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Database: Pfam
Entry: LSDAT_euk
LinkDB: LSDAT_euk
Original site: LSDAT_euk 
#=GF ID   LSDAT_euk
#=GF AC   PF18139.2
#=GF DE   SLOG in TRPM
#=GF AU   Iyer LM;0000-0002-4844-2022
#=GF AU   Aravind L;0000-0003-0771-253X
#=GF AU   Burroughs AM;0000-0002-2229-8771
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   Laks
#=GF GA   25.70 25.70;
#=GF TC   26.50 26.50;
#=GF NC   25.50 25.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   26590262
#=GF RT   Comparative genomic analyses reveal a vast, novel network of
#=GF RT   nucleotide-centric systems in biological conflicts, immunity and
#=GF RT   signaling.
#=GF RA   Burroughs AM, Zhang D, Schaffer DE, Iyer LM, Aravind L;
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2015;43:10633-10654.
#=GF DR   INTERPRO; IPR041491;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Family in the SLOG superfamily, found in several eukaryotic
#=GF CC   channels including diverse ciliate channels and the TRPM class
#=GF CC   of animal ion channels. Positioned near the N-terminus of all
#=GF CC   TRPM channels, it is predicted to play a regulatory role for the
#=GF CC   channel in potentially recognizing a universal nucleotide or
#=GF CC   nucleotide-derived ligand [1].
#=GF SQ   3013
#=GS A0A267FW54_9PLAT/126-394    AC A0A267FW54.1
#=GS A0A3B3XBE1_9TELE/24-272     AC A0A3B3XBE1.1
#=GS F7D7V0_MACMU/102-365        AC F7D7V0.2
#=GS A0A2K5P6Q4_CERAT/1-265      AC A0A2K5P6Q4.1
#=GS A0A3P8VW11_CYNSE/109-374    AC A0A3P8VW11.1
#=GS A0A3Q3KND5_9TELE/92-357     AC A0A3Q3KND5.1
#=GS A0A1V4J9Z3_PATFA/110-375    AC A0A1V4J9Z3.1
#=GS F1M7G0_RAT/100-363          AC F1M7G0.3
#=GS A0A3P8UTV8_CYNSE/86-351     AC A0A3P8UTV8.1
#=GS TRPM3_HUMAN/153-443         AC Q9HCF6.4
#=GS E0VAW3_PEDHC/181-302        AC E0VAW3.1
#=GS A0A2C9LUR7_BIOGL/150-327    AC A0A2C9LUR7.1
#=GS A0A2J7Q9Y3_9NEOP/61-323     AC A0A2J7Q9Y3.1
#=GS H0X6M7_OTOGA/106-373        AC H0X6M7.1
#=GS A0A267F5R1_9PLAT/177-457    AC A0A267F5R1.1
#=GS A0A3Q3E7Z3_9LABR/39-180     AC A0A3Q3E7Z3.1
#=GS A0A452GZ28_9SAUR/40-170     AC A0A452GZ28.1
#=GS A0A287DDX0_ICTTR/148-348    AC A0A287DDX0.1
#=GS A0A2K5X0K0_MACFA/1-290      AC A0A2K5X0K0.1
#=GS A0A0R3TI71_HYMNN/2-103      AC A0A0R3TI71.1
#=GS A0A3P8UVM0_CYNSE/26-292     AC A0A3P8UVM0.1
#=GS F6WRZ8_HORSE/1-290          AC F6WRZ8.2
#=GS A0A3Q3E8I9_9LABR/2-127      AC A0A3Q3E8I9.1
#=GS A0A1D5QVB2_MACMU/70-146     AC A0A1D5QVB2.1
#=GS G3VZI9_SARHA/107-285        AC G3VZI9.1
#=GS A0A2K6GU06_PROCO/109-374    AC A0A2K6GU06.1
#=GS A0A452FNT2_CAPHI/130-420    AC A0A452FNT2.1
#=GS I3MES4_ICTTR/148-348        AC I3MES4.2
#=GS A0A2K6LKB3_RHIBE/103-368    AC A0A2K6LKB3.1
#=GS A0A3B4DY61_PYGNA/118-383    AC A0A3B4DY61.1
#=GS A0A087ZQX8_APIME/129-401    AC A0A087ZQX8.1
#=GS A0A2K5TWC9_MACFA/139-407    AC A0A2K5TWC9.1
#=GS G3P871_GASAC/65-331         AC G3P871.1
#=GS A0A0L8FRJ5_OCTBM/81-350     AC A0A0L8FRJ5.1
#=GS A0A093H1M6_STRCA/1-99       AC A0A093H1M6.1
#=GS A0A2R9AX08_PANPA/142-432    AC A0A2R9AX08.1
#=GS A0A091ES24_CORBR/60-325     AC A0A091ES24.1
#=GS W5KS04_ASTMX/101-377        AC W5KS04.2
#=GS M3W6B8_FELCA/88-356         AC M3W6B8.3
#=GS A0A3B3Q5F3_9TELE/108-379    AC A0A3B3Q5F3.1
#=GS A0A3Q3EB68_9LABR/77-317     AC A0A3Q3EB68.1
#=GS A0A3B4WFF6_SERLL/92-357     AC A0A3B4WFF6.1
#=GS A0A443SHC6_9ACAR/175-450    AC A0A443SHC6.1
#=GS A0A3B3YQT6_9TELE/109-377    AC A0A3B3YQT6.1
#=GS A0A2U9BTA0_SCOMX/103-368    AC A0A2U9BTA0.1
#=GS F7I2D0_CALJA/106-371        AC F7I2D0.2
#=GS A0A287D2G5_ICTTR/146-346    AC A0A287D2G5.1
#=GS A0A2T7Q025_POMCA/305-586    AC A0A2T7Q025.1
#=GS A0A1L8GT93_XENLA/1-265      AC A0A1L8GT93.1
#=GS A0A3Q3L4N8_9LABR/38-160     AC A0A3Q3L4N8.1
#=GS G5BHU0_HETGA/99-362         AC G5BHU0.1
#=GS A0A2K5XP29_MANLE/115-386    AC A0A2K5XP29.1
#=GS A0A2Y9TH73_PHYMC/233-498    AC A0A2Y9TH73.2
#=GS A0A3Q0KP99_SCHMA/141-411    AC A0A3Q0KP99.1
#=GS A0A1D5P8X8_CHICK/75-340     AC A0A1D5P8X8.2
#=GS A0A2K5SBA0_CEBCA/108-371    AC A0A2K5SBA0.1
#=GS A0A2I3HG97_NOMLE/113-378    AC A0A2I3HG97.1
#=GS A0A2I4B7N9_9TELE/83-362     AC A0A2I4B7N9.1
#=GS A0A1S3WSI9_ERIEU/88-355     AC A0A1S3WSI9.1
#=GS M3XT24_MUSPF/115-386        AC M3XT24.1
#=GS A0A261A2V8_9PELO/175-438    AC A0A261A2V8.1
#=GS G1RAZ4_NOMLE/115-387        AC G1RAZ4.2
#=GS A0A3B3R8B1_9TELE/121-386    AC A0A3B3R8B1.1
#=GS A0A0K0FFJ9_STRVS/175-443    AC A0A0K0FFJ9.1
#=GS A0A2D0PQX0_ICTPU/100-365    AC A0A2D0PQX0.1
#=GS A0A2I3LEI4_PAPAN/109-374    AC A0A2I3LEI4.1
#=GS A0A3P9BVC3_9CICH/108-373    AC A0A3P9BVC3.1
#=GS A0A2K5S2D0_CEBCA/1-265      AC A0A2K5S2D0.1
#=GS I3KVZ0_ORENI/13-273         AC I3KVZ0.1
#=GS A0A3P8SW67_AMPPE/5-269      AC A0A3P8SW67.1
#=GS A0A384A517_BALAS/109-372    AC A0A384A517.1
#=GS A0A0A0AY45_CHAVO/38-288     AC A0A0A0AY45.1
#=GS A0A3B4ZAJ9_SERLL/114-379    AC A0A3B4ZAJ9.1
#=GS A0A2K5MZD5_CERAT/106-371    AC A0A2K5MZD5.1
#=GS A0A2K5H7P9_COLAP/109-372    AC A0A2K5H7P9.1
#=GS A0A368GD27_ANCCA/43-130     AC A0A368GD27.1
#=GS A0A3M7QM14_BRAPC/189-330    AC A0A3M7QM14.1
#=GS A0A0R4IB92_DANRE/30-272     AC A0A0R4IB92.1
#=GS A0A0G2JYN5_RAT/105-370      AC A0A0G2JYN5.1
#=GS A0A452HIZ0_9SAUR/112-377    AC A0A452HIZ0.1
#=GS A0A452SG27_URSAM/1-82       AC A0A452SG27.1
#=GS A0A3B4EHB9_PYGNA/139-404    AC A0A3B4EHB9.1
#=GS A0A1S3QKP4_SALSA/67-194     AC A0A1S3QKP4.1
#=GS A0A3P8X867_ESOLU/158-423    AC A0A3P8X867.1
#=GS A0A2Y9N8D7_DELLE/1-265      AC A0A2Y9N8D7.1
#=GS A0A452HIZ2_9SAUR/127-392    AC A0A452HIZ2.1
#=GS A0A183S061_9TREM/1-94       AC A0A183S061.1
#=GS A0A1S3IHA9_LINUN/128-397    AC A0A1S3IHA9.1
#=GS A0A2I2ZTW8_GORGO/88-355     AC A0A2I2ZTW8.1
#=GS A0A087TL44_9ARAC/2-159      AC A0A087TL44.1
#=GS A0A452G8Q1_CAPHI/115-386    AC A0A452G8Q1.1
#=GS H0V5D6_CAVPO/105-370        AC H0V5D6.2
#=GS L5JYI9_PTEAL/1-194          AC L5JYI9.1
#=GS A0A3Q3EIN1_9LABR/1-248      AC A0A3Q3EIN1.1
#=GS A0A183TIR6_SCHSO/2-131      AC A0A183TIR6.1
#=GS A0A2D0SCS1_ICTPU/91-356     AC A0A2D0SCS1.1
#=GS A0A2R8M8I1_CALJA/115-386    AC A0A2R8M8I1.1
#=GS A0A1W4W0F6_DROFC/90-357     AC A0A1W4W0F6.1
#=GS A0A1I7V9L9_LOALO/128-396    AC A0A1I7V9L9.1
#=GS A0A2K6ST20_SAIBB/92-357     AC A0A2K6ST20.1
#=GS A0A3Q1H1H5_ANATE/113-378    AC A0A3Q1H1H5.1
#=GS A0A3Q1EW19_9TELE/123-388    AC A0A3Q1EW19.1
#=GS A0A182X2A2_ANOQN/94-271     AC A0A182X2A2.1
#=GS A0A452I0P1_9SAUR/97-351     AC A0A452I0P1.1
#=GS A0A0P7UP06_SCLFO/2-268      AC A0A0P7UP06.1
#=GS A0A183VNS5_TRIRE/130-199    AC A0A183VNS5.1
#=GS A0A3B3YQL8_9TELE/65-332     AC A0A3B3YQL8.1
#=GS A0A2K5P6U7_CERAT/124-389    AC A0A2K5P6U7.1
#=GS A0A0Q9XJP9_DROMO/176-443    AC A0A0Q9XJP9.1
#=GS A0A3Q1GAW5_9TELE/1-265      AC A0A3Q1GAW5.1
#=GS H9G8B4_ANOCA/106-371        AC H9G8B4.2
#=GS F2TZH4_SALR5/117-255        AC F2TZH4.1
#=GS A0A3Q7TQ87_VULVU/155-420    AC A0A3Q7TQ87.1
#=GS A0A2U4BAP3_TURTR/153-418    AC A0A2U4BAP3.1
#=GS A0A1S3IGZ2_LINUN/128-397    AC A0A1S3IGZ2.1
#=GS A0A087XDN4_POEFO/100-384    AC A0A087XDN4.1
#=GS A0A3M7RW82_BRAPC/123-446    AC A0A3M7RW82.1
#=GS F2TXZ0_SALR5/626-717        AC F2TXZ0.1
#=GS A0A2K5M7F1_CERAT/139-407    AC A0A2K5M7F1.1
#=GS W5MTC8_LEPOC/150-415        AC W5MTC8.1
#=GS A0A212FKU5_DANPL/57-113     AC A0A212FKU5.1
#=GS A0A3B4GMY3_9CICH/81-346     AC A0A3B4GMY3.1
#=GS I3J330_ORENI/109-374        AC I3J330.1
#=GS G1Q094_MYOLU/20-285         AC G1Q094.1
#=GS G1QQT5_NOMLE/38-288         AC G1QQT5.2
#=GS A0A1S3NLM3_SALSA/158-426    AC A0A1S3NLM3.1
#=GS K1QTZ5_CRAGI/132-451        AC K1QTZ5.1
#=GS G1NSR2_MYOLU/106-373        AC G1NSR2.1
#=GS A0A3Q2WRE6_HAPBU/123-388    AC A0A3Q2WRE6.1
#=GS H2R1V3_PANTR/38-287         AC H2R1V3.2
#=GS A0A3Q7VK32_URSAR/140-408    AC A0A3Q7VK32.1
#=GS H3CW36_TETNG/30-288         AC H3CW36.1
#=GS F6QWI3_MONDO/101-366        AC F6QWI3.2
#=GS A0A1S3PVU6_SALSA/51-314     AC A0A1S3PVU6.1
#=GS A0A0R3X961_HYDTA/56-313     AC A0A0R3X961.1
#=GS A0A067R873_ZOONE/95-362     AC A0A067R873.1
#=GS A0A3Q0CKC2_MESAU/124-414    AC A0A3Q0CKC2.1
#=GS A0A3B4DWA9_PYGNA/112-344    AC A0A3B4DWA9.1
#=GS H2NMN5_PONAB/1-265          AC H2NMN5.2
#=GS A0A3P8UYF1_CYNSE/75-340     AC A0A3P8UYF1.1
#=GS A0A3Q1D211_AMPOC/125-390    AC A0A3Q1D211.1
#=GS A0A2K5EJ31_AOTNA/111-374    AC A0A2K5EJ31.1
#=GS F6ZUA5_MACMU/101-364        AC F6ZUA5.2
#=GS A0A096MCA3_POEFO/102-367    AC A0A096MCA3.1
#=GS A0A091ER71_CORBR/94-359     AC A0A091ER71.1
#=GS A0A2D0Q5B7_ICTPU/81-324     AC A0A2D0Q5B7.1
#=GS A0A091I2W6_CALAN/115-386    AC A0A091I2W6.1
#=GS A0A337STS7_FELCA/109-372    AC A0A337STS7.1
#=GS A0A3Q3A8Y5_CHICK/80-345     AC A0A3Q3A8Y5.1
#=GS A0A452HZZ0_9SAUR/99-364     AC A0A452HZZ0.1
#=GS A0A3P8YZT2_ESOLU/66-331     AC A0A3P8YZT2.1
#=GS A0A2I4AUC0_9TELE/146-376    AC A0A2I4AUC0.1
#=GS A0A2I3RTQ8_PANTR/153-418    AC A0A2I3RTQ8.1
#=GS A0A158R7H3_TAEAS/188-503    AC A0A158R7H3.1
#=GS A0A2Y9N4R4_DELLE/153-443    AC A0A2Y9N4R4.1
#=GS A0A2K5BZN4_AOTNA/98-363     AC A0A2K5BZN4.1
#=GS A0A2K5NCL9_CERAT/1-129      AC A0A2K5NCL9.1
#=GS A0A3Q1BWR1_AMPOC/109-374    AC A0A3Q1BWR1.1
#=GS A0A0V1HUD5_9BILA/99-364     AC A0A0V1HUD5.1
#=GS A0A3Q0SN19_AMPCI/7-129      AC A0A3Q0SN19.1
#=GS A0A2Y9NCR0_DELLE/153-418    AC A0A2Y9NCR0.1
#=GS G3QZC9_GORGO/140-408        AC G3QZC9.2
#=GS A0A2I3TM21_PANTR/155-420    AC A0A2I3TM21.1
#=GS A0A0Q3R4N4_AMAAE/1-265      AC A0A0Q3R4N4.1
#=GS A0A0V0TRK0_9BILA/93-358     AC A0A0V0TRK0.1
#=GS TRPM8_RAT/115-386           AC Q8R455.4
#=GS A0A452RU39_URSAM/112-377    AC A0A452RU39.1
#=GS A0A3L8Q804_CHLGU/133-188    AC A0A3L8Q804.1
#=GS I3MNJ5_ICTTR/115-386        AC I3MNJ5.1
#=GS A0A183TBG6_SCHSO/21-246     AC A0A183TBG6.1
#=GS A0A016V3H2_9BILA/337-601    AC A0A016V3H2.1
#=GS A0A369RXU4_9METZ/135-425    AC A0A369RXU4.1
#=GS A0A3P8UNF2_CYNSE/83-349     AC A0A3P8UNF2.1
#=GS A0A2R9ATJ0_PANPA/124-389    AC A0A2R9ATJ0.1
#=GS A0A183L9U8_9TREM/135-405    AC A0A183L9U8.1
#=GS A0A1S3PWT2_SALSA/32-297     AC A0A1S3PWT2.1
#=GS A0A383Z5N8_BALAS/107-372    AC A0A383Z5N8.1
#=GS A0A3Q4G779_NEOBR/1-262      AC A0A3Q4G779.1
#=GS S4R8I5_PETMA/85-316         AC S4R8I5.1
#=GS A0A286Y056_CAVPO/1-289      AC A0A286Y056.1
#=GS A0A2C9JU86_BIOGL/139-408    AC A0A2C9JU86.1
#=GS M7BXS3_CHEMY/146-412        AC M7BXS3.1
#=GS R1B2M1_EMIHU/75-191         AC R1B2M1.1
#=GS D3Z539_MOUSE/1-232          AC D3Z539.2
#=GS A0A2U3VNU2_ODORO/101-364    AC A0A2U3VNU2.1
#=GS A0A3P8W5D1_CYNSE/4-260      AC A0A3P8W5D1.1
#=GS W6U243_ECHGR/7-278          AC W6U243.1
#=GS K1QH82_CRAGI/922-1146       AC K1QH82.1
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