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Database: Pfam
Entry: Nup88
LinkDB: Nup88
Original site: Nup88 
#=GF ID   Nup88
#=GF AC   PF10168.10
#=GF DE   Nuclear pore component
#=GF AU   KOGs;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   KOGs (KOG4460)
#=GF GA   24.40 24.40;
#=GF TC   24.40 24.40;
#=GF NC   24.30 24.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9049309
#=GF RT   The human homologue of yeast CRM1 is in a dynamic subcomplex
#=GF RT   with CAN/Nup214 and a novel nuclear pore component Nup88. 
#=GF RA   Fornerod M, van Deursen J, van Baal S, Reynolds A, Davis D,
#=GF RA   Murti KG, Fransen J, Grosveld G; 
#=GF RL   EMBO J. 1997;16:807-816.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12589057
#=GF RT   Nup98 localizes to both nuclear and cytoplasmic sides of the
#=GF RT   nuclear pore and binds to two distinct nucleoporin subcomplexes. 
#=GF RA   Griffis ER, Xu S, Powers MA; 
#=GF RL   Mol Biol Cell. 2003;14:600-610.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019321;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Nup88 can be divided into two structural domains; the N-terminal
#=GF CC   two-thirds of the protein has no obvious structural motifs but
#=GF CC   is the region for binding to Nup98, one of the components of the
#=GF CC   nuclear pore. the C-terminal end is a predicted coiled-coil
#=GF CC   domain [1]. Nup88 is overexpressed in tumour cells [2].
#=GF SQ   1129
#=GS G1SMJ0_RABIT/13-739         AC G1SMJ0.1
#=GS J3M183_ORYBR/1-128          AC J3M183.1
#=GS A0A3B1JBP6_ASTMX/8-701      AC A0A3B1JBP6.1
#=GS A0A0K9PDB1_ZOSMR/12-225     AC A0A0K9PDB1.1
#=GS W1PHV3_AMBTC/11-149         AC W1PHV3.1
#=GS NPP24_CAEEL/18-216          AC Q09372.2
#=GS G5BW82_HETGA/13-742         AC G5BW82.1
#=GS A0A1Q3CZU1_CEPFO/441-796    AC A0A1Q3CZU1.1
#=GS A0A2H3EIM9_ARMGA/391-763    AC A0A2H3EIM9.1
#=GS A0A444X2L1_ARAHY/438-795    AC A0A444X2L1.1
#=GS A0A2K6DEK0_MACNE/1-406      AC A0A2K6DEK0.1
#=GS A0A0N4TZT8_BRUPA/57-281     AC A0A0N4TZT8.1
#=GS A0A0D9W971_9ORYZ/105-281    AC A0A0D9W971.1
#=GS A0A162Q881_PHYB8/451-846    AC A0A162Q881.1
#=GS A0A3B3QZA8_9TELE/237-700    AC A0A3B3QZA8.1
#=GS U4U0E4_DENPD/10-618         AC U4U0E4.1
#=GS A0A1Y2ITF8_PYCCO/46-240     AC A0A1Y2ITF8.1
#=GS A0A2N5W4B9_9BASI/16-252     AC A0A2N5W4B9.1
#=GS A0A0L0SM34_ALLM3/226-392    AC A0A0L0SM34.1
#=GS A0A401TQB5_CHIPU/1-207      AC A0A401TQB5.1
#=GS A0A2Y9EJJ7_PHYMC/1-609      AC A0A2Y9EJJ7.1
#=GS F6PLL3_HORSE/13-742         AC F6PLL3.1
#=GS A0A0D2U2B9_CAPO3/424-539    AC A0A0D2U2B9.1
#=GS L9KLM7_TUPCH/13-668         AC L9KLM7.1
#=GS A0A0J7KYQ0_LASNI/12-77      AC A0A0J7KYQ0.1
#=GS A0A182JC17_9DIPT/135-709    AC A0A182JC17.1
#=GS A0A0A1NJN6_RHIZD/476-855    AC A0A0A1NJN6.1
#=GS A0A1A9WCP2_9MUSC/20-132     AC A0A1A9WCP2.1
#=GS A0A0V0WM75_9BILA/356-549    AC A0A0V0WM75.1
#=GS A0A0V0TAE0_9BILA/311-841    AC A0A0V0TAE0.1
#=GS A0A1V2L9D7_CYBFA/4-232      AC A0A1V2L9D7.1
#=GS E2QXG1_CANLF/13-738         AC E2QXG1.2
#=GS A0A2Z6R8V2_9GLOM/102-246    AC A0A2Z6R8V2.1
#=GS A0A316VDF2_9BASI/547-961    AC A0A316VDF2.1
#=GS A0A401Q3L2_SCYTO/1-547      AC A0A401Q3L2.1
#=GS A0A194PSL8_PAPXU/1-59       AC A0A194PSL8.1
#=GS G7DSS0_MIXOS/444-853        AC G7DSS0.1
#=GS A0A1U7TJ72_TARSY/13-742     AC A0A1U7TJ72.1
#=GS A0A2T6ZET0_TUBBO/46-196     AC A0A2T6ZET0.1
#=GS T1GBE7_MEGSC/1-74           AC T1GBE7.1
#=GS E0VH49_PEDHC/4-87           AC E0VH49.1
#=GS A0A165QZS0_EXIGL/2-163      AC A0A165QZS0.1
#=GS A0A182MT62_9DIPT/2-83       AC A0A182MT62.1
#=GS A0A452CMT7_BALAS/13-227     AC A0A452CMT7.1
#=GS A0A1B6PMX0_SORBI/1-129      AC A0A1B6PMX0.2
#=GS A0A182VW53_9DIPT/705-803    AC A0A182VW53.1
#=GS A0A251QPH8_PRUPE/26-229     AC A0A251QPH8.1
#=GS A0A3N4KID4_9PEZI/329-765    AC A0A3N4KID4.1
#=GS A0A1E3I0K9_9TREE/37-231     AC A0A1E3I0K9.1
#=GS W5J193_ANODA/5-440          AC W5J193.1
#=GS A0A068V032_COFCA/456-808    AC A0A068V032.1
#=GS A0A1Y9H9F9_9DIPT/5-199      AC A0A1Y9H9F9.1
#=GS A0A182U916_9DIPT/3-91       AC A0A182U916.1
#=GS A0A443SVW8_9ACAR/26-585     AC A0A443SVW8.1
#=GS A0A1A9W7V8_9MUSC/4-712      AC A0A1A9W7V8.1
#=GS A0A3Q7TI74_VULVU/13-738     AC A0A3Q7TI74.1
#=GS A0A166LY83_9AGAM/7-239      AC A0A166LY83.1
#=GS A0A286UNX3_9AGAM/7-245      AC A0A286UNX3.1
#=GS T1L081_TETUR/16-380         AC T1L081.1
#=GS NUP88_HUMAN/13-740          AC Q99567.2
#=GS A0A369RV58_9METZ/16-696     AC A0A369RV58.1
#=GS A0A0P0WEN1_ORYSJ/126-302    AC A0A0P0WEN1.1
#=GS A0A124SHM1_CYNCS/385-731    AC A0A124SHM1.1
#=GS A0A1Y1IBN0_KLENI/19-199     AC A0A1Y1IBN0.1
#=GS A0A2K1ZD17_POPTR/27-227     AC A0A2K1ZD17.1
#=GS F6PLI1_CALJA/13-740         AC F6PLI1.1
#=GS A8NY76_COPC7/420-878        AC A8NY76.2
#=GS A0A3Q2DN53_CYPVA/386-444    AC A0A3Q2DN53.1
#=GS F8PNT2_SERL3/391-763        AC F8PNT2.1
#=GS A0A2K5MCD5_CERAT/403-457    AC A0A2K5MCD5.1
#=GS A0A1A9ZM60_GLOPL/4-730      AC A0A1A9ZM60.1
#=GS A0A1B0BND4_9MUSC/4-730      AC A0A1B0BND4.1
#=GS A0A0V1L8D0_9BILA/13-409     AC A0A0V1L8D0.1
#=GS A0A1U7TJ82_TARSY/399-709    AC A0A1U7TJ82.1
#=GS A0A197JIY3_9FUNG/117-287    AC A0A197JIY3.1
#=GS A0A167JAB5_PHYB8/4-228      AC A0A167JAB5.1
#=GS A0A182XP30_ANOQN/683-781    AC A0A182XP30.1
#=GS K7MPK3_SOYBN/25-224         AC K7MPK3.1
#=GS M7CJ66_CHEMY/1-335          AC M7CJ66.1
#=GS A0A0E0KUY7_ORYPU/100-276    AC A0A0E0KUY7.1
#=GS A0A232FBT6_9HYME/5-77       AC A0A232FBT6.1
#=GS A0A0V1NF05_9BILA/12-195     AC A0A0V1NF05.1
#=GS A0A077ZBV8_TRITR/3-644      AC A0A077ZBV8.1
#=GS A0A452R984_URSAM/13-434     AC A0A452R984.1
#=GS B4GZB9_DROPE/3-697          AC B4GZB9.1
#=GS A0A182NQW7_9DIPT/11-586     AC A0A182NQW7.1
#=GS B4K764_DROMO/4-700          AC B4K764.1
#=GS A0A2J7PF85_9NEOP/1-493      AC A0A2J7PF85.1
#=GS A0A445B7U1_ARAHY/29-230     AC A0A445B7U1.1
#=GS A0A154PIZ5_DUFNO/1-570      AC A0A154PIZ5.1
#=GS A0A367KTY1_RHIST/351-824    AC A0A367KTY1.1
#=GS A0A1Y1XZE5_9FUNG/333-812    AC A0A1Y1XZE5.1
#=GS Q54XC9_DICDI/7-245          AC Q54XC9.1
#=GS A0A183MLN7_9TREM/530-833    AC A0A183MLN7.1
#=GS A0A166LY83_9AGAM/374-810    AC A0A166LY83.1
#=GS J4GU80_9APHY/400-762        AC J4GU80.1
#=GS A0A1U7V0U2_NICSY/476-828    AC A0A1U7V0U2.1
#=GS A0A084W0G1_ANOSI/5-196      AC A0A084W0G1.1
#=GS G7DSS0_MIXOS/81-310         AC G7DSS0.1
#=GS A0A182MK59_9DIPT/1-67       AC A0A182MK59.1
#=GS A0A1E4TYV4_PACTA/12-214     AC A0A1E4TYV4.1
#=GS A0A0D0DT93_9AGAM/43-256     AC A0A0D0DT93.1
#=GS A0A2R9A5T4_PANPA/13-740     AC A0A2R9A5T4.1
#=GS A0A2C9LBJ3_BIOGL/9-729      AC A0A2C9LBJ3.1
#=GS A0A1J1IGS3_9DIPT/360-618    AC A0A1J1IGS3.1
#=GS A0A0L0GF96_9EUKA/403-749    AC A0A0L0GF96.1
#=GS A0A0K3C3T2_RHOTO/80-299     AC A0A0K3C3T2.1
#=GS A0A059AA21_EUCGR/101-289    AC A0A059AA21.1
#=GS A0A120E8K2_9BASI/92-341     AC A0A120E8K2.1
#=GS A0A1D6JDW1_MAIZE/123-458    AC A0A1D6JDW1.1
#=GS S2K2L2_MUCC1/348-834        AC S2K2L2.1
#=GS A0A1D2MIX7_ORCCI/6-653      AC A0A1D2MIX7.1
#=GS A0A2V3J6S6_9FLOR/88-163     AC A0A2V3J6S6.1
#=GS A0A238FL44_9BASI/458-944    AC A0A238FL44.1
#=GS A0A2H3EIM9_ARMGA/34-246     AC A0A2H3EIM9.1
#=GS A0A091JKJ7_EGRGA/1-643      AC A0A091JKJ7.1
#=GS A0A453CSW8_AEGTS/1-124      AC A0A453CSW8.1
#=GS K7EUG6_PONAB/497-705        AC K7EUG6.1
#=GS A0A287BTG5_PIG/13-641       AC A0A287BTG5.1
#=GS A0A067M8V2_9AGAM/383-807    AC A0A067M8V2.1
#=GS A0A482VU54_9CUCU/1-241      AC A0A482VU54.1
#=GS A0A0F7RSV2_9BASI/23-240     AC A0A0F7RSV2.1
#=GS A0A367J034_9FUNG/163-543    AC A0A367J034.1
#=GS A0A0W0FCC9_9AGAR/384-588    AC A0A0W0FCC9.1
#=GS A0A0V1AXI2_TRISP/16-352     AC A0A0V1AXI2.1
#=GS F1A2R1_DICPU/7-245          AC F1A2R1.1
#=GS A0A182XP30_ANOQN/94-581     AC A0A182XP30.1
#=GS A0A484BMM6_DRONA/948-1644   AC A0A484BMM6.1
#=GS A0A3B3CWI7_ORYME/8-94       AC A0A3B3CWI7.1
#=GS B9T865_RICCO/20-164         AC B9T865.1
#=GS A0A1D1V6Z7_RAMVA/52-709     AC A0A1D1V6Z7.1
#=GS A0A059A8T7_EUCGR/502-854    AC A0A059A8T7.1
#=GS A0A0M9A488_9HYME/5-70       AC A0A0M9A488.1
#=GS M5XM35_PRUPE/26-229         AC M5XM35.1
#=GS G7JB78_MEDTR/434-789        AC G7JB78.2
#=GS K7EUG6_PONAB/78-503         AC K7EUG6.1
#=GS A0A1J8Q8S9_9AGAM/386-776    AC A0A1J8Q8S9.1
#=GS A0A1U7VDW0_NICSY/469-821    AC A0A1U7VDW0.1
#=GS B0CYS7_LACBS/41-250         AC B0CYS7.1
#=GS A0A2P5QR01_GOSBA/469-756    AC A0A2P5QR01.1
#=GS R9ACU0_WALI9/20-203         AC R9ACU0.1
#=GS A0A2H3XRF4_PHODC/50-256     AC A0A2H3XRF4.1
#=GS A0A1A6HJT1_NEOLE/156-228    AC A0A1A6HJT1.1
#=GS A0A1S3RK33_SALSA/8-698      AC A0A1S3RK33.1
#=GS F4WC99_ACREC/1-619          AC F4WC99.1
#=GS A0A3Q1GCD7_9TELE/8-718      AC A0A3Q1GCD7.1
#=GS A0A3Q0IJG8_DIACI/147-203    AC A0A3Q0IJG8.1
#=GS A0A093G5N5_DRYPU/1-642      AC A0A093G5N5.1
#=GS A0A0V0WM14_9BILA/1-144      AC A0A0V0WM14.1
#=GS V4V9S1_9ROSI/25-231         AC V4V9S1.1
#=GS A0A099ZN49_TINGU/1-643      AC A0A099ZN49.1
#=GS A0A2I3GLE0_NOMLE/1-395      AC A0A2I3GLE0.1
#=GS I1BU21_RHIO9/30-208         AC I1BU21.1
#=GS S4RXH6_PETMA/1-484          AC S4RXH6.1
#=GS A0A2H5NJR2_CITUN/25-231     AC A0A2H5NJR2.1
#=GS A0A409WFQ2_PSICY/53-251     AC A0A409WFQ2.1
#=GS A0A2I0M1N3_COLLI/1-641      AC A0A2I0M1N3.1
#=GS A0A1S2Y8D5_CICAR/20-219     AC A0A1S2Y8D5.1
#=GS A0A088AVE5_APIME/5-694      AC A0A088AVE5.1
#=GS A0A0C3QPJ2_9AGAM/2-211      AC A0A0C3QPJ2.1
#=GS A0A0V0WLY8_9BILA/70-666     AC A0A0V0WLY8.1
#=GS A0A1Y2FJ57_9FUNG/1-236      AC A0A1Y2FJ57.1
#=GS A0A1X7UN76_AMPQE/217-645    AC A0A1X7UN76.1
#=GS A0A1Y1UKA1_9TREE/54-242     AC A0A1Y1UKA1.1
#=GS A0A2Y9PYC0_DELLE/223-683    AC A0A2Y9PYC0.1
#=GS A0A1J1IGS3_9DIPT/4-363      AC A0A1J1IGS3.1
#=GS R7TDB5_CAPTE/335-640        AC R7TDB5.1
#=GS A0A0D3EHK6_BRAOL/470-829    AC A0A0D3EHK6.1
#=GS A0A1X2IQZ5_9FUNG/97-291     AC A0A1X2IQZ5.1
#=GS A0A0V1H909_9BILA/339-637    AC A0A0V1H909.1
#=GS F7C806_XENTR/6-725          AC F7C806.1
#=GS A0A0V0TAE0_9BILA/19-343     AC A0A0V0TAE0.1
#=GS F6Y295_XENTR/6-725          AC F6Y295.1
#=GS A0A0V0SGU2_9BILA/17-351     AC A0A0V0SGU2.1
#=GS A0A137QGL1_9AGAR/390-759    AC A0A137QGL1.1
#=GS A0A163J7W6_ABSGL/40-313     AC A0A163J7W6.1
#=GS A0A182ULY3_ANOME/1-49       AC A0A182ULY3.1
#=GS D7LYD0_ARALL/7-183          AC D7LYD0.1
#=GS A0A137QGL1_9AGAR/55-248     AC A0A137QGL1.1
#=GS A0A0V1AZ23_TRISP/100-650    AC A0A0V1AZ23.1
#=GS A0A1Y1XZE5_9FUNG/9-267      AC A0A1Y1XZE5.1
#=GS A0A195BIT6_9HYME/5-72       AC A0A195BIT6.1
#=GS A0A3B3THX8_9TELE/8-727      AC A0A3B3THX8.1
#=GS M5E6Z2_MALS4/324-775        AC M5E6Z2.1
#=GS A0A226PFM8_COLVI/10-734     AC A0A226PFM8.1
#=GS A0A1U7LS04_NEOID/334-792    AC A0A1U7LS04.1
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