KEGG   Pseudoalteromonas donghaensis: D0907_01480
Entry
D0907_01480       CDS       T05890                                 
Name
(GenBank) DUF3372 domain-containing protein
  KO
K01200  pullulanase [EC:3.2.1.41]
Organism
pdj  Pseudoalteromonas donghaensis
Pathway
pdj00500  Starch and sucrose metabolism
pdj01100  Metabolic pathways
pdj01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Module
pdj_M00855  Glycogen degradation, glycogen => glucose-6P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pdj00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00500 Starch and sucrose metabolism
    D0907_01480
Enzymes [BR:pdj01000]
 3. Hydrolases
  3.2  Glycosylases
   3.2.1  Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
    3.2.1.41  pullulanase
     D0907_01480
SSDB
Motif
Pfam: Pullul_strch_C Pullulanase_N2 CBM_48 AMPK1_CBM PUD Alpha-amylase Pullulanase_Ins
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXV64038
Position
319558..323874
AA seq 1438 aa
MKIIADFNRLLITCSIALLAACGGGASNDIDSGQVLLTCSVPQIPNAAGTECVEPPPINC
PAPTVPDENNESCVVGADPTLPDPVVFPADDEAILFYNRTSDDAYEGYRLHTWNNDVCDA
YAAPFDATDWANGHEYDGIDPNYGAYWIVKLKDGYNECANFIVHIGTEGSGKAFGDVDLK
MPLMQDDEKFQRMNFTIHGEPSVFEYPIVSLGERPVSISGASAHWIDLSTVIYKPSNELT
SIIKLHASSSADLAVDEDTGELNGQVVELTSTSLNDEQVAKVPHLAAWNAYQGSWDAAAA
KELIKHQLVVAGYDADGKLIEATYVQTAKALDDLYTSGESDANEAQLGVHYANNGIDISV
WAPTASNMKLALYDANKTELEQLAMTFDSTTGIWSSNVDISHDRHYYRFMFDVYHPTTKQ
IERLWSTDPYSLNVSTNGLYSQLINLDDDDTKPSGWDDRVVPTIDYPEQAVIYEGHVRDF
SVRDETVSEANRGKYLAFTELDSAPMRHLKKLADNGLTHFHLLPLTDIGTIDEDASQRVD
ITATLGDLCTRINDDADACKTEDKSALIIDLMASYLPGSDDAQALANAMRGVDSFNWGYD
PHHFIAPEGSYASSPEGIARVKETRAMIQSLQEIGLRVVLDVVYNHTTSSGVWDKSVFDK
LVPGYYHRYNEISGDIERSTCCENTATEHVMMDKFVADSMVILARDFGYDSFRFDVMGHM
PKASIMTALSAVQAVDPDTYFYGEGWNFEEVADNRLFVQAKQIDMAGTEVGTFNDRIREA
IRGGAFFSNSATDGNLADQDTLRLSLAGNLQNYILKDFKGNSAKGSSFSWNTQPAAYALD
PADSINYVSKHDNETLWDQLQYKHGNNLNIEERVRIHNMALAMPLMSQGIPFMQMGADML
RSKSMDRNSYDSGDWFNFVDFSKETNNWNVGLPPAQDNQAKWGEIAPISANTNAQAMASD
IEYASNVFTEFLSIRSSSPLFSLTTEQDILDRVGFHNIGKRQQQGLVVMSIDDGVGLTDL
DSQYDAIVVIMNGTEQSLSHTVSTAYGFELHPVLKASVDSSMSAASFMTGEGEGTFTVPA
YTIAVFVKPQGVTQGEGLSANATAGAPDIVPFGSTTVYVRGSLNDWGTANGFDYVGNGEY
KIAIPLTAGSYEFKVASEDWSTVDFGALSADVAEVIEGEDEPLARSGANMTFTAAMDAIY
VFSFDATDIENPVLKVYNEEPFVGTSIYVRGNLNDWSTSDELMYQGKGVYTFTKQLIAGS
YEFKVASEDWKTVDYGSGESSAVVTVGTEKLLAVKGTNMTIDIARDGQYQFVFDASNLEE
PLMTVFNAEMFGETPVYLRGSMNNWDPVNLLTYAGDATYSTTIALDVDDYEFKVASSDWN
TVNLGGSGESPLAVLGEAASLEAVGANISLSITQAGNYRFTVQGPDLNKLTVMVEAVE
NT seq 4317 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaataatagctgattttaaccgcttactcattacctgtagcatagcgttgctagct
gcatgtggtggtggagctagtaatgatattgattcagggcaagttttattgacctgtagc
gtaccgcagatccccaatgcagcgggtactgaatgtgttgaaccacccccgattaattgt
ccggccccaactgtgcctgatgaaaataatgagagctgtgtagtaggggctgatccaaca
ctgcctgatcctgtggtttttccagcggatgacgaagccattttgttctataaccgtacc
agtgatgatgcttatgaagggtatcgtttgcacacgtggaataatgatgtgtgtgatgca
tatgcagcaccgtttgatgcgacggattgggcaaatggtcatgagtacgatggtatcgat
ccgaactatggcgcgtactggattgtaaaactcaaagacggctacaacgagtgtgccaac
ttcattgtacatattggtactgaaggttcaggcaaagcgtttggtgatgtcgatttaaaa
atgccattgatgcaagacgatgaaaagttccaacgtatgaactttaccattcatggtgaa
ccatcagtatttgaatacccaattgttagcttaggtgagcgtccggtgagtatttctggt
gcgtctgcgcattggattgatctttcaacggtgatttataaaccaagcaatgagcttacg
agtattattaaattgcacgcttcaagcagtgcagatttagctgtcgatgaagatactggt
gagttaaatggtcaagtggttgaactaacatcgacgtctttgaacgatgagcaagtagct
aaagtgccacaccttgctgcatggaatgcttaccaaggtagctgggatgcagccgctgca
aaagagctgattaaacaccagttggttgtggcaggctatgatgctgatggcaagctaatt
gaagcaacttatgtgcaaaccgctaaagctctcgatgacttgtacaccagcggtgaaagt
gatgccaatgaagcacaactaggtgtgcattacgccaataatggcattgatatctcggta
tgggcgcctactgcaagcaatatgaaattagcgctttacgatgctaataaaactgagctt
gaacaacttgctatgacctttgatagcacaacgggtatttggtctagtaatgtcgatatc
agtcacgatcgccattactaccgttttatgtttgatgtttatcatcctactaccaagcaa
attgaacgcttatggagcacagatccttactctttaaatgtttcaactaatggtttatac
agccaactaattaatcttgatgatgacgatactaaaccgagtggctgggatgatcgtgtt
gtaccaaccattgattaccccgaacaagcggtgatttacgaaggccatgtacgtgacttt
agtgttcgcgatgaaacggtaagtgaagcaaaccgtggtaagtatcttgcgtttactgag
cttgatagtgcgccaatgcgccatcttaaaaagctagctgataatggcttaacacatttc
cacttactgccactgacagatattggcactattgacgaagatgcgagccaacgtgtagat
attacagcaacgttaggtgatttatgtacacgcattaacgatgatgccgatgcatgtaaa
accgaagataagagcgcattgattattgacctaatggcttcatacctaccggggtctgat
gatgcacaagcacttgccaatgcaatgcgtggtgttgatagttttaactggggttatgat
ccgcatcactttattgccccagaaggctcttacgcttcatcgcctgaaggtatagcacga
gttaaagaaacgcgtgcgatgattcagtctttacaagaaattggtttacgtgtcgtgctt
gatgttgtttataaccacaccacgtcatcaggtgtctgggataaatcagtcttcgataaa
ctggtaccaggttattaccacagatataacgaaatatccggtgatatcgaacgctcaact
tgttgtgaaaatacagcaacagaacatgtcatgatggataagtttgttgctgactctatg
gtgattctagctcgtgattttggttacgatagcttccgctttgatgtgatggggcatatg
ccaaaagcgtcaattatgacggctcttagtgcagtgcaagcggttgaccctgatacctat
ttctacggtgaaggttggaactttgaggaagtcgctgataatcgattgtttgtgcaagct
aagcaaatagatatggctggcacagaagtcggtacctttaatgaccgaattcgtgaagca
attcgtggtggtgctttctttagtaatagtgcgacagatggcaacttagccgatcaagat
acgcttcgcttatcgcttgccggtaacttacaaaactacattcttaaagactttaaaggc
aattcagcaaaaggcagtagctttagttggaatacgcagcctgcagcctatgcactggac
cctgctgatagtattaactatgtctctaagcatgataacgaaacattgtgggatcagctg
caatataaacacggcaataaccttaatattgaagagcgtgtgcgtattcacaatatggct
ctagcgatgccattaatgagccaaggtattccatttatgcaaatgggtgcggatatgttg
cgttctaaatcaatggatcgtaatagctatgattctggcgattggttcaattttgttgat
ttcagtaaagaaactaataactggaatgtcggtttaccaccggcacaagataaccaagct
aaatggggcgaaatcgcaccaatttcagcaaataccaatgcgcaagcgatggcaagcgac
attgaatatgcaagtaatgtatttactgagttcttatcaattcgcagtagcagcccgcta
tttagcctaaccacggaacaagacattttagaccgcgtaggtttccataatattggaaaa
cgtcaacagcaaggtttagtggttatgagcattgatgatggcgttggtttgacggacctt
gatagccagtatgatgcgattgtagtgattatgaatggaaccgagcaaagcttatcgcat
acggtatctactgcctacggttttgagttacatcctgttttaaaagcgagtgttgattca
agtatgtcagcagcaagctttatgacaggtgagggagaggggacttttacagttcctgct
tacacgattgctgtgtttgtgaaaccacaaggtgttacgcaaggtgaaggtctaagtgct
aatgctactgcgggtgcaccagatatcgtgccattcggtagtacaaccgtttatgttcgt
ggctcattaaacgattggggtacggcaaacggctttgactatgtaggtaatggcgaatat
aaaattgccatcccacttacagcaggtagctatgagtttaaagtggcatctgaagattgg
tctacggttgattttggtgcgctttctgcagatgttgctgaagtgattgaaggtgaagac
gagccacttgcacgcagtggggccaatatgacctttactgcagcaatggacgctatctat
gtgttctcatttgatgcaaccgacatcgagaacccagtgcttaaagtgtataacgaggag
ccatttgtgggtacttcaatctatgtacgtggtaatttaaatgattggagtaccagtgac
gaattgatgtatcaaggtaaaggcgtttacaccttcactaagcaattaatagctggcagc
tatgagttcaaagtagcctctgaagattggaaaacggtggattatggttcaggtgaaagc
agtgcggttgttaccgtaggaactgagaaactgcttgcagtgaaaggtacaaacatgact
atcgacattgcaagggatggccaatatcagtttgtatttgatgctagcaaccttgaagag
ccactcatgaccgtgtttaacgcagaaatgtttggtgaaacccctgtctatctgcgtgga
agtatgaacaattgggatccagttaacctattaacctatgcaggcgatgctacatatagt
acgacaatagcactcgacgttgacgactatgaattcaaagttgcgtctagtgactggaac
acagtgaatttaggtggtagtggtgaatcgccactcgctgttcttggcgaagcggcctcg
ttagaagctgtcggcgccaatatctcattgagtattacacaggcgggtaactatcgtttt
acagtgcaaggacctgatctgaataaactaacagtaatggttgaagctgtggaatag

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (3)   
   KEGG MODULE (1)   
Chemical substance (4)   
   KEGG COMPOUND (4)   
Chemical reaction (2)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (2)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
Protein domain (7)   
   Pfam (7)   
All databases (22)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system