#=GF ID Mononeg_RNA_pol
#=GF AC PF00946.23
#=GF DE Mononegavirales RNA dependent RNA polymerase
#=GF PI Paramyx_RNA_pol;
#=GF AU Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU Griffiths-Jones SR;0000-0001-6043-807X
#=GF SE Pfam-B_586 (release 3.0)
#=GF GA 27.00 27.00;
#=GF TC 27.10 29.20;
#=GF NC 26.50 26.30;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 1771177
#=GF RT Gene expression of nonsegmented negative strand RNA viruses.
#=GF RA Banerjee AK, Barik S, De BP;
#=GF RL Pharmacol Ther 1991;51:47-70.
#=GF RN [2]
#=GF RM 9224928
#=GF RT Role of cellular kinases in the gene expression of nonsegmented
#=GF RT negative strand RNA viruses.
#=GF RA De BP, Das T, Banerjee AK;
#=GF RL Biol Chem 1997;378:489-493.
#=GF RN [3]
#=GF RM 14645906
#=GF RT Structural disorder and modular organization in Paramyxovirinae
#=GF RT N and P.
#=GF RA Karlin D, Ferron F, Canard B, Longhi S;
#=GF RL J Gen Virol. 2003;84:3239-3252.
#=GF DR INTERPRO; IPR014023;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC Members of the Mononegavirales including the Paramyxoviridae,
#=GF CC like other non-segmented negative strand RNA viruses, have an
#=GF CC RNA-dependent RNA polymerase composed of two subunits, a large
#=GF CC protein L and a phosphoprotein P. This is a protein
#=GF CC family of the L protein. The L protein confers the RNA
#=GF CC polymerase activity on the complex. The P protein acts as a
#=GF CC transcription factor [2].
#=GF SQ 496
#=GS A0A482LV38_9RHAB/42-1091 AC A0A482LV38.1
#=GS A0A0D3R181_9RHAB/42-1085 AC A0A0D3R181.1
#=GS A0A0B5KTA1_9VIRU/21-1020 AC A0A0B5KTA1.1
#=GS L_SYNV/197-448 AC P31332.1
#=GS A0A6C0X2K4_9MONO/15-994 AC A0A6C0X2K4.1
#=GS A0A140JPI6_9MONO/13-1134 AC A0A140JPI6.1
#=GS L_IHNVO/18-1067 AC Q82707.1
#=GS A0A0D3R177_9RHAB/38-1082 AC A0A0D3R177.1
#=GS B3F5A4_WCBV/35-1084 AC B3F5A4.1
#=GS A0A8J2MGM4_9NEOP/3-892 AC A0A8J2MGM4.1
#=GS A0A2H4PJ46_9MONO/12-1127 AC A0A2H4PJ46.1
#=GS I3NUY3_9RHAB/46-1095 AC I3NUY3.1
#=GS A0A1L3KN55_9VIRU/39-1068 AC A0A1L3KN55.1
#=GS A0A6F9F3V2_9RHAB/61-1062 AC A0A6F9F3V2.1
#=GS A0A0D3R154_9RHAB/43-1084 AC A0A0D3R154.1
#=GS A0A7D7IU63_9RHAB/160-1052 AC A0A7D7IU63.1
#=GS B7UCZ7_9RHAB/38-1070 AC B7UCZ7.1
#=GS L_HRSVB/16-1180 AC O36635.1
#=GS A0A0S1WF35_9MONO/22-1073 AC A0A0S1WF35.1
#=GS A0A2U8J9E5_9RHAB/12-1052 AC A0A2U8J9E5.1
#=GS A0A0B7NBP0_9FUNG/456-861 AC A0A0B7NBP0.1
#=GS L_SHRV/18-1064 AC Q9QJT4.1
#=GS A0A1L4A1T3_9VIRU/27-1062 AC A0A1L4A1T3.1
#=GS A0A4P2VSI5_9MONO/137-1018 AC A0A4P2VSI5.1
#=GS A0A4P2UTG7_9RHAB/204-461 AC A0A4P2UTG7.1
#=GS A0A1L3KMM2_9MONO/130-1003 AC A0A1L3KMM2.1
#=GS K4N3X4_9MONO/9-1092 AC K4N3X4.1
#=GS A0A1Z2RT53_9MONO/37-1041 AC A0A1Z2RT53.1
#=GS A0A0M3SUQ2_9MONO/169-1061 AC A0A0M3SUQ2.1
#=GS A0A835GRS1_SPOEX/131-652 AC A0A835GRS1.1
#=GS L_SV41/11-1128 AC P35341.1
#=GS A0A6B9Q4R9_9MONO/150-1028 AC A0A6B9Q4R9.1
#=GS A0A1L3KN93_9RHAB/39-1087 AC A0A1L3KN93.1
#=GS A0A0B5KXS7_9RHAB/175-1106 AC A0A0B5KXS7.1
#=GS A0A1L3KN76_9RHAB/90-1086 AC A0A1L3KN76.1
#=GS A0A6B9Q4D4_9MONO/28-1049 AC A0A6B9Q4D4.1
#=GS A0A0J7KGS3_LASNI/3-362 AC A0A0J7KGS3.1
#=GS A0A1L3KMN2_9MONO/4-995 AC A0A1L3KMN2.1
#=GS A0A177ATP4_9BILA/93-167 AC A0A177ATP4.1
#=GS D3GGM2_9RHAB/48-1089 AC D3GGM2.1
#=GS Q6E0X2_9RHAB/158-1074 AC Q6E0X2.1
#=GS A0A7R8Z1A0_HERIL/19-1039 AC A0A7R8Z1A0.1
#=GS A0A1L2YVG6_9RHAB/46-1061 AC A0A1L2YVG6.1
#=GS A0A1Z1G738_9MONO/17-1094 AC A0A1Z1G738.1
#=GS A0A140D8P7_9RHAB/46-1082 AC A0A140D8P7.1
#=GS A0A5Q0TVZ9_9MONO/161-1039 AC A0A5Q0TVZ9.1
#=GS A0A097A5B9_9RHAB/43-1080 AC A0A097A5B9.1
#=GS A0A1L3KN44_9VIRU/83-1034 AC A0A1L3KN44.1
#=GS A0A545AA87_9PEZI/43-342 AC A0A545AA87.1
#=GS A0A0D3R1H6_9RHAB/42-1077 AC A0A0D3R1H6.1
#=GS A0A482PGW5_9RHAB/88-1053 AC A0A482PGW5.1
#=GS J7GXK9_9MONO/16-1431 AC J7GXK9.1
#=GS A0A140D8M9_9RHAB/49-1081 AC A0A140D8M9.1
#=GS I1SV85_9RHAB/35-1060 AC I1SV85.1
#=GS A0A221LCI4_9RHAB/51-1092 AC A0A221LCI4.1
#=GS Q287X1_9MONO/13-1100 AC Q287X1.1
#=GS A0A177B2N5_9BILA/96-203 AC A0A177B2N5.1
#=GS A0A096ZGT8_9RHAB/49-1088 AC A0A096ZGT8.1
#=GS A0A1L3KN64_9VIRU/198-1014 AC A0A1L3KN64.1
#=GS A0A1L3KMP6_9MONO/51-1011 AC A0A1L3KMP6.1
#=GS A0A2D1GTP2_9RHAB/107-1043 AC A0A2D1GTP2.1
#=GS A0A386GWS9_9RHAB/211-1078 AC A0A386GWS9.1
#=GS A0A3G5FMI8_9MONO/130-1000 AC A0A3G5FMI8.1
#=GS A0A1L3KMY9_9VIRU/6-1017 AC A0A1L3KMY9.1
#=GS A0A6C0PII7_9VIRU/54-1014 AC A0A6C0PII7.1
#=GS L_MPV15/15-1119 AC Q50EW2.1
#=GS A0A0B5KEM5_9VIRU/163-1016 AC A0A0B5KEM5.1
#=GS A0A2P1GMY7_9MONO/17-1091 AC A0A2P1GMY7.1
#=GS A0A6B9KG49_9VIRU/327-1054 AC A0A6B9KG49.1
#=GS A0A1L3KNA4_9RHAB/60-1107 AC A0A1L3KNA4.1
#=GS L_TAVCV/41-1076 AC Q5GA85.1
#=GS A0A1L3KN75_9RHAB/87-1087 AC A0A1L3KN75.1
#=GS A0A0B5KXL1_9RHAB/43-1074 AC A0A0B5KXL1.1
#=GS A0A096ZGU9_9RHAB/46-1083 AC A0A096ZGU9.1
#=GS A0A0H5BN48_9MONO/13-1118 AC A0A0H5BN48.1
#=GS A0A0B5KRF3_9MONO/23-1147 AC A0A0B5KRF3.1
#=GS X5ETK0_9MONO/22-1060 AC X5ETK0.1
#=GS A0A1L3KMW2_9MONO/8-1021 AC A0A1L3KMW2.1
#=GS A0A1Y0KBV5_9MONO/17-1104 AC A0A1Y0KBV5.1
#=GS A0A3P7KB64_STRVU/4-69 AC A0A3P7KB64.1
#=GS A0A6B9Q463_9MONO/35-1026 AC A0A6B9Q463.1
#=GS L_LNYV3/51-1051 AC Q4W382.1
#=GS A0A0D3R2F8_9RHAB/38-1063 AC A0A0D3R2F8.1
#=GS A0A7J6WXI1_THATH/1-193 AC A0A7J6WXI1.1
#=GS A0A0J7KAM0_LASNI/51-436 AC A0A0J7KAM0.1
#=GS A5H728_9MONO/11-1118 AC A5H728.1
#=GS A0A6M3Z8I5_9MONO/20-1024 AC A0A6M3Z8I5.1
#=GS A0A0D3R132_9RHAB/40-1068 AC A0A0D3R132.1
#=GS A0A0D3R203_9RHAB/43-1085 AC A0A0D3R203.1
#=GS A0A4Z2EDQ2_9TELE/1-60 AC A0A4Z2EDQ2.1
#=GS D9IL78_9MONO/13-1119 AC D9IL78.2
#=GS A0A077EMR8_9MONO/95-977 AC A0A077EMR8.1
#=GS A0A0B7NBP0_9FUNG/36-451 AC A0A0B7NBP0.1
#=GS L_VSNJO/38-1070 AC P16379.2
#=GS A0A0B5KRK6_9RHAB/75-1124 AC A0A0B5KRK6.1
#=GS A0A1L3KN08_9MONO/135-1012 AC A0A1L3KN08.1
#=GS L_BEFVB/46-1095 AC Q9E784.1
#=GS K7X7F6_PRVF/39-1081 AC K7X7F6.1
#=GS A0A821X3Y8_9NEOP/1-190 AC A0A821X3Y8.1
#=GS A0A0A0V1H3_9RHAB/16-1045 AC A0A0A0V1H3.1
#=GS A0A2P1GNH0_9MONO/78-969 AC A0A2P1GNH0.1
#=GS D8WJ28_9MONO/11-1132 AC D8WJ28.1
#=GS A0A4D6DD03_9RHAB/449-1136 AC A0A4D6DD03.1
#=GS J9U761_9RHAB/45-1090 AC J9U761.1
#=GS S5TC82_9RHAB/38-1070 AC S5TC82.1
#=GS A0A1Z2RT97_9RHAB/58-1091 AC A0A1Z2RT97.1
#=GS A0A0B5KT83_9VIRU/129-991 AC A0A0B5KT83.1
#=GS I3VIZ3_9MONO/16-1087 AC I3VIZ3.1
#=GS Q6WGL9_9MONO/13-1122 AC Q6WGL9.1
#=GS A0A482JQ67_9VIRU/27-1016 AC A0A482JQ67.1
#=GS A0A544ZZM3_9PEZI/1-538 AC A0A544ZZM3.1
#=GS Q709E3_9MONO/13-1118 AC Q709E3.1
#=GS L_EBOSU/11-1090 AC Q5XX01.1
#=GS A0A0B5KTT2_9RHAB/40-1069 AC A0A0B5KTT2.1
#=GS A0A4P2UTG7_9RHAB/451-1140 AC A0A4P2UTG7.1
#=GS A0A0C5CF34_9RHAB/41-1080 AC A0A0C5CF34.1
#=GS A0A0B5KF21_9RHAB/34-1074 AC A0A0B5KF21.1
#=GS A0A2R2Z7N1_9RHAB/54-1053 AC A0A2R2Z7N1.1
#=GS A0A2P1BSW5_9RHAB/45-1076 AC A0A2P1BSW5.1
#=GS E3P8Z1_9RHAB/36-1059 AC E3P8Z1.1
#=GS I6ZL26_9MONO/116-970 AC I6ZL26.1
#=GS A0A1U9W1D9_9RHAB/40-1056 AC A0A1U9W1D9.1
#=GS L_MABVM/9-1092 AC P31352.2
#=GS A0A2P1GMS5_9RHAB/39-1065 AC A0A2P1GMS5.1
#=GS A0A7R8YZW5_HERIL/18-744 AC A0A7R8YZW5.1
#=GS A0A140D8L6_9RHAB/20-1077 AC A0A140D8L6.1
#=GS W5S5N8_9MONO/11-1128 AC W5S5N8.1
#=GS A0A0B5KK35_9RHAB/159-1059 AC A0A0B5KK35.1
#=GS A0A0B5KX99_9VIRU/167-1013 AC A0A0B5KX99.1
#=GS Q6YIR9_FDLV8/10-1113 AC Q6YIR9.1
#=GS A0A7J8AMD5_MYOMY/16-220 AC A0A7J8AMD5.1
#=GS U3SWQ5_9MONO/17-1118 AC U3SWQ5.1
#=GS A0A1D8FVQ4_9RHAB/146-1079 AC A0A1D8FVQ4.1
#=GS A0A0B5KTB5_9VIRU/4-935 AC A0A0B5KTB5.1
#=GS A0A0B5KRB3_9VIRU/45-1017 AC A0A0B5KRB3.1
#=GS A0A2D2PYK8_9RHAB/128-1052 AC A0A2D2PYK8.1
#=GS A0A0B5KR88_9VIRU/162-1013 AC A0A0B5KR88.1
#=GS A0A291I327_9RHAB/99-1133 AC A0A291I327.1
#=GS L_CDVO/13-1118 AC P24658.3
#=GS A0A1L7B5J9_9VIRU/217-1115 AC A0A1L7B5J9.1
#=GS L_NIPAV/14-1177 AC Q997F0.1
#=GS M9T5K3_9RHAB/38-1070 AC M9T5K3.1
#=GS A0A6B9Q455_9MONO/20-1030 AC A0A6B9Q455.1
#=GS A0A2Z2CF58_9RHAB/38-1067 AC A0A2Z2CF58.1
#=GS L_MUMPM/11-1124 AC P30929.1
#=GS L_HENDH/14-1177 AC O89344.3
#=GS D8WJ42_9MONO/11-1128 AC D8WJ42.1
#=GS A0A0B5KTQ6_9RHAB/45-1085 AC A0A0B5KTQ6.1
#=GS L_HIRRV/18-1067 AC Q77SJ8.1
#=GS A0A1L3KN56_9VIRU/276-1055 AC A0A1L3KN56.1
#=GS A0A0B5KEW7_9VIRU/7-1070 AC A0A0B5KEW7.1
#=GS A0A7D7F379_9VIRU/13-974 AC A0A7D7F379.1
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#=GS A0A455LU23_9VIRU/189-1127 AC A0A455LU23.1
#=GS L_MEASC/13-1118 AC Q9WMB3.1
#=GS A0A0C4ME19_9RHAB/44-1071 AC A0A0C4ME19.1
#=GS I6U0Z3_9MONO/13-1127 AC I6U0Z3.1
#=GS A0A3S8TMN8_9RHAB/37-1065 AC A0A3S8TMN8.1
#=GS A0A1Q9EP81_SYMMI/508-1324 AC A0A1Q9EP81.1
#=GS M4VNS8_9RHAB/35-1059 AC M4VNS8.1
#=GS A0A1L3KN37_9VIRU/23-1005 AC A0A1L3KN37.1
#=GS C0J7I5_9MONO/17-1094 AC C0J7I5.1
#=GS L_ABLVB/36-1085 AC Q9QSP0.2
#=GS A0A177B2N5_9BILA/200-274 AC A0A177B2N5.1
#=GS A0A0B5KEQ8_9VIRU/280-1015 AC A0A0B5KEQ8.1
#=GS Q5MKN1_9MONO/15-1119 AC Q5MKN1.1
#=GS A0A1L3KMY8_9VIRU/46-1081 AC A0A1L3KMY8.1
#=GS A0A0B5KTD4_9RHAB/46-1090 AC A0A0B5KTD4.1
#=GS A0A1L3KNB0_9VIRU/135-1075 AC A0A1L3KNB0.1
#=GS D5L205_9RHAB/135-1068 AC D5L205.1
#=GS M4QTX8_9MONO/17-1092 AC M4QTX8.1
#=GS A0A0D3R1A5_9RHAB/46-1100 AC A0A0D3R1A5.1
#=GS B1NNZ5_9RHAB/33-1051 AC B1NNZ5.1
#=GS A0A6G6CIE6_9RHAB/76-1155 AC A0A6G6CIE6.1
#=GS A0A7D7F128_9RHAB/83-1052 AC A0A7D7F128.1
#=GS A0A023PHM4_9MONO/17-1118 AC A0A023PHM4.1
#=GS W5QKP6_9MONO/11-1118 AC W5QKP6.1
#=GS Q77M36_MEASM/13-1118 AC Q77M36.1
#=GS L_DMSVA/108-1072 AC C6S3N3.1
#=GS A0A2P1GJB5_9MONO/12-1115 AC A0A2P1GJB5.1
#=GS A0A0A1EBK8_9RHAB/39-1070 AC A0A0A1EBK8.1
#=GS A0A0B5KK67_9RHAB/54-1054 AC A0A0B5KK67.1
#=GS A0A6M6RE89_9RHAB/437-1133 AC A0A6M6RE89.1
#=GS G8EFI9_LLOVA/8-1086 AC G8EFI9.1
#=GS A0A5E4PN90_9NEOP/67-336 AC A0A5E4PN90.1
#=GS A0A1X9Y2V4_9RHAB/121-1045 AC A0A1X9Y2V4.1
#=GS Q4R4G3_PI2H/11-1124 AC Q4R4G3.1
#=GS A0A0D4BTA2_9MONO/22-1053 AC A0A0D4BTA2.1
#=GS L_RABVP/35-1084 AC P11213.2
#=GS B5FX46_9RHAB/42-1078 AC B5FX46.1
#=GS A0A0B5KXF8_9RHAB/50-1098 AC A0A0B5KXF8.1
#=GS A0A5J6CUU4_9MONO/13-1112 AC A0A5J6CUU4.1
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#=GS A0A6B9Q484_9MONO/39-1037 AC A0A6B9Q484.1
#=GS Q1MW97_9RHAB/12-1059 AC Q1MW97.1
#=GS G5D6G8_9MONO/14-1123 AC G5D6G8.1
#=GS A0A346RSR8_9MONO/32-1039 AC A0A346RSR8.1
#=GS A0A544ZZH8_9PEZI/70-988 AC A0A544ZZH8.1
#=GS A0A0D3R1V0_9RHAB/155-1072 AC A0A0D3R1V0.1
#=GS A0A0D3R0X0_9RHAB/61-1044 AC A0A0D3R0X0.1
#=GS A0A2P1GNG5_9MONO/25-1110 AC A0A2P1GNG5.1
#=GS G9IS04_9MONO/13-1100 AC G9IS04.1
#=GS A0A1L2YZU2_9RHAB/49-1081 AC A0A1L2YZU2.1
#=GS A0A1L3KN50_9RHAB/37-1067 AC A0A1L3KN50.1
#=GS A0A8J8WDK7_CHIOP/4-458 AC A0A8J8WDK7.1
#=GS L_LBVAV/150-1063 AC Q8B0U2.1
#=GS A0A7J6ZBK9_9COLE/494-693 AC A0A7J6ZBK9.1
#=GS Q77M16_MEASW/13-1118 AC Q77M16.1
#=GS A0A0B5KK98_9RHAB/49-1060 AC A0A0B5KK98.1
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