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Database: Pfam
Entry: CDC27
LinkDB: CDC27
Original site: CDC27 
#=GF ID   CDC27
#=GF AC   PF09507.12
#=GF DE   DNA polymerase subunit Cdc27
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Wood V
#=GF GA   24.50 24.50;
#=GF TC   24.50 24.50;
#=GF NC   24.20 24.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0123
#=GF RN   [1]
#=GF RM   15579205
#=GF RT   Mapping and mutation of the conserved DNA polymerase interaction
#=GF RT   motif (DPIM) located in the C-terminal domain of fission yeast
#=GF RT   DNA polymerase delta subunit Cdc27. 
#=GF RA   Gray FC, Pohler JR, Warbrick E, MacNeill SA; 
#=GF RL   BMC Mol Biol. 2004;5:21.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019038;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This protein forms the C subunit of DNA polymerase delta. It
#=GF CC   carries the essential residues for binding to the Pol1 subunit
#=GF CC   of polymerase alpha, from residues 293-332, which are
#=GF CC   characterised by the motif D--G--VT, referred to as the DPIM
#=GF CC   motif. The first 160 residues of the protein form the minimal
#=GF CC   domain for binding to the B subunit, Cdc1, of polymerase delta,
#=GF CC   the final 10 C-terminal residues, 362-372, being the DNA sliding
#=GF CC   clamp, PCNA, binding motif.
#=GF SQ   1589
#=GS A0A397YT05_BRACM/22-474     AC A0A397YT05.1
#=GS A0A0F8WNB0_9EURO/19-440     AC A0A0F8WNB0.1
#=GS A0A545UU88_9HYPO/141-412    AC A0A545UU88.1
#=GS A0A3Q7X8Z6_URSAR/19-465     AC A0A3Q7X8Z6.1
#=GS A0A556TWX1_BAGYA/1-406      AC A0A556TWX1.1
#=GS A0A4Y7THL6_9AGAR/363-655    AC A0A4Y7THL6.1
#=GS A0A0D0CRY4_9AGAM/19-527     AC A0A0D0CRY4.1
#=GS A0A2J6QUR3_9HELO/17-441     AC A0A2J6QUR3.1
#=GS A0A2P6N713_9EUKA/20-467     AC A0A2P6N713.1
#=GS A0A2H3EE81_ARMGA/19-518     AC A0A2H3EE81.1
#=GS A0A5C3LAM4_9AGAR/19-370     AC A0A5C3LAM4.1
#=GS A0A545UU88_9HYPO/17-242     AC A0A545UU88.1
#=GS A0A2I2ZLJ9_GORGO/19-463     AC A0A2I2ZLJ9.1
#=GS M2TX16_COCH5/19-459         AC M2TX16.1
#=GS A0A2Y9EUB0_PHYMC/19-465     AC A0A2Y9EUB0.1
#=GS A0A2U3UYL0_TURTR/19-465     AC A0A2U3UYL0.1
#=GS I0Z5K8_COCSC/21-442         AC I0Z5K8.1
#=GS A0A4D9AZC5_SALSN/22-137     AC A0A4D9AZC5.1
#=GS J9EYH8_9SPIT/23-520         AC J9EYH8.1
#=GS A1DIN4_NEOFI/1-399          AC A1DIN4.1
#=GS W2Q9I4_PHYPN/106-410        AC W2Q9I4.1
#=GS A0A2B4RP15_STYPI/74-296     AC A0A2B4RP15.1
#=GS A0A0N4VCD5_ENTVE/18-164     AC A0A0N4VCD5.1
#=GS A0A3M6UAR9_9CNID/68-355     AC A0A3M6UAR9.1
#=GS Q2UB13_ASPOR/19-438         AC Q2UB13.1
#=GS F4WT57_ACREC/22-442         AC F4WT57.1
#=GS A0A0B7NKT9_9FUNG/522-899    AC A0A0B7NKT9.1
#=GS W2SAJ1_9EURO/17-502         AC W2SAJ1.1
#=GS A0A0D0AZF6_9AGAM/19-493     AC A0A0D0AZF6.1
#=GS A0A4W5R822_9TELE/18-448     AC A0A4W5R822.1
#=GS A0A6A5M7H8_LUPAL/22-132     AC A0A6A5M7H8.1
#=GS K7J7L2_NASVI/19-448         AC K7J7L2.1
#=GS A0A2P6Q9X3_ROSCH/46-577     AC A0A2P6Q9X3.1
#=GS A0A0U1LKX4_TALIS/18-427     AC A0A0U1LKX4.1
#=GS A0A026W4W2_OOCBI/20-410     AC A0A026W4W2.1
#=GS A0A4Q7JTW0_METCM/22-312     AC A0A4Q7JTW0.1
#=GS A0A1B8AYL7_FUSPO/17-446     AC A0A1B8AYL7.1
#=GS A0A2A2K9R1_9BILA/26-466     AC A0A2A2K9R1.1
#=GS H0V994_CAVPO/19-465         AC H0V994.2
#=GS A0A5N5FQW9_9ROSA/387-901    AC A0A5N5FQW9.1
#=GS A0A439CPJ8_9PEZI/18-443     AC A0A439CPJ8.1
#=GS A0A1D8PDM8_CANAL/20-402     AC A0A1D8PDM8.1
#=GS A0A2S7PPT1_9HELO/17-478     AC A0A2S7PPT1.1
#=GS A0A433PRS8_9FUNG/12-187     AC A0A433PRS8.1
#=GS DPOD3_SCHPO/147-372         AC P30261.1
#=GS A0A409WIN9_PSICY/19-296     AC A0A409WIN9.1
#=GS A0A024FZW8_9STRA/94-382     AC A0A024FZW8.1
#=GS S3DB39_OPHP1/48-526         AC S3DB39.1
#=GS A0A0V0RGK2_9BILA/886-992    AC A0A0V0RGK2.1
#=GS A0A2P8AGA3_9PEZI/108-541    AC A0A2P8AGA3.1
#=GS A0A401KW11_ASPAW/19-447     AC A0A401KW11.1
#=GS Q2H0X8_CHAGB/17-415         AC Q2H0X8.1
#=GS Q5QNL2_ORYSJ/26-511         AC Q5QNL2.1
#=GS W9W5Y3_9EURO/18-514         AC W9W5Y3.1
#=GS A0A2A2JTM9_9BILA/32-467     AC A0A2A2JTM9.1
#=GS A0A1E4TZ52_PACTA/22-436     AC A0A1E4TZ52.1
#=GS F7BL41_MACMU/19-466         AC F7BL41.1
#=GS A0A2R6S4Y7_9APHY/18-577     AC A0A2R6S4Y7.1
#=GS A0A0J1AW58_9TREE/204-440    AC A0A0J1AW58.1
#=GS A0A672JU54_SALFA/18-450     AC A0A672JU54.1
#=GS A0A1S4A0S5_TOBAC/1-492      AC A0A1S4A0S5.1
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#=GS A0A319ET85_ASPSB/19-441     AC A0A319ET85.1
#=GS A0A162I600_9EURO/17-506     AC A0A162I600.1
#=GS A0A4U6UFI2_SETVI/26-517     AC A0A4U6UFI2.1
#=GS A0A364N9H3_9PLEO/1-437      AC A0A364N9H3.1
#=GS A0A0L0SKR1_ALLM3/16-370     AC A0A0L0SKR1.1
#=GS A0A2N1JDQ3_9BASI/16-171     AC A0A2N1JDQ3.1
#=GS A0A0C9LU79_9FUNG/2-263      AC A0A0C9LU79.1
#=GS W5M2S8_LEPOC/18-473         AC W5M2S8.1
#=GS A0A4S4LG37_9AGAM/19-519     AC A0A4S4LG37.1
#=GS A0A0M3JXR2_ANISI/57-243     AC A0A0M3JXR2.1
#=GS A0A433CX36_9FUNG/1-361      AC A0A433CX36.1
#=GS G1MFJ5_AILME/19-463         AC G1MFJ5.1
#=GS A0A6G0ZE22_APHCR/14-455     AC A0A6G0ZE22.1
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#=GS A0A3M9Y8D8_9PEZI/17-443     AC A0A3M9Y8D8.1
#=GS B8NPX4_ASPFN/365-421        AC B8NPX4.1
#=GS A0A2K5Z7V4_MANLE/1-427      AC A0A2K5Z7V4.1
#=GS A0A067R9B5_ZOONE/22-483     AC A0A067R9B5.1
#=GS A0A5M6BNU8_9TREE/228-539    AC A0A5M6BNU8.1
#=GS S3CGH6_GLAL2/17-454         AC S3CGH6.1
#=GS F1Q825_DANRE/18-457         AC F1Q825.1
#=GS A0A328D0B2_9ASTE/22-503     AC A0A328D0B2.1
#=GS A0A084FXJ9_PSEDA/1-414      AC A0A084FXJ9.1
#=GS A0A5D3AEG9_GOSMU/22-537     AC A0A5D3AEG9.1
#=GS A0A1S2XGH6_CICAR/22-527     AC A0A1S2XGH6.1
#=GS A0A067CY16_SAPPC/107-359    AC A0A067CY16.1
#=GS A0A1Q3AYB6_CEPFO/22-525     AC A0A1Q3AYB6.1
#=GS A0A284R5A7_ARMOS/22-519     AC A0A284R5A7.1
#=GS B7PBC7_IXOSC/9-304          AC B7PBC7.1
#=GS S4RI39_PETMA/24-481         AC S4RI39.1
#=GS H9JA34_BOMMO/21-459         AC H9JA34.1
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#=GS A0A5N6NWW1_9ASTR/22-484     AC A0A5N6NWW1.1
#=GS A0A1L9VX30_ASPGL/18-454     AC A0A1L9VX30.1
#=GS R0JF69_ANAPL/1-427          AC R0JF69.1
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#=GS A0A2K2CAJ7_POPTR/22-510     AC A0A2K2CAJ7.1
#=GS C3ZD95_BRAFL/23-497         AC C3ZD95.1
#=GS A0A101MCE7_9EURO/3-348      AC A0A101MCE7.1
#=GS A0A0L7QXG5_9HYME/1-355      AC A0A0L7QXG5.1
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#=GS A0A2G2YIS0_CAPAN/60-557     AC A0A2G2YIS0.1
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#=GS A0A3Q0H469_ALLSI/10-453     AC A0A3Q0H469.1
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#=GS J3NNW8_GAET3/20-452         AC J3NNW8.1
#=GS A0A5C3EES1_9BASI/20-555     AC A0A5C3EES1.1
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#=GS H2Q4E3_PANTR/1-427          AC H2Q4E3.2
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#=GS L8I5W9_9CETA/33-478         AC L8I5W9.1
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#=GS A0A0V1MPX4_9BILA/18-125     AC A0A0V1MPX4.1
#=GS C4JUQ7_UNCRE/1-407          AC C4JUQ7.1
#=GS DPOD3_CHICK/19-461          AC Q5ZK28.2
#=GS A0A2I2GED1_9EURO/19-441     AC A0A2I2GED1.1
#=GS A0A2N5VXY8_9BASI/42-142     AC A0A2N5VXY8.1
#=GS A0A1U8MAT7_GOSHI/22-535     AC A0A1U8MAT7.1
#=GS A0A2T0FMK7_9ASCO/15-229     AC A0A2T0FMK7.1
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#=GS A0A151PJ33_ALLMI/19-407     AC A0A151PJ33.1
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#=GS A0A1J8QQZ2_9AGAM/4-299      AC A0A1J8QQZ2.1
#=GS A0A1F7ZLD8_9EURO/19-450     AC A0A1F7ZLD8.1
#=GS A0A1V6QP10_9EURO/16-423     AC A0A1V6QP10.1
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#=GS A0A067P613_PLEOS/19-389     AC A0A067P613.1
#=GS A0A1U7QHF8_MESAU/19-462     AC A0A1U7QHF8.1
#=GS M1WBT4_CLAP2/234-431        AC M1WBT4.1
#=GS B8MR13_TALSN/18-269         AC B8MR13.1
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