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Database: Pfam
Entry: Peptidase_M56
LinkDB: Peptidase_M56
Original site: Peptidase_M56 
#=GF ID   Peptidase_M56
#=GF AC   PF05569.12
#=GF DE   BlaR1 peptidase M56
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Merops
#=GF GA   31.00 31.00;
#=GF TC   31.00 31.00;
#=GF NC   30.90 30.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11245199
#=GF RT   Microbiology. Signaling antibiotic resistance in staphylococci. 
#=GF RA   Archer GL, Bosilevac JM; 
#=GF RL   Science 2001;291:1915-1916.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11239156
#=GF RT   A proteolytic transmembrane signaling pathway and resistance to
#=GF RT   beta-lactams in staphylococci. 
#=GF RA   Zhang HZ, Hackbarth CJ, Chansky KM, Chambers HF; 
#=GF RL   Science 2001;291:1962-1965.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   9164468
#=GF RT   Mechanisms of methicillin resistance in staphylococci. 
#=GF RA   Brakstad OG, Maeland JA; 
#=GF RL   APMIS 1997;105:264-276.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   23733187
#=GF RT   A novel family of soluble minimal scaffolds provides structural
#=GF RT   insight into the  catalytic domains of integral membrane
#=GF RT   metallopeptidases.
#=GF RA   Lopez-Pelegrin M, Cerda-Costa N, Martinez-Jimenez F,
#=GF RA   Cintas-Pedrola A, Canals A, Peinado JR, Marti-Renom MA,
#=GF RA   Lopez-Otin C, Arolas JL, Gomis-Ruth FX;
#=GF RL   J Biol Chem. 2013;288:21279-21294.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008756;
#=GF DR   MEROPS; M56;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Production of beta-Lactamase and penicillin-binding protein 2a
#=GF CC   (which mediate staphylococcal resistance to beta-lactam
#=GF CC   antibiotics) is regulated by a signal-transducing integral
#=GF CC   membrane protein       and a transcriptional repressor.  The
#=GF CC   signal transducer is a fusion protein with penicillin-binding
#=GF CC   and zinc metalloprotease domains.  The signal for protein
#=GF CC   expression is transmitted by site-specific proteolytic cleavage
#=GF CC   of both the transducer, which auto-activates, and the repressor,
#=GF CC   which is inactivated, unblocking gene transcription. Homologues
#=GF CC   to this peptidase domain, which corresponds to Merops family 
#=GF CC   M56, are also found in a number of other bacterial genome
#=GF CC   sequences.
#=GF SQ   4461
#=GS A0A318UHF6_9SPHI/135-252  AC A0A318UHF6.1
#=GS B0SZY3_CAUSK/7-277        AC B0SZY3.1
#=GS A0A1M5ASL3_9BACE/13-262   AC A0A1M5ASL3.1
#=GS A0A1I0RTP1_9RHOB/13-300   AC A0A1I0RTP1.1
#=GS A0A3S3VLL0_9SPHI/10-258   AC A0A3S3VLL0.1
#=GS A0A378HZZ7_9GAMM/2-290    AC A0A378HZZ7.1
#=GS R6HC53_9FIRM/56-259       AC R6HC53.1
#=GS A0A0B5S5I2_9FLAO/72-187   AC A0A0B5S5I2.1
#=GS A0A417CA22_9FIRM/1-289    AC A0A417CA22.1
#=GS G8UJ05_TANFA/4-263        AC G8UJ05.1
#=GS A0A399RCB1_9RHOB/11-328   AC A0A399RCB1.1
#=GS A0A0M1UWJ3_PAESO/4-284    AC A0A0M1UWJ3.1
#=GS A0A174PBG0_9BACE/83-262   AC A0A174PBG0.1
#=GS A0A369PDY0_9GAMM/6-294    AC A0A369PDY0.1
#=GS A0A3T1D7U7_9BACL/51-251   AC A0A3T1D7U7.1
#=GS A0A318XQL2_9FIRM/6-279    AC A0A318XQL2.1
#=GS A0A1H4GV82_9SPHI/22-296   AC A0A1H4GV82.1
#=GS A0A1M5SD10_9FIRM/5-288    AC A0A1M5SD10.1
#=GS R9KZL8_9FIRM/8-326        AC R9KZL8.1
#=GS A0A068NNH7_9BACT/14-302   AC A0A068NNH7.1
#=GS A0A3S8RQM4_9BACL/3-296    AC A0A3S8RQM4.1
#=GS I3Z4R0_BELBD/19-345       AC I3Z4R0.1
#=GS A0A368KJ01_9PLAN/23-326   AC A0A368KJ01.1
#=GS H8MNF3_CORCM/17-309       AC H8MNF3.1
#=GS A0A1Y4MBK1_9FIRM/6-277    AC A0A1Y4MBK1.1
#=GS A0A2T7BCV3_9BACT/20-311   AC A0A2T7BCV3.1
#=GS A0A328C3Y2_9DELT/147-276  AC A0A328C3Y2.1
#=GS K6XKC9_9ALTE/2-270        AC K6XKC9.1
#=GS A0A417U2D7_9FIRM/6-286    AC A0A417U2D7.1
#=GS F9D6J5_PREDD/162-274      AC F9D6J5.1
#=GS W4V3F9_9FIRM/6-281        AC W4V3F9.1
#=GS A0A2P8CVK1_9BACT/2-264    AC A0A2P8CVK1.1
#=GS A0A3A9US72_9FLAO/7-257    AC A0A3A9US72.1
#=GS A0A0D7W661_9FLAO/3-247    AC A0A0D7W661.1
#=GS M5RRC6_9PLAN/11-332       AC M5RRC6.1
#=GS A0A3N2MAY4_9BACT/169-274  AC A0A3N2MAY4.1
#=GS A0A1G9XHB3_9FLAO/62-257   AC A0A1G9XHB3.1
#=GS A0A1I4ME09_9BACL/40-248   AC A0A1I4ME09.1
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#=GS A6TUY0_ALKMQ/6-271        AC A6TUY0.1
#=GS A0A1M6QYQ9_9CLOT/161-390  AC A0A1M6QYQ9.1
#=GS A0A1V4I9N7_9CLOT/9-330    AC A0A1V4I9N7.1
#=GS A0A1G6KLK4_9SPHN/3-288    AC A0A1G6KLK4.1
#=GS A0A2Z2KHA3_9BACL/2-288    AC A0A2Z2KHA3.1
#=GS R5DMC7_9FIRM/19-259       AC R5DMC7.1
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#=GS A0A1I5FQ30_9FIRM/1-287    AC A0A1I5FQ30.1
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#=GS R6FDP8_9BACE/38-281       AC R6FDP8.1
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#=GS A0A413G7T3_9FIRM/6-296    AC A0A413G7T3.1
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#=GS A0A0Q7ENC3_9CAUL/13-284   AC A0A0Q7ENC3.1
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#=GS A0A1V3RRC2_9FLAO/2-271    AC A0A1V3RRC2.1
#=GS W0JDJ6_9BACT/8-308        AC W0JDJ6.1
#=GS A0A2S7WP18_9FLAO/145-255  AC A0A2S7WP18.1
#=GS L8D4V6_9GAMM/116-249      AC L8D4V6.1
#=GS G8TE94_NIAKG/156-264      AC G8TE94.1
#=GS A0A1Y4WL00_9FIRM/5-295    AC A0A1Y4WL00.1
#=GS A0A1B6Z449_9SPHN/7-274    AC A0A1B6Z449.1
#=GS A0A1Y4ETI2_9FIRM/5-183    AC A0A1Y4ETI2.1
#=GS A0A2W1NUX7_9BACL/4-304    AC A0A2W1NUX7.1
#=GS C6W6S9_DYAFD/4-270        AC C6W6S9.1
#=GS A0A3D8YGV3_9BACT/7-274    AC A0A3D8YGV3.1
#=GS A0A3D8VIM1_9GAMM/23-271   AC A0A3D8VIM1.1
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#=GS A0A1N7K184_9FLAO/1-252    AC A0A1N7K184.1
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#=GS W4UM17_9BACE/149-261      AC W4UM17.1
#=GS A0A223NQ92_9SPHI/25-314   AC A0A223NQ92.1
#=GS N9WDR6_9SPHN/13-307       AC N9WDR6.1
#=GS A0A1I0KTF3_9BACL/44-233   AC A0A1I0KTF3.1
#=GS R4KDT4_9FIRM/6-301        AC R4KDT4.1
#=GS A0A1A7KM55_9FLAO/2-252    AC A0A1A7KM55.1
#=GS R6QQJ5_9FIRM/6-277        AC R6QQJ5.1
#=GS A0A0Q7Q2K6_9GAMM/16-300   AC A0A0Q7Q2K6.1
#=GS A0A1W1VVA8_9BACT/77-292   AC A0A1W1VVA8.1
#=GS R9KJ30_9FIRM/7-296        AC R9KJ30.1
#=GS H8MTQ6_CORCM/172-289      AC H8MTQ6.1
#=GS A0A2T8HLP8_9SPHI/78-254   AC A0A2T8HLP8.1
#=GS R5ADC9_9FIRM/38-288       AC R5ADC9.1
#=GS A0A2Z4GG32_9BACT/1-275    AC A0A2Z4GG32.1
#=GS A0A0G3M963_9FLAO/148-254  AC A0A0G3M963.1
#=GS A0A401HXS1_9BACL/148-379  AC A0A401HXS1.1
#=GS A0A3S3YSQ9_9SPHI/10-302   AC A0A3S3YSQ9.1
#=GS A0A0M0H984_ANEMI/6-297    AC A0A0M0H984.1
#=GS R9J801_9FIRM/122-354      AC R9J801.1
#=GS S0KLT1_9ENTE/6-278        AC S0KLT1.1
#=GS A6EMN8_9BACT/6-260        AC A6EMN8.1
#=GS N1Z197_9CLOT/2-298        AC N1Z197.1
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#=GS H8XTW2_FLAIG/9-259        AC H8XTW2.1
#=GS A0A0B2C2H5_9SPHN/8-269    AC A0A0B2C2H5.1
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#=GS A0A0C1L0T5_9BACT/15-293   AC A0A0C1L0T5.1
#=GS A0A2S1QUB0_9FLAO/6-252    AC A0A2S1QUB0.1
#=GS A0A1N6Y942_9BACT/146-260  AC A0A1N6Y942.1
#=GS A0A416EGH7_9FIRM/1-284    AC A0A416EGH7.1
#=GS A0A0Q3TK85_9BACI/5-183    AC A0A0Q3TK85.1
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#=GS Q160N7_ROSDO/7-291        AC Q160N7.1
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#=GS A0A316TPR2_9BACT/19-306   AC A0A316TPR2.1
#=GS R5EM43_9FIRM/6-286        AC R5EM43.1
#=GS A0A3P0X761_9BACT/149-355  AC A0A3P0X761.1
#=GS Q181X3_PEPD6/10-282       AC Q181X3.1
#=GS S2E6N4_9BACT/139-253      AC S2E6N4.1
#=GS A0A417HMC5_9FIRM/13-267   AC A0A417HMC5.1
#=GS A0A2S1SHZ9_9FLAO/13-298   AC A0A2S1SHZ9.1
#=GS A0A1I0HQC0_THASX/20-298   AC A0A1I0HQC0.1
#=GS W7YPQ7_9BACT/18-319       AC W7YPQ7.1
#=GS F2JLR7_CELLD/10-308       AC F2JLR7.1
#=GS A0A2W2AF26_9BACT/148-260  AC A0A2W2AF26.1
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#=GS A0A0U2LEU5_9BACL/10-329   AC A0A0U2LEU5.1
#=GS A0A498CNM3_9FIRM/6-305    AC A0A498CNM3.1
#=GS A0A2P7TWL0_9SPHI/178-308  AC A0A2P7TWL0.1
#=GS R5AGC2_9FIRM/10-296       AC R5AGC2.1
#=GS R5SKC6_9FIRM/1-308        AC R5SKC6.1
#=GS A0A2V1IRR3_9BACT/146-258  AC A0A2V1IRR3.1
#=GS A0A386HKD6_9BACT/20-304   AC A0A386HKD6.1
#=GS Q7UHG7_RHOBA/5-281        AC Q7UHG7.1
#=GS S0JFV8_9FIRM/1-281        AC S0JFV8.1
#=GS A0A385BM88_9FLAO/150-259  AC A0A385BM88.1
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#=GS A0A3S2WWH1_9SPHI/11-299   AC A0A3S2WWH1.1
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#=GS A0A192WQX1_9BACT/87-326   AC A0A192WQX1.1
#=GS A0A3S9MUK3_9FLAO/23-252   AC A0A3S9MUK3.1
#=GS A0A291R019_9BACT/17-311   AC A0A291R019.1
#=GS G2FMY0_9FIRM/14-332       AC G2FMY0.1
#=GS F9YU18_CAPCC/7-230        AC F9YU18.1
#=GS A0A0M4D0V5_SPHS1/10-309   AC A0A0M4D0V5.1
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#=GS A0A426CQ04_9BACT/8-80     AC A0A426CQ04.1
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#=GS G5GFS1_9FIRM/1-141        AC G5GFS1.1
#=GS A0A1T5JFB6_9BACT/144-251  AC A0A1T5JFB6.1
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