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Database: Pfam
Entry: LSDAT_euk
LinkDB: LSDAT_euk
Original site: LSDAT_euk 
#=GF ID   LSDAT_euk
#=GF AC   PF18139.1
#=GF DE   SLOG in TRPM
#=GF AU   Iyer LM;0000-0002-4844-2022
#=GF AU   Aravind L;0000-0003-0771-253X
#=GF AU   Burroughs AM;0000-0002-2229-8771
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   Laks
#=GF GA   25.70 25.70;
#=GF TC   25.70 25.80;
#=GF NC   25.40 25.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   26590262
#=GF RT   Comparative genomic analyses reveal a vast, novel network of
#=GF RT   nucleotide-centric systems in biological conflicts, immunity and
#=GF RT   signaling.
#=GF RA   Burroughs AM, Zhang D, Schaffer DE, Iyer LM, Aravind L;
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2015;43:10633-10654.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Family in the SLOG superfamily, found in several eukaryotic
#=GF CC   channels including diverse ciliate channels and the TRPM class
#=GF CC   of animal ion channels. Positioned near the N-terminus of all
#=GF CC   TRPM channels, it is predicted to play a regulatory role for the
#=GF CC   channel in potentially recognizing a universal nucleotide or
#=GF CC   nucleotide-derived ligand [1].
#=GF SQ   2068
#=GS F7D7V0_MACMU/102-365        AC F7D7V0.2
#=GS A0A2K5P6Q4_CERAT/1-265      AC A0A2K5P6Q4.1
#=GS A0A1V4J9Z3_PATFA/110-375    AC A0A1V4J9Z3.1
#=GS F1M7G0_RAT/100-363          AC F1M7G0.3
#=GS TRPM3_HUMAN/153-443         AC Q9HCF6.4
#=GS E0VAW3_PEDHC/181-302        AC E0VAW3.1
#=GS H0X6M7_OTOGA/106-373        AC H0X6M7.1
#=GS A0A287DDX0_ICTTR/148-348    AC A0A287DDX0.1
#=GS A0A183KGC7_9TREM/76-215     AC A0A183KGC7.1
#=GS S9XRM3_CAMFR/1-265          AC S9XRM3.1
#=GS A0A0R3TI71_HYMNN/2-103      AC A0A0R3TI71.1
#=GS A0A096N1N3_PAPAN/38-289     AC A0A096N1N3.2
#=GS A0A1S3HED0_LINUN/325-608    AC A0A1S3HED0.1
#=GS A0A0M0JYM7_9EUKA/23-271     AC A0A0M0JYM7.1
#=GS A0A0R3NQ39_DROPS/192-459    AC A0A0R3NQ39.1
#=GS H2TYQ2_TAKRU/91-380         AC H2TYQ2.1
#=GS A0A1D5QVB2_MACMU/70-146     AC A0A1D5QVB2.1
#=GS A0A0R3NQW3_DROPS/192-459    AC A0A0R3NQW3.1
#=GS G3VZI9_SARHA/107-285        AC G3VZI9.1
#=GS H2SS61_TAKRU/109-374        AC H2SS61.1
#=GS I3MES4_ICTTR/148-348        AC I3MES4.2
#=GS A0A087ZQX8_APIME/129-401    AC A0A087ZQX8.1
#=GS G3P871_GASAC/65-331         AC G3P871.1
#=GS A0A0L8FRJ5_OCTBM/81-350     AC A0A0L8FRJ5.1
#=GS A0A093H1M6_STRCA/1-99       AC A0A093H1M6.1
#=GS A0A1I8IVR7_9PLAT/2-141      AC A0A1I8IVR7.1
#=GS A0A091ES24_CORBR/60-325     AC A0A091ES24.1
#=GS H2KVK2_CLOSI/144-413        AC H2KVK2.1
#=GS A0A1I8IWW2_9PLAT/160-324    AC A0A1I8IWW2.1
#=GS A0A287D2G5_ICTTR/146-346    AC A0A287D2G5.1
#=GS A0A1L8GT93_XENLA/1-265      AC A0A1L8GT93.1
#=GS G5BHU0_HETGA/99-362         AC G5BHU0.1
#=GS A0A093FAG7_TYTAL/1-99       AC A0A093FAG7.1
#=GS A0A2I3HG97_NOMLE/113-378    AC A0A2I3HG97.1
#=GS A0A2I4B7N9_9TELE/83-362     AC A0A2I4B7N9.1
#=GS M3XT24_MUSPF/115-386        AC M3XT24.1
#=GS A0A261A2V8_9PELO/175-438    AC A0A261A2V8.1
#=GS G1RAZ4_NOMLE/115-387        AC G1RAZ4.2
#=GS A0A0K0FFJ9_9BILA/175-443    AC A0A0K0FFJ9.1
#=GS A0A0M0JYB6_9EUKA/1-75       AC A0A0M0JYB6.1
#=GS A0A2D0PQX0_ICTPU/100-365    AC A0A2D0PQX0.1
#=GS A0A2I3LEI4_PAPAN/109-374    AC A0A2I3LEI4.1
#=GS I3KVZ0_ORENI/13-273         AC I3KVZ0.1
#=GS F7HVG4_CALJA/1-169          AC F7HVG4.1
#=GS A0A2K5MZD5_CERAT/106-371    AC A0A2K5MZD5.1
#=GS A0A2K5H7P9_COLAP/109-372    AC A0A2K5H7P9.1
#=GS H2M4U9_ORYLA/124-407        AC H2M4U9.1
#=GS B3S397_TRIAD/1-292          AC B3S397.1
#=GS A0A0G2JYN5_RAT/105-370      AC A0A0G2JYN5.1
#=GS A0A183S061_9TREM/1-94       AC A0A183S061.1
#=GS A0A1S3IHA9_LINUN/128-397    AC A0A1S3IHA9.1
#=GS A0A1I7ZC35_9BILA/116-384    AC A0A1I7ZC35.1
#=GS A0A0N5DMQ9_TRIMR/95-329     AC A0A0N5DMQ9.1
#=GS A0A087TL44_9ARAC/2-159      AC A0A087TL44.1
#=GS H0V5D6_CAVPO/105-370        AC H0V5D6.2
#=GS L5M6D4_MYODS/103-159        AC L5M6D4.1
#=GS L5JYI9_PTEAL/1-194          AC L5JYI9.1
#=GS K1PZA4_CRAGI/4-98           AC K1PZA4.1
#=GS H2TYQ3_TAKRU/90-355         AC H2TYQ3.1
#=GS A0A183TIR6_SCHSO/2-131      AC A0A183TIR6.1
#=GS A0A2D0SCS1_ICTPU/91-356     AC A0A2D0SCS1.1
#=GS A0A1W4W0F6_DROFC/90-357     AC A0A1W4W0F6.1
#=GS A0A1I7V9L9_LOALO/128-396    AC A0A1I7V9L9.1
#=GS A0A182X2A2_ANOQN/94-271     AC A0A182X2A2.1
#=GS A0A0P7UP06_9TELE/2-268      AC A0A0P7UP06.1
#=GS L5LE56_MYODS/92-228         AC L5LE56.1
#=GS A0A1B0GS49_MOUSE/1-209      AC A0A1B0GS49.1
#=GS A0A2K5P6U7_CERAT/124-389    AC A0A2K5P6U7.1
#=GS A0A0Q9XJP9_DROMO/176-443    AC A0A0Q9XJP9.1
#=GS H2L6C4_ORYLA/13-278         AC H2L6C4.1
#=GS H9G8B4_ANOCA/106-371        AC H9G8B4.2
#=GS G4LW05_SCHMA/290-406        AC G4LW05.1
#=GS A0A077Z6J1_TRITR/68-326     AC A0A077Z6J1.1
#=GS A0A1I8FH48_9PLAT/2-78       AC A0A1I8FH48.1
#=GS A0A1S3G3N4_DIPOR/88-356     AC A0A1S3G3N4.1
#=GS F2TZH4_SALR5/117-255        AC F2TZH4.1
#=GS A0A1S3IGZ2_LINUN/128-397    AC A0A1S3IGZ2.1
#=GS A0A087XDN4_POEFO/100-384    AC A0A087XDN4.1
#=GS A0A2K5M7F1_CERAT/139-407    AC A0A2K5M7F1.1
#=GS W5MTC8_LEPOC/150-415        AC W5MTC8.1
#=GS A0A212FKU5_DANPL/57-113     AC A0A212FKU5.1
#=GS A0A093QTR5_PHACA/115-388    AC A0A093QTR5.1
#=GS F7GYC0_CALJA/13-200         AC F7GYC0.1
#=GS I3J330_ORENI/109-374        AC I3J330.1
#=GS G1Q094_MYOLU/20-285         AC G1Q094.1
#=GS A0A0R3NKM8_DROPS/192-459    AC A0A0R3NKM8.1
#=GS A0A1S3NLM3_SALSA/158-426    AC A0A1S3NLM3.1
#=GS K1QTZ5_CRAGI/132-451        AC K1QTZ5.1
#=GS G1NSR2_MYOLU/106-373        AC G1NSR2.1
#=GS A0A091HNN1_CALAN/38-295     AC A0A091HNN1.1
#=GS A0A0R3NKT9_DROPS/97-364     AC A0A0R3NKT9.1
#=GS F6QWI3_MONDO/101-366        AC F6QWI3.2
#=GS A0A1S3PVU6_SALSA/51-314     AC A0A1S3PVU6.1
#=GS A0A091W6M3_OPIHO/38-290     AC A0A091W6M3.1
#=GS A0A0R3X961_HYDTA/56-313     AC A0A0R3X961.1
#=GS V8NRS1_OPHHA/133-398        AC V8NRS1.1
#=GS TRPM4_RAT/89-356            AC Q9ESQ5.2
#=GS A0A0L7LF07_9NEOP/114-262    AC A0A0L7LF07.1
#=GS A0A067R873_ZOONE/95-362     AC A0A067R873.1
#=GS A0A1U7QDA9_MESAU/124-389    AC A0A1U7QDA9.1
#=GS H2NMN5_PONAB/1-265          AC H2NMN5.2
#=GS A0A1I8FPY9_9PLAT/59-117     AC A0A1I8FPY9.1
#=GS F6ZUA5_MACMU/101-364        AC F6ZUA5.2
#=GS A0A096MCA3_POEFO/102-367    AC A0A096MCA3.1
#=GS H0XE03_OTOGA/38-296         AC H0XE03.1
#=GS A0A091ER71_CORBR/94-359     AC A0A091ER71.1
#=GS A0A091I2W6_CALAN/115-386    AC A0A091I2W6.1
#=GS A0A0M0JRP1_9EUKA/53-273     AC A0A0M0JRP1.1
#=GS H2LTM0_ORYLA/4-250          AC H2LTM0.1
#=GS A0A2I4AUC0_9TELE/146-376    AC A0A2I4AUC0.1
#=GS A0A2I3RTQ8_PANTR/153-418    AC A0A2I3RTQ8.1
#=GS A0A158R7H3_TAEAS/188-503    AC A0A158R7H3.1
#=GS A0A087XLQ0_POEFO/79-155     AC A0A087XLQ0.1
#=GS A0A2K5NCL9_CERAT/1-129      AC A0A2K5NCL9.1
#=GS A0A0V1HUD5_9BILA/99-364     AC A0A0V1HUD5.1
#=GS F7HVG1_CALJA/1-249          AC F7HVG1.1
#=GS G3QZC9_GORGO/140-408        AC G3QZC9.2
#=GS A0A2I3TM21_PANTR/155-420    AC A0A2I3TM21.1
#=GS A0A0Q3R4N4_AMAAE/1-265      AC A0A0Q3R4N4.1
#=GS A0A0V0TRK0_9BILA/93-358     AC A0A0V0TRK0.1
#=GS A0A068YEY0_ECHMU/41-182     AC A0A068YEY0.1
#=GS H2RSK3_TAKRU/1-193          AC H2RSK3.1
#=GS TRPM8_RAT/115-386           AC Q8R455.4
#=GS A0A091DPN5_FUKDA/115-248    AC A0A091DPN5.1
#=GS I3MNJ5_ICTTR/115-386        AC I3MNJ5.1
#=GS A0A183TBG6_SCHSO/21-246     AC A0A183TBG6.1
#=GS A0A016V3H2_9BILA/337-601    AC A0A016V3H2.1
#=GS A0A183L9U8_9TREM/135-405    AC A0A183L9U8.1
#=GS A0A1S3PWT2_SALSA/32-297     AC A0A1S3PWT2.1
#=GS A0A286Y056_CAVPO/1-289      AC A0A286Y056.1
#=GS A0A2C9JU86_BIOGL/139-408    AC A0A2C9JU86.1
#=GS D3Z539_MOUSE/1-232          AC D3Z539.2
#=GS W6U243_ECHGR/7-278          AC W6U243.1
#=GS A0A0N4Y0P5_NIPBR/51-98      AC A0A0N4Y0P5.1
#=GS A0A091ICX9_CALAN/58-323     AC A0A091ICX9.1
#=GS H3CXZ4_TETNG/109-374        AC H3CXZ4.1
#=GS A0A0F8D3V7_LARCR/684-963    AC A0A0F8D3V7.1
#=GS A0A0M0JMG8_9EUKA/660-785    AC A0A0M0JMG8.1
#=GS A0A2K5P6U3_CERAT/1-290      AC A0A2K5P6U3.1
#=GS F7HSW2_MACMU/155-420        AC F7HSW2.2
#=GS A0A0V0XH93_TRIPS/116-381    AC A0A0V0XH93.1
#=GS F7GDX3_MONDO/109-374        AC F7GDX3.2
#=GS A0A1A6H0V5_NEOLE/135-345    AC A0A1A6H0V5.1
#=GS L5K8G4_PTEAL/109-374        AC L5K8G4.1
#=GS A0A2G8LMS1_STIJA/65-323     AC A0A2G8LMS1.1
#=GS A0A183QLJ0_9TREM/141-329    AC A0A183QLJ0.1
#=GS A0A093Q746_9PASS/102-366    AC A0A093Q746.1
#=GS A0A1U8C035_MESAU/100-364    AC A0A1U8C035.1
#=GS W4XFE3_STRPU/1-121          AC W4XFE3.1
#=GS F6ZAH7_MONDO/114-385        AC F6ZAH7.2
#=GS A0A2I2ZE19_GORGO/38-310     AC A0A2I2ZE19.1
#=GS A0A194QGK7_PAPXU/75-334     AC A0A194QGK7.1
#=GS A0A094KZE1_ANTCR/115-388    AC A0A094KZE1.1
#=GS A0A2D0PP87_ICTPU/158-423    AC A0A2D0PP87.1
#=GS U3IK56_ANAPL/140-407        AC U3IK56.1
#=GS A0A1S3NLP2_SALSA/96-361     AC A0A1S3NLP2.1
#=GS A0A1S3NH63_SALSA/105-384    AC A0A1S3NH63.1
#=GS H0VIP3_CAVPO/96-359         AC H0VIP3.2
#=GS A0A0R3NRI8_DROPS/192-459    AC A0A0R3NRI8.1
#=GS A0A158Q3C8_DRAME/66-189     AC A0A158Q3C8.1
#=GS A0A158QHA1_HYMNN/79-202     AC A0A158QHA1.1
#=GS W2TBW2_NECAM/61-213         AC W2TBW2.1
#=GS U3KA58_FICAL/106-371        AC U3KA58.1
#=GS E0VAW3_PEDHC/59-184         AC E0VAW3.1
#=GS A0A0R3NKE0_DROPS/192-459    AC A0A0R3NKE0.1
#=GS I3MYM4_ICTTR/140-408        AC I3MYM4.2
#=GS A0A0A0ALI1_CHAVO/94-359     AC A0A0A0ALI1.1
#=GS E3M7R8_CAERE/207-470        AC E3M7R8.1
#=GS A0A0R3T0G6_HYMNN/64-325     AC A0A0R3T0G6.1
#=GS A0A091PP92_LEPDC/92-357     AC A0A091PP92.1
#=GS A0A182UK91_9DIPT/63-236     AC A0A182UK91.1
#=GS A0A183QPS6_9TREM/67-158     AC A0A183QPS6.1
#=GS TRPM5_HUMAN/38-292          AC Q9NZQ8.1
#=GS A0A0L8HB45_OCTBM/57-327     AC A0A0L8HB45.1
#=GS A0A2B4RSR2_STYPI/224-509    AC A0A2B4RSR2.1
#=GS A0A2K5NCI7_CERAT/98-361     AC A0A2K5NCI7.1
#=GS W5MU38_LEPOC/107-372        AC W5MU38.1
#=GS T1IZ08_STRMM/66-366         AC T1IZ08.1
#=GS B4MJT0_DROWI/97-364         AC B4MJT0.2
#=GS A0A0Q3M5K4_AMAAE/7-208      AC A0A0Q3M5K4.1
#=GS A0A068XCI9_HYMMI/96-362     AC A0A068XCI9.2
#=GS A0A0C2H2X4_9BILA/22-277     AC A0A0C2H2X4.1
#=GS A0A226P751_COLVI/153-424    AC A0A226P751.1
#=GS W5N632_LEPOC/106-371        AC W5N632.1
#=GS A0A0A0ANP2_CHAVO/1-99       AC A0A0A0ANP2.1
#=GS A0A087RDD5_APTFO/115-386    AC A0A087RDD5.1
#=GS A0A2I3LN55_PAPAN/112-395    AC A0A2I3LN55.1
#=GS F6UTK9_CANLF/1-171          AC F6UTK9.1
#=GS A0A068XFL3_HYMMI/241-512    AC A0A068XFL3.2
#=GS L8Y3I6_TUPCH/115-377        AC L8Y3I6.1
#=GS B4GBW2_DROPE/90-357         AC B4GBW2.1
#=GS A0A1S3R7C5_SALSA/103-336    AC A0A1S3R7C5.1
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#=GS Q504Y1_HUMAN/1-265          AC Q504Y1.1
#=GS W5KUY2_ASTMX/72-161         AC W5KUY2.1
#=GS A0A1S3R6I7_SALSA/103-339    AC A0A1S3R6I7.1
#=GS F6YDP8_HORSE/138-406        AC F6YDP8.1
#=GS A0A0Q3XAT3_AMAAE/112-237    AC A0A0Q3XAT3.1
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#=GS A0A287BJA4_PIG/106-371      AC A0A287BJA4.1
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#=GS A0A1V4JNM4_PATFA/35-288     AC A0A1V4JNM4.1
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#=GS A0A0V1KZX5_9BILA/93-358     AC A0A0V1KZX5.1
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#=GS TRPM2_RAT/139-408           AC E9PTA2.3
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#=GS TRPM6_MOUSE/100-363         AC Q8CIR4.1
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#=GS A0A0G2KB64_RAT/105-370      AC A0A0G2KB64.1
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#=GS A0A0C4DFT0_HUMAN/65-190     AC A0A0C4DFT0.1
#=GS A0A1U7Q4Q7_MESAU/124-389    AC A0A1U7Q4Q7.1
#=GS A0A2I3RK32_PANTR/109-374    AC A0A2I3RK32.1
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#=GS A0A287D0L9_ICTTR/28-254     AC A0A287D0L9.1
#=GS Q17QV5_BOVIN/1-184          AC Q17QV5.1
#=GS A0A0V1KYJ5_9BILA/93-358     AC A0A0V1KYJ5.1
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#=GS A0A0N4Y0P5_NIPBR/108-312    AC A0A0N4Y0P5.1
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#=GS A0A1I8IX24_9PLAT/117-312    AC A0A1I8IX24.1
#=GS H0WUC4_OTOGA/94-359         AC H0WUC4.1
#=GS A0A091LXP0_CARIC/38-290     AC A0A091LXP0.1
#=GS C3YU15_BRAFL/396-478        AC C3YU15.1
#=GS A0A091QDN8_HALAL/1-100      AC A0A091QDN8.1
#=GS H3B0C1_LATCH/53-322         AC H3B0C1.1
#=GS W5MTD7_LEPOC/150-415        AC W5MTD7.1
#=GS K7GJJ9_PELSI/107-378        AC K7GJJ9.1
#=GS A0A2K5MD35_CERAT/92-357     AC A0A2K5MD35.1
#=GS A0A091DZC2_FUKDA/146-411    AC A0A091DZC2.1
#=GS A0A1I8H3D8_9PLAT/58-158     AC A0A1I8H3D8.1
#=GS G1KI10_ANOCA/60-327         AC G1KI10.2
#=GS A0A094LXJ7_9AVES/38-292     AC A0A094LXJ7.1
#=GS A0A1V4JFG3_PATFA/107-372    AC A0A1V4JFG3.1
#=GS A0A182RUF8_ANOFN/1-95       AC A0A182RUF8.1
#=GS W5QCZ8_SHEEP/115-386        AC W5QCZ8.1
#=GS I3JEU6_ORENI/83-349         AC I3JEU6.1
#=GS TRPM7_MOUSE/106-371         AC Q923J1.1
#=GS G3PCI5_GASAC/113-378        AC G3PCI5.1
#=GS H2TYQ6_TAKRU/30-300         AC H2TYQ6.1
#=GS A0A183I078_9BILA/192-460    AC A0A183I078.1
#=GS A0A1D5NWC6_CHICK/1-259      AC A0A1D5NWC6.1
#=GS U3J6N9_ANAPL/106-373        AC U3J6N9.1
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#=GS TRPM4_MOUSE/89-356          DR PDB; 6BCO C; 89-356;
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#=GS F1NGK6_CHICK/149-417        AC F1NGK6.2
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