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Database: Pfam
Entry: DNA_pol_phi
LinkDB: DNA_pol_phi
Original site: DNA_pol_phi 
#=GF ID   DNA_pol_phi
#=GF AC   PF04931.13
#=GF DE   DNA polymerase phi
#=GF PI   DNA_pol_V; 
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_10566 (release 7.6)
#=GF GA   27.60 27.60;
#=GF TC   27.90 27.60;
#=GF NC   27.50 27.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12093911
#=GF RT   The fifth essential DNA polymerase phi in Saccharomyces
#=GF RT   cerevisiae is localized to the nucleolus and plays an important
#=GF RT   role in synthesis of rRNA. 
#=GF RA   Shimizu K, Kawasaki Y, Hiraga S, Tawaramoto M, Nakashima N,
#=GF RA   Sugino A; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2002;99:9133-9138.
#=GF DR   INTERPRO; IPR007015;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family includes the fifth essential DNA polymerase in yeast
#=GF CC   EC:2.7.7.7. Pol5p is localised exclusively to the nucleolus and
#=GF CC   binds near or at the enhancer region of rRNA-encoding DNA
#=GF CC   repeating units.
#=GF SQ   1218
#=GS A0A1U8JJI9_GOSHI/169-262    AC A0A1U8JJI9.1
#=GS I2GWK9_TETBL/52-872         AC I2GWK9.1
#=GS A0A182FSK9_ANOAL/409-714    AC A0A182FSK9.1
#=GS W6XXV9_COCCA/356-1174       AC W6XXV9.1
#=GS I2G4A9_USTH4/90-926         AC I2G4A9.1
#=GS A0A1V2L8P9_CYBFA/41-701     AC A0A1V2L8P9.1
#=GS MBB1A_RAT/70-833            AC O35821.2
#=GS A0A1U7YP52_NICSY/3-72       AC A0A1U7YP52.1
#=GS A0A178ZHV1_9EURO/52-896     AC A0A178ZHV1.1
#=GS A0A2G8KIA0_STIJA/1-321      AC A0A2G8KIA0.1
#=GS M2N9X7_BAUCO/74-853         AC M2N9X7.1
#=GS A0A0V1I485_9BILA/52-756     AC A0A0V1I485.1
#=GS G9MKX0_HYPVG/752-889        AC G9MKX0.1
#=GS A0A1E5RMV0_9ASCO/49-923     AC A0A1E5RMV0.1
#=GS A0A182JL77_9DIPT/71-878     AC A0A182JL77.1
#=GS J9B181_WUCBA/393-666        AC J9B181.1
#=GS A0A1I7RSG2_BURXY/420-674    AC A0A1I7RSG2.1
#=GS A0A200QK24_9MAGN/155-972    AC A0A200QK24.1
#=GS G4UCG6_NEUT9/101-872        AC G4UCG6.1
#=GS A0A1X7STT2_AMPQE/1-282      AC A0A1X7STT2.1
#=GS Q2UM78_ASPOR/53-837         AC Q2UM78.1
#=GS H0GFB6_SACCK/46-859         AC H0GFB6.1
#=GS A0A161HH18_9ASCO/91-886     AC A0A161HH18.1
#=GS A0A154PTV4_9HYME/69-817     AC A0A154PTV4.1
#=GS A0A0N7L416_9STRA/57-796     AC A0A0N7L416.1
#=GS A7E9A0_SCLS1/97-349         AC A7E9A0.1
#=GS K7ILW9_NASVI/46-790         AC K7ILW9.1
#=GS B3MYZ4_DROAN/110-860        AC B3MYZ4.2
#=GS A0A0C3ANX2_9HOMO/64-860     AC A0A0C3ANX2.1
#=GS K8EHI6_9CHLO/88-987         AC K8EHI6.1
#=GS K3YPC9_SETIT/161-991        AC K3YPC9.1
#=GS A0A0N4VSQ7_HAEPC/20-300     AC A0A0N4VSQ7.1
#=GS A0A1G4IVK2_9SACH/43-876     AC A0A1G4IVK2.1
#=GS A0A183BN79_GLOPA/341-553    AC A0A183BN79.1
#=GS V5F327_KALBG/90-912         AC V5F327.1
#=GS A0A2C9LUN6_BIOGL/1-229      AC A0A2C9LUN6.1
#=GS A0A1V8V2N1_9PEZI/87-688     AC A0A1V8V2N1.1
#=GS A0A1Z5TUI6_HORWE/72-836     AC A0A1Z5TUI6.1
#=GS N1PJF9_DOTSN/75-845         AC N1PJF9.1
#=GS A0A0C2ZAA4_9HOMO/349-504    AC A0A0C2ZAA4.1
#=GS A0A0A1N835_9FUNG/1-410      AC A0A0A1N835.1
#=GS A0A060SK59_PYCCI/71-878     AC A0A060SK59.1
#=GS A0A0N4THI3_BRUPA/2-110      AC A0A0N4THI3.1
#=GS W4KK64_9HOMO/66-882         AC W4KK64.1
#=GS A0A1B8B1L7_FUSPO/113-880    AC A0A1B8B1L7.1
#=GS M7UB61_BOTF1/97-870         AC M7UB61.1
#=GS A0A182SI52_9DIPT/1-378      AC A0A182SI52.1
#=GS A0A1D6S897_WHEAT/1-546      AC A0A1D6S897.1
#=GS A8Q2S8_MALGO/82-885         AC A8Q2S8.1
#=GS A0A2C5YXT3_9HYPO/88-772     AC A0A2C5YXT3.1
#=GS A0A0G4IXX1_PLABS/420-647    AC A0A0G4IXX1.1
#=GS G1S6B5_NOMLE/622-767        AC G1S6B5.2
#=GS A0A158NUL4_ATTCE/74-815     AC A0A158NUL4.1
#=GS C1G8R9_PARBD/59-860         AC C1G8R9.1
#=GS A0A0L6U720_9BASI/56-850     AC A0A0L6U720.1
#=GS A0A0B4IAF2_9HYPO/95-875     AC A0A0B4IAF2.1
#=GS A0A0H2S3A1_9HOMO/83-868     AC A0A0H2S3A1.1
#=GS A0A2C9L9D8_BIOGL/1-151      AC A0A2C9L9D8.1
#=GS A0A1I8FVX4_9PLAT/601-819    AC A0A1I8FVX4.1
#=GS G0WI71_NAUDC/46-903         AC G0WI71.1
#=GS A0A0V1KRX4_9BILA/248-745    AC A0A0V1KRX4.1
#=GS A0A1B8FPZ6_9PEZI/109-857    AC A0A1B8FPZ6.1
#=GS A0A068XAT8_HYMMI/67-690     AC A0A068XAT8.1
#=GS A0A091KAL4_COLST/1-763      AC A0A091KAL4.1
#=GS A0A1L8HGB4_XENLA/77-861     AC A0A1L8HGB4.1
#=GS H0EFC8_GLAL7/97-491         AC H0EFC8.1
#=GS B4I942_DROSE/115-850        AC B4I942.1
#=GS A0A2K5HBB2_COLAP/607-689    AC A0A2K5HBB2.1
#=GS Q6Z0Z0_ORYSJ/176-1044       AC Q6Z0Z0.1
#=GS A0A1V8U5T5_9PEZI/86-877     AC A0A1V8U5T5.1
#=GS A0A067KVQ7_JATCU/185-979    AC A0A067KVQ7.1
#=GS I1NX18_ORYGL/171-1040       AC I1NX18.1
#=GS K9F8E1_PEND2/61-839         AC K9F8E1.1
#=GS A0A1Q3E522_LENED/66-136     AC A0A1Q3E522.1
#=GS A0A0R3QZG9_9BILA/408-679    AC A0A0R3QZG9.1
#=GS A0A151K375_9HYME/74-815     AC A0A151K375.1
#=GS A0A146F7Y9_9EURO/61-843     AC A0A146F7Y9.1
#=GS H0EFC8_GLAL7/502-801        AC H0EFC8.1
#=GS A0A1I8CK17_9BILA/41-276     AC A0A1I8CK17.1
#=GS A0A1E5RQZ6_HANUV/49-928     AC A0A1E5RQZ6.1
#=GS A0A178AWE5_9PLEO/76-871     AC A0A178AWE5.1
#=GS W9CPB5_9HELO/92-866         AC W9CPB5.1
#=GS I1M2K6_SOYBN/157-964        AC I1M2K6.1
#=GS C4R176_KOMPG/42-819         AC C4R176.1
#=GS A0A094EX79_9PEZI/112-859    AC A0A094EX79.1
#=GS K0SEP9_THAOC/158-594        AC K0SEP9.1
#=GS G9NMM8_HYPAI/752-889        AC G9NMM8.1
#=GS H3FAD2_PRIPA/377-697        AC H3FAD2.1
#=GS E1ZRW4_CHLVA/119-951        AC E1ZRW4.1
#=GS A0A0F8V496_9EURO/63-839     AC A0A0F8V496.1
#=GS A0A074T5F5_HAMHA/1179-1400  AC A0A074T5F5.1
#=GS A0A2H2ILT3_CAEJA/1-81       AC A0A2H2ILT3.1
#=GS A0A0C7NCI2_9SACH/53-868     AC A0A0C7NCI2.1
#=GS A0A094CS43_9PEZI/1-577      AC A0A094CS43.1
#=GS G0SD85_CHATD/101-862        AC G0SD85.1
#=GS M5EAK0_MALS4/75-834         AC M5EAK0.1
#=GS U1HH43_ENDPU/563-1363       AC U1HH43.1
#=GS A0A063BUN6_9HYPO/97-906     AC A0A063BUN6.1
#=GS A0A087QWK3_APTFO/7-781      AC A0A087QWK3.1
#=GS A0A067C0R7_SAPPC/58-749     AC A0A067C0R7.1
#=GS A0A2H3F331_9HELO/100-873    AC A0A2H3F331.1
#=GS A0A0N4ZY72_PARTI/923-1233   AC A0A0N4ZY72.1
#=GS A0A1R1YCN4_9FUNG/692-925    AC A0A1R1YCN4.1
#=GS A0A1L9SDY6_9EURO/58-877     AC A0A1L9SDY6.1
#=GS A0A183HJT9_9BILA/117-310    AC A0A183HJT9.1
#=GS A0A183TIL5_SCHSO/182-800    AC A0A183TIL5.1
#=GS A0A1U7ZLE0_NELNU/179-992    AC A0A1U7ZLE0.1
#=GS A0A0L8FLL4_OCTBM/3-162      AC A0A0L8FLL4.1
#=GS A1DML7_NEOFI/61-832         AC A1DML7.1
#=GS C1GRM9_PARBA/61-866         AC C1GRM9.2
#=GS A1CTC1_ASPCL/61-846         AC A1CTC1.1
#=GS A0A182VPA5_ANOME/72-896     AC A0A182VPA5.1
#=GS A0A2A2LG29_9BILA/444-705    AC A0A2A2LG29.1
#=GS U4U6H5_DENPD/63-794         AC U4U6H5.1
#=GS A0A1D6GZU7_MAIZE/156-1008   AC A0A1D6GZU7.1
#=GS A0A1I8FXE6_9PLAT/581-752    AC A0A1I8FXE6.1
#=GS A0A0K0F091_9BILA/294-678    AC A0A0K0F091.1
#=GS D5G8V8_TUBMM/46-841         AC D5G8V8.1
#=GS W6MFS8_9ASCO/41-907         AC W6MFS8.1
#=GS A0A067TS23_GALM3/74-875     AC A0A067TS23.1
#=GS A0A1Y3N8H2_PIRSE/1-396      AC A0A1Y3N8H2.1
#=GS A0A0K0DB80_ANGCA/364-532    AC A0A0K0DB80.1
#=GS A0A1D6GZU5_MAIZE/156-1015   AC A0A1D6GZU5.1
#=GS A0A0F4X7G2_HANUV/49-928     AC A0A0F4X7G2.1
#=GS A0A0M3K8D9_ANISI/61-488     AC A0A0M3K8D9.1
#=GS A0A1I7YK28_9BILA/281-392    AC A0A1I7YK28.1
#=GS A0A0B0NGE1_GOSAR/179-986    AC A0A0B0NGE1.1
#=GS A0A0V0YN70_TRIPS/52-721     AC A0A0V0YN70.1
#=GS B8N4J5_ASPFN/61-845         AC B8N4J5.1
#=GS G0R999_HYPJQ/106-893        AC G0R999.1
#=GS A0A085NPG8_9BILA/117-290    AC A0A085NPG8.1
#=GS A7TI86_VANPO/45-851         AC A7TI86.1
#=GS A0A194RJ57_PAPMA/676-751    AC A0A194RJ57.1
#=GS A0A074VM33_9PEZI/73-858     AC A0A074VM33.1
#=GS A0A182GTJ8_AEDAL/61-729     AC A0A182GTJ8.1
#=GS A0A183IEV4_9BILA/151-343    AC A0A183IEV4.1
#=GS A0A0P0VEG4_ORYSJ/1-126      AC A0A0P0VEG4.1
#=GS K5Y4P7_AGABU/77-850         AC K5Y4P7.1
#=GS G0MEU4_CAEBE/44-457         AC G0MEU4.1
#=GS A0A0L0SQ09_ALLMA/515-781    AC A0A0L0SQ09.1
#=GS A0A151GN67_9HYPO/772-916    AC A0A151GN67.1
#=GS A0A2H3ZDT2_PHODC/191-1037   AC A0A2H3ZDT2.1
#=GS W5MJB3_LEPOC/70-859         AC W5MJB3.1
#=GS A0A1D6GZU8_MAIZE/5-643      AC A0A1D6GZU8.1
#=GS A0A151ZED8_9MYCE/136-953    AC A0A151ZED8.1
#=GS A0A087VM00_BALRE/7-781      AC A0A087VM00.1
#=GS A0A0L1HW58_9PLEO/392-1209   AC A0A0L1HW58.1
#=GS A0A0V0UL99_9BILA/52-754     AC A0A0V0UL99.1
#=GS A0A2D0PMF7_ICTPU/95-897     AC A0A2D0PMF7.1
#=GS A0A0N4UIY1_DRAME/67-250     AC A0A0N4UIY1.1
#=GS A0A2H3IFN7_9EURO/60-837     AC A0A2H3IFN7.1
#=GS B3RSM5_TRIAD/307-716        AC B3RSM5.1
#=GS H3BH19_LATCH/71-859         AC H3BH19.1
#=GS S7N0L5_MYOBR/77-842         AC S7N0L5.1
#=GS A0A075B4W2_9FUNG/2-64       AC A0A075B4W2.1
#=GS L2GEQ7_COLGN/109-225        AC L2GEQ7.1
#=GS D8UJ89_VOLCA/98-1079        AC D8UJ89.1
#=GS A0A1V6PSL1_9EURO/55-835     AC A0A1V6PSL1.1
#=GS A0A158R9U6_TAEAS/705-838    AC A0A158R9U6.1
#=GS G8B4R7_CANPC/1-751          AC G8B4R7.1
#=GS A0A0D0E8V0_9HOMO/64-877     AC A0A0D0E8V0.1
#=GS E2AFV9_CAMFO/670-739        AC E2AFV9.1
#=GS A0A179HKA5_9HYPO/97-883     AC A0A179HKA5.1
#=GS A0A250XMM3_9CHLO/556-1117   AC A0A250XMM3.1
#=GS G5B921_HETGA/80-849         AC G5B921.1
#=GS M5GAS9_DACPD/61-866         AC M5GAS9.1
#=GS A0A084R2P4_STAC4/95-886     AC A0A084R2P4.1
#=GS A0A1X7RX11_ZYMTR/17-782     AC A0A1X7RX11.1
#=GS A0A1F8AFL4_9EURO/61-843     AC A0A1F8AFL4.1
#=GS A0A166IYS2_9HOMO/75-873     AC A0A166IYS2.1
#=GS A0A139A5H8_GONPR/479-697    AC A0A139A5H8.1
#=GS A0A0G4PPW1_PENCA/61-841     AC A0A0G4PPW1.1
#=GS A0A175WB89_9PEZI/99-858     AC A0A175WB89.1
#=GS A0A0L0CF50_LUCCU/106-901    AC A0A0L0CF50.1
#=GS A0A0D1Z0K5_9EURO/52-896     AC A0A0D1Z0K5.1
#=GS A0A0L7QZY1_9HYME/69-819     AC A0A0L7QZY1.1
#=GS A0A0B1T4L2_OESDE/174-369    AC A0A0B1T4L2.1
#=GS A0A0L0HLD5_SPIPN/64-842     AC A0A0L0HLD5.1
#=GS A0A0D3AYP3_BRAOL/99-236     AC A0A0D3AYP3.1
#=GS G3JLT3_CORMM/95-864         AC G3JLT3.1
#=GS A0A074T5F5_HAMHA/109-258    AC A0A074T5F5.1
#=GS W1QIV7_OGAPD/41-824         AC W1QIV7.1
#=GS A0A0V0UFF6_9BILA/52-751     AC A0A0V0UFF6.1
#=GS A5E5U7_LODEL/40-897         AC A5E5U7.1
#=GS N1R7K3_FUSC4/94-869         AC N1R7K3.1
#=GS A0A1U7SES1_ALLSI/2-733      AC A0A1U7SES1.1
#=GS A0A0F4GGJ5_9PEZI/89-854     AC A0A0F4GGJ5.1
#=GS G0QXR1_ICHMG/4-270          AC G0QXR1.1
#=GS A0A0S6XLC8_9FUNG/161-593    AC A0A0S6XLC8.1
#=GS A0A091SPP7_9AVES/7-781      AC A0A091SPP7.1
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