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Database: Pfam
Entry: 7TM_GPCR_Srj
LinkDB: 7TM_GPCR_Srj
Original site: 7TM_GPCR_Srj 
#=GF ID   7TM_GPCR_Srj
#=GF AC   PF10319.12
#=GF DE   Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srj
#=GF PI   Srj; 
#=GF AU   Thomas JH;0000-0002-6256-4536
#=GF AU   Robertson H;
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Thomas JH, Robertson H
#=GF GA   24.10 24.10;
#=GF TC   24.10 24.10;
#=GF NC   24.00 24.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0192
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7585938
#=GF RT   Divergent seven transmembrane receptors are candidate
#=GF RT   chemosensory receptors in C. elegans. 
#=GF RA   Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI; 
#=GF RL   Cell 1995;83:207-218.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11238245
#=GF RT   Updating the str and srj (stl) families of chemoreceptors in
#=GF RT   Caenorhabditis nematodes reveals frequent gene movement within
#=GF RT   and between chromosomes. 
#=GF RA   Robertson HM; 
#=GF RL   Chem Senses. 2001;26:151-159.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   18050473
#=GF RT   The putative chemoreceptor families of C. elegans. 
#=GF RA   Robertson HM, Thomas JH; 
#=GF RL   WormBook. 2006; [Epub ahead of print]
#=GF DR   INTERPRO; IPR019423;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Chemoreception is mediated in Caenorhabditis elegans by members
#=GF CC   of the seven-transmembrane G-protein-coupled receptor class (7TM
#=GF CC   GPCRs) of proteins which are of the serpentine type [1]. Srj is
#=GF CC   part of the Str superfamily of chemoreceptors. The srj family is
#=GF CC   designated as the out-group based on its location in preliminary
#=GF CC   phylogenetic analyses of the entire superfamily [2].
#=GF CC   Chemoperception is one of the central senses of soil nematodes
#=GF CC   like C. elegans which are otherwise 'blind' and 'deaf' [3].
#=GF SQ   332
#=GS A0A2G5TA93_9PELO/1-259     AC A0A2G5TA93.1
#=GS A0A261AHJ9_9PELO/1-317     AC A0A261AHJ9.1
#=GS Q965U3_CAEEL/1-309         AC Q965U3.3
#=GS O17354_CAEEL/1-310         AC O17354.2
#=GS A0A2G5TD84_9PELO/1-314     AC A0A2G5TD84.1
#=GS A0A2G5T8E3_9PELO/1-312     AC A0A2G5T8E3.1
#=GS A0A2G5T8J9_9PELO/1-325     AC A0A2G5T8J9.1
#=GS G0PN06_CAEBE/2-309         AC G0PN06.1
#=GS A8Y408_CAEBR/2-329         AC A8Y408.2
#=GS E3LPT6_CAERE/1-270         AC E3LPT6.1
#=GS E3LLJ7_CAERE/1-201         AC E3LLJ7.1
#=GS O16348_CAEEL/1-309         AC O16348.2
#=GS E3LJU4_CAERE/2-313         AC E3LJU4.1
#=GS A0A2A2LY96_9BILA/10-82     AC A0A2A2LY96.1
#=GS A0A2G5TBA3_9PELO/1-146     AC A0A2G5TBA3.1
#=GS A0A2G5TBR3_9PELO/1-188     AC A0A2G5TBR3.1
#=GS P91506_CAEEL/2-313         AC P91506.2
#=GS G0NMT6_CAEBE/83-206        AC G0NMT6.1
#=GS A0A2A2KJB4_9BILA/14-308    AC A0A2A2KJB4.1
#=GS A0A261B5L5_9PELO/1-220     AC A0A261B5L5.1
#=GS A0A131MB81_CAEEL/1-221     AC A0A131MB81.1
#=GS A8WPR4_CAEBR/1-75          AC A8WPR4.1
#=GS O44610_CAEEL/1-215         AC O44610.2
#=GS E3MQ48_CAERE/1-314         AC E3MQ48.1
#=GS G0NEK7_CAEBE/2-310         AC G0NEK7.1
#=GS O17857_CAEEL/1-197         AC O17857.2
#=GS A0A2G5TDH8_9PELO/1-189     AC A0A2G5TDH8.1
#=GS A8WPP8_CAEBR/1-307         AC A8WPP8.1
#=GS K7GZQ9_CAEJA/1-142         AC K7GZQ9.1
#=GS A0A2G5TDK3_9PELO/51-140    AC A0A2G5TDK3.1
#=GS A8WPR6_CAEBR/5-84          AC A8WPR6.1
#=GS A0A261CC60_9PELO/2-60      AC A0A261CC60.1
#=GS A0A2A2JPX2_9BILA/10-80     AC A0A2A2JPX2.1
#=GS A0A2G5T867_9PELO/1-88      AC A0A2G5T867.1
#=GS A8Y296_CAEBR/1-309         AC A8Y296.2
#=GS E3ND54_CAERE/242-277       AC E3ND54.1
#=GS A0A2G5T9K6_9PELO/3-196     AC A0A2G5T9K6.1
#=GS G0PLJ7_CAEBE/1-70          AC G0PLJ7.1
#=GS A0A2H2IZK4_CAEJA/2-223     AC A0A2H2IZK4.1
#=GS A0A2G5TGH0_9PELO/2-309     AC A0A2G5TGH0.1
#=GS A0A2G5TEA1_9PELO/154-230   AC A0A2G5TEA1.1
#=GS E3MHG1_CAERE/1-300         AC E3MHG1.1
#=GS A8Y2N2_CAEBR/1-321         AC A8Y2N2.2
#=GS K7H986_CAEJA/1-61          AC K7H986.1
#=GS G0PLJ8_CAEBE/1-290         AC G0PLJ8.1
#=GS A0A0M7RFA4_CAEEL/1-282     AC A0A0M7RFA4.1
#=GS A0A2H2IQ48_CAEJA/1-140     AC A0A2H2IQ48.1
#=GS H3FPE9_PRIPA/924-1044      AC H3FPE9.2
#=GS A0A0C2CNR2_9BILA/1-71      AC A0A0C2CNR2.1
#=GS A0A2G5TBS7_9PELO/337-620   AC A0A2G5TBS7.1
#=GS E3LLK0_CAERE/1-82          AC E3LLK0.1
#=GS E3LJU6_CAERE/328-617       AC E3LJU6.1
#=GS A0A2G5TCZ3_9PELO/274-552   AC A0A2G5TCZ3.1
#=GS K7GZQ8_CAEJA/1-147         AC K7GZQ8.1
#=GS A0A2G5TH53_9PELO/15-322    AC A0A2G5TH53.1
#=GS A0A260ZIC9_9PELO/1-75      AC A0A260ZIC9.1
#=GS E3NP41_CAERE/1-308         AC E3NP41.1
#=GS A0A2G5T828_9PELO/1-276     AC A0A2G5T828.1
#=GS A0A0N4W7S2_HAEPC/2-75      AC A0A0N4W7S2.1
#=GS A0A2G5TBY5_9PELO/1-293     AC A0A2G5TBY5.1
#=GS A0A2G5TEB1_9PELO/1-310     AC A0A2G5TEB1.1
#=GS A8WXY4_CAEBR/1-312         AC A8WXY4.1
#=GS A0A261CC60_9PELO/58-244    AC A0A261CC60.1
#=GS E3LL33_CAERE/1-325         AC E3LL33.1
#=GS A0A2G5TCT2_9PELO/147-237   AC A0A2G5TCT2.1
#=GS E3NEP5_CAERE/190-371       AC E3NEP5.1
#=GS A8XS47_CAEBR/1-310         AC A8XS47.1
#=GS A0A2G5TBR3_9PELO/182-273   AC A0A2G5TBR3.1
#=GS G0MT60_CAEBE/1-209         AC G0MT60.1
#=GS Q9TXS5_CAEEL/1-309         AC Q9TXS5.2
#=GS A0A2G5TN15_9PELO/1-311     AC A0A2G5TN15.1
#=GS A0A261BT29_9PELO/1-282     AC A0A261BT29.1
#=GS G0M914_CAEBE/64-186        AC G0M914.1
#=GS A0A2G5TDH8_9PELO/178-243   AC A0A2G5TDH8.1
#=GS A0A2G5TCT7_9PELO/64-153    AC A0A2G5TCT7.1
#=GS A0A2G5TCT2_9PELO/2-150     AC A0A2G5TCT2.1
#=GS A0A261CC87_9PELO/868-1132  AC A0A261CC87.1
#=GS E3MQ47_CAERE/1-309         AC E3MQ47.1
#=GS H2KZM1_CAEEL/1-310         AC H2KZM1.1
#=GS A0A2G5TN31_9PELO/1-300     AC A0A2G5TN31.1
#=GS A8Y288_CAEBR/1-276         AC A8Y288.2
#=GS G0NEK9_CAEBE/2-310         AC G0NEK9.1
#=GS P91507_CAEEL/2-313         AC P91507.1
#=GS P91504_CAEEL/1-309         AC P91504.2
#=GS A8X1Y1_CAEBR/1-310         AC A8X1Y1.1
#=GS A0A2G5T8G9_9PELO/1-65      AC A0A2G5T8G9.1
#=GS K7GYR5_CAEJA/1-196         AC K7GYR5.1
#=GS G0PLI0_CAEBE/1-312         AC G0PLI0.1
#=GS A0A2H2HZT5_CAEJA/1-84      AC A0A2H2HZT5.1
#=GS A0A261BV28_9PELO/82-310    AC A0A261BV28.1
#=GS E3LJU0_CAERE/2-313         AC E3LJU0.1
#=GS E3LJT3_CAERE/1-315         AC E3LJT3.1
#=GS A0A2G5TB56_9PELO/311-572   AC A0A2G5TB56.1
#=GS A0A261BZ94_9PELO/1-291     AC A0A261BZ94.1
#=GS A8XBA5_CAEBR/72-232        AC A8XBA5.2
#=GS A8Y295_CAEBR/1-267         AC A8Y295.2
#=GS K7GZQ7_CAEJA/1-88          AC K7GZQ7.1
#=GS A0A0B2VU57_TOXCA/1-99      AC A0A0B2VU57.1
#=GS E3LKG3_CAERE/1-183         AC E3LKG3.1
#=GS O16981_CAEEL/1-309         AC O16981.1
#=GS A0A2G5TEC6_9PELO/186-276   AC A0A2G5TEC6.1
#=GS E3LLJ8_CAERE/2-81          AC E3LLJ8.1
#=GS O17809_CAEEL/1-308         AC O17809.1
#=GS G0MT94_CAEBE/2-313         AC G0MT94.1
#=GS A0A2G5TC38_9PELO/1-310     AC A0A2G5TC38.1
#=GS A0A2G5TBP0_9PELO/1-308     AC A0A2G5TBP0.1
#=GS E3LI06_CAERE/69-268        AC E3LI06.1
#=GS A0A2G5T8Q8_9PELO/61-217    AC A0A2G5T8Q8.1
#=GS A0A261CC87_9PELO/546-854   AC A0A261CC87.1
#=GS G0MT91_CAEBE/1-309         AC G0MT91.1
#=GS A8Y297_CAEBR/178-300       AC A8Y297.2
#=GS A8XRY0_CAEBR/2-300         AC A8XRY0.2
#=GS G0MPB5_CAEBE/96-153        AC G0MPB5.1
#=GS E3LJ88_CAERE/1-323         AC E3LJ88.1
#=GS A0A2G5TAN4_9PELO/341-602   AC A0A2G5TAN4.1
#=GS A0A2G5T8G9_9PELO/62-224    AC A0A2G5T8G9.1
#=GS A0A2G5TCT7_9PELO/2-66      AC A0A2G5TCT7.1
#=GS A8Y4D6_CAEBR/140-229       AC A8Y4D6.1
#=GS O01456_CAEEL/1-312         AC O01456.1
#=GS H2KYR0_CAEEL/89-187        AC H2KYR0.1
#=GS G0MPB3_CAEBE/2-309         AC G0MPB3.1
#=GS A0A261BJ23_9PELO/1-48      AC A0A261BJ23.1
#=GS A0A2G5TEA1_9PELO/225-316   AC A0A2G5TEA1.1
#=GS E3LL62_CAERE/2-331         AC E3LL62.1
#=GS A8XBA5_CAEBR/1-79          AC A8XBA5.2
#=GS O16347_CAEEL/1-309         AC O16347.1
#=GS A0A2G5TBS7_9PELO/44-329    AC A0A2G5TBS7.1
#=GS SRJ38_CAEEL/1-309          AC O16975.2
#=GS A0A090L599_STRRB/8-312     AC A0A090L599.1
#=GS A0A2H2HYJ9_CAEJA/1-156     AC A0A2H2HYJ9.1
#=GS Q9NA41_CAEEL/1-308         AC Q9NA41.4
#=GS A0A2G5T9T9_9PELO/1-259     AC A0A2G5T9T9.1
#=GS A8WPR5_CAEBR/63-136        AC A8WPR5.2
#=GS Q9UAW7_CAEEL/2-313         AC Q9UAW7.1
#=GS A0A261BV28_9PELO/19-84     AC A0A261BV28.1
#=GS A0A2G5TC67_9PELO/1-309     AC A0A2G5TC67.1
#=GS A0A2G5TD46_9PELO/1-140     AC A0A2G5TD46.1
#=GS O16986_CAEEL/1-312         AC O16986.1
#=GS A0A261BT52_9PELO/1-309     AC A0A261BT52.1
#=GS A8WPR3_CAEBR/1-309         AC A8WPR3.1
#=GS A0A4X3NSH3_PRIPA/2-294     AC A0A4X3NSH3.1
#=GS A0A2G5TG87_9PELO/22-329    AC A0A2G5TG87.1
#=GS A0A2H2I4S7_CAEJA/2-120     AC A0A2H2I4S7.1
#=GS E3LI08_CAERE/1-188         AC E3LI08.1
#=GS O16987_CAEEL/1-309         AC O16987.1
#=GS K7H5N3_CAEJA/1-309         AC K7H5N3.1
#=GS A0A4X3NSN3_PRIPA/2-149     AC A0A4X3NSN3.1
#=GS A0A4X3PHE9_PRIPA/2-138     AC A0A4X3PHE9.1
#=GS A0A2G5TBV4_9PELO/1-108     AC A0A2G5TBV4.1
#=GS E3LQ10_CAERE/2-314         AC E3LQ10.1
#=GS E3CTG4_CAEEL/1-221         AC E3CTG4.1
#=GS E3ND54_CAERE/19-245        AC E3ND54.1
#=GS Q966G6_CAEEL/1-311         AC Q966G6.1
#=GS E3MB92_CAERE/1-324         AC E3MB92.1
#=GS H3G4K6_PRIPA/5-109         AC H3G4K6.2
#=GS G0MTC3_CAEBE/1-312         AC G0MTC3.1
#=GS A0A2G5TDK3_9PELO/1-55      AC A0A2G5TDK3.1
#=GS A0A2G5TCZ7_9PELO/1-259     AC A0A2G5TCZ7.1
#=GS G0NYL3_CAEBE/1-279         AC G0NYL3.1
#=GS Q22283_CAEEL/1-308         AC Q22283.2
#=GS A0A261CDU5_9PELO/299-606   AC A0A261CDU5.1
#=GS A0A261BRR1_9PELO/2-188     AC A0A261BRR1.1
#=GS A0A2G5T9C3_9PELO/3-75      AC A0A2G5T9C3.1
#=GS A0A261BV06_9PELO/1-156     AC A0A261BV06.1
#=GS O17355_CAEEL/1-310         AC O17355.1
#=GS Q9GUC0_CAEEL/2-310         AC Q9GUC0.1
#=GS A0A261BV06_9PELO/153-277   AC A0A261BV06.1
#=GS A0A2G5TCZ2_9PELO/1-82      AC A0A2G5TCZ2.1
#=GS A0A261BS30_9PELO/317-627   AC A0A261BS30.1
#=GS A0A2G5TBN2_9PELO/1-287     AC A0A2G5TBN2.1
#=GS B6IET6_CAEBR/1-144         AC B6IET6.1
#=GS H2KYR0_CAEEL/1-98          AC H2KYR0.1
#=GS G0NEI4_CAEBE/1-310         AC G0NEI4.1
#=GS A0A2G5T8Q8_9PELO/1-65      AC A0A2G5T8Q8.1
#=GS A0A131MBS1_CAEEL/1-116     AC A0A131MBS1.1
#=GS G0PLJ7_CAEBE/63-168        AC G0PLJ7.1
#=GS G0M913_CAEBE/148-271       AC G0M913.1
#=GS A0A261CDS5_9PELO/1-309     AC A0A261CDS5.1
#=GS Q9N5F9_CAEEL/1-310         AC Q9N5F9.2
#=GS E3NDJ8_CAERE/1-47          AC E3NDJ8.1
#=GS A0A261BQ61_9PELO/2-308     AC A0A261BQ61.1
#=GS G0PKA4_CAEBE/3-246         AC G0PKA4.1
#=GS A0A2G5TBL0_9PELO/1-147     AC A0A2G5TBL0.1
#=GS Q9N4X5_CAEEL/1-310         AC Q9N4X5.2
#=GS A0A2G5T7M7_9PELO/27-122    AC A0A2G5T7M7.1
#=GS A8WQ73_CAEBR/1-310         AC A8WQ73.2
#=GS A8WPR5_CAEBR/1-65          AC A8WPR5.2
#=GS G0M913_CAEBE/1-150         AC G0M913.1
#=GS G0NM75_CAEBE/1-311         AC G0NM75.1
#=GS E3NDJ9_CAERE/1-249         AC E3NDJ9.1
#=GS E3LKG1_CAERE/1-133         AC E3LKG1.1
#=GS K7HLL4_CAEJA/42-102        AC K7HLL4.1
#=GS A0A2G5T8K5_9PELO/2-190     AC A0A2G5T8K5.1
#=GS E3NGV0_CAERE/1-69          AC E3NGV0.1
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