GenomeNet

Database: Pfam
Entry: 7TM_GPCR_Srh
LinkDB: 7TM_GPCR_Srh
Original site: 7TM_GPCR_Srh 
#=GF ID   7TM_GPCR_Srh
#=GF AC   PF10318.9
#=GF DE   Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srh
#=GF PI   Srh; 
#=GF AU   Thomas JH;0000-0002-6256-4536
#=GF AU   Robertson H;
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Thomas JH, Robertson H
#=GF GA   25.00 25.00;
#=GF TC   25.00 25.00;
#=GF NC   24.90 24.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7585938
#=GF RT   Divergent seven transmembrane receptors are candidate
#=GF RT   chemosensory receptors in C. elegans. 
#=GF RA   Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI; 
#=GF RL   Cell 1995;83:207-218.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10673277
#=GF RT   The large srh family of chemoreceptor genes in Caenorhabditis
#=GF RT   nematodes reveals processes of genome evolution involving large
#=GF RT   duplications and deletions and intron gains and losses. 
#=GF RA   Robertson HM; 
#=GF RL   Genome Res. 2000;10:192-203.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   18050473
#=GF RT   The putative chemoreceptor families of C. elegans. 
#=GF RA   Robertson HM, Thomas JH; 
#=GF RL   WormBook. 2006; [Epub ahead of print]
#=GF DR   INTERPRO; IPR019422;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Chemoreception is mediated in Caenorhabditis elegans by members
#=GF CC   of the seven-transmembrane G-protein-coupled receptor class (7TM
#=GF CC   GPCRs) of proteins which are of the serpentine type [1]. Srh is
#=GF CC   part of the Str superfamily of chemoreceptors [2].
#=GF CC   Chemoperception is one of the central senses of soil nematodes
#=GF CC   like C. elegans which are otherwise 'blind' and 'deaf' [3].
#=GF SQ   2346
#=GS A8X2F3_CAEBR/10-142         AC A8X2F3.2
#=GS A8Y0W8_CAEBR/11-314         AC A8Y0W8.1
#=GS A0A1I7YVQ0_9BILA/1-302      AC A0A1I7YVQ0.1
#=GS A0A016UQP2_9BILA/9-173      AC A0A016UQP2.1
#=GS A0A261BF78_9PELO/1-203      AC A0A261BF78.1
#=GS A0A1I7T9W7_9PELO/13-107     AC A0A1I7T9W7.1
#=GS A0A1I7TVZ8_9PELO/1-127      AC A0A1I7TVZ8.1
#=GS A0A0K3AVR9_CAEEL/1-245      AC A0A0K3AVR9.1
#=GS A0A1I7XYH2_9BILA/6-304      AC A0A1I7XYH2.1
#=GS A0A1I7TXW0_9PELO/1-185      AC A0A1I7TXW0.1
#=GS A0A1I7UIH9_9PELO/62-100     AC A0A1I7UIH9.1
#=GS K7H7L1_CAEJA/1-77           AC K7H7L1.1
#=GS A0A0K0ETS4_STRER/70-174     AC A0A0K0ETS4.1
#=GS A0A2G5TQ71_9PELO/9-312      AC A0A2G5TQ71.1
#=GS H3G4V4_PRIPA/6-125          AC H3G4V4.1
#=GS A0A1I7XFM6_HETBA/101-242    AC A0A1I7XFM6.1
#=GS E3LJ48_CAERE/24-344         AC E3LJ48.1
#=GS E3MIW1_CAERE/1-230          AC E3MIW1.1
#=GS E3LKA0_CAERE/26-321         AC E3LKA0.1
#=GS G0MU01_CAEBE/1-235          AC G0MU01.1
#=GS A0A1I7RXH9_BURXY/14-322     AC A0A1I7RXH9.1
#=GS H3EMI1_PRIPA/40-209         AC H3EMI1.1
#=GS A0A016US05_9BILA/1-70       AC A0A016US05.1
#=GS G0PDI0_CAEBE/1-91           AC G0PDI0.1
#=GS A0A016RXD1_9BILA/1-143      AC A0A016RXD1.1
#=GS G0MW13_CAEBE/1-133          AC G0MW13.1
#=GS A0A1I7T6I9_9PELO/11-280     AC A0A1I7T6I9.1
#=GS E3LHP8_CAERE/28-332         AC E3LHP8.1
#=GS A0A261CKV2_9PELO/7-310      AC A0A261CKV2.1
#=GS A0A261BKX5_9PELO/692-985    AC A0A261BKX5.1
#=GS A0A1I7ZJP0_9BILA/279-424    AC A0A1I7ZJP0.1
#=GS A0A261B1Y7_9PELO/1-206      AC A0A261B1Y7.1
#=GS A0A2G5TDP1_9PELO/123-199    AC A0A2G5TDP1.1
#=GS A0A2G5SZ87_9PELO/9-313      AC A0A2G5SZ87.1
#=GS A0A261C595_9PELO/7-175      AC A0A261C595.1
#=GS E3LHM5_CAERE/10-315         AC E3LHM5.1
#=GS A0A261BJU0_9PELO/956-1151   AC A0A261BJU0.1
#=GS A0A1I7TDL5_9PELO/1-194      AC A0A1I7TDL5.1
#=GS A0A2G5TI35_9PELO/1-259      AC A0A2G5TI35.1
#=GS H8WGV9_CAEBR/3-212          AC H8WGV9.1
#=GS A0A1I7XIP9_HETBA/9-209      AC A0A1I7XIP9.1
#=GS E3MTF0_CAERE/4-304          AC E3MTF0.1
#=GS A0A261BJU0_9PELO/361-587    AC A0A261BJU0.1
#=GS O45660_CAEEL/8-311          AC O45660.1
#=GS A0A0N4YIQ3_NIPBR/11-144     AC A0A0N4YIQ3.1
#=GS O16782_CAEEL/1-267          AC O16782.4
#=GS A0A016SSH9_9BILA/9-132      AC A0A016SSH9.1
#=GS E3LIW4_CAERE/44-347         AC E3LIW4.1
#=GS A0A1I8AJG1_9BILA/4-259      AC A0A1I8AJG1.1
#=GS A0A1I7SCC2_BURXY/10-317     AC A0A1I7SCC2.1
#=GS O61969_CAEEL/11-307         AC O61969.1
#=GS Q9N5I5_CAEEL/9-315          AC Q9N5I5.2
#=GS A0A016TRW9_9BILA/1-37       AC A0A016TRW9.1
#=GS K7H7D2_CAEJA/14-312         AC K7H7D2.1
#=GS B6IER3_CAEBR/1-288          AC B6IER3.1
#=GS G0PIJ1_CAEBE/21-202         AC G0PIJ1.1
#=GS G0M9C9_CAEBE/1-229          AC G0M9C9.1
#=GS A0A1I7TY12_9PELO/1-83       AC A0A1I7TY12.1
#=GS G0P0J0_CAEBE/9-329          AC G0P0J0.1
#=GS A0A2G5SCG3_9PELO/1-149      AC A0A2G5SCG3.1
#=GS A8XN04_CAEBR/24-83          AC A8XN04.2
#=GS A0A016RZC5_9BILA/62-311     AC A0A016RZC5.1
#=GS A0A261CH29_9PELO/6-293      AC A0A261CH29.1
#=GS E3MTC4_CAERE/3-139          AC E3MTC4.1
#=GS E3MNC1_CAERE/7-250          AC E3MNC1.1
#=GS A0A1I7ZB73_9BILA/493-637    AC A0A1I7ZB73.1
#=GS A0A1I8AVJ8_9BILA/5-298      AC A0A1I8AVJ8.1
#=GS A0A1I7RVT2_BURXY/2-195      AC A0A1I7RVT2.1
#=GS A0A1I8AVH2_9BILA/5-288      AC A0A1I8AVH2.1
#=GS A0A2G5TBT7_9PELO/179-478    AC A0A2G5TBT7.1
#=GS A0A1I7YPA8_9BILA/1-85       AC A0A1I7YPA8.1
#=GS K7HAL5_CAEJA/63-350         AC K7HAL5.1
#=GS A0A0K0G5K7_9BILA/13-336     AC A0A0K0G5K7.1
#=GS A8X2A1_CAEBR/15-314         AC A8X2A1.1
#=GS A0A261CMK9_9PELO/310-579    AC A0A261CMK9.1
#=GS A0A1I7SCH1_BURXY/403-684    AC A0A1I7SCH1.1
#=GS O16906_CAEEL/11-316         AC O16906.2
#=GS A0A261CL97_9PELO/50-284     AC A0A261CL97.1
#=GS A0A2G5TQ54_9PELO/2-258      AC A0A2G5TQ54.1
#=GS A0A261BJU0_9PELO/871-959    AC A0A261BJU0.1
#=GS K7H565_CAEJA/9-175          AC K7H565.1
#=GS E3LJN6_CAERE/12-115         AC E3LJN6.1
#=GS A8WKX1_CAEBR/1-213          AC A8WKX1.1
#=GS E3LHS4_CAERE/76-387         AC E3LHS4.1
#=GS A8XQ83_CAEBR/315-409        AC A8XQ83.1
#=GS A0A1I7TXW2_9PELO/1-244      AC A0A1I7TXW2.1
#=GS A0A261BWQ9_9PELO/362-663    AC A0A261BWQ9.1
#=GS E3LKX8_CAERE/24-327         AC E3LKX8.1
#=GS A0A1I8AU52_9BILA/13-290     AC A0A1I8AU52.1
#=GS A0A1I7SZE1_9PELO/1-197      AC A0A1I7SZE1.1
#=GS A0A1I7S5G5_BURXY/16-327     AC A0A1I7S5G5.1
#=GS E3MTC8_CAERE/14-120         AC E3MTC8.1
#=GS E3LI07_CAERE/13-314         AC E3LI07.1
#=GS A0A1I7U0L4_9PELO/1-150      AC A0A1I7U0L4.1
#=GS A0A2G5T9T5_9PELO/1-202      AC A0A2G5T9T5.1
#=GS A0A1I7X047_HETBA/53-197     AC A0A1I7X047.1
#=GS A8WQC8_CAEBR/10-302         AC A8WQC8.1
#=GS A0A1I7ZN84_9BILA/5-304      AC A0A1I7ZN84.1
#=GS A0A261C492_9PELO/26-321     AC A0A261C492.1
#=GS A0A1I7T6I7_9PELO/4-86       AC A0A1I7T6I7.1
#=GS A0A1I7RUQ1_BURXY/7-317      AC A0A1I7RUQ1.1
#=GS A8X1X1_CAEBR/14-231         AC A8X1X1.2
#=GS A0A2G5TBP2_9PELO/1-184      AC A0A2G5TBP2.1
#=GS A0A016STF6_9BILA/9-149      AC A0A016STF6.1
#=GS A0A1I7XXA9_9BILA/4-302      AC A0A1I7XXA9.1
#=GS A8WKF7_CAEBR/1-267          AC A8WKF7.2
#=GS A0A2H2HV52_CAEJA/272-354    AC A0A2H2HV52.1
#=GS E3LJN8_CAERE/1-159          AC E3LJN8.1
#=GS E3NC46_CAERE/30-267         AC E3NC46.1
#=GS A0A1I7TVZ7_9PELO/1-251      AC A0A1I7TVZ7.1
#=GS A0A1I7TBW1_9PELO/1-83       AC A0A1I7TBW1.1
#=GS E3LHR2_CAERE/12-304         AC E3LHR2.1
#=GS E3LUY8_CAERE/27-330         AC E3LUY8.1
#=GS A8X864_CAEBR/5-236          AC A8X864.2
#=GS A0A2G5TFH0_9PELO/4-143      AC A0A2G5TFH0.1
#=GS Q9GUB7_CAEEL/24-328         AC Q9GUB7.1
#=GS A0A1I7T6I2_9PELO/1-267      AC A0A1I7T6I2.1
#=GS A0A260ZVX8_9PELO/113-253    AC A0A260ZVX8.1
#=GS K7GV70_CAEJA/3-187          AC K7GV70.1
#=GS A0A1I7V272_9PELO/1-265      AC A0A1I7V272.1
#=GS O45697_CAEEL/20-321         AC O45697.1
#=GS A0A1I7W9A6_HETBA/9-70       AC A0A1I7W9A6.1
#=GS A0A016RZE5_9BILA/11-169     AC A0A016RZE5.1
#=GS A0A2G5TKF8_9PELO/1-102      AC A0A2G5TKF8.1
#=GS O44579_CAEEL/13-314         AC O44579.1
#=GS A0A2G5TKF5_9PELO/17-320     AC A0A2G5TKF5.1
#=GS G0PIJ3_CAEBE/21-322         AC G0PIJ3.1
#=GS A0A1I8A2U1_9BILA/3-298      AC A0A1I8A2U1.1
#=GS A0A1I7RZS0_BURXY/19-317     AC A0A1I7RZS0.1
#=GS E3MZF3_CAERE/22-326         AC E3MZF3.1
#=GS Q9XXP3_CAEEL/10-305         AC Q9XXP3.1
#=GS A0A2G5T772_9PELO/1-170      AC A0A2G5T772.1
#=GS A0A1I7YNT3_9BILA/1-272      AC A0A1I7YNT3.1
#=GS A0A158QYS4_NIPBR/146-189    AC A0A158QYS4.1
#=GS A8Y4J9_CAEBR/14-277         AC A8Y4J9.2
#=GS A0A261CPA7_9PELO/9-313      AC A0A261CPA7.1
#=GS A0A016SSH5_9BILA/9-226      AC A0A016SSH5.1
#=GS O61879_CAEEL/19-322         AC O61879.2
#=GS A0A2G5UL46_9PELO/238-389    AC A0A2G5UL46.1
#=GS A0A0K3ART6_CAEEL/64-339     AC A0A0K3ART6.1
#=GS G0N159_CAEBE/11-311         AC G0N159.1
#=GS A0A260ZUI2_9PELO/162-249    AC A0A260ZUI2.1
#=GS Q9XV76_CAEEL/10-310         AC Q9XV76.1
#=GS A0A1I7UTW7_9PELO/1-158      AC A0A1I7UTW7.1
#=GS A0A1I7T6J0_9PELO/1-63       AC A0A1I7T6J0.1
#=GS A0A1I7W7Z2_HETBA/9-114      AC A0A1I7W7Z2.1
#=GS A0A1I7X369_HETBA/2-156      AC A0A1I7X369.1
#=GS A0A261BV20_9PELO/878-1163   AC A0A261BV20.1
#=GS B6IHU4_CAEBR/1-187          AC B6IHU4.1
#=GS A0A1I7SHY4_BURXY/14-250     AC A0A1I7SHY4.1
#=GS E3MTT3_CAERE/333-548        AC E3MTT3.1
#=GS A0A260ZW23_9PELO/5-147      AC A0A260ZW23.1
#=GS Q7YXA9_CAEEL/23-326         AC Q7YXA9.1
#=GS A0A2G5TE57_9PELO/167-243    AC A0A2G5TE57.1
#=GS A0A0N4X4B8_HAEPC/11-134     AC A0A0N4X4B8.1
#=GS A0A261CDU4_9PELO/351-627    AC A0A261CDU4.1
#=GS A0A0K0EPA9_STRER/13-283     AC A0A0K0EPA9.1
#=GS A0A2G5TE67_9PELO/1-194      AC A0A2G5TE67.1
#=GS A0A1I7T6I8_9PELO/1-188      AC A0A1I7T6I8.1
#=GS G0MU49_CAEBE/1-194          AC G0MU49.1
#=GS A0A2G5T642_9PELO/94-236     AC A0A2G5T642.1
#=GS A0A1I7V271_9PELO/1-67       AC A0A1I7V271.1
#=GS E3MTU0_CAERE/26-329         AC E3MTU0.1
#=GS A0A1I7SCX2_BURXY/352-666    AC A0A1I7SCX2.1
#=GS A0A1I7S7T5_BURXY/69-302     AC A0A1I7S7T5.1
#=GS A0A1I7UVN4_9PELO/26-249     AC A0A1I7UVN4.1
#=GS A0A1I7YJC0_9BILA/3-305      AC A0A1I7YJC0.1
#=GS A0A1I8CG14_9BILA/84-264     AC A0A1I8CG14.1
#=GS A0A1I7ZAN2_9BILA/7-297      AC A0A1I7ZAN2.1
#=GS A0A1I7ZYA1_9BILA/6-302      AC A0A1I7ZYA1.1
#=GS A0A2G5TBT7_9PELO/1-177      AC A0A2G5TBT7.1
#=GS A0A1I7TY00_9PELO/1-267      AC A0A1I7TY00.1
#=GS E3LPA7_CAERE/1-205          AC E3LPA7.1
#=GS A0A2G5TDP1_9PELO/1-127      AC A0A2G5TDP1.1
#=GS Q7YXA5_CAEEL/8-311          AC Q7YXA5.2
#=GS A0A0K0DY36_STRER/48-319     AC A0A0K0DY36.1
#=GS A0A2G5TI78_9PELO/1-59       AC A0A2G5TI78.1
#=GS A0A1I7Z2B9_9BILA/8-295      AC A0A1I7Z2B9.1
#=GS A0A016UQN3_9BILA/5-201      AC A0A016UQN3.1
#=GS E3LHL8_CAERE/19-347         AC E3LHL8.1
#=GS A0A1I7Z235_9BILA/12-155     AC A0A1I7Z235.1
#=GS Q20530_CAEEL/17-312         AC Q20530.2
#=GS O44541_CAEEL/13-314         AC O44541.1
#=GS A0A1I7ZXQ9_9BILA/5-303      AC A0A1I7ZXQ9.1
#=GS K7IAH6_CAEJA/1-136          AC K7IAH6.1
#=GS A0A2G5THF0_9PELO/1-248      AC A0A2G5THF0.1
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