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Database: Pfam
Entry: 7TM_GPCR_Str
LinkDB: 7TM_GPCR_Str
Original site: 7TM_GPCR_Str 
#=GF ID   7TM_GPCR_Str
#=GF AC   PF10326.12
#=GF DE   Serpentine type 7TM GPCR chemoreceptor Str
#=GF PI   Str; 
#=GF AU   Thomas JH;0000-0002-6256-4536
#=GF AU   Robertson H;
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Thomas JH, Robertson H
#=GF GA   22.00 22.00;
#=GF TC   22.00 22.00;
#=GF NC   21.90 21.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0192
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7585938
#=GF RT   Divergent seven transmembrane receptors are candidate
#=GF RT   chemosensory receptors in C. elegans. 
#=GF RA   Troemel ER, Chou JH, Dwyer ND, Colbert HA, Bargmann CI; 
#=GF RL   Cell 1995;83:207-218.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11238245
#=GF RT   Updating the str and srj (stl) families of chemoreceptors in
#=GF RT   Caenorhabditis nematodes reveals frequent gene movement within
#=GF RT   and between chromosomes. 
#=GF RA   Robertson HM; 
#=GF RL   Chem Senses. 2001;26:151-159.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   18050473
#=GF RT   The putative chemoreceptor families of C. elegans. 
#=GF RA   Robertson HM, Thomas JH; 
#=GF RL   WormBook. 2006; [Epub ahead of print]
#=GF DR   INTERPRO; IPR019428;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Chemoreception is mediated in Caenorhabditis elegans by members
#=GF CC   of the seven-transmembrane G-protein-coupled receptor class (7TM
#=GF CC   GPCRs) of proteins which are of the serpentine type [1]. Str is
#=GF CC   a member of the Str superfamily of chemoreceptors. Almost a
#=GF CC   quarter (22.5%) of str and srj family genes and pseudogenes in
#=GF CC   C. elegans appear to have been newly formed by gene duplications
#=GF CC   since the species split [2].  Chemoperception is one of the
#=GF CC   central senses of soil nematodes like C. elegans which are
#=GF CC   otherwise 'blind' and 'deaf' [3].
#=GF SQ   3033
#=GS K7HBY0_CAEJA/1-223          AC K7HBY0.1
#=GS A0A4X3PPJ7_PRIPA/8-302      AC A0A4X3PPJ7.1
#=GS A0A4X3PH51_PRIPA/4-317      AC A0A4X3PH51.1
#=GS A0A016U052_9BILA/1-116      AC A0A016U052.1
#=GS E3LIP3_CAERE/132-333        AC E3LIP3.1
#=GS A0A261BL97_9PELO/314-430    AC A0A261BL97.1
#=GS A0A6G0UKC1_9BILA/8-181      AC A0A6G0UKC1.1
#=GS A0A261BRJ2_9PELO/72-185     AC A0A261BRJ2.1
#=GS A0A261BUY1_9PELO/195-227    AC A0A261BUY1.1
#=GS A0A261C630_9PELO/16-230     AC A0A261C630.1
#=GS E3LZI4_CAERE/4-325          AC E3LZI4.1
#=GS G0PM43_CAEBE/10-286         AC G0PM43.1
#=GS G0NWB9_CAEBE/86-284         AC G0NWB9.1
#=GS A0A261CJZ0_9PELO/4-231      AC A0A261CJZ0.1
#=GS E3N1Y0_CAERE/1-296          AC E3N1Y0.1
#=GS A0A2G9U544_TELCI/8-163      AC A0A2G9U544.1
#=GS B6IEV1_CAEBR/14-75          AC B6IEV1.1
#=GS A0A4X3NVX6_PRIPA/24-130     AC A0A4X3NVX6.1
#=GS G0NT15_CAEBE/16-318         AC G0NT15.1
#=GS A0A016S924_9BILA/7-310      AC A0A016S924.1
#=GS A0A6G0UJ04_9BILA/296-497    AC A0A6G0UJ04.1
#=GS H3FU25_PRIPA/23-323         AC H3FU25.2
#=GS A8WRA0_CAEBR/13-321         AC A8WRA0.1
#=GS A8WZF4_CAEBR/12-297         AC A8WZF4.1
#=GS A0A2G5TDL5_9PELO/12-200     AC A0A2G5TDL5.1
#=GS O17872_CAEEL/10-317         AC O17872.1
#=GS A0A261CJF4_9PELO/1-85       AC A0A261CJF4.1
#=GS A0A0R3Q1N5_ANGCS/13-105     AC A0A0R3Q1N5.1
#=GS Q86D26_CAEEL/4-310          AC Q86D26.1
#=GS H3FNW6_PRIPA/270-432        AC H3FNW6.2
#=GS A8WRA3_CAEBR/200-266        AC A8WRA3.2
#=GS O61888_CAEEL/7-312          AC O61888.1
#=GS A0A2G5TDV0_9PELO/1-107      AC A0A2G5TDV0.1
#=GS E3MQ27_CAERE/6-313          AC E3MQ27.1
#=GS A0A261BTP6_9PELO/561-854    AC A0A261BTP6.1
#=GS G0P654_CAEBE/1-259          AC G0P654.1
#=GS H3G0J1_PRIPA/21-342         AC H3G0J1.2
#=GS A0A2G5TP62_9PELO/9-336      AC A0A2G5TP62.1
#=GS K7H3H2_CAEJA/24-328         AC K7H3H2.1
#=GS A0A2G5U009_9PELO/1-263      AC A0A2G5U009.1
#=GS E3NR07_CAERE/21-318         AC E3NR07.1
#=GS A0A4X3PGX0_PRIPA/10-175     AC A0A4X3PGX0.1
#=GS E3MWA7_CAERE/8-311          AC E3MWA7.1
#=GS G0NHQ9_CAEBE/8-316          AC G0NHQ9.1
#=GS G0P2B8_CAEBE/4-95           AC G0P2B8.1
#=GS H3F0N7_PRIPA/337-508        AC H3F0N7.2
#=GS G0PFC2_CAEBE/1-211          AC G0PFC2.1
#=GS A0A0N4X1T2_HAEPC/1-154      AC A0A0N4X1T2.1
#=GS E3LHE0_CAERE/55-361         AC E3LHE0.1
#=GS A8XD61_CAEBR/119-213        AC A8XD61.1
#=GS A0A2G5U310_9PELO/1-79       AC A0A2G5U310.1
#=GS G0MTQ5_CAEBE/8-315          AC G0MTQ5.1
#=GS A0A2G5TPZ5_9PELO/1-92       AC A0A2G5TPZ5.1
#=GS A0A2G5TPX5_9PELO/1-277      AC A0A2G5TPX5.1
#=GS G0PJL0_CAEBE/57-298         AC G0PJL0.1
#=GS A0A260Z6G0_9PELO/146-276    AC A0A260Z6G0.1
#=GS A8XX20_CAEBR/18-311         AC A8XX20.2
#=GS G0NQR2_CAEBE/13-224         AC G0NQR2.1
#=GS A0A2G5TAA5_9PELO/68-129     AC A0A2G5TAA5.1
#=GS E3NNX4_CAERE/1-160          AC E3NNX4.1
#=GS A0A2G5U0X6_9PELO/10-151     AC A0A2G5U0X6.1
#=GS Q9XX33_CAEEL/5-309          AC Q9XX33.3
#=GS E3MR87_CAERE/13-308         AC E3MR87.1
#=GS A0A2G5UVP9_9PELO/7-196      AC A0A2G5UVP9.1
#=GS A0A2G5TVM3_9PELO/4-313      AC A0A2G5TVM3.1
#=GS E3LKV5_CAERE/10-313         AC E3LKV5.1
#=GS G0P526_CAEBE/8-312          AC G0P526.1
#=GS A0A2G5TFF0_9PELO/1-191      AC A0A2G5TFF0.1
#=GS A8XDP5_CAEBR/76-307         AC A8XDP5.2
#=GS A0A4X3PHM4_PRIPA/12-229     AC A0A4X3PHM4.1
#=GS A0A368GQK7_ANCCA/81-206     AC A0A368GQK7.1
#=GS A0A261B2F6_9PELO/1-155      AC A0A261B2F6.1
#=GS G0PJP1_CAEBE/1-162          AC G0PJP1.1
#=GS A0A4X3PBD4_PRIPA/294-462    AC A0A4X3PBD4.1
#=GS A0A0N4WVN0_HAEPC/1-111      AC A0A0N4WVN0.1
#=GS A0A016TJP5_9BILA/1-102      AC A0A016TJP5.1
#=GS A0A2G5UTI2_9PELO/1-98       AC A0A2G5UTI2.1
#=GS G0PF76_CAEBE/13-133         AC G0PF76.1
#=GS A0A2G5T5T0_9PELO/166-226    AC A0A2G5T5T0.1
#=GS A0A4X3PH28_PRIPA/331-489    AC A0A4X3PH28.1
#=GS A0A2G5T9T7_9PELO/16-128     AC A0A2G5T9T7.1
#=GS O16921_CAEEL/9-317          AC O16921.1
#=GS A0A368GNN4_ANCCA/18-263     AC A0A368GNN4.1
#=GS G0NXC0_CAEBE/300-364        AC G0NXC0.1
#=GS K7HS16_CAEJA/1-169          AC K7HS16.1
#=GS A8XB42_CAEBR/269-329        AC A8XB42.2
#=GS A0A016ULH3_9BILA/1-104      AC A0A016ULH3.1
#=GS A0A4X3PCB5_PRIPA/1427-1728  AC A0A4X3PCB5.1
#=GS A0A2G5TYT7_9PELO/344-495    AC A0A2G5TYT7.1
#=GS A0A0R3PCW2_ANGCS/11-133     AC A0A0R3PCW2.1
#=GS A0A4X3PHR3_PRIPA/270-502    AC A0A4X3PHR3.1
#=GS E3N7F3_CAERE/10-317         AC E3N7F3.1
#=GS H3F0P2_PRIPA/79-375         AC H3F0P2.2
#=GS A0A2G5TVR4_9PELO/1-121      AC A0A2G5TVR4.1
#=GS H3E7A1_PRIPA/274-344        AC H3E7A1.2
#=GS A8XV44_CAEBR/10-317         AC A8XV44.1
#=GS E3NSU1_CAERE/12-322         AC E3NSU1.1
#=GS A0A261A8G1_9PELO/7-87       AC A0A261A8G1.1
#=GS G0MSC7_CAEBE/10-97          AC G0MSC7.1
#=GS H3ER79_PRIPA/22-319         AC H3ER79.2
#=GS G0NQ81_CAEBE/10-317         AC G0NQ81.1
#=GS O16330_CAEEL/9-314          AC O16330.1
#=GS Q9N482_CAEEL/10-317         AC Q9N482.2
#=GS E3M5Z2_CAERE/11-320         AC E3M5Z2.1
#=GS A0A4X3NWT6_PRIPA/1-176      AC A0A4X3NWT6.1
#=GS A0A260ZYP0_9PELO/17-200     AC A0A260ZYP0.1
#=GS H3G478_PRIPA/1-110          AC H3G478.2
#=GS G0P535_CAEBE/4-305          AC G0P535.1
#=GS A0A016WCH8_9BILA/7-309      AC A0A016WCH8.1
#=GS A0A261BTP6_9PELO/1263-1561  AC A0A261BTP6.1
#=GS A0A2G5UCB1_9PELO/1-149      AC A0A2G5UCB1.1
#=GS A0A368FEE3_ANCCA/4-200      AC A0A368FEE3.1
#=GS A0A2G5T4W6_9PELO/5-310      AC A0A2G5T4W6.1
#=GS G0M973_CAEBE/519-771        AC G0M973.1
#=GS A0A2G5TN94_9PELO/18-314     AC A0A2G5TN94.1
#=GS A0A0S4XRX5_CAEEL/1-141      AC A0A0S4XRX5.1
#=GS A0A4X3PHW5_PRIPA/298-459    AC A0A4X3PHW5.1
#=GS A0A4X3NUY9_PRIPA/23-156     AC A0A4X3NUY9.1
#=GS A8XD66_CAEBR/4-309          AC A8XD66.1
#=GS A0A4X3PF16_PRIPA/149-260    AC A0A4X3PF16.1
#=GS G0NRD4_CAEBE/18-317         AC G0NRD4.1
#=GS O18027_CAEEL/5-311          AC O18027.2
#=GS A0A4U8UWF5_STECR/147-286    AC A0A4U8UWF5.1
#=GS A0A261CGX9_9PELO/5-232      AC A0A261CGX9.1
#=GS A8WQ61_CAEBR/10-68          AC A8WQ61.2
#=GS A8X1N8_CAEBR/8-309          AC A8X1N8.1
#=GS A0A016SWF8_9BILA/15-173     AC A0A016SWF8.1
#=GS E3M763_CAERE/10-88          AC E3M763.1
#=GS A0A2G5TYM1_9PELO/81-256     AC A0A2G5TYM1.1
#=GS A0A2H2JDJ6_CAEJA/1-52       AC A0A2H2JDJ6.1
#=GS A0A260Z5T2_9PELO/1-83       AC A0A260Z5T2.1
#=GS A0A4X3PBA4_PRIPA/7-269      AC A0A4X3PBA4.1
#=GS G0PD64_CAEBE/1-156          AC G0PD64.1
#=GS Q21838_CAEEL/11-320         AC Q21838.2
#=GS K7H6Z4_CAEJA/10-126         AC K7H6Z4.1
#=GS E3MND1_CAERE/14-318         AC E3MND1.1
#=GS A0A2G5VS40_9PELO/1-213      AC A0A2G5VS40.1
#=GS O16473_CAEEL/8-311          AC O16473.1
#=GS A0A2A2JYM8_9BILA/19-321     AC A0A2A2JYM8.1
#=GS A8XDH4_CAEBR/12-312         AC A8XDH4.2
#=GS A8Y2S2_CAEBR/21-327         AC A8Y2S2.2
#=GS A0A7E4VD31_PANRE/2-170      AC A0A7E4VD31.1
#=GS A8X250_CAEBR/11-320         AC A8X250.1
#=GS K7HRG1_CAEJA/197-290        AC K7HRG1.1
#=GS A0A4X3PJ29_PRIPA/8-304      AC A0A4X3PJ29.1
#=GS A0A4X3PHW5_PRIPA/198-309    AC A0A4X3PHW5.1
#=GS A0A2G5TAM2_9PELO/244-309    AC A0A2G5TAM2.1
#=GS A0A2G5SZW8_9PELO/1-170      AC A0A2G5SZW8.1
#=GS A0A261BTH0_9PELO/301-598    AC A0A261BTH0.1
#=GS W2SHW0_NECAM/4-131          AC W2SHW0.1
#=GS A0A2A2LHG5_9BILA/21-192     AC A0A2A2LHG5.1
#=GS E3LJ49_CAERE/7-312          AC E3LJ49.1
#=GS E3MZY4_CAERE/10-317         AC E3MZY4.1
#=GS A0A016U5X6_9BILA/11-164     AC A0A016U5X6.1
#=GS K7H876_CAEJA/185-246        AC K7H876.1
#=GS A0A016U0I6_9BILA/114-306    AC A0A016U0I6.1
#=GS A0A3P7J2C9_STRVU/9-72       AC A0A3P7J2C9.1
#=GS A0A2G5T5B4_9PELO/1-242      AC A0A2G5T5B4.1
#=GS A8XB20_CAEBR/391-586        AC A8XB20.2
#=GS A0A2G5TZ96_9PELO/1-270      AC A0A2G5TZ96.1
#=GS H3FYQ6_PRIPA/3-257          AC H3FYQ6.2
#=GS E3NAW8_CAERE/8-310          AC E3NAW8.1
#=GS A0A7E4VA67_PANRE/11-303     AC A0A7E4VA67.1
#=GS A0A7E4W3V6_PANRE/1-187      AC A0A7E4W3V6.1
#=GS O45338_CAEEL/14-324         AC O45338.2
#=GS A0A261BJF6_9PELO/8-154      AC A0A261BJF6.1
#=GS A0A2G5TAM2_9PELO/14-74      AC A0A2G5TAM2.1
#=GS H3G433_PRIPA/118-308        AC H3G433.2
#=GS A0A4X3PHF2_PRIPA/287-591    AC A0A4X3PHF2.1
#=GS A0A2G5U303_9PELO/1-226      AC A0A2G5U303.1
#=GS A0A2G9TTQ4_TELCI/1-165      AC A0A2G9TTQ4.1
#=GS A0A2G5TKR8_9PELO/10-313     AC A0A2G5TKR8.1
#=GS A0A4X3PC21_PRIPA/755-889    AC A0A4X3PC21.1
#=GS A0A4X3PBD4_PRIPA/466-521    AC A0A4X3PBD4.1
#=GS A0A2G5TEQ7_9PELO/210-273    AC A0A2G5TEQ7.1
#=GS O62280_CAEEL/6-311          AC O62280.1
#=GS H3FLV5_PRIPA/785-946        AC H3FLV5.2
#=GS A0A261A7I6_9PELO/93-214     AC A0A261A7I6.1
#=GS Q965K9_CAEEL/8-315          AC Q965K9.2
#=GS G0NWC1_CAEBE/61-162         AC G0NWC1.1
#=GS A0A7E4VVK6_PANRE/37-220     AC A0A7E4VVK6.1
#=GS G0MTQ6_CAEBE/1-215          AC G0MTQ6.1
#=GS A0A2G9TKQ6_TELCI/9-65       AC A0A2G9TKQ6.1
#=GS A0A260YVM9_9PELO/1-192      AC A0A260YVM9.1
#=GS A0A261CKG3_9PELO/12-317     AC A0A261CKG3.1
#=GS Q966B4_CAEEL/11-318         AC Q966B4.2
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