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Database: Pfam
Entry: DUF5051
LinkDB: DUF5051
Original site: DUF5051 
#=GF ID   DUF5051
#=GF AC   PF16473.6
#=GF DE   3' exoribonuclease, RNase T-like
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   PDB:4hvj
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   27.00 27.00;
#=GF NC   26.90 26.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   24311791
#=GF RT   Mycobacterium tuberculosis Rv2179c protein establishes a new
#=GF RT   exoribonuclease family with broad phylogenetic distribution.
#=GF RA   Abendroth J, Ollodart A, Andrews ES, Myler PJ, Staker BL,
#=GF RA   Edwards TE, Arcus VL, Grundner C;
#=GF RL   J Biol Chem. 2014;289:2139-2147.
#=GF DR   INTERPRO; IPR033390;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This is a highly divergent 3' exoribonuclease family. The
#=GF CC   proteins constitute a typical RNase fold, where the active site
#=GF CC   residues form a magnesium catalytic centre. The protein of the
#=GF CC   solved structure readily cleaves 3' overhangs in a
#=GF CC   time-dependent manner. It is similar to DEDD-type RNases and is
#=GF CC   an unusual ATP-binding protein that binds ATP and dATP. It forms
#=GF CC   a dimer in solution and both protomers in the asymmetric unit
#=GF CC   bind a magnesium ion through Asp-6 in SwissProt:P9WJ73 [1].
#=GF SQ   1068
#=GS A0A1F1KU49_9CORY/1-156    AC A0A1F1KU49.1
#=GS A0A363S4N9_9GAMM/4-166    AC A0A363S4N9.1
#=GS A0A1X1TG95_9MYCO/1-157    AC A0A1X1TG95.1
#=GS A0A1E8PY79_9MYCO/1-157    AC A0A1E8PY79.1
#=GS A0A1I2GJ55_9ACTN/12-167   AC A0A1I2GJ55.1
#=GS A0A2S8YR46_9PSED/1-149    AC A0A2S8YR46.1
#=GS A0A0K1RA30_9CORY/1-155    AC A0A0K1RA30.1
#=GS A0A1H0FPB1_9BACT/4-196    AC A0A1H0FPB1.1
#=GS D9VPC6_9ACTN/10-191       AC D9VPC6.1
#=GS A0A1S6L1X3_9CAUD/19-203   AC A0A1S6L1X3.1
#=GS Q5YZ14_NOCFA/24-180       AC Q5YZ14.1
#=GS A0A2D0W9C0_9CAUD/7-176    AC A0A2D0W9C0.1
#=GS A0A2J6Q0N2_9HELO/8-213    AC A0A2J6Q0N2.1
#=GS A0A1I5J195_9BACT/3-163    AC A0A1I5J195.1
#=GS A0A097EVM2_9CAUD/27-204   AC A0A097EVM2.1
#=GS A4X9W2_SALTO/3-163        AC A4X9W2.1
#=GS A0A2H4PIG4_9CAUD/6-191    AC A0A2H4PIG4.1
#=GS A0A482ICX3_9CAUD/1-187    AC A0A482ICX3.1
#=GS Q76Z82_9CAUD/8-199        AC Q76Z82.1
#=GS A0A2I6UHW8_9CAUD/2-180    AC A0A2I6UHW8.1
#=GS D4DZ72_SEROD/2-181        AC D4DZ72.1
#=GS A0A1G9DPQ5_9ACTN/3-168    AC A0A1G9DPQ5.1
#=GS A0A2T0M323_9PSEU/1-156    AC A0A2T0M323.1
#=GS A0A3S5EIB8_MYCCI/1-157    AC A0A3S5EIB8.1
#=GS R6NFI9_9BACE/3-164        AC R6NFI9.1
#=GS A0A372J693_9ACTN/2-157    AC A0A372J693.1
#=GS G8QK10_AZOOP/1-160        AC G8QK10.1
#=GS A0A1K1LP84_9BACT/3-163    AC A0A1K1LP84.1
#=GS A0A1Q2HXZ9_9CORY/1-156    AC A0A1Q2HXZ9.1
#=GS A0A177IRE0_9CORY/1-156    AC A0A177IRE0.1
#=GS A0A1E1F5P0_9SPHN/1-149    AC A0A1E1F5P0.1
#=GS A1TAY6_MYCVP/1-156        AC A1TAY6.1
#=GS A0A328PT36_9BACT/3-163    AC A0A328PT36.1
#=GS Q6U9T1_9CAUD/5-196        AC Q6U9T1.1
#=GS A0A0I9U2S7_9MYCO/1-160    AC A0A0I9U2S7.1
#=GS A0A1A0MA55_9MYCO/1-157    AC A0A1A0MA55.1
#=GS A0A0A0RL02_9CAUD/1-180    AC A0A0A0RL02.1
#=GS A0A072TD21_MEDTR/21-168   AC A0A072TD21.1
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#=GS A0A366ELD9_9RHIZ/1-151    AC A0A366ELD9.1
#=GS A0A374ACM1_9BACT/3-164    AC A0A374ACM1.1
#=GS A0A0K1LQ45_9CAUD/6-197    AC A0A0K1LQ45.1
#=GS M4SJR8_9SPHN/1-147        AC M4SJR8.1
#=GS D4HTX2_9CAUD/65-241       AC D4HTX2.1
#=GS A0A1G7BJL1_9NOCA/1-157    AC A0A1G7BJL1.1
#=GS A0A420F637_9ACTN/3-162    AC A0A420F637.1
#=GS A0A1A1XXG4_9MYCO/1-157    AC A0A1A1XXG4.1
#=GS A0A1H5AIY7_9ACTN/10-191   AC A0A1H5AIY7.1
#=GS A0A1H9HBT6_9BACT/2-200    AC A0A1H9HBT6.1
#=GS A0A1I2RG04_9CORY/1-157    AC A0A1I2RG04.1
#=GS A0A1B2ANM3_9CAUD/3-168    AC A0A1B2ANM3.1
#=GS G1W8M9_9BACT/3-163        AC G1W8M9.1
#=GS A0A1H8VMZ4_9ACTN/4-159    AC A0A1H8VMZ4.1
#=GS M4MHP8_9CAUD/6-180        AC M4MHP8.1
#=GS A0A367NDW7_9PSED/6-176    AC A0A367NDW7.1
#=GS C3PHH7_CORA7/1-156        AC C3PHH7.1
#=GS Q8X280_ECO57/641-813      AC Q8X280.1
#=GS R5AMR2_9BACT/3-162        AC R5AMR2.1
#=GS A0A1I7AQP3_9ACTN/2-157    AC A0A1I7AQP3.1
#=GS A0A264Y4I0_9BACT/3-162    AC A0A264Y4I0.1
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#=GS C7PD13_CHIPD/2-163        AC C7PD13.1
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#=GS A0A1B2IHD3_9CAUD/21-211   AC A0A1B2IHD3.1
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#=GS M3TB79_9ACTN/1-156        AC M3TB79.1
#=GS D0UWG4_9CAUD/2-193        AC D0UWG4.1
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#=GS A0A1Q8CR87_9PSEU/1-156    AC A0A1Q8CR87.1
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#=GS A0A0A0RS84_9CAUD/1-174    AC A0A0A0RS84.1
#=GS A0A1T5IQ58_9BACT/3-164    AC A0A1T5IQ58.1
#=GS A0A2I6PFU9_9CAUD/3-202    AC A0A2I6PFU9.1
#=GS L1N2A8_9BACT/3-163        AC L1N2A8.1
#=GS A0A3N0FD27_9ACTN/3-163    AC A0A3N0FD27.1
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