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Database: Pfam
Entry: Kdo
LinkDB: Kdo
Original site: Kdo 
#=GF ID   Kdo
#=GF AC   PF06293.14
#=GF DE   Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Krupa A, Srinivasan N
#=GF GA   21.30 21.30;
#=GF TC   21.30 21.30;
#=GF NC   21.20 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Lipopolysaccharide_kinase_(Kdo/WaaP)_family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11069912
#=GF RT   Purification and characterization of WaaP from Escherichia coli,
#=GF RT   a lipopolysaccharide kinase essential for outer membrane
#=GF RT   stability. 
#=GF RA   Yethon JA, Whitfield C; 
#=GF RL   J Biol Chem 2001;276:5498-5504.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12021457
#=GF RT   Lipopolysaccharide phosphorylating enzymes encoded in the
#=GF RT   genomes of Gram-negative bacteria are related to the eukaryotic
#=GF RT   protein kinases. 
#=GF RA   Krupa A, Srinivasan N; 
#=GF RL   Protein Sci 2002;11:1580-1584.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10531340
#=GF RT   A Haemophilus influenzae gene that encodes a membrane bound
#=GF RT   3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (Kdo) kinase. Possible
#=GF RT   involvement of kdo phosphorylation in bacterial virulence. 
#=GF RA   White KA, Lin S, Cotter RJ, Raetz CR; 
#=GF RL   J Biol Chem 1999;274:31391-31400.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   These lipopolysaccharide kinases are related to protein kinases
#=GF CC   Pfam:PF00069. This family includes waaP (rfaP) gene product is
#=GF CC   required for the addition of phosphate to O-4 of the first
#=GF CC   heptose residue of the lipopolysaccharide (LPS) inner core
#=GF CC   region. It has previously been shown that WaaP is  necessary for
#=GF CC   resistance to hydrophobic and polycationic antimicrobials in E.
#=GF CC   coli and that it is required for virulence in invasive strains
#=GF CC   of S. enterica [1].
#=GF SQ   3815
#=GS A0A256ZEY1_9ARCH/318-480    AC A0A256ZEY1.1
#=GS U3AKT3_9VIBR/28-231         AC U3AKT3.1
#=GS A0A255YZN4_9FLAO/34-226     AC A0A255YZN4.1
#=GS A0A239C5C3_9ACTN/54-200     AC A0A239C5C3.1
#=GS A0A1M6YG89_9FLAO/36-229     AC A0A1M6YG89.1
#=GS A0A1F3BFN1_9ARCH/325-507    AC A0A1F3BFN1.1
#=GS E1SW63_FERBD/28-235         AC E1SW63.1
#=GS A0A011NUR7_9PROT/23-232     AC A0A011NUR7.1
#=GS B8MPN8_TALSN/670-755        AC B8MPN8.1
#=GS A0A1U7CWV2_9BACT/56-259     AC A0A1U7CWV2.1
#=GS A0A0H4W0S9_9BORD/38-229     AC A0A0H4W0S9.1
#=GS A0A0S8ZRT9_9PSED/18-226     AC A0A0S8ZRT9.1
#=GS A0A0D1MB47_PSEPU/55-196     AC A0A0D1MB47.1
#=GS A0A165SCK3_9HOMO/270-333    AC A0A165SCK3.1
#=GS A0A2A3VNV8_9GAMM/42-244     AC A0A2A3VNV8.1
#=GS K9NQX5_9PSED/18-226         AC K9NQX5.1
#=GS A0A1Z8XUP3_9PROT/112-215    AC A0A1Z8XUP3.1
#=GS A0A0N4UDY7_DRAME/68-171     AC A0A0N4UDY7.1
#=GS A0A078LQ40_9PSED/285-461    AC A0A078LQ40.1
#=GS A0A1H2NMC0_9PSED/440-594    AC A0A1H2NMC0.1
#=GS A0A1W7CS68_9ACTN/50-197     AC A0A1W7CS68.1
#=GS A0A1E3BED8_9EURO/652-722    AC A0A1E3BED8.1
#=GS A0A0C5VWY3_9GAMM/27-205     AC A0A0C5VWY3.1
#=GS A0A0V0VIF8_9BILA/523-701    AC A0A0V0VIF8.1
#=GS G8Q3U0_PSEFL/280-464        AC G8Q3U0.1
#=GS K1WD31_TRIAC/446-557        AC K1WD31.1
#=GS A0A222XFP9_9CELL/49-202     AC A0A222XFP9.1
#=GS A0A1F8AE24_9EURO/62-131     AC A0A1F8AE24.1
#=GS A0A2B7XP14_9EURO/101-203    AC A0A2B7XP14.1
#=GS M7SXD8_EUTLA/214-286        AC M7SXD8.1
#=GS D9XU35_9ACTN/53-209         AC D9XU35.1
#=GS A0A0B0EJF8_9BACT/33-239     AC A0A0B0EJF8.1
#=GS A0A0T6UIQ8_9PSED/22-223     AC A0A0T6UIQ8.1
#=GS A0A1G3FAS1_9GAMM/20-208     AC A0A1G3FAS1.1
#=GS W6UM79_ECHGR/316-506        AC W6UM79.1
#=GS A0A0D6SBF1_9PSED/6-213      AC A0A0D6SBF1.1
#=GS A0A2H9L3T8_9ARCH/52-217     AC A0A2H9L3T8.1
#=GS A0A0D8Q827_9GAMM/28-231     AC A0A0D8Q827.1
#=GS A0A1S3EQJ2_DIPOR/113-234    AC A0A1S3EQJ2.1
#=GS J6GQB6_9PORP/40-229         AC J6GQB6.1
#=GS A0A1A8XZL5_9PROT/297-472    AC A0A1A8XZL5.1
#=GS A0A0X8BZ27_9PSED/22-223     AC A0A0X8BZ27.1
#=GS W9T4J7_9PSED/22-223         AC W9T4J7.1
#=GS R1EQY7_BOTPV/161-266        AC R1EQY7.1
#=GS A0A1Z5STH0_HORWE/175-285    AC A0A1Z5STH0.1
#=GS A0A0J6HS38_9PSED/23-228     AC A0A0J6HS38.1
#=GS A0A0V0Z7B9_9BILA/308-491    AC A0A0V0Z7B9.1
#=GS A4YCC1_SHEPC/32-243         AC A4YCC1.1
#=GS A0A1H8MV29_9ACTN/52-204     AC A0A1H8MV29.1
#=GS A0A0F4NMQ4_9VIBR/28-231     AC A0A0F4NMQ4.1
#=GS G8RNV9_MYCRN/54-213         AC G8RNV9.1
#=GS A0A0H4CJJ6_9ACTN/52-210     AC A0A0H4CJJ6.1
#=GS H3CDT1_TETNG/18-208         AC H3CDT1.1
#=GS A0A0Q6RMA7_9MICO/47-194     AC A0A0Q6RMA7.1
#=GS A0A1D7XPW4_9FLAO/34-217     AC A0A1D7XPW4.1
#=GS A0A1S9D507_ASPOZ/652-721    AC A0A1S9D507.1
#=GS Q543M9_MOUSE/31-216         AC Q543M9.1
#=GS A0A120E5I7_9BASI/118-216    AC A0A120E5I7.1
#=GS A6UWA3_META3/430-521        AC A6UWA3.1
#=GS A0A1G8PDL2_9PSED/26-233     AC A0A1G8PDL2.1
#=GS U2ZVP1_PSEA4/24-231         AC U2ZVP1.1
#=GS C3PGB7_CORA7/45-197         AC C3PGB7.1
#=GS A0A137SAI5_9ALTE/32-232     AC A0A137SAI5.1
#=GS A0A0D9RQT4_CHLSB/49-225     AC A0A0D9RQT4.1
#=GS A0A0Q0Z0F0_9PSED/18-226     AC A0A0Q0Z0F0.1
#=GS A0A239BTE8_9ACTN/252-410    AC A0A239BTE8.1
#=GS A0A1M5KP02_9PSED/20-231     AC A0A1M5KP02.1
#=GS A0A1G8SK39_9PSED/21-219     AC A0A1G8SK39.1
#=GS D6Z2M2_DESAT/33-237         AC D6Z2M2.1
#=GS J9NUH9_CANLF/88-274         AC J9NUH9.1
#=GS A0A0M9VMU5_9BASI/65-241     AC A0A0M9VMU5.1
#=GS A0A0Q0ID86_9GAMM/29-234     AC A0A0Q0ID86.1
#=GS BUD32_YEAST/46-224          AC P53323.1
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW7 A; 46-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW5 A; 46-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WWA A; 47-224;
#=GS BUD32_YEAST/46-224          DR PDB; 4WW9 A; 46-224;
#=GS A0A094G633_9PEZI/64-244     AC A0A094G633.1
#=GS A0A1Z9XCG6_9ALTE/34-238     AC A0A1Z9XCG6.1
#=GS A0A166L310_9HOMO/6-85       AC A0A166L310.1
#=GS A1D5Z6_NEOFI/56-249         AC A1D5Z6.1
#=GS A0A1M5KNW2_9PSED/22-223     AC A0A1M5KNW2.1
#=GS A0A0R0CFR0_9GAMM/39-241     AC A0A0R0CFR0.1
#=GS L1LW05_PSEPU/20-231         AC L1LW05.1
#=GS A0A0N4WIU5_HAEPC/220-402    AC A0A0N4WIU5.1
#=GS A0A1V6X1Q4_PENNA/652-720    AC A0A1V6X1Q4.1
#=GS A0A135IBB7_9GAMM/28-231     AC A0A135IBB7.1
#=GS A0A0F3L3L1_9GAMM/31-235     AC A0A0F3L3L1.1
#=GS M1WER6_CLAP2/154-223        AC M1WER6.1
#=GS A0A1I5DU50_9MICO/43-197     AC A0A1I5DU50.1
#=GS L0M0E9_ENTBF/19-230         AC L0M0E9.1
#=GS A0A178ELH3_9PLEO/191-269    AC A0A178ELH3.1
#=GS A0A072MYJ5_9ALTE/32-232     AC A0A072MYJ5.1
#=GS A0A0N2CYC0_AGGAP/15-191     AC A0A0N2CYC0.1
#=GS A0A0L1HII2_9PLEO/356-426    AC A0A0L1HII2.1
#=GS A0A085DU25_9GAMM/43-243     AC A0A085DU25.1
#=GS A0A0X8HCK6_9GAMM/36-229     AC A0A0X8HCK6.1
#=GS B6HWF7_PENRW/497-580        AC B6HWF7.1
#=GS A0A118DTF7_9BURK/584-687    AC A0A118DTF7.1
#=GS I3I9U5_9GAMM/62-247         AC I3I9U5.1
#=GS A0A1G7QRD0_9EURY/420-532    AC A0A1G7QRD0.1
#=GS A0A1I3C8B8_9MICO/45-198     AC A0A1I3C8B8.1
#=GS A0A1I5REX0_9PSED/22-220     AC A0A1I5REX0.1
#=GS H0EHA7_GLAL7/273-357        AC H0EHA7.1
#=GS G3JLC1_CORMM/143-242        AC G3JLC1.1
#=GS M1BIG9_SOLTU/19-158         AC M1BIG9.1
#=GS A0A0T6VRE6_9PSED/28-220     AC A0A0T6VRE6.1
#=GS F3YXC4_DESAF/112-262        AC F3YXC4.1
#=GS A0A0L1J6G4_ASPNO/116-200    AC A0A0L1J6G4.1
#=GS A0A1R1LAM6_9MICC/60-210     AC A0A1R1LAM6.1
#=GS A0A1H4LT95_9ACTN/52-208     AC A0A1H4LT95.1
#=GS M9X4J7_MANHA/30-233         AC M9X4J7.1
#=GS A0A0M8UYP1_9ACTN/53-209     AC A0A0M8UYP1.1
#=GS S6UYY9_PSESF/19-226         AC S6UYY9.1
#=GS A0A1L0FSC2_9ASCO/54-217     AC A0A1L0FSC2.1
#=GS M7PIF1_9GAMM/22-224         AC M7PIF1.1
#=GS A0A1T0AS73_9PAST/41-162     AC A0A1T0AS73.1
#=GS A0A0A0M4E6_9GAMM/39-121     AC A0A0A0M4E6.1
#=GS A0A1I4ZLB6_9ACTN/52-208     AC A0A1I4ZLB6.1
#=GS A0A2H3I511_9EURO/46-247     AC A0A2H3I511.1
#=GS N1Q6C5_PSEFD/41-223         AC N1Q6C5.1
#=GS A0A0R3UHY1_9CEST/336-516    AC A0A0R3UHY1.1
#=GS A0A0U5FYR9_9EURO/353-489    AC A0A0U5FYR9.1
#=GS S8GXU6_9BACT/18-213         AC S8GXU6.1
#=GS A0A0T1WFE2_9MYCO/54-200     AC A0A0T1WFE2.1
#=GS U1JJD5_9GAMM/29-234         AC U1JJD5.1
#=GS C0N8T3_9GAMM/271-447        AC C0N8T3.1
#=GS F3ZQE9_9BACE/28-199         AC F3ZQE9.1
#=GS S6AY35_PSERE/18-221         AC S6AY35.1
#=GS A0A1U7GQK1_9BACT/39-253     AC A0A1U7GQK1.1
#=GS A0A1H1UA28_9MICO/53-211     AC A0A1H1UA28.1
#=GS A0A1J5LLQ1_9BACT/54-222     AC A0A1J5LLQ1.1
#=GS A0A1J5TXW8_9GAMM/42-209     AC A0A1J5TXW8.1
#=GS A0A0P7B7M1_9HYPO/93-173     AC A0A0P7B7M1.1
#=GS A0A0N9VZR0_9GAMM/62-173     AC A0A0N9VZR0.1
#=GS A6R5H4_AJECN/581-676        AC A6R5H4.1
#=GS A0A0V0U5R3_9BILA/428-606    AC A0A0V0U5R3.1
#=GS Q3A539_PELCD/57-250         AC Q3A539.1
#=GS G5B7R3_HETGA/19-218         AC G5B7R3.1
#=GS A0A1V6VCE2_PENNA/8-92       AC A0A1V6VCE2.1
#=GS L8ET40_STRR1/333-402        AC L8ET40.1
#=GS A6QYQ7_AJECN/267-344        AC A6QYQ7.1
#=GS A0A1L9U275_9EURO/46-120     AC A0A1L9U275.1
#=GS A0A165JS35_9PEZI/119-219    AC A0A165JS35.1
#=GS A0A1H8UZ39_9RHOB/75-215     AC A0A1H8UZ39.1
#=GS A0A1L9SP73_9EURO/110-184    AC A0A1L9SP73.1
#=GS Q4WMM3_ASPFU/628-717        AC Q4WMM3.1
#=GS G3AWC4_CANTC/53-224         AC G3AWC4.1
#=GS A6R3B6_AJECN/634-730        AC A6R3B6.1
#=GS A0A1G8SJW6_9PSED/24-225     AC A0A1G8SJW6.1
#=GS A0A0A7JPL5_9PSED/20-231     AC A0A0A7JPL5.1
#=GS A0A094AH86_9PEZI/176-255    AC A0A094AH86.1
#=GS L9JGS1_TUPCH/31-180         AC L9JGS1.1
#=GS R7S4T6_PUNST/215-297        AC R7S4T6.1
#=GS A0A1H5MTJ2_9MICO/47-197     AC A0A1H5MTJ2.1
#=GS Q15ZV1_PSEA6/31-235         AC Q15ZV1.1
#=GS A0A098SVK1_9PSED/287-460    AC A0A098SVK1.1
#=GS K8YQ63_NANGC/43-223         AC K8YQ63.1
#=GS A0A0D9NQV9_METAN/182-259    AC A0A0D9NQV9.1
#=GS A0A286TWD3_9BACT/507-613    AC A0A286TWD3.1
#=GS C4L7W6_TOLAT/31-235         AC C4L7W6.1
#=GS A0A1W6ZEE0_9BORD/19-212     AC A0A1W6ZEE0.1
#=GS A0A1I4GY97_9FIRM/66-246     AC A0A1I4GY97.1
#=GS A0A2G8JY43_STIJA/13-202     AC A0A2G8JY43.1
#=GS E5R3W9_ARTGP/635-712        AC E5R3W9.1
#=GS A0A244CQ16_9GAMM/29-234     AC A0A244CQ16.1
#=GS A0A0J6GK76_9CELL/49-215     AC A0A0J6GK76.1
#=GS B8M5A4_TALSN/51-252         AC B8M5A4.1
#=GS M4REZ1_9BIFI/72-228         AC M4REZ1.1
#=GS A0A1E5IYX2_SHECO/28-238     AC A0A1E5IYX2.1
#=GS C6WXI9_METML/20-230         AC C6WXI9.1
#=GS R6XX48_9BACT/32-201         AC R6XX48.1
#=GS A0A1G0N009_9DELT/75-275     AC A0A1G0N009.1
#=GS A0A1F5AHX0_9BACT/78-225     AC A0A1F5AHX0.1
#=GS A0A1X7AHY8_9GAMM/29-231     AC A0A1X7AHY8.1
#=GS K9NC29_9PSED/281-444        AC K9NC29.1
#=GS Q5LIR6_BACFN/39-218         AC Q5LIR6.1
#=GS A0A1G4MEC3_LACFM/43-226     AC A0A1G4MEC3.1
#=GS A0A1C5I4V1_9ACTN/60-212     AC A0A1C5I4V1.1
#=GS A0A1T4NXK2_9GAMM/54-256     AC A0A1T4NXK2.1
#=GS A0A1Q5KJ37_9ACTN/52-209     AC A0A1Q5KJ37.1
#=GS A0A090P6Q2_9VIBR/35-236     AC A0A090P6Q2.1
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#=GS F5SZC4_9GAMM/280-463        AC F5SZC4.1
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#=GS A0A0C4WGN1_9GAMM/26-220     AC A0A0C4WGN1.1
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#=GS S6BPL9_PSERE/22-223         AC S6BPL9.1
#=GS R7SXH1_DICSQ/142-257        AC R7SXH1.1
#=GS A0A0C9SWA8_PAXIN/89-170     AC A0A0C9SWA8.1
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#=GS I1XHZ9_METNJ/534-702        AC I1XHZ9.1
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