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Database: Pfam
Entry: LYRIC
LinkDB: LYRIC
Original site: LYRIC 
#=GF ID   LYRIC
#=GF AC   PF15686.6
#=GF DE   Lysine-rich CEACAM1 co-isolated protein family
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU   Hetherington K;
#=GF SE   Jackhmmer:Q86UE4
#=GF GA   30.00 30.00;
#=GF TC   32.70 30.00;
#=GF NC   29.90 29.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   14980505
#=GF RT   3D3/lyric: a novel transmembrane protein of the endoplasmic
#=GF RT   reticulum and nuclear envelope, which is also present in the
#=GF RT   nucleolus.
#=GF RA   Sutherland HG, Lam YW, Briers S, Lamond AI, Bickmore WA;
#=GF RL   Exp Cell Res. 2004;294:94-105.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   15383321
#=GF RT   Identification of a novel protein, LYRIC, localized to tight
#=GF RT   junctions of polarized epithelial cells.
#=GF RA   Britt DE, Yang DF, Yang DQ, Flanagan D, Callanan H, Lim YP, Lin
#=GF RA   SH, Hixson DC;
#=GF RL   Exp Cell Res. 2004;300:134-148.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   18440304
#=GF RT   LYRIC/AEG-1 overexpression modulates BCCIPalpha protein levels
#=GF RT   in prostate tumor cells.
#=GF RA   Ash SC, Yang DQ, Britt DE;
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun. 2008;371:333-338.
#=GF DR   INTERPRO; IPR031402;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   LYRIC is a family of proteins found in eukaryotes. It is a
#=GF CC   type-1b membrane protein with a single transmembrane domain and
#=GF CC   localises to the endoplasmic reticulum and the nuclear envelope.
#=GF CC   It is also found in the nucleolus, suggesting functional
#=GF CC   relationships between these two cellular compartments [1]. It is
#=GF CC   found to be colocalised with tight junction proteins ZO-1 and
#=GF CC   occludin in polarised epithelial cells, suggesting that LYRIC is
#=GF CC   part of the tight junction complex [2]. LYRIC has been shown to
#=GF CC   promote tumour cell migration and invasion by activating the
#=GF CC   transcription factor NF-kappaB [3].
#=GF SQ   411
#=GS A0A1S3RWZ6_SALSA/5-323    AC A0A1S3RWZ6.1
#=GS A0A2I2UKZ6_FELCA/320-367  AC A0A2I2UKZ6.1
#=GS H2QWH0_PANTR/6-423        AC H2QWH0.1
#=GS A0A3B4XYH4_SERLL/323-366  AC A0A3B4XYH4.1
#=GS A0A2I2YKU1_GORGO/6-453    AC A0A2I2YKU1.1
#=GS A0A3Q3L8G7_9TELE/4-263    AC A0A3Q3L8G7.1
#=GS M3XF64_FELCA/6-423        AC M3XF64.3
#=GS A0A498MZF4_LABRO/5-416    AC A0A498MZF4.1
#=GS A0A401RJK7_CHIPU/1-73     AC A0A401RJK7.1
#=GS A0A3Q0SDC7_AMPCI/296-341  AC A0A3Q0SDC7.1
#=GS A0A2K6PJY0_RHIRO/342-390  AC A0A2K6PJY0.1
#=GS A0A3Q0S8K6_AMPCI/291-340  AC A0A3Q0S8K6.1
#=GS A0A060Y3M3_ONCMY/1-81     AC A0A060Y3M3.1
#=GS A0A3P8VLN5_CYNSE/4-397    AC A0A3P8VLN5.1
#=GS G3NLN4_GASAC/5-401        AC G3NLN4.1
#=GS A0A096LSJ5_POEFO/4-310    AC A0A096LSJ5.1
#=GS A0A2I3BRF4_MOUSE/1-41     AC A0A2I3BRF4.1
#=GS A0A2Y9JDI5_ENHLU/6-423    AC A0A2Y9JDI5.1
#=GS A0A3P8WK06_CYNSE/5-424    AC A0A3P8WK06.1
#=GS A0A218V694_9PASE/1-142    AC A0A218V694.1
#=GS A0A151MY16_ALLMI/2-264    AC A0A151MY16.1
#=GS A0A1S3Q2V1_SALSA/5-391    AC A0A1S3Q2V1.1
#=GS A0A3B4XYH4_SERLL/6-328    AC A0A3B4XYH4.1
#=GS I3KHV4_ORENI/4-408        AC I3KHV4.1
#=GS A0A087QUR2_APTFO/1-306    AC A0A087QUR2.1
#=GS A0A4D9E4X0_9SAUR/366-471  AC A0A4D9E4X0.1
#=GS A0A3Q2W431_HAPBU/4-389    AC A0A3Q2W431.1
#=GS A0A3Q1INE9_ANATE/5-412    AC A0A3Q1INE9.1
#=GS M3YBF4_MUSPF/6-469        AC M3YBF4.1
#=GS K7G992_PELSI/1-336        AC K7G992.1
#=GS A0A3Q3X6Z8_MOLML/4-153    AC A0A3Q3X6Z8.1
#=GS H3D6Z2_TETNG/5-397        AC H3D6Z2.1
#=GS G5B8Y0_HETGA/1-300        AC G5B8Y0.1
#=GS A0A3Q7VR49_URSAR/343-389  AC A0A3Q7VR49.1
#=GS A0A3Q1GBP8_9TELE/161-277  AC A0A3Q1GBP8.1
#=GS L8YGL8_TUPCH/16-335       AC L8YGL8.1
#=GS A0A2K6C565_MACNE/6-423    AC A0A2K6C565.1
#=GS A0A3Q2HHM7_HORSE/9-426    AC A0A3Q2HHM7.1
#=GS A0A3P8PGI7_ASTCA/4-389    AC A0A3P8PGI7.1
#=GS A0A401NV03_SCYTO/16-399   AC A0A401NV03.1
#=GS A0A2K6TVS8_SAIBB/6-424    AC A0A2K6TVS8.1
#=GS A0A1S3EWZ1_DIPOR/344-390  AC A0A1S3EWZ1.1
#=GS A0A3Q1EMY4_9TELE/4-156    AC A0A3Q1EMY4.1
#=GS A0A226PKI3_COLVI/6-381    AC A0A226PKI3.1
#=GS A0A2Y9P5D6_DELLE/6-431    AC A0A2Y9P5D6.1
#=GS A0A3Q3XEK4_MOLML/5-214    AC A0A3Q3XEK4.1
#=GS A0A401NYS4_SCYTO/5-360    AC A0A401NYS4.1
#=GS A0A1S3RWZ6_SALSA/320-384  AC A0A1S3RWZ6.1
#=GS A0A3Q0S8K6_AMPCI/5-141    AC A0A3Q0S8K6.1
#=GS A0A2R8M918_CALJA/321-367  AC A0A2R8M918.1
#=GS A0A3Q1FHL2_9TELE/5-415    AC A0A3Q1FHL2.1
#=GS W5MUJ8_LEPOC/5-184        AC W5MUJ8.1
#=GS A0A3P9NSS9_POERE/6-421    AC A0A3P9NSS9.1
#=GS A0A096LTN4_POEFO/6-410    AC A0A096LTN4.1
#=GS A0A401NYS4_SCYTO/347-449  AC A0A401NYS4.1
#=GS A0A2Y9EFP6_PHYMC/6-453    AC A0A2Y9EFP6.1
#=GS A0A1S3NEB6_SALSA/314-380  AC A0A1S3NEB6.1
#=GS A0A3B4DTK7_PYGNA/5-439    AC A0A3B4DTK7.1
#=GS A0A2U9AZU3_SCOMX/6-335    AC A0A2U9AZU3.1
#=GS A0A2K5HTE5_COLAP/321-367  AC A0A2K5HTE5.1
#=GS A0A2Y9QR27_TRIMA/6-454    AC A0A2Y9QR27.1
#=GS A0A3P8PYI0_ASTCA/8-310    AC A0A3P8PYI0.1
#=GS A0A3B3DM55_ORYME/4-391    AC A0A3B3DM55.1
#=GS A0A2Y9PD54_DELLE/124-419  AC A0A2Y9PD54.1
#=GS A0A2I3HVK6_NOMLE/319-367  AC A0A2I3HVK6.1
#=GS A0A3Q1JX97_ANATE/4-382    AC A0A3Q1JX97.1
#=GS A0A3P8SFN8_AMPPE/4-391    AC A0A3P8SFN8.1
#=GS A0A3B3VEQ4_9TELE/4-326    AC A0A3B3VEQ4.1
#=GS G1KRW1_ANOCA/7-429        AC G1KRW1.1
#=GS U3FTX9_CALJA/6-423        AC U3FTX9.1
#=GS A0A2K5E061_AOTNA/316-367  AC A0A2K5E061.1
#=GS A0A1U7T8G6_TARSY/6-447    AC A0A1U7T8G6.1
#=GS A0A452HUN5_9SAUR/170-271  AC A0A452HUN5.1
#=GS G1KYS7_ANOCA/1-216        AC G1KYS7.1
#=GS A0A3P9B3C0_9CICH/5-424    AC A0A3P9B3C0.1
#=GS A0A1L8FZL5_XENLA/5-411    AC A0A1L8FZL5.1
#=GS A0A4D9F4D6_9SAUR/199-366  AC A0A4D9F4D6.1
#=GS A8DZ70_DANRE/5-447        AC A8DZ70.1
#=GS A0A3M0L2E3_HIRRU/14-200   AC A0A3M0L2E3.1
#=GS A0A2K5MIM5_CERAT/6-423    AC A0A2K5MIM5.1
#=GS A0A3Q7TJI4_VULVU/219-265  AC A0A3Q7TJI4.1
#=GS A0A3B4UCL7_SERDU/5-412    AC A0A3B4UCL7.1
#=GS A0A3Q7VR49_URSAR/6-349    AC A0A3Q7VR49.1
#=GS A0A1S3NEB6_SALSA/5-321    AC A0A1S3NEB6.1
#=GS G3HK40_CRIGR/40-88        AC G3HK40.1
#=GS A0A3Q0R429_AMPCI/150-252  AC A0A3Q0R429.1
#=GS A0A1D5PR60_CHICK/1-137    AC A0A1D5PR60.2
#=GS A0A493TRH2_ANAPP/367-473  AC A0A493TRH2.1
#=GS A0A452HQD6_9SAUR/6-363    AC A0A452HQD6.1
#=GS A0A1U7T1X9_TARSY/6-450    AC A0A1U7T1X9.1
#=GS H2LCM4_ORYLA/4-394        AC H2LCM4.2
#=GS B5X3H6_SALSA/312-380      AC B5X3H6.1
#=GS A0A3Q0R429_AMPCI/242-313  AC A0A3Q0R429.1
#=GS F1QAS0_DANRE/5-404        AC F1QAS0.1
#=GS A0A096M7I3_POEFO/6-420    AC A0A096M7I3.1
#=GS A0A1S3EWZ1_DIPOR/6-350    AC A0A1S3EWZ1.1
#=GS A0A3Q3GM95_9LABR/211-356  AC A0A3Q3GM95.1
#=GS A0A3M0L7F0_HIRRU/6-439    AC A0A3M0L7F0.1
#=GS G1T182_RABIT/5-421        AC G1T182.1
#=GS A0A1L8FTM3_XENLA/5-120    AC A0A1L8FTM3.1
#=GS A0A3L8T3A5_CHLGU/370-474  AC A0A3L8T3A5.1
#=GS A0A3B4ECI3_PYGNA/13-383   AC A0A3B4ECI3.1
#=GS A0A0A0AXQ9_CHAVO/1-305    AC A0A0A0AXQ9.1
#=GS A0A2K5QSV1_CEBCA/1-326    AC A0A2K5QSV1.1
#=GS F7DYP6_ORNAN/12-320       AC F7DYP6.2
#=GS A0A2K5YGD5_MANLE/1-324    AC A0A2K5YGD5.1
#=GS F6ZU62_HORSE/3-403        AC F6ZU62.2
#=GS A0A2U3YGB3_LEPWE/6-425    AC A0A2U3YGB3.1
#=GS F1S0L8_PIG/6-423          AC F1S0L8.2
#=GS B5X3H6_SALSA/5-318        AC B5X3H6.1
#=GS H3A137_LATCH/5-348        AC H3A137.1
#=GS H0ZP16_TAEGU/6-421        AC H0ZP16.1
#=GS A0A452HQE3_9SAUR/365-470  AC A0A452HQE3.1
#=GS A0A3Q0SDC7_AMPCI/157-301  AC A0A3Q0SDC7.1
#=GS G3QE46_GORGO/1-327        AC G3QE46.2
#=GS F6QHD1_MOUSE/3-257        AC F6QHD1.2
#=GS A0A1U7TK12_TARSY/6-420    AC A0A1U7TK12.1
#=GS A0A3L8T3A5_CHLGU/6-391    AC A0A3L8T3A5.1
#=GS A0A2U4AIM3_TURTR/125-419  AC A0A2U4AIM3.1
#=GS M3XIC1_LATCH/30-297       AC M3XIC1.1
#=GS A0A3Q2HS31_HORSE/323-370  AC A0A3Q2HS31.1
#=GS A0A2K6TVS9_SAIBB/320-367  AC A0A2K6TVS9.1
#=GS A0A1U7TCG7_TARSY/6-346    AC A0A1U7TCG7.1
#=GS A0A1L8FTM3_XENLA/174-372  AC A0A1L8FTM3.1
#=GS I3M5F7_ICTTR/6-422        AC I3M5F7.2
#=GS A0A096LTF3_POEFO/6-321    AC A0A096LTF3.1
#=GS A0A1D5QDU1_MACMU/6-423    AC A0A1D5QDU1.1
#=GS A0A2D0PR20_ICTPU/251-440  AC A0A2D0PR20.1
#=GS A0A2K6EYS2_PROCO/1-327    AC A0A2K6EYS2.1
#=GS A0A2K6MUY0_RHIBE/6-423    AC A0A2K6MUY0.1
#=GS A0A3Q1MQI0_BOVIN/6-454    AC A0A3Q1MQI0.1
#=GS A0A2I0MWT7_COLLI/268-370  AC A0A2I0MWT7.1
#=GS A0A096LSJ5_POEFO/293-372  AC A0A096LSJ5.1
#=GS A0A2K6C570_MACNE/342-390  AC A0A2K6C570.1
#=GS F6PXD9_MONDO/9-438        AC F6PXD9.2
#=GS A0A087Y9M2_POEFO/6-422    AC A0A087Y9M2.2
#=GS A0A3B4G356_9CICH/8-310    AC A0A3B4G356.1
#=GS A0A455C8G5_PHYMC/12-343   AC A0A455C8G5.1
#=GS A0A4D9E4X0_9SAUR/6-375    AC A0A4D9E4X0.1
#=GS Q24JZ4_BOVIN/6-424        AC Q24JZ4.1
#=GS A0A3Q7U9G4_VULVU/193-243  AC A0A3Q7U9G4.1
#=GS G1NHR6_MELGA/1-323        AC G1NHR6.2
#=GS A0A0D9RIX6_CHLSB/6-423    AC A0A0D9RIX6.1
#=GS LYRIC_MOUSE/6-420         AC Q80WJ7.1
#=GS G3VA67_SARHA/2-313        AC G3VA67.1
#=GS I3J396_ORENI/11-423       AC I3J396.1
#=GS A0A3Q1B296_AMPOC/4-391    AC A0A3Q1B296.1
#=GS A0A3P9NSQ9_POERE/6-421    AC A0A3P9NSQ9.1
#=GS A0A1S3NF46_SALSA/5-317    AC A0A1S3NF46.1
#=GS A0A3Q7SZK0_VULVU/1-276    AC A0A3Q7SZK0.1
#=GS A0A3Q2X3S7_HAPBU/4-389    AC A0A3Q2X3S7.1
#=GS F7DD48_MACMU/1-327        AC F7DD48.2
#=GS A0A2D0PX90_ICTPU/5-424    AC A0A2D0PX90.1
#=GS A0A3B3QM34_9TELE/21-249   AC A0A3B3QM34.1
#=GS A0A2K5MIM1_CERAT/6-453    AC A0A2K5MIM1.1
#=GS H0WJY8_OTOGA/6-426        AC H0WJY8.1
#=GS A0A3B5AXA5_9TELE/5-416    AC A0A3B5AXA5.1
#=GS M3XIC1_LATCH/274-382      AC M3XIC1.1
#=GS A0A2I4CG59_9TELE/4-386    AC A0A2I4CG59.1
#=GS A0A2K5HTE2_COLAP/6-423    AC A0A2K5HTE2.1
#=GS A0A3Q3XKS4_MOLML/5-216    AC A0A3Q3XKS4.1
#=GS A0A2Y9PAX8_DELLE/6-423    AC A0A2Y9PAX8.1
#=GS A0A1V4JN31_PATFA/196-327  AC A0A1V4JN31.1
#=GS A0A2I3HVK6_NOMLE/1-326    AC A0A2I3HVK6.1
#=GS A0A060Y0Z5_ONCMY/5-378    AC A0A060Y0Z5.1
#=GS E9PUX0_MOUSE/6-163        AC E9PUX0.1
#=GS A0A1D5PJ54_CHICK/6-123    AC A0A1D5PJ54.2
#=GS A0A402ELV3_9SAUR/6-386    AC A0A402ELV3.1
#=GS H2PQV6_PONAB/6-422        AC H2PQV6.1
#=GS A0A3Q2KV21_HORSE/9-456    AC A0A3Q2KV21.1
#=GS F1PKY9_CANLF/6-455        AC F1PKY9.2
#=GS F6ZQL0_MOUSE/2-104        AC F6ZQL0.1
#=GS A0A2R8QJH1_DANRE/5-447    AC A0A2R8QJH1.1
#=GS G3S6B5_GORGO/6-423        AC G3S6B5.2
#=GS A0A2K6EYS2_PROCO/321-366  AC A0A2K6EYS2.1
#=GS A0A3B3VW80_9TELE/6-422    AC A0A3B3VW80.1
#=GS A0A2K5DZZ9_AOTNA/6-423    AC A0A2K5DZZ9.1
#=GS A0A1A6GQ64_NEOLE/1-68     AC A0A1A6GQ64.1
#=GS A0A3B5R2C3_XIPMA/5-417    AC A0A3B5R2C3.1
#=GS F6ZSG0_MOUSE/1-214        AC F6ZSG0.1
#=GS A0A3P8PYF0_ASTCA/1-301    AC A0A3P8PYF0.1
#=GS A0A2K5HTE5_COLAP/1-327    AC A0A2K5HTE5.1
#=GS A0A286ZU54_PIG/6-453      AC A0A286ZU54.1
#=GS A0A2U3W347_ODORO/6-423    AC A0A2U3W347.1
#=GS A0A1U7QFC2_MESAU/6-422    AC A0A1U7QFC2.1
#=GS A0A2K6TVS9_SAIBB/1-327    AC A0A2K6TVS9.1
#=GS A0A2R9AA22_PANPA/310-356  AC A0A2R9AA22.1
#=GS A0A3Q2ZDM2_KRYMA/4-395    AC A0A3Q2ZDM2.1
#=GS A0A3Q7U9G4_VULVU/1-203    AC A0A3Q7U9G4.1
#=GS F7I3Z2_CALJA/6-453        AC F7I3Z2.2
#=GS A0A2K6PJY0_RHIRO/6-349    AC A0A2K6PJY0.1
#=GS A0A3P9DI43_9CICH/1-366    AC A0A3P9DI43.1
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