#=GF ID 7TM_GPCR_Srj
#=GF AC PF10319.15
#=GF DE Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Srj
#=GF PI Srj;
#=GF AU Thomas JH;0000-0002-6256-4536
#=GF AU Robertson H;
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE Thomas JH, Robertson H
#=GF GA 24.10 24.10;
#=GF TC 24.10 24.10;
#=GF NC 24.00 24.00;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 81514348 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0192
#=GF RN [1]
#=GF RM 7585938
#=GF RT Divergent seven transmembrane receptors are candidate
#=GF RT chemosensory receptors in C. elegans.
#=GF RA Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI;
#=GF RL Cell 1995;83:207-218.
#=GF RN [2]
#=GF RM 11238245
#=GF RT Updating the str and srj (stl) families of chemoreceptors in
#=GF RT Caenorhabditis nematodes reveals frequent gene movement within
#=GF RT and between chromosomes.
#=GF RA Robertson HM;
#=GF RL Chem Senses. 2001;26:151-159.
#=GF RN [3]
#=GF RM 18050473
#=GF RT The putative chemoreceptor families of C. elegans.
#=GF RA Robertson HM, Thomas JH;
#=GF RL WormBook. 2006; [Epub ahead of print]
#=GF DR INTERPRO; IPR019423;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC Chemoreception is mediated in Caenorhabditis elegans by members
#=GF CC of the seven-transmembrane G-protein-coupled receptor class (7TM
#=GF CC GPCRs) of proteins which are of the serpentine type [1]. Srj is
#=GF CC part of the Str superfamily of chemoreceptors. The srj family is
#=GF CC designated as the out-group based on its location in preliminary
#=GF CC phylogenetic analyses of the entire superfamily [2].
#=GF CC Chemoperception is one of the central senses of soil nematodes
#=GF CC like C. elegans which are otherwise 'blind' and 'deaf' [3].
#=GF SQ 381
#=GS P91507_CAEEL/2-313 AC P91507.1
#=GS A8Y408_CAEBR/2-329 AC A8Y408.2
#=GS G0MTC3_CAEBE/1-312 AC G0MTC3.1
#=GS A0A2G5TAA6_9PELO/1-246 AC A0A2G5TAA6.1
#=GS O17124_CAEEL/2-307 AC O17124.1
#=GS A0A2G5TCT2_9PELO/147-237 AC A0A2G5TCT2.1
#=GS B6IGE1_CAEBR/21-220 AC B6IGE1.1
#=GS E3LL63_CAERE/2-325 AC E3LL63.1
#=GS A8WQ73_CAEBR/1-310 AC A8WQ73.2
#=GS G0N8S1_CAEBE/16-338 AC G0N8S1.1
#=GS A8WPR5_CAEBR/62-136 AC A8WPR5.2
#=GS A0A0B2VU57_TOXCA/1-99 AC A0A0B2VU57.1
#=GS A8WPR6_CAEBR/5-84 AC A8WPR6.1
#=GS O16981_CAEEL/1-309 AC O16981.1
#=GS A0A8R1DN36_CAEJA/1-187 AC A0A8R1DN36.1
#=GS A0A2G5T8Q8_9PELO/62-217 AC A0A2G5T8Q8.1
#=GS SRJ38_CAEEL/1-309 AC O16975.2
#=GS G0PG39_CAEBE/1-193 AC G0PG39.1
#=GS A8Y407_CAEBR/2-309 AC A8Y407.1
#=GS E3NDJ8_CAERE/1-47 AC E3NDJ8.1
#=GS A8Y280_CAEBR/1-32 AC A8Y280.1
#=GS A0A2G5T8Q8_9PELO/1-64 AC A0A2G5T8Q8.1
#=GS E3LQ10_CAERE/2-314 AC E3LQ10.1
#=GS A0A261BTJ3_9PELO/3-160 AC A0A261BTJ3.1
#=GS A0A2A6BW72_PRIPA/5-108 AC A0A2A6BW72.1
#=GS A0A2G5TD84_9PELO/1-314 AC A0A2G5TD84.1
#=GS A0A261BRR1_9PELO/2-188 AC A0A261BRR1.1
#=GS Q23625_CAEEL/2-309 AC Q23625.2
#=GS A0A2G5T8G9_9PELO/62-224 AC A0A2G5T8G9.1
#=GS A0A915H2J7_9BILA/1-27 AC A0A915H2J7.1
#=GS A0A261BRF7_9PELO/331-638 AC A0A261BRF7.1
#=GS A8Y296_CAEBR/1-309 AC A8Y296.2
#=GS G0MTA5_CAEBE/1-202 AC G0MTA5.1
#=GS A0A8S1H8H9_9PELO/138-365 AC A0A8S1H8H9.1
#=GS A0A8S1HB13_9PELO/4-117 AC A0A8S1HB13.1
#=GS G0MT91_CAEBE/1-309 AC G0MT91.1
#=GS E3MQ48_CAERE/1-314 AC E3MQ48.1
#=GS B6IET6_CAEBR/141-230 AC B6IET6.1
#=GS E3ND54_CAERE/19-245 AC E3ND54.1
#=GS E3NP41_CAERE/1-308 AC E3NP41.1
#=GS A0A2G5T813_9PELO/2-310 AC A0A2G5T813.1
#=GS A0A8R1DIC1_CAEJA/1-156 AC A0A8R1DIC1.1
#=GS P91504_CAEEL/1-309 AC P91504.2
#=GS Q9N4X6_CAEEL/1-307 AC Q9N4X6.1
#=GS E3LJ88_CAERE/1-323 AC E3LJ88.1
#=GS A0A260ZIC9_9PELO/71-265 AC A0A260ZIC9.1
#=GS A0A2A2LY96_9BILA/10-82 AC A0A2A2LY96.1
#=GS A8Y2N1_CAEBR/1-41 AC A8Y2N1.1
#=GS A0A2G5TNR5_9PELO/1-181 AC A0A2G5TNR5.1
#=GS E3LI08_CAERE/1-188 AC E3LI08.1
#=GS A0A2G5TBG5_9PELO/1-293 AC A0A2G5TBG5.1
#=GS A0A2G5TCT7_9PELO/2-66 AC A0A2G5TCT7.1
#=GS A0A8S1HDJ2_9PELO/66-174 AC A0A8S1HDJ2.1
#=GS A0A261BQ69_9PELO/1-310 AC A0A261BQ69.1
#=GS A0A261BV28_9PELO/82-310 AC A0A261BV28.1
#=GS A8Y297_CAEBR/179-300 AC A8Y297.2
#=GS A0A2G5T8Q0_9PELO/1-309 AC A0A2G5T8Q0.1
#=GS E3LL62_CAERE/2-331 AC E3LL62.1
#=GS A0A8S1HDJ2_9PELO/212-344 AC A0A8S1HDJ2.1
#=GS A0A2G5TN31_9PELO/1-300 AC A0A2G5TN31.1
#=GS G0NHT9_CAEBE/2-102 AC G0NHT9.1
#=GS A0A8R1IWE9_CAEJA/1-78 AC A0A8R1IWE9.1
#=GS A0A914EN88_9BILA/25-135 AC A0A914EN88.1
#=GS A0A261BQ47_9PELO/1-130 AC A0A261BQ47.1
#=GS A0A2G5T8X8_9PELO/1-284 AC A0A2G5T8X8.1
#=GS A0A261BV28_9PELO/19-84 AC A0A261BV28.1
#=GS A0A131MD33_CAEEL/2-207 AC A0A131MD33.1
#=GS G0MPB5_CAEBE/1-105 AC G0MPB5.1
#=GS A0A8S1HHA5_9PELO/26-93 AC A0A8S1HHA5.1
#=GS A0A261BT29_9PELO/1-282 AC A0A261BT29.1
#=GS A0A0B1TF64_OESDE/9-195 AC A0A0B1TF64.1
#=GS A0A2G5TCN9_9PELO/1-156 AC A0A2G5TCN9.1
#=GS A0A261CC60_9PELO/58-244 AC A0A261CC60.1
#=GS A0A2G5TDK3_9PELO/51-140 AC A0A2G5TDK3.1
#=GS A0A8S1EEU2_9PELO/3-310 AC A0A8S1EEU2.1
#=GS G0M914_CAEBE/64-185 AC G0M914.1
#=GS A0A2G5TDH8_9PELO/178-243 AC A0A2G5TDH8.1
#=GS A0A2G5TH44_9PELO/38-293 AC A0A2G5TH44.1
#=GS B6IET6_CAEBR/1-144 AC B6IET6.1
#=GS A0A261BV06_9PELO/1-156 AC A0A261BV06.1
#=GS A0A2G5TBA6_9PELO/1-309 AC A0A2G5TBA6.1
#=GS A0A261CDU5_9PELO/299-606 AC A0A261CDU5.1
#=GS E3LJU0_CAERE/2-313 AC E3LJU0.1
#=GS G0MPB3_CAEBE/2-309 AC G0MPB3.1
#=GS Q965U3_CAEEL/1-309 AC Q965U3.3
#=GS Q22283_CAEEL/1-308 AC Q22283.2
#=GS A0A8S1H8H9_9PELO/6-112 AC A0A8S1H8H9.1
#=GS O16986_CAEEL/1-312 AC O16986.1
#=GS G0PAG6_CAEBE/1-169 AC G0PAG6.1
#=GS A0A8S1HB04_9PELO/1-78 AC A0A8S1HB04.1
#=GS A0A2G5T9C3_9PELO/3-75 AC A0A2G5T9C3.1
#=GS E3NDJ9_CAERE/1-249 AC E3NDJ9.1
#=GS A0A8R1I380_CAEJA/1-71 AC A0A8R1I380.1
#=GS G0MT96_CAEBE/2-313 AC G0MT96.1
#=GS A8X1X7_CAEBR/1-309 AC A8X1X7.1
#=GS G0M913_CAEBE/1-149 AC G0M913.1
#=GS A0A260ZIC9_9PELO/1-75 AC A0A260ZIC9.1
#=GS Q9N4Z1_CAEEL/1-309 AC Q9N4Z1.2
#=GS O16990_CAEEL/1-309 AC O16990.1
#=GS G0M913_CAEBE/148-271 AC G0M913.1
#=GS A0A8S1HGK0_9PELO/179-274 AC A0A8S1HGK0.1
#=GS O17830_CAEEL/34-343 AC O17830.2
#=GS E3MB92_CAERE/1-324 AC E3MB92.1
#=GS G0MT92_CAEBE/2-196 AC G0MT92.1
#=GS A0A8R1DIG9_CAEJA/1-84 AC A0A8R1DIG9.1
#=GS A0A261BZ94_9PELO/1-291 AC A0A261BZ94.1
#=GS A8XS49_CAEBR/2-310 AC A8XS49.1
#=GS A0A915GN04_9BILA/202-255 AC A0A915GN04.1
#=GS A0A261AHJ9_9PELO/1-317 AC A0A261AHJ9.1
#=GS A8XS47_CAEBR/1-310 AC A8XS47.1
#=GS A0A8S1EE77_9PELO/76-206 AC A0A8S1EE77.1
#=GS G0NHT9_CAEBE/171-229 AC G0NHT9.1
#=GS Q9GUC0_CAEEL/2-310 AC Q9GUC0.1
#=GS A0A2G5TDK3_9PELO/1-59 AC A0A2G5TDK3.1
#=GS A8Y4D6_CAEBR/140-229 AC A8Y4D6.1
#=GS A0A261CDS5_9PELO/1-309 AC A0A261CDS5.1
#=GS G0NMT6_CAEBE/1-86 AC G0NMT6.1
#=GS O16347_CAEEL/1-309 AC O16347.1
#=GS A0A0M7RFA4_CAEEL/1-282 AC A0A0M7RFA4.1
#=GS E3LHE1_CAERE/47-369 AC E3LHE1.1
#=GS A8XBA5_CAEBR/72-232 AC A8XBA5.2
#=GS A0A2G5TC67_9PELO/1-309 AC A0A2G5TC67.1
#=GS G0M8Z4_CAEBE/1-310 AC G0M8Z4.1
#=GS E3LI06_CAERE/1-74 AC E3LI06.1
#=GS A0A2G5TEC6_9PELO/1-190 AC A0A2G5TEC6.1
#=GS E3LKG0_CAERE/14-133 AC E3LKG0.1
#=GS Q9NA41_CAEEL/1-308 AC Q9NA41.4
#=GS E3LQ09_CAERE/2-309 AC E3LQ09.1
#=GS A0A2G5TBN2_9PELO/1-287 AC A0A2G5TBN2.1
#=GS A0A261CC87_9PELO/872-1132 AC A0A261CC87.1
#=GS G0M8S8_CAEBE/3-309 AC G0M8S8.1
#=GS G0NHT9_CAEBE/98-175 AC G0NHT9.1
#=GS A0A8R1HSS7_CAEJA/29-119 AC A0A8R1HSS7.1
#=GS E3LL90_CAERE/1-312 AC E3LL90.1
#=GS A0A2G5TGH0_9PELO/2-309 AC A0A2G5TGH0.1
#=GS A8X2P6_CAEBR/1-310 AC A8X2P6.2
#=GS O44610_CAEEL/1-216 AC O44610.2
#=GS G0NMT6_CAEBE/83-206 AC G0NMT6.1
#=GS A8WPR5_CAEBR/1-65 AC A8WPR5.2
#=GS A0A8R1I1E2_CAEJA/1-61 AC A0A8R1I1E2.1
#=GS A0A8R1HNI2_CAEJA/2-120 AC A0A8R1HNI2.1
#=GS A8Y2N2_CAEBR/1-321 AC A8Y2N2.2
#=GS A0A2G5TEC6_9PELO/185-276 AC A0A2G5TEC6.1
#=GS A0A8R1HSB3_CAEJA/1-145 AC A0A8R1HSB3.1
#=GS A0A811L776_9BILA/21-151 AC A0A811L776.1
#=GS E3LPT6_CAERE/1-270 AC E3LPT6.1
#=GS A0A8S1EE77_9PELO/1-93 AC A0A8S1EE77.1
#=GS A0A2G5TD46_9PELO/134-225 AC A0A2G5TD46.1
#=GS A0A8R1DYM7_CAEJA/1-139 AC A0A8R1DYM7.1
#=GS A0A2G5T9T9_9PELO/1-259 AC A0A2G5T9T9.1
#=GS A8Y288_CAEBR/1-276 AC A8Y288.2
#=GS A0A2G5TCT7_9PELO/64-153 AC A0A2G5TCT7.1
#=GS A0A260ZCZ4_9PELO/1-308 AC A0A260ZCZ4.1
#=GS A0A2A6CL21_PRIPA/2-138 AC A0A2A6CL21.1
#=GS A0A2G5TBS7_9PELO/337-620 AC A0A2G5TBS7.1
#=GS E3LJT2_CAERE/2-310 AC E3LJT2.1
#=GS E3NEP5_CAERE/1-189 AC E3NEP5.1
#=GS A0A8S1HHA5_9PELO/94-213 AC A0A8S1HHA5.1
#=GS A0A915G638_9BILA/1-310 AC A0A915G638.1
#=GS A0A2G5TD46_9PELO/1-140 AC A0A2G5TD46.1
#=GS A0A8R1DWA2_CAEJA/1-284 AC A0A8R1DWA2.1
#=GS A0A2G5TBL0_9PELO/1-147 AC A0A2G5TBL0.1
#=GS G0M912_CAEBE/63-225 AC G0M912.1
#=GS A0A261BV06_9PELO/154-277 AC A0A261BV06.1
#=GS A0A915G3I0_9BILA/3-296 AC A0A915G3I0.1
#=GS A0A2G5TAN4_9PELO/341-602 AC A0A2G5TAN4.1
#=GS G0MT90_CAEBE/1-174 AC G0MT90.1
#=GS A0A8S1HB13_9PELO/316-557 AC A0A8S1HB13.1
#=GS A0A2G5TCX5_9PELO/2-310 AC A0A2G5TCX5.1
#=GS A8XBA5_CAEBR/1-79 AC A8XBA5.2
#=GS A8Y280_CAEBR/24-115 AC A8Y280.1
#=GS A0A8R1EBW0_CAEJA/2-223 AC A0A8R1EBW0.1
#=GS E3NGV0_CAERE/1-69 AC E3NGV0.1
#=GS A0A2A6CKI0_PRIPA/146-260 AC A0A2A6CKI0.1
#=GS E3MQ47_CAERE/1-309 AC E3MQ47.1
#=GS O17125_CAEEL/2-307 AC O17125.5
#=GS G0NEK9_CAEBE/2-310 AC G0NEK9.1
#=GS A0A2G5T8G9_9PELO/1-65 AC A0A2G5T8G9.1
#=GS G0PKA4_CAEBE/3-246 AC G0PKA4.1
#=GS A0A2G5TBA3_9PELO/1-146 AC A0A2G5TBA3.1
#=GS A0A2G5T8J9_9PELO/1-325 AC A0A2G5T8J9.1
#=GS E3LL33_CAERE/1-325 AC E3LL33.1
#=GS G0NMT5_CAEBE/1-89 AC G0NMT5.1
#=GS G0PNX6_CAEBE/2-164 AC G0PNX6.1
#=GS E3LJU5_CAERE/1-309 AC E3LJU5.1
#=GS A0A8S1HB13_9PELO/578-655 AC A0A8S1HB13.1
#=GS A0A8S1HGK0_9PELO/5-187 AC A0A8S1HGK0.1
#=GS E3MNC9_CAERE/1-288 AC E3MNC9.1
#=GS O16982_CAEEL/1-309 AC O16982.1
#=GS G0MT59_CAEBE/20-310 AC G0MT59.1
#=GS A0A2G5TCZ3_9PELO/274-552 AC A0A2G5TCZ3.1
#=GS A0A2A2LC13_9BILA/11-103 AC A0A2A2LC13.1
#=GS A0A2G5T8E3_9PELO/1-312 AC A0A2G5T8E3.1
#=GS A0A2G5THR4_9PELO/1-272 AC A0A2G5THR4.1
#=GS G0PLJ8_CAEBE/1-290 AC G0PLJ8.1
#=GS Q9UAW7_CAEEL/2-313 AC Q9UAW7.1
#=GS A8Y282_CAEBR/1-312 AC A8Y282.1
#=GS A0A2G5TBJ8_9PELO/1-311 AC A0A2G5TBJ8.1
#=GS A0A261BVE0_9PELO/1-290 AC A0A261BVE0.1
#=GS A8Y295_CAEBR/1-267 AC A8Y295.2
#=GS A0A8S1EEX0_9PELO/1-92 AC A0A8S1EEX0.1
#=GS P91506_CAEEL/2-313 AC P91506.2
#=GS A0A486WYK3_CAEEL/1-284 AC A0A486WYK3.1
#=GS A0A8R1EBI5_CAEJA/1-119 AC A0A8R1EBI5.1
#=GS A0A261B5L5_9PELO/1-220 AC A0A261B5L5.1
#=GS A0A8S1HKL1_9PELO/4-274 AC A0A8S1HKL1.1
#=GS G0NM75_CAEBE/1-311 AC G0NM75.1
#=GS E3LLJ7_CAERE/199-273 AC E3LLJ7.1
#=GS O16348_CAEEL/1-309 AC O16348.2
#=GS G0MT94_CAEBE/2-313 AC G0MT94.1
#=GS A0A8S1HQM0_9PELO/1-41 AC A0A8S1HQM0.1
#=GS A0A915GTT1_9BILA/4-74 AC A0A915GTT1.1
#=GS A0A8S1HBT6_9PELO/117-226 AC A0A8S1HBT6.1
#=GS A0A8S1HHD1_9PELO/259-348 AC A0A8S1HHD1.1
#=GS A0A0K2WN07_CAEEL/1-161 AC A0A0K2WN07.1
#=GS A0A090L599_STRRB/8-312 AC A0A090L599.1
#=GS A8Y2N1_CAEBR/35-196 AC A8Y2N1.1
#=GS E3LI06_CAERE/69-268 AC E3LI06.1
#=GS A8WPP8_CAEBR/1-307 AC A8WPP8.1
#=GS A0A2G5TC38_9PELO/1-310 AC A0A2G5TC38.1
#=GS A8X1Y1_CAEBR/1-310 AC A8X1Y1.1
#=GS A0A2G5T9K6_9PELO/3-196 AC A0A2G5T9K6.1
#=GS A8WXY4_CAEBR/1-312 AC A8WXY4.1
#=GS A0A2A6C403_PRIPA/446-516 AC A0A2A6C403.1
#=GS A0A8S1HHD1_9PELO/341-396 AC A0A8S1HHD1.1
#=GS A0A2G5TEA1_9PELO/154-230 AC A0A2G5TEA1.1
#=GS Q9TXS5_CAEEL/1-309 AC Q9TXS5.2
#=GS A8WQ28_CAEBR/1-309 AC A8WQ28.1
#=GS A8X1Y0_CAEBR/1-310 AC A8X1Y0.1
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