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Database: Pfam
Entry: Caps_synth_GfcC
LinkDB: Caps_synth_GfcC
Original site: Caps_synth_GfcC 
#=GF ID   Caps_synth_GfcC
#=GF AC   PF06251.12
#=GF DE   Capsule biosynthesis GfcC
#=GF PI   DUF1017;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   Pfam-B_9574 (release 9.0)
#=GF GA   22.10 22.10;
#=GF TC   22.10 22.10;
#=GF NC   22.00 22.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10200953
#=GF RT   Structure, assembly and regulation of expression of capsules in
#=GF RT   Escherichia coli.
#=GF RA   Whitfield C, Roberts IS;
#=GF RL   Mol Microbiol. 1999;31:1307-1319.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   16030220
#=GF RT   Identification of an Escherichia coli operon required for
#=GF RT   formation of the O-antigen capsule.
#=GF RA   Peleg A, Shifrin Y, Ilan O, Nadler-Yona C, Nov S, Koby S, Baruch
#=GF RA   K, Altuvia S, Elgrably-Weiss M, Abe CM, Knutton S, Saper MA,
#=GF RA   Rosenshine I;
#=GF RL   J Bacteriol. 2005;187:5259-5266.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   17250770
#=GF RT   A novel superfamily containing the beta-grasp fold involved in
#=GF RT   binding diverse soluble ligands. 
#=GF RA   Burroughs AM, Balaji S, Iyer LM, Aravind L; 
#=GF RL   Biol Direct. 2007;2:4-4.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   21449614
#=GF RT   Crystal structure of E. coli group 4 capsule protein GfcC
#=GF RT   reveals a domain organization resembling Wza.
#=GF RA   Sathiyamoorthy K, Mills E, Franzmann TM, Rosenshine I, Saper MA;
#=GF RL   Biochemistry 2011;0:0-0.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010425;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Many bacteria are covered in a layer of surface-associated
#=GF CC   polysaccharide called the capsule. These capsules can be divided
#=GF CC   into four groups depending upon the organisation of genes
#=GF CC   responsible for capsule assembly, the assembly pathway and
#=GF CC   regulation [1].  This family plays a role in group 4 capsule
#=GF CC   biosynthesis [2].  These proteins have a beta-grasp fold [3].
#=GF CC   Two beta-grasp domains, D2 and D3, are arranged in tandem. There
#=GF CC   is a C-terminal amphipathic helix which packs against D3. A
#=GF CC   helical hairpin insert in D2 binds to D3 and constrains its
#=GF CC   position, a conserved arginine residue at the end of this
#=GF CC   hairpin is essential for structural integrity [4].
#=GF SQ   606
#=GS A0A3N1WVC3_9BURK/31-245     AC A0A3N1WVC3.1
#=GS A0A1D9BED0_9NEIS/323-547    AC A0A1D9BED0.1
#=GS A0A425XWP3_9BACT/636-794    AC A0A425XWP3.1
#=GS A0A133Y1V0_9BACT/623-832    AC A0A133Y1V0.1
#=GS A0A1X0Y0Z5_9DELT/591-821    AC A0A1X0Y0Z5.1
#=GS A0A167PNY1_9GAMM/673-879    AC A0A167PNY1.1
#=GS A0A3D9L834_9BACT/668-795    AC A0A3D9L834.1
#=GS A0A1S1NX60_9GAMM/16-234     AC A0A1S1NX60.1
#=GS A0A495D7C1_9ALTE/633-838    AC A0A495D7C1.1
#=GS F8N5X7_9BACT/634-821        AC F8N5X7.1
#=GS A0A3A6QIR6_9VIBR/638-863    AC A0A3A6QIR6.1
#=GS A0A2A2HZ04_9ALTE/23-249     AC A0A2A2HZ04.1
#=GS A0A2U4D8S2_CITAM/19-245     AC A0A2U4D8S2.1
#=GS Q15QX9_PSEA6/17-247         AC Q15QX9.1
#=GS A0A327X079_9BACT/669-775    AC A0A327X079.1
#=GS A0A0U1PZD1_9BURK/278-503    AC A0A0U1PZD1.1
#=GS A0A2I2A881_9GAMM/694-923    AC A0A2I2A881.1
#=GS A0A432X6Y5_9GAMM/609-836    AC A0A432X6Y5.1
#=GS Q87T50_VIBPA/646-871        AC Q87T50.1
#=GS M1FEC0_9ALTE/594-828        AC M1FEC0.1
#=GS A0A427K4I4_9GAMM/20-249     AC A0A427K4I4.1
#=GS F3L3S5_9GAMM/632-859        AC F3L3S5.1
#=GS A0A1T5FIX0_9BACT/665-779    AC A0A1T5FIX0.1
#=GS A0A0W1STR0_9GAMM/657-893    AC A0A0W1STR0.1
#=GS A0A1R4B3P1_9VIBR/25-257     AC A0A1R4B3P1.1
#=GS G8ALG8_AZOBR/759-982        AC G8ALG8.1
#=GS A0A1I7MYB6_9BACT/715-820    AC A0A1I7MYB6.1
#=GS H5WSC0_9BURK/440-592        AC H5WSC0.1
#=GS K6YW12_9ALTE/18-239         AC K6YW12.1
#=GS E3G2F4_ENTLS/19-245         AC E3G2F4.1
#=GS A0A443IGI6_9GAMM/20-247     AC A0A443IGI6.1
#=GS A0A3G3GIL3_9BACT/650-786    AC A0A3G3GIL3.1
#=GS A0A1I6M5H2_9BACT/645-857    AC A0A1I6M5H2.1
#=GS U4KFP4_9VIBR/637-860        AC U4KFP4.1
#=GS Q63N78_BURPS/608-821        AC Q63N78.1
#=GS A0A1I0N658_9BACT/738-867    AC A0A1I0N658.1
#=GS Z5XLI7_9GAMM/655-871        AC Z5XLI7.1
#=GS K2K6B8_9GAMM/602-827        AC K2K6B8.1
#=GS A0A447MC93_SALBN/19-245     AC A0A447MC93.1
#=GS A0A3S2VMP4_9SPHI/691-806    AC A0A3S2VMP4.1
#=GS YJBG_ECOLI/19-245           AC P32688.1
#=GS A0A0Q5D1E2_9BURK/321-542    AC A0A0Q5D1E2.1
#=GS A0A090SCF7_9VIBR/2-192      AC A0A090SCF7.1
#=GS A0A426H823_9GAMM/4-178      AC A0A426H823.1
#=GS A0A1I4A8W7_9PROT/708-888    AC A0A1I4A8W7.1
#=GS A0A059KK06_9BURK/471-659    AC A0A059KK06.1
#=GS A0A1G7NBL2_9BACT/588-813    AC A0A1G7NBL2.1
#=GS C7RAP3_KANKD/674-901        AC C7RAP3.1
#=GS A0A365SFR0_9PSED/7-169      AC A0A365SFR0.1
#=GS A0A495TY94_9SPHI/698-807    AC A0A495TY94.1
#=GS A0A1Y1CE73_9BACT/625-799    AC A0A1Y1CE73.1
#=GS E8X6J4_GRATM/680-910        AC E8X6J4.1
#=GS A0A0F4QNN0_9GAMM/633-857    AC A0A0F4QNN0.1
#=GS A0A1H8BFP1_9BACT/614-816    AC A0A1H8BFP1.1
#=GS A0KM78_AERHH/18-252         AC A0KM78.1
#=GS A9D4M4_9GAMM/592-824        AC A9D4M4.1
#=GS A0A432ZQT5_9GAMM/684-916    AC A0A432ZQT5.1
#=GS A0A2G5L7U4_9BACT/716-825    AC A0A2G5L7U4.1
#=GS A0A3R8T5A7_9BURK/561-754    AC A0A3R8T5A7.1
#=GS A0A2W7RI27_9BACT/579-813    AC A0A2W7RI27.1
#=GS A0A0S2DXY1_9GAMM/30-262     AC A0A0S2DXY1.1
#=GS A0A428MHK1_9BACT/663-893    AC A0A428MHK1.1
#=GS A0A2T0X607_9BACT/572-767    AC A0A2T0X607.1
#=GS A0A1B8PHX3_MORNO/337-537    AC A0A1B8PHX3.1
#=GS U4KFP6_9VIBR/23-239         AC U4KFP6.1
#=GS A0A432X4Y8_9GAMM/20-126     AC A0A432X4Y8.1
#=GS A0A1E5CZP0_9VIBR/41-288     AC A0A1E5CZP0.1
#=GS A0A014NRJ2_9GAMM/20-251     AC A0A014NRJ2.1
#=GS A0A0A0DWC1_9BURK/520-704    AC A0A0A0DWC1.1
#=GS S2LHK4_HALAF/56-242         AC S2LHK4.1
#=GS A0A143B739_9DELT/670-896    AC A0A143B739.1
#=GS I3ZCQ9_TERRK/645-818        AC I3ZCQ9.1
#=GS A4BYL4_9FLAO/651-797        AC A4BYL4.1
#=GS A0A368JTS6_9BACT/674-776    AC A0A368JTS6.1
#=GS Q2NR05_SODGM/16-164         AC Q2NR05.1
#=GS A0A1H2Z006_9BACT/653-782    AC A0A1H2Z006.1
#=GS A0A432ZB34_9GAMM/652-882    AC A0A432ZB34.1
#=GS G7Z6G9_AZOL4/741-947        AC G7Z6G9.1
#=GS A0A3N4AA85_9PSED/21-253     AC A0A3N4AA85.1
#=GS L1PBM6_9FLAO/593-801        AC L1PBM6.1
#=GS D0YWL4_PHODD/41-272         AC D0YWL4.1
#=GS A0A3N0VGN4_9GAMM/745-967    AC A0A3N0VGN4.1
#=GS A0A2N1F691_9FLAO/582-793    AC A0A2N1F691.1
#=GS A0A3F2V416_9GAMM/711-929    AC A0A3F2V416.1
#=GS A0A2U2HN47_9BURK/496-676    AC A0A2U2HN47.1
#=GS Q39TL2_GEOMG/586-768        AC Q39TL2.1
#=GS A0A365WN22_9PSED/17-250     AC A0A365WN22.1
#=GS A0A1L6JB14_9SPHN/373-592    AC A0A1L6JB14.1
#=GS A0A1E5D2K3_9VIBR/629-853    AC A0A1E5D2K3.1
#=GS A0A1P8R3P0_9GAMM/30-243     AC A0A1P8R3P0.1
#=GS A0A1E8FHI3_9ALTE/19-242     AC A0A1E8FHI3.1
#=GS A0A243SYL4_9GAMM/32-240     AC A0A243SYL4.1
#=GS A0A2T0U6Z3_9SPHI/689-802    AC A0A2T0U6Z3.1
#=GS A0A0F4PT92_9GAMM/679-905    AC A0A0F4PT92.1
#=GS A0A315BZ57_9BURK/528-740    AC A0A315BZ57.1
#=GS A0A3A9J9I4_9PROT/193-381    AC A0A3A9J9I4.1
#=GS D3SF71_THISK/124-245        AC D3SF71.1
#=GS A0A2X3EB02_KLUCR/20-246     AC A0A2X3EB02.1
#=GS A0A094L3F7_9GAMM/636-864    AC A0A094L3F7.1
#=GS D8PBP5_9BACT/638-845        AC D8PBP5.1
#=GS A6GM19_9BURK/31-248         AC A6GM19.1
#=GS A0A1S1MZZ8_9GAMM/642-865    AC A0A1S1MZZ8.1
#=GS A0A1M5N238_9ALTE/16-243     AC A0A1M5N238.1
#=GS A0A1S8D707_9PROT/709-925    AC A0A1S8D707.1
#=GS A0A1J0VJ94_9GAMM/128-248    AC A0A1J0VJ94.1
#=GS A0A2X4WV13_SALER/19-245     AC A0A2X4WV13.1
#=GS Q8ECI4_SHEON/23-261         AC Q8ECI4.1
#=GS E1VH83_9GAMM/732-922        AC E1VH83.1
#=GS A0A0J6NNT0_9NEIS/392-634    AC A0A0J6NNT0.1
#=GS A0A1I6HAF1_9ALTE/649-884    AC A0A1I6HAF1.1
#=GS A0A257IX53_9BACT/621-764    AC A0A257IX53.1
#=GS A0A318EG62_9GAMM/97-189     AC A0A318EG62.1
#=GS A0A1H3VSR1_9GAMM/20-259     AC A0A1H3VSR1.1
#=GS A0A199XP56_9FLAO/681-788    AC A0A199XP56.1
#=GS A0A269PP28_9GAMM/620-853    AC A0A269PP28.1
#=GS A0A150XC46_9BACT/769-879    AC A0A150XC46.1
#=GS A0A1M6RW63_9ALTE/622-856    AC A0A1M6RW63.1
#=GS A0A2Z2NKF2_9GAMM/384-569    AC A0A2Z2NKF2.1
#=GS A0A1T0CPL2_9GAMM/342-540    AC A0A1T0CPL2.1
#=GS A0A257CJY0_9BURK/427-617    AC A0A257CJY0.1
#=GS A0A3N1J087_9ENTR/19-245     AC A0A3N1J087.1
#=GS A0A0S2JYR0_9GAMM/635-860    AC A0A0S2JYR0.1
#=GS A0A1T4VYU6_9DELT/314-525    AC A0A1T4VYU6.1
#=GS G2KSB1_MICAA/640-871        AC G2KSB1.1
#=GS H0PXN6_9RHOO/20-254         AC H0PXN6.1
#=GS W0I331_9GAMM/20-251         AC W0I331.1
#=GS A0A432Z9G9_9GAMM/26-275     AC A0A432Z9G9.1
#=GS A0A1Y6EGM7_9GAMM/672-901    AC A0A1Y6EGM7.1
#=GS A0A1D8RTT0_9GAMM/664-878    AC A0A1D8RTT0.1
#=GS A0A318EDH0_9GAMM/3-96       AC A0A318EDH0.1
#=GS A0A0J8YFH7_9GAMM/21-252     AC A0A0J8YFH7.1
#=GS A0A2M6V8D8_9BURK/626-849    AC A0A2M6V8D8.1
#=GS D0IC10_GRIHO/32-271         AC D0IC10.1
#=GS A0A3N4PWX7_9BACT/734-836    AC A0A3N4PWX7.1
#=GS A0A1P8KPM3_9PROT/295-522    AC A0A1P8KPM3.1
#=GS A0A257HZD7_9BACT/678-797    AC A0A257HZD7.1
#=GS A0A1G8PR38_9BURK/51-253     AC A0A1G8PR38.1
#=GS A0A1I5RYW1_9BURK/19-179     AC A0A1I5RYW1.1
#=GS A0A327WNK9_9GAMM/676-911    AC A0A327WNK9.1
#=GS W1SCC3_9SPHN/381-602        AC W1SCC3.1
#=GS R9GQ91_9SPHI/699-807        AC R9GQ91.1
#=GS A0A0S2JHJ8_9GAMM/692-906    AC A0A0S2JHJ8.1
#=GS A0A0L0AYN8_9ENTR/19-245     AC A0A0L0AYN8.1
#=GS A0A2N8GPI3_9PSED/17-250     AC A0A2N8GPI3.1
#=GS Q8ECE9_SHEON/686-904        AC Q8ECE9.1
#=GS A0A0Q0KZ95_9GAMM/676-903    AC A0A0Q0KZ95.1
#=GS Q5QWW2_IDILO/13-248         AC Q5QWW2.1
#=GS A0A239D7L6_9PROT/737-965    AC A0A239D7L6.1
#=GS K2JYH0_9GAMM/637-866        AC K2JYH0.1
#=GS A0A178K8V1_9GAMM/1-198      AC A0A178K8V1.1
#=GS A0A1P9X221_9BACT/673-787    AC A0A1P9X221.1
#=GS B3QV12_CHLT3/706-897        AC B3QV12.1
#=GS A0A244CPV7_9GAMM/645-869    AC A0A244CPV7.1
#=GS A0A261GQE0_9GAMM/589-816    AC A0A261GQE0.1
#=GS A0A1C3ER91_9GAMM/54-288     AC A0A1C3ER91.1
#=GS C7M6P8_CAPOD/593-801        AC C7M6P8.1
#=GS A0A0Q4MM80_9GAMM/20-251     AC A0A0Q4MM80.1
#=GS Q12KS6_SHEDO/644-902        AC Q12KS6.1
#=GS A0A1Y6C0R2_9PROT/304-530    AC A0A1Y6C0R2.1
#=GS A0A431VCL1_9PROT/783-1001   AC A0A431VCL1.1
#=GS E8V351_TERSS/661-884        AC E8V351.1
#=GS A0A166K4H0_9GAMM/673-882    AC A0A166K4H0.1
#=GS A0A432X4Y8_9GAMM/148-276    AC A0A432X4Y8.1
#=GS A0A2G3K311_9BURK/589-834    AC A0A2G3K311.1
#=GS A0A2M6V1W0_9BURK/39-246     AC A0A2M6V1W0.1
#=GS D9SFJ7_GALCS/529-744        AC D9SFJ7.1
#=GS A0A396U297_9GAMM/690-901    AC A0A396U297.1
#=GS A0A432WB48_9GAMM/65-271     AC A0A432WB48.1
#=GS A0A071M1G6_9ENTR/25-251     AC A0A071M1G6.1
#=GS A0A267TIJ8_9BACT/640-760    AC A0A267TIJ8.1
#=GS A0A0R0D7K9_9GAMM/28-252     AC A0A0R0D7K9.1
#=GS A0A3Q9GD18_9GAMM/675-893    AC A0A3Q9GD18.1
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