GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Regulator_TrmB
LinkDB: Regulator_TrmB
Original site: Regulator_TrmB 
#=GF ID   Regulator_TrmB
#=GF AC   PF11495.8
#=GF DE   Archaeal transcriptional regulator TrmB
#=GF AU   Pollington J;0000-0002-8158-8998
#=GF SE   pdb_2f5t
#=GF GA   22.20 22.20;
#=GF TC   22.20 22.20;
#=GF NC   22.10 22.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16473881
#=GF RT   Crystal structure of the sugar binding domain of the archaeal
#=GF RT   transcriptional regulator TrmB. 
#=GF RA   Krug M, Lee SJ, Diederichs K, Boos W, Welte W; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2006;281:10976-10982.
#=GF DR   INTERPRO; IPR021586;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   TrmB is an alpha-glucoside sensing transcriptional regulator.
#=GF CC   The protein is the transcriptional repressor for gene cluster
#=GF CC   encoding trehalose/maltose ABC transporter in T.litoralis and
#=GF CC   P.furiosus [1]. TrmB has lost its DNA binding domain but
#=GF CC   retained its sugar recognition site. A nonreducing glucosyl
#=GF CC   residue is shared by all substrates bound to TrmB which suggests
#=GF CC   that its a common recognition motif [1].
#=GF SQ   878
#=GS A0A160VTB7_9EURY/125-264  AC A0A160VTB7.1
#=GS A0A1B8UYV1_9BACL/107-240  AC A0A1B8UYV1.1
#=GS A0A151EZ59_9EURY/25-169   AC A0A151EZ59.1
#=GS A0A1Q7MJF6_9CREN/117-252  AC A0A1Q7MJF6.1
#=GS A0A2A3SXJ3_9EURY/123-258  AC A0A2A3SXJ3.1
#=GS W0JS36_9EURY/119-244      AC W0JS36.1
#=GS C6PVN1_9CLOT/113-257      AC C6PVN1.1
#=GS L0JLD6_NATP1/111-347      AC L0JLD6.1
#=GS A0A1I6GUI4_9EURY/110-356  AC A0A1I6GUI4.1
#=GS L9VYS7_9EURY/111-347      AC L9VYS7.1
#=GS A0A0W1R7M3_9EURY/108-355  AC A0A0W1R7M3.1
#=GS W0JNI9_9EURY/108-350      AC W0JNI9.1
#=GS A0A268SM62_9BACL/101-228  AC A0A268SM62.1
#=GS A0A075R5Q0_BRELA/108-230  AC A0A075R5Q0.1
#=GS A0A0W1SMK3_9EURY/110-344  AC A0A0W1SMK3.1
#=GS A0A063ZPB1_9EURY/119-202  AC A0A063ZPB1.1
#=GS S0ALX9_FERAC/111-337      AC S0ALX9.1
#=GS Q7VZI3_BORPE/114-249      AC Q7VZI3.1
#=GS A0A1I4UV56_9PSEU/111-228  AC A0A1I4UV56.1
#=GS A0A221MD93_9BACI/101-239  AC A0A221MD93.1
#=GS A0A2G9NE23_9ARCH/130-271  AC A0A2G9NE23.1
#=GS A0A081EXE3_9EURY/110-345  AC A0A081EXE3.1
#=GS A0A1G9ZHW8_9EURY/119-248  AC A0A1G9ZHW8.1
#=GS A0A1I2P1R9_9EURY/110-354  AC A0A1I2P1R9.1
#=GS M0MBZ6_9EURY/108-349      AC M0MBZ6.1
#=GS A0A0K9YYR1_9BACL/101-228  AC A0A0K9YYR1.1
#=GS A0A0J5GNZ1_9BACI/101-240  AC A0A0J5GNZ1.1
#=GS I8J3T2_9BACI/101-240      AC I8J3T2.1
#=GS A0A1Y4VCX1_9FIRM/112-227  AC A0A1Y4VCX1.1
#=GS D3SRM7_NATMM/108-360      AC D3SRM7.1
#=GS J2HID9_9BACL/107-227      AC J2HID9.1
#=GS A0A0E3S2N7_9EURY/113-249  AC A0A0E3S2N7.1
#=GS A0A1I6L6J8_9EURY/110-353  AC A0A1I6L6J8.1
#=GS A0A225MSH0_9BURK/125-227  AC A0A225MSH0.1
#=GS A0A0Q7APJ7_9BURK/110-234  AC A0A0Q7APJ7.1
#=GS Q5WC51_BACSK/108-234      AC Q5WC51.1
#=GS A0A1G1YQE8_9BACT/88-222   AC A0A1G1YQE8.1
#=GS M0D3A7_9EURY/108-349      AC M0D3A7.1
#=GS D2S0N5_HALTV/107-347      AC D2S0N5.1
#=GS A0A1Q9ULQ9_9ACTN/116-225  AC A0A1Q9ULQ9.1
#=GS D3S141_FERPA/122-252      AC D3S141.1
#=GS M0DJ23_9EURY/110-344      AC M0DJ23.1
#=GS A0A0P0SAH1_9PSEU/114-218  AC A0A0P0SAH1.1
#=GS A0A1D8FVX5_9ACTN/112-264  AC A0A1D8FVX5.1
#=GS R9SMQ3_9EURY/115-277      AC R9SMQ3.1
#=GS C6A540_THESM/110-338      AC C6A540.1
#=GS A0A162SHW4_9CLOT/113-252  AC A0A162SHW4.1
#=GS A0A0N8PWF4_9ARCH/119-251  AC A0A0N8PWF4.1
#=GS R5D7B4_9FIRM/108-210      AC R5D7B4.1
#=GS A0A292YUT4_9PSEU/112-236  AC A0A292YUT4.1
#=GS A0A1H6US47_9EURY/108-347  AC A0A1H6US47.1
#=GS A0A1I7H7P9_9CLOT/104-222  AC A0A1I7H7P9.1
#=GS A0A1I0Q9U5_9EURY/120-266  AC A0A1I0Q9U5.1
#=GS A0A238UMV6_HALVU/110-344  AC A0A238UMV6.1
#=GS A0A2H9LD36_9ARCH/118-251  AC A0A2H9LD36.1
#=GS A0A1I3QU00_9BACL/111-235  AC A0A1I3QU00.1
#=GS A0A218P2B0_THECE/110-336  AC A0A218P2B0.1
#=GS A0A0B0IBQ7_9BACL/101-241  AC A0A0B0IBQ7.1
#=GS M0NP10_9EURY/119-237      AC M0NP10.1
#=GS A0A0H4WQU8_9DELT/106-226  AC A0A0H4WQU8.1
#=GS Q9HIL5_THEAC/80-302       AC Q9HIL5.1
#=GS D2RSR0_HALTV/119-253      AC D2RSR0.1
#=GS J3JI67_9EURY/110-356      AC J3JI67.1
#=GS A0A1Q7LUS6_9CREN/118-266  AC A0A1Q7LUS6.1
#=GS A0A1G9Q578_9EURY/108-349  AC A0A1G9Q578.1
#=GS A0A0M0G4L8_9BACI/109-215  AC A0A0M0G4L8.1
#=GS A0A256ZXL1_9CREN/115-351  AC A0A256ZXL1.1
#=GS A0A1M5SJ66_9EURY/110-351  AC A0A1M5SJ66.1
#=GS A0A1C0ACZ5_9FIRM/104-221  AC A0A1C0ACZ5.1
#=GS A0A268E0I6_9BACI/109-214  AC A0A268E0I6.1
#=GS C0C1U1_9FIRM/108-231      AC C0C1U1.1
#=GS V4GP35_9EURY/110-345      AC V4GP35.1
#=GS A0A1N7DXI1_9EURY/108-351  AC A0A1N7DXI1.1
#=GS M9L7P5_PAEPP/105-230      AC M9L7P5.1
#=GS A0A1H8PXC9_9EURY/108-349  AC A0A1H8PXC9.1
#=GS A0A166SQP3_9EURY/110-353  AC A0A166SQP3.1
#=GS D1MPW4_BACAN/106-230      AC D1MPW4.1
#=GS A0A2A9CQF3_9ACTN/110-217  AC A0A2A9CQF3.1
#=GS A0A250B8F2_9ENTR/101-231  AC A0A250B8F2.1
#=GS Q0W3Q3_METAR/113-257      AC Q0W3Q3.1
#=GS A0A1R1EK73_9BACL/102-248  AC A0A1R1EK73.1
#=GS A0A0M1NM94_9BACI/109-214  AC A0A0M1NM94.1
#=GS A0A117KPP8_9EURY/110-337  AC A0A117KPP8.1
#=GS A0A1Q7MF72_9CREN/118-266  AC A0A1Q7MF72.1
#=GS A0A1H8MQN2_9EURY/110-351  AC A0A1H8MQN2.1
#=GS B8D2J4_HALOH/111-253      AC B8D2J4.1
#=GS M0L971_9EURY/111-347      AC M0L971.1
#=GS A0A135VHI0_9ARCH/18-119   AC A0A135VHI0.1
#=GS E3PX89_ACESD/109-251      AC E3PX89.1
#=GS A0A0Q4Q159_9SPHN/118-240  AC A0A0Q4Q159.1
#=GS A0A1I6L0S8_9EURY/110-353  AC A0A1I6L0S8.1
#=GS A0A0F7FGP0_9CREN/118-341  AC A0A0F7FGP0.1
#=GS A0A1K2G0R5_9ACTN/115-303  AC A0A1K2G0R5.1
#=GS A0A0L6JP20_9FIRM/106-219  AC A0A0L6JP20.1
#=GS A0A0U1L5F2_9FIRM/107-233  AC A0A0U1L5F2.1
#=GS A0A1M3N697_9DELT/110-226  AC A0A1M3N697.1
#=GS A0A2C1L2P2_9BACI/102-228  AC A0A2C1L2P2.1
#=GS Q65MY0_BACLD/109-218      AC Q65MY0.1
#=GS A0A1G5L0B7_9BACL/101-231  AC A0A1G5L0B7.1
#=GS R4W8B2_9EURY/108-358      AC R4W8B2.1
#=GS A0A073KDM4_9BACI/107-235  AC A0A073KDM4.1
#=GS A0A0A5HUZ1_9VIBR/107-249  AC A0A0A5HUZ1.1
#=GS Q8PZX0_METMA/119-275      AC Q8PZX0.1
#=GS A0A0W1RAL8_9EURY/110-356  AC A0A0W1RAL8.1
#=GS A0A285P2C4_9EURY/108-351  AC A0A285P2C4.1
#=GS A0A075LU01_9EURY/111-338  AC A0A075LU01.1
#=GS A0A0A3J838_9BACI/109-232  AC A0A0A3J838.1
#=GS A0A0D2GGT4_9DELT/104-256  AC A0A0D2GGT4.1
#=GS A0A1J4USW8_9ARCH/144-264  AC A0A1J4USW8.1
#=GS A0A2G1WMP2_9EURY/108-351  AC A0A2G1WMP2.1
#=GS A0A1Q8BAF9_9CREN/139-283  AC A0A1Q8BAF9.1
#=GS Q3EVL7_BACTI/101-232      AC Q3EVL7.1
#=GS A0A1I6HNW2_9EURY/110-344  AC A0A1I6HNW2.1
#=GS A0A0U5AC14_9EURY/119-237  AC A0A0U5AC14.1
#=GS A0A0U5H471_9EURY/111-347  AC A0A0U5H471.1
#=GS A0A0A7V1G1_9ARCH/117-250  AC A0A0A7V1G1.1
#=GS A0A285NU54_9EURY/111-355  AC A0A285NU54.1
#=GS A0A209DKA1_9BACL/109-215  AC A0A209DKA1.1
#=GS A0A1H8UX14_9EURY/122-359  AC A0A1H8UX14.1
#=GS A1S0G7_THEPD/113-342      AC A1S0G7.1
#=GS A5UQI6_ROSS1/107-238      AC A5UQI6.1
#=GS A0A081C3G4_9BACT/109-205  AC A0A081C3G4.1
#=GS A0A256ZKX6_9CREN/214-275  AC A0A256ZKX6.1
#=GS A0A1G9VY29_9EURY/111-345  AC A0A1G9VY29.1
#=GS A0A1I0CTG9_9FIRM/105-222  AC A0A1I0CTG9.1
#=GS A0A133VT44_9EURY/115-246  AC A0A133VT44.1
#=GS O30209_ARCFU/85-215       AC O30209.1
#=GS A0A256ZKX6_9CREN/120-217  AC A0A256ZKX6.1
#=GS A0A0B0DCR9_9BACI/101-243  AC A0A0B0DCR9.1
#=GS D5DTF9_BACMQ/101-236      AC D5DTF9.1
#=GS E8M642_9VIBR/107-250      AC E8M642.1
#=GS A8ME09_CALMQ/115-351      AC A8ME09.1
#=GS A0A1W9PG62_9BACT/50-153   AC A0A1W9PG62.1
#=GS A0A1I2SLQ2_9EURY/111-222  AC A0A1I2SLQ2.1
#=GS A0A1Y3A7F8_9EURY/108-351  AC A0A1Y3A7F8.1
#=GS W0I6V4_9EURY/125-264      AC W0I6V4.1
#=GS A0A0W1SVN8_9EURY/119-246  AC A0A0W1SVN8.1
#=GS A0A256IPA9_9EURY/110-352  AC A0A256IPA9.1
#=GS R6J905_9FIRM/104-217      AC R6J905.1
#=GS A0A075LSZ4_9EURY/110-337  AC A0A075LSZ4.1
#=GS A0A256KIL8_9EURY/1-89     AC A0A256KIL8.1
#=GS T0N5W9_9EURY/114-231      AC T0N5W9.1
#=GS A0A2B2B3V0_9BACI/107-232  AC A0A2B2B3V0.1
#=GS A0A1F7KZN1_9BACT/124-260  AC A0A1F7KZN1.1
#=GS A0A1H1FSB8_9EURY/110-348  AC A0A1H1FSB8.1
#=GS A0A1B1N003_9BACL/109-207  AC A0A1B1N003.1
#=GS R6QDN3_9FIRM/104-212      AC R6QDN3.1
#=GS D6TEN5_9CHLR/108-255      AC D6TEN5.1
#=GS U1N3I9_9EURY/117-351      AC U1N3I9.1
#=GS E1RK76_METP4/109-246      AC E1RK76.1
#=GS F7NJL6_9FIRM/109-231      AC F7NJL6.1
#=GS E1IDZ6_9CHLR/108-230      AC E1IDZ6.1
#=GS A0A256XNZ7_9CREN/121-334  AC A0A256XNZ7.1
#=GS M0D3W7_9EURY/110-352      AC M0D3W7.1
#=GS U1N7E7_9EURY/110-354      AC U1N7E7.1
#=GS A0A101DN00_9EURY/125-264  AC A0A101DN00.1
#=GS A0A0J1HNB0_BACCI/109-208  AC A0A0J1HNB0.1
#=GS A0A0D5V4I2_9BURK/142-250  AC A0A0D5V4I2.1
#=GS A0A1H8VMU8_9EURY/114-360  AC A0A1H8VMU8.1
#=GS A0A1I6LTQ7_9EURY/111-345  AC A0A1I6LTQ7.1
#=GS A0A151F737_9EURY/21-116   AC A0A151F737.1
#=GS A0A1Q9PA62_9ARCH/113-202  AC A0A1Q9PA62.1
#=GS V6AVA5_9ARCH/117-253      AC V6AVA5.1
#=GS A0A259UH06_9FIRM/107-233  AC A0A259UH06.1
#=GS A0A1Q7LY02_9CREN/142-253  AC A0A1Q7LY02.1
#=GS A0A1V2A8L1_9BACI/107-232  AC A0A1V2A8L1.1
#=GS A0A133UCX8_9EURY/27-166   AC A0A133UCX8.1
#=GS D2RWM1_HALTV/108-350      AC D2RWM1.1
#=GS A0A2D6K515_9ARCH/130-254  AC A0A2D6K515.1
#=GS U1PGA6_9EURY/110-344      AC U1PGA6.1
#=GS A0A256ZNJ4_9CREN/117-346  AC A0A256ZNJ4.1
#=GS F8D4W6_HALXS/108-350      AC F8D4W6.1
#=GS C3WAF6_FUSMR/107-247      AC C3WAF6.2
#=GS A0A1M5S4C6_9EURY/110-345  AC A0A1M5S4C6.1
#=GS T0N2L1_9EURY/116-351      AC T0N2L1.1
#=GS B7VK56_VIBTL/107-252      AC B7VK56.1
#=GS A0A1Q1FKU4_9EURY/111-345  AC A0A1Q1FKU4.1
#=GS F8AH99_PYRYC/112-343      AC F8AH99.1
#=GS A0A0L6TWC8_9FIRM/104-217  AC A0A0L6TWC8.1
#=GS A0A0J6FUL3_9BACI/101-236  AC A0A0J6FUL3.1
#=GS C5A4D8_THEGJ/112-340      AC C5A4D8.1
#=GS A0A1I0P9B5_9EURY/115-359  AC A0A1I0P9B5.1
#=GS A0A0G1ETQ4_9BACT/122-260  AC A0A0G1ETQ4.1
#=GS A0A0W7YM24_9BACI/110-246  AC A0A0W7YM24.1
#=GS A0A0V8JQR5_9BACI/101-237  AC A0A0V8JQR5.1
#=GS E3EFC1_PAEPS/111-217      AC E3EFC1.1
#=GS C6A1J5_THESM/128-267      AC C6A1J5.1
#=GS F8DBA8_HALXS/119-254      AC F8DBA8.1
#=GS O58509_PYRHO/111-349      AC O58509.1
#=GS K6T6Y9_9CLOT/108-255      AC K6T6Y9.1
#=GS V6DZH0_9EURY/119-247      AC V6DZH0.1
#=GS A0A174WVD3_9CLOT/112-251  AC A0A174WVD3.1
#=GS A0A1J4UUN4_9ARCH/132-253  AC A0A1J4UUN4.1
#=GS A0A1W7CXA1_9ACTN/110-230  AC A0A1W7CXA1.1
#=GS A0A0W1R4D8_9EURY/110-344  AC A0A0W1R4D8.1
#=GS D1AJE9_SEBTE/108-226      AC D1AJE9.1
#=GS A0A1I0NHR7_9EURY/110-355  AC A0A1I0NHR7.1
#=GS A0A074LX77_9BACL/102-237  AC A0A074LX77.1
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#=GS A0A2A5QTM3_9EURY/111-347  AC A0A2A5QTM3.1
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