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Database: Pfam
Entry: Sigma70_ECF
LinkDB: Sigma70_ECF
Original site: Sigma70_ECF 
#=GF ID   Sigma70_ECF
#=GF AC   PF07638.12
#=GF DE   ECF sigma factor
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Blast clustering of Pirellula proteome
#=GF GA   21.10 21.10;
#=GF TC   21.10 21.10;
#=GF NC   21.00 21.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12073657
#=GF RT   The extracytoplasmic function (ECF) sigma factors. 
#=GF RA   Helmann JD; 
#=GF RL   Adv Microb Physiol 2002;46:47-110.
#=GF DR   INTERPRO; IPR011517;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   These proteins are probably RNA polymerase sigma factors
#=GF CC   belonging to the extra-cytoplasmic function (ECF) subfamily [1]
#=GF CC   and show sequence similarity to Pfam:PF04542 and Pfam:PF04545.
#=GF SQ   1191
#=GS A0A2P6C459_9BACT/9-188    AC A0A2P6C459.1
#=GS A0A0Q6YVZ8_9BRAD/4-178    AC A0A0Q6YVZ8.1
#=GS M5SVC9_9PLAN/50-244       AC M5SVC9.1
#=GS A0A0E3Z3F6_9GAMM/14-198   AC A0A0E3Z3F6.1
#=GS F4GVZ1_PUSST/7-168        AC F4GVZ1.1
#=GS A0A368VGV0_9ACTN/7-89     AC A0A368VGV0.1
#=GS W0RFR6_9BACT/2-185        AC W0RFR6.1
#=GS A0A0F3GJC6_9BACT/7-90     AC A0A0F3GJC6.1
#=GS A0A1U7CZH1_9BACT/1-183    AC A0A1U7CZH1.1
#=GS A0A0U2UHF7_9BACL/97-194   AC A0A0U2UHF7.1
#=GS A0A259TU24_9BACT/15-190   AC A0A259TU24.1
#=GS A0A257M1N3_9BACT/5-187    AC A0A257M1N3.1
#=GS E1SSK5_FERBD/5-174        AC E1SSK5.1
#=GS F4QH64_9CAUL/3-119        AC F4QH64.1
#=GS A0A2A2WJI4_9PLAN/1-184    AC A0A2A2WJI4.1
#=GS A0A255QPL4_9PLAN/4-197    AC A0A255QPL4.1
#=GS L0D7L1_SINAD/4-189        AC L0D7L1.1
#=GS A0A271JEA7_9BACT/7-188    AC A0A271JEA7.1
#=GS A0A418NUQ6_9SPHN/38-215   AC A0A418NUQ6.1
#=GS E7GUI7_CLOSY/61-181       AC E7GUI7.1
#=GS Q029D1_SOLUE/1-164        AC Q029D1.1
#=GS A0A1A9HRK6_9BURK/1-184    AC A0A1A9HRK6.1
#=GS A0A1P8WM88_9PLAN/9-177    AC A0A1P8WM88.1
#=GS A3ZRA7_9PLAN/5-200        AC A3ZRA7.1
#=GS U2Y3S4_9SPHN/2-73         AC U2Y3S4.1
#=GS A0A0L6T427_9BURK/1-174    AC A0A0L6T427.1
#=GS A0A192WXX5_9BACT/2-181    AC A0A192WXX5.1
#=GS K8EW44_CARML/7-193        AC K8EW44.2
#=GS A0A2K2FTL5_9SPHN/2-60     AC A0A2K2FTL5.1
#=GS F5ZBY8_ALTNA/10-197       AC F5ZBY8.1
#=GS M5TZ10_9PLAN/1-183        AC M5TZ10.1
#=GS Q5LKI9_RUEPO/47-182       AC Q5LKI9.1
#=GS A0A0U2Z3E2_9ALTE/6-186    AC A0A0U2Z3E2.1
#=GS A0A117RGN2_9ACTN/789-875  AC A0A117RGN2.1
#=GS A0A1L6LAL7_9DELT/3-183    AC A0A1L6LAL7.1
#=GS K6Y5T0_9ALTE/7-182        AC K6Y5T0.1
#=GS W0TL15_9GAMM/8-191        AC W0TL15.1
#=GS A0A143PNZ6_9BACT/33-222   AC A0A143PNZ6.1
#=GS A0A143BJ53_9BACT/1-183    AC A0A143BJ53.1
#=GS A0A2A2W8Y4_9PLAN/1-190    AC A0A2A2W8Y4.1
#=GS A0A411HLG2_9GAMM/9-180    AC A0A411HLG2.1
#=GS A0A2T6DEL0_9BACT/48-241   AC A0A2T6DEL0.1
#=GS A0A2P1PVE1_9GAMM/29-207   AC A0A2P1PVE1.1
#=GS A0A143PLU3_9BACT/2-184    AC A0A143PLU3.1
#=GS A0A370X5R7_9GAMM/4-185    AC A0A370X5R7.1
#=GS A0A099CT54_9GAMM/1-181    AC A0A099CT54.1
#=GS A0A225E6I9_9BACT/5-203    AC A0A225E6I9.1
#=GS A0A1C4AUA3_9BACT/10-179   AC A0A1C4AUA3.1
#=GS A0A143PI93_9BACT/9-189    AC A0A143PI93.1
#=GS Q0C1Q3_HYPNA/6-185        AC Q0C1Q3.1
#=GS A0A1T5KJN8_9GAMM/4-187    AC A0A1T5KJN8.1
#=GS A0A2K8KTN2_9GAMM/9-184    AC A0A2K8KTN2.1
#=GS A0A1Y2PGX9_9FLAO/2-166    AC A0A1Y2PGX9.1
#=GS A0A271JET7_9BACT/2-183    AC A0A271JET7.1
#=GS A0A1V0DFT5_9BACT/6-189    AC A0A1V0DFT5.1
#=GS A0A2Z3GYJ8_9BACT/14-195   AC A0A2Z3GYJ8.1
#=GS A0A225E077_9BACT/4-201    AC A0A225E077.1
#=GS A0A371Q717_9ACTN/80-167   AC A0A371Q717.1
#=GS R6SQ96_9FIRM/3-75         AC R6SQ96.1
#=GS A3ZXL7_9PLAN/3-164        AC A3ZXL7.1
#=GS A0A1I2C0U3_9FIRM/61-160   AC A0A1I2C0U3.1
#=GS A0A1Q8ZSM1_9RHIZ/106-199  AC A0A1Q8ZSM1.1
#=GS A0A142XAS9_9BACT/6-192    AC A0A142XAS9.1
#=GS A0A1B3LK49_9PROT/110-201  AC A0A1B3LK49.1
#=GS A0A1P8WLU8_9PLAN/4-191    AC A0A1P8WLU8.1
#=GS A0A1H6AU22_9BACT/10-191   AC A0A1H6AU22.1
#=GS A0A2A8CX38_9BACT/62-244   AC A0A2A8CX38.1
#=GS A0A2P1PVZ9_9GAMM/1-184    AC A0A2P1PVZ9.1
#=GS A0A2A2W8Q6_9PLAN/27-224   AC A0A2A2W8Q6.1
#=GS A0A271JCY2_9BACT/32-212   AC A0A271JCY2.1
#=GS J9R0K2_RIEAN/2-189        AC J9R0K2.1
#=GS Q02AP7_SOLUE/25-206       AC Q02AP7.1
#=GS A0A2P1PV22_9GAMM/33-212   AC A0A2P1PV22.1
#=GS A6C3B8_9PLAN/1-83         AC A6C3B8.1
#=GS A0A1G6Y2Y8_9GAMM/16-196   AC A0A1G6Y2Y8.1
#=GS F0SMW5_RUBBR/10-203       AC F0SMW5.1
#=GS A0A2U2HNJ9_9BURK/4-187    AC A0A2U2HNJ9.1
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#=GS A0A2L0EHK2_SORCE/22-223   AC A0A2L0EHK2.1
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#=GS A0A261GL16_9GAMM/3-184    AC A0A261GL16.1
#=GS A3ZNA7_9PLAN/12-203       AC A3ZNA7.1
#=GS A0A396KNV2_9FIRM/4-190    AC A0A396KNV2.1
#=GS A0A0R0EDX2_9GAMM/13-178   AC A0A0R0EDX2.1
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#=GS A0A3N4PMQ6_9BACT/98-171   AC A0A3N4PMQ6.1
#=GS A0A143PFQ8_9BACT/1-181    AC A0A143PFQ8.1
#=GS A0A143PNT6_9BACT/1-167    AC A0A143PNT6.1
#=GS A0A2U9T751_9GAMM/6-188    AC A0A2U9T751.1
#=GS A3ZZC0_9PLAN/1-185        AC A3ZZC0.1
#=GS A0A0L0WA63_CLOPU/45-143   AC A0A0L0WA63.1
#=GS A0A1U7CPJ6_9BACT/6-201    AC A0A1U7CPJ6.1
#=GS A0A062U5W7_9RHOB/6-185    AC A0A062U5W7.1
#=GS A0A143PMA3_9BACT/13-196   AC A0A143PMA3.1
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#=GS A0A2N0VE24_9BACT/9-191    AC A0A2N0VE24.1
#=GS F3KRC2_9BURK/125-176      AC F3KRC2.1
#=GS A0A1X6WMB7_9ENTE/414-507  AC A0A1X6WMB7.1
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#=GS A0A192WX65_9BACT/2-184    AC A0A192WX65.1
#=GS A0A411HQK5_9GAMM/12-193   AC A0A411HQK5.1
#=GS A0A2P1PNP8_9GAMM/6-194    AC A0A2P1PNP8.1
#=GS A0A142Y9P6_9PLAN/5-208    AC A0A142Y9P6.1
#=GS A0A167G7V7_9GAMM/10-190   AC A0A167G7V7.1
#=GS A0A495ECB2_9FLAO/113-212  AC A0A495ECB2.1
#=GS A0A0K0XXD1_9GAMM/6-187    AC A0A0K0XXD1.1
#=GS A0A372BW12_9GAMM/4-183    AC A0A372BW12.1
#=GS A0A142WWT0_9PLAN/6-199    AC A0A142WWT0.1
#=GS L0DL66_SINAD/1-184        AC L0DL66.1
#=GS A0A371QNX7_9BACT/23-212   AC A0A371QNX7.1
#=GS L8JFS0_9GAMM/2-188        AC L8JFS0.1
#=GS A0A3D8V871_9GAMM/4-186    AC A0A3D8V871.1
#=GS A0A0R2G523_9LACT/4-178    AC A0A0R2G523.1
#=GS A6CBR8_9PLAN/1-184        AC A6CBR8.1
#=GS A0A2P1PUQ5_9GAMM/11-187   AC A0A2P1PUQ5.1
#=GS A0A0R2A3G6_9LACO/7-197    AC A0A0R2A3G6.1
#=GS A0A2P8KA08_9BURK/125-187  AC A0A2P8KA08.1
#=GS YAGL_ECOLI/160-228        AC P77607.1
#=GS A0A2P1PM26_9GAMM/53-237   AC A0A2P1PM26.1
#=GS A0A0R0CMX4_9GAMM/1-167    AC A0A0R0CMX4.1
#=GS A0A167G448_9GAMM/4-185    AC A0A167G448.1
#=GS A6C732_9PLAN/1-179        AC A6C732.1
#=GS Q5E1V3_ALIF1/4-188        AC Q5E1V3.1
#=GS A0A427C9C0_9GAMM/4-187    AC A0A427C9C0.1
#=GS A0A0N7F3X0_9PSEU/118-200  AC A0A0N7F3X0.1
#=GS A0A1U7CTQ6_9BACT/6-197    AC A0A1U7CTQ6.1
#=GS R6SSH1_9CLOT/1-115        AC R6SSH1.1
#=GS A0A2N0VJB6_9BACT/4-186    AC A0A2N0VJB6.1
#=GS W0RC36_9BACT/21-191       AC W0RC36.1
#=GS A0A192WXU9_9BACT/4-184    AC A0A192WXU9.1
#=GS A0A372DHJ0_9GAMM/4-186    AC A0A372DHJ0.1
#=GS N9UWZ9_9SPHN/18-187       AC N9UWZ9.1
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#=GS A0A2A2GFV5_9BACT/17-200   AC A0A2A2GFV5.1
#=GS V4R8J0_9CAUL/4-164        AC V4R8J0.1
#=GS A6BZ67_9PLAN/25-215       AC A6BZ67.1
#=GS Q1QFK5_NITHX/4-178        AC Q1QFK5.1
#=GS A0A2A2WGV8_9PLAN/35-111   AC A0A2A2WGV8.1
#=GS A0A239MJF9_9BACT/96-267   AC A0A239MJF9.1
#=GS A0A0K0XYC8_9GAMM/4-178    AC A0A0K0XYC8.1
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#=GS A0A432MN54_9BACT/21-211   AC A0A432MN54.1
#=GS A0A0F4NSS3_PSEO7/1-182    AC A0A0F4NSS3.1
#=GS A0A0K0XU72_9GAMM/3-185    AC A0A0K0XU72.1
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#=GS L0DJN8_SINAD/6-204        AC L0DJN8.1
#=GS M5RH53_9PLAN/121-216      AC M5RH53.1
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#=GS Q021X5_SOLUE/4-187        AC Q021X5.1
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#=GS A0A2U1W1J2_9PROT/101-193  AC A0A2U1W1J2.1
#=GS A0A432MNW1_9BACT/14-203   AC A0A432MNW1.1
#=GS M5RVM0_9PLAN/8-192        AC M5RVM0.1
#=GS R6WYT2_9CLOT/42-124       AC R6WYT2.1
#=GS A0A368KXB1_9PLAN/4-198    AC A0A368KXB1.1
#=GS A0A1H1M716_9BACL/101-193  AC A0A1H1M716.1
#=GS A0A255QJQ1_9PLAN/2-185    AC A0A255QJQ1.1
#=GS A0A1V3SB22_9BURK/117-178  AC A0A1V3SB22.1
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#=GS A0A1R4K438_9SPHI/74-154   AC A0A1R4K438.1
#=GS A0A0K8P1H6_IDESA/5-177    AC A0A0K8P1H6.1
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#=GS A0A127F606_STEDE/6-189    AC A0A127F606.1
#=GS A0A192WS49_9BACT/5-173    AC A0A192WS49.1
#=GS A0A142Y569_9PLAN/28-202   AC A0A142Y569.1
#=GS A0A4D6AQP2_9VIRU/8-98     AC A0A4D6AQP2.1
#=GS A0A2T5G067_9SPHN/2-60     AC A0A2T5G067.1
#=GS A0A411HI80_9GAMM/53-223   AC A0A411HI80.1
#=GS A0A0U3EQS2_9BURK/1-178    AC A0A0U3EQS2.1
#=GS H8MGU7_CORCM/18-179       AC H8MGU7.1
#=GS A4A584_9GAMM/139-193      AC A4A584.1
#=GS C5T319_ACIDE/85-171       AC C5T319.1
#=GS I7ZK40_9GAMM/46-221       AC I7ZK40.1
#=GS B9XAK3_PEDPL/7-187        AC B9XAK3.1
#=GS A0A271IUF8_9BACT/10-190   AC A0A271IUF8.1
#=GS A0A0K8P0C2_IDESA/11-180   AC A0A0K8P0C2.1
#=GS A0A143PTQ8_9BACT/4-186    AC A0A143PTQ8.1
#=GS A0A2Z5G6B6_9BACT/5-186    AC A0A2Z5G6B6.1
#=GS A0A368KUN7_9PLAN/26-203   AC A0A368KUN7.1
#=GS A0A1G6VLZ1_9GAMM/12-190   AC A0A1G6VLZ1.1
#=GS A0A147H0Z3_9BURK/132-190  AC A0A147H0Z3.1
#=GS I4AJ64_BERLS/4-191        AC I4AJ64.1
#=GS A0A2A2WGS7_9PLAN/5-189    AC A0A2A2WGS7.1
#=GS Q028D8_SOLUE/24-191       AC Q028D8.1
#=GS A0A091AZU8_9GAMM/4-186    AC A0A091AZU8.1
#=GS A0A0A0M9U7_9GAMM/4-186    AC A0A0A0M9U7.1
#=GS A0A1M5CR60_9BACT/3-185    AC A0A1M5CR60.1
#=GS L0DID4_SINAD/4-194        AC L0DID4.1
#=GS A0A2A2G9W4_9BACT/4-186    AC A0A2A2G9W4.1
#=GS A0A2T6CNS3_9BACT/24-229   AC A0A2T6CNS3.1
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