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Database: Pfam
Entry: Plasmodium_Vir
LinkDB: Plasmodium_Vir
Original site: Plasmodium_Vir 
#=GF ID   Plasmodium_Vir
#=GF AC   PF05795.11
#=GF DE   Plasmodium vivax Vir protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_7631 (release 8.0)
#=GF GA   28.00 28.00;
#=GF TC   28.00 28.00;
#=GF NC   27.90 27.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11298455
#=GF RT   A superfamily of variant genes encoded in the subtelomeric
#=GF RT   region of Plasmodium vivax. 
#=GF RA   del Portillo HA, Fernandez-Becerra C, Bowman S, Oliver K, Preuss
#=GF RA   M, Sanchez CP, Schneider NK, Villalobos JM, Rajandream MA,
#=GF RA   Harris D, Pereira da Silva LH, Barrell B, Lanzer M; 
#=GF RL   Nature 2001;410:839-842.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008780;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several Vir proteins specific to
#=GF CC   Plasmodium vivax. The vir genes are present at about 600-1,000
#=GF CC   copies per haploid genome and encode proteins that are
#=GF CC   immunovariant in natural infections, indicating that they may
#=GF CC   have a functional role in establishing chronic infection through
#=GF CC   antigenic variation [1]. 
#=GF SQ   5293
#=GS A5K5D8_PLAVS/181-314        AC A5K5D8.1
#=GS A0A1A8X881_9APIC/11-234     AC A0A1A8X881.1
#=GS A0A1A8WA66_9APIC/246-331    AC A0A1A8WA66.1
#=GS A0A1B1DWA4_9APIC/15-283     AC A0A1B1DWA4.1
#=GS A0A1B1DY32_9APIC/16-427     AC A0A1B1DY32.1
#=GS A0A1A8WSK3_9APIC/221-338    AC A0A1A8WSK3.1
#=GS A0A1A8WCS6_9APIC/227-310    AC A0A1A8WCS6.1
#=GS A0A1A8X9S9_PLAMA/14-528     AC A0A1A8X9S9.1
#=GS B3L966_PLAKH/311-532        AC B3L966.1
#=GS A0A1A8WHA4_9APIC/219-304    AC A0A1A8WHA4.1
#=GS A5KDH0_PLAVS/16-255         AC A5KDH0.1
#=GS A0A1A9AHX8_9APIC/18-207     AC A0A1A9AHX8.1
#=GS A0A1A8WAV5_9APIC/284-583    AC A0A1A8WAV5.1
#=GS A0A1A9AKR9_9APIC/110-201    AC A0A1A9AKR9.1
#=GS A0A1A9ACH3_9APIC/200-297    AC A0A1A9ACH3.1
#=GS A0A1A8XDG0_9APIC/2-227      AC A0A1A8XDG0.1
#=GS A0A1A9AFH7_9APIC/14-237     AC A0A1A9AFH7.1
#=GS A0A1A8WTP2_9APIC/1-149      AC A0A1A8WTP2.1
#=GS A0A1A9AR20_9APIC/11-258     AC A0A1A9AR20.1
#=GS A0A1A9AMY5_9APIC/18-332     AC A0A1A9AMY5.1
#=GS A0A1A8WQU2_PLAMA/13-532     AC A0A1A8WQU2.1
#=GS A0A1Y1JP51_PLAGO/39-281     AC A0A1Y1JP51.1
#=GS A0A1A8WLS0_9APIC/577-841    AC A0A1A8WLS0.1
#=GS A0A1B1E0U0_9APIC/233-386    AC A0A1B1E0U0.1
#=GS A0A1A8WMV4_9APIC/224-323    AC A0A1A8WMV4.1
#=GS K6UJX0_9APIC/265-599        AC K6UJX0.1
#=GS A0A1A9ATB7_9APIC/11-240     AC A0A1A9ATB7.1
#=GS A0A1A8WZ98_PLAMA/8-490      AC A0A1A8WZ98.1
#=GS A0A1A8WPM2_9APIC/4-214      AC A0A1A8WPM2.1
#=GS A0A1A9AFA9_9APIC/251-338    AC A0A1A9AFA9.1
#=GS A0A1A9AJ42_9APIC/261-345    AC A0A1A9AJ42.1
#=GS A5KCR3_PLAVS/9-274          AC A5KCR3.1
#=GS A5KCV5_PLAVS/33-406         AC A5KCV5.1
#=GS A0A1A9AKZ3_9APIC/284-680    AC A0A1A9AKZ3.1
#=GS A0A1A8WGP9_9APIC/529-785    AC A0A1A8WGP9.1
#=GS B3L966_PLAKH/11-297         AC B3L966.1
#=GS A0A1A8WPF0_9APIC/248-330    AC A0A1A8WPF0.1
#=GS A0A1A9AI62_9APIC/207-321    AC A0A1A9AI62.1
#=GS A0A1B1DTI5_9APIC/12-177     AC A0A1B1DTI5.1
#=GS A0A1A8WFT8_9APIC/106-183    AC A0A1A8WFT8.1
#=GS A0A1A8WQS3_PLAMA/232-320    AC A0A1A8WQS3.1
#=GS A0A1A8WE34_9APIC/11-344     AC A0A1A8WE34.1
#=GS A0A1A8XCT6_9APIC/207-320    AC A0A1A8XCT6.1
#=GS A0A1A9AJP1_9APIC/209-338    AC A0A1A9AJP1.1
#=GS A0A1A8WHT2_9APIC/226-337    AC A0A1A8WHT2.1
#=GS A0A1A9APZ8_9APIC/228-323    AC A0A1A9APZ8.1
#=GS A0A1A9AQ83_9APIC/22-258     AC A0A1A9AQ83.1
#=GS A0A1A9AMS1_9APIC/223-310    AC A0A1A9AMS1.1
#=GS A0A1A9AMS6_9APIC/226-355    AC A0A1A9AMS6.1
#=GS A0A1A9AKM2_9APIC/219-330    AC A0A1A9AKM2.1
#=GS A0A1A8VTA1_9APIC/7-239      AC A0A1A8VTA1.1
#=GS A0A1A8WEL1_9APIC/242-344    AC A0A1A8WEL1.1
#=GS A0A1A8YQ54_9APIC/15-93      AC A0A1A8YQ54.1
#=GS A0A1A8WU28_9APIC/22-261     AC A0A1A8WU28.1
#=GS A0A1A9AS26_9APIC/16-423     AC A0A1A9AS26.1
#=GS A0A1A8WR51_9APIC/3-188      AC A0A1A8WR51.1
#=GS A0A1A8X459_9APIC/216-351    AC A0A1A8X459.1
#=GS A0A1A8WHC7_9APIC/265-352    AC A0A1A8WHC7.1
#=GS A0A1A8YNM7_9APIC/343-469    AC A0A1A8YNM7.1
#=GS A0A1A8WJH6_9APIC/267-353    AC A0A1A8WJH6.1
#=GS A0A1Y1JNV0_PLAGO/9-198      AC A0A1Y1JNV0.1
#=GS A0A1A8X105_9APIC/74-178     AC A0A1A8X105.1
#=GS A0A1A9ADJ2_9APIC/258-339    AC A0A1A9ADJ2.1
#=GS A0A1A9AKM1_9APIC/11-262     AC A0A1A9AKM1.1
#=GS A0A1A9AHD5_9APIC/283-678    AC A0A1A9AHD5.1
#=GS A5KDK3_PLAVS/16-104         AC A5KDK3.1
#=GS A0A1A8WMM3_9APIC/12-352     AC A0A1A8WMM3.1
#=GS A0A1A8WLP3_9APIC/218-345    AC A0A1A8WLP3.1
#=GS A0A1A9ARM8_9APIC/13-240     AC A0A1A9ARM8.1
#=GS B3L485_PLAKH/15-355         AC B3L485.1
#=GS A0A1A9AGW6_9APIC/212-348    AC A0A1A9AGW6.1
#=GS A5KCU7_PLAVS/1-203          AC A5KCU7.1
#=GS A0A1A9A613_9APIC/24-233     AC A0A1A9A613.1
#=GS K6V278_9APIC/1-212          AC K6V278.1
#=GS A0A1A8WH15_9APIC/7-235      AC A0A1A8WH15.1
#=GS A5KD03_PLAVS/2-386          AC A5KD03.1
#=GS A0A1B1DT83_9APIC/1393-1627  AC A0A1B1DT83.1
#=GS A0A1A9AML2_9APIC/2-176      AC A0A1A9AML2.1
#=GS A0A1A8WSE9_9APIC/214-300    AC A0A1A8WSE9.1
#=GS A5KCS4_PLAVS/1-364          AC A5KCS4.1
#=GS A0A1A9AH50_9APIC/57-256     AC A0A1A9AH50.1
#=GS A0A1A8VQW2_9APIC/239-342    AC A0A1A8VQW2.1
#=GS A0A1A8XC97_9APIC/313-709    AC A0A1A8XC97.1
#=GS A0A1A9AS79_9APIC/201-288    AC A0A1A9AS79.1
#=GS A0A1A9AI09_9APIC/239-337    AC A0A1A9AI09.1
#=GS A0A1A8WNI5_9APIC/215-324    AC A0A1A8WNI5.1
#=GS A0A1A8XC60_9APIC/2-88       AC A0A1A8XC60.1
#=GS A0A1A8WIU8_9APIC/20-300     AC A0A1A8WIU8.1
#=GS K6UZL6_9APIC/293-606        AC K6UZL6.1
#=GS B3L658_PLAKH/84-219         AC B3L658.1
#=GS A0A1A9ASJ8_9APIC/13-259     AC A0A1A9ASJ8.1
#=GS A0A1A8WPR3_9APIC/25-564     AC A0A1A8WPR3.1
#=GS A5K735_PLAVS/2-282          AC A5K735.1
#=GS A0A1A8XCG0_9APIC/9-249      AC A0A1A8XCG0.1
#=GS A0A1A8WBH0_9APIC/17-385     AC A0A1A8WBH0.1
#=GS A0A1A8WYF2_PLAMA/164-275    AC A0A1A8WYF2.1
#=GS A0A1A8WEN7_9APIC/23-255     AC A0A1A8WEN7.1
#=GS A0A1A9ATU6_9APIC/224-324    AC A0A1A9ATU6.1
#=GS A0A1A9ASL6_9APIC/255-349    AC A0A1A9ASL6.1
#=GS A0A1A9ADX6_9APIC/190-322    AC A0A1A9ADX6.1
#=GS A0A1A8VNQ5_9APIC/11-245     AC A0A1A8VNQ5.1
#=GS A0A1B1DWI6_9APIC/12-266     AC A0A1B1DWI6.1
#=GS A0A1B1E2A3_9APIC/11-250     AC A0A1B1E2A3.1
#=GS A5KCV7_PLAVS/5-344          AC A5KCV7.1
#=GS A0A1A8WD18_9APIC/12-258     AC A0A1A8WD18.1
#=GS A0A1Y1JUB7_PLAGO/38-616     AC A0A1Y1JUB7.1
#=GS A0A1A8WQP9_9APIC/208-334    AC A0A1A8WQP9.1
#=GS A0A1A9AJF5_9APIC/209-292    AC A0A1A9AJF5.1
#=GS A0A1A8X859_PLAMA/13-494     AC A0A1A8X859.1
#=GS A0A1A8WC98_9APIC/214-331    AC A0A1A8WC98.1
#=GS A0A1A9ATI2_9APIC/14-241     AC A0A1A9ATI2.1
#=GS A0A1A9AIL8_9APIC/14-107     AC A0A1A9AIL8.1
#=GS A0A1A9AN84_9APIC/264-351    AC A0A1A9AN84.1
#=GS A0A1A9AI29_9APIC/3-244      AC A0A1A9AI29.1
#=GS A0A1Y1JS79_PLAGO/270-369    AC A0A1Y1JS79.1
#=GS A0A1A9ARM1_9APIC/1-66       AC A0A1A9ARM1.1
#=GS K6VKH4_9APIC/3-149          AC K6VKH4.1
#=GS A0A1A8WHP6_9APIC/10-252     AC A0A1A8WHP6.1
#=GS A0A1A9AM04_9APIC/11-260     AC A0A1A9AM04.1
#=GS A0A1A8WKM8_9APIC/236-338    AC A0A1A8WKM8.1
#=GS A0A1A9APM3_9APIC/239-324    AC A0A1A9APM3.1
#=GS K6UF41_9APIC/1-194          AC K6UF41.1
#=GS A0A1Y1JUK4_PLAGO/13-206     AC A0A1Y1JUK4.1
#=GS A0A1A8WNC3_9APIC/2-249      AC A0A1A8WNC3.1
#=GS A0A1A9AK64_9APIC/2-94       AC A0A1A9AK64.1
#=GS A0A1A8WKX8_9APIC/12-242     AC A0A1A8WKX8.1
#=GS A0A1A8XB07_9APIC/11-223     AC A0A1A8XB07.1
#=GS A0A1Y1JHN7_PLAGO/17-253     AC A0A1Y1JHN7.1
#=GS K6V3I7_9APIC/2-77           AC K6V3I7.1
#=GS A0A1A8WV22_9APIC/15-213     AC A0A1A8WV22.1
#=GS A0A1A8XCN0_9APIC/206-290    AC A0A1A8XCN0.1
#=GS A0A1A8WD39_9APIC/12-340     AC A0A1A8WD39.1
#=GS B3L4W1_PLAKH/7-251          AC B3L4W1.1
#=GS A5KDG4_PLAVS/148-361        AC A5KDG4.1
#=GS A0A1A8VMK6_9APIC/231-331    AC A0A1A8VMK6.1
#=GS A0A1A9AGS4_9APIC/16-412     AC A0A1A9AGS4.1
#=GS A0A1A9AS75_9APIC/169-288    AC A0A1A9AS75.1
#=GS A0A1B1E6X9_9APIC/16-326     AC A0A1B1E6X9.1
#=GS A0A1A8WPM0_9APIC/16-458     AC A0A1A8WPM0.1
#=GS A0A1A8WJW6_9APIC/147-271    AC A0A1A8WJW6.1
#=GS A0A1A8X4L9_9APIC/23-357     AC A0A1A8X4L9.1
#=GS A0A1A8WMM0_9APIC/1-278      AC A0A1A8WMM0.1
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#=GS A0A1Y1JN08_PLAGO/28-405     AC A0A1Y1JN08.1
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#=GS A0A1A8WUE0_PLAMA/5-229      AC A0A1A8WUE0.1
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#=GS A5KCX3_PLAVS/16-418         AC A5KCX3.1
#=GS A0A1A8VW80_9APIC/530-772    AC A0A1A8VW80.1
#=GS K6UZJ4_9APIC/16-155         AC K6UZJ4.1
#=GS A0A1Y1JPE4_PLAGO/13-411     AC A0A1Y1JPE4.1
#=GS A0A1A9AKG9_9APIC/12-235     AC A0A1A9AKG9.1
#=GS A0A1B1E7B0_9APIC/250-479    AC A0A1B1E7B0.1
#=GS A0A1A9AHB6_9APIC/225-338    AC A0A1A9AHB6.1
#=GS A0A1A8WLW0_9APIC/11-124     AC A0A1A8WLW0.1
#=GS A0A1A9ALV0_9APIC/210-292    AC A0A1A9ALV0.1
#=GS A0A1A9AMA9_9APIC/218-335    AC A0A1A9AMA9.1
#=GS A0A1A8WKG1_9APIC/90-174     AC A0A1A8WKG1.1
#=GS A0A1Y1JS54_PLAGO/21-509     AC A0A1Y1JS54.1
#=GS A0A1A9AB26_9APIC/9-217      AC A0A1A9AB26.1
#=GS A0A1A9AS71_9APIC/15-223     AC A0A1A9AS71.1
#=GS A0A1A8VKW6_9APIC/206-291    AC A0A1A8VKW6.1
#=GS A0A1A8VSA7_9APIC/17-216     AC A0A1A8VSA7.1
#=GS B3KZG5_PLAKH/242-491        AC B3KZG5.1
#=GS A0A1A8WD18_9APIC/256-341    AC A0A1A8WD18.1
#=GS A0A1A8WLU2_9APIC/23-263     AC A0A1A8WLU2.1
#=GS A0A1A8WQ05_9APIC/45-255     AC A0A1A8WQ05.1
#=GS A0A1A9AMP2_9APIC/226-321    AC A0A1A9AMP2.1
#=GS A0A1A9A599_9APIC/245-333    AC A0A1A9A599.1
#=GS A0A1A8WFK5_9APIC/24-286     AC A0A1A8WFK5.1
#=GS A0A1Y1JDU9_PLAGO/781-871    AC A0A1Y1JDU9.1
#=GS A0A1A9AMZ9_9APIC/11-272     AC A0A1A9AMZ9.1
#=GS A0A1A8W7Z6_9APIC/21-266     AC A0A1A8W7Z6.1
#=GS A0A1A8W8M7_9APIC/112-461    AC A0A1A8W8M7.1
#=GS A0A1A8WXC1_PLAMA/16-455     AC A0A1A8WXC1.1
#=GS A0A1A8WWQ5_PLAMA/13-237     AC A0A1A8WWQ5.1
#=GS A0A1A8WDZ7_9APIC/225-302    AC A0A1A8WDZ7.1
#=GS A0A1A9AST6_9APIC/6-347      AC A0A1A9AST6.1
#=GS A0A1B1E7S9_9APIC/28-277     AC A0A1B1E7S9.1
#=GS A0A1B1E5Q8_9APIC/379-622    AC A0A1B1E5Q8.1
#=GS A5KAS0_PLAVS/36-522         AC A5KAS0.1
#=GS A0A1A9AJW9_9APIC/9-209      AC A0A1A9AJW9.1
#=GS A0A1A8WQ00_9APIC/740-833    AC A0A1A8WQ00.1
#=GS A0A1B1DSD6_9APIC/17-240     AC A0A1B1DSD6.1
#=GS A0A1A9A739_9APIC/7-297      AC A0A1A9A739.1
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#=GS A0A1B1DWD7_9APIC/4-235      AC A0A1B1DWD7.1
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