#=GF ID Caps_synth
#=GF AC PF05704.12
#=GF DE Capsular polysaccharide synthesis protein
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_7575 (release 8.0)
#=GF GA 24.50 24.50;
#=GF TC 24.50 24.50;
#=GF NC 24.40 24.40;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 11179285
#=GF RT Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae type 4,
#=GF RT 6B, 8, and 18C capsular polysaccharide gene clusters.
#=GF RA Jiang SM, Wang L, Reeves PR;
#=GF RL Infect Immun 2001;69:1244-1255.
#=GF RN [2]
#=GF RM 9838125
#=GF RT Molecular structure of the gene cluster responsible for the
#=GF RT synthesis of the polysaccharide capsule of Streptococcus
#=GF RT pneumoniae type 33F.
#=GF RA Llull D, Lopez R, Garcia E, Munoz R;
#=GF RL Biochim Biophys Acta 1998;1443:217-224.
#=GF RN [3]
#=GF RM 10688204
#=GF RT The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter
#=GF RT jejuni reveals hypervariable sequences.
#=GF RA Parkhill J, Wren BW, Mungall K, Ketley JM, Churcher C, Basham D,
#=GF RA Chillingworth T, Davies RM, Feltwell T, Holroyd S, Jagels K,
#=GF RA Karlyshev AV, Moule S, Pallen MJ, Penn CW, Quail MA, Rajandream
#=GF RA MA, Rutherford KM, van Vliet AH, Whitehead S, Barrell BG;
#=GF RL Nature 2000;403:665-668.
#=GF RN [4]
#=GF RM 7752885
#=GF RT Region II of the Haemophilus influenzae type be capsulation
#=GF RT locus is involved in serotype-specific polysaccharide synthesis.
#=GF RA Van Eldere J, Brophy L, Loynds B, Celis P, Hancock I, Carman S,
#=GF RA Kroll JS, Moxon ER;
#=GF RL Mol Microbiol 1995;15:107-118.
#=GF RN [5]
#=GF RM 10094675
#=GF RT acs1 of Haemophilus influenzae type a capsulation locus region
#=GF RT II encodes a bifunctional ribulose 5-phosphate reductase-
#=GF RT CDP-ribitol pyrophosphorylase.
#=GF RA Follens A, Veiga-da-Cunha M, Merckx R, van Schaftingen E, van
#=GF RA Eldere J;
#=GF RL J Bacteriol 1999;181:2001-2007.
#=GF DR INTERPRO; IPR008441;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This family consists of several capsular polysaccharide
#=GF CC proteins. Capsular polysaccharide (CPS) is a major virulence
#=GF CC factor in Streptococcus pneumoniae [1].
#=GF SQ 746
#=GS R5ZK69_9CLOT/29-315 AC R5ZK69.1
#=GS A0A246ADT4_9SPHI/1-140 AC A0A246ADT4.1
#=GS A0A1L9UUQ3_9EURO/16-212 AC A0A1L9UUQ3.1
#=GS A0A0M8KEX6_9BACT/20-294 AC A0A0M8KEX6.1
#=GS R7G843_9PROT/521-793 AC R7G843.1
#=GS A0A167W6M3_9HOMO/75-257 AC A0A167W6M3.1
#=GS A0A094GXP9_9PEZI/52-243 AC A0A094GXP9.1
#=GS A0A147FUT7_9GAMM/41-276 AC A0A147FUT7.1
#=GS A0A0M0K5D5_9EUKA/99-241 AC A0A0M0K5D5.1
#=GS E6W7J3_PANSA/16-259 AC E6W7J3.1
#=GS W9CI99_9HELO/29-222 AC W9CI99.1
#=GS A0A2A3K0S2_9RHOB/63-228 AC A0A2A3K0S2.1
#=GS R6QJ08_9CLOT/2-200 AC R6QJ08.1
#=GS A0A1E7R3C4_9GAMM/10-259 AC A0A1E7R3C4.1
#=GS A0A1Q9EC93_SYMMI/2-259 AC A0A1Q9EC93.1
#=GS A0A194V508_9PEZI/28-211 AC A0A194V508.1
#=GS A0A094I1E0_9PEZI/20-209 AC A0A094I1E0.1
#=GS A0A0D6N704_9PROT/50-232 AC A0A0D6N704.1
#=GS R6ZZQ9_9FIRM/1-120 AC R6ZZQ9.1
#=GS A0A1Q9C657_SYMMI/173-349 AC A0A1Q9C657.1
#=GS R5ZBB7_9CLOT/22-307 AC R5ZBB7.1
#=GS E1SCB4_PANVC/39-202 AC E1SCB4.1
#=GS A0A139HXT1_9PEZI/8-189 AC A0A139HXT1.1
#=GS A0A1Z9Z2L8_9GAMM/3-220 AC A0A1Z9Z2L8.1
#=GS R5EFA8_9FIRM/1-115 AC R5EFA8.1
#=GS A0A0A7IA00_9BIFI/35-310 AC A0A0A7IA00.1
#=GS A0A135LSY5_PENPA/19-204 AC A0A135LSY5.1
#=GS R5NCF8_9BACT/38-315 AC R5NCF8.1
#=GS A0A0Q6AQY4_9FLAO/1-195 AC A0A0Q6AQY4.1
#=GS A0A096P8T9_OSTTA/54-189 AC A0A096P8T9.1
#=GS A0A1Q8S6B9_9PEZI/17-216 AC A0A1Q8S6B9.1
#=GS A0A1I6VAL7_9SPHI/21-140 AC A0A1I6VAL7.1
#=GS G3XTJ3_ASPNA/17-212 AC G3XTJ3.1
#=GS A0A165DA79_EXIGL/25-211 AC A0A165DA79.1
#=GS A0A0H1BGT2_9EURO/9-226 AC A0A0H1BGT2.1
#=GS A0A2H3IC45_9EURO/41-259 AC A0A2H3IC45.1
#=GS E1M893_9STRE/1-221 AC E1M893.1
#=GS A0A1V9D9W8_9GAMM/30-202 AC A0A1V9D9W8.1
#=GS N8VYI5_9GAMM/5-232 AC N8VYI5.1
#=GS A0A0R1PFG5_9LACO/24-303 AC A0A0R1PFG5.1
#=GS A0A0R2D2B6_9LACO/39-304 AC A0A0R2D2B6.1
#=GS A0A0L1HIU3_9PLEO/5-185 AC A0A0L1HIU3.1
#=GS A0A0D1YLY9_9PEZI/43-224 AC A0A0D1YLY9.1
#=GS A0A261G548_9BIFI/1-235 AC A0A261G548.1
#=GS A0A1M4Z3D1_9BURK/47-206 AC A0A1M4Z3D1.1
#=GS C9RPC4_FIBSS/1-139 AC C9RPC4.1
#=GS C7ZDU0_NECH7/11-211 AC C7ZDU0.1
#=GS A0A087DSZ2_9BIFI/44-326 AC A0A087DSZ2.1
#=GS A0A222DZR8_9RHOB/2-151 AC A0A222DZR8.1
#=GS D4MVZ4_ANAHA/46-326 AC D4MVZ4.1
#=GS I3D604_HAEPH/36-327 AC I3D604.1
#=GS A0A0J1H1L6_9GAMM/3-175 AC A0A0J1H1L6.1
#=GS A0A1I2J112_9ACTN/362-613 AC A0A1I2J112.1
#=GS A0A166YPT2_9PEZI/11-207 AC A0A166YPT2.1
#=GS A0A174GQQ1_9CLOT/1-140 AC A0A174GQQ1.1
#=GS B8M658_TALSN/5-206 AC B8M658.1
#=GS R6XEQ9_9BACT/1-189 AC R6XEQ9.1
#=GS D7CS04_TRURR/2-140 AC D7CS04.1
#=GS A0A174I0L9_9BACT/1-198 AC A0A174I0L9.1
#=GS C1G044_PARBD/5-207 AC C1G044.2
#=GS A0A084H4H6_BACID/1-167 AC A0A084H4H6.1
#=GS A0A0G0AMM6_TRIHA/6-205 AC A0A0G0AMM6.1
#=GS A0A0H1BH39_9EURO/24-205 AC A0A0H1BH39.1
#=GS A0A2C5XV00_9HYPO/24-210 AC A0A2C5XV00.1
#=GS C4IDA9_CLOBU/22-310 AC C4IDA9.1
#=GS A0A149R016_9PROT/51-119 AC A0A149R016.1
#=GS A0A2A4W3L6_9PROT/19-175 AC A0A2A4W3L6.1
#=GS A0A1T4LIT5_9SPIO/1-141 AC A0A1T4LIT5.1
#=GS A0A231MMX6_9EURO/20-216 AC A0A231MMX6.1
#=GS A0A162IVA4_9HYPO/17-236 AC A0A162IVA4.1
#=GS C7DD67_9RHOB/1-175 AC C7DD67.1
#=GS R6ZCG1_9CLOT/2-139 AC R6ZCG1.1
#=GS W9VGB6_9EURO/14-244 AC W9VGB6.1
#=GS A0A1C1X4W9_9PEZI/13-231 AC A0A1C1X4W9.1
#=GS S5ZXH7_9SPIO/38-311 AC S5ZXH7.1
#=GS A0A0A2E023_9PORP/21-307 AC A0A0A2E023.1
#=GS C9R202_AGGAD/43-329 AC C9R202.1
#=GS A0A1Y4NL82_9FIRM/31-300 AC A0A1Y4NL82.1
#=GS A0A167AWG5_9PEZI/4-225 AC A0A167AWG5.1
#=GS A0A2A2AIX9_9BURK/69-215 AC A0A2A2AIX9.1
#=GS A0A0N0RTI5_9HYPO/18-219 AC A0A0N0RTI5.1
#=GS A0A1X7L3G7_9SPHI/8-132 AC A0A1X7L3G7.1
#=GS A0A1A6FQZ9_9RHIZ/7-151 AC A0A1A6FQZ9.1
#=GS A0A066Y2K2_COLSU/14-233 AC A0A066Y2K2.1
#=GS A0A165DAB0_EXIGL/21-211 AC A0A165DAB0.1
#=GS R6MI47_9BACE/1-144 AC R6MI47.1
#=GS A0A0U1Q334_9BURK/48-169 AC A0A0U1Q334.1
#=GS A1TIT5_ACIAC/34-191 AC A1TIT5.1
#=GS A0A286ACJ0_9SPHI/1-142 AC A0A286ACJ0.1
#=GS R5ARK5_9FIRM/1-137 AC R5ARK5.1
#=GS A0A1I4EYR3_9BACL/1-212 AC A0A1I4EYR3.1
#=GS A0A0C2VY58_9BACL/1-173 AC A0A0C2VY58.1
#=GS A0A0Q5LF24_9BURK/60-273 AC A0A0Q5LF24.1
#=GS A0A1H9EJ70_9FIRM/38-313 AC A0A1H9EJ70.1
#=GS A0A0A2HZ07_PENEN/16-206 AC A0A0A2HZ07.1
#=GS A0A239RLG9_9BACT/4-277 AC A0A239RLG9.1
#=GS A0A167I8P2_9HYPO/17-209 AC A0A167I8P2.1
#=GS R5E0K9_9FIRM/227-501 AC R5E0K9.1
#=GS A0A229VUF8_9BIFI/1-198 AC A0A229VUF8.1
#=GS R5LAG6_9FIRM/36-313 AC R5LAG6.1
#=GS A0A1B8GLI5_9PEZI/23-208 AC A0A1B8GLI5.1
#=GS A0A0F9X5T8_TRIHA/14-263 AC A0A0F9X5T8.1
#=GS A0A010RBH1_9PEZI/11-221 AC A0A010RBH1.1
#=GS A0A179V058_BLAGS/23-205 AC A0A179V058.1
#=GS A0A1Q9C6C6_SYMMI/4-57 AC A0A1Q9C6C6.1
#=GS B8DWN8_BIFA0/103-348 AC B8DWN8.1
#=GS A0A194WDM8_9PEZI/29-211 AC A0A194WDM8.1
#=GS A0A248TPI8_9BACI/1-209 AC A0A248TPI8.1
#=GS A0A1U7PZM7_9FLAO/31-302 AC A0A1U7PZM7.1
#=GS A0A1J9P2K1_9EURO/5-205 AC A0A1J9P2K1.1
#=GS A0A2C6AB90_9HYPO/33-212 AC A0A2C6AB90.1
#=GS A0A1Y4D7B4_9BACT/1-140 AC A0A1Y4D7B4.1
#=GS Q40712_OSEVJ/2772-2895 AC Q40712.1
#=GS Q0AKZ7_MARMM/1-245 AC Q0AKZ7.1
#=GS R6MK64_9BACE/50-333 AC R6MK64.1
#=GS V2T7Y2_9GAMM/35-203 AC V2T7Y2.1
#=GS A0A261G7Z5_9BIFI/45-307 AC A0A261G7Z5.1
#=GS A0A235E1F0_9SPHI/13-304 AC A0A235E1F0.1
#=GS A0A0A0C934_9CELL/31-274 AC A0A0A0C934.1
#=GS U2BJI5_9CLOT/35-303 AC U2BJI5.1
#=GS A0A261GAU4_9BIFI/3-286 AC A0A261GAU4.1
#=GS A0A1L2ZN44_9MICC/69-179 AC A0A1L2ZN44.1
#=GS A0A263HDT6_9PAST/1-66 AC A0A263HDT6.1
#=GS A0A0P7BBR0_9HYPO/23-230 AC A0A0P7BBR0.1
#=GS W6R626_9RHIZ/8-263 AC W6R626.1
#=GS A0A084IMD7_9GAMM/55-274 AC A0A084IMD7.1
#=GS A0A0D2JCB3_9EURO/30-209 AC A0A0D2JCB3.1
#=GS A0A1V1SZC9_9FUNG/35-235 AC A0A1V1SZC9.1
#=GS W9J754_FUSOX/40-257 AC W9J754.1
#=GS G9NBK9_HYPVG/11-238 AC G9NBK9.1
#=GS A0A1Q9E1G7_SYMMI/402-673 AC A0A1Q9E1G7.1
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#=GS E7NQN2_TREPH/43-311 AC E7NQN2.1
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#=GS A0A1G9H7L9_9CLOT/1-112 AC A0A1G9H7L9.1
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#=GS A0A0B0D008_9BACI/2-147 AC A0A0B0D008.1
#=GS R1E689_EMIHU/35-286 AC R1E689.1
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#=GS E9DCM8_COCPS/12-217 AC E9DCM8.1
#=GS A0A1Q5QC91_9EURO/16-219 AC A0A1Q5QC91.1
#=GS A0A1I3P2K8_9PLAN/173-310 AC A0A1I3P2K8.1
#=GS A0A066WXA9_COLSU/33-251 AC A0A066WXA9.1
#=GS A0A0A8H2G4_9PROT/429-728 AC A0A0A8H2G4.1
#=GS M2ZSR1_PSEFD/21-223 AC M2ZSR1.1
#=GS A0A2A2EM24_9BIFI/25-293 AC A0A2A2EM24.1
#=GS A0A2B7Z180_9EURO/11-206 AC A0A2B7Z180.1
#=GS A0A1V8T5V7_9PEZI/14-211 AC A0A1V8T5V7.1
#=GS R6A9U8_9CLOT/50-317 AC R6A9U8.1
#=GS A8YX79_LACH4/17-305 AC A8YX79.1
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#=GS S0DVA9_GIBF5/21-203 AC S0DVA9.1
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#=GS A0A1Q5Q7I0_9EURO/4-202 AC A0A1Q5Q7I0.1
#=GS A0A093ZER8_9PEZI/22-207 AC A0A093ZER8.1
#=GS E7RMI7_9BACT/33-297 AC E7RMI7.1
#=GS H1XA71_WEICO/81-324 AC H1XA71.1
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#=GS J3PEX5_GAGT3/21-215 AC J3PEX5.1
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#=GS W9WMW5_9EURO/14-230 AC W9WMW5.1
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#=GS U2UTC7_9ACTN/51-331 AC U2UTC7.1
#=GS A0A1B8GFV3_9PEZI/1-155 AC A0A1B8GFV3.1
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#=GS S0DYH8_GIBF5/21-242 AC S0DYH8.1
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#=GS A0A0D1W4B5_9EURO/8-234 AC A0A0D1W4B5.1
#=GS A0A1Y1YTC4_9PLEO/21-206 AC A0A1Y1YTC4.1
#=GS A0A1L7WLS3_9HELO/13-204 AC A0A1L7WLS3.1
#=GS A0A0D2C402_9EURO/22-240 AC A0A0D2C402.1
#=GS F7KIM0_9FIRM/542-812 AC F7KIM0.1
#=GS A0A151GPP7_9HYPO/67-254 AC A0A151GPP7.1
#=GS A0A0F8UPI4_9EURO/12-220 AC A0A0F8UPI4.1
#=GS H7EMH2_9SPIO/37-305 AC H7EMH2.1
#=GS M7TL59_EUTLA/12-208 AC M7TL59.1
#=GS N2A7V8_9LACO/1-204 AC N2A7V8.1
#=GS G9MFL6_HYPVG/29-221 AC G9MFL6.1
#=GS C2EPL1_9LACO/26-304 AC C2EPL1.1
#=GS A0A0F4Z3B8_TALEM/35-234 AC A0A0F4Z3B8.1
#=GS A0A132B4T2_9HELO/8-207 AC A0A132B4T2.1
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