#=GF ID 7TM_GPCR_Srj
#=GF AC PF10319.9
#=GF DE Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srj
#=GF PI Srj;
#=GF AU Thomas JH;0000-0002-6256-4536
#=GF AU Robertson H;
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE Thomas JH, Robertson H
#=GF GA 24.10 24.10;
#=GF TC 24.10 24.10;
#=GF NC 24.00 24.00;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 7585938
#=GF RT Divergent seven transmembrane receptors are candidate
#=GF RT chemosensory receptors in C. elegans.
#=GF RA Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI;
#=GF RL Cell 1995;83:207-218.
#=GF RN [2]
#=GF RM 11238245
#=GF RT Updating the str and srj (stl) families of chemoreceptors in
#=GF RT Caenorhabditis nematodes reveals frequent gene movement within
#=GF RT and between chromosomes.
#=GF RA Robertson HM;
#=GF RL Chem Senses. 2001;26:151-159.
#=GF RN [3]
#=GF RM 18050473
#=GF RT The putative chemoreceptor families of C. elegans.
#=GF RA Robertson HM, Thomas JH;
#=GF RL WormBook. 2006; [Epub ahead of print]
#=GF DR INTERPRO; IPR019423;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC Chemoreception is mediated in Caenorhabditis elegans by members
#=GF CC of the seven-transmembrane G-protein-coupled receptor class (7TM
#=GF CC GPCRs) of proteins which are of the serpentine type [1]. Srj is
#=GF CC part of the Str superfamily of chemoreceptors. The srj family is
#=GF CC designated as the out-group based on its location in preliminary
#=GF CC phylogenetic analyses of the entire superfamily [2].
#=GF CC Chemoperception is one of the central senses of soil nematodes
#=GF CC like C. elegans which are otherwise 'blind' and 'deaf' [3].
#=GF SQ 393
#=GS A0A2G5TA93_9PELO/1-259 AC A0A2G5TA93.1
#=GS A0A261AHJ9_9PELO/1-317 AC A0A261AHJ9.1
#=GS Q965U3_CAEEL/1-309 AC Q965U3.3
#=GS O17354_CAEEL/1-310 AC O17354.2
#=GS A0A2G5TD84_9PELO/1-314 AC A0A2G5TD84.1
#=GS A0A2G5T8E3_9PELO/1-312 AC A0A2G5T8E3.1
#=GS A0A1I7T224_9PELO/1-69 AC A0A1I7T224.1
#=GS A0A2G5T8J9_9PELO/1-325 AC A0A2G5T8J9.1
#=GS G0PN06_CAEBE/2-309 AC G0PN06.1
#=GS A0A1I8C3S5_9BILA/85-273 AC A0A1I8C3S5.1
#=GS A8Y408_CAEBR/2-329 AC A8Y408.2
#=GS E3LPT6_CAERE/1-270 AC E3LPT6.1
#=GS A0A1I7UBV8_9PELO/139-228 AC A0A1I7UBV8.1
#=GS A0A1I7V264_9PELO/208-463 AC A0A1I7V264.1
#=GS E3LLJ7_CAERE/1-201 AC E3LLJ7.1
#=GS O16348_CAEEL/1-309 AC O16348.2
#=GS E3LJU4_CAERE/2-313 AC E3LJU4.1
#=GS A0A2G5TBA3_9PELO/1-146 AC A0A2G5TBA3.1
#=GS A0A2G5TBR3_9PELO/1-188 AC A0A2G5TBR3.1
#=GS P91506_CAEEL/2-313 AC P91506.2
#=GS G0NMT6_CAEBE/83-206 AC G0NMT6.1
#=GS A0A261B5L5_9PELO/1-220 AC A0A261B5L5.1
#=GS A0A1I7UBN1_9PELO/1-183 AC A0A1I7UBN1.1
#=GS A0A1I7UBM9_9PELO/2-250 AC A0A1I7UBM9.1
#=GS A0A131MB81_CAEEL/1-221 AC A0A131MB81.1
#=GS A0A1I7V258_9PELO/1-65 AC A0A1I7V258.1
#=GS A8WPR4_CAEBR/1-75 AC A8WPR4.1
#=GS A0A1I7UBV8_9PELO/1-147 AC A0A1I7UBV8.1
#=GS O44610_CAEEL/1-215 AC O44610.2
#=GS E3MQ48_CAERE/1-314 AC E3MQ48.1
#=GS G0NEK7_CAEBE/2-310 AC G0NEK7.1
#=GS O17857_CAEEL/1-197 AC O17857.2
#=GS A0A2G5TDH8_9PELO/1-189 AC A0A2G5TDH8.1
#=GS A8WPP8_CAEBR/1-307 AC A8WPP8.1
#=GS A0A1I8CXL7_9BILA/13-313 AC A0A1I8CXL7.1
#=GS K7GZQ9_CAEJA/1-142 AC K7GZQ9.1
#=GS A0A2G5TDK3_9PELO/51-140 AC A0A2G5TDK3.1
#=GS A8WPR6_CAEBR/5-84 AC A8WPR6.1
#=GS A0A1I7TYH1_9PELO/1-312 AC A0A1I7TYH1.1
#=GS A0A261CC60_9PELO/2-60 AC A0A261CC60.1
#=GS A0A1I7U7Z4_9PELO/1-207 AC A0A1I7U7Z4.1
#=GS A0A2G5T867_9PELO/1-88 AC A0A2G5T867.1
#=GS A8Y296_CAEBR/1-309 AC A8Y296.2
#=GS E3ND54_CAERE/242-277 AC E3ND54.1
#=GS A0A1I7RQR7_BURXY/154-279 AC A0A1I7RQR7.1
#=GS A0A2G5T9K6_9PELO/3-196 AC A0A2G5T9K6.1
#=GS G0PLJ7_CAEBE/1-70 AC G0PLJ7.1
#=GS H3G4D2_PRIPA/4-56 AC H3G4D2.1
#=GS A0A2H2IZK4_CAEJA/2-223 AC A0A2H2IZK4.1
#=GS A0A1I7UVV9_9PELO/1-182 AC A0A1I7UVV9.1
#=GS A0A2G5TGH0_9PELO/2-309 AC A0A2G5TGH0.1
#=GS A0A2G5TEA1_9PELO/154-230 AC A0A2G5TEA1.1
#=GS E3MHG1_CAERE/1-300 AC E3MHG1.1
#=GS A8Y2N2_CAEBR/1-321 AC A8Y2N2.2
#=GS A0A1I7UBN2_9PELO/1-310 AC A0A1I7UBN2.1
#=GS A0A1I7UBD4_9PELO/63-137 AC A0A1I7UBD4.1
#=GS K7H986_CAEJA/1-61 AC K7H986.1
#=GS G0PLJ8_CAEBE/1-290 AC G0PLJ8.1
#=GS A0A0M7RFA4_CAEEL/1-282 AC A0A0M7RFA4.1
#=GS A0A2H2IQ48_CAEJA/1-140 AC A0A2H2IQ48.1
#=GS A0A0C2CNR2_9BILA/1-71 AC A0A0C2CNR2.1
#=GS A0A2G5TBS7_9PELO/337-620 AC A0A2G5TBS7.1
#=GS E3LLK0_CAERE/1-82 AC E3LLK0.1
#=GS E3LJU6_CAERE/328-617 AC E3LJU6.1
#=GS A0A2G5TCZ3_9PELO/274-552 AC A0A2G5TCZ3.1
#=GS K7GZQ8_CAEJA/1-147 AC K7GZQ8.1
#=GS A0A2G5TH53_9PELO/15-322 AC A0A2G5TH53.1
#=GS A0A260ZIC9_9PELO/1-75 AC A0A260ZIC9.1
#=GS E3NP41_CAERE/1-308 AC E3NP41.1
#=GS A0A2G5T828_9PELO/1-276 AC A0A2G5T828.1
#=GS A0A0N4W7S2_HAEPC/2-75 AC A0A0N4W7S2.1
#=GS A0A2G5TBY5_9PELO/1-293 AC A0A2G5TBY5.1
#=GS A0A1I7TYH5_9PELO/2-120 AC A0A1I7TYH5.1
#=GS A0A1I7V257_9PELO/64-153 AC A0A1I7V257.1
#=GS A0A2G5TEB1_9PELO/1-310 AC A0A2G5TEB1.1
#=GS A8WXY4_CAEBR/1-312 AC A8WXY4.1
#=GS A0A2G5T760_9PELO/63-165 AC A0A2G5T760.1
#=GS A0A261CC60_9PELO/58-244 AC A0A261CC60.1
#=GS E3LL33_CAERE/1-325 AC E3LL33.1
#=GS A0A2G5TCT2_9PELO/147-237 AC A0A2G5TCT2.1
#=GS E3NEP5_CAERE/190-371 AC E3NEP5.1
#=GS H3DXF5_PRIPA/1-72 AC H3DXF5.1
#=GS A8XS47_CAEBR/1-310 AC A8XS47.1
#=GS A0A2G5TBR3_9PELO/182-273 AC A0A2G5TBR3.1
#=GS G0MT60_CAEBE/1-209 AC G0MT60.1
#=GS Q9TXS5_CAEEL/1-309 AC Q9TXS5.2
#=GS A0A2G5TN15_9PELO/1-311 AC A0A2G5TN15.1
#=GS A0A261BT29_9PELO/1-282 AC A0A261BT29.1
#=GS G0M914_CAEBE/64-186 AC G0M914.1
#=GS A0A2G5TDH8_9PELO/178-243 AC A0A2G5TDH8.1
#=GS A0A2G5TCT7_9PELO/64-153 AC A0A2G5TCT7.1
#=GS A0A2G5TCT2_9PELO/2-150 AC A0A2G5TCT2.1
#=GS A0A261CC87_9PELO/868-1132 AC A0A261CC87.1
#=GS E3MQ47_CAERE/1-309 AC E3MQ47.1
#=GS H2KZM1_CAEEL/1-310 AC H2KZM1.1
#=GS A0A2G5TN31_9PELO/1-300 AC A0A2G5TN31.1
#=GS A0A1I7TYH4_9PELO/1-309 AC A0A1I7TYH4.1
#=GS A8Y288_CAEBR/1-276 AC A8Y288.2
#=GS G0NEK9_CAEBE/2-310 AC G0NEK9.1
#=GS P91507_CAEEL/2-313 AC P91507.1
#=GS P91504_CAEEL/1-309 AC P91504.2
#=GS A0A1I7TYH2_9PELO/1-260 AC A0A1I7TYH2.1
#=GS A8X1Y1_CAEBR/1-310 AC A8X1Y1.1
#=GS A0A2G5T8G9_9PELO/1-65 AC A0A2G5T8G9.1
#=GS K7GYR5_CAEJA/1-196 AC K7GYR5.1
#=GS G0PLI0_CAEBE/1-312 AC G0PLI0.1
#=GS A0A016U164_9BILA/21-138 AC A0A016U164.1
#=GS A0A2H2HZT5_CAEJA/1-84 AC A0A2H2HZT5.1
#=GS A0A261BV28_9PELO/82-310 AC A0A261BV28.1
#=GS A0A1I7TYH8_9PELO/1-276 AC A0A1I7TYH8.1
#=GS E3LJU0_CAERE/2-313 AC E3LJU0.1
#=GS E3LJT3_CAERE/1-315 AC E3LJT3.1
#=GS A0A2G5TB56_9PELO/311-572 AC A0A2G5TB56.1
#=GS A0A261BZ94_9PELO/1-291 AC A0A261BZ94.1
#=GS A8XBA5_CAEBR/72-232 AC A8XBA5.2
#=GS A8Y295_CAEBR/1-267 AC A8Y295.2
#=GS K7GZQ7_CAEJA/1-88 AC K7GZQ7.1
#=GS A0A0B2VU57_TOXCA/1-99 AC A0A0B2VU57.1
#=GS E3LKG3_CAERE/1-183 AC E3LKG3.1
#=GS A0A1I7T223_9PELO/1-170 AC A0A1I7T223.1
#=GS O16981_CAEEL/1-309 AC O16981.1
#=GS A0A2G5TEC6_9PELO/186-276 AC A0A2G5TEC6.1
#=GS E3LLJ8_CAERE/2-81 AC E3LLJ8.1
#=GS O17809_CAEEL/1-308 AC O17809.1
#=GS G0MT94_CAEBE/2-313 AC G0MT94.1
#=GS A0A1I7TYH3_9PELO/11-322 AC A0A1I7TYH3.1
#=GS H3FBN5_PRIPA/1-59 AC H3FBN5.1
#=GS A0A1I7X2B9_HETBA/4-83 AC A0A1I7X2B9.1
#=GS A0A2G5TC38_9PELO/1-310 AC A0A2G5TC38.1
#=GS A0A2G5TBP0_9PELO/1-308 AC A0A2G5TBP0.1
#=GS E3LI06_CAERE/69-268 AC E3LI06.1
#=GS A0A2G5T8Q8_9PELO/61-217 AC A0A2G5T8Q8.1
#=GS H3E258_PRIPA/5-76 AC H3E258.1
#=GS A0A261CC87_9PELO/546-854 AC A0A261CC87.1
#=GS G0MT91_CAEBE/1-309 AC G0MT91.1
#=GS A8Y297_CAEBR/178-300 AC A8Y297.2
#=GS A0A1I7TYH6_9PELO/3-69 AC A0A1I7TYH6.1
#=GS A0A1I7V261_9PELO/5-44 AC A0A1I7V261.1
#=GS A0A1I7V259_9PELO/1-134 AC A0A1I7V259.1
#=GS A0A1I7TW86_9PELO/23-157 AC A0A1I7TW86.1
#=GS A8XRY0_CAEBR/2-300 AC A8XRY0.2
#=GS G0MPB5_CAEBE/96-153 AC G0MPB5.1
#=GS A0A1I7TYH0_9PELO/1-180 AC A0A1I7TYH0.1
#=GS A0A1I7S9B4_BURXY/169-291 AC A0A1I7S9B4.1
#=GS A0A1I7RJW4_BURXY/196-307 AC A0A1I7RJW4.1
#=GS E3LJ88_CAERE/1-323 AC E3LJ88.1
#=GS A0A2G5TAN4_9PELO/341-602 AC A0A2G5TAN4.1
#=GS A0A2G5T8G9_9PELO/62-224 AC A0A2G5T8G9.1
#=GS A0A2G5TCT7_9PELO/2-66 AC A0A2G5TCT7.1
#=GS A8Y4D6_CAEBR/140-229 AC A8Y4D6.1
#=GS A0A1I7UBD4_9PELO/130-166 AC A0A1I7UBD4.1
#=GS O01456_CAEEL/1-312 AC O01456.1
#=GS H2KYR0_CAEEL/89-187 AC H2KYR0.1
#=GS G0MPB3_CAEBE/2-309 AC G0MPB3.1
#=GS A0A261BJ23_9PELO/1-48 AC A0A261BJ23.1
#=GS A0A2G5TEA1_9PELO/225-316 AC A0A2G5TEA1.1
#=GS E3LL62_CAERE/2-331 AC E3LL62.1
#=GS A8XBA5_CAEBR/1-79 AC A8XBA5.2
#=GS O16347_CAEEL/1-309 AC O16347.1
#=GS A0A2G5TBS7_9PELO/44-329 AC A0A2G5TBS7.1
#=GS SRJ38_CAEEL/1-309 AC O16975.2
#=GS A0A090L599_STRRB/8-312 AC A0A090L599.1
#=GS A0A1I7V256_9PELO/1-134 AC A0A1I7V256.1
#=GS A0A2H2HYJ9_CAEJA/1-156 AC A0A2H2HYJ9.1
#=GS Q9NA41_CAEEL/1-308 AC Q9NA41.4
#=GS A0A2G5T9T9_9PELO/1-259 AC A0A2G5T9T9.1
#=GS A8WPR5_CAEBR/63-136 AC A8WPR5.2
#=GS Q9UAW7_CAEEL/2-313 AC Q9UAW7.1
#=GS A0A261BV28_9PELO/19-84 AC A0A261BV28.1
#=GS H3DT40_PRIPA/221-429 AC H3DT40.1
#=GS A0A2G5TC67_9PELO/1-309 AC A0A2G5TC67.1
#=GS A0A2G5TD46_9PELO/1-140 AC A0A2G5TD46.1
#=GS O16986_CAEEL/1-312 AC O16986.1
#=GS A0A261BT52_9PELO/1-309 AC A0A261BT52.1
#=GS A8WPR3_CAEBR/1-309 AC A8WPR3.1
#=GS A0A1I7TP47_9PELO/2-68 AC A0A1I7TP47.1
#=GS A0A2G5TG87_9PELO/22-329 AC A0A2G5TG87.1
#=GS A0A2H2I4S7_CAEJA/2-120 AC A0A2H2I4S7.1
#=GS E3LI08_CAERE/1-188 AC E3LI08.1
#=GS O16987_CAEEL/1-309 AC O16987.1
#=GS K7H5N3_CAEJA/1-309 AC K7H5N3.1
#=GS A0A2G5TBV4_9PELO/1-108 AC A0A2G5TBV4.1
#=GS A0A1I7RJW3_BURXY/1-81 AC A0A1I7RJW3.1
#=GS E3LQ10_CAERE/2-314 AC E3LQ10.1
#=GS A0A1I7V260_9PELO/5-48 AC A0A1I7V260.1
#=GS H3ETY9_PRIPA/270-341 AC H3ETY9.1
#=GS E3CTG4_CAEEL/1-221 AC E3CTG4.1
#=GS E3ND54_CAERE/19-245 AC E3ND54.1
#=GS A0A1I7TYI0_9PELO/37-122 AC A0A1I7TYI0.1
#=GS Q966G6_CAEEL/1-311 AC Q966G6.1
#=GS E3MB92_CAERE/1-324 AC E3MB92.1
#=GS A0A1I7V251_9PELO/1-130 AC A0A1I7V251.1
#=GS G0MTC3_CAEBE/1-312 AC G0MTC3.1
#=GS A0A2G5TDK3_9PELO/1-55 AC A0A2G5TDK3.1
#=GS A0A2G5TCZ7_9PELO/1-259 AC A0A2G5TCZ7.1
#=GS G0NYL3_CAEBE/1-279 AC G0NYL3.1
#=GS A0A1I7V262_9PELO/1-67 AC A0A1I7V262.1
#=GS Q22283_CAEEL/1-308 AC Q22283.2
#=GS A0A261CDU5_9PELO/299-606 AC A0A261CDU5.1
#=GS A0A261BRR1_9PELO/2-188 AC A0A261BRR1.1
#=GS A0A2G5T9C3_9PELO/3-75 AC A0A2G5T9C3.1
#=GS A0A261BV06_9PELO/1-156 AC A0A261BV06.1
#=GS A0A0N5B371_STREA/1-80 AC A0A0N5B371.1
#=GS O17355_CAEEL/1-310 AC O17355.1
#=GS Q9GUC0_CAEEL/2-310 AC Q9GUC0.1
#=GS A0A261BV06_9PELO/153-277 AC A0A261BV06.1
#=GS A0A2G5TCZ2_9PELO/1-82 AC A0A2G5TCZ2.1
#=GS A0A1I7U758_9PELO/2-133 AC A0A1I7U758.1
#=GS A0A261BS30_9PELO/317-627 AC A0A261BS30.1
#=GS A0A2G5TBN2_9PELO/1-287 AC A0A2G5TBN2.1
#=GS B6IET6_CAEBR/1-144 AC B6IET6.1
#=GS H2KYR0_CAEEL/1-98 AC H2KYR0.1
#=GS G0NEI4_CAEBE/1-310 AC G0NEI4.1
#=GS A0A2G5T8Q8_9PELO/1-65 AC A0A2G5T8Q8.1
#=GS A0A131MBS1_CAEEL/1-116 AC A0A131MBS1.1
#=GS H3EM03_PRIPA/4-156 AC H3EM03.1
#=GS G0PLJ7_CAEBE/63-168 AC G0PLJ7.1
#=GS G0M913_CAEBE/148-271 AC G0M913.1
#=GS A0A261CDS5_9PELO/1-309 AC A0A261CDS5.1
#=GS Q9N5F9_CAEEL/1-310 AC Q9N5F9.2
#=GS E3NDJ8_CAERE/1-47 AC E3NDJ8.1
#=GS A0A261BQ61_9PELO/2-308 AC A0A261BQ61.1
#=GS G0PKA4_CAEBE/3-246 AC G0PKA4.1
#=GS A0A2G5TBL0_9PELO/1-147 AC A0A2G5TBL0.1
#=GS Q9N4X5_CAEEL/1-310 AC Q9N4X5.2
#=GS A0A2G5T7M7_9PELO/27-122 AC A0A2G5T7M7.1
#=GS A8WQ73_CAEBR/1-310 AC A8WQ73.2
#=GS A8WPR5_CAEBR/1-65 AC A8WPR5.2
#=GS G0M913_CAEBE/1-150 AC G0M913.1
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