GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Pectate_lyase22
LinkDB: Pectate_lyase22
Original site: Pectate_lyase22 
#=GF ID   Pectate_lyase22
#=GF AC   PF14583.7
#=GF DE   Oligogalacturonate lyase
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   CATH:3c5mA00
#=GF GA   30.00 30.00;
#=GF TC   30.00 30.20;
#=GF NC   29.90 29.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   WD40_repeat
#=GF RN   [1]
#=GF RM   20805221
#=GF RT   Structural and mechanistic classification of uronic
#=GF RT   acid-containing polysaccharide lyases.
#=GF RA   Garron ML, Cygler M;
#=GF RL   Glycobiology. 2010;20:1547-1573.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   20851883
#=GF RT   The active site of oligogalacturonate lyase provides unique
#=GF RT   insights into cytoplasmic oligogalacturonate beta-elimination.
#=GF RA   Abbott DW, Gilbert HJ, Boraston AB;
#=GF RL   J Biol Chem. 2010;285:39029-39038.
#=GF DR   INTERPRO; IPR027946;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This is a family of oligogalacturonate lyases, referred to more
#=GF CC   generally as pectate lyase family 22.  These proteins fold into
#=GF CC   7-bladed beta-propellers.
#=GF SQ   306
#=GS A0A1B9G728_9TREE/176-409  AC A0A1B9G728.1
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#=GS A0A1B8U6R4_9FLAO/31-409   AC A0A1B8U6R4.1
#=GS A0A172ZLW5_9BACL/1-170    AC A0A172ZLW5.1
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#=GS A0A229UXL7_9BACL/4-386    AC A0A229UXL7.1
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#=GS A0A3S0JN87_9BACI/1-387    AC A0A3S0JN87.1
#=GS U2MFK4_SERFO/1-386        AC U2MFK4.1
#=GS A0A229UJT7_9BACL/1-283    AC A0A229UJT7.1
#=GS N2ITX1_9PSED/1-386        AC N2ITX1.1
#=GS A0A090UVS3_ESCVU/1-386    AC A0A090UVS3.1
#=GS A0A0N1AB95_9PROT/1-386    AC A0A0N1AB95.1
#=GS A0A071M122_9ENTR/1-376    AC A0A071M122.1
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