#=GF ID Peptidase_C92
#=GF AC PF05708.16
#=GF DE Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family
#=GF PI DUF830;
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_5425 (release 8.0)
#=GF GA 27.00 27.00;
#=GF TC 27.00 27.00;
#=GF NC 26.90 26.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 --cpu 4 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0125
#=GF RN [1]
#=GF RM 21799766
#=GF RT Structural analysis of papain-like NlpC/P60 superfamily enzymes
#=GF RT with a circularly permuted topology reveals potential lipid
#=GF RT binding sites.
#=GF RA Xu Q, Rawlings ND, Chiu HJ, Jaroszewski L, Klock HE, Knuth MW,
#=GF RA Miller MD, Elsliger MA, Deacon AM, Godzik A, Lesley SA, Wilson
#=GF RA IA;
#=GF RL PLoS One. 2011;6:e22013.
#=GF DR INTERPRO; IPR024453;
#=GF DR MEROPS; C92;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It
#=GF CC has amidase specificity for the amide bond between a lipid and
#=GF CC an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each
#=GF CC monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central,
#=GF CC 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices
#=GF CC on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7,
#=GF CC PDB:3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two
#=GF CC additional helices located above Cys154 contribute to the
#=GF CC formation of the active site, where the lysine ligand is bound
#=GF CC [1].
#=GF SQ 1405
#=GS A0A432MLJ1_9BACT/11-196 AC A0A432MLJ1.1
#=GS A0A838ZTC7_9FLAO/23-205 AC A0A838ZTC7.1
#=GS A0A8J8SY05_HALGN/57-209 AC A0A8J8SY05.1
#=GS A0A3P1SMU6_9GAMM/16-192 AC A0A3P1SMU6.1
#=GS A0A3N7A069_9BACT/23-205 AC A0A3N7A069.1
#=GS A0A368MWS0_9FLAO/27-209 AC A0A368MWS0.1
#=GS H8KQC7_SOLCM/28-207 AC H8KQC7.1
#=GS A0A2S2E050_9ALTE/23-203 AC A0A2S2E050.1
#=GS A0A5B9W0N0_9BACT/67-214 AC A0A5B9W0N0.1
#=GS A0A1R2AXT8_9CILI/149-296 AC A0A1R2AXT8.1
#=GS A0A161IUW5_9GAMM/37-148 AC A0A161IUW5.1
#=GS F0F4P6_9BACT/36-216 AC F0F4P6.1
#=GS A0A183DPA1_9BILA/8-194 AC A0A183DPA1.1
#=GS A0A370DM84_9GAMM/12-134 AC A0A370DM84.1
#=GS A0A1V4SKN7_RUMHU/91-232 AC A0A1V4SKN7.1
#=GS A0A1K1QDU3_9BACT/30-207 AC A0A1K1QDU3.1
#=GS L0M4W7_ENTBF/8-185 AC L0M4W7.1
#=GS A0A5K7X1E4_9BACT/253-435 AC A0A5K7X1E4.1
#=GS F7QH50_9BRAD/37-147 AC F7QH50.1
#=GS J9EM57_9SPIT/614-761 AC J9EM57.1
#=GS A0A6S6R9L7_9FIRM/84-206 AC A0A6S6R9L7.1
#=GS R5JI20_9FIRM/3-118 AC R5JI20.1
#=GS A0A1J1DXU5_9FLAO/30-219 AC A0A1J1DXU5.1
#=GS A0A1W2FEG6_9PSEU/55-197 AC A0A1W2FEG6.1
#=GS A8AYQ7_STRGC/5-163 AC A8AYQ7.1
#=GS A0A2S0VM70_9ALTE/9-185 AC A0A2S0VM70.1
#=GS A0A078B3T1_STYLE/585-745 AC A0A078B3T1.1
#=GS A0A285BE21_9FIRM/111-237 AC A0A285BE21.1
#=GS K6Z2S1_9ALTE/35-146 AC K6Z2S1.1
#=GS A0A329T1J1_9STRA/173-334 AC A0A329T1J1.1
#=GS A0A2S7U7P2_9BACT/20-196 AC A0A2S7U7P2.1
#=GS A0A5B8B5V2_9HYPH/41-153 AC A0A5B8B5V2.1
#=GS A0A0Q8QLR2_9BURK/12-189 AC A0A0Q8QLR2.1
#=GS M6TL87_LEPIR/28-205 AC M6TL87.1
#=GS R5BDV5_9BACT/40-165 AC R5BDV5.1
#=GS A0A0V1LIM7_9BILA/24-220 AC A0A0V1LIM7.1
#=GS A0A1A7KME9_9FLAO/39-221 AC A0A1A7KME9.1
#=GS J9I240_9SPIT/207-355 AC J9I240.1
#=GS A0A2U9QHL8_9POXV/10-174 AC A0A2U9QHL8.1
#=GS A0A0D6TKZ1_9FLAO/44-221 AC A0A0D6TKZ1.1
#=GS H0TUP3_9BRAD/37-152 AC H0TUP3.1
#=GS A0A0V0TGB2_9BILA/24-220 AC A0A0V0TGB2.1
#=GS A0A2S9JUC4_9SPHI/29-211 AC A0A2S9JUC4.1
#=GS A0A851GIJ2_9BACT/284-444 AC A0A851GIJ2.1
#=GS F0V7H5_NEOCL/284-430 AC F0V7H5.1
#=GS F8WWY7_9BACT/42-219 AC F8WWY7.1
#=GS A0A0V1G2D8_TRIPS/26-222 AC A0A0V1G2D8.1
#=GS A0A2S3QSY5_9PROT/296-497 AC A0A2S3QSY5.1
#=GS A0A098LDQ5_9BACT/40-217 AC A0A098LDQ5.1
#=GS A0A1H3S0A7_9BACI/150-269 AC A0A1H3S0A7.1
#=GS A0A327QDZ1_9BACT/42-218 AC A0A327QDZ1.1
#=GS A0A017H6D4_9FUSO/47-165 AC A0A017H6D4.1
#=GS A0A2A2JMZ3_9BILA/3-151 AC A0A2A2JMZ3.1
#=GS Q0AZX6_SYNWW/70-186 AC Q0AZX6.1
#=GS A0A1I1FFS3_9LACO/3-180 AC A0A1I1FFS3.1
#=GS A0A8J6UA96_9FLAO/21-201 AC A0A8J6UA96.1
#=GS A0A5C7GIC6_9FLAO/313-501 AC A0A5C7GIC6.1
#=GS A0A078B8N8_STYLE/238-418 AC A0A078B8N8.1
#=GS A0A4R6QB45_9FLAO/40-217 AC A0A4R6QB45.1
#=GS A0A2W2DLA8_9ACTN/2-135 AC A0A2W2DLA8.1
#=GS A0A4Q8QIP0_9BRAD/36-148 AC A0A4Q8QIP0.1
#=GS A0A433SFQ5_9BURK/34-170 AC A0A433SFQ5.1
#=GS YEBB_ECOLI/8-185 AC P24238.2
#=GS A0A1G6NKQ9_9BACT/36-213 AC A0A1G6NKQ9.1
#=GS A0A202E2Q5_9BACT/26-165 AC A0A202E2Q5.1
#=GS A0A7S8C535_9HYPH/40-151 AC A0A7S8C535.1
#=GS A0A517Y9C4_9BACT/50-225 AC A0A517Y9C4.1
#=GS A0A142L2D8_9BACT/20-201 AC A0A142L2D8.1
#=GS A0A5B8T1I7_9GAMM/34-143 AC A0A5B8T1I7.1
#=GS B2CWF8_9POXV/10-163 AC B2CWF8.1
#=GS A0A5R8YD45_9HYPH/89-263 AC A0A5R8YD45.1
#=GS Q8XY44_RALSO/4-141 AC Q8XY44.1
#=GS B3E6J0_TRIL1/326-519 AC B3E6J0.1
#=GS A6T4Z6_KLEP7/64-159 AC A6T4Z6.1
#=GS A0A0K6GTQ0_9NEIS/5-137 AC A0A0K6GTQ0.1
#=GS U5BS26_9BACT/56-243 AC U5BS26.1
#=GS W6WBF0_RHIS8/2-189 AC W6WBF0.1
#=GS T0RL79_9PROT/254-434 AC T0RL79.1
#=GS R6VXT8_9BACT/23-207 AC R6VXT8.1
#=GS A0A5C6ZLR5_9FLAO/29-215 AC A0A5C6ZLR5.1
#=GS G4QNS4_GLANF/37-141 AC G4QNS4.1
#=GS E1X4D2_HALMS/246-438 AC E1X4D2.1
#=GS A0A286IP52_9BACT/33-187 AC A0A286IP52.1
#=GS D8DXJ9_PREBR/33-207 AC D8DXJ9.1
#=GS J1NX60_STREE/1-160 AC J1NX60.1
#=GS Q8V3P1_SWPV1/10-168 AC Q8V3P1.1
#=GS A0A318UFX2_9SPHI/26-205 AC A0A318UFX2.1
#=GS A0A1R2BU19_9CILI/145-293 AC A0A1R2BU19.1
#=GS A0A1R2BHX0_9CILI/162-304 AC A0A1R2BHX0.1
#=GS A0A1V1ZKU4_9FLAO/11-196 AC A0A1V1ZKU4.1
#=GS N1U1W3_9LEPT/37-214 AC N1U1W3.1
#=GS F9Q795_9PAST/2-152 AC F9Q795.1
#=GS A0A368L109_9BURK/12-189 AC A0A368L109.1
#=GS A0A1B7K3J1_9GAMM/23-196 AC A0A1B7K3J1.1
#=GS A0A2A3U6T7_9SPHI/26-198 AC A0A2A3U6T7.1
#=GS A0A243PDV6_9SPHN/58-222 AC A0A243PDV6.1
#=GS A0A2P8NB05_9HYPH/41-153 AC A0A2P8NB05.1
#=GS A0A1B7K3A6_9GAMM/9-186 AC A0A1B7K3A6.1
#=GS D3IEA3_9BACT/33-212 AC D3IEA3.2
#=GS A0A1H7VPJ4_9GAMM/24-205 AC A0A1H7VPJ4.1
#=GS A0A2V1HBQ6_9GAMM/13-189 AC A0A2V1HBQ6.1
#=GS T0SX21_9PROT/175-328 AC T0SX21.1
#=GS A0A1Y0I8X6_9GAMM/32-153 AC A0A1Y0I8X6.1
#=GS L0DLZ7_SINAD/90-243 AC L0DLZ7.1
#=GS Q1CXU9_MYXXD/27-198 AC Q1CXU9.1
#=GS A0A1H4EMY5_9BACI/45-179 AC A0A1H4EMY5.1
#=GS A3WS74_9BRAD/37-148 AC A3WS74.1
#=GS A0A4Q1IR34_9FLAO/29-215 AC A0A4Q1IR34.1
#=GS A0A1M4TNP9_9BACT/265-442 AC A0A1M4TNP9.1
#=GS A0A167IQ65_9BURK/34-146 AC A0A167IQ65.1
#=GS A0A6C2YRN7_9BACT/123-223 AC A0A6C2YRN7.1
#=GS A0A1T4WHG5_9BACT/44-214 AC A0A1T4WHG5.1
#=GS A0A0N1KFS5_9BACI/38-168 AC A0A0N1KFS5.1
#=GS A0A5J4YHF3_PORPP/34-144 AC A0A5J4YHF3.1
#=GS A0A1G5SZG3_9SPHN/22-200 AC A0A1G5SZG3.1
#=GS B4D4G3_9BACT/35-207 AC B4D4G3.1
#=GS A0A0N4V5T8_ENTVE/19-168 AC A0A0N4V5T8.1
#=GS A0A084UEH4_9HYPH/53-165 AC A0A084UEH4.1
#=GS A0A0D7VZZ2_9FLAO/1-182 AC A0A0D7VZZ2.1
#=GS C0QB57_DESAH/33-144 AC C0QB57.1
#=GS A0A3P3WFD7_9FLAO/24-205 AC A0A3P3WFD7.1
#=GS A0A1B1G1F7_9BACT/28-212 AC A0A1B1G1F7.1
#=GS A0A345HA64_9FLAO/25-206 AC A0A345HA64.1
#=GS A0A369UR16_9GAMM/31-208 AC A0A369UR16.1
#=GS A0A4P8YHE2_9ENTR/52-163 AC A0A4P8YHE2.1
#=GS R6YCK0_9BACE/42-209 AC R6YCK0.1
#=GS A0A3N1Y1E3_9GAMM/33-155 AC A0A3N1Y1E3.1
#=GS W2Q2W6_PHYPN/70-227 AC W2Q2W6.1
#=GS A0A430KLG8_9GAMM/16-196 AC A0A430KLG8.1
#=GS A0A8R1TZB0_ONCVO/8-192 AC A0A8R1TZB0.1
#=GS A0A6L9MK26_9HYPH/33-225 AC A0A6L9MK26.1
#=GS A0A4U0ZME6_9DELT/34-146 AC A0A4U0ZME6.1
#=GS A4JN45_BURVG/38-169 AC A4JN45.1
#=GS F8X0R9_9BACT/34-222 AC F8X0R9.1
#=GS A0A366HUR5_9BACT/35-208 AC A0A366HUR5.1
#=GS A0DI29_PARTE/246-421 AC A0DI29.1
#=GS A0A812PLY0_9DINO/1118-1268 AC A0A812PLY0.1
#=GS A0A0E3Z160_9GAMM/35-141 AC A0A0E3Z160.1
#=GS Q39ZJ1_GEOMG/306-493 AC Q39ZJ1.1
#=GS A0A4Y6PXH2_9DELT/292-486 AC A0A4Y6PXH2.1
#=GS A0A2S9YH55_9DELT/374-591 AC A0A2S9YH55.1
#=GS A4BJV2_9GAMM/255-466 AC A4BJV2.1
#=GS D7VPL9_SPHSI/30-212 AC D7VPL9.1
#=GS Q32AD7_SHIDS/20-194 AC Q32AD7.1
#=GS A0A5C6ELD2_9BACT/251-404 AC A0A5C6ELD2.1
#=GS A0A0N4Y4W5_NIPBR/9-184 AC A0A0N4Y4W5.1
#=GS A0A7X6H176_9RHOB/85-231 AC A0A7X6H176.1
#=GS A0A317CUZ1_9GAMM/47-213 AC A0A317CUZ1.1
#=GS A0A7Z0VN11_9GAMM/272-476 AC A0A7Z0VN11.1
#=GS F7NDY8_9FIRM/27-204 AC F7NDY8.1
#=GS J9HTY6_9SPIT/391-546 AC J9HTY6.1
#=GS A0A7Z2JIL6_9BURK/3-180 AC A0A7Z2JIL6.1
#=GS A0A0A2LL47_9FLAO/21-203 AC A0A0A2LL47.1
#=GS A0A514WZG5_9PROT/179-335 AC A0A514WZG5.1
#=GS A0A202DZ89_9BACT/258-476 AC A0A202DZ89.1
#=GS R5CM02_9BACT/32-200 AC R5CM02.1
#=GS A0A257HDZ7_9HYPH/33-143 AC A0A257HDZ7.1
#=GS A0A1I4TA15_9FLAO/38-220 AC A0A1I4TA15.1
#=GS R4K134_CLOPA/100-229 AC R4K134.1
#=GS D1AKM5_SEBTE/36-179 AC D1AKM5.1
#=GS A0A5B8L541_9HYPH/97-259 AC A0A5B8L541.1
#=GS A0A2I0CNR6_9PSED/300-478 AC A0A2I0CNR6.1
#=GS A0A0N8HHE4_9GAMM/36-147 AC A0A0N8HHE4.1
#=GS A0A1E2UTA3_9GAMM/36-160 AC A0A1E2UTA3.1
#=GS C9MPF8_9BACT/36-179 AC C9MPF8.1
#=GS A0A345D8U4_9BURK/37-147 AC A0A345D8U4.1
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#=GS A0A4R1EV01_9GAMM/253-403 AC A0A4R1EV01.1
#=GS Q32H99_SHIDS/41-218 AC Q32H99.1
#=GS A2TZ73_9FLAO/10-199 AC A2TZ73.1
#=GS A0A419WBC5_9BACT/27-209 AC A0A419WBC5.1
#=GS A0A0X3ARC7_9FLAO/27-216 AC A0A0X3ARC7.1
#=GS A0A183DNP1_9BILA/8-194 AC A0A183DNP1.1
#=GS A5FUN5_ACICJ/37-146 AC A5FUN5.1
#=GS A0A7Y8KY04_9BURK/37-149 AC A0A7Y8KY04.1
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#=GS A0A498SDG2_ACAVI/7-192 AC A0A498SDG2.1
#=GS D9RWY2_PREMB/28-178 AC D9RWY2.1
#=GS Q8XCI9_ECO57/8-185 AC Q8XCI9.2
#=GS A0CUJ8_PARTE/234-408 AC A0CUJ8.1
#=GS K6UXG2_PLACD/240-399 AC K6UXG2.1
#=GS A0A0L8V7K0_9BACT/26-207 AC A0A0L8V7K0.1
#=GS A0A7X0LX38_9BACI/20-179 AC A0A7X0LX38.1
#=GS V4PSR7_9CAUL/31-218 AC V4PSR7.1
#=GS A0A011PNQ8_9PROT/24-192 AC A0A011PNQ8.1
#=GS A0A1M6MHV8_9BACT/21-199 AC A0A1M6MHV8.1
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#=GS A0A1N6JQE6_9BACT/17-192 AC A0A1N6JQE6.1
#=GS A0A077EIX5_9FLAO/2-184 AC A0A077EIX5.1
#=GS A0A3N1IWJ8_9ENTR/52-161 AC A0A3N1IWJ8.1
#=GS D8FBG5_9DELT/273-480 AC D8FBG5.1
#=GS A0A2T0LQ92_9PSEU/41-169 AC A0A2T0LQ92.1
#=GS A0A7D4BYS0_9BACT/22-207 AC A0A7D4BYS0.1
#=GS A0A810N430_9ACTN/102-239 AC A0A810N430.1
#=GS Q6MHE4_BDEBA/321-499 AC Q6MHE4.1
#=GS Q5JET8_THEKO/43-200 AC Q5JET8.1
#=GS A0A1V3SGF6_9BURK/35-142 AC A0A1V3SGF6.1
#=GS A0A0R2CJX5_9LACO/8-186 AC A0A0R2CJX5.1
#=GS A0A4R5M4J2_9BURK/22-173 AC A0A4R5M4J2.1
#=GS A0A0R1VI01_9LACO/14-168 AC A0A0R1VI01.1
#=GS F5J0G6_9BACT/22-209 AC F5J0G6.1
#=GS F9ZIN3_9PROT/37-148 AC F9ZIN3.1
#=GS A0A0V0URY4_9BILA/24-220 AC A0A0V0URY4.1
#=GS A0A410GAW6_9BURK/21-166 AC A0A410GAW6.1
#=GS T0SYY5_9PROT/29-197 AC T0SYY5.1
#=GS A0CSA1_PARTE/148-291 AC A0CSA1.1
#=GS A0A6M5XWX5_9BURK/66-208 AC A0A6M5XWX5.1
#=GS A0A081PJL8_9SPHI/21-196 AC A0A081PJL8.1
#=GS S2E4Z6_INDAL/22-208 AC S2E4Z6.1
#=GS A0A1T4VXZ8_9GAMM/38-161 AC A0A1T4VXZ8.1
#=GS A0A1Y3VG94_9BACT/22-206 AC A0A1Y3VG94.1
#=GS A0A177L9A4_9BACI/20-188 AC A0A177L9A4.1
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