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Database: Pfam
Entry: PF01057
LinkDB: PF01057
Original site: PF01057 
#=GF ID   Parvo_NS1
#=GF AC   PF01057.18
#=GF DE   Parvovirus non-structural protein NS1
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_400 (release 3.0)
#=GF GA   20.00 18.00;
#=GF TC   20.00 18.20;
#=GF NC   19.90 17.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8372437
#=GF RT   Nuclear targeting of the parvoviral replicator molecule NS1:
#=GF RT   evidence for self-association prior to nuclear transport. 
#=GF RA   Nuesch JP, Tattersall P; 
#=GF RL   Virology 1993;196:637-651.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9454701
#=GF RT   Nonstructural protein-2 and the replication of canine
#=GF RT   parvovirus. 
#=GF RA   Wang D, Yuan W, Davis I, Parrish CR; 
#=GF RL   Virology 1998;240:273-281.
#=GF DR   INTERPRO; IPR001257;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This family also contains the NS2 protein. Parvoviruses encode
#=GF CC   two non-structural proteins, NS1 and NS2. The mRNA for NS2
#=GF CC   contains the coding sequence for the first 87 amino acids of
#=GF CC   NS1, then by an alternative splicing mechanism mRNA from a
#=GF CC   different reading frame, encoding the last 78 amino acids, makes
#=GF CC   up the full length of the NS2 mRNA [2]. NS1, is the major
#=GF CC   non-structural protein.  It is essential for DNA replication. 
#=GF CC   It is an 83-kDa nuclear phosphoprotein.  It has DNA helicase and
#=GF CC   ATPase activity [1].  
#=GF SQ   117
#=GS A0A443Q9D7_9ACAR/165-371  AC A0A443Q9D7.1
#=GS NS1_ADVG/303-581          AC P24030.2
#=GS T1I3J3_RHOPR/113-320      AC T1I3J3.1
#=GS A0A067PKM9_9AGAM/7-59     AC A0A067PKM9.1
#=GS X1X3G9_ACYPI/20-151       AC X1X3G9.1
#=GS Q9DW64_RCMVM/48-326       AC Q9DW64.1
#=GS T1I3J1_RHOPR/152-333      AC T1I3J1.1
#=GS A0A091DB60_FUKDA/1-59     AC A0A091DB60.1
#=GS Q77NU8_PFDNG/256-498      AC Q77NU8.1
#=GS A0A3G8FB72_9CAUD/219-356  AC A0A3G8FB72.1
#=GS A0A0R3SYX2_HYMDI/123-272  AC A0A0R3SYX2.1
#=GS Q9JFY0_BMDNS/52-405       AC Q9JFY0.1
#=GS X1XI85_ACYPI/11-84        AC X1XI85.1
#=GS A0A0D0AHV4_9AGAM/24-75    AC A0A0D0AHV4.1
#=GS A0A2J7QND1_9NEOP/39-286   AC A0A2J7QND1.1
#=GS U6E974_9CAUD/220-356      AC U6E974.1
#=GS A0A0R3TEN8_HYMNN/232-356  AC A0A0R3TEN8.1
#=GS A0A0R3SMH5_HYMDI/159-316  AC A0A0R3SMH5.1
#=GS A0A191ULI0_9ADEN/50-195   AC A0A191ULI0.1
#=GS U5NEK6_9ADEN/1-275        AC U5NEK6.1
#=GS U5NEA5_9ADEN/2-266        AC U5NEA5.1
#=GS J9LI54_ACYPI/208-315      AC J9LI54.1
#=GS A0A3G8FB96_9CAUD/219-356  AC A0A3G8FB96.1
#=GS NS1_HBOC1/303-579         AC D0EZM8.1
#=GS VU94_HHV6U/222-485        AC Q00683.1
#=GS A0A075FAA9_9ADEN/1-247    AC A0A075FAA9.1
#=GS E9I3L8_DAPPU/361-559      AC E9I3L8.1
#=GS J9LL47_ACYPI/315-477      AC J9LL47.2
#=GS A0A1D8QM97_9ADEN/43-186   AC A0A1D8QM97.1
#=GS A0A0R3SZ58_HYMDI/24-254   AC A0A0R3SZ58.1
#=GS I3PMM4_9ADEN/2-246        AC I3PMM4.1
#=GS A0A3S0VZK0_9MICC/6-118    AC A0A3S0VZK0.1
#=GS A0A075FBK5_9ADEN/8-167    AC A0A075FBK5.1
#=GS A0A1B1SLH1_9ADEN/1-271    AC A0A1B1SLH1.1
#=GS D3X6W7_CHPV1/267-542      AC D3X6W7.1
#=GS A0A4D6B238_9CAUD/219-401  AC A0A4D6B238.1
#=GS J9LI55_ACYPI/344-498      AC J9LI55.2
#=GS U5NDW8_9ADEN/9-168        AC U5NDW8.1
#=GS A0A0W0FVN8_9AGAR/59-110   AC A0A0W0FVN8.1
#=GS A0A164MUI8_9CRUS/372-564  AC A0A164MUI8.1
#=GS X1XAP6_ACYPI/278-387      AC X1XAP6.1
#=GS A0A2N0Z432_9BACI/290-420  AC A0A2N0Z432.1
#=GS NS1_AADNV/273-561         AC Q90185.1
#=GS A0A0C9ZXF8_9AGAM/176-225  AC A0A0C9ZXF8.1
#=GS G3IRD1_METTV/476-625      AC G3IRD1.1
#=GS X1XJ53_ACYPI/82-237       AC X1XJ53.1
#=GS A0A087VWK1_ECHMU/2-125    AC A0A087VWK1.2
#=GS J9M820_ACYPI/504-637      AC J9M820.2
#=GS A0A482XJW9_LAOST/5-90     AC A0A482XJW9.1
#=GS A0A443QB72_9ACAR/10-75    AC A0A443QB72.1
#=GS T1I545_RHOPR/54-145       AC T1I545.1
#=GS R4N2I4_9ADEN/1-272        AC R4N2I4.1
#=GS NS1_PAVHV/206-487         AC Q9PZT1.1
#=GS Q4U3C5_BMDND/42-314       AC Q4U3C5.1
#=GS T1KBZ7_TETUR/2-83         AC T1KBZ7.1
#=GS J9LDI1_ACYPI/259-425      AC J9LDI1.2
#=GS A0A1D8QMB1_9ADEN/1-263    AC A0A1D8QMB1.1
#=GS Q30BS4_9ADEN/1-267        AC Q30BS4.1
#=GS A0A2S9KEC2_9BURK/462-623  AC A0A2S9KEC2.1
#=GS A0A1P8SW63_9ADEN/47-187   AC A0A1P8SW63.1
#=GS A0A0C2YEJ9_HEBCY/19-115   AC A0A0C2YEJ9.1
#=GS I3VQC2_9BETA/220-491      AC I3VQC2.1
#=GS A0A2J7RSB0_9NEOP/419-682  AC A0A2J7RSB0.1
#=GS X1WQG0_ACYPI/1282-1442    AC X1WQG0.1
#=GS A0A4D5ZHK2_9VIRU/164-386  AC A0A4D5ZHK2.1
#=GS A0A3G8F858_9CAUD/221-355  AC A0A3G8F858.1
#=GS T1HE18_RHOPR/86-169       AC T1HE18.1
#=GS A0A183M632_9TREM/327-519  AC A0A183M632.1
#=GS A0A0D0BIS9_9AGAM/176-225  AC A0A0D0BIS9.1
#=GS A0A0R3SJP8_HYMDI/9-161    AC A0A0R3SJP8.1
#=GS A0A0R3SKT2_HYMDI/149-253  AC A0A0R3SKT2.1
#=GS A0A420XHZ2_9PAST/255-437  AC A0A420XHZ2.1
#=GS A0A183NN83_9TREM/1-134    AC A0A183NN83.1
#=GS Q9JFY3_BMDNS/594-712      AC Q9JFY3.1
#=GS Q84365_MUMIP/316-599      AC Q84365.1
#=GS X5M4V8_9ADEN/43-185       AC X5M4V8.1
#=GS A0A1P8SW60_9ADEN/2-268    AC A0A1P8SW60.1
#=GS A0A0R3TQ81_HYMNN/189-287  AC A0A0R3TQ81.1
#=GS A0A0N1PH43_PAPMA/227-433  AC A0A0N1PH43.1
#=GS A0A0R2CR58_9LACO/473-645  AC A0A0R2CR58.1
#=GS REP40_AAV2S/1-261         AC Q89269.1
#=GS E0YC54_9ADEN/2-265        AC E0YC54.1
#=GS A0A0W0GEE4_9AGAR/61-124   AC A0A0W0GEE4.1
#=GS A0A0R3SKT2_HYMDI/373-473  AC A0A0R3SKT2.1
#=GS I3PMM2_9ADEN/1-277        AC I3PMM2.1
#=GS A0A3S3P4E9_9ACAR/23-135   AC A0A3S3P4E9.1
#=GS A0A444SMK3_ARMVU/295-500  AC A0A444SMK3.1
#=GS Q9IBP6_IHHNV/383-608      AC Q9IBP6.1
#=GS A0A409W7H9_9AGAR/249-296  AC A0A409W7H9.1
#=GS A0A3Q0KU56_SCHMA/394-522  AC A0A3Q0KU56.1
#=GS E0YC57_9ADEN/2-135        AC E0YC57.1
#=GS F8HGR1_9CAUD/223-402      AC F8HGR1.1
#=GS VU94_HHV6Z/221-485        AC Q9WSZ6.1
#=GS U5NED8_9ADEN/26-179       AC U5NED8.1
#=GS W6U8M3_ECHGR/15-200       AC W6U8M3.1
#=GS NS1_PAVBP/182-469         AC P07296.1
#=GS A0A191ULQ7_9ADEN/1-267    AC A0A191ULQ7.1
#=GS YO13_ADEG1/72-204         AC Q64746.1
#=GS H2ESE4_BTPV1/228-505      AC H2ESE4.1
#=GS B2J090_NOSP7/416-590      AC B2J090.1
#=GS A0A2J7RSA2_9NEOP/348-547  AC A0A2J7RSA2.1
#=GS A0A0V8JGX2_9BACI/287-444  AC A0A0V8JGX2.1
#=GS A0A482XLN3_LAOST/99-241   AC A0A482XLN3.1
#=GS REP78_AAV2S/217-485       AC Q89268.1
#=GS REP52_AAV2S/1-261         AC Q89270.1
#=GS J9L7H5_ACYPI/451-576      AC J9L7H5.2
#=GS A0A2U7VKF4_9CAUD/220-356  AC A0A2U7VKF4.1
#=GS E9KL91_9ADEN/1-267        AC E9KL91.1
#=GS REP68_AAV2S/210-485       AC P03132.1
#=GS REP68_AAV2S/210-485       DR PDB; 1S9H B; 225-485;
#=GS REP68_AAV2S/210-485       DR PDB; 1U0J A; 225-485;
#=GS REP68_AAV2S/210-485       DR PDB; 1S9H A; 225-485;
#=GS REP68_AAV2S/210-485       DR PDB; 1S9H C; 225-485;
#=GS NS1_JDNVP/315-513         AC Q90054.1
#=GS A0A0L8GWZ8_OCTBM/1-122    AC A0A0L8GWZ8.1
#=GS A0A0R3TQ85_HYMNN/30-231   AC A0A0R3TQ85.1
#=GS A0A0C3B4N2_9AGAM/4-77     AC A0A0C3B4N2.1
#=GS A0A0B5A527_9CAUD/221-407  AC A0A0B5A527.1
#=GS YO2_ADEG1/1-276           AC Q89621.1
#=GS X5LKA2_9ADEN/5-267        AC X5LKA2.1
#=GS NS1_MUMIP/267-550         AC P03134.1
A0A443Q9D7_9ACAR/165-371             ...........................................................................nwifeynawteteligklhyepafltiykkfsfsknfekakvla---------.......--------........--------.......----.........-.........-......-.-.........---------..-----------...-.-...S....Q..K...VINM...R.....FEEL....IE..MWEETKiq..............nnfLSESE.STDV...ML.Q...WC....SLQE.IN.PNEF.ANT...I.....I.SF..I.....N..K..S..LC.KI.....N.T...L..WFH........................................GQSNAGKSY.IVR..........................SIAN..LC..Q..L.Y.H..Q..I.....PPG....S..N..R..F.....MW..Q...D...AV...NKRLI..IMT.E..P..V..L..D...E..V...AI...E..G...CK..EVFEGT.GCYVP.....VKMKSDQFLAPT...PVII..TSN.TY..-....---.--.-----------............-----------------.....-------------..-----........----------lwa...............................................................
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