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Database: Pfam
Entry: RNA_pol_3_Rpc31
LinkDB: RNA_pol_3_Rpc31
Original site: RNA_pol_3_Rpc31 
#=GF ID   RNA_pol_3_Rpc31
#=GF AC   PF11705.8
#=GF DE   DNA-directed RNA polymerase III subunit Rpc31
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Pfam-B_203281 (release 23.0)
#=GF GA   29.40 29.40;
#=GF TC   29.80 29.40;
#=GF NC   29.10 29.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16877568
#=GF RT   Ancient origin, functional conservation and fast evolution of
#=GF RT   DNA-dependent RNA polymerase III. 
#=GF RA   Proshkina GM, Shematorova EK, Proshkin SA, Zaros C, Thuriaux P,
#=GF RA   Shpakovski GV; 
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2006;34:3615-3624.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024661;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   RNA polymerase III contains seventeen subunits in yeasts and in
#=GF CC   human cells. Twelve of these are akin to RNA polymerase I or II
#=GF CC   and the other five are RNA pol III-specific, and form the
#=GF CC   functionally distinct groups (i) Rpc31-Rpc34-Rpc82, and (ii)
#=GF CC   Rpc37-Rpc53. Rpc31, Rpc34 and Rpc82 form a cluster of
#=GF CC   enzyme-specific subunits that contribute to transcription
#=GF CC   initiation in S.cerevisiae and H.sapiens. There is evidence that
#=GF CC   these subunits are anchored at or near the N-terminal Zn-fold of
#=GF CC   Rpc1, itself prolonged by a highly conserved but RNA polymerase
#=GF CC   III-specific domain [1].
#=GF SQ   1074
#=GS M2N2E1_BAUCO/8-195        AC M2N2E1.1
#=GS A0A158NTN4_ATTCE/2-197    AC A0A158NTN4.1
#=GS A0A0K8L2R5_9EURO/665-892  AC A0A0K8L2R5.1
#=GS S2JE17_MUCC1/6-202        AC S2JE17.1
#=GS G1M3N3_AILME/2-212        AC G1M3N3.1
#=GS B5DFW4_SALSA/5-213        AC B5DFW4.1
#=GS A0A1G4J6U9_9SACH/4-218    AC A0A1G4J6U9.1
#=GS A0A1S4B5M1_TOBAC/4-185    AC A0A1S4B5M1.1
#=GS E9ES01_METRA/5-254        AC E9ES01.1
#=GS W5MNK6_LEPOC/5-204        AC W5MNK6.1
#=GS A0A084RHC2_STACH/5-255    AC A0A084RHC2.1
#=GS G0PD86_CAEBE/3-206        AC G0PD86.1
#=GS J3MMW4_ORYBR/4-193        AC J3MMW4.1
#=GS A0A0E0EE86_9ORYZ/4-187    AC A0A0E0EE86.1
#=GS A0A0W4ZWT1_PNEJ7/4-159    AC A0A0W4ZWT1.1
#=GS A0A1L9N543_ASPTU/3-232    AC A0A1L9N543.1
#=GS A0A0N4Y9Y5_NIPBR/2-201    AC A0A0N4Y9Y5.1
#=GS A0A1Y3NK40_PIRSE/3-89     AC A0A1Y3NK40.1
#=GS A0A1S3NM35_SALSA/26-230   AC A0A1S3NM35.1
#=GS A0A1F8AEX6_9EURO/3-226    AC A0A1F8AEX6.1
#=GS RPC7_MOUSE/2-209          AC Q6NXY9.1
#=GS A0A0D9MNF2_ASPFA/674-896  AC A0A0D9MNF2.1
#=GS X0KAM7_FUSOX/5-250        AC X0KAM7.1
#=GS A0A179UJD0_BLAGS/3-243    AC A0A179UJD0.1
#=GS A0A1S3M3C0_SALSA/12-176   AC A0A1S3M3C0.1
#=GS J9JX01_ACYPI/6-241        AC J9JX01.1
#=GS A0A0E0LN74_ORYPU/588-786  AC A0A0E0LN74.1
#=GS A0A1S3NLT5_SALSA/2-197    AC A0A1S3NLT5.1
#=GS A0A091X9F7_OPIHO/1-198    AC A0A091X9F7.1
#=GS M1WI44_CLAP2/3-259        AC M1WI44.1
#=GS A0A0E0LN75_ORYPU/263-461  AC A0A0E0LN75.1
#=GS A0A261C4L9_9PELO/3-207    AC A0A261C4L9.1
#=GS A0A1V6SME1_9EURO/37-237   AC A0A1V6SME1.1
#=GS A0A0F8BS75_CERFI/3-252    AC A0A0F8BS75.1
#=GS A0A1A6HF76_NEOLE/4-129    AC A0A1A6HF76.1
#=GS A0A2I3MHT0_PAPAN/4-88     AC A0A2I3MHT0.1
#=GS A0A0E0AMK4_9ORYZ/4-157    AC A0A0E0AMK4.1
#=GS A0A1S8VVP0_9FUNG/9-207    AC A0A1S8VVP0.1
#=GS A0A0G2FHS5_9PEZI/2-229    AC A0A0G2FHS5.1
#=GS A0A067EKV5_CITSI/4-187    AC A0A067EKV5.1
#=GS F0VK49_NEOCL/2-205        AC F0VK49.1
#=GS L5K696_PTEAL/4-241        AC L5K696.1
#=GS A0A067EKV1_CITSI/4-194    AC A0A067EKV1.1
#=GS A0A0F8V460_9EURO/658-883  AC A0A0F8V460.1
#=GS A0A094MJ42_ANTCR/1-196    AC A0A094MJ42.1
#=GS A0A2I3HM28_NOMLE/2-209    AC A0A2I3HM28.1
#=GS A0A1U8CUW1_MESAU/4-129    AC A0A1U8CUW1.1
#=GS A0A091G6Y0_9AVES/1-196    AC A0A091G6Y0.1
#=GS A0A1E1LKP9_9HELO/3-229    AC A0A1E1LKP9.1
#=GS A0A225ASZ6_9EURO/3-236    AC A0A225ASZ6.1
#=GS A0A1V8V4Z1_9PEZI/3-234    AC A0A1V8V4Z1.1
#=GS B4MXG0_DROWI/3-202        AC B4MXG0.1
#=GS W5JWT7_ANODA/4-203        AC W5JWT7.1
#=GS A0A2K2B1M0_POPTR/4-180    AC A0A2K2B1M0.1
#=GS A0A1B8GH95_9PEZI/3-232    AC A0A1B8GH95.1
#=GS B4IRS4_DROPE/1-148        AC B4IRS4.1
#=GS W2RSK4_9EURO/3-261        AC W2RSK4.1
#=GS A0A0D1YRA0_9EURO/3-320    AC A0A0D1YRA0.1
#=GS W5QHI6_SHEEP/19-219       AC W5QHI6.1
#=GS A0A2G5VVR1_9PELO/2-206    AC A0A2G5VVR1.1
#=GS A0A0D1XRL2_9EURO/4-283    AC A0A0D1XRL2.1
#=GS J4HXI2_9APHY/6-217        AC J4HXI2.1
#=GS A6NGX6_HUMAN/4-88         AC A6NGX6.1
#=GS G0SY04_RHOT2/7-204        AC G0SY04.1
#=GS C1MRW9_MICPC/3-339        AC C1MRW9.1
#=GS G8BBQ2_CANPC/3-233        AC G8BBQ2.1
#=GS A0A0R0GAU2_SOYBN/2-193    AC A0A0R0GAU2.1
#=GS A0A091HTC0_CALAN/1-198    AC A0A091HTC0.1
#=GS Q9N3T3_CAEEL/11-215       AC Q9N3T3.1
#=GS A0A1Y2GHE4_9FUNG/3-197    AC A0A1Y2GHE4.1
#=GS E1BNG5_BOVIN/2-209        AC E1BNG5.2
#=GS A0A088A7Y5_APIME/1-190    AC A0A088A7Y5.1
#=GS F7WAJ9_SORMK/4-252        AC F7WAJ9.1
#=GS A0A0N5AU13_9BILA/3-217    AC A0A0N5AU13.1
#=GS A0A195EEV8_9HYME/2-202    AC A0A195EEV8.1
#=GS A0A182FB30_ANOAL/4-204    AC A0A182FB30.1
#=GS A0A0L0SX08_ALLMA/8-209    AC A0A0L0SX08.1
#=GS G3JGX0_CORMM/45-281       AC G3JGX0.1
#=GS A0A2I2UI86_FELCA/2-88     AC A0A2I2UI86.1
#=GS A0A1J8PUR6_9HOMO/4-203    AC A0A1J8PUR6.1
#=GS A0A1W4WK90_AGRPL/3-193    AC A0A1W4WK90.1
#=GS A0A0F4YVT0_TALEM/3-230    AC A0A0F4YVT0.1
#=GS G3X2W9_SARHA/4-223        AC G3X2W9.1
#=GS H3CX01_TETNG/3-201        AC H3CX01.1
#=GS A0A2H3J039_WOLCO/2-172    AC A0A2H3J039.1
#=GS F6UDC2_HORSE/4-190        AC F6UDC2.1
#=GS A0A137NUV2_CONC2/9-161    AC A0A137NUV2.1
#=GS A0A067MDC0_9HOMO/6-201    AC A0A067MDC0.1
#=GS A0A182NKI1_9DIPT/4-204    AC A0A182NKI1.1
#=GS A0A177U8A1_9BASI/4-225    AC A0A177U8A1.1
#=GS A0A1A6AB32_9TREE/7-223    AC A0A1A6AB32.1
#=GS W5Q454_SHEEP/2-209        AC W5Q454.1
#=GS A0A1D2VEP0_9ASCO/2-220    AC A0A1D2VEP0.1
#=GS N4UKL2_COLOR/3-247        AC N4UKL2.1
#=GS A0A1I7ZDP1_9BILA/3-203    AC A0A1I7ZDP1.1
#=GS W5C661_WHEAT/4-203        AC W5C661.1
#=GS A0A1Y1UCY7_9TREE/3-251    AC A0A1Y1UCY7.1
#=GS A0A0S6XQI8_9FUNG/1-131    AC A0A0S6XQI8.1
#=GS V4T1P1_9ROSI/4-194        AC V4T1P1.1
#=GS D2HQ52_AILME/4-203        AC D2HQ52.1
#=GS A0A120E917_9BASI/6-201    AC A0A120E917.1
#=GS A0A0L7LI52_9NEOP/3-205    AC A0A0L7LI52.1
#=GS A0A0N1I7W5_PAPMA/4-205    AC A0A0N1I7W5.1
#=GS S9X9W8_SCHCR/1-193        AC S9X9W8.1
#=GS A0A1V6RIF3_9EURO/2-226    AC A0A1V6RIF3.1
#=GS A0A1L8FBW2_XENLA/3-201    AC A0A1L8FBW2.1
#=GS A0A177SXE7_9BASI/1-214    AC A0A177SXE7.1
#=GS F7BFJ0_XENTR/3-202        AC F7BFJ0.1
#=GS A0A1Y2C755_9FUNG/1-153    AC A0A1Y2C755.1
#=GS H3CB82_TETNG/5-193        AC H3CB82.1
#=GS A0A0K9Q159_ZOSMR/4-192    AC A0A0K9Q159.1
#=GS A5DQ81_PICGU/65-276       AC A5DQ81.2
#=GS A0A2K5IBU6_COLAP/1-182    AC A0A2K5IBU6.1
#=GS A0A0E0LN72_ORYPU/567-765  AC A0A0E0LN72.1
#=GS A0A063C413_9HYPO/3-253    AC A0A063C413.1
#=GS A0A0D2QBB3_GOSRA/84-282   AC A0A0D2QBB3.1
#=GS A0A251V1E3_HELAN/4-178    AC A0A251V1E3.1
#=GS V5F7W5_BYSSN/3-229        AC V5F7W5.1
#=GS A0A165Q9H1_9APHY/6-199    AC A0A165Q9H1.1
#=GS G3H2S9_CRIGR/52-252       AC G3H2S9.1
#=GS A0A1Z5TH48_HORWE/3-243    AC A0A1Z5TH48.1
#=GS E7KH21_YEASA/5-151        AC E7KH21.1
#=GS A0A1B8F3W7_9PEZI/3-232    AC A0A1B8F3W7.1
#=GS A0A061H8C1_9BASI/4-201    AC A0A061H8C1.1
#=GS A0A2I3SBJ5_PANTR/2-87     AC A0A2I3SBJ5.1
#=GS F2U6D9_SALR5/4-172        AC F2U6D9.1
#=GS A0A1G4ITC3_9SACH/4-219    AC A0A1G4ITC3.1
#=GS A0A067KXI5_JATCU/3-193    AC A0A067KXI5.1
#=GS F7CNH6_CALJA/5-202        AC F7CNH6.1
#=GS G5BBN3_HETGA/4-204        AC G5BBN3.1
#=GS H2R8S9_PANTR/4-88         AC H2R8S9.1
#=GS A0A1S2Y2H0_CICAR/10-211   AC A0A1S2Y2H0.1
#=GS A0A1B9GRR8_9TREE/3-241    AC A0A1B9GRR8.1
#=GS F7FXJ6_MONDO/3-199        AC F7FXJ6.1
#=GS A0A0H5C0B8_CYBJA/3-218    AC A0A0H5C0B8.1
#=GS A0A1S3RWY6_SALSA/5-210    AC A0A1S3RWY6.1
#=GS A0A240SWE9_9MUSC/3-197    AC A0A240SWE9.1
#=GS A0A1J1J362_9DIPT/4-195    AC A0A1J1J362.1
#=GS A0A1B0GGA6_GLOMM/74-173   AC A0A1B0GGA6.1
#=GS F2SPL7_TRIRC/122-263      AC F2SPL7.1
#=GS A0A1D8PS98_CANAL/4-275    AC A0A1D8PS98.1
#=GS A6QZX2_AJECN/3-243        AC A6QZX2.1
#=GS R0JYQ8_SETT2/8-252        AC R0JYQ8.1
#=GS A0A183J6R0_9BILA/1-103    AC A0A183J6R0.1
#=GS W5L5A6_ASTMX/2-208        AC W5L5A6.1
#=GS Q6CX38_KLULA/3-234        AC Q6CX38.1
#=GS G3R856_GORGO/4-204        AC G3R856.2
#=GS A0A023B1M9_GRENI/2-191    AC A0A023B1M9.1
#=GS F4RME8_MELLP/4-245        AC F4RME8.1
#=GS E9ICU6_SOLIN/2-201        AC E9ICU6.1
#=GS A0A093ZAL6_9PEZI/3-234    AC A0A093ZAL6.1
#=GS A0A0D0A1X6_9HOMO/5-200    AC A0A0D0A1X6.1
#=GS A0A182HQD9_ANOAR/4-204    AC A0A182HQD9.1
#=GS B4HKS0_DROSE/3-196        AC B4HKS0.1
#=GS A0A0A2KPI6_PENIT/2-226    AC A0A0A2KPI6.1
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#=GS A0A1L9TZQ4_9EURO/3-227    AC A0A1L9TZQ4.1
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#=GS A0A162MX88_CORDF/3-258    AC A0A162MX88.1
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#=GS E2C5B1_HARSA/2-216        AC E2C5B1.1
#=GS A0A067RAN5_ZOONE/4-217    AC A0A067RAN5.1
#=GS A0A1S4C824_TOBAC/3-185    AC A0A1S4C824.1
#=GS A0A1U7S1C6_ALLSI/3-212    AC A0A1U7S1C6.1
#=GS A0A1V6P535_9EURO/2-226    AC A0A1V6P535.1
#=GS A0A1X2IBS9_9FUNG/4-195    AC A0A1X2IBS9.1
#=GS U6M7R5_EIMMA/2-201        AC U6M7R5.1
#=GS M2QED1_CERS8/6-200        AC M2QED1.1
#=GS A0A0C9LVC0_9FUNG/6-202    AC A0A0C9LVC0.1
#=GS W9CKA2_9HELO/3-231        AC W9CKA2.1
#=GS W1QET9_OGAPD/7-211        AC W1QET9.1
#=GS A0A093JIZ8_EURHL/1-197    AC A0A093JIZ8.1
#=GS F6HY81_VITVI/4-197        AC F6HY81.1
#=GS A0A168TAM4_ABSGL/5-93     AC A0A168TAM4.1
#=GS A0A096MDU3_POEFO/2-188    AC A0A096MDU3.1
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#=GS A0A195ERS3_9HYME/2-208    AC A0A195ERS3.1
#=GS A0A0L9VFQ3_PHAAN/2-194    AC A0A0L9VFQ3.1
#=GS R7YSJ3_CONA1/59-253       AC R7YSJ3.1
#=GS S8CA59_DACHA/4-243        AC S8CA59.1
#=GS G0NVX0_CAEBE/3-206        AC G0NVX0.1
#=GS A0A1J7JQR5_9PEZI/3-263    AC A0A1J7JQR5.1
#=GS A0A091JE42_EGRGA/1-198    AC A0A091JE42.1
#=GS A0A2H3A4C3_9HYPO/4-253    AC A0A2H3A4C3.1
#=GS A0A0D9P781_METAN/5-254    AC A0A0D9P781.1
#=GS A0A1B0AHZ8_GLOPL/3-198    AC A0A1B0AHZ8.1
#=GS A0A068YH14_ECHMU/143-262  AC A0A068YH14.1
#=GS A0A1C1WS66_9PEZI/3-257    AC A0A1C1WS66.1
#=GS A0A067PUA6_9HOMO/4-168    AC A0A067PUA6.1
#=GS G5AWY4_HETGA/5-201        AC G5AWY4.1
#=GS A0A091TEY0_PHALP/1-198    AC A0A091TEY0.1
#=GS B6K632_SCHJY/1-194        AC B6K632.1
#=GS A0A0J0XJH0_9TREE/2-159    AC A0A0J0XJH0.1
#=GS A0A2G8LMZ8_STIJA/3-199    AC A0A2G8LMZ8.1
#=GS K5V4T3_PHACS/5-198        AC K5V4T3.1
#=GS F7B4F4_CIOIN/3-198        AC F7B4F4.2
#=GS I3MLX5_ICTTR/4-204        AC I3MLX5.1
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