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Database: Pfam
Entry: Lycopene_cycl
LinkDB: Lycopene_cycl
Original site: Lycopene_cycl 
#=GF ID   Lycopene_cycl
#=GF AC   PF05834.14
#=GF DE   Lycopene cyclase protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_8336 (release 8.0)
#=GF GA   23.40 23.40;
#=GF TC   23.40 23.40;
#=GF NC   23.30 23.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0063
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8837512
#=GF RT   Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase
#=GF RT   enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic
#=GF RT   carotenoid formation. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Pogson B, Sun Z, McDonald KA, DellaPenna D,
#=GF RA   Gantt E; 
#=GF RL   Plant Cell 1996;8:1613-1626.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226339
#=GF RT   One ring or two? Determination of ring number in carotenoids by
#=GF RT   lycopene epsilon-cyclases. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Gantt E; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98:2905-2910.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of lycopene beta and epsilon cyclase
#=GF CC   proteins. Carotenoids with cyclic end groups are essential
#=GF CC   components of the photosynthetic membranes in all plants, algae,
#=GF CC   and cyanobacteria. These lipid-soluble compounds protect against
#=GF CC   photo-oxidation, harvest light for photosynthesis, and dissipate
#=GF CC   excess light energy absorbed by the antenna pigments. The
#=GF CC   cyclisation of lycopene (psi, psi-carotene) is a key branch
#=GF CC   point in the pathway of carotenoid biosynthesis. Two types of
#=GF CC   cyclic end groups are found in higher plant carotenoids: the
#=GF CC   beta and epsilon rings. Carotenoids with two beta rings are
#=GF CC   ubiquitous, and those with one beta and one epsilon ring are
#=GF CC   common; however, carotenoids with two epsilon rings are rare
#=GF CC   [1,2].  
#=GF SQ   2345
#=GS A0A369I8A6_9BACT/5-377     AC A0A369I8A6.1
#=GS A0A495W490_9PSEU/2-345     AC A0A495W490.1
#=GS A0A239KE51_9BURK/2-168     AC A0A239KE51.1
#=GS I1H9L4_BRADI/11-194        AC I1H9L4.1
#=GS A0A561TAS0_9ACTN/1-373     AC A0A561TAS0.1
#=GS G0L580_ZOBGA/8-380         AC G0L580.1
#=GS A0A0N1BKL0_9SPHN/7-379     AC A0A0N1BKL0.1
#=GS A0A1V2RJ30_9ACTN/3-379     AC A0A1V2RJ30.1
#=GS A0A384INH0_9ACTN/16-390    AC A0A384INH0.1
#=GS A0A257EPT1_9PROT/43-415    AC A0A257EPT1.1
#=GS A0A2S2DVQ4_9BACT/13-386    AC A0A2S2DVQ4.1
#=GS A0A1H5YXA2_9ACTN/84-184    AC A0A1H5YXA2.1
#=GS A5VB81_SPHWW/7-380         AC A5VB81.1
#=GS J3L1C5_ORYBR/28-427        AC J3L1C5.1
#=GS W9S642_9ROSA/80-473        AC W9S642.1
#=GS V4YJ10_9PROT/4-401         AC V4YJ10.1
#=GS A0A519FQP3_9BURK/14-215    AC A0A519FQP3.1
#=GS A0A3L6PTE2_PANMI/119-286   AC A0A3L6PTE2.1
#=GS A0A1C5JKQ1_9ACTN/15-386    AC A0A1C5JKQ1.1
#=GS L1K0V8_GUITC/136-278       AC L1K0V8.1
#=GS A0A0D0USZ0_9ACTN/10-381    AC A0A0D0USZ0.1
#=GS A0A1S3C5G8_CUCME/89-482    AC A0A1S3C5G8.1
#=GS A0A095SW91_9FLAO/6-374     AC A0A095SW91.1
#=GS F6GHB9_LACS5/8-377         AC F6GHB9.1
#=GS M0RZ31_MUSAM/28-426        AC M0RZ31.1
#=GS A0A166PM69_9ACTN/109-371   AC A0A166PM69.1
#=GS A0A0H5CGI0_9PSEU/6-357     AC A0A0H5CGI0.1
#=GS A0A1H1L388_9ACTN/12-382    AC A0A1H1L388.1
#=GS A0A160P6L2_STRLU/10-384    AC A0A160P6L2.1
#=GS I0KE89_9BACT/5-375         AC I0KE89.1
#=GS A0A345UGT8_9BACT/6-373     AC A0A345UGT8.1
#=GS K0ET44_9NOCA/10-357        AC K0ET44.1
#=GS A0A164I4K6_9NOCA/10-366    AC A0A164I4K6.1
#=GS A0A6I4VA97_9GAMM/5-374     AC A0A6I4VA97.1
#=GS A0A2R4CH31_9BURK/7-377     AC A0A2R4CH31.1
#=GS A0A1N7L413_9RHOB/4-349     AC A0A1N7L413.1
#=GS A0A5N5G7N1_9ROSA/89-482    AC A0A5N5G7N1.1
#=GS A0A2S8LCA1_9MYCO/37-219    AC A0A2S8LCA1.1
#=GS A0A059MRG9_9NOCA/11-384    AC A0A059MRG9.1
#=GS A0A099J448_9MICO/8-372     AC A0A099J448.1
#=GS A0A078LU15_9PSED/6-376     AC A0A078LU15.1
#=GS A0A199V466_ANACO/115-512   AC A0A199V466.1
#=GS A0A1E7FM14_9STRA/78-499    AC A0A1E7FM14.1
#=GS F6EUT8_SPHCR/5-376         AC F6EUT8.1
#=GS L1K0V8_GUITC/351-614       AC L1K0V8.1
#=GS A0A411X4N0_9BURK/5-374     AC A0A411X4N0.1
#=GS A0A176TCC1_9FLAO/2-357     AC A0A176TCC1.1
#=GS A3PDG8_PROM0/5-397         AC A3PDG8.1
#=GS A0A1H9E1V6_9FLAO/6-375     AC A0A1H9E1V6.1
#=GS A0A2P5D2C2_TREOI/89-482    AC A0A2P5D2C2.1
#=GS A0A6I0FX20_9CORY/3-336     AC A0A6I0FX20.1
#=GS A0A1G9I3P9_9ACTN/8-364     AC A0A1G9I3P9.1
#=GS A0A1A8ZLQ1_9ACTN/15-386    AC A0A1A8ZLQ1.1
#=GS A0A4Y8ZWA9_9SPHN/8-380     AC A0A4Y8ZWA9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/713-839       AC C1N7E6.1
#=GS A0A4D6HFR0_9EURY/6-210     AC A0A4D6HFR0.1
#=GS A0A1Q9LPQ1_9PSEU/2-52      AC A0A1Q9LPQ1.1
#=GS A0A4P7ZZ42_9SYNE/1-190     AC A0A4P7ZZ42.1
#=GS A0A143BQ70_9BACT/24-403    AC A0A143BQ70.1
#=GS A0A2I0IST4_PUNGR/1-333     AC A0A2I0IST4.1
#=GS A0A0K9NQI4_ZOSMR/91-488    AC A0A0K9NQI4.1
#=GS A0A1R3HA77_COCAP/108-491   AC A0A1R3HA77.1
#=GS A0A5A7NXZ4_STRAF/81-283    AC A0A5A7NXZ4.1
#=GS A0A4R7IZD0_9ACTN/55-233    AC A0A4R7IZD0.1
#=GS C1IP75_WHEAT/115-514       AC C1IP75.1
#=GS A0A0D2UFJ3_GOSRA/115-518   AC A0A0D2UFJ3.1
#=GS A0A6I4SVX4_9SPHN/7-380     AC A0A6I4SVX4.1
#=GS A0A366E152_9NOCA/4-343     AC A0A366E152.1
#=GS U5ECN2_NOCAS/4-344         AC U5ECN2.1
#=GS A0A0M8WSI2_9ACTN/1-369     AC A0A0M8WSI2.1
#=GS LCYB_TOBAC/85-478          AC Q43578.1
#=GS A0A392UGS4_9FABA/1-52      AC A0A392UGS4.1
#=GS A0A1H2F6K7_9FLAO/5-375     AC A0A1H2F6K7.1
#=GS A0A0D6TM50_9FLAO/6-374     AC A0A0D6TM50.1
#=GS G7GIT4_9ACTN/1-361         AC G7GIT4.1
#=GS A0A239VD21_9MICO/4-328     AC A0A239VD21.1
#=GS H8GZY4_DEIGI/12-391        AC H8GZY4.1
#=GS B8BUM8_THAPS/89-499        AC B8BUM8.1
#=GS W1PYB6_AMBTC/126-519       AC W1PYB6.1
#=GS V7B1F7_PHAVU/1-152         AC V7B1F7.1
#=GS A0A1M7PW80_9ACTN/5-396     AC A0A1M7PW80.1
#=GS A0A173KV86_9SPHN/8-376     AC A0A173KV86.1
#=GS A0A0U3MMI0_9BURK/230-380   AC A0A0U3MMI0.1
#=GS A0A430DUL0_9SPHN/8-379     AC A0A430DUL0.1
#=GS Q0W1J4_METAR/4-349         AC Q0W1J4.1
#=GS A0A2T0S8I3_9PSEU/1-359     AC A0A2T0S8I3.1
#=GS D9TDL7_MICAI/16-387        AC D9TDL7.1
#=GS A0A0P7B1V1_9FLAO/5-375     AC A0A0P7B1V1.1
#=GS A0A1Y1T6U0_9FLAO/8-375     AC A0A1Y1T6U0.1
#=GS A0A6A9USE8_9ACTN/1-352     AC A0A6A9USE8.1
#=GS A0A314YK42_PRUYE/89-482    AC A0A314YK42.1
#=GS A0A0F2J1A4_9BACT/8-189     AC A0A0F2J1A4.1
#=GS A0A1H3FAL3_9EURY/6-210     AC A0A1H3FAL3.1
#=GS A0A1I3D3P3_9GAMM/14-62     AC A0A1I3D3P3.1
#=GS A0A0B8NIU0_9NOCA/4-354     AC A0A0B8NIU0.1
#=GS A0A563EWC1_9PSEU/3-342     AC A0A563EWC1.1
#=GS K0SH12_THAOC/82-517        AC K0SH12.1
#=GS C1B4P9_RHOOB/11-369        AC C1B4P9.1
#=GS A0A2G3B2S4_CAPCH/173-257   AC A0A2G3B2S4.1
#=GS W9QK12_9ROSA/116-520       AC W9QK12.1
#=GS A0A5D2WBX6_GOSMU/82-475    AC A0A5D2WBX6.1
#=GS A0ACL9_STRA7/10-384        AC A0ACL9.1
#=GS A0A4S8JML5_MUSBA/129-527   AC A0A4S8JML5.1
#=GS A0A4D9BZU2_SALSN/110-516   AC A0A4D9BZU2.1
#=GS A0A1I2A995_9BACT/5-377     AC A0A1I2A995.1
#=GS A0A367F3J2_9ACTN/5-384     AC A0A367F3J2.1
#=GS G0QIJ4_NANS0/3-211         AC G0QIJ4.1
#=GS M5VYW6_PRUPE/82-475        AC M5VYW6.1
#=GS A0A2C8YST3_9MICO/8-372     AC A0A2C8YST3.1
#=GS A0A017RSM5_9CLOT/5-46      AC A0A017RSM5.1
#=GS A0A432C7Z3_9FLAO/6-375     AC A0A432C7Z3.1
#=GS A0A1I3BGG1_9MICO/8-373     AC A0A1I3BGG1.1
#=GS A1K6U6_AZOSB/2-153         AC A1K6U6.1
#=GS A0A1Q5N666_9ACTN/6-385     AC A0A1Q5N666.1
#=GS A0A1H3VYT6_9RHOB/12-362    AC A0A1H3VYT6.1
#=GS I0HDN1_ACTM4/4-373         AC I0HDN1.1
#=GS A0A2I0XJH4_9ASPA/108-506   AC A0A2I0XJH4.1
#=GS A0A0D2LRX1_GOSRA/112-510   AC A0A0D2LRX1.1
#=GS A0A1H2VFZ9_9RHOB/13-389    AC A0A1H2VFZ9.1
#=GS A0A5A7TMK9_CUCME/71-348    AC A0A5A7TMK9.1
#=GS A0A5B8S471_9SPHN/7-380     AC A0A5B8S471.1
#=GS A0A4Q1TBM2_9BACL/4-44      AC A0A4Q1TBM2.1
#=GS A0A4Q2UTL8_9BACT/5-373     AC A0A4Q2UTL8.1
#=GS A0A1H2QYP3_9PSEU/1-373     AC A0A1H2QYP3.1
#=GS A0A5N5GIC8_9ROSA/81-474    AC A0A5N5GIC8.1
#=GS A0A2I4FHZ7_JUGRE/83-477    AC A0A2I4FHZ7.1
#=GS I1JN65_SOYBN/92-485        AC I1JN65.1
#=GS A0A5J5IP60_9BACT/7-377     AC A0A5J5IP60.1
#=GS A0A1Y5S8I2_9RHOB/3-364     AC A0A1Y5S8I2.1
#=GS A0A150GEC0_GONPE/222-379   AC A0A150GEC0.1
#=GS F7XNL5_METZD/9-360         AC F7XNL5.1
#=GS H8Z4Q7_9GAMM/8-392         AC H8Z4Q7.1
#=GS A0A1G8T707_9FLAO/5-375     AC A0A1G8T707.1
#=GS M7ZUM0_TRIUA/1-179         AC M7ZUM0.1
#=GS A0A444X237_ARAHY/83-142    AC A0A444X237.1
#=GS A0A2S7WLR4_9FLAO/5-374     AC A0A2S7WLR4.1
#=GS A0A1U7WLQ2_NICSY/105-502   AC A0A1U7WLQ2.1
#=GS A0A067EDS0_CITSI/109-476   AC A0A067EDS0.1
#=GS V5AW51_ENTCL/6-376         AC V5AW51.1
#=GS A0A3N1XAV7_9FIRM/6-68      AC A0A3N1XAV7.1
#=GS A0A1M5KLH2_9FLAO/8-374     AC A0A1M5KLH2.1
#=GS A0A1D8G9Q4_9ACTN/14-388    AC A0A1D8G9Q4.1
#=GS A0A1H5PPP0_9ACTN/5-384     AC A0A1H5PPP0.1
#=GS A0A346PNE5_9EURY/27-231    AC A0A346PNE5.1
#=GS A0A5J6Q310_9SYNE/1-386     AC A0A5J6Q310.1
#=GS A0A511CWN9_9PSEU/3-367     AC A0A511CWN9.1
#=GS A0A2K2A2L0_POPTR/134-532   AC A0A2K2A2L0.1
#=GS A0A318ASK5_9NOSO/8-380     AC A0A318ASK5.1
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#=GS A0A1S3T7N4_VIGRR/89-482    AC A0A1S3T7N4.1
#=GS A0A519QUC1_9SPHN/7-379     AC A0A519QUC1.1
#=GS LCYB_SOLLC/85-478          AC Q43503.1
#=GS M0MPF7_HALMO/6-179         AC M0MPF7.1
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#=GS A0A4U1L9S5_9SPHN/8-380     AC A0A4U1L9S5.1
#=GS A0A0E0IBZ9_ORYNI/140-306   AC A0A0E0IBZ9.1
#=GS W9GQG1_9PROT/225-393       AC W9GQG1.1
#=GS A0A0Q8XE03_9SPHN/8-380     AC A0A0Q8XE03.1
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#=GS A0A6B8VTI0_9CORY/5-314     AC A0A6B8VTI0.1
#=GS A0A1A3I2X9_9MYCO/37-105    AC A0A1A3I2X9.1
#=GS A0A6A2ZQ33_HIBSY/82-474    AC A0A6A2ZQ33.1
#=GS A0A2A3N072_9SPHN/8-375     AC A0A2A3N072.1
#=GS A0A061GLV2_THECC/110-508   AC A0A061GLV2.1
#=GS U5E603_NOCAS/21-370        AC U5E603.1
#=GS H0R608_9ACTN/6-359         AC H0R608.1
#=GS A0A4T3EYI8_9SPHN/7-386     AC A0A4T3EYI8.1
#=GS A0A0P9CHN0_9PROT/5-352     AC A0A0P9CHN0.1
#=GS A0A3S4NPG7_9MAGN/89-482    AC A0A3S4NPG7.1
#=GS A0A5N6L9W8_9ASTR/174-324   AC A0A5N6L9W8.1
#=GS Q2RWR2_RHORT/232-400       AC Q2RWR2.1
#=GS A0A238UQQ0_HALVU/6-187     AC A0A238UQQ0.1
#=GS A0A0N0AW12_9ACTN/6-382     AC A0A0N0AW12.1
#=GS A0A2K1KBT3_PHYPA/148-544   AC A0A2K1KBT3.1
#=GS A0A089YP11_9PSED/4-374     AC A0A089YP11.1
#=GS A0A2K3MQW7_TRIPR/11-412    AC A0A2K3MQW7.1
#=GS A0A5B8B4X2_9RHIZ/2-122     AC A0A5B8B4X2.1
#=GS A0A541B2C2_9NOCA/9-367     AC A0A541B2C2.1
#=GS A0A3N6U9K2_BRACR/326-476   AC A0A3N6U9K2.1
#=GS Q1YU65_9GAMM/6-382         AC Q1YU65.1
#=GS D8T5C7_SELML/97-495        AC D8T5C7.1
#=GS A0A0L9UNF8_PHAAN/83-476    AC A0A0L9UNF8.1
#=GS A0A0D3EBZ0_BRAOL/114-510   AC A0A0D3EBZ0.1
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