#=GF ID   Flu_M1_C
#=GF AC   PF08289.15
#=GF DE   Influenza Matrix protein (M1) C-terminal domain
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_30 (Release 17.0)
#=GF GA   22.30 22.30;
#=GF TC   22.30 147.90;
#=GF NC   22.20 21.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12590584
#=GF RT   Zinc- and pH-dependent conformational transition in a putative
#=GF RT   interdomain linker region of the influenza virus matrix protein
#=GF RT   M1. 
#=GF RA   Okada A, Miura T, Takeuchi H; 
#=GF RL   Biochemistry 2003;42:1978-1984.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013188;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This region is thought to be a second domain of the M1 matrix
#=GF CC   protein.
#=GF SQ   31
#=GS G7WV27_9INFA/158-252      AC G7WV27.1
#=GS A0S734_9INFA/158-252      AC A0S734.1
#=GS M1_I68A5/158-252          AC Q67180.1
#=GS A0A8J2Y2U3_9PROT/158-252  AC A0A8J2Y2U3.1
#=GS V5SN61_9INFA/158-252      AC V5SN61.1
#=GS A3DRT6_9INFA/158-252      AC A3DRT6.1
#=GS A0A8J2V5G5_9PROT/66-160   AC A0A8J2V5G5.1
#=GS Q6VGH7_9INFA/158-252      AC Q6VGH7.1
#=GS A0A2V5KYF6_9MICC/158-252  AC A0A2V5KYF6.1
#=GS E6XY44_9INFA/158-252      AC E6XY44.1
#=GS Q07FT2_9INFA/158-252      AC Q07FT2.1
#=GS A0A172SNN7_9INFB/158-248  AC A0A172SNN7.1
#=GS M1_I66A1/158-252          AC Q0A457.1
#=GS M1_INBLE/158-248          AC P03489.1
#=GS A0T1I8_9INFA/158-252      AC A0T1I8.1
#=GS Q6DPW4_9INFA/158-252      AC Q6DPW4.1
#=GS A0A0B4UX07_9INFA/97-191   AC A0A0B4UX07.1
#=GS A0A0B4UVX5_9INFA/158-252  AC A0A0B4UVX5.1
#=GS A0A2S3ZR30_ARTGL/158-252  AC A0A2S3ZR30.1
#=GS Q71FN1_9INFA/158-252      AC Q71FN1.1
#=GS E4UF17_9INFA/158-252      AC E4UF17.1
#=GS Q0QHF8_9INFA/158-252      AC Q0QHF8.1
#=GS Q20P23_I63A3/158-252      AC Q20P23.1
#=GS G7WV29_9INFA/158-252      AC G7WV29.1
#=GS A0A838L7H5_9SPHN/97-191   AC A0A838L7H5.1
#=GS B2ZV39_9INFA/158-252      AC B2ZV39.1
#=GS A2V6K6_9INFA/158-252      AC A2V6K6.1
#=GS M1_I34A1/158-252          AC P03485.1
#=GS A0A2V5JJ01_9MICC/158-252  AC A0A2V5JJ01.1
#=GS F2P1E2_I66A1/158-252      AC F2P1E2.1
#=GS M1_I96A0/158-252          AC Q9Q0L8.1
G7WV27_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTVGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0S734_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
M1_I68A5/158-252                     .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRAIGTPPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A8J2Y2U3_9PROT/158-252             .QHRSHRQMATTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTVGTHPNSSTGLKDDLIENLQAYQNRMG--VQLQRFK
V5SN61_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQTYQKRMG--VQMQRFK
A3DRT6_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVATTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEIASQARQMVQAMRAIGTHPSSSTGLRDDLLENLQTYQKRMG--VQMQRFK
A0A8J2V5G5_9PROT/66-160              .QHRSHRQMATITNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVANQARQMVQAMRTIGTHPNSSTGLRDNLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
Q6VGH7_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A2V5KYF6_9MICC/158-252             .QHRSHRQMATSTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEIASQARQMVQAMRTVGTHPNSSTGLKDDLIENLQAYQNRMG--VQLQRFK
E6XY44_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
Q07FT2_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A172SNN7_9INFB/158-248             .SHRAHSRAARSSVPGVRREMQMVSAMNTAKTMNGMG----KGEDVQKLAEELQSNIGVLRSLGASQKNGEGIAKDVMEVLK--QSSMGNSALVKKYL
M1_I66A1/158-252                     .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
M1_INBLE/158-248                     .SHRAHSRAARSSVPGVRREMQMVSAMNTAKTMNGMG----KGEDVQKLAEELQNNIGVLRSLGASQKNGEGIAKDVMEVLK--QSSMGNSALVRKYL
A0T1I8_9INFA/158-252                 h-HRSHRQMATTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTQPSSSAGLKDDLIENLQAYQKRMG--VQMQRFK
Q6DPW4_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMATITNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEIANQARQMVQAMRTIGTHPNSSAGLRDNLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A0B4UX07_9INFA/97-191              .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A0B4UVX5_9INFA/158-252             .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A2S3ZR30_ARTGL/158-252             .QHRSHRQMATSTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEIASQARQMVQAMRTVGTHPNSSTGLKDDLIENLQAYQNRMG--VQLQRFK
Q71FN1_9INFA/158-252                 h-HRSHRQMATTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGASEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTQPSSSAGLKDDLIENLQAYQKRMG--VQMQRFK
E4UF17_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQIAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--MQMQRFK
Q0QHF8_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTITNPLTRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
Q20P23_I63A3/158-252                 .QHRSHRQMVTITNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
G7WV29_9INFA/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
A0A838L7H5_9SPHN/97-191              .QHRSHRQMATTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTVGTHPNSSTGLKDDLIENLQAYQNRMG--VQLQRFK
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A2V6K6_9INFA/158-252                 h-HRSHRQMATTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTQPSSSAGLKDDLIENLQAYQKRMG--VQMQRFK
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F2P1E2_I66A1/158-252                 .QHRSHRQMVTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
M1_I96A0/158-252                     .QHRSHRQMATTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDNLLENLQAYQKRMG--VQMQRFK
#=GC seq_cons                        .QHRSHRQMsTTTNPLIRHENRMVLASTTAKAMEQMAGSSEQAAEAMEVASQARQMVQAMRTIGTHPSSSAGLKDDLLENLQAYQKRMG..VQMQRFK
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