KEGG   Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_0519500
Entry
PF3D7_0519500     CDS       T00095                                 
Name
(RefSeq) CCR4 domain-containing protein 1, putative
  KO
K12603  CCR4-NOT transcription complex subunit 6 [EC:3.1.13.4]
Organism
pfa  Plasmodium falciparum 3D7
Pathway
pfa03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfa00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PF3D7_0519500
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pfa03019]
    PF3D7_0519500
Enzymes [BR:pfa01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     PF3D7_0519500
Messenger RNA biogenesis [BR:pfa03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     PF3D7_0519500
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     PF3D7_0519500
SSDB
Motif
Pfam: Exo_endo_phos
Other DBs
NCBI-GeneID: 813011
NCBI-ProteinID: XP_001351753
PlasmoDB: PF3D7_0519500
UniProt: Q8I3R5
Position
5:complement(join(801450..802412,802624..809127))
AA seq 2488 aa
MYIYPSTVNRQHCTKKKKKKKTITHFFSYNMENQKGKTNFTFYKKNKSNDCETTYKSEEK
KNKKNVEKNYKVVETYKSSFKVQEENVNVNNNYFLRSINNVDKNYNVIYKKCSNSIGGAT
VVTNSSELHANDEADHIGTDSNILGHKKKKVHQMVKVKMKQDPKEGQDHITYKNKKKSNM
NEMNNNDDNNNDNNNDNNNNDNNDDNNDDNNNDNNDDNNNDNNNDNNNNNDNNNNNNNNN
DSNNNCNNNNDYSSYYYNSDVDVESLIYTQETKKIKNTKNKKNSTDYNNNNVTSKDIKIR
KSNIIELNKLLKENLRIEQNLQKQKKDKIDEVDVYVEEEEDNYEEKKDYQQTGKEISNTK
NMGKEEENSRKKKNKQKEKHNECRDANDKELSVQQRNDQNNINEHYEELSKDTKKEKGKK
KNKDNKNNTENKDNKDNKDNKDNKNNTENKDNKDNKNNIDNKNDKENNNNKGNKENNNNK
GNIENNNNKGNKENNNNKANTDNKNNKDNKEKDKSNITIIEKNASKGKKTKNKKTSQNKK
NDICDNKEIININYISEQNINENHYSLKEKNMQNKKDEYNYSTIETDNNNNNDDINYYNK
NITKNIINNDIKQFVNKNYMEHNYVHNNTYIYNNNNNINNNNNNNNNNNSVPYNYDNSIF
TCDINDDQKNYKDELKNEILKTNKKFVVNNISFNKNINNLKLLKDYNLNDIVNNFEQYKS
MNKHLANDNNNNIDDENMPGNINRGKKKNHNNNKYHNGKDNHMSTTREYNINNNNNNDSI
HNPYFQYTEDYKNINDDIANNQDNKNVKNHLFNYNNHMYKKFVSNQYLENVPNVHVTNNQ
KSDFNNAYGNICSYNYNVNKNILNNNKVTNNNSLNSNNVNIMNSINTMSVNDQNYITNRN
YNNILSNTNMNVSNIPSENNNIGELNKTNNNMNIQNSISKENIHNIMDNTTTYTHPNSVC
NSHYMNNTVIYDTNHIMCNDKVSNMNKCMPNQNVDVYSYGYMPDNIPVNVVYNNFNDTPT
YFPNNNNNNNININHDMVDTNMEEKRPGDVAPHANNHILKFSCQVNNSSKMLSDTLIKTN
KGKVHLNLLTDVKCSTRKNINNNNNNDNNNNNDNNNNNNDECHINIQKDDTKIDNGQKED
NITTNNNNSNCNSEGKDNRHDNKNNDINNNDINNNDINNNDINNNDINNNDINNNDKNLL
ILDKNKKKTSNNKKNICDKDPPNNKKNICEKDTQNNKKNTCEKDTQNNKKNTCEKDPPNN
KKNTCEKDPPNNKKNICEKDPPNNKKNICEKDPLNNNSNSIKKNGQHMKDGDNKLKIEEV
EKKQESNKEDSTTNKITKNNSVNNKDNENIDVDKTLKEKNNSITSTDVIEKFELNKNGLY
TSKNKCENKDEIKSIKLNNSCKNKMNELLEKKKNKNKYLAEIIRCELIWGPTKNKEPITP
VESCELHPVVIIKDQYGHLYDDDEDNENNPIGKTVNIFYRWSRGPPRTVCFFHPQKIACL
QCTVTFRCFCSYECFMKGFDHLHKYYKSNGSINIPSHPNLHTYGVPCSPFDWDNYEKNIE
FDEKHYNSLIQSGLLNEPNKEKWEIINNERNYIPCQKDIGHQIMLETMILDKNSISSGNL
IDSNINPFDQQQNELNESSEYESSSEDDDASQNNQNKMSSVKYSDVQQNEINLMNNQILL
RSYNESLDFNNNKNMYLFKNNNNNNNDNNSSNNNNNNNNINSGTHNVNNTNMVVHMNNST
TNFYNLYDMDNNNNNNVANFHLQNRETDYLPINNTYNTLPISINNKTNNVNNMNSVNNNL
NSHSQSVDIKKCEGGVMYFPEKSLDYSRNSYKYSTNNITKIIDKRIDNFEMTYMNTTHGK
IDSNNNNNNNNNNINGSIMNNHHSTTLGSSNNVGNINDKYVNNFSYSIDNNHIYVNNEIH
FMNNMNIPSSQQKIYNDISIESSKDLNISSNNLLTPYTNNMIDGINIQSTNEARTINTKM
ILMNPLINADNNKIAYKNMLNNKYLNVSSISINDNNYMNETHMNINDDNRNSILPVQENN
FLVKQKKKKKKKKDSKTNNKKKKKKIYVLDDKVWNSIKDPNIYHKIITGCCIPNITVFPN
YNITCFKNYNHTNPQNQFTIMTWNVLAEIYGTIEAFPHCDPYMLAWSYRKTKIIQEILNN
SPDIVCLQEIQNEHFLDFFKPSLGEFGYEGVYKQKTKEIFTSPSGKRRGGKYTIDGCAIF
YNKKKLKFVETYALEFSKLIKEASVLTLPKEIQKNPSLVKRLLKDNVALVILLECIQQYS
KIYDKSEEKQNKKLLIVANTHIVANPEANYVKIWQTQILVKVIEYLKINFIKKYETIPSL
IICGDFNSTPSSAVYQLIYKKTCSRTHEDFNSDKYSLLTDLKLGHNLNLKSAYAISKLLS
QKLNPEEYNNLELYEPLFTNYTSNFIGCLDYIFYNDENLNIISTVNVADENQLIQEAQMY
QLSDCALPSPIRPSDHLPLIAQFEFKVF
NT seq 7467 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatatatatccaagtactgtcaaccgccaacattgcacaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
aaaacaatcacacatttcttctcatataatatggagaatcagaagggtaaaactaacttc
acgttttataaaaagaataaaagtaatgattgtgaaactacatataaatctgaagaaaaa
aaaaataaaaaaaatgtagagaagaattataaagtggttgaaacatataaaagttccttt
aaagttcaggaagaaaatgtaaatgtaaacaacaattattttcttagatctataaataat
gtagacaaaaattacaacgtaatatataaaaaatgttctaattctattgggggagctacg
gttgtaacaaattcatcggaattacatgcaaatgatgaagcagatcatataggaacagat
tcgaatatattaggacataaaaagaagaaagttcatcaaatggtcaaggtgaagatgaag
caagatcctaaggagggacaagaccacatcacttataaaaataagaaaaaaagtaacatg
aacgaaatgaacaataatgatgataataataatgataataataatgataataataataat
gataataatgatgataataatgatgataataataatgataataatgatgataataataat
gataataataatgataataataataataatgataataataataataataataataataat
gatagtaataataattgtaataataataatgattattcttcatattattataatagtgat
gtggatgtagaatctttaatatatacacaagaaaccaagaaaatcaaaaatacgaaaaat
aaaaaaaactcaacagattataacaacaacaatgttacgtcaaaagatattaagataaga
aaaagtaatattatcgaattaaataaattattaaaagaaaatttaaggattgaacagaat
ttacaaaaacaaaaaaaagataaaatagacgaagttgatgtgtatgttgaggaggaagaa
gataattatgaagaaaaaaaggattatcaacaaacaggaaaagaaatatcaaatactaaa
aatatgggaaaggaggaagaaaattcaagaaaaaaaaaaaacaaacaaaaagaaaagcat
aacgaatgcagagatgctaatgataaggaactaagtgtacaacaaagaaatgatcaaaat
aatattaacgaacactatgaggaattatcaaaggataccaagaaagaaaaaggaaaaaaa
aaaaataaagataataaaaataacacagaaaataaggataacaaggataataaagataac
aaggataataaaaataacacagaaaataaagataacaaggataataaaaataacatagat
aataaaaatgataaagaaaacaacaataacaaaggtaacaaagaaaacaacaataacaaa
ggtaacatagaaaacaacaataacaaaggtaacaaagaaaacaacaataacaaggctaac
acagataataaaaataacaaagataacaaggaaaaggataaaagtaatattaccataata
gaaaaaaatgcatcgaaaggcaaaaaaacaaaaaataaaaaaactagccaaaataaaaaa
aatgacatatgtgacaataaagaaattataaatataaattatatatcagaacaaaatata
aatgaaaatcattattcattaaaggaaaaaaatatgcaaaataaaaaagatgaatataat
tatagcaccatagagacagacaataataataataatgatgatattaattattataataaa
aatattacaaagaatattataaataatgatatcaaacaatttgtcaataaaaattatatg
gagcataattatgttcataataatacctacatatataataataataataatattaataat
aataataataataataataataataatagtgttccttataattatgataatagcatcttt
acctgtgatataaatgatgatcaaaagaattataaagatgaattgaaaaatgaaatattg
aaaacaaataaaaaatttgttgtaaataatattagttttaataaaaatataaataaccta
aaactcttgaaagactataatttgaatgacatagttaataattttgaacaatacaaaagt
atgaataaacatttagcaaatgacaataataataatattgatgatgaaaatatgccaggt
aatattaatagggggaaaaaaaaaaatcataataataataaatatcacaatggtaaagat
aatcatatgtctactacaagagagtataatataaacaataataataataatgatagtata
cataatccttatttccaatatacagaagattataaaaatataaatgatgatatagcaaat
aatcaggataataaaaatgttaagaatcatctttttaattataacaatcatatgtataaa
aaatttgtgtctaatcaatatttggaaaatgttcctaatgtacatgtaacaaataatcaa
aagagtgatttcaataatgcttatggaaatatctgttcttataattataatgtaaataaa
aatatattgaataacaataaagtaactaataataatagtctcaattctaataatgttaat
attatgaattcaataaataccatgagtgtgaacgatcaaaattatataacgaatagaaat
tataataatatattgagtaacactaatatgaatgtttctaatatacctagtgaaaataat
aatataggagaacttaataaaacgaataacaatatgaatattcaaaatagcatatcaaaa
gaaaatatacataacattatggataatactactacttatacacatcctaattcagtatgt
aattctcattatatgaataatactgtaatatatgatacaaaccatattatgtgtaatgat
aaggtatctaatatgaataagtgtatgcctaatcaaaatgtagatgtatattcatatgga
tatatgcccgacaacatccctgttaatgttgtatataataattttaacgacacacctaca
tatttcccaaataataataataataataatattaatattaatcatgatatggttgatact
aatatggaagaaaaacgaccaggagatgtggcacctcacgctaataatcatattcttaaa
ttttcttgtcaagttaataattcttcaaaaatgttaagcgacacgttaatcaaaactaac
aaaggaaaggtacatttgaatttattaacggacgtaaaatgctccacaaggaagaatatc
aataataataataacaacgacaacaacaacaataatgataataataataataataatgat
gaatgtcatattaatatacaaaaggatgacaccaaaattgataatggtcaaaaagaggat
aatattactacaaataataataatagtaattgtaatagtgaaggtaaggataatagacat
gataataaaaataatgatataaataacaatgatataaataacaatgatataaataacaat
gatataaataacaatgatataaataacaatgatataaataacaatgataagaatttgtta
atactagataaaaataaaaaaaaaacctcaaataataaaaaaaatatatgtgataaagac
cccccaaacaataaaaaaaatatatgtgaaaaagacacccaaaacaataaaaaaaataca
tgtgaaaaagacacccaaaacaataaaaaaaatacatgtgaaaaagaccccccaaacaat
aaaaaaaatacatgtgaaaaagaccctccaaacaataaaaaaaatatatgtgaaaaagac
cctccaaacaataaaaaaaatatatgtgaaaaagaccccctaaacaacaattccaatagc
ataaaaaagaatggacaacatatgaaggatggtgataataaattaaaaatcgaagaggta
gaaaagaaacaagaaagcaacaaggaagatagtactacaaataaaattactaagaacaat
tcagttaataataaagataatgaaaatattgatgtggataaaaccttaaaagaaaaaaat
aattcaataacatccactgatgtaatagaaaaatttgaattaaataaaaatggtttatat
acatcaaaaaataaatgtgagaataaagatgagattaaaagtataaaactaaataacagt
tgtaagaataaaatgaatgaattattagaaaagaaaaaaaataaaaataaatatttggcg
gaaatcataagatgtgaacttatatggggaccaacaaaaaacaaagaaccaataacacca
gtagaaagttgtgaactgcatcccgttgttattataaaagatcaatatggacatttatat
gatgatgatgaagataatgaaaataatcctataggtaaaacagtaaatattttctataga
tggagtagaggacctccaagaactgtttgtttttttcatccacaaaaaattgcatgttta
caatgtactgtaacgtttagatgtttttgttcctatgaatgttttatgaaaggttttgat
catctacataaatattataaaagtaatggatcaattaatattccatcacatcctaattta
catacgtatggtgttccatgttcaccttttgattgggataattacgaaaaaaatatcgaa
ttcgatgaaaaacattataattccttgatacaatcaggattattaaatgaaccaaataaa
gaaaaatgggaaattataaataatgaaagaaattatattccttgtcaaaaagatattgga
catcaaattatgttagaaactatgatacttgataaaaatagtatctcatctggtaattta
attgattcaaatataaatccctttgatcaacaacaaaatgaattaaatgagagtagtgaa
tatgaatcttcatctgaagatgatgatgcttcacagaataatcaaaacaaaatgtcttct
gtaaaatattcagatgttcaacaaaatgaaattaaccttatgaataatcaaattctttta
agaagttataatgaatctctagactttaataataataaaaatatgtatctattcaaaaat
aataacaacaacaataatgataataatagcagcaacaataataataataataataatatt
aatagtggaactcataatgttaataatacaaacatggtcgtccatatgaacaattcaaca
acaaatttttataacttgtatgacatggataataataataataataatgttgcaaatttt
catttgcaaaatagagaaacagattacttacccataaataatacatataatactcttcct
atcagtatcaacaataaaacaaacaatgtgaataatatgaacagtgttaataataacctg
aatagtcattcccaatccgtggatataaaaaagtgcgaaggaggggtcatgtactttcct
gaaaaaagcctagattattcgcgtaacagttacaaatacagtacgaataatattaccaaa
attattgataaaaggatagacaattttgaaatgacctatatgaacacaacacacggaaaa
atagatagtaacaataataataataataataataataatataaatggaagtattatgaat
aatcatcattccacaactttaggatcatcaaacaatgtgggaaatataaatgataaatat
gtaaataattttagttattcaatagataataatcatatatatgtaaataatgaaatacat
tttatgaacaatatgaatattccatcatctcaacaaaaaatatataatgatataagtata
gaatcaagtaaagatttaaatattagttccaacaatttgcttactccatatacaaacaat
atgattgacggaataaatattcaaagtactaatgaggcaagaacaataaatactaaaatg
atattaatgaatcccttaataaatgcggataataacaaaattgcttataagaatatgtta
aataataaataccttaatgtatcatccataagtattaatgataataattatatgaatgag
actcatatgaatataaatgatgataacagaaatagtatactacctgtacaagaaaacaat
tttttagttaaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagatagcaaaacaaataataaa
aagaagaaaaagaaaatatatgttttagatgataaagtatggaatagtataaaagatcca
aatatatatcataaaataataacaggttgttgtatacccaatataactgtttttccgaat
tataatataacttgttttaaaaattataatcataccaatccacaaaatcaatttactatt
atgacttggaatgtgttagcagaaatttatggaaccattgaagcttttccacattgtgat
ccttatatgttagcatggtcctatagaaaaacaaaaataattcaggagatcttaaataat
agtccggatatagtatgtttgcaggaaatacaaaatgaacactttttggacttcttcaag
ccgtcccttggagagtttgggtatgaaggtgtttacaaacaaaaaacgaaagaaattttc
acgtccccttcaggaaaaaggagaggagggaaatatactatagatggatgtgcaatattt
tataataagaagaaattaaaatttgtagaaacatatgcattagaatttagtaaattaata
aaagaagcttctgttttaacattaccaaaagaaattcaaaagaatccttcgttagttaag
agattattaaaggataatgtagcattagttatattattagaatgtatccagcaatactcg
aaaatatatgataaatcagaagaaaaacaaaataagaaattactaatagttgcaaataca
catattgtagcaaatcctgaagctaattatgtaaaaatatggcaaactcaaatattagtt
aaagtaatcgaatatttaaaaataaattttattaagaaatatgaaacaataccaagttta
attatatgtggagattttaatagtactccttcaagtgctgtatatcaattaatatacaaa
aaaacttgtagtagaacccatgaagactttaactcggataaatatagtttattaacagat
ttaaaattaggtcataatttgaatttgaaatcagcatatgctatatccaaattattatca
caaaaattaaatcctgaagaatataataatttagagttatatgaaccattatttactaat
tatacaagtaattttattggatgtttagattatatattctataatgatgaaaatcttaat
attatttctaccgtaaatgtagcagatgaaaatcaattaatacaagaagcgcaaatgtat
caactttcggactgtgctctaccaagccctataagaccatctgaccatctaccattaata
gcacaatttgagttcaaagtattttga

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (5)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
   PLASMODB (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (15)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system