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Database: Pfam
Entry: Caps_synth
LinkDB: Caps_synth
Original site: Caps_synth 
#=GF ID   Caps_synth
#=GF AC   PF05704.12
#=GF DE   Capsular polysaccharide synthesis protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_7575 (release 8.0)
#=GF GA   24.50 24.50;
#=GF TC   24.50 24.50;
#=GF NC   24.40 24.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11179285
#=GF RT   Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae type 4,
#=GF RT   6B, 8, and 18C capsular polysaccharide gene clusters. 
#=GF RA   Jiang SM, Wang L, Reeves PR; 
#=GF RL   Infect Immun 2001;69:1244-1255.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9838125
#=GF RT   Molecular structure of the gene cluster responsible for the
#=GF RT   synthesis of the polysaccharide capsule of Streptococcus
#=GF RT   pneumoniae type 33F. 
#=GF RA   Llull D, Lopez R, Garcia E, Munoz R; 
#=GF RL   Biochim Biophys Acta 1998;1443:217-224.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10688204
#=GF RT   The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter
#=GF RT   jejuni reveals hypervariable sequences. 
#=GF RA   Parkhill J, Wren BW, Mungall K, Ketley JM, Churcher C, Basham D,
#=GF RA   Chillingworth T, Davies RM, Feltwell T, Holroyd S, Jagels K,
#=GF RA   Karlyshev AV, Moule S, Pallen MJ, Penn CW, Quail MA, Rajandream
#=GF RA   MA, Rutherford KM, van Vliet AH, Whitehead S, Barrell BG; 
#=GF RL   Nature 2000;403:665-668.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   7752885
#=GF RT   Region II of the Haemophilus influenzae type be capsulation
#=GF RT   locus is involved in serotype-specific polysaccharide synthesis. 
#=GF RA   Van Eldere J, Brophy L, Loynds B, Celis P, Hancock I, Carman S,
#=GF RA   Kroll JS, Moxon ER; 
#=GF RL   Mol Microbiol 1995;15:107-118.
#=GF RN   [5]
#=GF RM   10094675
#=GF RT   acs1 of Haemophilus influenzae type a capsulation locus region
#=GF RT   II encodes a bifunctional ribulose 5-phosphate reductase-
#=GF RT   CDP-ribitol pyrophosphorylase. 
#=GF RA   Follens A, Veiga-da-Cunha M, Merckx R, van Schaftingen E, van
#=GF RA   Eldere J; 
#=GF RL   J Bacteriol 1999;181:2001-2007.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008441;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several capsular polysaccharide
#=GF CC   proteins. Capsular polysaccharide (CPS) is a major virulence
#=GF CC   factor in Streptococcus pneumoniae [1]. 
#=GF SQ   746
#=GS R5ZK69_9CLOT/29-315         AC R5ZK69.1
#=GS A0A246ADT4_9SPHI/1-140      AC A0A246ADT4.1
#=GS A0A1L9UUQ3_9EURO/16-212     AC A0A1L9UUQ3.1
#=GS A0A0M8KEX6_9BACT/20-294     AC A0A0M8KEX6.1
#=GS R7G843_9PROT/521-793        AC R7G843.1
#=GS A0A167W6M3_9HOMO/75-257     AC A0A167W6M3.1
#=GS A0A094GXP9_9PEZI/52-243     AC A0A094GXP9.1
#=GS A0A147FUT7_9GAMM/41-276     AC A0A147FUT7.1
#=GS A0A0M0K5D5_9EUKA/99-241     AC A0A0M0K5D5.1
#=GS E6W7J3_PANSA/16-259         AC E6W7J3.1
#=GS W9CI99_9HELO/29-222         AC W9CI99.1
#=GS A0A2A3K0S2_9RHOB/63-228     AC A0A2A3K0S2.1
#=GS R6QJ08_9CLOT/2-200          AC R6QJ08.1
#=GS A0A1E7R3C4_9GAMM/10-259     AC A0A1E7R3C4.1
#=GS A0A1Q9EC93_SYMMI/2-259      AC A0A1Q9EC93.1
#=GS A0A194V508_9PEZI/28-211     AC A0A194V508.1
#=GS A0A094I1E0_9PEZI/20-209     AC A0A094I1E0.1
#=GS A0A0D6N704_9PROT/50-232     AC A0A0D6N704.1
#=GS R6ZZQ9_9FIRM/1-120          AC R6ZZQ9.1
#=GS A0A1Q9C657_SYMMI/173-349    AC A0A1Q9C657.1
#=GS R5ZBB7_9CLOT/22-307         AC R5ZBB7.1
#=GS E1SCB4_PANVC/39-202         AC E1SCB4.1
#=GS A0A139HXT1_9PEZI/8-189      AC A0A139HXT1.1
#=GS A0A1Z9Z2L8_9GAMM/3-220      AC A0A1Z9Z2L8.1
#=GS R5EFA8_9FIRM/1-115          AC R5EFA8.1
#=GS A0A0A7IA00_9BIFI/35-310     AC A0A0A7IA00.1
#=GS A0A135LSY5_PENPA/19-204     AC A0A135LSY5.1
#=GS R5NCF8_9BACT/38-315         AC R5NCF8.1
#=GS A0A0Q6AQY4_9FLAO/1-195      AC A0A0Q6AQY4.1
#=GS A0A096P8T9_OSTTA/54-189     AC A0A096P8T9.1
#=GS A0A1Q8S6B9_9PEZI/17-216     AC A0A1Q8S6B9.1
#=GS A0A1I6VAL7_9SPHI/21-140     AC A0A1I6VAL7.1
#=GS G3XTJ3_ASPNA/17-212         AC G3XTJ3.1
#=GS A0A165DA79_EXIGL/25-211     AC A0A165DA79.1
#=GS A0A0H1BGT2_9EURO/9-226      AC A0A0H1BGT2.1
#=GS A0A2H3IC45_9EURO/41-259     AC A0A2H3IC45.1
#=GS E1M893_9STRE/1-221          AC E1M893.1
#=GS A0A1V9D9W8_9GAMM/30-202     AC A0A1V9D9W8.1
#=GS N8VYI5_9GAMM/5-232          AC N8VYI5.1
#=GS A0A0R1PFG5_9LACO/24-303     AC A0A0R1PFG5.1
#=GS A0A0R2D2B6_9LACO/39-304     AC A0A0R2D2B6.1
#=GS A0A0L1HIU3_9PLEO/5-185      AC A0A0L1HIU3.1
#=GS A0A0D1YLY9_9PEZI/43-224     AC A0A0D1YLY9.1
#=GS A0A261G548_9BIFI/1-235      AC A0A261G548.1
#=GS A0A1M4Z3D1_9BURK/47-206     AC A0A1M4Z3D1.1
#=GS C9RPC4_FIBSS/1-139          AC C9RPC4.1
#=GS C7ZDU0_NECH7/11-211         AC C7ZDU0.1
#=GS A0A087DSZ2_9BIFI/44-326     AC A0A087DSZ2.1
#=GS A0A222DZR8_9RHOB/2-151      AC A0A222DZR8.1
#=GS D4MVZ4_ANAHA/46-326         AC D4MVZ4.1
#=GS I3D604_HAEPH/36-327         AC I3D604.1
#=GS A0A0J1H1L6_9GAMM/3-175      AC A0A0J1H1L6.1
#=GS A0A1I2J112_9ACTN/362-613    AC A0A1I2J112.1
#=GS A0A166YPT2_9PEZI/11-207     AC A0A166YPT2.1
#=GS A0A174GQQ1_9CLOT/1-140      AC A0A174GQQ1.1
#=GS B8M658_TALSN/5-206          AC B8M658.1
#=GS R6XEQ9_9BACT/1-189          AC R6XEQ9.1
#=GS D7CS04_TRURR/2-140          AC D7CS04.1
#=GS A0A174I0L9_9BACT/1-198      AC A0A174I0L9.1
#=GS C1G044_PARBD/5-207          AC C1G044.2
#=GS A0A084H4H6_BACID/1-167      AC A0A084H4H6.1
#=GS A0A0G0AMM6_TRIHA/6-205      AC A0A0G0AMM6.1
#=GS A0A0H1BH39_9EURO/24-205     AC A0A0H1BH39.1
#=GS A0A2C5XV00_9HYPO/24-210     AC A0A2C5XV00.1
#=GS C4IDA9_CLOBU/22-310         AC C4IDA9.1
#=GS A0A149R016_9PROT/51-119     AC A0A149R016.1
#=GS A0A2A4W3L6_9PROT/19-175     AC A0A2A4W3L6.1
#=GS A0A1T4LIT5_9SPIO/1-141      AC A0A1T4LIT5.1
#=GS A0A231MMX6_9EURO/20-216     AC A0A231MMX6.1
#=GS A0A162IVA4_9HYPO/17-236     AC A0A162IVA4.1
#=GS C7DD67_9RHOB/1-175          AC C7DD67.1
#=GS R6ZCG1_9CLOT/2-139          AC R6ZCG1.1
#=GS W9VGB6_9EURO/14-244         AC W9VGB6.1
#=GS A0A1C1X4W9_9PEZI/13-231     AC A0A1C1X4W9.1
#=GS S5ZXH7_9SPIO/38-311         AC S5ZXH7.1
#=GS A0A0A2E023_9PORP/21-307     AC A0A0A2E023.1
#=GS C9R202_AGGAD/43-329         AC C9R202.1
#=GS A0A1Y4NL82_9FIRM/31-300     AC A0A1Y4NL82.1
#=GS A0A167AWG5_9PEZI/4-225      AC A0A167AWG5.1
#=GS A0A2A2AIX9_9BURK/69-215     AC A0A2A2AIX9.1
#=GS A0A0N0RTI5_9HYPO/18-219     AC A0A0N0RTI5.1
#=GS A0A1X7L3G7_9SPHI/8-132      AC A0A1X7L3G7.1
#=GS A0A1A6FQZ9_9RHIZ/7-151      AC A0A1A6FQZ9.1
#=GS A0A066Y2K2_COLSU/14-233     AC A0A066Y2K2.1
#=GS A0A165DAB0_EXIGL/21-211     AC A0A165DAB0.1
#=GS R6MI47_9BACE/1-144          AC R6MI47.1
#=GS A0A0U1Q334_9BURK/48-169     AC A0A0U1Q334.1
#=GS A1TIT5_ACIAC/34-191         AC A1TIT5.1
#=GS A0A286ACJ0_9SPHI/1-142      AC A0A286ACJ0.1
#=GS R5ARK5_9FIRM/1-137          AC R5ARK5.1
#=GS A0A1I4EYR3_9BACL/1-212      AC A0A1I4EYR3.1
#=GS A0A0C2VY58_9BACL/1-173      AC A0A0C2VY58.1
#=GS A0A0Q5LF24_9BURK/60-273     AC A0A0Q5LF24.1
#=GS A0A1H9EJ70_9FIRM/38-313     AC A0A1H9EJ70.1
#=GS A0A0A2HZ07_PENEN/16-206     AC A0A0A2HZ07.1
#=GS A0A239RLG9_9BACT/4-277      AC A0A239RLG9.1
#=GS A0A167I8P2_9HYPO/17-209     AC A0A167I8P2.1
#=GS R5E0K9_9FIRM/227-501        AC R5E0K9.1
#=GS A0A229VUF8_9BIFI/1-198      AC A0A229VUF8.1
#=GS R5LAG6_9FIRM/36-313         AC R5LAG6.1
#=GS A0A1B8GLI5_9PEZI/23-208     AC A0A1B8GLI5.1
#=GS A0A0F9X5T8_TRIHA/14-263     AC A0A0F9X5T8.1
#=GS A0A010RBH1_9PEZI/11-221     AC A0A010RBH1.1
#=GS A0A179V058_BLAGS/23-205     AC A0A179V058.1
#=GS A0A1Q9C6C6_SYMMI/4-57       AC A0A1Q9C6C6.1
#=GS B8DWN8_BIFA0/103-348        AC B8DWN8.1
#=GS A0A194WDM8_9PEZI/29-211     AC A0A194WDM8.1
#=GS A0A248TPI8_9BACI/1-209      AC A0A248TPI8.1
#=GS A0A1U7PZM7_9FLAO/31-302     AC A0A1U7PZM7.1
#=GS A0A1J9P2K1_9EURO/5-205      AC A0A1J9P2K1.1
#=GS A0A2C6AB90_9HYPO/33-212     AC A0A2C6AB90.1
#=GS A0A1Y4D7B4_9BACT/1-140      AC A0A1Y4D7B4.1
#=GS Q40712_OSEVJ/2772-2895      AC Q40712.1
#=GS Q0AKZ7_MARMM/1-245          AC Q0AKZ7.1
#=GS R6MK64_9BACE/50-333         AC R6MK64.1
#=GS V2T7Y2_9GAMM/35-203         AC V2T7Y2.1
#=GS A0A261G7Z5_9BIFI/45-307     AC A0A261G7Z5.1
#=GS A0A235E1F0_9SPHI/13-304     AC A0A235E1F0.1
#=GS A0A0A0C934_9CELL/31-274     AC A0A0A0C934.1
#=GS U2BJI5_9CLOT/35-303         AC U2BJI5.1
#=GS A0A261GAU4_9BIFI/3-286      AC A0A261GAU4.1
#=GS A0A1L2ZN44_9MICC/69-179     AC A0A1L2ZN44.1
#=GS A0A263HDT6_9PAST/1-66       AC A0A263HDT6.1
#=GS A0A0P7BBR0_9HYPO/23-230     AC A0A0P7BBR0.1
#=GS W6R626_9RHIZ/8-263          AC W6R626.1
#=GS A0A084IMD7_9GAMM/55-274     AC A0A084IMD7.1
#=GS A0A0D2JCB3_9EURO/30-209     AC A0A0D2JCB3.1
#=GS A0A1V1SZC9_9FUNG/35-235     AC A0A1V1SZC9.1
#=GS W9J754_FUSOX/40-257         AC W9J754.1
#=GS G9NBK9_HYPVG/11-238         AC G9NBK9.1
#=GS A0A1Q9E1G7_SYMMI/402-673    AC A0A1Q9E1G7.1
#=GS A0A1B8CBI2_9PEZI/15-208     AC A0A1B8CBI2.1
#=GS E7NQN2_TREPH/43-311         AC E7NQN2.1
#=GS M7U3K5_BOTF1/23-210         AC M7U3K5.1
#=GS A0A1G9H7L9_9CLOT/1-112      AC A0A1G9H7L9.1
#=GS A0A255TG49_9BACT/24-112     AC A0A255TG49.1
#=GS A0A0J8RGV9_COCIT/28-196     AC A0A0J8RGV9.1
#=GS A0A0R1XET0_9LACO/1-144      AC A0A0R1XET0.1
#=GS A0A1T4MF71_9SPIO/10-299     AC A0A1T4MF71.1
#=GS C7ZIR9_NECH7/24-216         AC C7ZIR9.1
#=GS A0A0B0D008_9BACI/2-147      AC A0A0B0D008.1
#=GS R1E689_EMIHU/35-286         AC R1E689.1
#=GS A0A166Y590_9PEZI/6-207      AC A0A166Y590.1
#=GS A0A239XXH9_9SPHI/28-258     AC A0A239XXH9.1
#=GS A0A286BRZ3_9ENTR/18-282     AC A0A286BRZ3.1
#=GS A0A095S987_9GAMM/2-154      AC A0A095S987.1
#=GS A2Q7G1_ASPNC/17-212         AC A2Q7G1.1
#=GS N4VKV8_COLOR/27-249         AC N4VKV8.1
#=GS A0A0E9NP82_9ASCO/558-606    AC A0A0E9NP82.1
#=GS A0A1T5E5E7_9SPHI/1-169      AC A0A1T5E5E7.1
#=GS A0A1H4EVA9_9BACT/2-245      AC A0A1H4EVA9.1
#=GS R5M7G7_9BACE/11-293         AC R5M7G7.1
#=GS J3K4G3_COCIM/61-263         AC J3K4G3.2
#=GS F0F886_9BACT/43-314         AC F0F886.1
#=GS A0A261GAW9_9BIFI/29-298     AC A0A261GAW9.1
#=GS A0A0C3GM17_9PEZI/20-247     AC A0A0C3GM17.1
#=GS N9F260_ACIHA/5-231          AC N9F260.1
#=GS A0A1Q9JDN7_9FIRM/244-517    AC A0A1Q9JDN7.1
#=GS A0A1S9CT82_9FIRM/147-421    AC A0A1S9CT82.1
#=GS E3RRX9_PYRTT/7-207          AC E3RRX9.1
#=GS A0A085Z2L9_9FLAO/2-248      AC A0A085Z2L9.1
#=GS A0A0N1WJF0_AGGAP/21-297     AC A0A0N1WJF0.1
#=GS A0A179I157_9HYPO/26-209     AC A0A179I157.1
#=GS E9DCM8_COCPS/12-217         AC E9DCM8.1
#=GS A0A1Q5QC91_9EURO/16-219     AC A0A1Q5QC91.1
#=GS A0A1I3P2K8_9PLAN/173-310    AC A0A1I3P2K8.1
#=GS A0A066WXA9_COLSU/33-251     AC A0A066WXA9.1
#=GS A0A0A8H2G4_9PROT/429-728    AC A0A0A8H2G4.1
#=GS M2ZSR1_PSEFD/21-223         AC M2ZSR1.1
#=GS A0A2A2EM24_9BIFI/25-293     AC A0A2A2EM24.1
#=GS A0A2B7Z180_9EURO/11-206     AC A0A2B7Z180.1
#=GS A0A1V8T5V7_9PEZI/14-211     AC A0A1V8T5V7.1
#=GS R6A9U8_9CLOT/50-317         AC R6A9U8.1
#=GS A8YX79_LACH4/17-305         AC A8YX79.1
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