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Database: Pfam
Entry: PKD_channel
LinkDB: PKD_channel
Original site: PKD_channel 
#=GF ID   PKD_channel
#=GF AC   PF08016.12
#=GF DE   Polycystin cation channel
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Bateman A
#=GF GA   19.90 19.90;
#=GF TC   19.90 19.90;
#=GF NC   19.80 19.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10517637
#=GF RT   Polycystin-L is a calcium-regulated cation channel permeable to
#=GF RT   calcium ions. 
#=GF RA   Chen XZ, Vassilev PM, Basora N, Peng JB, Nomura H, Segal Y,
#=GF RA   Brown EM, Reeders ST, Hediger MA, Zhou J; 
#=GF RL   Nature 1999;401:383-386.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11264013
#=GF RT   Polycystin-2 is a novel cation channel implicated in defective
#=GF RT   intracellular Ca(2+) homeostasis in polycystic kidney disease. 
#=GF RA   Vassilev PM, Guo L, Chen XZ, Segal Y, Peng JB, Basora N,
#=GF RA   Babakhanlou H, Cruger G, Kanazirska M, Ye Cp, Brown EM, Hediger
#=GF RA   MA, Zhou J; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;282:341-350.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013122;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family contains the cation channel region of PKD1 and PKD2
#=GF CC   proteins.
#=GF SQ   3113
#=GS D7UU24_CAEEL/329-552        AC D7UU24.1
#=GS A0A091LPS8_CATAU/1584-2017  AC A0A091LPS8.1
#=GS L1IA33_GUITH/1351-1496      AC L1IA33.1
#=GS A0A0L8GJJ2_OCTBM/905-1342   AC A0A0L8GJJ2.1
#=GS M3YVF5_MUSPF/3636-4040      AC M3YVF5.1
#=GS W4GSN6_9STRA/20-164         AC W4GSN6.1
#=GS T0QHR2_9STRA/81-514         AC T0QHR2.1
#=GS A0A2I4C2I0_9TELE/2153-2397  AC A0A2I4C2I0.1
#=GS A0A0M0K5M3_9EUKA/132-210    AC A0A0M0K5M3.1
#=GS A0A0P7X8V9_9TELE/788-1041   AC A0A0P7X8V9.1
#=GS A0A1D5PG37_CHICK/1995-2418  AC A0A1D5PG37.1
#=GS M3Z8C3_MUSPF/140-431        AC M3Z8C3.1
#=GS A0A0G4GWV7_VITBC/817-959    AC A0A0G4GWV7.1
#=GS A0A2B4RP68_STYPI/1768-2213  AC A0A2B4RP68.1
#=GS A0A091TQY4_PHALP/32-455     AC A0A091TQY4.1
#=GS A0A1L9RNK9_ASPWE/259-463    AC A0A1L9RNK9.1
#=GS A0A0B1TRJ9_OESDE/1-246      AC A0A0B1TRJ9.1
#=GS A0A183WXJ1_TRIRE/1-65       AC A0A183WXJ1.1
#=GS A7RJ08_NEMVE/1-115          AC A7RJ08.1
#=GS G3VM12_SARHA/147-569        AC G3VM12.1
#=GS A0A0G4ISB2_PLABS/159-580    AC A0A0G4ISB2.1
#=GS W2HDX3_PHYPR/136-271        AC W2HDX3.1
#=GS L1J410_GUITH/1122-1273      AC L1J410.1
#=GS A0A067R2P4_ZOONE/340-551    AC A0A067R2P4.1
#=GS A0A226N1A4_CALSU/174-429    AC A0A226N1A4.1
#=GS M7AP60_CHEMY/374-526        AC M7AP60.1
#=GS A0A1I8J0W5_9PLAT/2983-3152  AC A0A1I8J0W5.1
#=GS A0A0F8CLF3_LARCR/364-507    AC A0A0F8CLF3.1
#=GS A0A2I4B9C9_9TELE/275-419    AC A0A2I4B9C9.1
#=GS G7Q079_MACFA/89-230         AC G7Q079.1
#=GS D4A828_RAT/75-497           AC D4A828.1
#=GS A0A183DB42_9BILA/7-164      AC A0A183DB42.1
#=GS A0A1I8GYK7_9PLAT/94-495     AC A0A1I8GYK7.1
#=GS D6RBX8_HUMAN/1-83           AC D6RBX8.1
#=GS A0A2A2KDK8_9BILA/225-349    AC A0A2A2KDK8.1
#=GS A0A1A6HRD7_NEOLE/263-455    AC A0A1A6HRD7.1
#=GS F1SAG5_PIG/368-513          AC F1SAG5.1
#=GS S7MQ45_MYOBR/62-482         AC S7MQ45.1
#=GS C3YK08_BRAFL/183-299        AC C3YK08.1
#=GS E0W279_PEDHC/342-482        AC E0W279.1
#=GS A0A226PJF7_COLVI/2022-2129  AC A0A226PJF7.1
#=GS V9FPF2_PHYPR/137-227        AC V9FPF2.1
#=GS T1I059_RHOPR/320-496        AC T1I059.1
#=GS A0A077ZT07_STYLE/298-530    AC A0A077ZT07.1
#=GS C3Y3N9_BRAFL/86-287         AC C3Y3N9.1
#=GS A0A0L8FS31_OCTBM/77-500     AC A0A0L8FS31.1
#=GS F1NE51_CHICK/31-403         AC F1NE51.3
#=GS T0RY77_9STRA/82-523         AC T0RY77.1
#=GS A0A093QDM1_PHACA/54-476     AC A0A093QDM1.1
#=GS A0A0R3RLP5_9BILA/314-467    AC A0A0R3RLP5.1
#=GS A0A2D0SLN8_ICTPU/406-552    AC A0A2D0SLN8.1
#=GS H2V470_TAKRU/2517-2803      AC H2V470.1
#=GS F6R8U5_MONDO/375-523        AC F6R8U5.2
#=GS G3WTL6_SARHA/364-507        AC G3WTL6.1
#=GS W6YAQ2_COCCA/224-432        AC W6YAQ2.1
#=GS A7SE40_NEMVE/1-283          AC A7SE40.1
#=GS A0A0Q3XA07_AMAAE/3531-3738  AC A0A0Q3XA07.1
#=GS A0A024U1H7_9STRA/103-543    AC A0A024U1H7.1
#=GS A0A1I8J263_9PLAT/30-83      AC A0A1I8J263.1
#=GS A0A091VA67_NIPNI/226-442    AC A0A091VA67.1
#=GS A0A0D9QW60_CHLSB/1438-1677  AC A0A0D9QW60.1
#=GS A0A225WZ31_9STRA/89-521     AC A0A225WZ31.1
#=GS A0A1U7Q7W5_MESAU/1632-2062  AC A0A1U7Q7W5.1
#=GS G1Q141_MYOLU/1895-2174      AC G1Q141.1
#=GS A0A226EK91_FOLCA/142-471    AC A0A226EK91.1
#=GS A0A2K5LAG2_CERAT/1432-1671  AC A0A2K5LAG2.1
#=GS A0A093J1L4_STRCA/269-435    AC A0A093J1L4.1
#=GS A0A1U8D6G6_ALLSI/73-495     AC A0A1U8D6G6.1
#=GS A0A0M3JQM1_ANISI/1-71       AC A0A0M3JQM1.1
#=GS A0A1I8JJP5_9PLAT/194-454    AC A0A1I8JJP5.1
#=GS A0A0R3WG97_TAEAS/466-843    AC A0A0R3WG97.1
#=GS G7NTK5_MACFA/364-508        AC G7NTK5.1
#=GS S9YQY2_CAMFR/634-780        AC S9YQY2.1
#=GS A0A1R2D3I0_9CILI/63-314     AC A0A1R2D3I0.1
#=GS C3ZGR4_BRAFL/1-421          AC C3ZGR4.1
#=GS A0A1U8DIT7_ALLSI/416-560    AC A0A1U8DIT7.1
#=GS L5KGG6_PTEAL/234-638        AC L5KGG6.1
#=GS V5IMY9_NEUCR/341-436        AC V5IMY9.1
#=GS T1FTZ6_HELRO/222-509        AC T1FTZ6.1
#=GS G4ZYG3_PHYSP/171-435        AC G4ZYG3.1
#=GS T0Q1J1_9STRA/303-438        AC T0Q1J1.1
#=GS A0A1L8GKN5_XENLA/1990-2413  AC A0A1L8GKN5.1
#=GS A0A2K5NFA2_CERAT/301-447    AC A0A2K5NFA2.1
#=GS U3I5S3_ANAPL/343-487        AC U3I5S3.1
#=GS E1Z8F2_CHLVA/1151-1305      AC E1Z8F2.1
#=GS A0A0L0BKM8_LUCCU/162-558    AC A0A0L0BKM8.1
#=GS A0A093FES8_TYTAL/69-489     AC A0A093FES8.1
#=GS A0A087QHK6_APTFO/362-508    AC A0A087QHK6.1
#=GS A0A1D5P8Y1_CHICK/3685-4103  AC A0A1D5P8Y1.1
#=GS K1PC79_CRAGI/149-571        AC K1PC79.1
#=GS A0A2K3CUY7_CHLRE/4765-4925  AC A0A2K3CUY7.1
#=GS Q6C4S0_YARLI/244-461        AC Q6C4S0.1
#=GS L1IUN1_GUITH/51-504         AC L1IUN1.1
#=GS A0A0G4FGX1_VITBC/518-960    AC A0A0G4FGX1.1
#=GS B4LLU9_DROVI/18-398         AC B4LLU9.2
#=GS A0A0R3T5K9_HYMNN/293-408    AC A0A0R3T5K9.1
#=GS B4G9M0_DROPE/520-915        AC B4G9M0.1
#=GS F6RXN1_CIOIN/55-480         AC F6RXN1.2
#=GS A0A0A0AFZ2_CHAVO/340-484    AC A0A0A0AFZ2.1
#=GS A0A094LAY2_9AVES/67-490     AC A0A094LAY2.1
#=GS B4K0Q7_DROGR/2-279          AC B4K0Q7.1
#=GS C3YC86_BRAFL/2886-3140      AC C3YC86.1
#=GS A0A0K0FG47_9BILA/339-566    AC A0A0K0FG47.1
#=GS A0A091LN46_CATAU/69-490     AC A0A091LN46.1
#=GS A0A2B4STG1_STYPI/455-590    AC A0A2B4STG1.1
#=GS A0A2A2JQY5_9BILA/225-349    AC A0A2A2JQY5.1
#=GS F1NIW3_CHICK/364-508        AC F1NIW3.2
#=GS H3AK63_LATCH/1879-2091      AC H3AK63.1
#=GS A0A024UTM6_9STRA/261-395    AC A0A024UTM6.1
#=GS A0A0M0JJ03_9EUKA/275-581    AC A0A0M0JJ03.1
#=GS A0A1R2CAC6_9CILI/181-527    AC A0A1R2CAC6.1
#=GS V4B190_LOTGI/1-227          AC V4B190.1
#=GS A0A0D9S6V9_CHLSB/345-488    AC A0A0D9S6V9.1
#=GS F0Y7Y9_AURAN/323-777        AC F0Y7Y9.1
#=GS A0A093GPJ8_TYTAL/67-490     AC A0A093GPJ8.1
#=GS A0A2G8JYH1_STIJA/1478-1918  AC A0A2G8JYH1.1
#=GS A0A0G4FXH4_VITBC/235-488    AC A0A0G4FXH4.1
#=GS A0A1V4JYT8_PATFA/317-508    AC A0A1V4JYT8.1
#=GS A0A2A2LV58_9BILA/115-262    AC A0A2A2LV58.1
#=GS M3YDV1_MUSPF/1982-2405      AC M3YDV1.1
#=GS F7GM26_CALJA/272-692        AC F7GM26.1
#=GS A0A1I8GEF3_9PLAT/521-927    AC A0A1I8GEF3.1
#=GS A0A0A1TKJ8_9HYPO/232-449    AC A0A0A1TKJ8.1
#=GS K7G420_PELSI/160-255        AC K7G420.1
#=GS W5M5A6_LEPOC/3701-4119      AC W5M5A6.1
#=GS A0A2I4C5T3_9TELE/162-584    AC A0A2I4C5T3.1
#=GS A0A096MXN5_PAPAN/370-513    AC A0A096MXN5.1
#=GS A0A1I8F3L2_9PLAT/320-745    AC A0A1I8F3L2.1
#=GS A0A2G9R879_LITCT/1-153      AC A0A2G9R879.1
#=GS B4J1A4_DROGR/167-595        AC B4J1A4.1
#=GS A0A1S3REZ8_SALSA/218-639    AC A0A1S3REZ8.1
#=GS E6QY52_CRYGW/226-452        AC E6QY52.1
#=GS A0A183TAH0_SCHSO/19-134     AC A0A183TAH0.1
#=GS A0A1L9SB60_9EURO/257-463    AC A0A1L9SB60.1
#=GS C3YNC8_BRAFL/1653-1941      AC C3YNC8.1
#=GS A0A0C9Z751_9HOMO/247-328    AC A0A0C9Z751.1
#=GS A0A231M1Y7_9EURO/246-463    AC A0A231M1Y7.1
#=GS A0A1X0NSA4_9TRYP/312-462    AC A0A1X0NSA4.1
#=GS W2LMM7_PHYPR/183-501        AC W2LMM7.1
#=GS H2KTZ9_CLOSI/139-562        AC H2KTZ9.1
#=GS G3VPR1_SARHA/226-646        AC G3VPR1.1
#=GS W4Z655_STRPU/2665-3084      AC W4Z655.1
#=GS L5KQ46_PTEAL/1267-1477      AC L5KQ46.1
#=GS A0A0R3WE82_TAEAS/402-549    AC A0A0R3WE82.1
#=GS F0ZPC2_DICPU/301-527        AC F0ZPC2.1
#=GS A0A1U8CUJ2_ALLSI/1031-1302  AC A0A1U8CUJ2.1
#=GS A0A225W3U9_9STRA/297-444    AC A0A225W3U9.1
#=GS T1F487_HELRO/27-132         AC T1F487.1
#=GS A0A0M3IK00_ASCLU/70-169     AC A0A0M3IK00.1
#=GS F1Q0G0_CANLF/3646-4050      AC F1Q0G0.2
#=GS A0A1S3RE13_SALSA/62-483     AC A0A1S3RE13.1
#=GS A0A287A0W7_PIG/461-607      AC A0A287A0W7.1
#=GS A0A0M0JHQ6_9EUKA/824-893    AC A0A0M0JHQ6.1
#=GS A0A093IN08_FULGA/3642-4039  AC A0A093IN08.1
#=GS A0A2C9LH39_BIOGL/1-161      AC A0A2C9LH39.1
#=GS D0MRA9_PHYIT/119-555        AC D0MRA9.1
#=GS C6HN32_AJECH/248-464        AC C6HN32.1
#=GS A0A1I8H621_9PLAT/1-240      AC A0A1I8H621.1
#=GS A0A093E1I7_9AVES/69-490     AC A0A093E1I7.1
#=GS A0A1R2BLX2_9CILI/999-1169   AC A0A1R2BLX2.1
#=GS F6VIE7_XENTR/214-635        AC F6VIE7.1
#=GS U4UTK0_DENPD/329-474        AC U4UTK0.1
#=GS A0A1S3F8Z2_DIPOR/147-569    AC A0A1S3F8Z2.1
#=GS C1N908_MICPC/1129-1472      AC C1N908.1
#=GS T1G5F6_HELRO/16-408         AC T1G5F6.1
#=GS H2SM30_TAKRU/1885-2079      AC H2SM30.1
#=GS A0A1U7QVP4_MESAU/370-513    AC A0A1U7QVP4.1
#=GS G1Q633_MYOLU/136-416        AC G1Q633.1
#=GS H3GK24_PHYRM/219-375        AC H3GK24.1
#=GS G5C921_HETGA/317-508        AC G5C921.1
#=GS X6N353_RETFI/220-350        AC X6N353.1
#=GS A0A068XJJ5_HYMMI/142-545    AC A0A068XJJ5.1
#=GS A0A1U7TM48_TARSY/1-194      AC A0A1U7TM48.1
#=GS A0A1I7WIL6_HETBA/622-757    AC A0A1I7WIL6.1
#=GS A0A1S3IFB0_LINUN/1-309      AC A0A1S3IFB0.1
#=GS A0A0Q9X073_DROMO/163-413    AC A0A0Q9X073.1
#=GS X6MK54_RETFI/1-252          AC X6MK54.1
#=GS A0A0N5AEU4_9BILA/314-541    AC A0A0N5AEU4.1
#=GS A0A0M3JAZ7_ANISI/2-176      AC A0A0M3JAZ7.1
#=GS A0D266_PARTE/475-683        AC A0D266.1
#=GS V9FPW9_PHYPR/136-271        AC V9FPW9.1
#=GS A0A093H718_TYTAL/55-477     AC A0A093H718.1
#=GS A0A1Q9CZY6_SYMMI/329-481    AC A0A1Q9CZY6.1
#=GS A2BGV1_DANRE/380-525        AC A2BGV1.1
#=GS A0A1I8GLP5_9PLAT/112-535    AC A0A1I8GLP5.1
#=GS D8TX65_VOLCA/1489-1640      AC D8TX65.1
#=GS J9PBA7_CANLF/1602-2032      AC J9PBA7.1
#=GS A0A087YFT8_POEFO/1996-2414  AC A0A087YFT8.1
#=GS A0A225WD79_9STRA/307-511    AC A0A225WD79.1
#=GS D8TMS8_VOLCA/529-668        AC D8TMS8.1
#=GS B4J3E0_DROGR/459-603        AC B4J3E0.1
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#=GS I3MR26_ICTTR/378-524        AC I3MR26.2
#=GS C3YTF9_BRAFL/1571-2006      AC C3YTF9.1
#=GS A0A093J1F0_EURHL/69-490     AC A0A093J1F0.1
#=GS K1PAM8_CRAGI/1425-1870      AC K1PAM8.1
#=GS C3Z6G4_BRAFL/251-440        AC C3Z6G4.1
#=GS H3FDX4_PRIPA/125-431        AC H3FDX4.1
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