDATPFRKYTKQKSFNNPWIDGCGVKGFLNKLDENA
DEKKTTIKGSTGNSDTTEISYDEKIDFFAKLLLNKGYDYYGTELLYSGIYGVPLQAHIFF
GVIYYQRLRHMAYDKAQVRRTGPVCHLTHQPLKGKKKHGGIRLGEMERDGLISHGCSFII
NERFLMNSDGHECFVCPKCGLILSPILQYNCSGKLIKGRSIGGHSKMAVCKSCNVSCKIV
YVPYVLRYLLNELVCLNITIRLNVQSIESIFGMK
NT seq 4425 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcggtgatgacaccgaataatcataaaacaaatgaagcaagtgaaaaagaaatggac
cgttataaaatggatagtagaaaaagtttaattagcaaaaatcgaaataatgaagataat
aataaaaaaacaaggataaatttagatattactgatgaagaaataaaattacatgtaaaa
attatagaatccttatacccaaatataaaattaaaaattgacaaagtaattaatgggact
tataatatattcacaaaatttttagttcaatctcatattgatgattttaattcatttata
aatgtgtatataaaaaatatgcctgaaacattaccagttattgaatattctcctaatcta
aataaatactcttgtttaaattatgagagaaaaccaaaagaacgtataaaattatatgta
agtgatataataataaaaagcccaattataaaaagtgataacggaaatacaagacctaat
tacccatatttatgcaaattagcttgtagcacttatgaaggtgaagttttaatggtaata
aataaacaatataaaaatgaaattgttcgaactactgtaagtacaggttttatacctatt
atggtgttatcagatttatgtaatttaaaaaacttaaataaaaaagaattagttcaaaag
ggggaagatgaaagcttattaggaggattttttattatttctggtcatttaaaaataata
agatatgtgatatgcccaaaatataattcaatattgctaaacgaagaaaataaagttcat
ataaattgtttactaagtgacaatagcgtttttattaattctttagcttatttaaaaaat
tatgaatatgaatttttatcacggtttcagggttcttttattcatataccattcaatgtg
ttaattttatgtctgagcccaataaaaaaaaaaagttatatatataacaaaattaaattg
ggtataaaaaatgaaaatgcaatcaaatatatagaaaattatataaattcgattttttta
aaaaataatattaatgaaaaagaaatattcgaaaaatataatttaaaatatataggaaag
tatgcaaatgtttcaagaactatatttagatattatgaaggaaataatcataaaaaagga
aagtctgttatcaattattgtgtattaccacatttgcaaactaattcagaaaaattcgaa
acgatttgtttaatgtttaaacaattagttctaagcaaatttaaattaattactacagta
aataaagattctttagaataccattctgtaacaacttgcagtagtttattatcaaatatt
cttaaagaaagaattttaagttgcttttatagaatgcaaatgttgtatagcagatctctt
cataaatttttggaaaaaaaatatgaagtgttcaagctcaatgttaaacaaatatatctg
cgttacaaagaaatgatattgcatgaattgagtgaagaccactttaatcagattttgctt
aacaataatgcggataaattggaaaacaatgaagaattaacctcggaaaatgaccatatg
aacagcaagatggattccacgaaaaatctcagacttatgtttatgaacgaaaaggaaaaa
ttatttgcaagtgccgatgggtacttgagagaaatgtttagtgatgctcgggtatttatt
gaaaattccagaacatttggagctgcatctttttctatatcatatctttttaaaacgggg
aatatagcatctgattatatacattatcaacaaaaaagtgggtgggttattttagcagac
gaaattaataaccttagattgctaactaattttagatctatacatagaggtagctttttt
caagacgttaaggttttatcgccaagaaaattgttaggagaatcttggggttttatatgc
cctgtccatacacctgacggttcgccatgtggtttattaaatcacttgtctcaatattgt
tgtatttataatgttgctagtaacgaatcacataaatttaatataaaaatgtatttaaaa
aaaatcggaataaatattaacttagatgaaacaagtggtatacatactatttatgagaat
caaactattccaatcattgttgattcagtccctattacatatattagtgagactgagttt
aaaagaacagtttataaactgaaatatgcaaaaaatcataatttatacaatttaaagtca
cattttgaaattcttgcatacttaaatgagcaatcaatgatggatagtataataattaat
acatgcacaggtagaattataaggcctatattaaatctaaaaatgaaatgtattgaattt
atttcgcctggatatcaaccatatgtttctatagctgtaaattatgatgatatattaaaa
aataatttggctcgaaaaattttaaaaaaaaaagaaaatattgtaaatttaaatatgaac
aatacaaaaaatacgaaaaaaatgaccctcaaagaacaatatcatttttatactaataaa
aaacataacatagaaaaagaggcaaaaaattacaatgaaagtgaaattgtaagaaaagaa
aataaaaaagcctcaaaaagtaaaaataaagtactaaatatactggaaaataaaaaacaa
tatcaatttaatgaggatgaatatattagtagctctgattatgaaaccagtagtgaatct
gataaatattcagatgataatatgtcatcaacaacttatatcgatagtgatgaaaacttg
aatatagatatatatgaacaaattcctcaaaaatttgaatatatggaattaaaacaaaca
tcctttttatcatttttagcttctttaacaccattttctgatcacaaccaaagtcctcgt
aatatatatcaatgccaaatgcttaagcaaacaatggggatacaaagtttaaatatgttt
tatacctttactaataaaatttatagaattataacaccgcaattcccacttgttgttaca
agagattatgaattttatggagttgataattttcctagtggtacgaatgcggttgttgct
atattagcatatacaggatatgatatggaagatgcacttataattaataaagctagttca
gatagagggatgtttagaacacatatatataaaacggaagtaattgatttatataaaaaa
acaaattctcctgattttgttctaggtaataatattagatataatgctaatagtttgtca
tcgaaaaataatattcgtgaacataaaggaaaatttttaaataaagatggtttaccatgt
ataaaccaaaaaatattagaaaataatccattatattcatatataaataaaaaaaatgaa
ttaactacttatgaaatttttaaaactcatggtgattattatgttgattgtgtaagtaat
tcacaaaataaccaaattgcaataataagattaagaacaactagaccacctttagtagga
gataaatttgcttcaagacatggacaaaaaggtgttatctcaagattattccctcatgaa
gatatgcctttttcagaaagtggaatagttccagatgttatttttaatcctcatggtata
ccatcacgtatgacaatcggtatgcttattgaaagtatttgtggtaaagctgcttctata
tatggaaaaagaattgatgctactccttttagaaaatatactaaacaaaaaagtttcaat
aacccatggattgatggctgtggagtaaagggatttctgaacaagctagatgaaaatgct
gatgaaaaaaaaactactataaaaggttccactggaaatagcgacacaactgagattagt
tacgatgaaaaaattgatttttttgcaaaattgctactaaataaaggatatgattattat
ggaacagaattattatatagtggtatatatggagtcccattacaagcacatatatttttc
ggagtaatttattatcaaagattaagacatatggcttatgataaagcccaagttagacgg
acaggaccagtatgtcatttaacacaccagcctttaaaaggtaaaaaaaaacatggtggt
atcagattaggagaaatggaaagagatggtttaatatcgcatggttgtagttttataatt
aatgaaagatttttaatgaattcagatgggcatgaatgttttgtttgccctaaatgtgga
ttgatattatctccaattttgcaatataactgtagtggcaaattaatcaaaggaaggtca
attggaggacatagtaaaatggcagtttgcaaatcttgcaatgtttcatgcaagattgta
tatgttccttatgttttgcgatatttgttgaatgagttagtctgcttaaatataacaata
cgattaaatgtacaatctatagaatcaatatttggcatgaaataa

DBGET integrated database retrieval system