GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Nicastrin
LinkDB: Nicastrin
Original site: Nicastrin 
#=GF ID   Nicastrin
#=GF AC   PF05450.18
#=GF DE   Nicastrin
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_15452 (release 8.0)
#=GF GA   25.00 25.00;
#=GF TC   25.00 25.00;
#=GF NC   24.90 24.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Gamma_secretase
#=GF CL   CL0035
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12584255
#=GF RT   gamma-Secretase activity requires the presenilin-dependent
#=GF RT   trafficking of nicastrin through the Golgi apparatus but not its
#=GF RT   complex glycosylation. 
#=GF RA   Herreman A, Van Gassen G, Bentahir M, Nyabi O, Craessaerts K,
#=GF RA   Mueller U, Annaert W, De Strooper B; 
#=GF RL   J Cell Sci 2003;116:1127-1136.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12507492
#=GF RT   Nicastrin is a resident lysosomal membrane protein. 
#=GF RA   Bagshaw RD, Pasternak SH, Mahuran DJ, Callahan JW; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2003;300:615-618.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10993067
#=GF RT   Nicastrin modulates presenilin-mediated notch/glp-1 signal
#=GF RT   transduction and betaAPP processing. 
#=GF RA   Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song
#=GF RA   YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H,
#=GF RA   Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C,
#=GF RA   Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS,
#=GF RA   Sorb
#=GF RL   Nature 2000;407:48-54.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   11295540
#=GF RT   Nicastrin, a presenilin-interacting protein, contains an
#=GF RT   aminopeptidase/transferrin receptor superfamily domain. 
#=GF RA   Fagan R, Swindells M, Overington J, Weir M; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 2001;26:213-214.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Nicastrin and presenilin are two major components of the
#=GF CC   gamma-secretase complex, which executes the intramembrane
#=GF CC   proteolysis of type I integral membrane proteins such as the
#=GF CC   amyloid precursor protein (APP) and Notch.  Nicastrin is
#=GF CC   synthesised in fibroblasts and neurons as an
#=GF CC   endoglycosidase-H-sensitive glycosylated precursor protein
#=GF CC   (immature nicastrin) and is then modified by complex
#=GF CC   glycosylation in the Golgi apparatus and by sialylation in the
#=GF CC   trans-Golgi network (mature nicastrin) [1]. A region featured in
#=GF CC   this family has a fold similar to human transferrin receptor
#=GF CC   (TfR, Swiss:P02786) and a bacterial aminopeptidase
#=GF CC   (Swiss:P80561). It is implicated in the pathogenesis of
#=GF CC   Alzheimer's disease [4].
#=GF SQ   1490
#=GS A0A553PB30_TIGCA/264-492    AC A0A553PB30.1
#=GS A0A673TBK3_SURSU/273-489    AC A0A673TBK3.1
#=GS A0A5F4DL21_CANLF/253-478    AC A0A5F4DL21.1
#=GS A0A5N5N0Q0_9ROSI/1033-1108  AC A0A5N5N0Q0.1
#=GS F6UBR8_ORNAN/382-606        AC F6UBR8.2
#=GS A0A1S3HZN4_LINUN/261-499    AC A0A1S3HZN4.1
#=GS A0A672ILM7_SALFA/281-502    AC A0A672ILM7.1
#=GS A0A668TCW1_OREAU/262-480    AC A0A668TCW1.1
#=GS A0A0C2G238_9BILA/1-134      AC A0A0C2G238.1
#=GS A0A445DQA0_ARAHY/250-459    AC A0A445DQA0.1
#=GS A0A1S3R483_SALSA/273-497    AC A0A1S3R483.1
#=GS G0NXW2_CAEBE/112-290        AC G0NXW2.1
#=GS G7J8R2_MEDTR/242-467        AC G7J8R2.2
#=GS A0A662X2J3_9STRA/2-234      AC A0A662X2J3.1
#=GS A0A669FC45_ORENI/248-466    AC A0A669FC45.1
#=GS A0A1L8FCM9_XENLA/275-499    AC A0A1L8FCM9.1
#=GS A0A3Q3XED2_MOLML/261-474    AC A0A3Q3XED2.1
#=GS A0A3Q2LJE9_HORSE/274-499    AC A0A3Q2LJE9.1
#=GS I1C2J8_RHIO9/1008-1206      AC I1C2J8.1
#=GS A0A2K6UY71_SAIBB/254-479    AC A0A2K6UY71.1
#=GS A0A151TNY8_CAJCA/221-382    AC A0A151TNY8.1
#=GS A0A154PEW5_DUFNO/247-451    AC A0A154PEW5.1
#=GS A0A6P7K972_9TELE/278-502    AC A0A6P7K972.1
#=GS A0A2R6RDZ6_ACTCC/246-455    AC A0A2R6RDZ6.1
#=GS A0A673WRH8_SALTR/238-462    AC A0A673WRH8.1
#=GS A0A5E4MKM4_9HEMI/255-473    AC A0A5E4MKM4.1
#=GS B9HQ38_POPTR/231-384        AC B9HQ38.2
#=GS A0A182GLG6_AEDAL/277-513    AC A0A182GLG6.1
#=GS A0A5C7IMQ0_9ROSI/255-347    AC A0A5C7IMQ0.1
#=GS A0A3P9MVP3_POERE/261-485    AC A0A3P9MVP3.1
#=GS A0A498N2H5_LABRO/166-267    AC A0A498N2H5.1
#=GS A0A367KST2_RHIST/240-483    AC A0A367KST2.1
#=GS A0A0L9V6H3_PHAAN/223-384    AC A0A0L9V6H3.1
#=GS A0A433DIZ1_9FUNG/283-496    AC A0A433DIZ1.1
#=GS A0A388L7Q1_CHABU/159-282    AC A0A388L7Q1.1
#=GS A0A672T7P4_SINGR/268-491    AC A0A672T7P4.1
#=GS A0A091D5L2_FUKDA/274-499    AC A0A091D5L2.1
#=GS A0A2K2AX97_POPTR/224-371    AC A0A2K2AX97.1
#=GS A0A5N6NZ91_9ASTR/223-370    AC A0A5N6NZ91.1
#=GS A0A1E7FB76_9STRA/246-481    AC A0A1E7FB76.1
#=GS A0A0B7N3T5_9FUNG/1052-1301  AC A0A0B7N3T5.1
#=GS A0A7N6BFH1_ANATE/278-501    AC A0A7N6BFH1.1
#=GS A0A397TT83_9GLOM/216-462    AC A0A397TT83.1
#=GS A0A430QKT9_SCHBO/208-392    AC A0A430QKT9.1
#=GS A0A6J1YGU5_ACIJB/274-499    AC A0A6J1YGU5.1
#=GS A0A2G5CA71_AQUCA/223-366    AC A0A2G5CA71.1
#=GS A0A2H5PYN1_CITUN/7-83       AC A0A2H5PYN1.1
#=GS A0A667Z6E6_9TELE/263-487    AC A0A667Z6E6.1
#=GS A0A0V1ARD4_TRISP/122-189    AC A0A0V1ARD4.1
#=GS A0A090M8Y9_OSTTA/271-428    AC A0A090M8Y9.1
#=GS A0A3Q7R9F5_VULVU/274-499    AC A0A3Q7R9F5.1
#=GS A0A6J2TGU8_DROLE/272-509    AC A0A6J2TGU8.1
#=GS A0A673H558_9TELE/241-463    AC A0A673H558.1
#=GS A0A453S3L8_AEGTS/214-419    AC A0A453S3L8.1
#=GS A0A1D2MFT3_ORCCI/207-423    AC A0A1D2MFT3.1
#=GS A0A022PYG9_ERYGU/225-388    AC A0A022PYG9.1
#=GS M1B119_SOLTU/89-309         AC M1B119.1
#=GS A0A1Y1VNJ3_9FUNG/245-425    AC A0A1Y1VNJ3.1
#=GS A0A6P7F605_DIAVI/260-488    AC A0A6P7F605.1
#=GS A2E0Z0_TRIVA/204-436        AC A2E0Z0.1
#=GS A0A673AAM8_9TELE/263-472    AC A0A673AAM8.1
#=GS A0A0R0EVX5_SOYBN/239-467    AC A0A0R0EVX5.1
#=GS A0A061J0S5_TRYRA/332-490    AC A0A061J0S5.1
#=GS A0A026VT56_OOCBI/1-91       AC A0A026VT56.1
#=GS A0A5A7T1R9_CUCME/222-382    AC A0A5A7T1R9.1
#=GS A0A2R6P745_ACTCC/223-382    AC A0A2R6P745.1
#=GS I1LRI7_SOYBN/221-384        AC I1LRI7.2
#=GS A0A446XJX4_TRITD/79-265     AC A0A446XJX4.1
#=GS W4FD47_9STRA/254-503        AC W4FD47.1
#=GS A0A5A7PK23_STRAF/214-375    AC A0A5A7PK23.1
#=GS A0A372RG75_9GLOM/204-299    AC A0A372RG75.1
#=GS A0A1U7TT82_CARSF/273-498    AC A0A1U7TT82.1
#=GS A0A0G4IRC0_PLABS/226-423    AC A0A0G4IRC0.1
#=GS A0A5G2R4B3_PIG/367-473      AC A0A5G2R4B3.1
#=GS A0A0J7KHQ8_LASNI/1-138      AC A0A0J7KHQ8.1
#=GS A0A445E577_ARAHY/223-383    AC A0A445E577.1
#=GS A0A0B1T5K9_OESDE/1226-1472  AC A0A0B1T5K9.1
#=GS A0A453PIR9_AEGTS/247-450    AC A0A453PIR9.1
#=GS T1FSB4_HELRO/427-556        AC T1FSB4.1
#=GS A0A6P7T8Q9_OCTVU/264-507    AC A0A6P7T8Q9.1
#=GS A0A091TZ87_PHORB/245-463    AC A0A091TZ87.1
#=GS A0A6P5XLW3_DURZI/164-322    AC A0A6P5XLW3.1
#=GS A0A267ETC5_9PLAT/288-487    AC A0A267ETC5.1
#=GS A0A498SH56_ACAVI/293-515    AC A0A498SH56.1
#=GS A0A2P5CPI5_TREOI/182-329    AC A0A2P5CPI5.1
#=GS V4AJE4_LOTGI/240-476        AC V4AJE4.1
#=GS A0A448ZDA8_9STRA/265-519    AC A0A448ZDA8.1
#=GS A0A5D2UVK7_GOSMU/221-369    AC A0A5D2UVK7.1
#=GS A0A091JZH8_COLST/246-470    AC A0A091JZH8.1
#=GS A0A194R7R5_PAPMA/242-491    AC A0A194R7R5.1
#=GS K7GGD1_PELSI/270-494        AC K7GGD1.1
#=GS A0A0Q3X9C0_AMAAE/280-405    AC A0A0Q3X9C0.1
#=GS A0A2T7FBS8_9POAL/249-458    AC A0A2T7FBS8.1
#=GS B7FSJ4_PHATC/257-518        AC B7FSJ4.1
#=GS A0A6J3LF03_9HYME/246-451    AC A0A6J3LF03.1
#=GS A0A1D6P084_MAIZE/229-347    AC A0A1D6P084.1
#=GS A0A5E4MMP0_9HEMI/270-486    AC A0A5E4MMP0.1
#=GS NCLN_CAEEL/208-410          AC A5JYX8.1
#=GS A0A068YE75_ECHMU/212-356    AC A0A068YE75.1
#=GS A0A4E0QYE1_FASHE/276-499    AC A0A4E0QYE1.1
#=GS W5PGA9_SHEEP/285-510        AC W5PGA9.1
#=GS K3XAK7_GLOUD/251-504        AC K3XAK7.1
#=GS A0A151XFD1_9HYME/246-445    AC A0A151XFD1.1
#=GS NICA_DICPU/231-448          AC F0ZBA6.1
#=GS NICA_DICPU/231-448          DR PDB; 4R12 A; 231-448;
#=GS A0A669ELT0_ORENI/227-451    AC A0A669ELT0.1
#=GS W1NW73_AMBTC/218-383        AC W1NW73.1
#=GS V4UDN5_CITCL/220-380        AC V4UDN5.1
#=GS A0A6A4JZI0_APOLU/251-474    AC A0A6A4JZI0.1
#=GS A0A0E0K513_ORYPU/248-457    AC A0A0E0K513.1
#=GS A0A397VW87_9GLOM/242-468    AC A0A397VW87.1
#=GS A0A1U8B9M7_NELNU/244-475    AC A0A1U8B9M7.1
#=GS A0A6A6L653_HEVBR/247-440    AC A0A6A6L653.1
#=GS A0A6I9RUL6_ELAGV/282-491    AC A0A6I9RUL6.1
#=GS A0A0N4YB32_NIPBR/273-501    AC A0A0N4YB32.1
#=GS A0A3P8LXQ7_TRIRE/1-80       AC A0A3P8LXQ7.1
#=GS A0A453PIR3_AEGTS/247-363    AC A0A453PIR3.1
#=GS A0A132AEM1_SARSC/256-486    AC A0A132AEM1.1
#=GS A0A401TAU4_CHIPU/1-69       AC A0A401TAU4.1
#=GS A0A7N8X899_9TELE/275-488    AC A0A7N8X899.1
#=GS A0A444ZVW0_ARAHY/264-473    AC A0A444ZVW0.1
#=GS A0A016VKY5_9BILA/305-533    AC A0A016VKY5.1
#=GS A0A1Z5JDZ1_FISSO/261-514    AC A0A1Z5JDZ1.1
#=GS A0A026WCE7_OOCBI/3-108      AC A0A026WCE7.1
#=GS A0A1U7V8F9_NICSY/247-456    AC A0A1U7V8F9.1
#=GS A0A6P5YSR9_DURZI/244-452    AC A0A6P5YSR9.1
#=GS A0A4W6BMM0_LATCA/258-478    AC A0A4W6BMM0.1
#=GS A0A6A3BCU7_HIBSY/244-476    AC A0A6A3BCU7.1
#=GS A0A195AUS2_9HYME/221-420    AC A0A195AUS2.1
#=GS A0A5D2Z322_GOSMU/221-367    AC A0A5D2Z322.1
#=GS A0A1U7WPJ9_NICSY/18-177     AC A0A1U7WPJ9.1
#=GS A0A663M363_ATHCN/274-495    AC A0A663M363.1
#=GS A0A2H9ZV80_9ASPA/656-872    AC A0A2H9ZV80.1
#=GS A0A4W5JXT5_9TELE/266-491    AC A0A4W5JXT5.1
#=GS A0A1E5UW33_9POAL/208-432    AC A0A1E5UW33.1
#=GS A0A0Q3X9C0_AMAAE/405-462    AC A0A0Q3X9C0.1
#=GS A0A4W2I2R8_BOBOX/330-555    AC A0A4W2I2R8.1
#=GS B4QTU0_DROSI/264-497        AC B4QTU0.1
#=GS A0A6A2X455_HIBSY/222-370    AC A0A6A2X455.1
#=GS A0A673X2A9_SALTR/260-484    AC A0A673X2A9.1
#=GS A0A540NKB0_MALBA/229-386    AC A0A540NKB0.1
#=GS A0A7N9AW24_9TELE/254-439    AC A0A7N9AW24.1
#=GS A0A2K2ARM5_POPTR/246-466    AC A0A2K2ARM5.1
#=GS A0A6J0P3J4_RAPSA/222-368    AC A0A6J0P3J4.1
#=GS A0A250X5T5_9CHLO/257-474    AC A0A250X5T5.1
#=GS J3LGV5_ORYBR/248-457        AC J3LGV5.1
#=GS A0A672TH47_STRHB/288-512    AC A0A672TH47.1
#=GS Q7KS07_DROME/266-499        AC Q7KS07.2
#=GS A0A446XJY6_TRITD/214-402    AC A0A446XJY6.1
#=GS A0A0L0GEW5_9EUKA/6-229      AC A0A0L0GEW5.1
#=GS A0A4Y1RMW0_PRUDU/224-382    AC A0A4Y1RMW0.1
#=GS A0A0D3BYG4_BRAOL/171-380    AC A0A0D3BYG4.1
#=GS A0A2K6KVB9_RHIBE/274-499    AC A0A2K6KVB9.1
#=GS A0A0N0U3I5_9HYME/249-450    AC A0A0N0U3I5.1
#=GS A0A5A8CLJ1_CAFRO/2487-2570  AC A0A5A8CLJ1.1
#=GS A0A5G2QCC7_PIG/274-499      AC A0A5G2QCC7.1
#=GS A0A2K3N9B7_TRIPR/17-175     AC A0A2K3N9B7.1
#=GS A0A226MKQ6_CALSU/286-510    AC A0A226MKQ6.1
#=GS A0A2Y9FUB6_PHYMC/233-458    AC A0A2Y9FUB6.1
#=GS A0A1Y1IGF6_KLENI/292-507    AC A0A1Y1IGF6.1
#=GS A0A5A7QA22_STRAF/248-414    AC A0A5A7QA22.1
#=GS A0A5J5C7L8_9ASTE/224-381    AC A0A5J5C7L8.1
#=GS A0A0N4UT91_ENTVE/221-465    AC A0A0N4UT91.1
#=GS A0A2I0LLC9_COLLI/270-494    AC A0A2I0LLC9.1
#=GS A0A0J7KQK1_LASNI/246-297    AC A0A0J7KQK1.1
#=GS A0A7N6A208_ANATE/263-478    AC A0A7N6A208.1
#=GS A0A673ABX6_9TELE/260-468    AC A0A673ABX6.1
#=GS A0A287X028_HORVV/78-283     AC A0A287X028.1
#=GS A0A6P5XLY1_DURZI/221-379    AC A0A6P5XLY1.1
#=GS A0A6A6KQZ0_HEVBR/218-427    AC A0A6A6KQZ0.1
#=GS A0A2K5EPB2_AOTNA/254-479    AC A0A2K5EPB2.1
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