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Database: Pfam
Entry: Lycopene_cycl
LinkDB: Lycopene_cycl
Original site: Lycopene_cycl 
#=GF ID   Lycopene_cycl
#=GF AC   PF05834.12
#=GF DE   Lycopene cyclase protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_8336 (release 8.0)
#=GF GA   23.40 23.40;
#=GF TC   23.40 23.40;
#=GF NC   23.30 23.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8837512
#=GF RT   Functional analysis of the beta and epsilon lycopene cyclase
#=GF RT   enzymes of Arabidopsis reveals a mechanism for control of cyclic
#=GF RT   carotenoid formation. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Pogson B, Sun Z, McDonald KA, DellaPenna D,
#=GF RA   Gantt E; 
#=GF RL   Plant Cell 1996;8:1613-1626.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11226339
#=GF RT   One ring or two? Determination of ring number in carotenoids by
#=GF RT   lycopene epsilon-cyclases. 
#=GF RA   Cunningham FX Jr, Gantt E; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98:2905-2910.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of lycopene beta and epsilon cyclase
#=GF CC   proteins. Carotenoids with cyclic end groups are essential
#=GF CC   components of the photosynthetic membranes in all plants, algae,
#=GF CC   and cyanobacteria. These lipid-soluble compounds protect against
#=GF CC   photo-oxidation, harvest light for photosynthesis, and dissipate
#=GF CC   excess light energy absorbed by the antenna pigments. The
#=GF CC   cyclisation of lycopene (psi, psi-carotene) is a key branch
#=GF CC   point in the pathway of carotenoid biosynthesis. Two types of
#=GF CC   cyclic end groups are found in higher plant carotenoids: the
#=GF CC   beta and epsilon rings. Carotenoids with two beta rings are
#=GF CC   ubiquitous, and those with one beta and one epsilon ring are
#=GF CC   common; however, carotenoids with two epsilon rings are rare
#=GF CC   [1,2].  
#=GF SQ   1890
#=GS A0A1B6YEA4_9BACT/8-377     AC A0A1B6YEA4.1
#=GS A0A251V369_HELAN/115-513   AC A0A251V369.1
#=GS A0A0Q4KST3_9SPHN/8-380     AC A0A0Q4KST3.1
#=GS A0A0E3NPJ9_9EURY/4-379     AC A0A0E3NPJ9.1
#=GS E6XDE0_CELAD/5-376         AC E6XDE0.1
#=GS A0A2G3CD69_CAPCH/83-476    AC A0A2G3CD69.1
#=GS A0A239KE51_9BURK/2-168     AC A0A239KE51.1
#=GS L8DKK3_9NOCA/7-368         AC L8DKK3.1
#=GS A0A1W6E907_9BACT/5-375     AC A0A1W6E907.1
#=GS I1H9L4_BRADI/11-194        AC I1H9L4.1
#=GS A0A1V2RJ30_9ACTN/3-379     AC A0A1V2RJ30.1
#=GS G0L580_ZOBGA/8-380         AC G0L580.1
#=GS A0A0N1BKL0_9SPHN/7-379     AC A0A0N1BKL0.1
#=GS G2I622_KOMMN/10-63         AC G2I622.1
#=GS A0A0F5PAL0_9SPHN/7-379     AC A0A0F5PAL0.1
#=GS K1L9I7_9BACT/9-382         AC K1L9I7.1
#=GS A0A257EPT1_9PROT/43-415    AC A0A257EPT1.1
#=GS A0A287L0I0_HORVV/1-180     AC A0A287L0I0.1
#=GS M4CRJ7_BRARP/116-510       AC M4CRJ7.1
#=GS A0A0M3EXD5_ENTCL/7-377     AC A0A0M3EXD5.1
#=GS U7D5N7_9BACT/5-197         AC U7D5N7.1
#=GS A5VB81_SPHWW/7-380         AC A5VB81.1
#=GS J3L1C5_ORYBR/28-427        AC J3L1C5.1
#=GS L0IX24_9MYCO/3-165         AC L0IX24.1
#=GS A0A1J4Q7N7_9ACTN/5-384     AC A0A1J4Q7N7.1
#=GS A0A261D1E7_9ACTN/51-404    AC A0A261D1E7.1
#=GS W9S642_9ROSA/80-473        AC W9S642.1
#=GS A0A1G3D0B8_9GAMM/7-377     AC A0A1G3D0B8.1
#=GS V4YJ10_9PROT/4-401         AC V4YJ10.1
#=GS A0A1X7PPH9_9RHIZ/2-153     AC A0A1X7PPH9.1
#=GS D9XNI7_9ACTN/1-313         AC D9XNI7.1
#=GS A0A1C5JKQ1_9ACTN/15-386    AC A0A1C5JKQ1.1
#=GS L1K0V8_GUITH/136-278       AC L1K0V8.1
#=GS A0A0D0USZ0_9ACTN/10-381    AC A0A0D0USZ0.1
#=GS A0A1S3C5G8_CUCME/89-482    AC A0A1S3C5G8.1
#=GS A0A095SW91_9FLAO/6-374     AC A0A095SW91.1
#=GS M0RZ31_MUSAM/28-426        AC M0RZ31.1
#=GS F6GHB9_LACS5/8-377         AC F6GHB9.1
#=GS A0A0H5CGI0_9PSEU/6-357     AC A0A0H5CGI0.1
#=GS A0A1H1L388_9ACTN/12-382    AC A0A1H1L388.1
#=GS A0A0C7NDU4_9THEO/6-51      AC A0A0C7NDU4.1
#=GS A0A160P6L2_STRLU/10-384    AC A0A160P6L2.1
#=GS A0A2A7N7T9_9MYCO/28-226    AC A0A2A7N7T9.1
#=GS A0A1Q5KGS8_9ACTN/5-384     AC A0A1Q5KGS8.1
#=GS A0A1T1CJ49_9FLAO/10-380    AC A0A1T1CJ49.1
#=GS I0KE89_9BACT/5-375         AC I0KE89.1
#=GS A0A0S9R7Z4_9ACTN/7-366     AC A0A0S9R7Z4.1
#=GS K0ET44_9NOCA/10-357        AC K0ET44.1
#=GS J3MT20_ORYBR/83-241        AC J3MT20.1
#=GS A0A164I4K6_9NOCA/10-366    AC A0A164I4K6.1
#=GS W0E9A2_9FIRM/5-44          AC W0E9A2.1
#=GS A0A0N0APC3_9PSEU/1-330     AC A0A0N0APC3.1
#=GS A0A1C4MT86_9ACTN/5-384     AC A0A1C4MT86.1
#=GS A0A260W8Q2_9NOCA/8-363     AC A0A260W8Q2.1
#=GS A0A1R1IEP0_9ACTN/16-410    AC A0A1R1IEP0.1
#=GS C0ZZI7_RHOE4/9-367         AC C0ZZI7.1
#=GS K8DCN1_CROSK/1-56          AC K8DCN1.1
#=GS A0A285QKB8_9SPHN/8-380     AC A0A285QKB8.1
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#=GS A0A099J448_9MICO/8-372     AC A0A099J448.1
#=GS A0A0Q4SET4_9FLAO/11-383    AC A0A0Q4SET4.1
#=GS A0A078LU15_9PSED/6-376     AC A0A078LU15.1
#=GS A0A199V466_ANACO/115-512   AC A0A199V466.1
#=GS A0A0U1QKC2_9SYNE/13-399    AC A0A0U1QKC2.1
#=GS K6WZ54_9MICO/293-418       AC K6WZ54.1
#=GS F6EUT8_SPHCR/5-376         AC F6EUT8.1
#=GS A0A1E7FM14_9STRA/78-499    AC A0A1E7FM14.1
#=GS A0A1S3U538_VIGRR/109-507   AC A0A1S3U538.1
#=GS L1K0V8_GUITH/351-614       AC L1K0V8.1
#=GS A0A1M5KQH7_9PSED/5-375     AC A0A1M5KQH7.1
#=GS A0A147FW93_9GAMM/6-376     AC A0A147FW93.1
#=GS C1N7E6_MICPC/854-1137      AC C1N7E6.1
#=GS A0A0N0A2R5_9NOCA/3-371     AC A0A0N0A2R5.1
#=GS A0A2G2Y836_CAPAN/269-342   AC A0A2G2Y836.1
#=GS A0A292Z7E6_9PSEU/1-383     AC A0A292Z7E6.1
#=GS A0A176TCC1_9FLAO/2-357     AC A0A176TCC1.1
#=GS A3PDG8_PROM0/5-397         AC A3PDG8.1
#=GS A0A1H9E1V6_9FLAO/6-375     AC A0A1H9E1V6.1
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#=GS A0A1A8ZLQ1_9ACTN/15-386    AC A0A1A8ZLQ1.1
#=GS A0A0F7KYY9_9SPHN/7-380     AC A0A0F7KYY9.1
#=GS C1N7E6_MICPC/713-839       AC C1N7E6.1
#=GS Q0S0G9_RHOJR/59-418        AC Q0S0G9.1
#=GS G8RY24_MYCRN/37-218        AC G8RY24.1
#=GS A0A1Z9WR82_9GAMM/5-344     AC A0A1Z9WR82.1
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#=GS A0A192D6R3_9SPHN/17-400    AC A0A192D6R3.1
#=GS A0A2A4FYF8_9SPHN/7-379     AC A0A2A4FYF8.1
#=GS A0A2A3UI33_9SPHI/4-176     AC A0A2A3UI33.1
#=GS A0A2G3AKX0_CAPAN/66-165    AC A0A2G3AKX0.1
#=GS A0A0F8ELQ6_9EURY/4-377     AC A0A0F8ELQ6.1
#=GS A0A143BQ70_9BACT/24-403    AC A0A143BQ70.1
#=GS A0A250XJD3_9CHLO/98-507    AC A0A250XJD3.1
#=GS A0A1N7PJL8_9RHOB/4-164     AC A0A1N7PJL8.1
#=GS L8EHN6_STRR1/5-384         AC L8EHN6.1
#=GS A0A1S9AH16_9BURK/2-176     AC A0A1S9AH16.1
#=GS A0A0A1B2R7_9GAMM/6-376     AC A0A0A1B2R7.1
#=GS A0A0K9NQI4_ZOSMR/91-488    AC A0A0K9NQI4.1
#=GS A0A1R3HA77_COCAP/108-491   AC A0A1R3HA77.1
#=GS Y801_DEIRA/10-385          AC Q9RW68.1
#=GS C1IP75_WHEAT/115-514       AC C1IP75.1
#=GS A0A0X3SWS3_9ACTN/14-161    AC A0A0X3SWS3.1
#=GS D7L8W7_ARALL/84-479        AC D7L8W7.1
#=GS V4LF12_EUTSA/82-478        AC V4LF12.1
#=GS A0A0D2UFJ3_GOSRA/115-518   AC A0A0D2UFJ3.1
#=GS A0A101AFY6_9MYCO/35-220    AC A0A101AFY6.1
#=GS A0A1I1KFH8_9BURK/9-379     AC A0A1I1KFH8.1
#=GS U5ECN2_NOCAS/4-344         AC U5ECN2.1
#=GS A0A0M8WSI2_9ACTN/1-369     AC A0A0M8WSI2.1
#=GS LCYB_TOBAC/85-478          AC Q43578.1
#=GS A0A2G2CVX7_9SPHN/12-383    AC A0A2G2CVX7.1
#=GS A0A0A2MFB6_9FLAO/6-375     AC A0A0A2MFB6.1
#=GS A2Q2Y6_MEDTR/83-476        AC A2Q2Y6.1
#=GS A0A1M6JQ64_9FLAO/5-374     AC A0A1M6JQ64.1
#=GS I9WDF4_9SPHN/24-395        AC I9WDF4.1
#=GS A0A0D2JKJ9_9CHLO/60-459    AC A0A0D2JKJ9.1
#=GS A0A1H2F6K7_9FLAO/5-375     AC A0A1H2F6K7.1
#=GS A0A0D6TM50_9FLAO/6-374     AC A0A0D6TM50.1
#=GS M1APW5_SOLTU/85-478        AC M1APW5.1
#=GS A0A1G8DJN2_9PSEU/3-90      AC A0A1G8DJN2.1
#=GS G7GIT4_9ACTN/1-361         AC G7GIT4.1
#=GS A0A1B9E0E3_9FLAO/5-375     AC A0A1B9E0E3.1
#=GS A0A2G3BP10_CAPCH/5-281     AC A0A2G3BP10.1
#=GS H8GZY4_DEIGI/12-391        AC H8GZY4.1
#=GS A0A256XH32_9EURY/5-339     AC A0A256XH32.1
#=GS A0A251NH96_PRUPE/107-506   AC A0A251NH96.1
#=GS B8BUM8_THAPS/89-499        AC B8BUM8.1
#=GS A0A085VM14_PSESX/4-374     AC A0A085VM14.1
#=GS W1PYB6_AMBTC/126-519       AC W1PYB6.1
#=GS K6Y3J0_9ALTE/12-392        AC K6Y3J0.1
#=GS V7B1F7_PHAVU/1-152         AC V7B1F7.1
#=GS A0A1M7PW80_9ACTN/5-396     AC A0A1M7PW80.1
#=GS A0A0U5KZA4_9GAMM/6-376     AC A0A0U5KZA4.1
#=GS A0A173KV86_9SPHN/8-376     AC A0A173KV86.1
#=GS A0A0U3MMI0_9BURK/230-380   AC A0A0U3MMI0.1
#=GS A0A0B8XMX7_9SPHI/10-392    AC A0A0B8XMX7.1
#=GS Q0W1J4_METAR/4-349         AC Q0W1J4.1
#=GS G2Z2I9_FLABF/4-376         AC G2Z2I9.1
#=GS D9TDL7_MICAI/16-387        AC D9TDL7.1
#=GS A0A0D6NEL3_9PROT/10-63     AC A0A0D6NEL3.1
#=GS A0A1S1R8V6_9ACTN/293-419   AC A0A1S1R8V6.1
#=GS A0A0P7B1V1_9FLAO/5-375     AC A0A0P7B1V1.1
#=GS A0A1G0AMT5_9BACT/5-375     AC A0A1G0AMT5.1
#=GS A0A1I5XGV6_9BACT/11-385    AC A0A1I5XGV6.1
#=GS K2QAR5_9RHIZ/6-389         AC K2QAR5.1
#=GS A0A1Q8CUZ2_9PSEU/8-377     AC A0A1Q8CUZ2.1
#=GS A0A0C1ZXK5_9DELT/13-408    AC A0A0C1ZXK5.1
#=GS A0A1H4IPY1_9FLAO/5-344     AC A0A1H4IPY1.1
#=GS A2BJ01_HYPBU/7-331         AC A2BJ01.1
#=GS A0A1I6LBM1_9EURY/6-209     AC A0A1I6LBM1.1
#=GS A0A1I5CF04_9FLAO/8-377     AC A0A1I5CF04.1
#=GS A0A1Y1T6U0_9FLAO/8-375     AC A0A1Y1T6U0.1
#=GS A0A1B9DIU5_9FLAO/11-389    AC A0A1B9DIU5.1
#=GS M4ECZ6_BRARP/1-77          AC M4ECZ6.1
#=GS A0A0F2J1A4_9BACT/8-189     AC A0A0F2J1A4.1
#=GS A0A1H3FAL3_9EURY/6-210     AC A0A1H3FAL3.1
#=GS A0A1I3D3P3_9GAMM/14-62     AC A0A1I3D3P3.1
#=GS A0A173LJJ9_9ACTN/98-368    AC A0A173LJJ9.1
#=GS Q4FPE3_PELUB/1-336         AC Q4FPE3.1
#=GS A0A0B8NIU0_9NOCA/4-354     AC A0A0B8NIU0.1
#=GS F8E2K3_CORRG/5-360         AC F8E2K3.1
#=GS K0SH12_THAOC/82-517        AC K0SH12.1
#=GS A0A0Q1HGV1_9FLAO/7-375     AC A0A0Q1HGV1.1
#=GS A0A1I2TQC7_9CORY/10-257    AC A0A1I2TQC7.1
#=GS C1B4P9_RHOOB/11-369        AC C1B4P9.1
#=GS A0A0B5ETP4_STRA4/13-387    AC A0A0B5ETP4.1
#=GS A0A1G6VB19_9PSEU/8-374     AC A0A1G6VB19.1
#=GS A0A2G3B2S4_CAPCH/173-257   AC A0A2G3B2S4.1
#=GS A0A0J8YHA3_9BACT/5-374     AC A0A0J8YHA3.1
#=GS A0A011UWU9_9RHIZ/2-153     AC A0A011UWU9.1
#=GS A0A1H3QH69_9PSEU/2-154     AC A0A1H3QH69.1
#=GS A0A1S2XFG4_CICAR/83-478    AC A0A1S2XFG4.1
#=GS W9QK12_9ROSA/116-520       AC W9QK12.1
#=GS A0ACL9_STRAM/10-384        AC A0ACL9.1
#=GS J1RWG7_9ACTN/5-383         AC J1RWG7.1
#=GS A0A1G8TT21_9ACTN/12-386    AC A0A1G8TT21.1
#=GS A0A1I2A995_9BACT/5-377     AC A0A1I2A995.1
#=GS A0A151BRN1_9ARCH/10-360    AC A0A151BRN1.1
#=GS A0A291GUC8_9MICO/2-175     AC A0A291GUC8.1
#=GS A0A1F1ZVN8_9CORY/144-423   AC A0A1F1ZVN8.1
#=GS A0A0G2HM62_9SYNE/4-390     AC A0A0G2HM62.1
#=GS A0A0E3V6E7_9BACT/5-388     AC A0A0E3V6E7.1
#=GS A0A1R3GP52_9ROSI/78-471    AC A0A1R3GP52.1
#=GS G0QIJ4_NANS0/3-211         AC G0QIJ4.1
#=GS A0A1B2AGK4_9SPHN/3-375     AC A0A1B2AGK4.1
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