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Database: Pfam
Entry: PF06452
LinkDB: PF06452
Original site: PF06452 
#=GF ID   CBM9_1
#=GF AC   PF06452.10
#=GF DE   Carbohydrate family 9 binding domain-like
#=GF PI   DUF1083;
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_2203 (release 10.0)
#=GF GA   20.80 20.80;
#=GF TC   21.00 20.80;
#=GF NC   20.70 20.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11371186
#=GF RT   Crystal structures of the family 9 carbohydrate-binding module
#=GF RT   from Thermotoga maritima xylanase 10A in native and ligand-bound
#=GF RT   forms.
#=GF RA   Notenboom V, Boraston AB, Kilburn DG, Rose DR;
#=GF RL   Biochemistry. 2001;40:6248-6256.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010502;
#=GF DR   SCOP; 1i8a; fa;
#=GF CC   CBM9_1 is a C-terminal domain on bacterial xylanase proteins,
#=GF CC   and it is tandemly repeated in a number of family-members.  The
#=GF CC   CBM9 module binds to amorphous and crystalline cellulose and a
#=GF CC   range of soluble di- and monosaccharides as well as to cello-
#=GF CC   and xylo- oligomers of different degrees of polymerisation.
#=GF CC   Comparison of the glucose and cellobiose complexes during
#=GF CC   crystallisation reveals surprising differences in binding of
#=GF CC   these two substrates by CBM9-2. Cellobiose was found to bind in
#=GF CC   a distinct orientation from glucose, while still maintaining
#=GF CC   optimal stacking and electrostatic interactions with the
#=GF CC   reducing end sugar [1].
#=GF SQ   1026
#=GS A0A0S7WPF7_9BACT/1-112      AC A0A0S7WPF7.1
#=GS A0A0M3C457_9SPHI/47-205     AC A0A0M3C457.1
#=GS A0A136NYM6_9BACT/48-199     AC A0A136NYM6.1
#=GS A0A161LEW7_9PORP/84-238     AC A0A161LEW7.1
#=GS F8EH48_RUNSL/64-230         AC F8EH48.1
#=GS R1D5D1_EMIHU/24-195         AC R1D5D1.1
#=GS F4A2J4_MAHA5/1109-1306      AC F4A2J4.1
#=GS A0A0S7YM03_9BACT/51-208     AC A0A0S7YM03.1
#=GS A0A0K1PTB1_9DELT/411-602    AC A0A0K1PTB1.1
#=GS A0A117L4Y0_9BACT/43-261     AC A0A117L4Y0.1
#=GS A0A0Q8RSR0_9BURK/39-244     AC A0A0Q8RSR0.1
#=GS A0A0S7XQ69_9BACT/50-211     AC A0A0S7XQ69.1
#=GS A0A0G3A302_9DELT/43-202     AC A0A0G3A302.1
#=GS W0J6G5_9BACT/53-248         AC W0J6G5.1
#=GS A0A0C5WA48_9GAMM/40-241     AC A0A0C5WA48.1
#=GS D3EE78_GEOS4/718-773        AC D3EE78.1
#=GS B9XLN1_PEDPL/52-240         AC B9XLN1.1
#=GS A0A0F7NE48_9ACTN/392-579    AC A0A0F7NE48.1
#=GS H1XTS5_9BACT/535-745        AC H1XTS5.1
#=GS A0A0Q9MYC4_9BACL/715-891    AC A0A0Q9MYC4.1
#=GS A0A0S8JR02_9BACE/28-125     AC A0A0S8JR02.1
#=GS A0A136LQ26_9BACT/49-221     AC A0A136LQ26.1
#=GS A0A0D3VF93_9BACL/28-188     AC A0A0D3VF93.1
#=GS W0RCU2_9BACT/38-204         AC W0RCU2.1
#=GS A0A090CXQ2_9CHLA/55-221     AC A0A090CXQ2.1
#=GS A0A0S8A0F2_9BACT/44-207     AC A0A0S8A0F2.1
#=GS I2GL17_9BACT/1022-1211      AC I2GL17.1
#=GS L8JJB7_9BACT/728-926        AC L8JJB7.1
#=GS A0A0N8TYT9_9GAMM/57-229     AC A0A0N8TYT9.1
#=GS R5PFA4_9BACT/869-1044       AC R5PFA4.1
#=GS A0A0L0FD39_9EUKA/23-212     AC A0A0L0FD39.1
#=GS L0DHT1_SINAD/47-227         AC L0DHT1.1
#=GS A0A162FDC7_9FLAO/45-202     AC A0A162FDC7.1
#=GS A0A108UBE5_9GAMM/51-194     AC A0A108UBE5.1
#=GS A0A0N7HYQ9_9FLAO/18-214     AC A0A0N7HYQ9.1
#=GS A0A0Q9Z422_9FLAO/38-200     AC A0A0Q9Z422.1
#=GS A0A0S7WPR8_9BACT/37-219     AC A0A0S7WPR8.1
#=GS E6U4D5_ETHHY/984-1188       AC E6U4D5.1
#=GS R6FPY0_9BACT/50-258         AC R6FPY0.1
#=GS G8LZ66_CLOCD/781-961        AC G8LZ66.1
#=GS A0A172TN26_9BACL/941-1115   AC A0A172TN26.1
#=GS A0A0D8D514_9GAMM/110-268    AC A0A0D8D514.1
#=GS A0A150ANS0_9BACT/248-442    AC A0A150ANS0.1
#=GS A0A0C1UHI0_9CYAN/43-210     AC A0A0C1UHI0.1
#=GS M7Y253_9BACT/40-210         AC M7Y253.1
#=GS A0A0A0C6K6_9CELL/1-137      AC A0A0A0C6K6.1
#=GS B1ZNF5_OPITP/844-1018       AC B1ZNF5.1
#=GS A0A099XPQ6_9FLAO/33-198     AC A0A099XPQ6.1
#=GS Q11TF7_CYTH3/777-962        AC Q11TF7.1
#=GS W8W0L0_9FLAO/46-217         AC W8W0L0.1
#=GS K5A932_PAEAL/30-219         AC K5A932.1
#=GS F5LP61_9BACL/51-241         AC F5LP61.1
#=GS W0RQA0_9BACT/44-232         AC W0RQA0.1
#=GS A0A0E4HE13_9BACL/1439-1636  AC A0A0E4HE13.1
#=GS A0A0S7WLS1_9BACT/33-216     AC A0A0S7WLS1.1
#=GS A0A0P6Y4G7_9CHLR/111-309    AC A0A0P6Y4G7.1
#=GS A0A0S8K7M4_9BACE/44-227     AC A0A0S8K7M4.1
#=GS A0A088F174_9SPHI/48-217     AC A0A088F174.1
#=GS A0A074L202_9BACT/40-207     AC A0A074L202.1
#=GS A4CGD0_ROBBH/59-224         AC A4CGD0.1
#=GS A0A090Q3N3_9FLAO/48-204     AC A0A090Q3N3.1
#=GS A0A0S8ESC2_9DELT/45-251     AC A0A0S8ESC2.1
#=GS B4CVG1_9BACT/14-202         AC B4CVG1.1
#=GS A0A0C2RJP5_9BACL/29-189     AC A0A0C2RJP5.1
#=GS A0A066WU43_9FLAO/23-196     AC A0A066WU43.1
#=GS A0A095SXU1_9FLAO/45-208     AC A0A095SXU1.1
#=GS A0A150X4X8_9BACT/41-227     AC A0A150X4X8.1
#=GS H3H1Q9_PHYRM/37-123         AC H3H1Q9.1
#=GS A0A142XR82_9PLAN/861-1037   AC A0A142XR82.1
#=GS A0A136MS94_9BACT/37-212     AC A0A136MS94.1
#=GS A0A0S8JPM2_9BACE/1-187      AC A0A0S8JPM2.1
#=GS A0A0N8K9Y2_9BACT/136-313    AC A0A0N8K9Y2.1
#=GS A0A0S8JLW9_9BACE/1-202      AC A0A0S8JLW9.1
#=GS A1S5R3_SHEAM/50-227         AC A1S5R3.1
#=GS A0A150XG35_9BACT/21-177     AC A0A150XG35.1
#=GS A0A0D3LMJ6_9BACT/42-218     AC A0A0D3LMJ6.1
#=GS A3XK85_LEEBM/38-229         AC A3XK85.1
#=GS C6W7T3_DYAFD/41-207         AC C6W7T3.1
#=GS C0BJA5_FLABM/42-234         AC C0BJA5.1
#=GS A0A0S8GZ28_9BACT/39-195     AC A0A0S8GZ28.1
#=GS A0A0P7Y9P1_9BACT/41-192     AC A0A0P7Y9P1.1
#=GS A0A0P0D8W7_9FLAO/42-261     AC A0A0P0D8W7.1
#=GS H8KT93_SOLCM/42-201         AC H8KT93.1
#=GS A0A0R2VPL2_9SPHI/230-407    AC A0A0R2VPL2.1
#=GS A0A0Q5AU98_9MICO/895-1086   AC A0A0Q5AU98.1
#=GS A0A0Q9TQF7_9BACL/20-251     AC A0A0Q9TQF7.1
#=GS F8EE86_RUNSL/77-257         AC F8EE86.1
#=GS E0I4N3_9BACL/507-692        AC E0I4N3.1
#=GS A0A0S8KB31_9BACT/37-207     AC A0A0S8KB31.1
#=GS A0A0S8H5F9_9BACT/70-259     AC A0A0S8H5F9.1
#=GS H1XSR4_9BACT/196-396        AC H1XSR4.1
#=GS Q11VQ4_CYTH3/913-1100       AC Q11VQ4.1
#=GS A0A127B646_9BACT/31-186     AC A0A127B646.1
#=GS A0A0S8H2N7_9BACE/286-467    AC A0A0S8H2N7.1
#=GS C0BHM3_FLABM/41-232         AC C0BHM3.1
#=GS A0A0Q9MEW6_9BACL/1181-1357  AC A0A0Q9MEW6.1
#=GS B3DZI7_METI4/41-247         AC B3DZI7.1
#=GS I3ZHB7_TERRK/39-247         AC I3ZHB7.1
#=GS G8T870_NIAKG/817-1001       AC G8T870.1
#=GS C0BP76_9BACT/52-221         AC C0BP76.1
#=GS B8I995_CLOCE/1409-1590      AC B8I995.1
#=GS W2ZF97_PHYPR/37-164         AC W2ZF97.1
#=GS I3C5B2_9FLAO/44-233         AC I3C5B2.1
#=GS C1ADK3_GEMAT/57-223         AC C1ADK3.1
#=GS F8ENM3_RUNSL/43-210         AC F8ENM3.1
#=GS A0A0D5YVK5_9FLAO/46-207     AC A0A0D5YVK5.1
#=GS A0A0A2MYG5_9FLAO/48-220     AC A0A0A2MYG5.1
#=GS R7ICN9_9FIRM/41-261         AC R7ICN9.1
#=GS A0A101GG62_9BACT/52-175     AC A0A101GG62.1
#=GS C7QJV1_CATAD/1159-1339      AC C7QJV1.1
#=GS A0A0C1KAM5_9CHLA/31-209     AC A0A0C1KAM5.1
#=GS G2LD90_CHLTF/77-241         AC G2LD90.1
#=GS L0EI14_THECK/58-230         AC L0EI14.1
#=GS A0A162PFA0_9BACT/53-180     AC A0A162PFA0.1
#=GS A0A0Q9TWX1_9BACL/583-772    AC A0A0Q9TWX1.1
#=GS A0A0Q8CIX9_9MICO/1057-1233  AC A0A0Q8CIX9.1
#=GS A9FZ52_SORC5/92-303         AC A9FZ52.1
#=GS G8M1U0_CLOCD/875-1051       AC G8M1U0.1
#=GS D1CI47_THET1/843-1036       AC D1CI47.1
#=GS I3VVC1_THESW/868-1044       AC I3VVC1.1
#=GS A0A024FJQ7_9FLAO/178-383    AC A0A024FJQ7.1
#=GS A0A126PDF1_9BACT/68-288     AC A0A126PDF1.1
#=GS A0A0A0BNA8_9CELL/1-38       AC A0A0A0BNA8.1
#=GS A0A0B7HAS5_9FLAO/39-228     AC A0A0B7HAS5.1
#=GS L7WE07_NONDD/53-229         AC L7WE07.1
#=GS V9FD14_PHYPR/34-147         AC V9FD14.1
#=GS S7VJV6_9FLAO/30-197         AC S7VJV6.1
#=GS A0A098LEP1_9BACT/498-685    AC A0A098LEP1.1
#=GS A0A0T6LPL4_9ACTN/739-925    AC A0A0T6LPL4.1
#=GS W9GP30_9MICO/504-585        AC W9GP30.1
#=GS Q023I4_SOLUE/26-132         AC Q023I4.1
#=GS A0A0S7ZE62_9BACT/54-223     AC A0A0S7ZE62.1
#=GS A0A0Q1BBS7_9DELT/44-205     AC A0A0Q1BBS7.1
#=GS Q2IPN6_ANADE/40-201         AC Q2IPN6.1
#=GS A0A098LLF9_9BACT/45-250     AC A0A098LLF9.1
#=GS R7ICU1_9FIRM/44-272         AC R7ICU1.1
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#=GS A0A0Q1BG09_9FLAO/52-219     AC A0A0Q1BG09.1
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#=GS F4GY46_CELFA/1054-1229      AC F4GY46.1
#=GS A0A0B0HXJ5_9BACL/29-209     AC A0A0B0HXJ5.1
#=GS S2DIL9_9BACT/52-222         AC S2DIL9.1
#=GS A0A0S8A121_9BACT/53-236     AC A0A0S8A121.1
#=GS A0A176U1D7_9FIRM/30-192     AC A0A176U1D7.1
#=GS A0A0A7KJE2_9DEIO/549-752    AC A0A0A7KJE2.1
#=GS A0A0R3SDH6_HYMDI/143-309    AC A0A0R3SDH6.1
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#=GS I3BZP5_9GAMM/635-819        AC I3BZP5.1
#=GS XYNA_THEMA/882-1059         AC Q60037.1
#=GS XYNA_THEMA/882-1059         DR PDB; 1I8U A; 11-188;
#=GS XYNA_THEMA/882-1059         DR PDB; 1I82 A; 11-188;
#=GS XYNA_THEMA/882-1059         DR PDB; 1I8A A; 11-188;
#=GS A0A0Q9MXK1_9BACL/52-243     AC A0A0Q9MXK1.1
#=GS A0A0S8I727_9CHLR/113-311    AC A0A0S8I727.1
#=GS E8NFV4_MICTS/708-895        AC E8NFV4.1
#=GS Q8ED67_SHEON/40-215         AC Q8ED67.1
#=GS A0A0Q9MEW6_9BACL/1467-1642  AC A0A0Q9MEW6.1
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#=GS A0A0S8KNB2_9BACE/31-195     AC A0A0S8KNB2.1
#=GS A0A101FY17_9CHLR/102-301    AC A0A101FY17.1
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#=GS A0A101VQE7_9BACT/561-761    AC A0A101VQE7.1
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#=GS W0J1J3_9BACT/22-191         AC W0J1J3.1
#=GS W4QLG4_9BACI/1079-1152      AC W4QLG4.1
#=GS A0A176T2Z0_9FLAO/43-266     AC A0A176T2Z0.1
#=GS D2QIM7_SPILD/23-222         AC D2QIM7.1
#=GS A0A101VYA1_9BACT/38-222     AC A0A101VYA1.1
#=GS V9GCN2_9BACL/29-191         AC V9GCN2.1
#=GS X5DHG6_9BACT/36-204         AC X5DHG6.1
#=GS W6K414_9MICO/83-284         AC W6K414.1
#=GS A0A095SY33_9FLAO/39-207     AC A0A095SY33.1
#=GS L8JYC2_9BACT/36-242         AC L8JYC2.1
#=GS A0A162PDX2_9BACT/45-214     AC A0A162PDX2.1
#=GS A0A101VZH8_9BACT/674-874    AC A0A101VZH8.1
#=GS A0A0S7Z565_9BACT/61-243     AC A0A0S7Z565.1
#=GS A0A0G1T3C0_9BACT/337-510    AC A0A0G1T3C0.1
#=GS D2QGP6_SPILD/41-214         AC D2QGP6.1
#=GS K4IF37_PSYTT/36-197         AC K4IF37.1
#=GS F3ZQM5_9BACE/48-256         AC F3ZQM5.1
#=GS Q11NQ3_CYTH3/511-695        AC Q11NQ3.1
#=GS D0MH72_RHOM4/59-225         AC D0MH72.1
#=GS C1A719_GEMAT/22-188         AC C1A719.1
#=GS K6XQG4_9ALTE/35-193         AC K6XQG4.1
#=GS I6ZRX6_MELRP/47-235         AC I6ZRX6.1
#=GS G8TPZ7_NIAKG/40-225         AC G8TPZ7.1
#=GS A0A0M8KFB2_9BACT/48-244     AC A0A0M8KFB2.1
#=GS A0A0T6LP15_9ACTN/739-913    AC A0A0T6LP15.1
#=GS S2D9K7_9BACT/39-212         AC S2D9K7.1
#=GS A8F3E2_PSELT/779-959        AC A8F3E2.1
#=GS C7MHE1_BRAFD/586-792        AC C7MHE1.1
#=GS A0A146G3B2_9BACT/42-252     AC A0A146G3B2.1
#=GS W6TQN2_9SPHI/24-204         AC W6TQN2.1
#=GS A6LE98_PARD8/54-240         AC A6LE98.1
#=GS A0A101IAG1_9BACT/48-235     AC A0A101IAG1.1
#=GS A0A143BMU3_9BACT/68-227     AC A0A143BMU3.1
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#=GS W0IU51_9BACT/688-868        AC W0IU51.1
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#=GS A0A0C2UZE6_9BACL/37-104     AC A0A0C2UZE6.1
#=GS B8I5B9_CLOCE/891-1066       AC B8I5B9.1
#=GS A0A0S8HET1_9BACT/62-214     AC A0A0S8HET1.1
#=GS A0A0Q0NW53_9GAMM/67-284     AC A0A0Q0NW53.1
#=GS W4DQ02_9BACL/768-938        AC W4DQ02.1
#=GS A0A167XDF8_9FLAO/34-194     AC A0A167XDF8.1
#=GS M5TBY9_9PLAN/715-820        AC M5TBY9.1
#=GS S9R4A7_9DELT/200-377        AC S9R4A7.1
#=GS A0A0S8IXP4_9BACT/49-210     AC A0A0S8IXP4.1
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#=GS F5LQ15_9BACL/29-250         AC F5LQ15.1
#=GS H8MLU4_CORCM/290-452        AC H8MLU4.1
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#=GS K8WWF2_9GAMM/35-230         AC K8WWF2.1
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#=GS R6RLY4_9FIRM/70-254         AC R6RLY4.1
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#=GS A0A067CEF5_SAPPC/43-211     AC A0A067CEF5.1
#=GS S0GEX2_9PORP/53-220         AC S0GEX2.1
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#=GS A0A143PR98_9BACT/24-113     AC A0A143PR98.1
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#=GS L7W7H8_NONDD/66-273         AC L7W7H8.1
#=GS A0A0Q9Y5B5_9BACI/29-192     AC A0A0Q9Y5B5.1
#=GS A0A136K7E7_9BACT/60-228     AC A0A136K7E7.1
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#=GS A0A023BU42_9FLAO/33-230     AC A0A023BU42.1
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#=GS K8WCV8_PRORE/36-231         AC K8WCV8.1
#=GS A0A146G559_9BACT/34-152     AC A0A146G559.1
#=GS D2PUP4_KRIFD/18-232         AC D2PUP4.1
#=GS A0A0F2IXY3_9BACT/45-60      AC A0A0F2IXY3.1
#=GS A0A0V1R112_9FLAO/39-244     AC A0A0V1R112.1
#=GS A0A091BI53_9GAMM/40-216     AC A0A091BI53.1
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#=GS XYNA1_PAESJ/877-1052        AC C6CRV0.1
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