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Database: Pfam
Entry: Caps_synth
LinkDB: Caps_synth
Original site: Caps_synth 
#=GF ID   Caps_synth
#=GF AC   PF05704.18
#=GF DE   Capsular polysaccharide synthesis protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_7575 (release 8.0)
#=GF GA   24.50 24.50;
#=GF TC   24.50 24.50;
#=GF NC   24.40 24.40;
#=GF BM   hmmbuild  HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -E 1000 -Z 81514348 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0110
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11179285
#=GF RT   Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae type 4,
#=GF RT   6B, 8, and 18C capsular polysaccharide gene clusters. 
#=GF RA   Jiang SM, Wang L, Reeves PR; 
#=GF RL   Infect Immun 2001;69:1244-1255.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9838125
#=GF RT   Molecular structure of the gene cluster responsible for the
#=GF RT   synthesis of the polysaccharide capsule of Streptococcus
#=GF RT   pneumoniae type 33F. 
#=GF RA   Llull D, Lopez R, Garcia E, Munoz R; 
#=GF RL   Biochim Biophys Acta 1998;1443:217-224.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10688204
#=GF RT   The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter
#=GF RT   jejuni reveals hypervariable sequences. 
#=GF RA   Parkhill J, Wren BW, Mungall K, Ketley JM, Churcher C, Basham D,
#=GF RA   Chillingworth T, Davies RM, Feltwell T, Holroyd S, Jagels K,
#=GF RA   Karlyshev AV, Moule S, Pallen MJ, Penn CW, Quail MA, Rajandream
#=GF RA   MA, Rutherford KM, van Vliet AH, Whitehead S, Barrell BG; 
#=GF RL   Nature 2000;403:665-668.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   7752885
#=GF RT   Region II of the Haemophilus influenzae type be capsulation
#=GF RT   locus is involved in serotype-specific polysaccharide synthesis. 
#=GF RA   Van Eldere J, Brophy L, Loynds B, Celis P, Hancock I, Carman S,
#=GF RA   Kroll JS, Moxon ER; 
#=GF RL   Mol Microbiol 1995;15:107-118.
#=GF RN   [5]
#=GF RM   10094675
#=GF RT   acs1 of Haemophilus influenzae type a capsulation locus region
#=GF RT   II encodes a bifunctional ribulose 5-phosphate reductase-
#=GF RT   CDP-ribitol pyrophosphorylase. 
#=GF RA   Follens A, Veiga-da-Cunha M, Merckx R, van Schaftingen E, van
#=GF RA   Eldere J; 
#=GF RL   J Bacteriol 1999;181:2001-2007.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008441;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several capsular polysaccharide
#=GF CC   proteins. Capsular polysaccharide (CPS) is a major virulence
#=GF CC   factor in Streptococcus pneumoniae [1]. 
#=GF SQ   1076
#=GS A0A8H5QFV3_GIBSU/18-203     AC A0A8H5QFV3.1
#=GS A0A5N5RJQ4_9BIFI/1-96       AC A0A5N5RJQ4.1
#=GS A0A543EDM4_9MICO/70-304     AC A0A543EDM4.1
#=GS A0A812QTJ6_SYMPI/29-257     AC A0A812QTJ6.1
#=GS A0A0C9UBH8_SPHS4/20-135     AC A0A0C9UBH8.1
#=GS A0A6L5YYY3_9RHOB/14-168     AC A0A6L5YYY3.1
#=GS A0A8T4K304_9FIRM/25-297     AC A0A8T4K304.1
#=GS A0A0M2HA27_9MICO/68-302     AC A0A0M2HA27.1
#=GS A0A0D2XIM8_FUSOF/19-242     AC A0A0D2XIM8.1
#=GS A0A1J9P2K1_9EURO/5-205      AC A0A1J9P2K1.1
#=GS A0A849L6N3_9RHOB/70-118     AC A0A849L6N3.1
#=GS A0A931C7F4_9ACTN/390-640    AC A0A931C7F4.1
#=GS A0A0R1PFG5_9LACO/24-303     AC A0A0R1PFG5.1
#=GS N4U8M3_FUSC1/21-241         AC N4U8M3.1
#=GS A0A5B8IXY4_9RHOB/1-152      AC A0A5B8IXY4.1
#=GS A0A1Q9ECZ7_SYMMI/552-725    AC A0A1Q9ECZ7.1
#=GS A0A0R1YRZ3_9LACO/37-309     AC A0A0R1YRZ3.1
#=GS W3XKC0_PESFW/9-205          AC W3XKC0.1
#=GS A0A1V8T5V7_9PEZI/14-211     AC A0A1V8T5V7.1
#=GS A0A1R3R5U4_ASPC5/16-209     AC A0A1R3R5U4.1
#=GS A0A8H4TW25_9HYPO/20-232     AC A0A8H4TW25.1
#=GS A0A177CL18_9PLEO/22-207     AC A0A177CL18.1
#=GS A0A0M0JK83_9EUKA/154-311    AC A0A0M0JK83.1
#=GS A0A395NAA6_TRIAR/11-204     AC A0A395NAA6.1
#=GS A0A261G7Z5_9BIFI/45-307     AC A0A261G7Z5.1
#=GS W3WL03_PESFW/20-208         AC W3WL03.1
#=GS A0A7S8DR63_FUSPS/15-190     AC A0A7S8DR63.1
#=GS A0A0A2L4B7_PENIT/19-205     AC A0A0A2L4B7.1
#=GS A0A1H5YPE3_9FIRM/36-309     AC A0A1H5YPE3.1
#=GS A0A974YI01_9HYPH/22-284     AC A0A974YI01.1
#=GS A0A2P5HVJ0_9PEZI/14-229     AC A0A2P5HVJ0.1
#=GS A0A2S4LAX4_9HYPO/10-201     AC A0A2S4LAX4.1
#=GS A0A8J2SFE8_9STRA/54-235     AC A0A8J2SFE8.1
#=GS A0A812I8E1_9DINO/212-389    AC A0A812I8E1.1
#=GS A0A5D0RKP8_9RHOB/91-319     AC A0A5D0RKP8.1
#=GS A0A8H8UHW3_9HELO/75-261     AC A0A8H8UHW3.1
#=GS A0A7H0HCH0_9BURK/40-196     AC A0A7H0HCH0.1
#=GS A0A2T3YT60_9HYPO/22-210     AC A0A2T3YT60.1
#=GS A0A2P5HVQ8_9PEZI/19-211     AC A0A2P5HVQ8.1
#=GS A0A1I4C4U7_9FIRM/32-308     AC A0A1I4C4U7.1
#=GS A0A0G0AMM6_TRIHA/7-205      AC A0A0G0AMM6.1
#=GS A0A1Y0MR14_9FLAO/1-160      AC A0A1Y0MR14.1
#=GS A9BR09_DELAS/41-191         AC A9BR09.1
#=GS G2KUX0_FRUST/10-290         AC G2KUX0.1
#=GS A0A3M0CR22_9PROT/8-252      AC A0A3M0CR22.1
#=GS A0A6G8BW29_9BURK/26-255     AC A0A6G8BW29.1
#=GS A0A4Z0YR61_9PEZI/20-200     AC A0A4Z0YR61.1
#=GS A0A812N6Y5_9DINO/73-253     AC A0A812N6Y5.1
#=GS A0A8J9RUK1_9CHLO/212-279    AC A0A8J9RUK1.1
#=GS A0A7W3JBW0_9MICO/209-471    AC A0A7W3JBW0.1
#=GS A0A812JP57_9DINO/116-270    AC A0A812JP57.1
#=GS A0A2T3ZV64_TRIHA/20-209     AC A0A2T3ZV64.1
#=GS A0A8H6K389_9PEZI/23-219     AC A0A8H6K389.1
#=GS A0A812SSB8_9DINO/59-231     AC A0A812SSB8.1
#=GS A0A2J6SWV7_9HELO/17-207     AC A0A2J6SWV7.1
#=GS A0A2C6AB90_9HYPO/33-212     AC A0A2C6AB90.1
#=GS A0A2P5HEC1_9PEZI/17-210     AC A0A2P5HEC1.1
#=GS A0A938Y343_9ACTN/10-192     AC A0A938Y343.1
#=GS A0A1W2TJM5_ROSNE/26-222     AC A0A1W2TJM5.1
#=GS A0A813DPP5_POLGL/596-777    AC A0A813DPP5.1
#=GS Q5B1W9_EMENI/4-225          AC Q5B1W9.1
#=GS A0A165DXV3_EXIGL/22-213     AC A0A165DXV3.1
#=GS A0A397HE72_9EURO/20-213     AC A0A397HE72.1
#=GS A0A839N7R1_9MICO/92-359     AC A0A839N7R1.1
#=GS A0A178AP92_9PLEO/28-229     AC A0A178AP92.1
#=GS A0A6P1LZW9_9BACT/32-303     AC A0A6P1LZW9.1
#=GS M7TL59_EUTLA/13-208         AC M7TL59.1
#=GS A0A813DMW2_POLGL/79-259     AC A0A813DMW2.1
#=GS A0A2N9QVY2_9PHYC/29-192     AC A0A2N9QVY2.1
#=GS A0A179FVB4_METCM/39-221     AC A0A179FVB4.1
#=GS A0A1L2ZN44_9MICC/69-180     AC A0A1L2ZN44.1
#=GS U2UTC7_9ACTN/51-331         AC U2UTC7.1
#=GS A0A430F759_9BIFI/64-302     AC A0A430F759.1
#=GS A0A8H7TCC0_9HELO/12-216     AC A0A8H7TCC0.1
#=GS W3X699_PESFW/14-205         AC W3X699.1
#=GS A0A8J1Z114_9DINO/1-64       AC A0A8J1Z114.1
#=GS G9N7D4_HYPVG/21-208         AC G9N7D4.1
#=GS A0A0T2KX38_9MICO/84-319     AC A0A0T2KX38.1
#=GS A0A4Y8CUJ9_9HELO/22-210     AC A0A4Y8CUJ9.1
#=GS A0A949TLK2_9CLOT/39-318     AC A0A949TLK2.1
#=GS R7Z4P7_CONA1/27-211         AC R7Z4P7.1
#=GS A0A1G6HG74_9GAMM/28-270     AC A0A1G6HG74.1
#=GS A0A2J8A738_9CHLO/19-179     AC A0A2J8A738.1
#=GS A0A2J7ZJG3_9CHLO/18-247     AC A0A2J7ZJG3.1
#=GS M7SHU0_EUTLA/31-226         AC M7SHU0.1
#=GS A0A2S9JT69_9SPHI/14-304     AC A0A2S9JT69.1
#=GS C7ZIR9_FUSV7/24-215         AC C7ZIR9.1
#=GS A0A812UMF1_9DINO/390-600    AC A0A812UMF1.1
#=GS A0A2J7ZMU2_9CHLO/48-222     AC A0A2J7ZMU2.1
#=GS A0A094A1Z5_9PEZI/16-209     AC A0A094A1Z5.1
#=GS A0A8J7E213_9CYAN/4-98       AC A0A8J7E213.1
#=GS A0A3N6RM31_9CYAN/1-150      AC A0A3N6RM31.1
#=GS I0HHG4_ACTM4/363-613        AC I0HHG4.1
#=GS A0A8H5ZFZ5_COCSA/21-209     AC A0A8H5ZFZ5.1
#=GS A0A553HT66_9PEZI/8-219      AC A0A553HT66.1
#=GS N0APJ9_9BACI/1-146          AC N0APJ9.1
#=GS A0A0A2E023_9PORP/20-307     AC A0A0A2E023.1
#=GS A0A1B8AF85_FUSPO/17-239     AC A0A1B8AF85.1
#=GS A0A250XJ51_9CHLO/69-278     AC A0A250XJ51.1
#=GS A0A4Q4TKL1_9PEZI/11-208     AC A0A4Q4TKL1.1
#=GS A0A0Q9IXE0_9HYPH/1-153      AC A0A0Q9IXE0.1
#=GS A0A0F4Z3B8_TALEM/35-233     AC A0A0F4Z3B8.1
#=GS A0A0G2FC12_9PEZI/47-227     AC A0A0G2FC12.1
#=GS A0A371RGS6_9PROT/4-164      AC A0A371RGS6.1
#=GS A0A0J9UPP9_FUSO4/40-274     AC A0A0J9UPP9.1
#=GS A0A388TJ50_9BACT/1-82       AC A0A388TJ50.1
#=GS A0A3R7M758_9RHOB/2-238      AC A0A3R7M758.1
#=GS A0A0C2YNI0_HEBCY/7-153      AC A0A0C2YNI0.1
#=GS A0A1V6RD13_9EURO/21-203     AC A0A1V6RD13.1
#=GS S0KXG4_9ENTE/12-291         AC S0KXG4.1
#=GS W9VGB6_9EURO/14-244         AC W9VGB6.1
#=GS A0A388TJT6_9BACT/3-202      AC A0A388TJT6.1
#=GS A0A066Y2K2_COLSU/14-232     AC A0A066Y2K2.1
#=GS A0A8H6JBE5_9PEZI/7-208      AC A0A8H6JBE5.1
#=GS A0A7Y9L9F2_9SPHI/1-148      AC A0A7Y9L9F2.1
#=GS H6C868_EXODN/4-149          AC H6C868.1
#=GS A0A8H8TVX0_9HELO/9-200      AC A0A8H8TVX0.1
#=GS A0A973QHV1_9HYPH/52-310     AC A0A973QHV1.1
#=GS A0A699ZVR5_HAELA/1-84       AC A0A699ZVR5.1
#=GS A0A7W5AC64_9ACTN/375-623    AC A0A7W5AC64.1
#=GS C1G044_PARBD/5-206          AC C1G044.2
#=GS A0A1C4HWE4_9ACTN/68-330     AC A0A1C4HWE4.1
#=GS A9BR13_DELAS/48-206         AC A9BR13.1
#=GS G9NBK9_HYPVG/14-219         AC G9NBK9.1
#=GS M7SB04_EUTLA/29-242         AC M7SB04.1
#=GS A0A240U6G4_9BURK/12-163     AC A0A240U6G4.1
#=GS A0A1Q9EP07_SYMMI/415-525    AC A0A1Q9EP07.1
#=GS Q40712_OSEVJ/2772-2887      AC Q40712.1
#=GS A0A241VTF6_9GAMM/4-212      AC A0A241VTF6.1
#=GS A0A179FJE0_METCM/19-222     AC A0A179FJE0.1
#=GS A0A1V8TFG3_9PEZI/16-210     AC A0A1V8TFG3.1
#=GS A0A0M0LI99_9BACI/2-65       AC A0A0M0LI99.1
#=GS M7SDL7_EUTLA/101-208        AC M7SDL7.1
#=GS A0A423X3U0_9PEZI/36-227     AC A0A423X3U0.1
#=GS A6NTT1_9FIRM/43-326         AC A6NTT1.1
#=GS M2S7J4_COCSN/21-209         AC M2S7J4.1
#=GS A0A7C8IEB1_9PLEO/15-207     AC A0A7C8IEB1.1
#=GS A0A553I8Q5_9PEZI/26-214     AC A0A553I8Q5.1
#=GS A0A4V4GRE7_9BURK/45-220     AC A0A4V4GRE7.1
#=GS A0A8T9CGK0_9HELO/16-206     AC A0A8T9CGK0.1
#=GS A0A5M9JJ99_MONFR/17-207     AC A0A5M9JJ99.1
#=GS A0A812VR04_9DINO/64-236     AC A0A812VR04.1
#=GS A0A8H5NUQ2_9HYPO/24-204     AC A0A8H5NUQ2.1
#=GS A0A8B6BGB2_MYTGA/39-276     AC A0A8B6BGB2.1
#=GS A0A5N6K4B7_MONLA/18-207     AC A0A5N6K4B7.1
#=GS A0A812ZU45_9DINO/366-639    AC A0A812ZU45.1
#=GS A0A426DLT4_9FIRM/109-369    AC A0A426DLT4.1
#=GS A0A1H4EVA9_9BACT/2-245      AC A0A1H4EVA9.1
#=GS N8VYI5_9GAMM/8-198          AC N8VYI5.1
#=GS A0A250XGI8_9CHLO/38-213     AC A0A250XGI8.1
#=GS A0A1J9R1B6_9EURO/429-647    AC A0A1J9R1B6.1
#=GS A0A6N6MFE8_9FLAO/9-188      AC A0A6N6MFE8.1
#=GS A0A812K7N7_9DINO/362-564    AC A0A812K7N7.1
#=GS A0A4U0U0B4_9PEZI/27-214     AC A0A4U0U0B4.1
#=GS A0A7H0HCH2_9BURK/44-196     AC A0A7H0HCH2.1
#=GS A0A8H4CQH8_COLGL/27-244     AC A0A8H4CQH8.1
#=GS A0A087DSZ2_9BIFI/44-326     AC A0A087DSZ2.1
#=GS A0A6A0ABU2_HAELA/1-84       AC A0A6A0ABU2.1
#=GS A0A395MX05_9HYPO/11-245     AC A0A395MX05.1
#=GS A0A432LKN7_9BACT/41-314     AC A0A432LKN7.1
#=GS V2T7Y2_9GAMM/35-255         AC V2T7Y2.1
#=GS A0A813GKH7_POLGL/725-982    AC A0A813GKH7.1
#=GS A0A1V1TNH0_9PEZI/23-252     AC A0A1V1TNH0.1
#=GS A0A132B4T2_MOLSC/7-214      AC A0A132B4T2.1
#=GS G9MFL6_HYPVG/27-221         AC G9MFL6.1
#=GS A0A1Y2X9T3_9PEZI/26-246     AC A0A1Y2X9T3.1
#=GS A0A317XE25_9EURO/13-209     AC A0A317XE25.1
#=GS A0A4Q4WQX1_9PEZI/56-245     AC A0A4Q4WQX1.1
#=GS A0A1Q9DN42_SYMMI/8-112      AC A0A1Q9DN42.1
#=GS A0A1Q9E1G7_SYMMI/402-674    AC A0A1Q9E1G7.1
#=GS A0A139GUG4_9PEZI/22-216     AC A0A139GUG4.1
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