GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Neisseria_TspB
LinkDB: Neisseria_TspB
Original site: Neisseria_TspB 
#=GF ID   Neisseria_TspB
#=GF AC   PF05616.17
#=GF DE   Neisseria meningitidis TspB protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_8925 (release 8.0)
#=GF GA   20.00 20.00;
#=GF TC   20.20 20.10;
#=GF NC   19.90 19.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF DR   INTERPRO; IPR008708;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several Neisseria meningitidis TspB
#=GF CC   virulence factor proteins.
#=GF SQ   55
#=GS A0A286E9P2_9NEIS/446-563  AC A0A286E9P2.1
#=GS G3P_BPPF3/292-483         AC P03624.1
#=GS A0A2A2EUT1_9GAMM/336-402  AC A0A2A2EUT1.1
#=GS V9HLU9_9NEIS/3-88         AC V9HLU9.1
#=GS G4CLJ7_9NEIS/220-383      AC G4CLJ7.1
#=GS Q9JY49_NEIMB/25-501       AC Q9JY49.1
#=GS A0A1H4GQV4_9GAMM/212-296  AC A0A1H4GQV4.1
#=GS A0A323URV6_9RHOO/281-438  AC A0A323URV6.1
#=GS A0A1I3G1L4_9BURK/287-475  AC A0A1I3G1L4.1
#=GS A0A669ES51_ORENI/37-186   AC A0A669ES51.1
#=GS A0A1P8JUU6_9BURK/297-466  AC A0A1P8JUU6.1
#=GS Q9JYD9_NEIMB/10-516       AC Q9JYD9.1
#=GS A0A5Q3S2K1_9NEIS/414-638  AC A0A5Q3S2K1.1
#=GS A0A669DKL5_ORENI/37-186   AC A0A669DKL5.1
#=GS U6Q1C2_9NEIS/1-131        AC U6Q1C2.1
#=GS A9BV75_DELAS/63-253       AC A9BV75.1
#=GS A0A4V1LT86_9GAMM/271-357  AC A0A4V1LT86.1
#=GS C4GK36_9NEIS/174-376      AC C4GK36.1
#=GS A0A2P1NLH1_9BURK/265-445  AC A0A2P1NLH1.1
#=GS A0A494XH30_9BURK/346-494  AC A0A494XH30.1
#=GS A0A1G6IRB0_9BURK/62-172   AC A0A1G6IRB0.1
#=GS A0A1H8U6H5_9PROT/315-404  AC A0A1H8U6H5.1
#=GS A0A892ZFR9_9NEIS/460-553  AC A0A892ZFR9.1
#=GS F0F2A1_9NEIS/362-547      AC F0F2A1.1
#=GS A0A4Q9R8S4_9GAMM/12-98    AC A0A4Q9R8S4.1
#=GS A0A380N0B3_9GAMM/278-476  AC A0A380N0B3.1
#=GS A0A892ZNX7_9NEIS/464-559  AC A0A892ZNX7.1
#=GS A0A7D5ICN1_9PSED/3-105    AC A0A7D5ICN1.1
#=GS A0A669DNF9_ORENI/37-185   AC A0A669DNF9.1
#=GS A0A1Z9YTG7_9GAMM/296-390  AC A0A1Z9YTG7.1
#=GS A0A2T4DWA3_9GAMM/1-159    AC A0A2T4DWA3.1
#=GS A0A2T0MMV8_9ACTN/12-67    AC A0A2T0MMV8.1
#=GS A0A669CY01_ORENI/37-186   AC A0A669CY01.1
#=GS A0A1H3ADN8_9PSED/48-116   AC A0A1H3ADN8.1
#=GS A0A0T6UQD7_9PSED/38-115   AC A0A0T6UQD7.1
#=GS Q9JYK0_NEIMB/56-547       AC Q9JYK0.1
#=GS Q63PM4_BURPS/383-577      AC Q63PM4.1
#=GS A0A1G7EGD1_9BURK/271-447  AC A0A1G7EGD1.1
#=GS U6Q2D8_9NEIS/117-297      AC U6Q2D8.1
#=GS U6Q3G4_9NEIS/208-384      AC U6Q3G4.1
#=GS Q7DDP6_NEIMB/1-130        AC Q7DDP6.1
#=GS C4GI39_9NEIS/249-420      AC C4GI39.1
#=GS A0A1N7G854_9GAMM/99-298   AC A0A1N7G854.1
#=GS G4CLJ7_9NEIS/347-481      AC G4CLJ7.1
#=GS A0A1E4UZL6_9PSED/73-238   AC A0A1E4UZL6.1
#=GS A0A1C9VG95_9BURK/9-211    AC A0A1C9VG95.1
#=GS Q5F7B3_NEIG1/1-506        AC Q5F7B3.2
#=GS Q5F7N0_NEIG1/1-507        AC Q5F7N0.1
#=GS A0A1X3DFJ1_9NEIS/2-282    AC A0A1X3DFJ1.1
#=GS A0A238HHY8_9NEIS/65-300   AC A0A238HHY8.1
#=GS A0A172U9F4_9GAMM/19-232   AC A0A172U9F4.1
#=GS F2JQ89_CELLD/19-203       AC F2JQ89.1
#=GS L1P0M5_9NEIS/469-572      AC L1P0M5.1
#=GS A0A4R6DR73_9RHOO/279-452  AC A0A4R6DR73.1
#=GS A0A4R2NBB4_9BURK/303-474  AC A0A4R2NBB4.1
A0A286E9P2_9NEIS/446-563             ..................................................................................................ssqtq----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------...-------------...-----.------------------------------.....-.....---..-..--.------------.-----.--------------..---...--------------------------.-----..----..---..---..-......---..-..-...---.....-..--....----....----........-----.-....-..--...-......---.-.--....--.---.....-..SN.A.QNQQEQ...S.nQQ.EE.RQ...DICKQ..NP..NSLMCAE..M..---QEVDYEDV..EVP..NNE.V.......K.....VEF....K.....PAD.L.....FSDN........GV..CPQPKQIVFY----.GSTYFLSYEPMCDF.AN.GARPMIILLGIVIAMSMVYA.TVK--em........................................................................
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