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Database: Pfam
Entry: FAN1_TPR
LinkDB: FAN1_TPR
Original site: FAN1_TPR 
#=GF ID   FAN1_TPR
#=GF AC   PF21170.1
#=GF DE   Fanconi-associated nuclease 1, TPR domain
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU   Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE   ECOD:EF17502
#=GF GA   24.00 24.00;
#=GF TC   24.00 24.10;
#=GF NC   23.90 23.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0020
#=GF RC   Paper describing PDB structure 4rea
#=GF RN   [1]
#=GF RM   25500724
#=GF RT   Structural insights into 5' flap DNA unwinding and incision by
#=GF RT   the human FAN1 dimer.
#=GF RA   Zhao Q, Xue X, Longerich S, Sung P, Xiong Y;
#=GF RL   Nat Commun. 2014;5:5726.
#=GF RC   Paper describing PDB structure 4ri8
#=GF RN   [2]
#=GF RM   25430771
#=GF RT   DNA repair. Mechanism of DNA interstrand cross-link processing
#=GF RT   by repair nuclease FAN1.
#=GF RA   Wang R, Persky NS, Yoo B, Ouerfelli O, Smogorzewska A, Elledge
#=GF RA   SJ, Pavletich NP;
#=GF RL   Science. 2014;346:1127-1130.
#=GF RC   Paper describing PDB structure 4ry3
#=GF RN   [3]
#=GF RM   25547363
#=GF RT   Crystal structure of human Fanconi-associated nuclease 1.
#=GF RA   Yan PX, Huo YG, Jiang T;
#=GF RL   Protein Cell. 2015;6:225-228.
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This is the TPR domain from Fanconi-associated nuclease 1
#=GF CC   (FAN1), which mediates inter-domain interactions and is part of
#=GF CC   the dimerization interface [1]. FAN1 is a DNA structure-specific
#=GF CC   nuclease involved in processing DNA interstrand crosslinks. FAN1
#=GF CC   maintains genomic stability and prevents tissue decline in
#=GF CC   multiple organs [1-3]. It mediates cancer drug resistance in
#=GF CC   several cancer subtypes.
#=GF SQ   2167
#=GS A0A2K2DQ71_BRADI/566-717    AC A0A2K2DQ71.1
#=GS G3WVX9_SARHA/638-791        AC G3WVX9.1
#=GS A0A0K3CNH9_RHOTO/336-458    AC A0A0K3CNH9.1
#=GS A0A4U0TZV2_9PEZI/449-594    AC A0A4U0TZV2.1
#=GS A0A1V9XVB2_9ACAR/421-573    AC A0A1V9XVB2.1
#=GS A0A5F5PLV9_HORSE/614-767    AC A0A5F5PLV9.1
#=GS A0A8H7BUI8_9FUNG/270-435    AC A0A8H7BUI8.1
#=GS A0A7E5WNC1_TRINI/449-601    AC A0A7E5WNC1.1
#=GS A0A3Q3BI08_KRYMA/549-702    AC A0A3Q3BI08.1
#=GS A0A5N5P616_PANHP/566-719    AC A0A5N5P616.1
#=GS A0A6I9P6Y5_9TELE/584-737    AC A0A6I9P6Y5.1
#=GS A0A1A6AHQ6_9TREE/558-696    AC A0A1A6AHQ6.1
#=GS A0A3M7B8U6_HORWE/176-322    AC A0A3M7B8U6.1
#=GS A0A4W6D1A6_LATCA/592-745    AC A0A4W6D1A6.1
#=GS A0A8C7Z2I4_9TELE/544-697    AC A0A8C7Z2I4.1
#=GS A0A6J3R0H4_TURTR/608-761    AC A0A6J3R0H4.1
#=GS A0A8H3IXK6_9LECA/437-582    AC A0A8H3IXK6.1
#=GS A0A8D0HIQ1_SPHPU/5-87       AC A0A8D0HIQ1.1
#=GS H9G6J7_ANOCA/595-748        AC H9G6J7.2
#=GS A0A8H7EEJ3_9PLEO/433-587    AC A0A8H7EEJ3.1
#=GS A0A8B9WYE8_BOSMU/608-761    AC A0A8B9WYE8.1
#=GS A0A8J4ZVK0_9CHEL/331-479    AC A0A8J4ZVK0.1
#=GS A0A8I5NI04_PAPAN/601-754    AC A0A8I5NI04.1
#=GS A0A4U0WMJ5_9PEZI/445-592    AC A0A4U0WMJ5.1
#=GS A0A7K6N1D3_PEDTO/619-772    AC A0A7K6N1D3.1
#=GS A0A4S3JY05_9EURO/382-555    AC A0A4S3JY05.1
#=GS A0A7K9E2G0_BARMA/624-670    AC A0A7K9E2G0.1
#=GS A0A673UKG1_SURSU/610-763    AC A0A673UKG1.1
#=GS A0A7K6MTY6_PANBI/594-747    AC A0A7K6MTY6.1
#=GS A0A2A4KAH8_HELVI/450-605    AC A0A2A4KAH8.1
#=GS A0A8B8WMT3_BALMU/667-789    AC A0A8B8WMT3.1
#=GS A0A3Q7R9V5_VULVU/613-766    AC A0A3Q7R9V5.1
#=GS A0A195DNH1_9HYME/523-678    AC A0A195DNH1.1
#=GS A0A7H8QGK4_9EURO/377-555    AC A0A7H8QGK4.1
#=GS A0A5E3WBL3_9AGAM/420-564    AC A0A5E3WBL3.1
#=GS A0A8B9WXI7_BOSMU/608-761    AC A0A8B9WXI7.1
#=GS W9XDC6_9EURO/451-605        AC W9XDC6.1
#=GS A0A3E2GVJ3_SCYLI/415-567    AC A0A3E2GVJ3.1
#=GS A0A5A9NZ89_9TELE/582-735    AC A0A5A9NZ89.1
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#=GS A0A7K8ZVV8_9PASS/611-764    AC A0A7K8ZVV8.1
#=GS A0A0D0A9P7_9AGAM/343-496    AC A0A0D0A9P7.1
#=GS A0A8H2VXG0_9HELO/446-596    AC A0A8H2VXG0.1
#=GS A0A0E0L8F9_ORYPU/616-767    AC A0A0E0L8F9.1
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#=GS A0A850TCF8_GRUAM/620-773    AC A0A850TCF8.1
#=GS A0A5D6XGN5_9STRA/474-603    AC A0A5D6XGN5.1
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#=GS A0A1L9PZV9_ASPVE/400-554    AC A0A1L9PZV9.1
#=GS A0A1V6Y0M0_PENNA/354-509    AC A0A1V6Y0M0.1
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#=GS G4T5T5_SERID/337-499        AC G4T5T5.1
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#=GS A0A851V808_9PASS/624-777    AC A0A851V808.1
#=GS A0A179UP14_BLAGS/387-566    AC A0A179UP14.1
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#=GS J9J4V3_9SPIT/555-631        AC J9J4V3.1
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#=GS A0A2K3QE02_9HYPO/426-598    AC A0A2K3QE02.1
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#=GS A0A834LSI5_RHOSS/527-655    AC A0A834LSI5.1
#=GS A0A6A1QGY9_BALPH/547-709    AC A0A6A1QGY9.1
#=GS A0A6J0T057_9SAUR/614-767    AC A0A6J0T057.1
#=GS F0UKZ7_AJEC8/381-559        AC F0UKZ7.1
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#=GS H3BGJ1_LATCH/612-765        AC H3BGJ1.1
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#=GS A0A674GPB0_TAEGU/614-767    AC A0A674GPB0.1
#=GS W4GB38_APHAT/259-377        AC W4GB38.1
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#=GS A0A0V1MMK7_9BILA/281-436    AC A0A0V1MMK7.1
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#=GS M2MEY9_BAUPA/432-578        AC M2MEY9.1
#=GS A0A673HLC6_9TELE/587-740    AC A0A673HLC6.1
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#=GS A0A0V0Y2D7_TRIPS/278-433    AC A0A0V0Y2D7.1
#=GS B9RWV7_RICCO/8-139          AC B9RWV7.1
#=GS A0A151MA71_ALLMI/288-441    AC A0A151MA71.1
#=GS A0A093C2R1_9AVES/565-718    AC A0A093C2R1.1
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