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Database: Pfam
Entry: PF11938
LinkDB: PF11938
Original site: PF11938 
#=GF ID   DUF3456
#=GF AC   PF11938.8
#=GF DE   TLR4 regulator and MIR-interacting MSAP
#=GF AU   Assefa S;0000-0003-2178-533X
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   PFAM-B_1799 (release 23.0)
#=GF GA   21.00 21.00;
#=GF TC   21.00 21.00;
#=GF NC   20.90 20.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16338228
#=GF RT   A molecule that is associated with Toll-like receptor 4 and
#=GF RT   regulates its cell surface expression.
#=GF RA   Konno K, Wakabayashi Y, Akashi-Takamura S, Ishii T, Kobayashi M,
#=GF RA   Takahashi K, Kusumoto Y, Saitoh S, Yoshizawa Y, Miyake K;
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun. 2006;339:1076-1082.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   17998391
#=GF RT   A protein associated with Toll-like receptor (TLR) 4 (PRAT4A) is
#=GF RT   required for TLR-dependent immune responses.
#=GF RA   Takahashi K, Shibata T, Akashi-Takamura S, Kiyokawa T,
#=GF RA   Wakabayashi Y, Tanimura N, Kobayashi T, Matsumoto F, Fukui R,
#=GF RA   Kouro T, Nagai Y, Takatsu K, Saitoh S, Miyake K;
#=GF RL   J Exp Med. 2007;204:2963-2976.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   18780723
#=GF RT   A single base mutation in the PRAT4A gene reveals differential
#=GF RT   interaction of PRAT4A with Toll-like receptors.
#=GF RA   Kiyokawa T, Akashi-Takamura S, Shibata T, Matsumoto F, Nishitani
#=GF RA   C, Kuroki Y, Seto Y, Miyake K;
#=GF RL   Int Immunol. 2008;20:1407-1415.
#=GF DR   INTERPRO; IPR021852;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family of proteins, found from plants to humans, is PRAT4
#=GF CC   (A and B), a Protein Associated with Toll-like receptor 4. The
#=GF CC   Toll family of receptors - TLRs - plays an essential role in
#=GF CC   innate recognition of microbial products, the first line of
#=GF CC   defence against bacterial infection [1]. PRAT4A influences the
#=GF CC   subcellular distribution and the strength of TLR responses and
#=GF CC   alters the relative activity of each TLR. PRAT4B regulates TLR4
#=GF CC   trafficking to the cell surface and the extent of its expression
#=GF CC   there [2][3]. TLR4 recognizes lipopolysaccharide (LPS), one of
#=GF CC   the most immuno-stimulatory glycolipids constituting the outer
#=GF CC   membrane of the Gram-negative bacteria.           This family
#=GF CC   has also been described as a SAP-like MIR-interacting protein
#=GF CC   family.
#=GF SQ   1498
#=GS H0X503_OTOGA/45-102         AC H0X503.1
#=GS A0A0N4Z0V7_PARTI/29-172     AC A0A0N4Z0V7.1
#=GS A0A091UZ28_NIPNI/42-84      AC A0A091UZ28.1
#=GS CNPY3_XENTR/27-187          AC Q5HZV5.2
#=GS U4UR88_DENPD/32-178         AC U4UR88.1
#=GS F6SV63_ORNAN/131-288        AC F6SV63.2
#=GS W5NAD1_LEPOC/48-206         AC W5NAD1.1
#=GS A0A0M0K6G7_9EUKA/30-194     AC A0A0M0K6G7.1
#=GS G1KEF9_ANOCA/35-193         AC G1KEF9.2
#=GS F7BCK6_XENTR/82-125         AC F7BCK6.1
#=GS A0A287T936_HORVV/18-153     AC A0A287T936.1
#=GS A0A0E0JUP1_ORYPU/35-176     AC A0A0E0JUP1.1
#=GS A0A0V0U371_9BILA/1262-1327  AC A0A0V0U371.1
#=GS J3JUW7_DENPD/31-198         AC J3JUW7.1
#=GS A0A2G8L9A1_STIJA/42-184     AC A0A2G8L9A1.1
#=GS F7CVV4_XENTR/15-157         AC F7CVV4.1
#=GS A0A0M3J0F4_ANISI/5-66       AC A0A0M3J0F4.1
#=GS A0A044TG09_ONCVO/33-96      AC A0A044TG09.2
#=GS V9FE82_PHYPR/102-157        AC V9FE82.1
#=GS A0A0V0WW51_9BILA/1256-1312  AC A0A0V0WW51.1
#=GS H0YI18_HUMAN/7-69           AC H0YI18.1
#=GS B5XFE5_SALSA/29-175         AC B5XFE5.1
#=GS A0A0V0U3N1_9BILA/121-273    AC A0A0V0U3N1.1
#=GS A0A059BQF2_EUCGR/48-188     AC A0A059BQF2.1
#=GS B0WLK3_CULQU/39-186         AC B0WLK3.1
#=GS A0A182JRC3_9DIPT/42-188     AC A0A182JRC3.1
#=GS A0A261ANZ5_9PELO/83-135     AC A0A261ANZ5.1
#=GS T1J2X4_STRMM/27-172         AC T1J2X4.1
#=GS A0A182P4A7_9DIPT/41-187     AC A0A182P4A7.1
#=GS A0A1U8BTK9_MESAU/1-81       AC A0A1U8BTK9.1
#=GS A0A0D9RGG3_CHLSB/47-205     AC A0A0D9RGG3.1
#=GS G3HJV0_CRIGR/1-97           AC G3HJV0.1
#=GS A0A0V1CV28_TRIBR/1221-1351  AC A0A0V1CV28.1
#=GS A0A091FV40_9AVES/42-84      AC A0A091FV40.1
#=GS A0A084WFX6_ANOSI/41-187     AC A0A084WFX6.1
#=GS H2M7Q2_ORYLA/33-90          AC H2M7Q2.1
#=GS A0A0B1RYI1_OESDE/25-91      AC A0A0B1RYI1.1
#=GS H2M7Q0_ORYLA/33-91          AC H2M7Q0.1
#=GS A0A182V1N3_ANOME/34-194     AC A0A182V1N3.1
#=GS G1PJS7_MYOLU/48-206         AC G1PJS7.1
#=GS A7TAT4_NEMVE/1-37           AC A7TAT4.1
#=GS A0A2C9KJ83_BIOGL/46-105     AC A0A2C9KJ83.1
#=GS A0A0D9QYR0_CHLSB/27-171     AC A0A0D9QYR0.1
#=GS A0A1Y3BCD7_EURMA/184-228    AC A0A1Y3BCD7.1
#=GS A0A1A9X3Q9_9MUSC/31-177     AC A0A1A9X3Q9.1
#=GS A0A226NLY9_CALSU/1-81       AC A0A226NLY9.1
#=GS M0S0V4_MUSAM/34-174         AC M0S0V4.1
#=GS A0A1V4KB22_PATFA/29-187     AC A0A1V4KB22.1
#=GS M4F1J2_BRARP/24-163         AC M4F1J2.1
#=GS H2RSJ3_TAKRU/25-83          AC H2RSJ3.1
#=GS W5Q6K4_SHEEP/47-176         AC W5Q6K4.1
#=GS G1KKQ7_ANOCA/36-180         AC G1KKQ7.2
#=GS A0A0V1CV27_TRIBR/1215-1271  AC A0A0V1CV27.1
#=GS A0A091TDL0_PHALP/1-144      AC A0A091TDL0.1
#=GS A0A0V1HB77_9BILA/782-847    AC A0A0V1HB77.1
#=GS A0A084WHA9_ANOSI/101-145    AC A0A084WHA9.1
#=GS H1A4U9_TAEGU/10-76          AC H1A4U9.1
#=GS A0A226PNM9_COLVI/36-94      AC A0A226PNM9.1
#=GS B4LP39_DROVI/30-176         AC B4LP39.2
#=GS B8AGI0_ORYSI/32-173         AC B8AGI0.1
#=GS H3B9H1_LATCH/32-89          AC H3B9H1.1
#=GS J9F592_WUCBA/2-63           AC J9F592.1
#=GS N6U7A2_DENPD/94-139         AC N6U7A2.1
#=GS A0A0N4SXQ7_BRUPA/30-92      AC A0A0N4SXQ7.1
#=GS A0A182F6A9_ANOAL/41-187     AC A0A182F6A9.1
#=GS A0A0V1PLV6_9BILA/1253-1318  AC A0A0V1PLV6.1
#=GS L5JLM4_PTEAL/52-210         AC L5JLM4.1
#=GS C1FFA2_MICCC/31-175         AC C1FFA2.1
#=GS A0A2D0R8S0_ICTPU/29-188     AC A0A2D0R8S0.1
#=GS G3Q6M0_GASAC/32-191         AC G3Q6M0.1
#=GS H2XPP2_CIOIN/48-182         AC H2XPP2.1
#=GS F6SXW0_MONDO/45-204         AC F6SXW0.1
#=GS G1P6E4_MYOLU/45-103         AC G1P6E4.1
#=GS H0WBZ3_CAVPO/27-171         AC H0WBZ3.1
#=GS A0A2G3CQS3_CAPCH/30-170     AC A0A2G3CQS3.1
#=GS A0A182HV41_ANOAR/105-149    AC A0A182HV41.1
#=GS W4XB26_STRPU/39-98          AC W4XB26.1
#=GS A0A226EYM1_FOLCA/41-119     AC A0A226EYM1.1
#=GS A0A132A0K8_SARSC/22-127     AC A0A132A0K8.1
#=GS Q9VVW7_DROME/35-196         AC Q9VVW7.2
#=GS T1IHQ1_STRMM/35-96          AC T1IHQ1.1
#=GS A0A287T927_HORVV/52-193     AC A0A287T927.1
#=GS Q017C7_OSTTA/27-169         AC Q017C7.1
#=GS A0A0D2X1P8_CAPO3/53-112     AC A0A0D2X1P8.1
#=GS A0A182U0G3_9DIPT/42-188     AC A0A182U0G3.1
#=GS B7QKH7_IXOSC/103-148        AC B7QKH7.1
#=GS A0A096NWH3_PAPAN/12-154     AC A0A096NWH3.2
#=GS A0A091VNC0_OPIHO/11-46      AC A0A091VNC0.1
#=GS A0A158NR17_ATTCE/30-175     AC A0A158NR17.1
#=GS Q28FU2_XENTR/31-173         AC Q28FU2.1
#=GS L9KM06_TUPCH/45-103         AC L9KM06.1
#=GS I3KRZ0_ORENI/26-185         AC I3KRZ0.1
#=GS A0A2H4A050_PHODC/37-116     AC A0A2H4A050.1
#=GS A0A218UDP1_9PASE/31-173     AC A0A218UDP1.1
#=GS A0A2I2ZWI3_GORGO/45-102     AC A0A2I2ZWI3.1
#=GS A0A182NTD8_9DIPT/41-187     AC A0A182NTD8.1
#=GS G1SHL3_RABIT/35-178         AC G1SHL3.2
#=GS A0A1D6QUM5_MAIZE/4-75       AC A0A1D6QUM5.1
#=GS A0A091M0K4_CARIC/1-114      AC A0A091M0K4.1
#=GS A0A287T923_HORVV/3-137      AC A0A287T923.1
#=GS A0A2D0R8S3_ICTPU/1-157      AC A0A2D0R8S3.1
#=GS A0A1I8D4E4_9BILA/26-165     AC A0A1I8D4E4.1
#=GS A0A2H2I3J9_CAEJA/26-89      AC A0A2H2I3J9.1
#=GS A0A0M3J8E3_ANISI/26-73      AC A0A0M3J8E3.1
#=GS B4LD26_DROVI/34-195         AC B4LD26.1
#=GS G1PVA2_MYOLU/45-210         AC G1PVA2.1
#=GS A0A183H5Q9_9BILA/5-71       AC A0A183H5Q9.1
#=GS A0A0V1PLV9_9BILA/1308-1363  AC A0A0V1PLV9.1
#=GS G3TDJ9_LOXAF/41-201         AC G3TDJ9.1
#=GS A0A1B0GUD4_HUMAN/1-136      AC A0A1B0GUD4.1
#=GS A0A0V0VD51_9BILA/1271-1401  AC A0A0V0VD51.1
#=GS A0A151J7R2_9HYME/42-103     AC A0A151J7R2.1
#=GS A0A0V1LNS1_9BILA/127-182    AC A0A0V1LNS1.1
#=GS A0A0R3NWT9_DROPS/30-91      AC A0A0R3NWT9.1
#=GS V8PD17_OPHHA/27-166         AC V8PD17.1
#=GS A0A182MUL3_9DIPT/41-183     AC A0A182MUL3.1
#=GS H2UGV6_TAKRU/27-186         AC H2UGV6.1
#=GS A0A2K5HT99_COLAP/1-136      AC A0A2K5HT99.1
#=GS F7CNK7_HORSE/56-214         AC F7CNK7.1
#=GS A0A1V4K383_PATFA/38-96      AC A0A1V4K383.1
#=GS A0A1W5B306_CIOIN/45-116     AC A0A1W5B306.1
#=GS A0A1U8DDW5_ALLSI/48-206     AC A0A1U8DDW5.1
#=GS F8VP03_HUMAN/27-72          AC F8VP03.1
#=GS A0A068Y828_ECHMU/27-183     AC A0A068Y828.1
#=GS A0A2K5HB06_COLAP/35-194     AC A0A2K5HB06.1
#=GS A0A0N4TRG4_BRUPA/31-167     AC A0A0N4TRG4.1
#=GS A0A182Q2E4_9DIPT/102-146    AC A0A182Q2E4.1
#=GS A0A182MM76_9DIPT/94-153     AC A0A182MM76.1
#=GS A0A1X0NUB5_9TRYP/52-202     AC A0A1X0NUB5.1
#=GS A8X551_CAEBR/52-166         AC A8X551.2
#=GS E9JBY0_SOLIN/33-193         AC E9JBY0.1
#=GS C3YL01_BRAFL/28-173         AC C3YL01.1
#=GS K7HMP9_CAEJA/261-313        AC K7HMP9.1
#=GS A0A2A2LRP6_9BILA/1-133      AC A0A2A2LRP6.1
#=GS A0A0V0XZJ9_TRIPS/198-252    AC A0A0V0XZJ9.1
#=GS A0A182NZN7_9DIPT/40-200     AC A0A182NZN7.1
#=GS A0A195AY15_9HYME/33-193     AC A0A195AY15.1
#=GS A0A212ETX8_DANPL/27-176     AC A0A212ETX8.1
#=GS A0A2I3TCJ0_PANTR/1-136      AC A0A2I3TCJ0.1
#=GS A0A0V0WW19_9BILA/1202-1267  AC A0A0V0WW19.1
#=GS G4YVZ8_PHYSP/50-111         AC G4YVZ8.1
#=GS W5JIL7_ANODA/53-111         AC W5JIL7.1
#=GS A0A0V1CV27_TRIBR/1161-1226  AC A0A0V1CV27.1
#=GS A8WQR3_CAEBR/26-89          AC A8WQR3.1
#=GS A0A1D1UUM5_RAMVA/94-137     AC A0A1D1UUM5.1
#=GS U3JCI6_FICAL/44-186         AC U3JCI6.1
#=GS A0A1Y1IFA3_KLENI/27-162     AC A0A1Y1IFA3.1
#=GS A0A1X7VRA4_AMPQE/36-95      AC A0A1X7VRA4.1
#=GS H2YG98_CIOSA/1-151          AC H2YG98.1
#=GS A0A1A9YPB8_GLOFF/29-175     AC A0A1A9YPB8.1
#=GS A0A0A0AJQ2_CHAVO/6-41       AC A0A0A0AJQ2.1
#=GS G3QJV8_GORGO/37-196         AC G3QJV8.2
#=GS F6ZML9_CALJA/36-195         AC F6ZML9.1
#=GS A0A0P7WJH3_9TELE/13-172     AC A0A0P7WJH3.1
#=GS A0A091D915_FUKDA/46-176     AC A0A091D915.1
#=GS MZB1_BOVIN/49-178           AC A5PJ93.1
#=GS S9YKC8_CAMFR/47-176         AC S9YKC8.1
#=GS L5K864_PTEAL/36-195         AC L5K864.1
#=GS A0A151PES7_ALLMI/27-85      AC A0A151PES7.1
#=GS G0P8S6_CAEBE/83-135         AC G0P8S6.1
#=GS A0A182PD03_9DIPT/105-149    AC A0A182PD03.1
#=GS G3TC49_LOXAF/42-200         AC G3TC49.1
#=GS M1ALU1_SOLTU/63-203         AC M1ALU1.1
#=GS A0A182MI88_9DIPT/39-199     AC A0A182MI88.1
#=GS H0W0E5_CAVPO/30-88          AC H0W0E5.2
#=GS A0A094LWW6_9AVES/42-84      AC A0A094LWW6.1
#=GS I3KSX8_ORENI/31-173         AC I3KSX8.1
#=GS A0A158R4S4_9BILA/32-109     AC A0A158R4S4.1
#=GS A0A087Y294_POEFO/31-179     AC A0A087Y294.1
#=GS A0A0M4EHF4_DROBS/30-176     AC A0A0M4EHF4.1
#=GS A0A0Q3MAL2_AMAAE/38-96      AC A0A0Q3MAL2.1
#=GS A0A1A6HNS0_NEOLE/45-100     AC A0A1A6HNS0.1
#=GS E2RDI0_CANLF/52-210         AC E2RDI0.1
#=GS A0A0V1PLV6_9BILA/1308-1363  AC A0A0V1PLV6.1
#=GS W5JIG9_ANODA/35-195         AC W5JIG9.1
#=GS A0A1W0XA12_HYPDU/94-139     AC A0A1W0XA12.1
#=GS A8X7W0_CAEBR/26-163         AC A8X7W0.1
#=GS A0A182W7H9_9DIPT/140-184    AC A0A182W7H9.1
#=GS A0A2K5ICD9_COLAP/30-88      AC A0A2K5ICD9.1
#=GS A0A182N2A1_9DIPT/33-193     AC A0A182N2A1.1
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#=GS A0A0V0Y0J4_TRIPS/142-207    AC A0A0V0Y0J4.1
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#=GS F1RAB4_DANRE/31-190         AC F1RAB4.1
#=GS A0A0J9YYJ0_HUMAN/1-118      AC A0A0J9YYJ0.1
#=GS G3R152_GORGO/27-171         AC G3R152.2
#=GS A0A151I932_9HYME/36-181     AC A0A151I932.1
#=GS A0A2D0PKV8_ICTPU/30-172     AC A0A2D0PKV8.1
#=GS C4WUW6_ACYPI/31-188         AC C4WUW6.1
#=GS A0A091IS34_EGRGA/42-84      AC A0A091IS34.1
#=GS G1QXD3_NOMLE/47-125         AC G1QXD3.2
#=GS A0A1B0AJZ9_GLOPL/31-191     AC A0A1B0AJZ9.1
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#=GS A0A1I8HMZ8_9PLAT/380-533    AC A0A1I8HMZ8.1
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#=GS E2BUS3_HARSA/36-179         AC E2BUS3.1
#=GS A0A0V1CVE4_TRIBR/1275-1331  AC A0A0V1CVE4.1
#=GS A0A1S3SF78_SALSA/31-89      AC A0A1S3SF78.1
#=GS H2UGV8_TAKRU/25-184         AC H2UGV8.1
#=GS A0A1I8MAC8_MUSDO/30-176     AC A0A1I8MAC8.1
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#=GS A0A183GZ06_9BILA/43-103     AC A0A183GZ06.1
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#=GS T1GEQ2_MEGSC/36-184         AC T1GEQ2.1
#=GS A7RSQ2_NEMVE/45-188         AC A7RSQ2.1
#=GS A0A1D2NAC2_ORCCI/52-212     AC A0A1D2NAC2.1
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#=GS C4WRR6_ACYPI/26-171         AC C4WRR6.1
#=GS A0A182L200_9DIPT/144-187    AC A0A182L200.1
#=GS G3SKA1_GORGO/1-83           AC G3SKA1.1
#=GS F4WP89_ACREC/1-138          AC F4WP89.1
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#=GS A0A0V1AB73_9BILA/1205-1260  AC A0A0V1AB73.1
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#=GS A0A0A0A197_CHAVO/1-115      AC A0A0A0A197.1
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#=GS H2QM13_PANTR/45-102         AC H2QM13.2
#=GS A0A195C3U6_9HYME/33-193     AC A0A195C3U6.1
#=GS H2UGV7_TAKRU/26-185         AC H2UGV7.1
#=GS A0A1L8HHT4_XENLA/31-173     AC A0A1L8HHT4.1
#=GS A0A2G5T2H5_9PELO/29-185     AC A0A2G5T2H5.1
#=GS A0A287BQG2_PIG/36-195       AC A0A287BQG2.1
#=GS A0A0M9A8M5_9HYME/33-193     AC A0A0M9A8M5.1
#=GS R0KZS1_ANAPL/1-41           AC R0KZS1.1
#=GS A0A1D6ADL8_WHEAT/36-143     AC A0A1D6ADL8.1
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#=GS A0A0R3RFK1_9BILA/486-592    AC A0A0R3RFK1.1
#=GS A0A151WNT8_9HYME/42-102     AC A0A151WNT8.1
#=GS A0A1S3MYF2_SALSA/30-88      AC A0A1S3MYF2.1
#=GS A0A182WT46_ANOQN/49-109     AC A0A182WT46.1
#=GS F6XIB7_CANLF/27-172         AC F6XIB7.1
#=GS A0A0J7L8K5_LASNI/28-157     AC A0A0J7L8K5.1
#=GS F6Z426_MONDO/34-91          AC F6Z426.2
#=GS G3HVH3_CRIGR/48-175         AC G3HVH3.1
#=GS A0A0L7LG78_9NEOP/36-196     AC A0A0L7LG78.1
#=GS A0A0V1LMR9_9BILA/1258-1323  AC A0A0V1LMR9.1
#=GS A0A088ALK7_APIME/23-82      AC A0A088ALK7.1
#=GS B7Q7J5_IXOSC/30-146         AC B7Q7J5.1
#=GS N6U7A2_DENPD/39-99          AC N6U7A2.1
#=GS A0A1I7TLI7_9PELO/2-75       AC A0A1I7TLI7.1
#=GS E4X750_OIKDI/25-182         AC E4X750.1
#=GS A0A182FW49_ANOAL/35-195     AC A0A182FW49.1
#=GS A0A1S4EKM3_DIACI/27-190     AC A0A1S4EKM3.1
#=GS A0A026WGI5_OOCBI/33-193     AC A0A026WGI5.1
#=GS A0A1D2N5N0_ORCCI/47-106     AC A0A1D2N5N0.1
#=GS A0A251U4M6_HELAN/29-169     AC A0A251U4M6.1
#=GS I3JGE7_ORENI/32-191         AC I3JGE7.1
#=GS J9E801_WUCBA/2-122          AC J9E801.1
#=GS A0A183D7V6_9BILA/1-95       AC A0A183D7V6.1
#=GS H2ZFS9_CIOSA/31-74          AC H2ZFS9.1
#=GS A0A286XM27_CAVPO/46-175     AC A0A286XM27.1
#=GS F7ID04_CALJA/43-201         AC F7ID04.1
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#=GS K2MVX5_TRYCR/110-249        AC K2MVX5.1
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H0X503_OTOGA/45-102                    ......................................p-CH..TCRAL..................VESF.N.KG.LERTIR.D.N.F.........---GG.G-.--N..T.....AWEEE........KL...S.KY.KDSE...........................................TRLVEVLEG...V.C..SK..S--..---.---.---.-.-...--------.............................--..-..-----.----.--------------............-.-----------....----...--.----------......--..------------......----d.....................................................................
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A0A0V1LMW3_9BILA/1312-1368             .................................skkskd---..-----..................----.-.--.------.-.-.-.........-----.--.---..-.....-----........--...-.--.----...........................................---------...-.-..--..---..---.---.---.-.-...--------.............................--..-..-----.----.-------------V...........kEeSKIKNLESKCH....AMAE...EH.EETLETWYYH......NQkkYPDLFDWFCIRT......VKVC......................................................................
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