GenomeNet

Database: Pfam
Entry: Protamine_like
LinkDB: Protamine_like
Original site: Protamine_like 
#=GF ID   Protamine_like
#=GF AC   PF06382.13
#=GF DE   Protamine and protamine like
#=GF PI   DUF1074;
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   Pfam-B_14962 (release 9.0)
#=GF GA   21.30 21.30;
#=GF TC   21.30 21.30;
#=GF NC   21.20 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0114
#=GF RN   [1]
#=GF RM   15988027
#=GF RT   Replacement by Drosophila melanogaster protamines and Mst77F of
#=GF RT   histones during chromatin condensation in late spermatids and
#=GF RT   role of sesame in the removal of these proteins from the male
#=GF RT   pronucleus.
#=GF RA   Jayaramaiah Raja S, Renkawitz-Pohl R;
#=GF RL   Mol Cell Biol. 2005;25:6165-6177.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   26673329
#=GF RT   Prtl99C Acts Together with Protamines and Safeguards Male
#=GF RT   Fertility in Drosophila.
#=GF RA   Eren-Ghiani Z, Rathke C, Theofel I, Renkawitz-Pohl R;
#=GF RL   Cell Rep. 2015;13:2327-2335.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024460;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several insect proteins including
#=GF CC   protamine A (ProtA), protamine B (ProtB) and protamine-like
#=GF CC   protein 99C (Prtl99C) from Drosophila melanogaster. They contain
#=GF CC   a HMG-box and are involved in chromatin compaction during
#=GF CC   spermiogenesis [1, 2]. Prtl99C is a sperm chromatin-associated
#=GF CC   protein that is essential for male fertility [2].
#=GF SQ   108
#=GS B4Q5X7_DROSI/1-147        AC B4Q5X7.1
#=GS Q9VJR1_DROME/1-144        AC Q9VJR1.1
#=GS Q9V3S3_DROME/1-146        AC Q9V3S3.1
#=GS A0A0P8YP06_DROAN/198-309  AC A0A0P8YP06.1
#=GS B0WEC2_CULQU/12-103       AC B0WEC2.1
#=GS B4NR12_DROWI/2-138        AC B4NR12.1
#=GS A0A653BYK4_CALMS/1-102    AC A0A653BYK4.1
#=GS B4K321_DROGR/1-93         AC B4K321.1
#=GS A0A0P8ZEB4_DROAN/15-152   AC A0A0P8ZEB4.1
#=GS A0A0P8YF59_DROAN/11-89    AC A0A0P8YF59.1
#=GS A0A182Y5R0_ANOST/16-110   AC A0A182Y5R0.1
#=GS A0A0L0CLK0_LUCCU/131-289  AC A0A0L0CLK0.1
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#=GS A0A3M9VGB9_9EURY/11-142   AC A0A3M9VGB9.1
#=GS B4LRZ6_DROVI/70-212       AC B4LRZ6.1
#=GS A0A0Q9WJI0_DROVI/58-187   AC A0A0Q9WJI0.1
#=GS A0A1S4F3V7_AEDAE/2-116    AC A0A1S4F3V7.1
#=GS B4MWQ8_DROWI/77-223       AC B4MWQ8.1
#=GS B3M769_DROAN/56-176       AC B3M769.2
#=GS B9A0M4_DROME/56-156       AC B9A0M4.1
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#=GS A0A653C922_CALMS/2-106    AC A0A653C922.1
#=GS B4JAV1_DROGR/14-136       AC B4JAV1.1
#=GS B4LB21_DROMO/61-193       AC B4LB21.2
#=GS B4LRZ5_DROVI/104-206      AC B4LRZ5.2
#=GS Q8IMZ6_DROME/6-94         AC Q8IMZ6.1
#=GS A0A6I8UZS2_DROPS/5-106    AC A0A6I8UZS2.1
#=GS B4L3Z4_DROMO/39-156       AC B4L3Z4.1
#=GS B4N5L4_DROWI/2-145        AC B4N5L4.1
#=GS A0A6I8VYD0_DROPS/2-83     AC A0A6I8VYD0.1
#=GS B4HW41_DROSE/56-204       AC B4HW41.1
#=GS A0A653C9T2_CALMS/1-97     AC A0A653C9T2.1
#=GS A0A182GI82_AEDAL/2-101    AC A0A182GI82.1
#=GS N6UL53_DENPD/1-98         AC N6UL53.1
#=GS T1GDW4_MEGSC/2-111        AC T1GDW4.1
#=GS B4MWQ8_DROWI/25-104       AC B4MWQ8.1
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#=GS A0A0S0X2Z1_DROME/19-126   AC A0A0S0X2Z1.1
#=GS A0A484B977_DRONA/3-81     AC A0A484B977.1
#=GS A0A0P8XZX6_DROAN/11-113   AC A0A0P8XZX6.1
#=GS B4G3P3_DROPE/7-103        AC B4G3P3.1
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#=GS B4LXH8_DROVI/12-85        AC B4LXH8.1
#=GS A0A1J1J0R9_9DIPT/17-141   AC A0A1J1J0R9.1
#=GS A0A286U7Z3_9AGAM/40-150   AC A0A286U7Z3.1
#=GS A0A5E4NQX4_9HEMI/2-73     AC A0A5E4NQX4.1
#=GS A0A6I8VHJ4_DROPS/6-80     AC A0A6I8VHJ4.1
#=GS A0A0Q9WR29_DROWI/64-221   AC A0A0Q9WR29.1
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#=GS B4R0T9_DROSI/115-198      AC B4R0T9.1
#=GS A0A484AW36_DRONA/43-158   AC A0A484AW36.1
#=GS A0A6I8V7K9_DROPS/1-71     AC A0A6I8V7K9.1
#=GS B4KE49_DROMO/196-332      AC B4KE49.2
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#=GS D2A2C6_TRICA/2-91         AC D2A2C6.1
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#=GS B4KE49_DROMO/7-84         AC B4KE49.2
#=GS W6KQG6_9TRYP/21-123       AC W6KQG6.1
#=GS A0A0Q9XBJ0_DROMO/60-193   AC A0A0Q9XBJ0.1
#=GS B4GK62_DROPE/62-129       AC B4GK62.1
#=GS A0A0L0C583_LUCCU/71-157   AC A0A0L0C583.1
#=GS A0A482V8Z3_9CUCU/2-93     AC A0A482V8Z3.1
#=GS B4H0U7_DROPE/5-104        AC B4H0U7.1
#=GS A0A653DFT0_CALMS/2-108    AC A0A653DFT0.1
#=GS A0A653DBE3_CALMS/1-71     AC A0A653DBE3.1
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#=GS A0A084VP93_ANOSI/8-121    AC A0A084VP93.1
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#=GS B4HXK5_DROSE/1-147        AC B4HXK5.1
#=GS A0A0S0X8W6_DROME/2-94     AC A0A0S0X8W6.1
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#=GS A0A482W0F1_9CUCU/19-104   AC A0A482W0F1.1
#=GS B4MZ64_DROWI/64-235       AC B4MZ64.1
#=GS B4R0T9_DROSI/1-124        AC B4R0T9.1
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#=GS A0A482V8V0_9CUCU/4-100    AC A0A482V8V0.1
#=GS B4NRG9_DROWI/66-193       AC B4NRG9.1
#=GS A0A0Q9X600_DROWI/2-66     AC A0A0Q9X600.1
#=GS A0A0Q9X1P6_DROWI/52-165   AC A0A0Q9X1P6.1
#=GS A0A6I8VYU8_DROPS/3-91     AC A0A6I8VYU8.1
#=GS PR99C_DROME/1-125         AC Q9VAF7.3
#=GS S8F603_FOMPI/182-277      AC S8F603.1
#=GS PR99C_DROME/123-198       AC Q9VAF7.3
#=GS A0A310SJB4_9HYME/2-116    AC A0A310SJB4.1
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Q9VJR1_DROME/1-144                   ...............................................................MSSNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...KRRAPPK.CKPM.K.SCA.KP..R..R.....K..AA......C.....A...K.A....T......R..P.K.VK...C...A......P..SQK..CS..K..Q..G.......P...V.T.N......N.AYLNF....V....R....F.F....RK....K....H..C....D..L.K.......P....Q....ELI......AEA.AKAW....AELPEHRKDRYRR...................M.ACKV..TT..................................SERH...KRRRICK--...........................................................
Q9V3S3_DROME/1-146                   ...............................................................MSSNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...IRRAPQK.CKPM.K.SCA.KP..R..R.....K..AA......C.....A...K.A....T......R..P.K.VK...C...A......P..RQK..CS..K..Q..G.......P...V.T.N......N.AYLNF....V....R....S.F....RK....K....H..C....N..L.K.......P....R....ELI......AKA.AKAW....ARLSENRKDRYRR...................M.ACKV..TT..................................SERH...KRRRICQQY...........................................................
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B0WEC2_CULQU/12-103                  ......................................................flvkpeppr------------------------------------...-------.----.-.---.--..-..-.....-..CT......C.....P...T.T....V......N..P.S.RA...T...I......P..TPR..AR..S..T..G.......R...M.T.R......N.PFFNY....L....G....H.F....RA....N....H..R....E..L.S.......P....V....GVT......VEG.ARVW....RRMTYQEKEPFVR...................V.A---..--..................................----...---------rlarrrpardq................................................
B4NR12_DROWI/2-138                   .........................................................krpscp---------------------KKRKPRGCPRKPACP...MRKKRAC.AKKR.K.PAC.PK..K..R.....K..PA......C.....R...R.K....Rk...acRpkR.R.NP...C...A......K.kRVK..CS..K..P..G.......P...V.M.N......N.GYLNF....V....R....S.F....RK....K....H..C....G..L.K.......P....Q....ELI......KMA.ARAW....CSLSEDKKNRYRR...................M.ACKV..TK..................................SCRH...KHRRVCT--gk.........................................................
A0A653BYK4_CALMS/1-102               ...........................................................mtrk------------------------------------...-------.----.-.---.--..-..-.....-..SR......R.....S...R.S....I......R..R.K.--...-...P......K..IQK..CEvyK..T..G.......P...I.T.V......N.PFLNF....V....R....D.V....RK....N....A..K....G..L.S.......V....C....EIV......SKA.GRLW....RRMNDEQKKPYYH...................L.AKKA..RElksr..........................ghksSHRD...RKRR-----esdrsl.....................................................
B4K321_DROGR/1-93                    ..............................................................m------------------------------------...-------.----.-.NCA.RK..K..R.....K..TR......C.....A...K.-....-......-..-.K.PK...C...A......-..TFK..CQ..R..S..G.......P...V.T.A......N.GFLNF....L....R....S.Y....RR....K....H..C....D..L.S.......P....I....EML......RKG.GAAW....HNLSEREKNRYRR...................Q.ACKV..TT..................................SCRH...KRRRVCT--s..........................................................
A0A0P8ZEB4_DROAN/15-152              .......................................................rnpsqmet------------------------STDGMLTGCKRK...DAKPKAT.CKPKnK.SSC.DP..K..P.....K..KT......R.....A...KpK....A......S..P.K.KA...C...SakkpkkP..KKT..SC..K..P..G.......P...I.M.N......N.GYLNF....V....R....A.Y....RE....K....H..C....G..M.K.......P....R....ELI......RRA.ARAW....CRLSEEKKDKYRR...................M.ACKV..TT..................................SQRH...KRRRVCQT-g..........................................................
A0A0P8YF59_DROAN/11-89               ..........................................................psdsv------------------------------------...-------.----.-.---.--..-..-.....-..--......-.....-...-.-....-......-..-.-.--...-...-......-..---..--..-..-..-.......-...-.-.-......K.AYRNF....L....R....L.Y....SR....Q....H..A....E..M.H.......P....N....DAA......NVA.IRLW....GTLTPSEKQRYEEldwdv........ienatkV.EGKS..KN..................................SEKK...KSS------laarks.....................................................
A0A182Y5R0_ANOST/16-110              .........................................................gsmmcr------------------------------------...-------.----.-.---.--..-..-.....-..--......-.....-...-.-....-......-..-.-.--...-...-......-..---..--..-..P..G.......K...T.T.R......N.PYLNF....L....R....D.Y....RR....K....N..C....H..L.S.......A....V....DIV......RQG.AEQW....RRMSDEQKLPYVKiafyt........plrrrrC.----..--..................................----...---------ptctgmsgrmkrsamraiarskamnrvr...............................
A0A0L0CLK0_LUCCU/131-289             ................................................nitappttipthitm------------------------------------...-----AQ.CTPR.K.TTR.MA..R..Rg...kR..VQ......C.....P...R.AcptpT......T..P.QpTA...T...T......A..AAR..CL..R..P..G.......P...V.Q.R......N.PFLNF....L....R....E.Y....RK....T....C..C....G..L.T.......A....I....ETV......RQG.AKAW....KNLSNEEKQRYIVeafya.........pkrrrR.----..--..................................----...---------lgamcgpvsrrggrvskrsrsamsrrvrsgksgsrrrskvc..................
A0A6I8W072_DROPS/62-137              ...........................................................ldsr------------------------------------...-------.----.-.---.--..-..-.....-..--......-.....-...-.-....-......-..-.-.--...-...-......-..KRK..RG..N..P..G.......P...I.T.N......N.GYLNF....I....R....K.F....RQs..nR....A..L....D..L.K.......P....Q....DVI......RQA.AKAW....RRLGDANKTLYRL...................H.ACKQ..A-..................................----...---------mrrqmikkc..................................................
A0A3M9VGB9_9EURY/11-142              ...................................................grvpsiffatpt-----------------GISAPTRSGQYATTSTAWK...LRRKPVSpPNPL.P.SCR.GT..T..S.....K..SI......C.....G...R.S....T......T..S.K.ST...A...S......P..HQR..LA..S..G..Q.......F...F.A.R......T.KPVKF....V....R....S.F....RS....-....C..A....T..L.S.......P....R....SMR......STA.SGSR....RPFSRA-------...................-.----..--..................................----...---------prpswhsirpirhrgsrr.........................................
B4LRZ6_DROVI/70-212                  ..............................dlddsccprkksppmccpkrrrscpkpcppkpr----------------------------------CP...ARRRKPC.CRPK.-.-C-.-P..K..P.....K..PR......C.....C...K.P....V......C..P.K.PV...C...P.....kPckKYK..CQ..K..P..G.......P...I.T.N......N.GYLNF....L....R....V.Y....RR....K....H..C....G..L.S.......P....K....ELV......MKA.ARAW....CRLPECKKDRYRR...................Q.ACKV..TT..................................NCRH...KRRRVCTQ-...........................................................
A0A0Q9WJI0_DROVI/58-187              ...................................neekarayikheyipknastrtiptekp----------------------------------KP...KPKQKVK.PKPK.K.KPI.AA..K..T.....K..IT......T.....S...R.K....S......Q..K.A.IN...S...K......T..KAR..NM..H..L..S.......H...C.S.N......N.AFRHF....I....R....E.F....RK....R....N..S....D..L.D.......L....Q....TAV......KLG.AKAW....CLLYQEEREMLKK...................L.ITK-..--..................................----...---------kgsisd.....................................................
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