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Database: Pfam
Entry: Prominin
LinkDB: Prominin
Original site: Prominin 
#=GF ID   Prominin
#=GF AC   PF05478.13
#=GF DE   Prominin
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_18226 (release 8.0)
#=GF GA   34.30 34.30;
#=GF TC   34.30 34.30;
#=GF NC   34.20 34.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11467842
#=GF RT   Rat prominin, like its mouse and human orthologues, is a
#=GF RT   pentaspan membrane glycoprotein. 
#=GF RA   Corbeil D, Fargeas CA, Huttner WB; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;285:939-944.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10587575
#=GF RT   A frameshift mutation in prominin (mouse)-like 1 causes human
#=GF RT   retinal degeneration. 
#=GF RA   Maw MA, Corbeil D, Koch J, Hellwig A, Wilson-Wheeler JC, Bridges
#=GF RA   RJ, Kumaramanickavel G, John S, Nancarrow D, Roper K, Weigmann
#=GF RA   A, Huttner WB, Denton MJ; 
#=GF RL   Hum Mol Genet 2000;9:27-34.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008795;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The prominins are an emerging family of proteins that among the
#=GF CC   multispan membrane proteins display a novel topology. Mouse
#=GF CC   prominin and human prominin (mouse)-like 1 (PROML1) are
#=GF CC   predicted to contain five membrane spanning domains, with an
#=GF CC   N-terminal domain exposed to the extracellular space followed by
#=GF CC   four, alternating small cytoplasmic and large extracellular,
#=GF CC   loops and a cytoplasmic C-terminal domain [1]. The exact
#=GF CC   function of prominin is unknown although in humans defects in
#=GF CC   PROM1, the gene coding for prominin, cause retinal degeneration
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   1935
#=GS A0A0Q3XB37_AMAAE/18-830     AC A0A0Q3XB37.1
#=GS A0A653CP81_CALMS/54-571     AC A0A653CP81.1
#=GS A0A0Q9WLM6_DROVI/37-831     AC A0A0Q9WLM6.1
#=GS A0A669DHB6_ORENI/716-748    AC A0A669DHB6.1
#=GS A0A4W5NCK9_9TELE/23-831     AC A0A4W5NCK9.1
#=GS A0A6Q2XCA4_ESOLU/15-690     AC A0A6Q2XCA4.1
#=GS A0A3P9AIJ2_ESOLU/647-757    AC A0A3P9AIJ2.2
#=GS A0A151NVG7_ALLMI/3-180      AC A0A151NVG7.1
#=GS A0A1V4KR42_PATFA/19-263     AC A0A1V4KR42.1
#=GS A0A4X2JRZ0_VOMUR/18-811     AC A0A4X2JRZ0.1
#=GS B4JDN5_DROGR/250-361        AC B4JDN5.1
#=GS A0A4W5NZA8_9TELE/2-76       AC A0A4W5NZA8.1
#=GS A0A2K5DWD1_AOTNA/535-783    AC A0A2K5DWD1.1
#=GS A0A3Q2ZSD2_KRYMA/44-861     AC A0A3Q2ZSD2.1
#=GS A0A0B4LGM0_DROME/44-828     AC A0A0B4LGM0.1
#=GS H2N0M2_ORYLA/22-830         AC H2N0M2.2
#=GS A0A6I8VN57_DROPS/1-735      AC A0A6I8VN57.1
#=GS A0A3Q3MFW9_9TELE/20-819     AC A0A3Q3MFW9.1
#=GS A0A6I8TGS5_AEDAE/81-901     AC A0A6I8TGS5.1
#=GS F6QEH7_XENTR/15-751         AC F6QEH7.3
#=GS A0A3S2PIL4_ORYJA/22-821     AC A0A3S2PIL4.1
#=GS A0A2K6FH89_PROCO/19-821     AC A0A2K6FH89.1
#=GS A0A2K6LHQ6_RHIBE/18-820     AC A0A2K6LHQ6.1
#=GS A0A091N592_CARIC/1-354      AC A0A091N592.1
#=GS F7HZF4_CALJA/27-352         AC F7HZF4.2
#=GS A0A4W4F061_ELEEL/36-358     AC A0A4W4F061.1
#=GS A0A194PLI5_PAPXU/408-1032   AC A0A194PLI5.1
#=GS A0A3B0KCV3_DROGU/50-851     AC A0A3B0KCV3.1
#=GS H3FMA3_PRIPA/233-532        AC H3FMA3.2
#=GS A0A3Q3M9P3_9TELE/20-811     AC A0A3Q3M9P3.1
#=GS A0A6I8VSY1_DROPS/67-492     AC A0A6I8VSY1.1
#=GS F6VPF3_ORNAN/16-821         AC F6VPF3.2
#=GS A0A671YQ19_SPAAU/35-853     AC A0A671YQ19.1
#=GS F1Q4W2_DANRE/33-490         AC F1Q4W2.2
#=GS G4VDS9_SCHMA/217-861        AC G4VDS9.1
#=GS A0A482XLZ6_LAOST/1020-1212  AC A0A482XLZ6.1
#=GS A0A2K6R2S9_RHIRO/18-820     AC A0A2K6R2S9.1
#=GS A0A3Q1HGT6_ANATE/21-813     AC A0A3Q1HGT6.1
#=GS A0A3P9AJC4_ESOLU/613-783    AC A0A3P9AJC4.2
#=GS A0A3Q4ALL6_MOLML/705-787    AC A0A3Q4ALL6.1
#=GS A0A0L7KQ64_9NEOP/118-284    AC A0A0L7KQ64.1
#=GS W5PJL2_SHEEP/18-812         AC W5PJL2.1
#=GS A0A670J5Y4_PODMU/18-798     AC A0A670J5Y4.1
#=GS A0A5K4ELR1_SCHMA/19-530     AC A0A5K4ELR1.1
#=GS A0A267G8B2_9PLAT/24-192     AC A0A267G8B2.1
#=GS A0A4W4G794_ELEEL/658-794    AC A0A4W4G794.1
#=GS A0A667YAG2_9TELE/33-798     AC A0A667YAG2.1
#=GS I3IYG0_ORENI/20-841         AC I3IYG0.2
#=GS U3K1M8_FICAL/8-766          AC U3K1M8.1
#=GS W4XSR7_STRPU/429-593        AC W4XSR7.1
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#=GS B3M7E2_DROAN/103-906        AC B3M7E2.2
#=GS A0A485MNZ5_LYNPA/649-709    AC A0A485MNZ5.1
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#=GS R7TUX7_CAPTE/4-769          AC R7TUX7.1
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#=GS A0A669CHZ6_ORENI/15-684     AC A0A669CHZ6.1
#=GS W2TYU6_NECAM/89-280         AC W2TYU6.1
#=GS A0A3S3PLD2_9ACAR/23-146     AC A0A3S3PLD2.1
#=GS A0A267EX25_9PLAT/24-192     AC A0A267EX25.1
#=GS A0A6I8W9A7_DROPS/1-58       AC A0A6I8W9A7.1
#=GS A0A2I3RX57_PANTR/18-820     AC A0A2I3RX57.1
#=GS A0A4X2JRG2_VOMUR/18-811     AC A0A4X2JRG2.1
#=GS F6VPE5_ORNAN/16-818         AC F6VPE5.3
#=GS A0A401PLD2_SCYTO/465-594    AC A0A401PLD2.1
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#=GS A0A2P8XYX0_BLAGE/4-253      AC A0A2P8XYX0.1
#=GS A0A183P9P2_9TREM/411-788    AC A0A183P9P2.1
#=GS A0A2K6UEF6_SAIBB/25-807     AC A0A2K6UEF6.1
#=GS L8IRY8_9CETA/1-745          AC L8IRY8.1
#=GS A0A0R3UH79_9CEST/474-844    AC A0A0R3UH79.1
#=GS A0A2K6LHQ3_RHIBE/3-342      AC A0A2K6LHQ3.1
#=GS K7G3F2_PELSI/17-813         AC K7G3F2.1
#=GS A0A672ZY58_9TELE/35-839     AC A0A672ZY58.1
#=GS A0A3Q4H6N6_NEOBR/24-767     AC A0A3Q4H6N6.1
#=GS A0A151NAP0_ALLMI/8-140      AC A0A151NAP0.1
#=GS A0A0Q9WS67_DROVI/3-444      AC A0A0Q9WS67.1
#=GS A0A5N4EG37_CAMDR/184-521    AC A0A5N4EG37.1
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#=GS A0A5K4EMR5_SCHMA/750-808    AC A0A5K4EMR5.1
#=GS A0A3Q0H6I1_ALLSI/1-662      AC A0A3Q0H6I1.1
#=GS A0A4W4EYX8_ELEEL/35-833     AC A0A4W4EYX8.1
#=GS G3NWN7_GASAC/1-749          AC G3NWN7.1
#=GS G5BGC4_HETGA/11-814         AC G5BGC4.1
#=GS A0A3P8T8Y3_AMPPE/33-814     AC A0A3P8T8Y3.1
#=GS A0A182Y9J9_ANOST/20-795     AC A0A182Y9J9.1
#=GS A0A2I4D864_9TELE/35-850     AC A0A2I4D864.1
#=GS A0A0G2JWD0_RAT/18-821       AC A0A0G2JWD0.1
#=GS A0A665U1Q6_ECHNA/20-694     AC A0A665U1Q6.1
#=GS A0A5F8A3C4_MACMU/18-811     AC A0A5F8A3C4.1
#=GS W5LQH3_ASTMX/39-858         AC W5LQH3.2
#=GS B4H411_DROPE/95-899         AC B4H411.1
#=GS A0A1S3RRW5_SALSA/35-807     AC A0A1S3RRW5.1
#=GS A0A0R3WLR5_HYDTA/658-841    AC A0A0R3WLR5.1
#=GS A0A4W5QIU5_9TELE/23-811     AC A0A4W5QIU5.1
#=GS A0A5J4NNA8_9TREM/282-526    AC A0A5J4NNA8.1
#=GS A0A0T6AU22_9SCAR/79-862     AC A0A0T6AU22.1
#=GS A0A401Q9J2_SCYTO/1-215      AC A0A401Q9J2.1
#=GS A0A673TAC0_SURSU/19-833     AC A0A673TAC0.1
#=GS A0A6I8VS40_DROPS/1-347      AC A0A6I8VS40.1
#=GS A0A673WY13_SALTR/24-730     AC A0A673WY13.1
#=GS A0A674AE12_SALTR/556-795    AC A0A674AE12.1
#=GS E4XF62_OIKDI/375-877        AC E4XF62.1
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#=GS A0A091W9I6_OPIHO/1-433      AC A0A091W9I6.1
#=GS A0A151P9T3_ALLMI/16-812     AC A0A151P9T3.1
#=GS A0A3Q2CQC9_CYPVA/37-856     AC A0A3Q2CQC9.1
#=GS G1L4H6_AILME/3-726          AC G1L4H6.1
#=GS A0A3P9BLQ0_9CICH/37-856     AC A0A3P9BLQ0.1
#=GS A0A3Q0H9V1_ALLSI/16-834     AC A0A3Q0H9V1.1
#=GS A0A232FHV9_9HYME/1034-1356  AC A0A232FHV9.1
#=GS A0A2I4D882_9TELE/35-856     AC A0A2I4D882.1
#=GS B4KWS6_DROMO/61-862         AC B4KWS6.1
#=GS A0A1W4XFR8_AGRPL/1-435      AC A0A1W4XFR8.1
#=GS E2AB51_CAMFO/519-811        AC E2AB51.1
#=GS B4LGX1_DROVI/57-861         AC B4LGX1.1
#=GS A0A0L8HAG4_OCTBM/25-787     AC A0A0L8HAG4.1
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#=GS A0A401PLD2_SCYTO/3-369      AC A0A401PLD2.1
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#=GS B4IHF8_DROSE/4-176          AC B4IHF8.1
#=GS U4UT99_DENPD/1-323          AC U4UT99.1
#=GS L8I0A7_9CETA/1-730          AC L8I0A7.1
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#=GS A0A3Q1I3T6_ANATE/37-832     AC A0A3Q1I3T6.1
#=GS A0A3P9AIL7_ESOLU/648-775    AC A0A3P9AIL7.1
#=GS A0A2K5HY18_COLAP/18-792     AC A0A2K5HY18.1
#=GS K1R0F5_CRAGI/473-766        AC K1R0F5.1
#=GS A0A2G8L6D5_STIJA/5-138      AC A0A2G8L6D5.1
#=GS A0A6J3PVM5_TURTR/25-793     AC A0A6J3PVM5.1
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#=GS T1IK67_STRMM/2-575          AC T1IK67.1
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