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Database: Pfam
Entry: FRQ
LinkDB: FRQ
Original site: FRQ 
#=GF ID   FRQ
#=GF AC   PF09421.11
#=GF DE   Frequency clock protein
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Griffiths-Jones S
#=GF GA   26.60 26.60;
#=GF TC   26.90 28.20;
#=GF NC   24.50 26.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   6455327
#=GF RT   The frq locus in Neurospora crassa: a key element in circadian
#=GF RT   clock organization. 
#=GF RA   Gardner GF, Feldman JF; 
#=GF RL   Genetics. 1980;96:877-886.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226160
#=GF RT   Coiled-coil domain-mediated FRQ-FRQ interaction is essential for
#=GF RT   its circadian clock function in Neurospora. 
#=GF RA   Cheng P, Yang Y, Heintzen C, Liu Y; 
#=GF RL   EMBO J. 2001;20:101-108.
#=GF DR   INTERPRO; IPR018554;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The frequency clock protein, is the central component of the
#=GF CC   frq-based circadian negative feedback loop, regulates various
#=GF CC   aspects of the circadian clock in Neurospora crassa [2]. This
#=GF CC   protein has been shown to interact with itself via a coiled-coil
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   382
#=GS A0A2L2TF02_9HYPO/13-1002   AC A0A2L2TF02.1
#=GS A0A167ZDW8_9HYPO/13-986    AC A0A167ZDW8.1
#=GS A0A1Y2V000_9PEZI/13-926    AC A0A1Y2V000.1
#=GS A0A2X0NTB1_9BASI/335-457   AC A0A2X0NTB1.1
#=GS A0A2S6CI72_9PEZI/14-953    AC A0A2S6CI72.1
#=GS A0A397TJC2_9GLOM/1-194     AC A0A397TJC2.1
#=GS A0A1J9RXW5_9PEZI/2-930     AC A0A1J9RXW5.1
#=GS X0D0E3_FUSOX/13-990        AC X0D0E3.1
#=GS A0A2X0KGG8_9BASI/197-311   AC A0A2X0KGG8.1
#=GS U4L1L8_PYROM/221-634       AC U4L1L8.1
#=GS A0A0D9PDY9_METAN/14-1001   AC A0A0D9PDY9.1
#=GS A0A225BEI5_9EURO/28-210    AC A0A225BEI5.1
#=GS A0A2V1D533_9PLEO/706-1215  AC A0A2V1D533.1
#=GS A0A428U004_9HYPO/13-995    AC A0A428U004.1
#=GS K1X2P6_MARBU/140-1086      AC K1X2P6.1
#=GS S8CAE7_DACHA/394-959       AC S8CAE7.1
#=GS A0A1B8AMU3_FUSPO/6-986     AC A0A1B8AMU3.1
#=GS A0A2V1D533_9PLEO/382-704   AC A0A2V1D533.1
#=GS A0A165I8T0_XYLHT/22-653    AC A0A165I8T0.1
#=GS A0A395T152_9HYPO/14-994    AC A0A395T152.1
#=GS A0A2H3TXG3_FUSOX/1-271     AC A0A2H3TXG3.1
#=GS W6ZHV6_COCMI/8-925         AC W6ZHV6.1
#=GS A0A2A9PLG4_9HYPO/28-1009   AC A0A2A9PLG4.1
#=GS A0A1Z5TUW0_HORWE/24-678    AC A0A1Z5TUW0.1
#=GS G4NDN6_MAGO7/7-94          AC G4NDN6.1
#=GS W9HBL5_9HYPO/136-657       AC W9HBL5.1
#=GS A0A369GXF9_9HYPO/12-991    AC A0A369GXF9.1
#=GS M2SG02_COCSN/8-953         AC M2SG02.1
#=GS A0A2S4L173_9HYPO/13-958    AC A0A2S4L173.1
#=GS A0A2K1QRA4_9PEZI/7-932     AC A0A2K1QRA4.1
#=GS G1X6Y9_ARTOA/466-964       AC G1X6Y9.1
#=GS A0A423X2D2_9PEZI/12-953    AC A0A423X2D2.1
#=GS A0A177C9P8_9PLEO/4-949     AC A0A177C9P8.1
#=GS A0A238FNK9_9BASI/534-727   AC A0A238FNK9.1
#=GS F7VVY1_SORMK/267-922       AC F7VVY1.1
#=GS S8CAE7_DACHA/94-456        AC S8CAE7.1
#=GS A0A0B4IH08_METMF/14-1003   AC A0A0B4IH08.1
#=GS A0A0A1TKC8_9HYPO/8-1014    AC A0A0A1TKC8.1
#=GS A0A0D2CVD7_9EURO/13-780    AC A0A0D2CVD7.1
#=GS A0A395M9K5_9HYPO/3-834     AC A0A395M9K5.1
#=GS A0A1C1CX91_9EURO/13-777    AC A0A1C1CX91.1
#=GS G2WSS3_VERDV/13-981        AC G2WSS3.1
#=GS A0A179EYK0_METCM/1-200     AC A0A179EYK0.1
#=GS S3BSL4_OPHP1/796-925       AC S3BSL4.1
#=GS A0A166Z9L2_9PEZI/81-1043   AC A0A166Z9L2.1
#=GS A0A0C4DUV7_MAGP6/9-969     AC A0A0C4DUV7.1
#=GS W9CLX9_SCLBF/34-959        AC W9CLX9.1
#=GS A0A072P233_9EURO/10-777    AC A0A072P233.1
#=GS A0A428NPF6_9HYPO/13-995    AC A0A428NPF6.1
#=GS G3J7U4_CORMM/6-961         AC G3J7U4.1
#=GS F9FNG8_FUSOF/5-178         AC F9FNG8.1
#=GS A0A2G5HT09_CERBT/14-943    AC A0A2G5HT09.1
#=GS A0A366S127_9HYPO/13-991    AC A0A366S127.1
#=GS A0A169YIG6_CORDF/8-962     AC A0A169YIG6.1
#=GS L2FIN8_COLFN/798-959       AC L2FIN8.1
#=GS A0A0D2YFL6_FUSO4/6-836     AC A0A0D2YFL6.1
#=GS R0IJ51_SETT2/7-964         AC R0IJ51.1
#=GS A0A0D2A8I8_9PEZI/16-962    AC A0A0D2A8I8.1
#=GS S3BSL4_OPHP1/48-417        AC S3BSL4.1
#=GS A0A364KYU4_9EURO/2-182     AC A0A364KYU4.1
#=GS A0A2H2ZI92_9HYPO/10-1011   AC A0A2H2ZI92.1
#=GS C9SGJ5_VERA1/13-846        AC C9SGJ5.1
#=GS J3NVQ4_GAGT3/6-960         AC J3NVQ4.1
#=GS N4UF71_FUSC1/13-989        AC N4UF71.1
#=GS F9FDK5_FUSOF/1-271         AC F9FDK5.1
#=GS A0A0D2YFR9_FUSO4/2-692     AC A0A0D2YFR9.1
#=GS A0A2J6RVD4_9HELO/7-986     AC A0A2J6RVD4.1
#=GS A0A2P5HP37_9PEZI/14-983    AC A0A2P5HP37.1
#=GS A0A365MJQ7_GIBIN/13-990    AC A0A365MJQ7.1
#=GS A0A2T4AY40_9HYPO/10-1012   AC A0A2T4AY40.1
#=GS A0A1Y2E7G9_9PEZI/13-786    AC A0A1Y2E7G9.1
#=GS A0A0N0V4W9_FUSLA/7-841     AC A0A0N0V4W9.1
#=GS A0A428R5F3_9HYPO/13-995    AC A0A428R5F3.1
#=GS A0A2X0MD47_9BASI/155-316   AC A0A2X0MD47.1
#=GS F9F185_FUSOF/1-137         AC F9F185.1
#=GS A0A2X0KFL0_9BASI/334-475   AC A0A2X0KFL0.1
#=GS A0A0D1Z5G2_9EURO/14-768    AC A0A0D1Z5G2.1
#=GS K2RYF1_MACPH/6-951         AC K2RYF1.1
#=GS A0A2X0MD47_9BASI/547-741   AC A0A2X0MD47.1
#=GS A0A2T3ZI29_9HYPO/11-998    AC A0A2T3ZI29.1
#=GS A0A0K3C7A0_RHOTO/495-680   AC A0A0K3C7A0.1
#=GS A0A0D2YDQ4_FUSO4/16-550    AC A0A0D2YDQ4.1
#=GS X0BGP0_FUSOX/1-726         AC X0BGP0.1
#=GS A0A2I0S827_9PEZI/13-952    AC A0A2I0S827.1
#=GS A0A1V1SYI6_9FUNG/14-822    AC A0A1V1SYI6.1
#=GS A0A1Y2G1J5_9BASI/151-288   AC A0A1Y2G1J5.1
#=GS A0A084RI20_STACH/11-999    AC A0A084RI20.1
#=GS A0A2I1G1A2_9GLOM/281-468   AC A0A2I1G1A2.1
#=GS A0A084QSS4_STAC4/11-999    AC A0A084QSS4.1
#=GS A0A0D2YF66_FUSO4/3-836     AC A0A0D2YF66.1
#=GS A0A395SLH7_FUSSP/13-991    AC A0A395SLH7.1
#=GS A0A238FD07_9BASI/519-685   AC A0A238FD07.1
#=GS A0A2H3SNZ4_FUSOX/20-841    AC A0A2H3SNZ4.1
#=GS A0A2H3ELN8_9HELO/277-383   AC A0A2H3ELN8.1
#=GS A0A2V1D606_9PLEO/2-335     AC A0A2V1D606.1
#=GS M2V4H4_COCH5/39-881        AC M2V4H4.1
#=GS A0A090D7Y4_PODAN/7-955     AC A0A090D7Y4.1
#=GS A0A177D6C6_ALTAL/8-962     AC A0A177D6C6.1
#=GS A0A395RKL6_FUSSP/8-841     AC A0A395RKL6.1
#=GS A0A1E1KTR7_9HELO/7-979     AC A0A1E1KTR7.1
#=GS A0A2H3IEP7_9EURO/9-193     AC A0A2H3IEP7.1
#=GS A0A2H3GD53_FUSOX/1-464     AC A0A2H3GD53.1
#=GS W9W555_9EURO/13-774        AC W9W555.1
#=GS A0A2S5BFS3_9BASI/270-375   AC A0A2S5BFS3.1
#=GS A0A395MX24_9HYPO/5-620     AC A0A395MX24.1
#=GS A0A2K0VV82_GIBNY/12-990    AC A0A2K0VV82.1
#=GS A0A178DNB7_9PLEO/8-966     AC A0A178DNB7.1
#=GS E9DWB8_METAQ/14-1003       AC E9DWB8.1
#=GS A0A2P4Z7M5_9HYPO/1-149     AC A0A2P4Z7M5.1
#=GS A0A2K0WJB8_GIBNY/1-734     AC A0A2K0WJB8.1
#=GS A0A3N2PMR5_9PEZI/19-1010   AC A0A3N2PMR5.1
#=GS F9GDS1_FUSOF/9-274         AC F9GDS1.1
#=GS A0A364NB42_9PLEO/94-914    AC A0A364NB42.1
#=GS W3XEY3_PESFW/35-990        AC W3XEY3.1
#=GS F7VVY1_SORMK/3-280         AC F7VVY1.1
#=GS G9MNS6_HYPVG/10-1006       AC G9MNS6.1
#=GS A0A225BEI5_9EURO/245-655   AC A0A225BEI5.1
#=GS S3BSL4_OPHP1/1022-1213     AC S3BSL4.1
#=GS W9YNV5_9EURO/19-811        AC W9YNV5.1
#=GS A0A139HDT9_9PEZI/14-944    AC A0A139HDT9.1
#=GS A0A2H3GKN0_FUSOX/7-334     AC A0A2H3GKN0.1
#=GS N1JI82_BLUG1/24-821        AC N1JI82.1
#=GS A0A439D7P7_9PEZI/14-816    AC A0A439D7P7.1
#=GS Q0UYV6_PHANO/397-896       AC Q0UYV6.2
#=GS F9FYL3_FUSOF/13-990        AC F9FYL3.1
#=GS N1PLP0_DOTSN/14-940        AC N1PLP0.1
#=GS W9J5P4_9HYPO/13-989        AC W9J5P4.1
#=GS A0A0A2VTC9_BEABA/8-963     AC A0A0A2VTC9.1
#=GS FRQ_NEUCR/13-984           AC P19970.3
#=GS W7LUZ3_GIBM7/13-990        AC W7LUZ3.1
#=GS A0A2Z6R0I4_9GLOM/22-270    AC A0A2Z6R0I4.1
#=GS N1S170_FUSC4/13-989        AC N1S170.1
#=GS A0A194VCG3_9PEZI/13-962    AC A0A194VCG3.1
#=GS F9F9R1_FUSOF/6-148         AC F9F9R1.1
#=GS A0A1V8UX91_9PEZI/2-601     AC A0A1V8UX91.1
#=GS G2XRI8_BOTF4/3-948         AC G2XRI8.1
#=GS A0A136IYV1_9PEZI/41-1018   AC A0A136IYV1.1
#=GS F9GB65_FUSOF/1-221         AC F9GB65.1
#=GS A0A2J6PIX5_9HELO/177-1158  AC A0A2J6PIX5.1
#=GS A0A0D2C8W7_9EURO/3-580     AC A0A0D2C8W7.1
#=GS A0A2H5TY96_RHIID/263-444   AC A0A2H5TY96.1
#=GS M7STB7_EUTLA/2-671         AC M7STB7.1
#=GS A0A1X7RWS0_ZYMTR/16-943    AC A0A1X7RWS0.1
#=GS A0A2X0KFL0_9BASI/481-699   AC A0A2X0KFL0.1
#=GS L2FIN8_COLFN/10-801        AC L2FIN8.1
#=GS A0A179FLI0_METCM/14-995    AC A0A179FLI0.1
#=GS S0DWZ4_GIBF5/534-958       AC S0DWZ4.1
#=GS A0A423VWY9_9PEZI/13-953    AC A0A423VWY9.1
#=GS A0A074X976_AURPU/20-915    AC A0A074X976.1
#=GS A0A317SER5_9PEZI/426-874   AC A0A317SER5.1
#=GS W9HBZ4_9HYPO/1-97          AC W9HBZ4.1
#=GS A0A395MYQ4_9HYPO/13-991    AC A0A395MYQ4.1
#=GS A0A1G4AQG4_9PEZI/12-973    AC A0A1G4AQG4.1
#=GS A0A2K0W9Q0_GIBNY/1-789     AC A0A2K0W9Q0.1
#=GS A0A2S7R0W3_9HELO/4-958     AC A0A2S7R0W3.1
#=GS U5H6Q4_USTV1/479-713       AC U5H6Q4.1
#=GS M7U578_BOTF1/3-947         AC M7U578.1
#=GS F9GBR4_FUSOF/6-175         AC F9GBR4.1
#=GS W9HC58_9HYPO/1-80          AC W9HC58.1
#=GS A0A2K3QMX4_9HYPO/46-964    AC A0A2K3QMX4.1
#=GS A0A125PI35_9BASI/496-629   AC A0A125PI35.1
#=GS A0A0N1NXH3_9EURO/14-663    AC A0A0N1NXH3.1
#=GS E9EXC4_METRA/14-1003       AC E9EXC4.2
#=GS W9IB52_9HYPO/5-844         AC W9IB52.1
#=GS A0A372R5Q1_9GLOM/70-251    AC A0A372R5Q1.1
#=GS F9F3F8_FUSOF/2-865         AC F9F3F8.1
#=GS A0A2H3HSB5_FUSOX/13-990    AC A0A2H3HSB5.1
#=GS A0A3N4LUX2_9PEZI/237-857   AC A0A3N4LUX2.1
#=GS A0A0K3C7A0_RHOTO/158-321   AC A0A0K3C7A0.1
#=GS A0A2H3ELN8_9HELO/381-817   AC A0A2H3ELN8.1
#=GS A0A218Z8S7_9HELO/12-979    AC A0A218Z8S7.1
#=GS X0C3C7_FUSOX/2-317         AC X0C3C7.1
#=GS A0A0D2XUV2_FUSO4/13-981    AC A0A0D2XUV2.1
#=GS A0A098DEF2_GIBZE/570-640   AC A0A098DEF2.1
#=GS F0XNA6_GROCL/54-1050       AC F0XNA6.1
#=GS G1X6Y9_ARTOA/65-470        AC G1X6Y9.1
#=GS B2WNS0_PYRTR/4-929         AC B2WNS0.1
#=GS A0A2H3U4B7_FUSOX/46-126    AC A0A2H3U4B7.1
#=GS A0A194SBP0_RHOGW/269-372   AC A0A194SBP0.1
#=GS A0A1L7XGL1_9HELO/6-989     AC A0A1L7XGL1.1
#=GS A0A2V1DEC9_9PLEO/329-751   AC A0A2V1DEC9.1
#=GS B8M9C0_TALSN/214-661       AC B8M9C0.1
#=GS A0A3N4KJY0_9PEZI/499-911   AC A0A3N4KJY0.1
#=GS A0A365NFV1_GIBIN/3-844     AC A0A365NFV1.1
#=GS A0A1V1SYI6_9FUNG/820-1004  AC A0A1V1SYI6.1
#=GS A0A2W1EL12_9PLEO/4-929     AC A0A2W1EL12.1
#=GS A0A168EAF7_9HYPO/1-874     AC A0A168EAF7.1
#=GS A0A2H3ELN8_9HELO/9-283     AC A0A2H3ELN8.1
#=GS F9GDQ5_FUSOF/2-150         AC F9GDQ5.1
#=GS A0A178ABY7_9PLEO/8-963     AC A0A178ABY7.1
#=GS A0A0B1P4J1_UNCNE/49-854    AC A0A0B1P4J1.1
#=GS A0A3N4JPI0_9PEZI/92-526    AC A0A3N4JPI0.1
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