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Database: Pfam
Entry: HDA2-3
LinkDB: HDA2-3
Original site: HDA2-3 
#=GF ID   HDA2-3
#=GF AC   PF11496.10
#=GF DE   Class II histone deacetylase complex subunits 2 and 3
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Chahwan C
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   27.00 27.00;
#=GF NC   26.90 26.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11287668
#=GF RT   HDA2 and HDA3 are related proteins that interact with and are
#=GF RT   essential for the activity of the yeast histone deacetylase
#=GF RT   HDA1. 
#=GF RA   Wu J, Carmen AA, Kobayashi R, Suka N, Grunstein M; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A. 2001;98:4391-4396.
#=GF DR   INTERPRO; IPR021006;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This family of class II histone deacetylase complex subunits
#=GF CC   HDA2 and HDA3 is found in fungi, The member from S. pombe is
#=GF CC   referred to as Ccq1 in Swiss:Q10432. These proteins associate
#=GF CC   with HDA1 to generate the activity of the HDA1 histone
#=GF CC   deacetylase complex. HDA1 interacts with itself and with the
#=GF CC   HDA2-HDA3 subcomplex to form a probable tetramer and these
#=GF CC   interactions are necessary for catalytic activity. The HDA1
#=GF CC   histone deacetylase complex is responsible for the deacetylation
#=GF CC   of lysine residues on the N-terminal part of the core histones
#=GF CC   (H2A, H2B, H3 and H4). Histone deacetylation gives a tag for
#=GF CC   epigenetic repression and plays an important role in
#=GF CC   transcriptional regulation, cell cycle progression and
#=GF CC   developmental events. HDA2 and HDA3 have a conserved coiled-coil
#=GF CC   domain towards their C-terminus [1].
#=GF SQ   403
#=GS A0A1U7EPZ3_9SACH/26-299     AC A0A1U7EPZ3.1
#=GS A0A0D2CFX5_9EURO/633-886    AC A0A0D2CFX5.1
#=GS A0A0D1XXC8_9PEZI/648-916    AC A0A0D1XXC8.1
#=GS A0A1G4JCQ3_9SACH/7-325      AC A0A1G4JCQ3.1
#=GS A0A166NMB3_9EURO/2-128      AC A0A166NMB3.1
#=GS A0A1E3QTM5_9ASCO/20-329     AC A0A1E3QTM5.1
#=GS A0A317WK43_9EURO/491-762    AC A0A317WK43.1
#=GS W6MGN2_9ASCO/28-356         AC W6MGN2.1
#=GS C5FI52_ARTOC/539-678        AC C5FI52.1
#=GS C0NTL9_AJECG/493-765        AC C0NTL9.1
#=GS G3AIU7_SPAPN/24-307         AC G3AIU7.1
#=GS K0KXX1_WICCF/32-360         AC K0KXX1.1
#=GS A0A3N4LVM2_9PEZI/64-239     AC A0A3N4LVM2.1
#=GS A0A1V6Y4B8_PENNA/525-794    AC A0A1V6Y4B8.1
#=GS A5DA02_PICGU/24-315         AC A5DA02.2
#=GS A0A421JTA2_9ASCO/55-334     AC A0A421JTA2.1
#=GS A0A2B7X683_9EURO/606-878    AC A0A2B7X683.1
#=GS A0A093YI65_9PEZI/877-1125   AC A0A093YI65.1
#=GS J8LGS4_SACAR/26-299         AC J8LGS4.1
#=GS A0A1V6TG98_9EURO/525-794    AC A0A1V6TG98.1
#=GS A1CZX8_NEOFI/281-555        AC A1CZX8.1
#=GS W9CB57_SCLBF/732-987        AC W9CB57.1
#=GS G7XN61_ASPKW/465-729        AC G7XN61.1
#=GS A0A2V1AXF1_9ASCO/56-386     AC A0A2V1AXF1.1
#=GS A7TJC4_VANPO/3-333          AC A7TJC4.1
#=GS C5M7V1_CANTT/62-353         AC C5M7V1.1
#=GS C5DBA1_LACTC/26-300         AC C5DBA1.1
#=GS A0A1L9T377_9EURO/556-827    AC A0A1L9T377.1
#=GS A0A1L9Q2L4_ASPVE/536-808    AC A0A1L9Q2L4.1
#=GS A0A2N3N693_9PEZI/196-447    AC A0A2N3N693.1
#=GS A0A421J972_9ASCO/39-341     AC A0A421J972.1
#=GS A1C4Z9_ASPCL/503-776        AC A1C4Z9.1
#=GS A0A0U5HFZ6_9EURO/537-814    AC A0A0U5HFZ6.1
#=GS A0A0D2K0Y1_9EURO/606-856    AC A0A0D2K0Y1.1
#=GS A0A1L0BF46_9ASCO/32-342     AC A0A1L0BF46.1
#=GS A0A395HQM6_ASPHC/139-408    AC A0A395HQM6.1
#=GS A0A4U0VCB9_9PEZI/761-1020   AC A0A4U0VCB9.1
#=GS G0WGJ8_NAUDC/26-299         AC G0WGJ8.1
#=GS A0A5J5EQP1_9PEZI/556-793    AC A0A5J5EQP1.1
#=GS A0A5N5X7G3_9EURO/142-414    AC A0A5N5X7G3.1
#=GS A0A1L9WH09_ASPA1/528-797    AC A0A1L9WH09.1
#=GS A0A0F7TUP3_PENBI/88-358     AC A0A0F7TUP3.1
#=GS F2SNN6_TRIRC/737-856        AC F2SNN6.1
#=GS A0A448YTE2_BRENA/28-326     AC A0A448YTE2.1
#=GS M3ACT1_PSEFD/45-310         AC M3ACT1.1
#=GS A0A512UEC6_9ASCO/52-267     AC A0A512UEC6.1
#=GS A0A5N6FXH7_PETAA/521-793    AC A0A5N6FXH7.1
#=GS A0A319BXT4_9EURO/531-800    AC A0A319BXT4.1
#=GS A0A443I0L8_BYSSP/489-763    AC A0A443I0L8.1
#=GS A0A3D8T520_9EURO/556-826    AC A0A3D8T520.1
#=GS G8YUF8_PICSO/24-300         AC G8YUF8.1
#=GS A0A2T0FEI2_9ASCO/180-302    AC A0A2T0FEI2.1
#=GS A5DBE6_PICGU/42-345         AC A5DBE6.2
#=GS A0A3M2TD13_9EURO/555-828    AC A0A3M2TD13.1
#=GS A0A2S7QCC0_9HELO/709-857    AC A0A2S7QCC0.1
#=GS W7HLZ9_9PEZI/265-531        AC W7HLZ9.1
#=GS A0A2T0FEI2_9ASCO/31-178     AC A0A2T0FEI2.1
#=GS A0A4Z1PKB3_9PEZI/679-939    AC A0A4Z1PKB3.1
#=GS A0A0A2KVT6_PENEN/523-792    AC A0A0A2KVT6.1
#=GS M7UTZ4_BOTF1/708-963        AC M7UTZ4.1
#=GS W1QKR3_OGAPD/23-316         AC W1QKR3.1
#=GS A0A074YLJ0_AURSE/1037-1238  AC A0A074YLJ0.1
#=GS A0A1B8CZN7_9PEZI/890-1138   AC A0A1B8CZN7.1
#=GS A0A0E9NHA7_SAICN/458-718    AC A0A0E9NHA7.1
#=GS A0A1F7ZZB9_9EURO/517-789    AC A0A1F7ZZB9.1
#=GS A0A5N6KI99_9HELO/29-127     AC A0A5N6KI99.1
#=GS A0A1E5R063_HANUV/30-164     AC A0A1E5R063.1
#=GS A0A1U7LGK4_NEOID/494-758    AC A0A1U7LGK4.1
#=GS A0A4P6XKW7_9ASCO/45-351     AC A0A4P6XKW7.1
#=GS A0A139H301_9PEZI/972-1083   AC A0A139H301.1
#=GS G0VGX8_NAUCC/24-368         AC G0VGX8.1
#=GS A0A5N6D5M0_ASPPA/524-796    AC A0A5N6D5M0.1
#=GS HDA3_ASHGO/26-295           AC Q758V8.2
#=GS J8LJN2_SACAR/7-315          AC J8LJN2.1
#=GS A0A3F3Q0D1_9EURO/464-736    AC A0A3F3Q0D1.1
#=GS W6PZH0_PENRF/473-742        AC W6PZH0.1
#=GS C4R8D4_KOMPG/36-375         AC C4R8D4.1
#=GS A0A139GZS8_9PEZI/2563-2662  AC A0A139GZS8.1
#=GS A0A1E3NDV7_9ASCO/28-326     AC A0A1E3NDV7.1
#=GS A0A0E9NII0_SAICN/478-738    AC A0A0E9NII0.1
#=GS A0A059JAE8_TRIIM/586-737    AC A0A059JAE8.1
#=GS A0A1L9UCG3_ASPBC/484-757    AC A0A1L9UCG3.1
#=GS A0A1V2L2N6_CYBFA/23-280     AC A0A1V2L2N6.1
#=GS H6BX21_EXODN/642-875        AC H6BX21.1
#=GS A0A517KZY6_9PEZI/826-940    AC A0A517KZY6.1
#=GS A0A0J8RGP7_COCIT/160-435    AC A0A0J8RGP7.1
#=GS A0A2I2FP00_9EURO/137-410    AC A0A2I2FP00.1
#=GS A0A093ZM37_9PEZI/873-1120   AC A0A093ZM37.1
#=GS A0A367XXU7_9ASCO/64-337     AC A0A367XXU7.1
#=GS A0A094F7U1_9PEZI/873-1120   AC A0A094F7U1.1
#=GS A0A395H2E6_9EURO/134-406    AC A0A395H2E6.1
#=GS A0A3F2Y561_DEKBR/12-115     AC A0A3F2Y561.1
#=GS A0A3D8RBZ0_9HELO/723-987    AC A0A3D8RBZ0.1
#=GS A0A2B7WJ62_9EURO/608-880    AC A0A2B7WJ62.1
#=GS A0A3F2Y842_DEKBR/28-326     AC A0A3F2Y842.1
#=GS A0A2S7QCC0_9HELO/865-967    AC A0A2S7QCC0.1
#=GS A0A072P3I1_9EURO/644-902    AC A0A072P3I1.1
#=GS A0A2I0RWP8_9PEZI/778-1044   AC A0A2I0RWP8.1
#=GS Q6CTS2_KLULA/6-323          AC Q6CTS2.1
#=GS A0A139H301_9PEZI/820-968    AC A0A139H301.1
#=GS C1GJV3_PARBD/170-440        AC C1GJV3.1
#=GS D5G9L0_TUBMM/122-249        AC D5G9L0.1
#=GS A0A0D2C3E9_9EURO/606-865    AC A0A0D2C3E9.1
#=GS A0A4V6RQP6_9EURO/87-352     AC A0A4V6RQP6.1
#=GS A0A317SDY9_9PEZI/256-364    AC A0A317SDY9.1
#=GS D5G9L0_TUBMM/243-365        AC D5G9L0.1
#=GS A0A319DF82_9EURO/138-410    AC A0A319DF82.1
#=GS A0A2P7YJV2_9ASCO/724-1035   AC A0A2P7YJV2.1
#=GS M3IV28_CANMX/55-327         AC M3IV28.1
#=GS A0A0F8U2C0_9EURO/549-823    AC A0A0F8U2C0.1
#=GS A0A3L6QH43_PANMI/479-717    AC A0A3L6QH43.1
#=GS A0A2U9R9H7_PICKU/8-385      AC A0A2U9R9H7.1
#=GS C4JM31_UNCRE/158-429        AC C4JM31.1
#=GS A0A2P7YL51_9PEZI/1024-1277  AC A0A2P7YL51.1
#=GS A0A178ZZC3_9EURO/533-785    AC A0A178ZZC3.1
#=GS A0A1X7R6F9_9SACH/1-416      AC A0A1X7R6F9.1
#=GS A0A5M9JWY0_MONFR/29-128     AC A0A5M9JWY0.1
#=GS A0A232LTM4_9EURO/134-407    AC A0A232LTM4.1
#=GS K9GCD3_PEND2/520-790        AC K9GCD3.1
#=GS Q4WEL1_ASPFU/373-647        AC Q4WEL1.1
#=GS H2AV91_KAZAF/6-317          AC H2AV91.1
#=GS A0A100IMB9_ASPNG/609-873    AC A0A100IMB9.1
#=GS E9DB98_COCPS/81-235         AC E9DB98.1
#=GS A0A2H3IE09_9EURO/138-411    AC A0A2H3IE09.1
#=GS G0V9C5_NAUCC/26-299         AC G0V9C5.1
#=GS A0A3N4KSG1_9PEZI/672-826    AC A0A3N4KSG1.1
#=GS A0A1G4JL15_9SACH/26-299     AC A0A1G4JL15.1
#=GS D4AR25_ARTBC/122-274        AC D4AR25.1
#=GS A0A1E3QQJ9_9ASCO/24-303     AC A0A1E3QQJ9.1
#=GS A0A2S6BV33_9PEZI/791-1053   AC A0A2S6BV33.1
#=GS A0A1Q2YLZ5_9ASCO/6-430      AC A0A1Q2YLZ5.1
#=GS Q5AU22_EMENI/562-834        AC Q5AU22.1
#=GS G8ZVB4_TORDC/4-328          AC G8ZVB4.1
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#=GS A0A1V6UBF7_9EURO/522-791    AC A0A1V6UBF7.1
#=GS B6HKK2_PENRW/524-793        AC B6HKK2.1
#=GS A0A2I2GG95_9EURO/123-390    AC A0A2I2GG95.1
#=GS A0A448YGC1_BRENA/17-379     AC A0A448YGC1.1
#=GS L8FNK8_PSED2/887-1035       AC L8FNK8.1
#=GS A0A517KZY6_9PEZI/680-822    AC A0A517KZY6.1
#=GS A0A3M7MKI8_9EURO/702-961    AC A0A3M7MKI8.1
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#=GS A0A1F5LXA0_9EURO/912-1182   AC A0A1F5LXA0.1
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#=GS A0A4U0U416_9PEZI/680-932    AC A0A4U0U416.1
#=GS A0A5N6ZDN7_9EURO/519-791    AC A0A5N6ZDN7.1
#=GS V5FGP0_BYSSN/882-1156       AC V5FGP0.1
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#=GS I2H183_TETBL/4-348          AC I2H183.1
#=GS A0A074VL27_9PEZI/912-1170   AC A0A074VL27.1
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#=GS A0A4Z1J9Z3_9HELO/712-969    AC A0A4Z1J9Z3.1
#=GS A0A2V5HEW6_9EURO/515-784    AC A0A2V5HEW6.1
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#=GS A0A0S7DWJ6_9EURO/530-804    AC A0A0S7DWJ6.1
#=GS A0A1E4TVS2_PACTA/1-291      AC A0A1E4TVS2.1
#=GS A0A510NVL2_9EURO/709-982    AC A0A510NVL2.1
#=GS A0A4U0XV57_9PEZI/132-389    AC A0A4U0XV57.1
#=GS A0A1Y1W1S1_9FUNG/807-1084   AC A0A1Y1W1S1.1
#=GS A0A0J8QTS3_COCIT/613-888    AC A0A0J8QTS3.1
#=GS A0A2B7ZFJ6_9EURO/616-888    AC A0A2B7ZFJ6.1
#=GS A0A1E3PJI9_9ASCO/28-180     AC A0A1E3PJI9.1
#=GS A0A0A2K833_PENIT/526-795    AC A0A0A2K833.1
#=GS A0A167CYV7_9ASCO/34-309     AC A0A167CYV7.1
#=GS A0A017SPG4_9EURO/118-391    AC A0A017SPG4.1
#=GS A0A0G4PSV0_PENCA/524-793    AC A0A0G4PSV0.1
#=GS A0A1V6QUG3_9EURO/524-793    AC A0A1V6QUG3.1
#=GS A0A1X7R2L7_9SACH/26-300     AC A0A1X7R2L7.1
#=GS A0A2T6ZXE7_TUBBO/252-364    AC A0A2T6ZXE7.1
#=GS I2JSD4_DEKBR/1-288          AC I2JSD4.2
#=GS H2APN6_KAZAF/26-303         AC H2APN6.1
#=GS A0A1S7HSB7_9SACH/6-319      AC A0A1S7HSB7.1
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