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Database: Pfam
Entry: Peptidase_M56
LinkDB: Peptidase_M56
Original site: Peptidase_M56 
#=GF ID   Peptidase_M56
#=GF AC   PF05569.13
#=GF DE   BlaR1 peptidase M56
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Merops
#=GF GA   31.00 31.00;
#=GF TC   31.00 31.00;
#=GF NC   30.90 30.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0126
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11245199
#=GF RT   Microbiology. Signaling antibiotic resistance in staphylococci. 
#=GF RA   Archer GL, Bosilevac JM; 
#=GF RL   Science 2001;291:1915-1916.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11239156
#=GF RT   A proteolytic transmembrane signaling pathway and resistance to
#=GF RT   beta-lactams in staphylococci. 
#=GF RA   Zhang HZ, Hackbarth CJ, Chansky KM, Chambers HF; 
#=GF RL   Science 2001;291:1962-1965.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   9164468
#=GF RT   Mechanisms of methicillin resistance in staphylococci. 
#=GF RA   Brakstad OG, Maeland JA; 
#=GF RL   APMIS 1997;105:264-276.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   23733187
#=GF RT   A novel family of soluble minimal scaffolds provides structural
#=GF RT   insight into the  catalytic domains of integral membrane
#=GF RT   metallopeptidases.
#=GF RA   Lopez-Pelegrin M, Cerda-Costa N, Martinez-Jimenez F,
#=GF RA   Cintas-Pedrola A, Canals A, Peinado JR, Marti-Renom MA,
#=GF RA   Lopez-Otin C, Arolas JL, Gomis-Ruth FX;
#=GF RL   J Biol Chem. 2013;288:21279-21294.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008756;
#=GF DR   MEROPS; M56;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Production of beta-Lactamase and penicillin-binding protein 2a
#=GF CC   (which mediate staphylococcal resistance to beta-lactam
#=GF CC   antibiotics) is regulated by a signal-transducing integral
#=GF CC   membrane protein       and a transcriptional repressor.  The
#=GF CC   signal transducer is a fusion protein with penicillin-binding
#=GF CC   and zinc metalloprotease domains.  The signal for protein
#=GF CC   expression is transmitted by site-specific proteolytic cleavage
#=GF CC   of both the transducer, which auto-activates, and the repressor,
#=GF CC   which is inactivated, unblocking gene transcription. Homologues
#=GF CC   to this peptidase domain, which corresponds to Merops family 
#=GF CC   M56, are also found in a number of other bacterial genome
#=GF CC   sequences.
#=GF SQ   5243
#=GS A0A1T5ILW0_9CLOT/106-362  AC A0A1T5ILW0.1
#=GS A0A2S1QUF8_9FLAO/142-260  AC A0A2S1QUF8.1
#=GS A0A1C2GLF6_9SPHI/21-315   AC A0A1C2GLF6.1
#=GS A0A2K4ZJ74_9FIRM/118-321  AC A0A2K4ZJ74.1
#=GS A0A378HZZ7_9GAMM/2-290    AC A0A378HZZ7.1
#=GS A0A518CV21_9BACT/148-394  AC A0A518CV21.1
#=GS A0A6I3L1Q0_9NOCA/41-204   AC A0A6I3L1Q0.1
#=GS A0A1Y4T9G2_9FIRM/2-158    AC A0A1Y4T9G2.1
#=GS Q01Y66_SOLUE/7-298        AC Q01Y66.1
#=GS A0A2U0ZB49_9BACT/18-301   AC A0A2U0ZB49.1
#=GS H8N012_CORCM/17-318       AC H8N012.1
#=GS A0A4R3KR29_9FIRM/5-323    AC A0A4R3KR29.1
#=GS A0A4R6J1U1_9BACT/2-265    AC A0A4R6J1U1.1
#=GS A0A316E2E9_9FLAO/50-252   AC A0A316E2E9.1
#=GS U7UKD8_9FIRM/92-279       AC U7UKD8.1
#=GS A0A5B7YFG8_9ALTE/72-252   AC A0A5B7YFG8.1
#=GS A0A417CA22_9FIRM/1-289    AC A0A417CA22.1
#=GS A0A5C5WYZ1_9BACT/24-314   AC A0A5C5WYZ1.1
#=GS G8UJ05_TANFA/4-263        AC G8UJ05.1
#=GS A0A1W1YFK6_9FLAO/64-257   AC A0A1W1YFK6.1
#=GS K6XJ27_9ALTE/70-273       AC K6XJ27.1
#=GS A0A0M1UWJ3_PAESO/4-284    AC A0A0M1UWJ3.1
#=GS A0A142Y6Z0_9BACT/11-329   AC A0A142Y6Z0.1
#=GS A0A4R3VWP6_9SPHI/28-298   AC A0A4R3VWP6.1
#=GS A0A5B8YLJ2_9FLAO/2-261    AC A0A5B8YLJ2.1
#=GS A0A3T1D7U7_9BACL/51-251   AC A0A3T1D7U7.1
#=GS C6W268_DYAFD/148-251      AC C6W268.1
#=GS A0A318XQL2_9FIRM/6-279    AC A0A318XQL2.1
#=GS A0A143PQ54_9BACT/8-284    AC A0A143PQ54.1
#=GS A0A3N0EDR7_9ACTN/29-240   AC A0A3N0EDR7.1
#=GS A0A243W5N3_9BACT/157-266  AC A0A243W5N3.1
#=GS A0A1M5SD10_9FIRM/5-288    AC A0A1M5SD10.1
#=GS A0A0F5JLE8_9BACT/137-262  AC A0A0F5JLE8.1
#=GS A0A366HEQ7_9BACT/21-328   AC A0A366HEQ7.1
#=GS A0A4Y9SSS8_9BURK/11-308   AC A0A4Y9SSS8.1
#=GS R9KZL8_9FIRM/8-326        AC R9KZL8.1
#=GS A0A068NNH7_9BACT/14-302   AC A0A068NNH7.1
#=GS A0A399SXF9_9BACT/74-265   AC A0A399SXF9.1
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#=GS A0A517TS31_9BACT/8-311    AC A0A517TS31.1
#=GS A0A1Y4MBK1_9FIRM/6-277    AC A0A1Y4MBK1.1
#=GS A0A417U2D7_9FIRM/6-286    AC A0A417U2D7.1
#=GS A0A517QTJ5_9BACT/9-326    AC A0A517QTJ5.1
#=GS W4V3F9_9FIRM/6-281        AC W4V3F9.1
#=GS A0A2P8CVK1_9BACT/2-264    AC A0A2P8CVK1.1
#=GS D0LRH7_HALO1/22-308       AC D0LRH7.1
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#=GS A0A4R1QY47_9FIRM/8-285    AC A0A4R1QY47.1
#=GS A0A1T5LA76_9GAMM/11-330   AC A0A1T5LA76.1
#=GS A6TUY0_ALKMQ/6-271        AC A6TUY0.1
#=GS A0A2D0MZI1_9BACT/89-278   AC A0A2D0MZI1.1
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#=GS A0A4Q0J8Y3_9BACT/158-256  AC A0A4Q0J8Y3.1
#=GS A0A4Q2YFL2_9BACT/11-319   AC A0A4Q2YFL2.1
#=GS A0A1G6KLK4_9SPHN/3-288    AC A0A1G6KLK4.1
#=GS R7JY20_9CLOT/125-346      AC R7JY20.1
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#=GS A0A1H2DW30_9BACT/81-331   AC A0A1H2DW30.1
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#=GS A0A495D6A8_9ALTE/16-279   AC A0A495D6A8.1
#=GS A0A3P3W693_9FLAO/37-259   AC A0A3P3W693.1
#=GS A0A517YR03_9BACT/3-319    AC A0A517YR03.1
#=GS A0A3M8FYV6_9BACT/16-302   AC A0A3M8FYV6.1
#=GS A0A0Q7T5N1_9CAUL/9-290    AC A0A0Q7T5N1.1
#=GS D4MTY5_ANAHA/78-274       AC D4MTY5.1
#=GS A0A6I6JT74_9BACT/148-265  AC A0A6I6JT74.1
#=GS A0A4V1SFC3_9SPHI/39-296   AC A0A4V1SFC3.1
#=GS A0A1I7H460_9BACT/3-263    AC A0A1I7H460.1
#=GS A0A5M6CMX6_9BACT/32-315   AC A0A5M6CMX6.1
#=GS A0A1I5FQ30_9FIRM/1-287    AC A0A1I5FQ30.1
#=GS A0A140L0F5_9FIRM/6-287    AC A0A140L0F5.1
#=GS A0A1B3W822_9GAMM/9-264    AC A0A1B3W822.1
#=GS A0A098G8U8_9GAMM/19-291   AC A0A098G8U8.1
#=GS F7KC88_9FIRM/6-317        AC F7KC88.1
#=GS A0A371QIA7_9BACT/19-307   AC A0A371QIA7.1
#=GS A0A1Y4HZ81_9BACT/147-262  AC A0A1Y4HZ81.1
#=GS A0A1H1QP91_9FLAO/4-261    AC A0A1H1QP91.1
#=GS A0A413G7T3_9FIRM/6-296    AC A0A413G7T3.1
#=GS C3JAJ8_POREA/155-268      AC C3JAJ8.1
#=GS A0A2S7KLK6_9FLAO/144-250  AC A0A2S7KLK6.1
#=GS A0A4R7F0W8_9FLAO/3-255    AC A0A4R7F0W8.1
#=GS A0A5B8VJU7_9BACT/17-309   AC A0A5B8VJU7.1
#=GS A0A4R6IKD1_9SPHI/128-234  AC A0A4R6IKD1.1
#=GS A0A3N7D237_9SPHI/14-298   AC A0A3N7D237.1
#=GS A0A1Y4T5D8_9FIRM/2-158    AC A0A1Y4T5D8.1
#=GS A0A2G5GDX8_9FLAO/63-254   AC A0A2G5GDX8.1
#=GS L0FZR4_ECHVK/18-320       AC L0FZR4.1
#=GS A0A0X7B9A7_9FLAO/2-252    AC A0A0X7B9A7.1
#=GS A0A401HVD1_9BACL/6-294    AC A0A401HVD1.1
#=GS A0A518BN79_9BACT/84-313   AC A0A518BN79.1
#=GS W0JDJ6_9BACT/8-308        AC W0JDJ6.1
#=GS A0A2S7WP18_9FLAO/145-255  AC A0A2S7WP18.1
#=GS A0A4R0MR25_9SPHI/154-257  AC A0A4R0MR25.1
#=GS A0A5B9E7X4_9BACT/13-300   AC A0A5B9E7X4.1
#=GS A0A4R6IQV9_9SPHI/20-308   AC A0A4R6IQV9.1
#=GS A0A0L1JR50_9RHOB/17-290   AC A0A0L1JR50.1
#=GS R7P6T6_9BACT/147-266      AC R7P6T6.1
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#=GS A0A1T5ILQ5_9CLOT/8-111    AC A0A1T5ILQ5.1
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#=GS A0A177PW98_9ACTN/56-258   AC A0A177PW98.1
#=GS A0A494XDC8_9BACL/8-295    AC A0A494XDC8.1
#=GS A0A369IBB8_9BACT/161-276  AC A0A369IBB8.1
#=GS A0A2K8XU34_9FLAO/88-254   AC A0A2K8XU34.1
#=GS A0A5K7XFC0_9BACT/135-353  AC A0A5K7XFC0.1
#=GS A0A653NWJ8_9FLAO/149-252  AC A0A653NWJ8.1
#=GS R4KDT4_9FIRM/6-301        AC R4KDT4.1
#=GS A3HXP7_9BACT/19-310       AC A3HXP7.1
#=GS R6QQJ5_9FIRM/6-277        AC R6QQJ5.1
#=GS A0A0Q7Q2K6_9GAMM/16-300   AC A0A0Q7Q2K6.1
#=GS R9KJ30_9FIRM/7-296        AC R9KJ30.1
#=GS A0A554SIG1_9PROT/155-253  AC A0A554SIG1.1
#=GS A0A1H9JMB6_9FLAO/54-247   AC A0A1H9JMB6.1
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#=GS A0A1Y3VFI4_9BACT/146-254  AC A0A1Y3VFI4.1
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#=GS A0A150XH91_9BACT/17-304   AC A0A150XH91.1
#=GS A0A1U7CT09_9BACT/115-333  AC A0A1U7CT09.1
#=GS A0A413I5E3_9FIRM/45-271   AC A0A413I5E3.1
#=GS A0A5C8L7P2_9BACL/9-337    AC A0A5C8L7P2.1
#=GS B4CTZ0_9BACT/9-303        AC B4CTZ0.1
#=GS A0A3A9F1H4_9BACT/1-288    AC A0A3A9F1H4.1
#=GS A0A554SJT4_9PROT/22-260   AC A0A554SJT4.1
#=GS A0A1T4YUJ3_9BACT/90-298   AC A0A1T4YUJ3.1
#=GS A0A150AQV4_9BACT/147-256  AC A0A150AQV4.1
#=GS A0A127VWN3_SPOPS/50-247   AC A0A127VWN3.1
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#=GS A0A5C6TWX4_9SPHN/5-264    AC A0A5C6TWX4.1
#=GS G0L5R7_ZOBGA/33-255       AC G0L5R7.1
#=GS A0A5C6FH53_9BACT/105-336  AC A0A5C6FH53.1
#=GS A0A212UEW1_9BACT/130-257  AC A0A212UEW1.1
#=GS F0SG40_RUBBR/103-345      AC F0SG40.1
#=GS A0A1M6IC30_9CLOT/7-323    AC A0A1M6IC30.1
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#=GS A0A239JXH0_9BACT/101-296  AC A0A239JXH0.1
#=GS A0A5C1AS49_9BACT/8-315    AC A0A5C1AS49.1
#=GS R5EM43_9FIRM/6-286        AC R5EM43.1
#=GS A0A1I0RUE6_9BACT/9-289    AC A0A1I0RUE6.1
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