#=GF ID Cas3_HD
#=GF AC PF18019.5
#=GF DE Cas3, HD domain
#=GF PI HD_6;
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE ECOD:EUF00138
#=GF GA 23.10 23.10;
#=GF TC 23.10 23.10;
#=GF NC 23.00 23.00;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF WK HD_domain
#=GF CL CL0237
#=GF RN [1]
#=GF RM 21775431
#=GF RT Structural and biochemical analysis of nuclease domain of
#=GF RT clustered regularly interspaced short palindromic repeat
#=GF RT (CRISPR)-associated protein 3 (Cas3).
#=GF RA Mulepati S, Bailey S;
#=GF RL J Biol Chem. 2011;286:31896-31903.
#=GF RN [2]
#=GF RM 25368186
#=GF RT Molecular insights into DNA interference by CRISPR-associated
#=GF RT nuclease-helicase Cas3.
#=GF RA Gong B, Shin M, Sun J, Jung CH, Bolt EL, van der Oost J, Kim JS;
#=GF RL Proc Natl Acad Sci U S A. 2014;111:16359-16364.
#=GF RN [3]
#=GF RM 25132177
#=GF RT Structures of CRISPR Cas3 offer mechanistic insights into
#=GF RT Cascade-activated DNA unwinding and degradation.
#=GF RA Huo Y, Nam KH, Ding F, Lee H, Wu L, Xiao Y, Farchione MD Jr,
#=GF RA Zhou S, Rajashankar K, Kurinov I, Zhang R, Ke A;
#=GF RL Nat Struct Mol Biol. 2014;21:771-777.
#=GF DR INTERPRO; IPR006483;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This HD domain is found at the N-terminus of Cas3 enzymes fused
#=GF CC to a helicase domain. This domain is sometimes found as a
#=GF CC separate protein. It acts as a nuclease that cleaves ssDNA.
#=GF SQ 2014
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#=GS F8AE48_THEID/4-212 AC F8AE48.1
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