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Database: Pfam
Entry: Kdo
LinkDB: Kdo
Original site: Kdo 
#=GF ID   Kdo
#=GF AC   PF06293.17
#=GF DE   Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Krupa A, Srinivasan N
#=GF GA   21.30 21.30;
#=GF TC   21.30 21.30;
#=GF NC   21.20 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Lipopolysaccharide_kinase_(Kdo/WaaP)_family
#=GF CL   CL0016
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11069912
#=GF RT   Purification and characterization of WaaP from Escherichia coli,
#=GF RT   a lipopolysaccharide kinase essential for outer membrane
#=GF RT   stability. 
#=GF RA   Yethon JA, Whitfield C; 
#=GF RL   J Biol Chem 2001;276:5498-5504.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12021457
#=GF RT   Lipopolysaccharide phosphorylating enzymes encoded in the
#=GF RT   genomes of Gram-negative bacteria are related to the eukaryotic
#=GF RT   protein kinases. 
#=GF RA   Krupa A, Srinivasan N; 
#=GF RL   Protein Sci 2002;11:1580-1584.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10531340
#=GF RT   A Haemophilus influenzae gene that encodes a membrane bound
#=GF RT   3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (Kdo) kinase. Possible
#=GF RT   involvement of kdo phosphorylation in bacterial virulence. 
#=GF RA   White KA, Lin S, Cotter RJ, Raetz CR; 
#=GF RL   J Biol Chem 1999;274:31391-31400.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   These lipopolysaccharide kinases are related to protein kinases
#=GF CC   Pfam:PF00069. This family includes waaP (rfaP) gene product is
#=GF CC   required for the addition of phosphate to O-4 of the first
#=GF CC   heptose residue of the lipopolysaccharide (LPS) inner core
#=GF CC   region. It has previously been shown that WaaP is  necessary for
#=GF CC   resistance to hydrophobic and polycationic antimicrobials in E.
#=GF CC   coli and that it is required for virulence in invasive strains
#=GF CC   of S. enterica [1].
#=GF SQ   4428
#=GS A0A0B1P979_UNCNE/56-238     AC A0A0B1P979.1
#=GS A0A6F7VW36_9ACTN/53-196     AC A0A6F7VW36.1
#=GS A0A1V4CBP7_9BURK/288-378    AC A0A1V4CBP7.1
#=GS A0A316Z5R8_9BASI/147-247    AC A0A316Z5R8.1
#=GS A0A166CH95_9AGAM/119-267    AC A0A166CH95.1
#=GS E1SW63_FERBD/28-235         AC E1SW63.1
#=GS A0A2G8JY43_STIJA/12-202     AC A0A2G8JY43.1
#=GS B8MPN8_TALSN/670-755        AC B8MPN8.1
#=GS A0A0H4W0S9_9BORD/38-229     AC A0A0H4W0S9.1
#=GS A0A4Q0J8I5_9BACT/37-223     AC A0A4Q0J8I5.1
#=GS A0A5N5L3F8_PANHP/23-209     AC A0A5N5L3F8.1
#=GS A0A1W7CS68_9ACTN/50-197     AC A0A1W7CS68.1
#=GS A0A4T0X2A0_9ASCO/50-208     AC A0A4T0X2A0.1
#=GS L2G456_COLFN/138-228        AC L2G456.1
#=GS A0A562I0I9_9GAMM/20-198     AC A0A562I0I9.1
#=GS A0A2B7XP14_9EURO/101-203    AC A0A2B7XP14.1
#=GS D9XU35_9ACTN/53-209         AC D9XU35.1
#=GS A0A0T6UIQ8_9PSED/22-223     AC A0A0T6UIQ8.1
#=GS A6DSP8_9BACT/2-200          AC A6DSP8.1
#=GS A0A1Y0KWH5_9PSED/276-450    AC A0A1Y0KWH5.1
#=GS A0A368NKX2_9GAMM/32-190     AC A0A368NKX2.1
#=GS A0A1Z5STH0_HORWE/175-285    AC A0A1Z5STH0.1
#=GS A0A443HMM1_BYSSP/180-256    AC A0A443HMM1.1
#=GS A0A101MS75_9EURO/116-190    AC A0A101MS75.1
#=GS A0A3P3VKF8_9GAMM/20-234     AC A0A3P3VKF8.1
#=GS A0A1S7HGN0_9SACH/55-223     AC A0A1S7HGN0.1
#=GS A0A0C3AD12_9AGAM/576-655    AC A0A0C3AD12.1
#=GS A0A5Q2FH19_9ACTN/46-196     AC A0A5Q2FH19.1
#=GS A0A4U5UA51_COLLU/83-234     AC A0A4U5UA51.1
#=GS A0A2T7THE8_9MICC/78-224     AC A0A2T7THE8.1
#=GS A0A3Q7XA49_URSAR/96-276     AC A0A3Q7XA49.1
#=GS A0A2Z3I2B4_9GAMM/18-220     AC A0A2Z3I2B4.1
#=GS A0A094D867_9PEZI/61-243     AC A0A094D867.1
#=GS A0A455UWY3_9GAMM/1-138      AC A0A455UWY3.2
#=GS A0A261G649_9BIFI/75-228     AC A0A261G649.1
#=GS A0A094G633_9PEZI/64-244     AC A0A094G633.1
#=GS A0A366WGG9_9ALTE/37-233     AC A0A366WGG9.1
#=GS L0M0E9_ENTBF/19-230         AC L0M0E9.1
#=GS A0A4R0H5G4_9ACTN/42-195     AC A0A4R0H5G4.1
#=GS A0A085DU25_9GAMM/43-243     AC A0A085DU25.1
#=GS A0A428Q4R0_9HYPO/178-259    AC A0A428Q4R0.1
#=GS A0A6L9Y740_9BURK/44-234     AC A0A6L9Y740.1
#=GS A0A2U1ZUE8_9MICO/48-196     AC A0A2U1ZUE8.1
#=GS A0A089WIM8_9PSED/59-197     AC A0A089WIM8.1
#=GS A0A1L3GS87_9DELT/529-714    AC A0A1L3GS87.1
#=GS A0A4Q1BN61_TREME/1238-1392  AC A0A4Q1BN61.1
#=GS A0A2R4XFU7_9BURK/1-161      AC A0A2R4XFU7.1
#=GS A0A2D2M1W5_9PSED/20-190     AC A0A2D2M1W5.1
#=GS A0A1Y4D1P8_9BACT/46-244     AC A0A1Y4D1P8.1
#=GS A0A409X2F7_PSICY/117-219    AC A0A409X2F7.1
#=GS G2WXU9_VERDV/197-266        AC G2WXU9.1
#=GS A0A091AK54_9PROT/43-216     AC A0A091AK54.1
#=GS A0A2K6LDI4_RHIBE/46-225     AC A0A2K6LDI4.1
#=GS A0A0V0WZT4_9BILA/521-701    AC A0A0V0WZT4.1
#=GS A0A364L4E4_9EURO/179-255    AC A0A364L4E4.1
#=GS A0A0A0M4E6_9GAMM/39-121     AC A0A0A0M4E6.1
#=GS A0A2R9BNQ8_PANPA/47-225     AC A0A2R9BNQ8.1
#=GS A0A2H3I511_9EURO/46-247     AC A0A2H3I511.1
#=GS N1Q6C5_PSEFD/41-223         AC N1Q6C5.1
#=GS A0A2P8DZ47_9ACTN/25-203     AC A0A2P8DZ47.1
#=GS A0A5C4WG12_9ACTN/37-185     AC A0A5C4WG12.1
#=GS A0A2U8GNY0_9RHOO/19-216     AC A0A2U8GNY0.1
#=GS A0A5S9IHA5_9BACT/19-230     AC A0A5S9IHA5.1
#=GS A0A0P7B7M1_9HYPO/93-173     AC A0A0P7B7M1.1
#=GS A0A663ERT0_AQUCH/57-243     AC A0A663ERT0.1
#=GS A0A3R7L6S7_TRYRA/21-227     AC A0A3R7L6S7.1
#=GS A0A0V1LSV9_9BILA/505-685    AC A0A0V1LSV9.1
#=GS A0A0G2E0P4_9EURO/67-266     AC A0A0G2E0P4.1
#=GS A0A4Z0FAQ5_9GAMM/87-292     AC A0A4Z0FAQ5.1
#=GS A0A1G8SJW6_9PSED/24-225     AC A0A1G8SJW6.1
#=GS A0A381GX60_CITKO/19-80      AC A0A381GX60.1
#=GS A0A1I2GTS5_9MICO/51-199     AC A0A1I2GTS5.1
#=GS A0A512PEY2_9CELL/49-206     AC A0A512PEY2.1
#=GS A0A286TWD3_9BACT/507-613    AC A0A286TWD3.1
#=GS A4VR67_PSEU5/17-213         AC A4VR67.1
#=GS A0A244CQ16_9GAMM/29-234     AC A0A244CQ16.1
#=GS A0A4V1IN46_9GAMM/45-232     AC A0A4V1IN46.1
#=GS A0A3B5R9R9_XIPMA/20-202     AC A0A3B5R9R9.1
#=GS R7HNT3_9BACT/58-210         AC R7HNT3.1
#=GS A0A2S0HSX2_9FLAO/34-220     AC A0A2S0HSX2.1
#=GS A0A0D2AW71_9PEZI/35-227     AC A0A0D2AW71.1
#=GS C6WXI9_METML/20-230         AC C6WXI9.1
#=GS G5B7R3_HETGA/13-218         AC G5B7R3.1
#=GS A0A2N7TSF9_9GAMM/40-236     AC A0A2N7TSF9.1
#=GS C6HN50_AJECH/137-202        AC C6HN50.1
#=GS A0A2N6UQU3_9ACTO/51-199     AC A0A2N6UQU3.1
#=GS A0A3N9TC51_9VIBR/28-231     AC A0A3N9TC51.1
#=GS A0A166RV90_METRR/116-189    AC A0A166RV90.1
#=GS A0A1X7AHY8_9GAMM/29-231     AC A0A1X7AHY8.1
#=GS A0A1X6PG95_PORUM/504-561    AC A0A1X6PG95.1
#=GS A0A369GJN2_9HYPO/185-270    AC A0A369GJN2.1
#=GS A0A4S4AFP1_9RHOO/27-235     AC A0A4S4AFP1.1
#=GS A0A518EX06_9BACT/30-243     AC A0A518EX06.1
#=GS A0A285YYG1_9BACT/55-250     AC A0A285YYG1.1
#=GS A0A4Y7Q2Q1_9AGAM/116-189    AC A0A4Y7Q2Q1.1
#=GS A0A6N9YIW2_9ACTN/43-198     AC A0A6N9YIW2.1
#=GS A0A0J8R3Y8_COCIT/452-519    AC A0A0J8R3Y8.1
#=GS A0A507QL45_MONPU/111-189    AC A0A507QL45.1
#=GS A0A432W6Q8_9GAMM/40-254     AC A0A432W6Q8.1
#=GS Y0KJ22_9PROT/22-232         AC Y0KJ22.1
#=GS W9C1Z4_SCLBF/153-240        AC W9C1Z4.1
#=GS A0A086D5M5_9GAMM/24-233     AC A0A086D5M5.1
#=GS A0A427U2R6_9VIBR/463-582    AC A0A427U2R6.1
#=GS A0A4Y7U0U6_9AGAR/236-307    AC A0A4Y7U0U6.1
#=GS A0A4Q0XP09_9PROT/36-218     AC A0A4Q0XP09.1
#=GS A0A0D2M7J4_9CHLO/335-458    AC A0A0D2M7J4.1
#=GS A0A4S4AUF4_9RHOO/27-235     AC A0A4S4AUF4.1
#=GS A0Z6Q2_9GAMM/45-243         AC A0Z6Q2.1
#=GS A0A077M2X0_9MICO/49-198     AC A0A077M2X0.1
#=GS N2J0F3_9PSED/22-223         AC N2J0F3.1
#=GS A0A4W2E8V6_BOBOX/41-225     AC A0A4W2E8V6.1
#=GS A0A2I0CNQ4_9PSED/285-461    AC A0A2I0CNQ4.1
#=GS A0A177BCB6_9BILA/9-157      AC A0A177BCB6.1
#=GS A0A177QI66_9GAMM/292-490    AC A0A177QI66.1
#=GS A0A024HNL3_PSEKB/22-223     AC A0A024HNL3.1
#=GS A0A261ER87_9BIFI/89-242     AC A0A261ER87.1
#=GS A0A4U5LKG2_9BURK/16-220     AC A0A4U5LKG2.1
#=GS A0A2P5HRY4_9PEZI/184-287    AC A0A2P5HRY4.1
#=GS A0A6M4MEI7_9ALTE/31-235     AC A0A6M4MEI7.1
#=GS A0A2C6AMW0_9HYPO/645-735    AC A0A2C6AMW0.1
#=GS A0A2V1DW96_9PLEO/496-559    AC A0A2V1DW96.1
#=GS A0A4R5H1X0_9ALTE/31-235     AC A0A4R5H1X0.1
#=GS A1KBI1_AZOSB/68-217         AC A1KBI1.1
#=GS A0A4Y9NHF2_9ACTN/54-195     AC A0A4Y9NHF2.1
#=GS BUD32_EMENI/59-257          AC Q5BAB7.1
#=GS A0A195F0I3_9HYME/8-221      AC A0A195F0I3.1
#=GS A0A0D2BJU9_9EURO/192-267    AC A0A0D2BJU9.1
#=GS A0A074WAV6_9PEZI/44-243     AC A0A074WAV6.1
#=GS A0A1H2DW24_9PSED/17-221     AC A0A1H2DW24.1
#=GS A0A086ZL18_9BIFI/74-228     AC A0A086ZL18.1
#=GS A0A011PKJ0_9PROT/63-272     AC A0A011PKJ0.1
#=GS A0A2P6N3F2_9EUKA/306-388    AC A0A2P6N3F2.1
#=GS E2AID2_CAMFO/7-223          AC E2AID2.1
#=GS C8VDA8_EMENI/653-722        AC C8VDA8.1
#=GS A0A1Y2VCE6_9PEZI/161-238    AC A0A1Y2VCE6.1
#=GS A0A0M2REV9_9ACTN/45-195     AC A0A0M2REV9.1
#=GS A0A1H8YXB0_9FLAO/52-219     AC A0A1H8YXB0.1
#=GS A0A0E3YZQ9_9GAMM/39-241     AC A0A0E3YZQ9.1
#=GS A0A0C5G8Y6_9ACTN/52-207     AC A0A0C5G8Y6.1
#=GS A0A2A9NIU8_9AGAR/33-108     AC A0A2A9NIU8.1
#=GS Q8IJN3_PLAF7/373-488        AC Q8IJN3.2
#=GS A0A2I2F1S8_9EURO/87-174     AC A0A2I2F1S8.1
#=GS A0A3Q1H6R9_9TELE/32-202     AC A0A3Q1H6R9.1
#=GS A0A1C4C8H9_9GAMM/21-232     AC A0A1C4C8H9.1
#=GS A0A517T965_9PLAN/54-255     AC A0A517T965.1
#=GS Q6NJ74_CORDI/54-200         AC Q6NJ74.1
#=GS A0A562CQN2_9ACTN/41-191     AC A0A562CQN2.1
#=GS A0A0K6IX16_9PROT/49-259     AC A0A0K6IX16.1
#=GS A0A263HC34_9PAST/28-238     AC A0A263HC34.1
#=GS A0A1B8CKD7_9PEZI/61-244     AC A0A1B8CKD7.1
#=GS C6HTH5_AJECH/129-236        AC C6HTH5.1
#=GS A0A120E5I7_9BASI/119-233    AC A0A120E5I7.1
#=GS A0A5R9QH14_9PSED/20-231     AC A0A5R9QH14.1
#=GS A0A1Y2WEV7_9PEZI/612-680    AC A0A1Y2WEV7.1
#=GS A0A1L9V3Y1_ASPGL/114-195    AC A0A1L9V3Y1.1
#=GS A0A423PUE6_9GAMM/30-235     AC A0A423PUE6.1
#=GS A0A1Q5Q1U4_9ACTO/42-199     AC A0A1Q5Q1U4.1
#=GS A0A1Y4A8W3_9BACE/28-216     AC A0A1Y4A8W3.1
#=GS A0A0V0XWP6_TRIPS/487-666    AC A0A0V0XWP6.1
#=GS K9G2F2_PEND2/282-475        AC K9G2F2.1
#=GS A0A1H2VXD8_9PSED/22-222     AC A0A1H2VXD8.1
#=GS BUD32_YEAST/45-223          AC P53323.1
#=GS BUD32_YEAST/45-223          DR PDB; 4WW7 A; 45-223;
#=GS BUD32_YEAST/45-223          DR PDB; 4WW5 A; 45-223;
#=GS BUD32_YEAST/45-223          DR PDB; 4WWA A; 47-223;
#=GS BUD32_YEAST/45-223          DR PDB; 4WW9 A; 45-223;
#=GS A0A1H2HGG4_9PSED/18-220     AC A0A1H2HGG4.1
#=GS A0A2Z3GW36_9BACT/60-270     AC A0A2Z3GW36.1
#=GS A0A3N4JBH0_9PEZI/41-209     AC A0A3N4JBH0.1
#=GS A0A1B7TH12_9ASCO/27-225     AC A0A1B7TH12.1
#=GS A0A0V0S4N3_9BILA/518-697    AC A0A0V0S4N3.1
#=GS A0A6I3IVW0_9MICO/53-196     AC A0A6I3IVW0.1
#=GS A0A366K7X1_9BIFI/78-226     AC A0A366K7X1.1
#=GS A0A1E3P103_WICAA/648-720    AC A0A1E3P103.1
#=GS A0A5N6TBR6_ASPPS/84-163     AC A0A5N6TBR6.1
#=GS A0A0X3VLU8_9ACTN/52-210     AC A0A0X3VLU8.1
#=GS A0A202DA07_9BACT/2-201      AC A0A202DA07.1
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