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Database: Pfam
Entry: Prominin
LinkDB: Prominin
Original site: Prominin 
#=GF ID   Prominin
#=GF AC   PF05478.11
#=GF DE   Prominin
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_18226 (release 8.0)
#=GF GA   32.30 32.30;
#=GF TC   32.30 32.40;
#=GF NC   32.10 32.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11467842
#=GF RT   Rat prominin, like its mouse and human orthologues, is a
#=GF RT   pentaspan membrane glycoprotein. 
#=GF RA   Corbeil D, Fargeas CA, Huttner WB; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;285:939-944.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10587575
#=GF RT   A frameshift mutation in prominin (mouse)-like 1 causes human
#=GF RT   retinal degeneration. 
#=GF RA   Maw MA, Corbeil D, Koch J, Hellwig A, Wilson-Wheeler JC, Bridges
#=GF RA   RJ, Kumaramanickavel G, John S, Nancarrow D, Roper K, Weigmann
#=GF RA   A, Huttner WB, Denton MJ; 
#=GF RL   Hum Mol Genet 2000;9:27-34.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008795;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The prominins are an emerging family of proteins that among the
#=GF CC   multispan membrane proteins display a novel topology. Mouse
#=GF CC   prominin and human prominin (mouse)-like 1 (PROML1) are
#=GF CC   predicted to contain five membrane spanning domains, with an
#=GF CC   N-terminal domain exposed to the extracellular space followed by
#=GF CC   four, alternating small cytoplasmic and large extracellular,
#=GF CC   loops and a cytoplasmic C-terminal domain [1]. The exact
#=GF CC   function of prominin is unknown although in humans defects in
#=GF CC   PROM1, the gene coding for prominin, cause retinal degeneration
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   1107
#=GS A0A068YF29_ECHMU/79-477     AC A0A068YF29.1
#=GS A0A0Q9WLM6_DROVI/37-831     AC A0A0Q9WLM6.1
#=GS A0A183AWE7_9TREM/5-158      AC A0A183AWE7.1
#=GS A0A0M3HPF2_ASCLU/8-210      AC A0A0M3HPF2.1
#=GS A0A1A6HWX6_NEOLE/89-596     AC A0A1A6HWX6.1
#=GS A0A151NVG7_ALLMI/3-180      AC A0A151NVG7.1
#=GS A0A1I8Q8Z6_STOCA/2-185      AC A0A1I8Q8Z6.1
#=GS J9ETE3_WUCBA/3-234          AC J9ETE3.1
#=GS B4JDN5_DROGR/250-361        AC B4JDN5.1
#=GS S7NF69_MYOBR/1-104          AC S7NF69.1
#=GS A0A182RZS7_ANOFN/40-852     AC A0A182RZS7.1
#=GS H2ST74_TAKRU/1-720          AC H2ST74.1
#=GS A0A1W4VNV5_DROFC/92-897     AC A0A1W4VNV5.1
#=GS A0A091N592_CARIC/1-354      AC A0A091N592.1
#=GS W5LQH3_ASTMX/38-846         AC W5LQH3.1
#=GS A0A0N4XYD3_NIPBR/234-806    AC A0A0N4XYD3.1
#=GS A0A0L7KQ64_9NEOP/118-284    AC A0A0L7KQ64.1
#=GS W5PJL2_SHEEP/18-812         AC W5PJL2.1
#=GS A0A182M429_9DIPT/30-842     AC A0A182M429.1
#=GS W5KXW9_ASTMX/23-806         AC W5KXW9.1
#=GS B3M7E2_DROAN/103-906        AC B3M7E2.2
#=GS F7HZF4_CALJA/27-374         AC F7HZF4.1
#=GS A0A151I8U1_9HYME/431-741    AC A0A151I8U1.1
#=GS T1KVU9_TETUR/13-287         AC T1KVU9.1
#=GS A0A093EY00_TYTAL/17-824     AC A0A093EY00.1
#=GS A0A1D1V095_RAMVA/27-822     AC A0A1D1V095.1
#=GS U3K1M8_FICAL/7-766          AC U3K1M8.1
#=GS A0A091D5N8_FUKDA/703-845    AC A0A091D5N8.1
#=GS W2TQF5_NECAM/3-178          AC W2TQF5.1
#=GS A0A0L8I972_OCTBM/4-135      AC A0A0L8I972.1
#=GS A0A1I8GPT6_9PLAT/17-810     AC A0A1I8GPT6.1
#=GS A0A0M3K6R8_ANISI/196-655    AC A0A0M3K6R8.1
#=GS A0A2I3RX57_PANTR/18-820     AC A0A2I3RX57.1
#=GS S9XE13_CAMFR/247-359        AC S9XE13.1
#=GS A0A183P9P2_9TREM/411-788    AC A0A183P9P2.1
#=GS A0A226P638_COLVI/217-675    AC A0A226P638.1
#=GS A0A0N5CZL1_THECL/74-322     AC A0A0N5CZL1.1
#=GS A0A1W4WCL6_DROFC/47-833     AC A0A1W4WCL6.1
#=GS K7G3F2_PELSI/17-813         AC K7G3F2.1
#=GS A0A0R3NGT7_DROPS/1-344      AC A0A0R3NGT7.1
#=GS A0A151NAP0_ALLMI/8-140      AC A0A151NAP0.1
#=GS A0A154PPD0_9HYME/58-852     AC A0A154PPD0.1
#=GS A0A0R3WLR5_HYDTA/659-840    AC A0A0R3WLR5.1
#=GS A0A218U9L9_9PASE/20-780     AC A0A218U9L9.1
#=GS W5L0W5_ASTMX/1-773          AC W5L0W5.1
#=GS A0A1S3II51_LINUN/37-831     AC A0A1S3II51.1
#=GS G5BGC4_HETGA/11-814         AC G5BGC4.1
#=GS G3NWN7_GASAC/1-749          AC G3NWN7.1
#=GS I3IYG0_ORENI/20-842         AC I3IYG0.1
#=GS Q28WV3_DROPS/57-839         AC Q28WV3.4
#=GS A0A182TTU4_9DIPT/450-763    AC A0A182TTU4.1
#=GS A0A182Y9J9_ANOST/20-795     AC A0A182Y9J9.1
#=GS A0A2I4D864_9TELE/35-850     AC A0A2I4D864.1
#=GS A0A0G2JWD0_RAT/18-821       AC A0A0G2JWD0.1
#=GS A0A0P9C0E8_DROAN/51-837     AC A0A0P9C0E8.1
#=GS B4H411_DROPE/95-899         AC B4H411.1
#=GS B4H680_DROPE/10-289         AC B4H680.1
#=GS A0A195BQN3_9HYME/63-465     AC A0A195BQN3.1
#=GS A0A0T6AU22_9SCAR/79-862     AC A0A0T6AU22.1
#=GS A0A151WHC5_9HYME/31-456     AC A0A151WHC5.1
#=GS D6WAM5_TRICA/12-744         AC D6WAM5.2
#=GS A0A1S3NNW3_SALSA/20-802     AC A0A1S3NNW3.1
#=GS A0A091W9I6_OPIHO/1-433      AC A0A091W9I6.1
#=GS A0A151P9T3_ALLMI/16-812     AC A0A151P9T3.1
#=GS H3FMA3_PRIPA/89-384         AC H3FMA3.1
#=GS K1PH12_CRAGI/448-663        AC K1PH12.1
#=GS T1IH19_STRMM/329-971        AC T1IH19.1
#=GS G1L4H6_AILME/3-726          AC G1L4H6.1
#=GS A0A2I4D882_9TELE/35-856     AC A0A2I4D882.1
#=GS A0A1W4XFR8_AGRPL/1-435      AC A0A1W4XFR8.1
#=GS B4KWS6_DROMO/61-862         AC B4KWS6.1
#=GS E2AB51_CAMFO/519-811        AC E2AB51.1
#=GS A0A0L8HAG4_OCTBM/25-787     AC A0A0L8HAG4.1
#=GS B4LGX1_DROVI/57-861         AC B4LGX1.1
#=GS B7PAU5_IXOSC/596-673        AC B7PAU5.1
#=GS T1HW48_RHOPR/45-141         AC T1HW48.1
#=GS A0A195FGF4_9HYME/89-497     AC A0A195FGF4.1
#=GS B4IHF8_DROSE/4-176          AC B4IHF8.1
#=GS U4UT99_DENPD/1-323          AC U4UT99.1
#=GS G1QGH8_NOMLE/25-302         AC G1QGH8.2
#=GS A0A093C0A4_9AVES/1-333      AC A0A093C0A4.1
#=GS A0A1U7S6E2_ALLSI/16-821     AC A0A1U7S6E2.1
#=GS A0A1S3RSP3_SALSA/24-837     AC A0A1S3RSP3.1
#=GS A0A1B0AP20_9MUSC/25-780     AC A0A1B0AP20.1
#=GS H7BWW9_DANRE/28-825         AC H7BWW9.2
#=GS A0A2D0RJJ2_ICTPU/28-825     AC A0A2D0RJJ2.1
#=GS F1RCM2_DANRE/36-837         AC F1RCM2.1
#=GS C3YIS9_BRAFL/780-911        AC C3YIS9.1
#=GS A0A1U7TH35_TARSY/18-820     AC A0A1U7TH35.1
#=GS A0A0C2FE21_9BILA/2-58       AC A0A0C2FE21.1
#=GS M3XKH5_LATCH/23-603         AC M3XKH5.1
#=GS A0A091V5K0_OPIHO/1-365      AC A0A091V5K0.1
#=GS A0A226MNQ6_CALSU/359-723    AC A0A226MNQ6.1
#=GS A0A0Q9XBX0_DROMO/65-839     AC A0A0Q9XBX0.1
#=GS A0A182SMC5_9DIPT/1-415      AC A0A182SMC5.1
#=GS A0A1L4AAC2_DROME/35-815     AC A0A1L4AAC2.1
#=GS A0A1A6HGX8_NEOLE/25-321     AC A0A1A6HGX8.1
#=GS B4IZP7_DROGR/73-877         AC B4IZP7.1
#=GS A0A158QIW0_HYMNN/105-262    AC A0A158QIW0.1
#=GS A0A2K5HY18_COLAP/18-792     AC A0A2K5HY18.1
#=GS A0A151HZH9_9HYME/22-749     AC A0A151HZH9.1
#=GS F7ES12_MONDO/20-823         AC F7ES12.2
#=GS A0A2G8L6D5_STIJA/5-138      AC A0A2G8L6D5.1
#=GS A0A1A9UXJ4_GLOAU/78-757     AC A0A1A9UXJ4.1
#=GS A0A183MUM4_9TREM/1-272      AC A0A183MUM4.1
#=GS V8NES1_OPHHA/386-469        AC V8NES1.1
#=GS A0A091J326_CALAN/4-446      AC A0A091J326.1
#=GS A0A1S3IDW2_LINUN/29-235     AC A0A1S3IDW2.1
#=GS F7HZI3_CALJA/1-284          AC F7HZI3.1
#=GS A0A151LY66_ALLMI/46-813     AC A0A151LY66.1
#=GS A0A0N5CKZ7_THECL/12-793     AC A0A0N5CKZ7.1
#=GS A0A1S3SSM0_SALSA/24-822     AC A0A1S3SSM0.1
#=GS A0A096NZG9_PAPAN/18-820     AC A0A096NZG9.2
#=GS G4LYQ2_SCHMA/21-184         AC G4LYQ2.1
#=GS Q5ZLD8_CHICK/17-96          AC Q5ZLD8.1
#=GS A0A091P0E1_APAVI/1-355      AC A0A091P0E1.1
#=GS F1PMC8_CANLF/1-741          AC F1PMC8.2
#=GS U3K3R9_FICAL/17-822         AC U3K3R9.1
#=GS PROM1_MOUSE/18-822          AC O54990.1
#=GS B0W3X9_CULQU/85-895         AC B0W3X9.1
#=GS A0A1V4KR42_PATFA/252-749    AC A0A1V4KR42.1
#=GS A0A226P638_COLVI/5-177      AC A0A226P638.1
#=GS A0A0B2W1M0_TOXCA/13-270     AC A0A0B2W1M0.1
#=GS A0A1W4W1M8_DROFC/44-822     AC A0A1W4W1M8.1
#=GS A0A1L8H1H6_XENLA/32-807     AC A0A1L8H1H6.1
#=GS A0A182PMI8_9DIPT/27-839     AC A0A182PMI8.1
#=GS B4QP19_DROSI/37-174         AC B4QP19.1
#=GS B4HTJ7_DROSE/98-691         AC B4HTJ7.1
#=GS H2P533_PONAB/25-654         AC H2P533.1
#=GS W4XP01_STRPU/46-585         AC W4XP01.1
#=GS A0A1S3EIV5_DIPOR/18-812     AC A0A1S3EIV5.1
#=GS Q17FE4_AEDAE/5-804          AC Q17FE4.1
#=GS A0A087QRH9_APTFO/1-437      AC A0A087QRH9.1
#=GS G1S3H0_NOMLE/18-820         AC G1S3H0.3
#=GS A0A2I0MN68_COLLI/1-378      AC A0A2I0MN68.1
#=GS A0A0Q3PMM0_AMAAE/16-235     AC A0A0Q3PMM0.1
#=GS A0A2A2LYK2_9BILA/36-448     AC A0A2A2LYK2.1
#=GS H3J314_STRPU/3-216          AC H3J314.1
#=GS W5NE34_LEPOC/23-793         AC W5NE34.1
#=GS G3X1S3_SARHA/18-814         AC G3X1S3.1
#=GS A0A1J1J058_9DIPT/128-795    AC A0A1J1J058.1
#=GS A0A1B0D4C1_PHLPP/5-264      AC A0A1B0D4C1.1
#=GS A0A087R1R6_APTFO/17-824     AC A0A087R1R6.1
#=GS G1TC31_RABIT/1-714          AC G1TC31.2
#=GS B4N6I8_DROWI/41-802         AC B4N6I8.2
#=GS A0A1U8BKH7_MESAU/19-813     AC A0A1U8BKH7.1
#=GS H2ST75_TAKRU/1-726          AC H2ST75.1
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#=GS G5APT5_HETGA/23-805         AC G5APT5.1
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#=GS A0A183WSI6_TRIRE/228-869    AC A0A183WSI6.1
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#=GS H2US21_TAKRU/1-774          AC H2US21.1
#=GS A0A158PD90_ANGCS/34-197     AC A0A158PD90.1
#=GS A0A0M3J1X3_ANISI/1-326      AC A0A0M3J1X3.1
#=GS U6PAM9_HAECO/13-811         AC U6PAM9.1
#=GS A0A0Q9WGH8_DROVI/57-861     AC A0A0Q9WGH8.1
#=GS A0A0B2VU36_TOXCA/37-565     AC A0A0B2VU36.1
#=GS A0A182ERX4_ONCOC/1-59       AC A0A182ERX4.1
#=GS H2ST68_TAKRU/21-828         AC H2ST68.1
#=GS B4H3Z2_DROPE/52-256         AC B4H3Z2.1
#=GS A0A0G2JDS7_MOUSE/1-41       AC A0A0G2JDS7.1
#=GS A0A0B2W1M0_TOXCA/273-583    AC A0A0B2W1M0.1
#=GS K7IYK1_NASVI/31-828         AC K7IYK1.1
#=GS G3RJ70_GORGO/18-820         AC G3RJ70.2
#=GS A0A1U7RVK7_ALLSI/16-821     AC A0A1U7RVK7.1
#=GS A0A0A0A2X7_CHAVO/1-355      AC A0A0A0A2X7.1
#=GS G0MVL9_CAEBE/150-298        AC G0MVL9.1
#=GS A0A151JWL2_9HYME/484-756    AC A0A151JWL2.1
#=GS A0A068Y880_ECHMU/254-844    AC A0A068Y880.1
#=GS A0A218VC49_9PASE/16-827     AC A0A218VC49.1
#=GS K1PH12_CRAGI/229-451        AC K1PH12.1
#=GS A0A2H2I0S9_CAEJA/234-537    AC A0A2H2I0S9.1
#=GS L8Y900_TUPCH/6-516          AC L8Y900.1
#=GS H2US22_TAKRU/37-842         AC H2US22.1
#=GS A0A1I7RXP2_BURXY/273-611    AC A0A1I7RXP2.1
#=GS A0A1A6HGX8_NEOLE/394-707    AC A0A1A6HGX8.1
#=GS A0A0Q3XB37_AMAAE/17-830     AC A0A0Q3XB37.1
#=GS A0A183K304_9TREM/483-862    AC A0A183K304.1
#=GS K7IUF8_NASVI/344-667        AC K7IUF8.1
#=GS V4ALB1_LOTGI/11-77          AC V4ALB1.1
#=GS A0A1I7VGL4_LOALO/404-685    AC A0A1I7VGL4.1
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