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Database: Pfam
Entry: Glyco_hydro_42M
LinkDB: Glyco_hydro_42M
Original site: Glyco_hydro_42M 
#=GF ID   Glyco_hydro_42M
#=GF AC   PF08532.11
#=GF DE   Beta-galactosidase trimerisation domain
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_2131 (release 5.4)
#=GF GA   25.80 25.80;
#=GF TC   25.80 25.80;
#=GF NC   25.70 25.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   Glycoside_hydrolase_family_42
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8577281
#=GF RT   Sequence analysis of flanking regions of the pfoA gene of
#=GF RT   Clostridium perfringens: beta-galactosidase gene (pbg) is
#=GF RT   located in the 3'-flanking region. 
#=GF RA   Shimizu T, Kobayashi T, Ba-Thein W, Ohtani K, Hayashi H; 
#=GF RL   Microbiol Immunol 1995;39:677-686.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12215416
#=GF RT   Trimeric crystal structure of the glycoside hydrolase family 42
#=GF RT   beta-galactosidase from Thermus thermophilus A4 and the
#=GF RT   structure of its complex with galactose. 
#=GF RA   Hidaka M, Fushinobu S, Ohtsu N, Motoshima H, Matsuzawa H, Shoun
#=GF RA   H, Wakagi T; 
#=GF RL   J Mol Biol 2002;322:79-91.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013738;
#=GF DR   SCOP; 1kwg; fa;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This is non catalytic domain B of beta-galactosidase enzymes
#=GF CC   belong to the glycosyl hydrolase 42 family. This domain is
#=GF CC   related to glutamine amidotransferase enzymes, but the catalytic
#=GF CC   residues are replaced by non functional amino acids. This domain
#=GF CC   is involved in trimerisation [1].
#=GF SQ   3331
#=GS A0A3N1PS51_9MICO/409-611    AC A0A3N1PS51.1
#=GS A0A1C1A4H7_9BACL/397-608    AC A0A1C1A4H7.1
#=GS A0A0N1FWJ2_9ACTN/398-600    AC A0A0N1FWJ2.1
#=GS A0A3N0FFA5_9ACTN/398-607    AC A0A3N0FFA5.1
#=GS A0A2A2Z6I1_9ACTN/487-652    AC A0A2A2Z6I1.1
#=GS A0A133UEQ5_9EURY/291-481    AC A0A133UEQ5.1
#=GS A0A100Y976_9ACTN/394-592    AC A0A100Y976.1
#=GS R5TTT6_9BACE/431-641        AC R5TTT6.1
#=GS A0A1R3XA97_9MICO/394-594    AC A0A1R3XA97.1
#=GS A0A2G3E277_9FIRM/390-594    AC A0A2G3E277.1
#=GS A0A101QNY6_9ACTN/407-611    AC A0A101QNY6.1
#=GS Q0FG15_9RHOB/400-584        AC Q0FG15.1
#=GS A0A1H1QJL2_9ACTN/414-619    AC A0A1H1QJL2.1
#=GS A0A2A2ZAD4_9ACTN/395-594    AC A0A2A2ZAD4.1
#=GS H1YA89_9SPHI/353-613        AC H1YA89.1
#=GS A0A1G9MMQ4_9ACTN/406-600    AC A0A1G9MMQ4.1
#=GS A0A345H4F2_9FLAO/643-700    AC A0A345H4F2.1
#=GS A0A2W2KAD3_9ACTN/303-503    AC A0A2W2KAD3.1
#=GS A0A401HS49_9BACL/388-595    AC A0A401HS49.1
#=GS A0A1H9G8Q5_9RHIZ/403-593    AC A0A1H9G8Q5.1
#=GS A0A495WQD1_9MICO/402-617    AC A0A495WQD1.1
#=GS A0A084UE79_9RHIZ/400-591    AC A0A084UE79.1
#=GS A0A0M9GNW5_9RHOB/412-604    AC A0A0M9GNW5.1
#=GS Q8RDH1_CALS4/382-535        AC Q8RDH1.1
#=GS A0A1H7M2Y4_9FIRM/404-617    AC A0A1H7M2Y4.1
#=GS S5ZMR6_9CREN/336-496        AC S5ZMR6.1
#=GS U1RD00_9BIFI/422-640        AC U1RD00.1
#=GS A0A0H4L1S8_9RHOB/392-515    AC A0A0H4L1S8.1
#=GS A0A1A8TDE5_9GAMM/410-602    AC A0A1A8TDE5.1
#=GS A0A1G6UZU0_9MICO/418-627    AC A0A1G6UZU0.1
#=GS A0A368YEH5_9BACI/405-614    AC A0A368YEH5.1
#=GS A0A1H2MFS1_9ACTN/406-641    AC A0A1H2MFS1.1
#=GS A0A2T3ANN6_9PEZI/464-686    AC A0A2T3ANN6.1
#=GS A0A124H9K0_9ACTN/397-600    AC A0A124H9K0.1
#=GS A0A2S1Z6V8_9ACTN/401-608    AC A0A2S1Z6V8.1
#=GS A0A1X7M3H0_9BURK/405-599    AC A0A1X7M3H0.1
#=GS A0A373NT24_9FIRM/404-619    AC A0A373NT24.1
#=GS A0A2A7MHT1_9CLOT/376-447    AC A0A2A7MHT1.1
#=GS A6W513_KINRD/393-596        AC A6W513.1
#=GS A0A397LTB7_9MICO/408-625    AC A0A397LTB7.1
#=GS A0A0N0V3E0_9RHOB/401-589    AC A0A0N0V3E0.1
#=GS A0A2W1NCA8_9BACL/372-448    AC A0A2W1NCA8.1
#=GS A0A413HUM6_9FIRM/395-608    AC A0A413HUM6.1
#=GS A0A086ZSV3_9BIFI/399-595    AC A0A086ZSV3.1
#=GS A0A1V2RBD0_9ACTN/410-614    AC A0A1V2RBD0.1
#=GS C9A7I9_ENTCA/394-601        AC C9A7I9.1
#=GS A0A1I4E5P0_9BACL/374-486    AC A0A1I4E5P0.1
#=GS A0A2M9CFD3_9MICO/408-627    AC A0A2M9CFD3.1
#=GS W4QQX6_BACA3/93-299         AC W4QQX6.1
#=GS A0A2V2YE35_9BACL/388-594    AC A0A2V2YE35.1
#=GS A0A1I4UWA3_9RHIZ/371-451    AC A0A1I4UWA3.1
#=GS A0A1H0VXX8_9BACI/411-617    AC A0A1H0VXX8.1
#=GS A0A101TAU7_9ACTN/400-606    AC A0A101TAU7.1
#=GS A0A0Q9CAS3_9CELL/391-609    AC A0A0Q9CAS3.1
#=GS C4ZF63_AGARV/395-601        AC C4ZF63.1
#=GS A0A124IEF7_9ACTN/404-625    AC A0A124IEF7.1
#=GS A0A1M7N5U3_9BACI/398-609    AC A0A1M7N5U3.1
#=GS A0A0L0B8K5_9MICC/386-602    AC A0A0L0B8K5.1
#=GS A0A2U1BBA7_9BACT/405-602    AC A0A2U1BBA7.1
#=GS A0A1A9GCA6_9RHIZ/363-492    AC A0A1A9GCA6.1
#=GS A0A1C7ICH6_9FIRM/62-125     AC A0A1C7ICH6.1
#=GS D2PY42_KRIFD/354-452        AC D2PY42.1
#=GS A0A3A9B178_9BACT/389-599    AC A0A3A9B178.1
#=GS A0A221W8Q7_9PSEU/572-648    AC A0A221W8Q7.1
#=GS R7ITD6_9FIRM/402-616        AC R7ITD6.1
#=GS A0A1T5KZZ1_9MICO/405-615    AC A0A1T5KZZ1.1
#=GS A0A370APW7_9SPIO/368-479    AC A0A370APW7.1
#=GS A0A1H1D277_9ACTN/396-615    AC A0A1H1D277.1
#=GS A0A2G9DCG1_9ACTN/402-600    AC A0A2G9DCG1.1
#=GS A0A3N4UCM0_9ACTN/394-593    AC A0A3N4UCM0.1
#=GS D3Q0A9_STANL/396-606        AC D3Q0A9.1
#=GS A0A1V9FQT1_9BACT/434-642    AC A0A1V9FQT1.1
#=GS A0A238J7X0_9RHOB/410-599    AC A0A238J7X0.1
#=GS A0A1B1AWC3_9ACTN/397-603    AC A0A1B1AWC3.1
#=GS A0A2W1Z2W0_9MICO/389-597    AC A0A2W1Z2W0.1
#=GS A0A0F2C3W4_9MICO/412-624    AC A0A0F2C3W4.1
#=GS B9NVL6_9RHOB/401-588        AC B9NVL6.1
#=GS A0A1X4NJF8_9RHOB/407-595    AC A0A1X4NJF8.1
#=GS D4LQJ0_9FIRM/389-598        AC D4LQJ0.1
#=GS A0A1H9PQG7_9ACTN/400-606    AC A0A1H9PQG7.1
#=GS A0A229UFZ8_9BACL/403-614    AC A0A229UFZ8.1
#=GS A0A3N4S0X6_9ACTN/403-609    AC A0A3N4S0X6.1
#=GS A0A2V4PAZ3_9ACTN/395-597    AC A0A2V4PAZ3.1
#=GS A0A495WLS9_9MICO/401-542    AC A0A495WLS9.1
#=GS A0A1L9PC90_ASPVE/464-679    AC A0A1L9PC90.1
#=GS A0A2T7T7H6_9ACTN/400-606    AC A0A2T7T7H6.1
#=GS A0A1H7N022_STRJI/410-614    AC A0A1H7N022.1
#=GS A0A1Y3Y7G6_9FIRM/457-611    AC A0A1Y3Y7G6.1
#=GS A0A1D2I9M1_9ACTN/394-593    AC A0A1D2I9M1.1
#=GS A0A0F0ENV3_9MICO/396-599    AC A0A0F0ENV3.1
#=GS A0A3D9V6P2_9ACTN/380-563    AC A0A3D9V6P2.1
#=GS A0A1Q4WS86_9ACTN/401-606    AC A0A1Q4WS86.1
#=GS A0A021VYR6_9CELL/400-612    AC A0A021VYR6.1
#=GS A0A2G7END2_9ACTN/428-631    AC A0A2G7END2.1
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#=GS A0A0M9YSH8_9ACTN/400-611    AC A0A0M9YSH8.1
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#=GS A0A0J1ILX2_BACCI/404-614    AC A0A0J1ILX2.1
#=GS S3KIR2_TREMA/399-605        AC S3KIR2.1
#=GS U2BHX5_9CLOT/391-603        AC U2BHX5.1
#=GS A0A371J4Z6_9FIRM/407-620    AC A0A371J4Z6.1
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#=GS A0A1D8FVY9_9ACTN/395-593    AC A0A1D8FVY9.1
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#=GS A0A329MGG8_9BACL/352-510    AC A0A329MGG8.1
#=GS A0A1K1SGA4_9BACT/406-609    AC A0A1K1SGA4.1
#=GS A0Z894_9GAMM/417-610        AC A0Z894.1
#=GS A0A3G2JL33_9ACTN/408-612    AC A0A3G2JL33.1
#=GS A0A250VPY2_STROL/408-617    AC A0A250VPY2.1
#=GS A0A176LA11_9ACTN/395-594    AC A0A176LA11.1
#=GS A0A1N7GMD7_9ACTN/407-611    AC A0A1N7GMD7.1
#=GS V4NWA3_9CAUL/410-613        AC V4NWA3.1
#=GS A0A1W1UQY9_9DEIO/418-612    AC A0A1W1UQY9.1
#=GS A0A268E7L9_9BACI/388-597    AC A0A268E7L9.1
#=GS A0A3L8A1T5_9BACT/409-620    AC A0A3L8A1T5.1
#=GS A0A2I5T6R6_SERS3/403-616    AC A0A2I5T6R6.1
#=GS A0A0B0HHW1_9BACI/167-374    AC A0A0B0HHW1.1
#=GS A0A089L9E4_9BACL/406-617    AC A0A089L9E4.1
#=GS H8E0V5_9MICO/408-612        AC H8E0V5.1
#=GS A0A0A0BX94_9CELL/410-612    AC A0A0A0BX94.1
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#=GS A0A1M6LAL4_9ACTN/379-502    AC A0A1M6LAL4.1
#=GS A0A168G285_9MICO/414-626    AC A0A168G285.1
#=GS F8EWQ4_TRECH/399-625        AC F8EWQ4.1
#=GS D1C035_XYLCX/396-606        AC D1C035.1
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#=GS A0A2A9E9E3_9MICO/393-595    AC A0A2A9E9E3.1
#=GS A0A401UW17_9CELL/399-602    AC A0A401UW17.1
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#=GS A0A3D9ITN6_9BACL/416-595    AC A0A3D9ITN6.1
#=GS A0A0Q7DFK4_9RHIZ/397-607    AC A0A0Q7DFK4.1
#=GS A0A0Q8LWE1_9MICO/399-606    AC A0A0Q8LWE1.1
#=GS A0A124ID93_9ACTN/400-606    AC A0A124ID93.1
#=GS A0A2Z5FYE3_9BACT/428-641    AC A0A2Z5FYE3.1
#=GS A0A0F7FZI5_9ACTN/405-612    AC A0A0F7FZI5.1
#=GS A0A1D8ATM5_9BACT/387-600    AC A0A1D8ATM5.1
#=GS R6KY91_9CLOT/393-602        AC R6KY91.1
#=GS Q5WC61_BACSK/410-615        AC Q5WC61.1
#=GS R6DNE5_9CLOT/397-597        AC R6DNE5.1
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