#=GF ID   PAXX
#=GF AC   PF15384.10
#=GF DE   PAXX, PAralog of XRCC4 and XLF, also called C9orf142
#=GF PI   DUF4610;
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Jackhmmer:Q9BUH6
#=GF GA   25.00 25.00;
#=GF TC   25.00 25.00;
#=GF NC   24.80 24.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   25574025
#=GF RT   DNA repair. PAXX, a paralog of XRCC4 and XLF, interacts with Ku
#=GF RT   to promote DNA double-strand break repair.
#=GF RA   Ochi T, Blackford AN, Coates J, Jhujh S, Mehmood S, Tamura N,
#=GF RA   Travers J, Wu Q, Draviam VM, Robinson CV, Blundell TL, Jackson
#=GF RA   SP;
#=GF RL   Science. 2015;347:185-188.
#=GF DR   INTERPRO; IPR027873;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   PAXX is a set of eukaryotic proteins that belong to the XRCC4
#=GF CC   superfamily of DNA-double-strand break-repair proteins. PAXX
#=GF CC   interacts directly with DSB-repair protein Ku and is recruited
#=GF CC   to DNA-damage sites in cells thus functioning with XRCC4 and XLF
#=GF CC   to bring about DSB repair and cell survival in response to
#=GF CC   DSB-inducing agents [1].
#=GF SQ   535
#=GS A0A8V1AIN8_CHICK/61-205   AC A0A8V1AIN8.1
#=GS A0A7L2BHV1_9PASS/1-119    AC A0A7L2BHV1.1
#=GS A0A091CUV4_FUKDA/433-587  AC A0A091CUV4.1
#=GS A0A7L4JDL1_9PASS/2-119    AC A0A7L4JDL1.1
#=GS A0A3Q2DG13_CYPVA/8-131    AC A0A3Q2DG13.1
#=GS A0A673GJS5_9TELE/12-197   AC A0A673GJS5.1
#=GS A0A6F9AFE6_9TELE/12-59    AC A0A6F9AFE6.1
#=GS G3R7L2_GORGO/8-204        AC G3R7L2.1
#=GS A0A8C0JN81_CANLU/58-176   AC A0A8C0JN81.1
#=GS A0A1X7VAM5_AMPQE/13-194   AC A0A1X7VAM5.1
#=GS A0A7F8R576_LEPWE/12-201   AC A0A7F8R576.1
#=GS A0A6I9IQ92_VICPA/11-65    AC A0A6I9IQ92.1
#=GS A0A6P5JTW0_PHACI/10-216   AC A0A6P5JTW0.1
#=GS A0A1U7RBJ1_MESAU/11-207   AC A0A1U7RBJ1.1
#=GS A0A7L0BYL4_9AVES/1-132    AC A0A7L0BYL4.1
#=GS A0A6P9DAT8_PANGU/8-196    AC A0A6P9DAT8.1
#=GS A0A553PW55_9TELE/12-196   AC A0A553PW55.1
#=GS A0A8I3MQ58_CANLF/10-206   AC A0A8I3MQ58.1
#=GS A0A4W5Q5J5_9TELE/19-193   AC A0A4W5Q5J5.1
#=GS A0A3P8VFZ7_CYNSE/8-194    AC A0A3P8VFZ7.1
#=GS A0A8D2JWI6_THEGE/8-204    AC A0A8D2JWI6.1
#=GS A0A210PQ60_MIZYE/18-205   AC A0A210PQ60.1
#=GS K7FJJ1_PELSI/11-141       AC K7FJJ1.1
#=GS A0A3Q1NLG8_BOVIN/6-204    AC A0A3Q1NLG8.1
#=GS A0A6J0DJ60_PERMB/11-199   AC A0A6J0DJ60.1
#=GS A0A7K8Q0R9_COCCO/1-139    AC A0A7K8Q0R9.1
#=GS A0A6P3J022_BISBI/6-62     AC A0A6P3J022.1
#=GS A0A8B8XKP2_BALMU/10-175   AC A0A8B8XKP2.1
#=GS A0A7K8QX16_9PASS/50-172   AC A0A7K8QX16.1
#=GS A0A674IKV0_TERCA/12-202   AC A0A674IKV0.1
#=GS A0A6J2GL82_9PASS/10-192   AC A0A6J2GL82.2
#=GS A0A7J7F786_DICBM/10-201   AC A0A7J7F786.1
#=GS A0A8C1EUF9_CYPCA/13-198   AC A0A8C1EUF9.1
#=GS A0A7K7FX22_CHIMN/52-190   AC A0A7K7FX22.1
#=GS A0A8J6EJF8_ELECQ/4-145    AC A0A8J6EJF8.1
#=GS A0A3Q7NQQ1_CALUR/11-207   AC A0A3Q7NQQ1.1
#=GS A0A8D2DE48_SCIVU/10-206   AC A0A8D2DE48.1
#=GS A0A7L3Y1Z5_9AVES/53-182   AC A0A7L3Y1Z5.1
#=GS PAXX_HUMAN/8-204          AC Q9BUH6.2
#=GS A0A2U9BQT6_SCOMX/12-198   AC A0A2U9BQT6.1
#=GS A0A2U3Y117_LEPWE/12-208   AC A0A2U3Y117.1
#=GS A0A8B8XS55_BALMU/10-67    AC A0A8B8XS55.1
#=GS A0A401PHZ7_SCYTO/16-207   AC A0A401PHZ7.1
#=GS A0A5N5KE76_PANHP/26-210   AC A0A5N5KE76.1
#=GS A0A8C6EI28_MICMU/11-207   AC A0A8C6EI28.1
#=GS G3W4I5_SARHA/10-215       AC G3W4I5.2
#=GS A0A6I8N3L4_ORNAN/50-165   AC A0A6I8N3L4.1
#=GS A0A8C6JHP8_MELUD/46-179   AC A0A8C6JHP8.1
#=GS A0A8J6EJL0_ELECQ/9-200    AC A0A8J6EJL0.1
#=GS A0A2R9AWV4_PANPA/8-204    AC A0A2R9AWV4.1
#=GS A0A7E6DHE8_9CHIR/15-95    AC A0A7E6DHE8.1
#=GS A0A4W5PZT0_9TELE/26-210   AC A0A4W5PZT0.1
#=GS A0A2K5CFN1_AOTNA/8-204    AC A0A2K5CFN1.1
#=GS A0A3Q2HAQ4_HORSE/51-144   AC A0A3Q2HAQ4.1
#=GS A0A1V4KPK0_PATFA/74-245   AC A0A1V4KPK0.1
#=GS A0A8J7P1T9_ATRSP/669-834  AC A0A8J7P1T9.1
#=GS A0A7L4MPF4_GLAPT/59-192   AC A0A7L4MPF4.1
#=GS A0A7K7RGI1_9PASS/7-127    AC A0A7K7RGI1.1
#=GS A0A6J0DJ39_PERMB/11-200   AC A0A6J0DJ39.1
#=GS A0A7K4Q735_MELMO/5-127    AC A0A7K4Q735.1
#=GS A0A7N8XUI3_9TELE/8-191    AC A0A7N8XUI3.1
#=GS A0A7L2Q9G7_9PASS/2-121    AC A0A7L2Q9G7.1
#=GS A0A2Y9EBT1_TRIMA/14-206   AC A0A2Y9EBT1.1
#=GS A0A6J3RJR2_TURTR/10-207   AC A0A6J3RJR2.1
#=GS A0A7L1ZQL7_LEILU/2-119    AC A0A7L1ZQL7.1
#=GS A0A8B8XLI8_BALMU/10-204   AC A0A8B8XLI8.1
#=GS B5XCG0_SALSA/26-210       AC B5XCG0.1
#=GS A0A7J5ZUI6_AMEME/21-202   AC A0A7J5ZUI6.1
#=GS A0A3Q3WAA7_MOLML/36-219   AC A0A3Q3WAA7.1
#=GS A0A2U9BRH0_SCOMX/149-227  AC A0A2U9BRH0.1
#=GS A0A4Z2BGK9_9TELE/8-150    AC A0A4Z2BGK9.1
#=GS G5BEI8_HETGA/98-267       AC G5BEI8.1
#=GS M3YHG1_MUSPF/9-204        AC M3YHG1.1
#=GS A0A3P9P328_POERE/33-105   AC A0A3P9P328.1
#=GS A0A8J6EJT8_ELECQ/9-135    AC A0A8J6EJT8.1
#=GS A0A5J5MLF7_MUNRE/10-208   AC A0A5J5MLF7.1
#=GS A0A6J0X4Y0_ODOVR/10-207   AC A0A6J0X4Y0.1
#=GS A0A3Q7QX59_VULVU/10-206   AC A0A3Q7QX59.1
#=GS A0A4X2KEF2_VOMUR/10-214   AC A0A4X2KEF2.1
#=GS A0A7M7PHI1_STRPU/15-205   AC A0A7M7PHI1.1
#=GS A0A8D0GH84_SPHPU/9-207    AC A0A8D0GH84.1
#=GS V4BFG4_LOTGI/11-201       AC V4BFG4.1
#=GS A0A8C8DDL1_ONCTS/26-211   AC A0A8C8DDL1.1
#=GS A0A852C581_9PICI/10-153   AC A0A852C581.1
#=GS A0A553PW54_9TELE/12-178   AC A0A553PW54.1
#=GS A2AJ30_MOUSE/10-157       AC A2AJ30.1
#=GS A0A665TUY2_ECHNA/45-228   AC A0A665TUY2.1
#=GS A0A672YJS1_9TELE/24-183   AC A0A672YJS1.1
#=GS A0A2U3WU98_ODORO/59-177   AC A0A2U3WU98.1
#=GS A0A7E6DH71_9CHIR/15-164   AC A0A7E6DH71.1
#=GS A0A7K5B0G7_9FURN/55-181   AC A0A7K5B0G7.1
#=GS A0A1S3G969_DIPOR/2-167    AC A0A1S3G969.1
#=GS A0A7K6FTK8_9CORV/2-129    AC A0A7K6FTK8.1
#=GS A0A151MF11_ALLMI/8-203    AC A0A151MF11.1
#=GS A0A6J2QFB3_COTGO/8-189    AC A0A6J2QFB3.1
#=GS A0A8C5K3Z4_JACJA/10-204   AC A0A8C5K3Z4.1
#=GS A0A6I9LC36_PERMB/11-199   AC A0A6I9LC36.1
#=GS A0A8B7R7R9_HIPAR/64-191   AC A0A8B7R7R9.1
#=GS F6XAV1_HORSE/226-273      AC F6XAV1.2
#=GS A0A340XC61_LIPVE/10-65    AC A0A340XC61.1
#=GS A0A8B7W0T0_CASCN/7-195    AC A0A8B7W0T0.1
#=GS L8J5J8_9CETA/1-166        AC L8J5J8.1
#=GS A0A8I3NAU1_CANLF/11-187   AC A0A8I3NAU1.1
#=GS A0A2B4SG76_STYPI/26-209   AC A0A2B4SG76.1
#=GS G3U5R1_LOXAF/10-205       AC G3U5R1.1
#=GS A0A7L1QEV9_9PASS/2-125    AC A0A7L1QEV9.1
#=GS A0A7K8U667_OCEOC/1-131    AC A0A7K8U667.1
#=GS A0A8C6YZT0_NOTPE/54-168   AC A0A8C6YZT0.1
#=GS A0A8C1ESU8_CYPCA/13-198   AC A0A8C1ESU8.1
#=GS H0W476_CAVPO/10-206       AC H0W476.1
#=GS A0A7K9WGQ9_9PASS/2-128    AC A0A7K9WGQ9.1
#=GS A0A8C4DEG0_DICLA/8-193    AC A0A8C4DEG0.1
#=GS A0A667Y5X7_9TELE/8-193    AC A0A667Y5X7.1
#=GS A0A8C7EQE5_NEOVI/13-201   AC A0A8C7EQE5.1
#=GS A0A3B3H5K0_ORYLA/42-191   AC A0A3B3H5K0.1
#=GS A0A6P5CM34_BOSIN/55-174   AC A0A6P5CM34.1
#=GS A0A3Q2DGF8_CYPVA/8-178    AC A0A3Q2DGF8.1
#=GS A0A7L1RZ02_9PASS/1-121    AC A0A7L1RZ02.1
#=GS A0A7L3Q1B4_9DEND/56-183   AC A0A7L3Q1B4.1
#=GS A0A7K9ZQU6_9CORV/2-121    AC A0A7K9ZQU6.1
#=GS A0A7K6R441_9PASS/1-128    AC A0A7K6R441.1
#=GS A0A8B7JFR9_9AVES/31-193   AC A0A8B7JFR9.1
#=GS A0A7K9NW75_9CORV/7-127    AC A0A7K9NW75.1
#=GS A0A7K8MQQ5_9CORV/5-127    AC A0A7K8MQQ5.1
#=GS A0A6P5CM34_BOSIN/6-61     AC A0A6P5CM34.1
#=GS A0A851PA88_9GALL/1-129    AC A0A851PA88.1
#=GS A0A7L2NFU4_PYCJO/1-118    AC A0A7L2NFU4.1
#=GS A0A851WPI7_CORMO/5-127    AC A0A851WPI7.1
#=GS A0A8B7W1C8_CASCN/7-203    AC A0A8B7W1C8.1
#=GS A0A8C6N0V9_MUSSI/10-205   AC A0A8C6N0V9.1
#=GS A0A444V2G5_ACIRT/39-127   AC A0A444V2G5.1
#=GS PAXX_MOUSE/10-205         AC Q8K0Y7.1
#=GS A0A8C5GAK5_9TELE/63-221   AC A0A8C5GAK5.1
#=GS A0A6F9A9G1_9TELE/19-156   AC A0A6F9A9G1.1
#=GS A0A851Q0B4_ANHAN/1-132    AC A0A851Q0B4.1
#=GS A0A3Q7NIN3_CALUR/11-200   AC A0A3Q7NIN3.1
#=GS A0A850U2K3_GRUAM/1-132    AC A0A850U2K3.1
#=GS A0A2I2YMQ8_GORGO/8-205    AC A0A2I2YMQ8.1
#=GS A0A7L3TE82_RISTR/49-177   AC A0A7L3TE82.1
#=GS A0A7L2VZE2_9AVES/70-192   AC A0A7L2VZE2.1
#=GS A0A0G2QC22_RAT/64-225     AC A0A0G2QC22.2
#=GS A0A6P8IJG2_ACTTE/27-205   AC A0A6P8IJG2.1
#=GS A0A5C6N3C1_9TELE/12-136   AC A0A5C6N3C1.1
#=GS A0A8C3CHF5_CAIMO/257-407  AC A0A8C3CHF5.1
#=GS A0A6I9IQ92_VICPA/60-178   AC A0A6I9IQ92.1
#=GS A0A287A735_PIG/76-204     AC A0A287A735.1
#=GS A0A8M1FVH0_URSMA/10-206   AC A0A8M1FVH0.1
#=GS A0A3M6URP1_POCDA/25-196   AC A0A3M6URP1.1
#=GS A0A673ZDN6_SALTR/26-211   AC A0A673ZDN6.1
#=GS R7VL35_CAPTE/18-207       AC R7VL35.1
#=GS A0A7N9CZ52_MACFA/8-203    AC A0A7N9CZ52.1
#=GS A0A7J7RW10_PIPKU/10-215   AC A0A7J7RW10.1
#=GS A0A8I6A089_RAT/10-175     AC A0A8I6A089.1
#=GS A0A8B8XLJ3_BALMU/10-171   AC A0A8B8XLJ3.1
#=GS A6QQL6_BOVIN/55-174       AC A6QQL6.1
#=GS A0A5N4E917_CAMDR/11-217   AC A0A5N4E917.1
#=GS A0A8C4ALY8_9TELE/12-200   AC A0A8C4ALY8.1
#=GS A0A8U0V5W7_MUSPF/57-119   AC A0A8U0V5W7.1
#=GS A0A7L2CQ16_CATFU/3-127    AC A0A7L2CQ16.1
#=GS W5M1K3_LEPOC/26-211       AC W5M1K3.1
#=GS A0A7M4FXW8_CROPO/36-119   AC A0A7M4FXW8.1
#=GS A0A5E4AAV8_MARMO/10-206   AC A0A5E4AAV8.1
#=GS A0A8J0T3G8_XENTR/16-185   AC A0A8J0T3G8.1
#=GS A0A8C3SCN9_CHESE/11-205   AC A0A8C3SCN9.1
#=GS A0A7L2WY02_PANHA/48-186   AC A0A7L2WY02.1
#=GS A0A8J4NGT2_EUDMI/1-137    AC A0A8J4NGT2.1
#=GS A0A8C5QKS7_9ANUR/72-117   AC A0A8C5QKS7.1
#=GS A0A5F8GAL8_MONDO/10-199   AC A0A5F8GAL8.1
#=GS A0A6P5ACF2_BRABE/17-208   AC A0A6P5ACF2.1
#=GS A0A8C7HA66_ONCKI/26-211   AC A0A8C7HA66.1
#=GS A0A8B7R7R9_HIPAR/12-65    AC A0A8B7R7R9.1
#=GS A0A643BTH2_BALPH/1-116    AC A0A643BTH2.1
#=GS A0A6J1YNM9_ACIJB/11-207   AC A0A6J1YNM9.1
#=GS A0A7J8EF27_MOLMO/96-292   AC A0A7J8EF27.1
#=GS A0A852FDI2_PEUTA/2-121    AC A0A852FDI2.1
#=GS A0A814ARV2_ADIRI/36-218   AC A0A814ARV2.1
#=GS A0A674NEE5_TAKRU/23-158   AC A0A674NEE5.1
#=GS A0A1A6GS05_NEOLE/11-208   AC A0A1A6GS05.1
#=GS A0A7K5QW79_9PASE/2-121    AC A0A7K5QW79.1
#=GS A0A8D2GZH6_UROPR/10-206   AC A0A8D2GZH6.1
#=GS A0A8C7X7E3_9TELE/1-161    AC A0A8C7X7E3.1
#=GS A0A6P8SDH3_GEOSA/7-197    AC A0A6P8SDH3.1
#=GS A0A2K6TPF3_SAIBB/8-204    AC A0A2K6TPF3.1
#=GS L8YA61_TUPCH/10-146       AC L8YA61.1
#=GS A0A7K5SZW4_9FRIN/2-121    AC A0A7K5SZW4.1
#=GS A0A8D0FYR7_STROC/76-158   AC A0A8D0FYR7.1
#=GS A0A8C6UD65_9GOBI/6-187    AC A0A8C6UD65.1
#=GS A0A6I8RLW9_XENTR/12-203   AC A0A6I8RLW9.2
#=GS A0A813WU47_9BILA/16-220   AC A0A813WU47.1
#=GS A0A7K5VSP5_9CORV/6-127    AC A0A7K5VSP5.1
#=GS A0A7L2H5B1_NYCGR/1-126    AC A0A7L2H5B1.1
#=GS A0A6J3RLS6_TURTR/59-177   AC A0A6J3RLS6.1
#=GS A0A7K5X5X0_9CHAR/47-182   AC A0A7K5X5X0.1
#=GS A0A6J2WTU3_CHACN/12-196   AC A0A6J2WTU3.1
#=GS A0A7L3FYT4_9GRUI/1-137    AC A0A7L3FYT4.1
#=GS A0A7L2U243_BALRX/47-187   AC A0A7L2U243.1
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#=GS A0A8B8XLA5_BALMU/10-175   AC A0A8B8XLA5.1
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