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Database: Pfam
Entry: PF06251
LinkDB: PF06251
Original site: PF06251 
#=GF ID   Caps_synth_GfcC
#=GF AC   PF06251.11
#=GF DE   Capsule biosynthesis GfcC
#=GF PI   DUF1017;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   Pfam-B_9574 (release 9.0)
#=GF GA   22.00 22.00;
#=GF TC   22.00 22.00;
#=GF NC   21.90 21.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10200953
#=GF RT   Structure, assembly and regulation of expression of capsules in
#=GF RT   Escherichia coli.
#=GF RA   Whitfield C, Roberts IS;
#=GF RL   Mol Microbiol. 1999;31:1307-1319.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   16030220
#=GF RT   Identification of an Escherichia coli operon required for
#=GF RT   formation of the O-antigen capsule.
#=GF RA   Peleg A, Shifrin Y, Ilan O, Nadler-Yona C, Nov S, Koby S, Baruch
#=GF RA   K, Altuvia S, Elgrably-Weiss M, Abe CM, Knutton S, Saper MA,
#=GF RA   Rosenshine I;
#=GF RL   J Bacteriol. 2005;187:5259-5266.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   17250770
#=GF RT   A novel superfamily containing the beta-grasp fold involved in
#=GF RT   binding diverse soluble ligands. 
#=GF RA   Burroughs AM, Balaji S, Iyer LM, Aravind L; 
#=GF RL   Biol Direct. 2007;2:4-4.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   21449614
#=GF RT   Crystal structure of E. coli group 4 capsule protein GfcC
#=GF RT   reveals a domain organization resembling Wza.
#=GF RA   Sathiyamoorthy K, Mills E, Franzmann TM, Rosenshine I, Saper MA;
#=GF RL   Biochemistry 2011;0:0-0.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010425;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Many bacteria are covered in a layer of surface-associated
#=GF CC   polysaccharide called the capsule. These capsules can be divided
#=GF CC   into four groups depending upon the organisation of genes
#=GF CC   responsible for capsule assembly, the assembly pathway and
#=GF CC   regulation [1].  This family plays a role in group 4 capsule
#=GF CC   biosynthesis [2].  These proteins have a beta-grasp fold [3].
#=GF CC   Two beta-grasp domains, D2 and D3, are arranged in tandem. There
#=GF CC   is a C-terminal amphipathic helix which packs against D3. A
#=GF CC   helical hairpin insert in D2 binds to D3 and constrains its
#=GF CC   position, a conserved arginine residue at the end of this
#=GF CC   hairpin is essential for structural integrity [4].
#=GF SQ   718
#=GS A0A127VJ92_9SPHI/712-822    AC A0A127VJ92.1
#=GS F9D0N7_PREDD/627-834        AC F9D0N7.1
#=GS A0A1X7GVK6_9PROT/745-953    AC A0A1X7GVK6.1
#=GS A0A150XBW9_9BACT/720-840    AC A0A150XBW9.1
#=GS A0A212TLK9_9ALTE/659-890    AC A0A212TLK9.1
#=GS A0A1X0Y0Z5_9DELT/591-821    AC A0A1X0Y0Z5.1
#=GS A0A1M3HFC2_9PROT/415-645    AC A0A1M3HFC2.1
#=GS B6WU55_9DELT/400-576        AC B6WU55.1
#=GS A0A285PZB5_9ALTE/593-828    AC A0A285PZB5.1
#=GS A0A1S1NX60_9GAMM/16-234     AC A0A1S1NX60.1
#=GS I3Z2U4_BELBD/656-855        AC I3Z2U4.1
#=GS F9T1H8_9VIBR/15-244         AC F9T1H8.1
#=GS A0A2A2HZ04_9ALTE/26-261     AC A0A2A2HZ04.1
#=GS A0A125Y3Q1_AERCA/18-251     AC A0A125Y3Q1.1
#=GS A0A0H2MHZ4_VARPD/37-247     AC A0A0H2MHZ4.1
#=GS G2KSB1_MICAA/641-872        AC G2KSB1.1
#=GS A0A177HB20_9RHOB/876-1103   AC A0A177HB20.1
#=GS A0A1H7V781_9DELT/909-1142   AC A0A1H7V781.1
#=GS A0A257EGR2_9BURK/542-777    AC A0A257EGR2.1
#=GS A0A0R0C6J4_9GAMM/3-233      AC A0A0R0C6J4.1
#=GS Q15QX9_PSEA6/17-247         AC Q15QX9.1
#=GS A0A1I3YWI3_9SPHN/489-643    AC A0A1I3YWI3.1
#=GS A0A1M6MRZ8_9PROT/6-100      AC A0A1M6MRZ8.1
#=GS A0A1I0NQ37_9BACT/695-795    AC A0A1I0NQ37.1
#=GS A0A1S2CCX5_9ALTE/586-820    AC A0A1S2CCX5.1
#=GS A0A0U1PZD1_9BURK/278-503    AC A0A0U1PZD1.1
#=GS A0A1N7JDF0_9PROT/700-915    AC A0A1N7JDF0.1
#=GS A0A2D1U8R6_9SPHI/680-831    AC A0A2D1U8R6.1
#=GS A0A1I2GUQ7_9BURK/48-221     AC A0A1I2GUQ7.1
#=GS A0A0F4PT92_9GAMM/676-906    AC A0A0F4PT92.1
#=GS A0A1I6GT20_9GAMM/30-133     AC A0A1I6GT20.1
#=GS A0A1Y2K4J6_9PROT/1016-1128  AC A0A1Y2K4J6.1
#=GS B6EPI2_ALISL/628-854        AC B6EPI2.1
#=GS I0KFQ9_9BACT/654-769        AC I0KFQ9.1
#=GS A0A244CPV7_9GAMM/645-875    AC A0A244CPV7.1
#=GS A0A1M7MT45_9FLAO/668-791    AC A0A1M7MT45.1
#=GS A0A0W1STR0_9GAMM/657-893    AC A0A0W1STR0.1
#=GS A0A1R4B3P1_9VIBR/25-257     AC A0A1R4B3P1.1
#=GS X5DLD1_9BACT/694-794        AC X5DLD1.1
#=GS A0A1J5II27_9GAMM/847-1040   AC A0A1J5II27.1
#=GS A0A0L8AV01_9BURK/515-726    AC A0A0L8AV01.1
#=GS A0A165S299_9GAMM/721-959    AC A0A165S299.1
#=GS R5P3F5_9BACT/646-848        AC R5P3F5.1
#=GS A0A1E5IVI8_SHECO/673-899    AC A0A1E5IVI8.1
#=GS K6YW12_9ALTE/18-239         AC K6YW12.1
#=GS A0A1H7GQH8_9GAMM/123-244    AC A0A1H7GQH8.1
#=GS U1KN70_9GAMM/648-880        AC U1KN70.1
#=GS I4W863_9GAMM/21-254         AC I4W863.1
#=GS A0A239CVB2_9BACT/559-789    AC A0A239CVB2.1
#=GS A0A1Y1RBI0_9PROT/689-910    AC A0A1Y1RBI0.1
#=GS E3G2F4_ENTLS/19-245         AC E3G2F4.1
#=GS A0A023Y3U2_9GAMM/19-252     AC A0A023Y3U2.1
#=GS A0A090IIE9_9GAMM/705-919    AC A0A090IIE9.1
#=GS U4KFP4_9VIBR/637-860        AC U4KFP4.1
#=GS A0A254NDZ7_9BURK/525-757    AC A0A254NDZ7.1
#=GS A0A0Q7LV61_9BURK/13-218     AC A0A0Q7LV61.1
#=GS A0A133Y1V0_9BACT/624-835    AC A0A133Y1V0.1
#=GS A0A0Q6MD82_9BURK/587-811    AC A0A0Q6MD82.1
#=GS K6Z8Q1_9ALTE/659-900        AC K6Z8Q1.1
#=GS YJBG_ECOLI/19-245           AC P32688.1
#=GS A0A167G984_9FLAO/599-789    AC A0A167G984.1
#=GS A7MPP5_CROS8/19-244         AC A7MPP5.1
#=GS A0A1M5GG34_9BACE/50-200     AC A0A1M5GG34.1
#=GS A0A1M5IH89_9FLAO/680-800    AC A0A1M5IH89.1
#=GS G8NPP6_GRAMM/776-1001       AC G8NPP6.1
#=GS A0A257HZD7_9BACT/682-797    AC A0A257HZD7.1
#=GS A0A158DES9_9BURK/457-635    AC A0A158DES9.1
#=GS Q0YTR6_9CHLB/446-605        AC Q0YTR6.1
#=GS A0A1I0PJE1_9BACT/708-812    AC A0A1I0PJE1.1
#=GS W1SCC3_9SPHN/382-602        AC W1SCC3.1
#=GS A0A1X1BQM0_9GAMM/20-247     AC A0A1X1BQM0.1
#=GS A0A2A3N684_CAPSP/600-805    AC A0A2A3N684.1
#=GS A0A1T5P5F3_9BACT/639-795    AC A0A1T5P5F3.1
#=GS A0KM78_AERHH/18-252         AC A0KM78.1
#=GS E8X6J4_GRATM/678-913        AC E8X6J4.1
#=GS A9D4M4_9GAMM/592-824        AC A9D4M4.1
#=GS A0A1M7HCE4_9GAMM/25-254     AC A0A1M7HCE4.1
#=GS H0PXN6_9RHOO/20-253         AC H0PXN6.1
#=GS H7FML3_9FLAO/682-791        AC H7FML3.1
#=GS C4KCJ1_THASP/48-260         AC C4KCJ1.1
#=GS A0A0A2VXK3_BEABA/222-419    AC A0A0A2VXK3.1
#=GS B3E8W3_GEOLS/629-860        AC B3E8W3.1
#=GS A6F1J2_9ALTE/623-857        AC A6F1J2.1
#=GS A0A1M7ZHQ3_9BACT/739-837    AC A0A1M7ZHQ3.1
#=GS Q3K9I5_PSEPF/9-240          AC Q3K9I5.1
#=GS A0A1E5D2K3_9VIBR/598-853    AC A0A1E5D2K3.1
#=GS I3ZBG1_TERRK/678-907        AC I3ZBG1.1
#=GS A0A1Q9HMX0_9VIBR/21-249     AC A0A1Q9HMX0.1
#=GS U4KFP6_9VIBR/23-239         AC U4KFP6.1
#=GS A0A1Y6EGM7_9GAMM/672-902    AC A0A1Y6EGM7.1
#=GS A0A0M3F3H8_ENTCL/19-245     AC A0A0M3F3H8.1
#=GS A0A1E5CZP0_9VIBR/41-288     AC A0A1E5CZP0.1
#=GS A0A014NRJ2_9GAMM/20-251     AC A0A014NRJ2.1
#=GS A3QCS0_SHELP/682-907        AC A3QCS0.1
#=GS A0A269PP28_9GAMM/620-854    AC A0A269PP28.1
#=GS C7M6P8_CAPOD/594-802        AC C7M6P8.1
#=GS A0A1M7P920_9SPHI/601-809    AC A0A1M7P920.1
#=GS A0A1Z9UWQ9_9RICK/361-569    AC A0A1Z9UWQ9.1
#=GS A0A0Q0F9V0_9GAMM/630-864    AC A0A0Q0F9V0.1
#=GS C4KCI8_THASP/584-775        AC C4KCI8.1
#=GS A0A1H9Q1Z2_9FLAO/691-821    AC A0A1H9Q1Z2.1
#=GS Q2NR05_SODGM/16-164         AC Q2NR05.1
#=GS A0A212PF96_9DELT/709-908    AC A0A212PF96.1
#=GS A0A2A2EYW1_9GAMM/581-811    AC A0A2A2EYW1.1
#=GS Q12KS6_SHEDO/679-906        AC Q12KS6.1
#=GS G7Z6G9_AZOL4/741-947        AC G7Z6G9.1
#=GS D0YWL4_PHODD/41-272         AC D0YWL4.1
#=GS A0A1L6JB14_9SPHN/373-591    AC A0A1L6JB14.1
#=GS Z5XLI7_9GAMM/652-872        AC Z5XLI7.1
#=GS X7E908_9GAMM/637-859        AC X7E908.1
#=GS D1VWV3_9BACT/617-813        AC D1VWV3.1
#=GS F8EPW4_RUNSL/627-755        AC F8EPW4.1
#=GS A0A060NH25_9BURK/40-242     AC A0A060NH25.1
#=GS Q5QWV1_IDILO/675-910        AC Q5QWV1.1
#=GS V9QV18_9PSED/20-250         AC V9QV18.1
#=GS A0A1P8R3P0_9GAMM/30-243     AC A0A1P8R3P0.1
#=GS A0A173MRQ7_9BACT/687-788    AC A0A173MRQ7.1
#=GS J0LBD2_9HELI/699-885        AC J0LBD2.1
#=GS U1K073_9GAMM/646-878        AC U1K073.1
#=GS A0A1E8FHI3_9ALTE/19-242     AC A0A1E8FHI3.1
#=GS H5TB44_9ALTE/682-905        AC H5TB44.1
#=GS A0A1H7UZU3_9SPHI/722-827    AC A0A1H7UZU3.1
#=GS A0A0N0GR26_9NEIS/502-726    AC A0A0N0GR26.1
#=GS A0A144NDS5_9GAMM/360-558    AC A0A144NDS5.1
#=GS A0A1B9E3P0_9FLAO/624-778    AC A0A1B9E3P0.1
#=GS A0A1T5DU41_9GAMM/18-255     AC A0A1T5DU41.1
#=GS D3SF71_THISK/124-245        AC D3SF71.1
#=GS A0A0X8GQU9_9BURK/600-783    AC A0A0X8GQU9.1
#=GS A0A1I4A8W7_9PROT/673-888    AC A0A1I4A8W7.1
#=GS A0A1M5N238_9ALTE/16-243     AC A0A1M5N238.1
#=GS A6VTE9_MARMS/628-857        AC A6VTE9.1
#=GS A0A1I2CKI2_9BURK/593-806    AC A0A1I2CKI2.1
#=GS Q8ECI4_SHEON/23-261         AC Q8ECI4.1
#=GS A0A291P715_9GAMM/108-242    AC A0A291P715.1
#=GS E1VH83_9GAMM/732-922        AC E1VH83.1
#=GS X5DL99_9BACT/630-762        AC X5DL99.1
#=GS A0A285KK56_9ENTR/19-245     AC A0A285KK56.1
#=GS A0A255Z6A7_9PROT/752-967    AC A0A255Z6A7.1
#=GS A0A1I2TIB3_9SPHI/717-822    AC A0A1I2TIB3.1
#=GS R5BH69_9BACE/596-788        AC R5BH69.1
#=GS A0A1H3VSR1_9GAMM/20-259     AC A0A1H3VSR1.1
#=GS H2ICC8_VIBSJ/31-247         AC H2ICC8.1
#=GS A0A1Y6BXT9_9ALTE/618-822    AC A0A1Y6BXT9.1
#=GS A0A1J0TIR2_9ALTE/16-244     AC A0A1J0TIR2.1
#=GS A0A0U3K823_9FLAO/608-796    AC A0A0U3K823.1
#=GS A4AB88_9GAMM/730-966        AC A4AB88.2
#=GS A0A1G8ECF4_9RHOO/688-909    AC A0A1G8ECF4.1
#=GS A0A085EJF1_9FLAO/627-807    AC A0A085EJF1.1
#=GS A0A0J1FUT7_9BURK/5-220      AC A0A0J1FUT7.1
#=GS M4S5V7_9SPHN/414-637        AC M4S5V7.1
#=GS A0A1G8PR38_9BURK/39-253     AC A0A1G8PR38.1
#=GS A0A1I1THL2_9BACT/649-794    AC A0A1I1THL2.1
#=GS A0A0S2JYR0_9GAMM/635-860    AC A0A0S2JYR0.1
#=GS A0A0Q5D1E2_9BURK/363-545    AC A0A0Q5D1E2.1
#=GS F3L3S5_9GAMM/636-862        AC F3L3S5.1
#=GS A0A172YGJ4_9GAMM/12-228     AC A0A172YGJ4.1
#=GS A0A1L3JIU6_9FLAO/622-790    AC A0A1L3JIU6.1
#=GS A0A150XC46_9BACT/775-876    AC A0A150XC46.1
#=GS A0A0U3EEQ2_9BURK/411-610    AC A0A0U3EEQ2.1
#=GS A4BYL4_9FLAO/594-797        AC A4BYL4.1
#=GS X0R1X5_9GAMM/162-360        AC X0R1X5.1
#=GS H0A6U8_9PROT/632-841        AC H0A6U8.1
#=GS A8TA69_9VIBR/29-247         AC A8TA69.1
#=GS A0A024HDF9_PSEKB/19-251     AC A0A024HDF9.1
#=GS A0A1I6GT20_9GAMM/150-299    AC A0A1I6GT20.1
#=GS A0A143B739_9DELT/670-898    AC A0A143B739.1
#=GS W0I331_9GAMM/20-251         AC W0I331.1
#=GS A0A0N8KKU5_9ALTE/585-821    AC A0A0N8KKU5.1
#=GS A0A1N6JY73_9BACT/667-774    AC A0A1N6JY73.1
#=GS A0A0J8YFH7_9BACT/21-252     AC A0A0J8YFH7.1
#=GS I1DWC5_9GAMM/664-892        AC I1DWC5.1
#=GS A0A142Z120_9BURK/22-238     AC A0A142Z120.1
#=GS A0A1G7UE16_CHIFI/712-809    AC A0A1G7UE16.1
#=GS A0A193KFN0_9VIBR/23-259     AC A0A193KFN0.1
#=GS D0IC10_GRIHO/32-271         AC D0IC10.1
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#=GS G8LHH6_ENTCL/19-245         AC G8LHH6.1
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